# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_28 - 421 Mg_chelatase PF01078.16 207 9.5e-06 17.1 0.1 1 1 3e-07 1.9e-05 16.1 0.1 20 42 199 221 195 225 0.91 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_28 - 421 Parvo_NS1 PF01057.12 272 0.00026 12.1 0.0 1 1 7.1e-06 0.00044 11.4 0.0 114 134 201 221 168 235 0.91 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_42 - 247 Seryl_tRNA_N PF02403.17 108 0.00014 14.2 10.0 1 2 2.4e-05 0.0015 10.8 1.5 32 89 40 96 32 105 0.82 # 30490 # 31230 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 1_42 - 247 Seryl_tRNA_N PF02403.17 108 0.00014 14.2 10.0 2 2 0.00053 0.033 6.5 1.0 42 95 153 205 113 213 0.85 # 30490 # 31230 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.507 1_28 - 421 IstB_IS21 PF01695.12 178 3.4e-06 18.8 0.0 1 1 1.8e-07 5.6e-06 18.1 0.0 49 71 203 225 198 255 0.76 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_10 - 212 IstB_IS21 PF01695.12 178 1.3e-05 16.9 1.1 1 1 2.2e-06 6.7e-05 14.6 1.1 50 84 3 38 1 99 0.82 # 3719 # 4354 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_10 - 212 MipZ PF09140.6 261 1e-14 46.4 0.1 1 2 1.1e-11 6.9e-10 30.6 0.0 2 53 2 52 1 56 0.86 # 3719 # 4354 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_10 - 212 MipZ PF09140.6 261 1e-14 46.4 0.1 2 2 1.3e-06 8.1e-05 14.0 0.0 88 130 67 109 61 120 0.90 # 3719 # 4354 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_10 - 212 YhjQ PF06564.7 244 2.7e-05 15.8 0.1 1 1 1.1e-06 6.7e-05 14.5 0.1 3 39 2 38 1 44 0.87 # 3719 # 4354 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_36 - 344 AAA_22 PF13401.1 131 1.2e-06 20.9 0.0 1 2 0.028 0.59 2.5 0.0 69 100 29 59 5 92 0.73 # 24842 # 25873 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_36 - 344 AAA_22 PF13401.1 131 1.2e-06 20.9 0.0 2 2 2.2e-06 4.6e-05 15.8 0.0 2 34 157 189 156 223 0.75 # 24842 # 25873 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_28 - 421 AAA_22 PF13401.1 131 1.9e-06 20.3 0.1 1 1 7.2e-07 1.5e-05 17.4 0.1 7 45 204 234 198 242 0.85 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_43 - 922 AAA_22 PF13401.1 131 1.1e-05 17.9 0.0 1 2 2.3e-05 0.00048 12.5 0.0 7 43 544 588 538 663 0.79 # 31242 # 34007 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_43 - 922 AAA_22 PF13401.1 131 1.1e-05 17.9 0.0 2 2 0.038 0.78 2.1 0.0 78 129 749 802 732 804 0.68 # 31242 # 34007 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_36 - 344 ATP_bind_1 PF03029.12 238 0.00047 12.0 0.0 1 1 1.4e-05 0.00087 11.1 0.0 2 22 165 185 164 192 0.88 # 24842 # 25873 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_10 - 212 SRP54 PF00448.17 196 4.8e-07 21.6 3.4 1 1 1e-07 3.2e-06 18.9 3.4 10 94 10 88 1 101 0.70 # 3719 # 4354 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_28 - 421 SRP54 PF00448.17 196 0.00021 13.0 0.0 1 1 1.1e-05 0.00034 12.3 0.0 3 41 203 239 201 263 0.83 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_28 - 421 AAA_17 PF13207.1 121 7.4e-12 38.4 0.2 1 1 8.3e-13 2.6e-11 36.7 0.2 1 110 203 304 203 408 0.73 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_10 - 212 AAA_17 PF13207.1 121 0.00023 14.2 0.1 1 1 1.8e-05 0.00056 13.0 0.0 1 64 2 74 2 112 0.64 # 3719 # 4354 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_10 - 212 MobB PF03205.9 140 5.7e-06 18.3 0.4 1 1 8.1e-07 2.5e-05 16.2 0.4 2 37 2 38 1 44 0.78 # 3719 # 4354 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_36 - 344 MobB PF03205.9 140 0.00056 11.9 0.1 1 1 3.3e-05 0.001 11.0 0.1 3 24 162 183 160 195 0.88 # 24842 # 25873 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_10 - 212 LpxK PF02606.9 326 0.00041 11.5 0.2 1 1 1e-05 0.00063 10.9 0.2 37 71 2 35 1 47 0.87 # 3719 # 4354 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_10 - 212 CTP_synth_N PF06418.9 276 1.5e-05 16.4 0.5 1 1 4.2e-07 2.6e-05 15.6 0.5 4 40 2 38 1 43 0.96 # 3719 # 4354 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_10 - 212 ArsA_ATPase PF02374.10 305 3.7e-13 41.3 0.0 1 1 8.4e-15 5.2e-13 40.8 0.0 3 51 2 51 1 86 0.88 # 3719 # 4354 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_10 - 212 PhoH PF02562.11 205 5.5e-05 14.7 0.4 1 1 3.4e-06 0.00011 13.8 0.4 21 53 3 35 1 44 0.83 # 3719 # 4354 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_28 - 421 PhoH PF02562.11 205 0.00051 11.5 0.1 1 1 3.5e-05 0.0011 10.5 0.1 22 45 204 227 192 232 0.85 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_36 - 344 T2SE PF00437.15 272 9.1e-53 171.1 0.0 1 1 3.6e-54 1.1e-52 170.8 0.0 6 265 16 309 11 315 0.92 # 24842 # 25873 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_28 - 421 T2SE PF00437.15 272 0.00013 13.1 0.0 1 1 8.7e-06 0.00027 12.1 0.0 129 155 202 228 168 242 0.85 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_28 - 421 SKI PF01202.17 158 0.0004 12.5 0.0 1 1 1.7e-05 0.001 11.1 0.0 1 33 210 244 210 267 0.76 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_28 - 421 Zeta_toxin PF06414.7 201 2.9e-06 18.7 0.0 1 1 8.3e-08 5.1e-06 17.9 0.0 19 55 204 239 187 277 0.81 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_10 - 212 VirC1 PF07015.6 231 1.4e-09 29.5 0.2 1 1 3.7e-11 2.3e-09 28.9 0.2 6 55 5 54 1 205 0.86 # 3719 # 4354 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_28 - 421 AAA_16 PF13191.1 185 5.6e-06 18.7 0.0 1 1 1.4e-06 2.9e-05 16.3 0.0 25 51 202 228 179 265 0.82 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_10 - 212 AAA_16 PF13191.1 185 2.1e-05 16.8 0.0 1 1 1.3e-06 2.7e-05 16.4 0.0 34 106 11 95 2 157 0.72 # 3719 # 4354 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_43 - 922 AAA_16 PF13191.1 185 0.00026 13.3 0.0 1 1 0.00018 0.0037 9.5 0.0 16 52 531 571 519 794 0.59 # 31242 # 34007 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_43 - 922 AAA_23 PF13476.1 202 0.00036 13.1 0.4 1 1 6.9e-05 0.0022 10.6 0.0 24 50 546 574 535 699 0.72 # 31242 # 34007 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_28 - 421 AAA_23 PF13476.1 202 0.0018 10.8 4.9 1 1 8e-05 0.0025 10.4 2.6 22 39 204 221 175 223 0.86 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_28 - 421 AAA_18 PF13238.1 129 2.6e-08 26.5 0.0 1 1 4.7e-09 1.5e-07 24.1 0.0 1 23 204 231 204 305 0.74 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_10 - 212 AAA_18 PF13238.1 129 0.0002 13.9 0.1 1 1 1.7e-05 0.00054 12.5 0.1 8 115 11 159 3 181 0.68 # 3719 # 4354 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_10 - 212 CbiA PF01656.18 195 4e-21 67.5 0.1 1 1 1.2e-22 7.4e-21 66.6 0.1 1 167 3 151 3 176 0.76 # 3719 # 4354 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_28 - 421 AAA_14 PF13173.1 128 9.8e-06 17.8 0.0 1 1 7e-07 4.3e-05 15.7 0.0 4 46 203 244 200 283 0.63 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_36 - 344 AAA_29 PF13555.1 62 0.00018 13.3 0.0 1 1 1.2e-05 0.00038 12.3 0.0 22 40 158 176 150 181 0.84 # 24842 # 25873 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_28 - 421 AAA_29 PF13555.1 62 0.00053 11.8 0.1 1 1 3.3e-05 0.001 10.9 0.1 24 43 202 221 194 223 0.84 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_28 - 421 AAA PF00004.24 132 1e-15 50.3 0.0 1 1 6.7e-17 4.2e-15 48.4 0.0 1 131 204 315 204 316 0.84 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_36 - 344 DUF258 PF03193.11 161 0.00012 13.5 0.0 1 1 3.3e-06 0.0002 12.8 0.0 22 57 144 181 125 205 0.75 # 24842 # 25873 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_35 - 609 TraG-D_C PF12696.2 128 2.2e-26 84.5 0.0 1 1 6e-28 3.7e-26 83.7 0.0 2 127 414 533 413 534 0.91 # 23029 # 24855 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_10 - 212 AAA_31 PF13614.1 157 3.2e-09 29.1 0.0 1 2 6.4e-09 3.9e-07 22.3 0.0 2 52 2 52 1 57 0.85 # 3719 # 4354 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_10 - 212 AAA_31 PF13614.1 157 3.2e-09 29.1 0.0 2 2 0.0017 0.1 4.7 0.0 116 154 76 113 66 116 0.84 # 3719 # 4354 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_28 - 421 NTPase_1 PF03266.10 168 9e-05 14.5 0.0 1 1 3.6e-06 0.00022 13.2 0.0 2 26 204 228 203 235 0.84 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_28 - 421 AAA_33 PF13671.1 143 7.6e-08 24.6 0.0 1 1 9.1e-09 2.8e-07 22.7 0.0 2 42 204 246 204 272 0.86 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_36 - 344 AAA_33 PF13671.1 143 0.00056 12.0 0.0 1 1 3.5e-05 0.0011 11.1 0.0 3 24 163 184 162 233 0.85 # 24842 # 25873 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_10 - 212 KTI12 PF08433.5 270 1.3e-05 16.7 0.0 1 1 6.9e-07 2.1e-05 16.0 0.0 11 81 11 88 1 101 0.68 # 3719 # 4354 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_28 - 421 KTI12 PF08433.5 270 1.9e-05 16.1 0.0 1 1 1e-06 3.2e-05 15.4 0.0 1 29 201 229 201 264 0.76 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_28 - 421 AAA_30 PF13604.1 196 0.00016 13.5 0.0 1 1 4.4e-06 0.00027 12.8 0.0 17 45 200 234 193 280 0.76 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_36 - 344 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 1.6e-05 16.6 0.0 1 1 4.3e-07 2.7e-05 15.9 0.0 41 59 162 180 129 184 0.88 # 24842 # 25873 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_36 - 344 ABC_tran PF00005.22 137 1e-05 18.1 0.0 1 1 9.1e-07 1.9e-05 17.2 0.0 7 32 155 180 150 199 0.90 # 24842 # 25873 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_43 - 922 ABC_tran PF00005.22 137 0.00021 13.8 0.0 1 1 3.9e-05 0.0008 12.0 0.0 14 45 544 575 531 596 0.80 # 31242 # 34007 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_28 - 421 ABC_tran PF00005.22 137 0.00039 13.0 0.0 1 1 5.3e-05 0.0011 11.5 0.0 13 37 203 227 198 256 0.88 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_28 - 421 RuvB_N PF05496.7 234 3.2e-05 15.2 0.0 1 1 1.2e-06 7.5e-05 14.1 0.0 48 73 199 224 157 232 0.82 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_28 - 421 AAA_19 PF13245.1 76 1.1e-06 20.7 0.0 1 1 8.1e-08 2.5e-06 19.5 0.0 11 35 203 225 197 257 0.80 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_10 - 212 AAA_19 PF13245.1 76 8.1e-05 14.6 0.4 1 1 6.2e-06 0.00019 13.4 0.4 20 49 11 36 2 42 0.82 # 3719 # 4354 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_55 - 71 RA PF00788.18 93 0.00041 13.1 0.0 1 1 6.8e-06 0.00042 13.1 0.0 16 51 29 68 14 70 0.83 # 39614 # 39826 # -1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.347 1_43 - 922 AAA_10 PF12846.2 304 2e-34 111.6 0.8 1 1 1.3e-35 4.1e-34 110.6 0.3 3 298 543 835 542 841 0.86 # 31242 # 34007 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_36 - 344 AAA_10 PF12846.2 304 0.00052 11.7 0.0 1 1 2.6e-05 0.00081 11.0 0.0 3 23 161 181 159 194 0.89 # 24842 # 25873 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_10 - 212 DUF2075 PF09848.4 352 0.00048 11.3 0.0 1 1 1.1e-05 0.00068 10.8 0.0 3 90 2 84 1 87 0.71 # 3719 # 4354 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_49 - 390 TIP49 PF06068.8 398 6.3e-05 14.0 0.0 1 1 3.2e-06 9.8e-05 13.3 0.0 134 186 252 304 237 370 0.82 # 36445 # 37614 # -1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.422 1_28 - 421 TIP49 PF06068.8 398 0.00016 12.6 0.0 1 1 9.5e-06 0.0003 11.8 0.0 49 81 200 232 193 252 0.85 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_28 - 421 PduV-EutP PF10662.4 143 0.0005 11.8 0.0 1 1 1.6e-05 0.001 10.8 0.0 1 23 201 223 201 231 0.90 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_36 - 344 DEAD PF00270.24 169 0.00054 11.7 0.0 1 1 1.9e-05 0.0012 10.6 0.0 8 30 152 175 145 228 0.88 # 24842 # 25873 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_35 - 609 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 5e-21 66.9 0.0 1 1 2.9e-22 9e-21 66.0 0.0 169 380 333 547 312 551 0.83 # 23029 # 24855 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_36 - 344 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 0.00076 10.3 0.0 1 1 3.7e-05 0.0011 9.7 0.0 17 39 161 183 151 200 0.90 # 24842 # 25873 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_1 - 339 AAA_11 PF13086.1 236 0.00042 12.1 0.7 1 1 8.7e-06 0.00054 11.8 0.7 76 158 231 312 126 321 0.76 # 1 # 1017 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.399 1_28 - 421 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.00058 12.2 0.0 1 1 2.5e-05 0.0015 10.8 0.0 21 46 201 226 197 280 0.81 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_35 - 609 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 9.9e-117 382.5 0.0 1 1 2e-118 1.2e-116 382.2 0.0 2 460 101 568 100 577 0.95 # 23029 # 24855 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_36 - 344 Pox_A32 PF04665.7 241 1.2e-05 17.0 0.0 1 1 2.7e-07 1.7e-05 16.4 0.0 15 37 161 183 150 220 0.78 # 24842 # 25873 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_28 - 421 RNA_helicase PF00910.17 107 4.5e-05 15.9 0.0 1 1 3.1e-06 0.00019 13.9 0.0 1 27 204 235 204 252 0.76 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_36 - 344 UPF0079 PF02367.12 123 0.00039 12.3 0.0 1 1 1.1e-05 0.00069 11.5 0.0 8 37 152 181 146 190 0.85 # 24842 # 25873 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_28 - 421 AAA_24 PF13479.1 213 1.8e-05 16.6 0.0 1 1 5.2e-07 3.2e-05 15.8 0.0 5 57 203 260 201 289 0.82 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_47 - 165 TIGR00922 TIGR00922 172 0.00064 11.5 0.0 1 1 1.3e-05 0.0008 11.2 0.0 29 104 27 105 16 134 0.83 # 35155 # 35649 # -1 # ID=1_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.444 1_43 - 922 NACHT PF05729.7 166 6.5e-05 14.9 0.0 1 1 1.3e-05 0.00027 12.8 0.0 5 28 546 569 544 577 0.87 # 31242 # 34007 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_36 - 344 NACHT PF05729.7 166 0.0002 13.2 0.0 1 1 2.4e-05 0.00049 12.0 0.0 2 22 161 181 160 184 0.90 # 24842 # 25873 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 1_10 - 212 NACHT PF05729.7 166 0.00022 13.2 1.4 1 1 2e-05 0.00042 12.2 0.8 3 28 3 29 1 35 0.80 # 3719 # 4354 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_10 - 212 AAA_25 PF13481.1 194 1.3e-05 16.9 1.4 1 1 1.2e-06 2.5e-05 16.0 1.4 42 65 10 34 2 87 0.81 # 3719 # 4354 # -1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.475 1_28 - 421 AAA_25 PF13481.1 194 4.1e-05 15.3 0.0 1 1 3.3e-06 6.9e-05 14.5 0.0 36 58 204 226 195 301 0.80 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_43 - 922 AAA_25 PF13481.1 194 0.00057 11.5 0.0 1 1 6.9e-05 0.0014 10.2 0.0 38 97 546 605 539 665 0.65 # 31242 # 34007 # -1 # ID=1_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_28 - 421 AAA_28 PF13521.1 163 5e-08 25.3 0.0 1 1 1.8e-09 1.1e-07 24.2 0.0 1 40 203 247 203 276 0.70 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_28 - 421 AAA_5 PF07728.9 139 5.5e-06 18.4 0.0 1 1 4.4e-07 2.7e-05 16.1 0.0 2 31 204 233 203 240 0.87 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 1_28 - 421 APS_kinase PF01583.15 157 0.00021 13.2 0.0 1 1 8.3e-06 0.00052 11.9 0.0 5 33 204 232 201 237 0.85 # 19629 # 20891 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b2 (February 2015) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/ec34edba-f0f7-45b4-829e-5e7ccbaef369 # Target file: checkm_output/bins/pm949/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm949/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/ec34edba-f0f7-45b4-829e-5e7ccbaef369 checkm_output/bins/pm949/genes.faa # Current dir: /mnt/DGK_KLIF/data/klif/reads-for-assembly/trainingsets2/combined/rfplasmid_combined_jellynew2 # Date: Tue Jul 7 17:11:28 2020 # [ok]