+------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+ | MLS - Macrolide, Lincosamide and Streptogramin B | +-------------------+------------+--------------------------------+------------+-------------------------+-----------------+----------------------+----------------------+-----------------+ | Resistance gene | Identity | Alignment Length/Gene Length | Coverage | Position in reference | Contig | Position in contig | Phenotype | Accession no. | |-------------------+------------+--------------------------------+------------+-------------------------+-----------------+----------------------+----------------------+-----------------| | erm(B) | 100 | 738/738 | 100 | 1..738 | contig_1_polish | 974300..975037 | Macrolide resistance | U18931 | +-------------------+------------+--------------------------------+------------+-------------------------+-----------------+----------------------+----------------------+-----------------+ +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+ | Tetracycline | +-------------------+------------+--------------------------------+------------+-------------------------+-----------------+----------------------+-------------------------+-----------------+ | Resistance gene | Identity | Alignment Length/Gene Length | Coverage | Position in reference | Contig | Position in contig | Phenotype | Accession no. | |-------------------+------------+--------------------------------+------------+-------------------------+-----------------+----------------------+-------------------------+-----------------| | tet(M) | 99.1667 | 1920/1920 | 100 | 1..1920 | contig_1_polish | 527922..529841 | Tetracycline resistance | X75073 | +-------------------+------------+--------------------------------+------------+-------------------------+-----------------+----------------------+-------------------------+-----------------+ ##################### macrolide ##################### erm(B), ID: 100.00 %, Alignment Length/Gene Length: 738/738, Coverage: 100.0, Positions in reference: 1..738, Contig name: contig_1_polish, Position: 974300..975037 ATGAACAAAAATATAAAATATTCTCAAAACTTTTTAACGAGTGAAAAAGTACTCAACCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ATGAACAAAAATATAAAATATTCTCAAAACTTTTTAACGAGTGAAAAAGTACTCAACCAA ATAATAAAACAATTGAATTTAAAAGAAACCGATACCGTTTACGAAATTGGAACAGGTAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ATAATAAAACAATTGAATTTAAAAGAAACCGATACCGTTTACGAAATTGGAACAGGTAAA GGGCATTTAACGACGAAACTGGCTAAAATAAGTAAACAGGTAACGTCTATTGAATTAGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GGGCATTTAACGACGAAACTGGCTAAAATAAGTAAACAGGTAACGTCTATTGAATTAGAC AGTCATCTATTCAACTTATCGTCAGAAAAATTAAAACTGAATACTCGTGTCACTTTAATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AGTCATCTATTCAACTTATCGTCAGAAAAATTAAAACTGAATACTCGTGTCACTTTAATT CACCAAGATATTCTACAGTTTCAATTCCCTAACAAACAGAGGTATAAAATTGTTGGGAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CACCAAGATATTCTACAGTTTCAATTCCCTAACAAACAGAGGTATAAAATTGTTGGGAGT ATTCCTTACCATTTAAGCACACAAATTATTAAAAAAGTGGTTTTTGAAAGCCATGCGTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ATTCCTTACCATTTAAGCACACAAATTATTAAAAAAGTGGTTTTTGAAAGCCATGCGTCT GACATCTATCTGATTGTTGAAGAAGGATTCTACAAGCGTACCTTGGATATTCACCGAACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GACATCTATCTGATTGTTGAAGAAGGATTCTACAAGCGTACCTTGGATATTCACCGAACA CTAGGGTTGCTCTTGCACACTCAAGTCTCGATTCAGCAATTGCTTAAGCTGCCAGCGGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CTAGGGTTGCTCTTGCACACTCAAGTCTCGATTCAGCAATTGCTTAAGCTGCCAGCGGAA TGCTTTCATCCTAAACCAAAAGTAAACAGTGTCTTAATAAAACTTACCCGCCATACCACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TGCTTTCATCCTAAACCAAAAGTAAACAGTGTCTTAATAAAACTTACCCGCCATACCACA GATGTTCCAGATAAATATTGGAAGCTATATACGTACTTTGTTTCAAAATGGGTCAATCGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GATGTTCCAGATAAATATTGGAAGCTATATACGTACTTTGTTTCAAAATGGGTCAATCGA GAATATCGTCAACTGTTTACTAAAAATCAGTTTCATCAAGCAATGAAACACGCCAAAGTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GAATATCGTCAACTGTTTACTAAAAATCAGTTTCATCAAGCAATGAAACACGCCAAAGTA AACAATTTAAGTACCGTTACTTATGAGCAAGTATTGTCTATTTTTAATAGTTATCTATTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AACAATTTAAGTACCGTTACTTATGAGCAAGTATTGTCTATTTTTAATAGTTATCTATTA TTTAACGGGAGGAAATAA |||||||||||||||||| TTTAACGGGAGGAAATAA ##################### tetracycline ##################### tet(M), ID: 99.17 %, Alignment Length/Gene Length: 1920/1920, Coverage: 100.0, Positions in reference: 1..1920, Contig name: contig_1_polish, Position: 527922..529841 ATGAAAATTATTAATATTGGAGTTTTAGCTCATGTTGATGCAGGAAAAACTACCTTAACA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ATGAAAATTATTAATATTGGAGTTTTAGCTCATGTTGATGCGGGAAAAACTACCTTAACA GAAAGCTTATTATATAACAGTGGAGCGATTACAGAATTAGGAAGCGTGGACAAAGGTACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GAAAGCTTATTATATAACAGTGGAGCGATTACAGAATTAGGAAGCGTGGACAAAGGTACA ACGAGGACGGATAATACGCTTTTAGAACGTCAGAGAGGAATTACAATTCAGACAGGAATA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ACGAGGACGGATAATACGCTTTTAGAACGTCAGAGAGGAATTACAATTCAGACAGGAATA ACCTCTTTTCAGTGGGAAAATACGAAGGTGAACATCATAGACACGCCAGGACATATGGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ACCTCTTTTCAGTGGGAAAATACGAAGGTGAACATCATAGACACGCCAGGACATATGGAT TTCTTAGCAGAAGTATATCGTTCATTATCAGTTTTAGATGGGGCAATTCTACTGATTTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TTCTTAGCAGAAGTATATCGTTCATTATCAGTTTTAGATGGGGCAATTCTACTGATTTCT GCAAAAGATGGCGTACAAGCACAAACTCGTATATTATTTCATGCACTTAGGAAAATGGGG 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