# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_49 - 213 MipZ PF09140.6 261 7e-07 22.1 1.4 1 1 8.5e-06 0.00046 12.9 1.1 7 134 9 115 3 151 0.66 # 41086 # 41724 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.493 1_19 - 403 MipZ PF09140.6 261 4.3e-06 19.5 1.4 1 2 0.00076 0.041 6.5 0.0 2 49 113 165 112 193 0.73 # 14045 # 15253 # -1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 1_19 - 403 MipZ PF09140.6 261 4.3e-06 19.5 1.4 2 2 2e-05 0.0011 11.6 0.1 90 135 239 284 224 289 0.90 # 14045 # 15253 # -1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 4_12 - 403 MipZ PF09140.6 261 1.2e-05 18.1 2.5 1 2 0.001 0.055 6.1 0.1 2 49 113 165 112 187 0.73 # 10620 # 11828 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 4_12 - 403 MipZ PF09140.6 261 1.2e-05 18.1 2.5 2 2 2.1e-05 0.0012 11.6 0.1 90 135 239 284 226 289 0.90 # 10620 # 11828 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_46 - 605 DUF87 PF01935.12 229 1.8e-21 70.6 0.4 1 1 1.8e-22 2.9e-20 66.6 0.4 10 154 150 378 143 449 0.72 # 36299 # 38113 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 2_31 - 302 NmrA PF05368.8 233 5.7e-44 143.6 0.0 1 1 6.8e-46 1.1e-43 142.7 0.0 1 232 8 235 8 236 0.89 # 29482 # 30387 # 1 # ID=2_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_46 - 605 AAA_22 PF13401.1 131 4.2e-05 17.3 0.0 1 2 0.00017 0.014 9.2 0.0 5 27 164 186 163 264 0.80 # 36299 # 38113 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 1_46 - 605 AAA_22 PF13401.1 131 4.2e-05 17.3 0.0 2 2 0.002 0.16 5.7 0.0 77 106 448 481 383 524 0.76 # 36299 # 38113 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 4_2 - 89 AAA_22 PF13401.1 131 0.0014 12.4 0.1 1 1 2.8e-05 0.0023 11.7 0.1 7 25 62 80 56 87 0.85 # 2928 # 3194 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.401 1_25 - 478 DNA_methylase PF00145.12 335 1.7e-79 260.9 0.0 1 1 2.6e-81 4.3e-79 259.6 0.0 1 331 96 457 96 460 0.86 # 19873 # 21306 # -1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.509 1_48 - 443 AAA_15 PF13175.1 415 5.1e-10 32.4 0.1 1 2 2e-05 0.0016 11.1 0.0 17 43 19 50 5 103 0.74 # 39435 # 40763 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.439 1_48 - 443 AAA_15 PF13175.1 415 5.1e-10 32.4 0.1 2 2 5.3e-08 4.3e-06 19.5 0.0 337 414 177 244 119 245 0.83 # 39435 # 40763 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.439 4_14 - 79 AAA_15 PF13175.1 415 0.00069 12.3 0.1 1 1 9e-06 0.00073 12.2 0.1 372 414 18 57 5 58 0.86 # 13291 # 13527 # 1 # ID=4_14;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.549 4_2 - 89 AAA_17 PF13207.1 121 0.0007 14.0 0.9 1 1 8.8e-06 0.0014 13.0 0.4 2 15 62 75 61 76 0.93 # 2928 # 3194 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.401 1_48 - 443 AAA_21 PF13304.1 303 1.1e-20 68.3 1.8 1 1 9.5e-22 7.7e-20 65.5 1.8 7 303 33 246 27 246 0.70 # 39435 # 40763 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.439 4_14 - 79 AAA_21 PF13304.1 303 0.00026 14.6 0.2 1 1 3.6e-06 0.00029 14.4 0.2 256 301 14 57 8 59 0.88 # 13291 # 13527 # 1 # ID=4_14;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.549 1_49 - 213 ArsA_ATPase PF02374.10 305 0.00051 12.7 0.9 1 1 5e-06 0.00082 12.0 0.9 5 23 7 25 1 35 0.85 # 41086 # 41724 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.493 4_2 - 89 T2SE PF00437.15 272 0.0012 11.4 0.0 1 1 7.3e-06 0.0012 11.4 0.0 127 152 58 84 19 88 0.71 # 2928 # 3194 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.401 1_48 - 443 SMC_N PF02463.14 220 1.3e-05 18.1 0.1 1 2 0.00022 0.018 7.8 0.0 2 45 2 46 1 93 0.86 # 39435 # 40763 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.439 1_48 - 443 SMC_N PF02463.14 220 1.3e-05 18.1 0.1 2 2 0.00014 0.012 8.4 0.0 156 185 197 226 127 248 0.82 # 39435 # 40763 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.439 1_46 - 605 SMC_N PF02463.14 220 0.00026 13.8 0.7 1 1 1.1e-05 0.00093 12.0 0.1 25 53 164 191 156 200 0.84 # 36299 # 38113 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 1_19 - 403 VirC1 PF07015.6 231 0.00014 14.5 0.0 1 2 0.079 6.4 -0.7 0.0 4 24 114 134 112 141 0.80 # 14045 # 15253 # -1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 1_19 - 403 VirC1 PF07015.6 231 0.00014 14.5 0.0 2 2 1.2e-05 0.00093 11.9 0.0 72 140 236 305 214 353 0.78 # 14045 # 15253 # -1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 4_12 - 403 VirC1 PF07015.6 231 0.00017 14.3 0.0 1 2 0.076 6.2 -0.6 0.0 4 24 114 134 112 142 0.80 # 10620 # 11828 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 4_12 - 403 VirC1 PF07015.6 231 0.00017 14.3 0.0 2 2 1.3e-05 0.0011 11.7 0.0 75 140 239 305 214 353 0.79 # 10620 # 11828 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_19 - 403 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.00016 14.5 0.0 1 1 3.3e-06 0.00026 13.8 0.0 8 72 120 189 114 203 0.77 # 14045 # 15253 # -1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 4_12 - 403 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.00027 13.7 0.0 1 1 5.5e-06 0.00044 13.0 0.0 8 68 120 185 114 198 0.77 # 10620 # 11828 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 4_2 - 89 AAA_16 PF13191.1 185 9.1e-05 16.1 0.0 1 1 6.8e-07 0.00011 15.8 0.0 14 47 48 83 39 87 0.81 # 2928 # 3194 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.401 1_48 - 443 AAA_23 PF13476.1 202 3.5e-07 24.3 0.3 1 1 1.2e-08 9.9e-07 22.8 0.1 1 67 4 75 4 189 0.76 # 39435 # 40763 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.439 1_46 - 605 AAA_23 PF13476.1 202 0.00018 15.5 4.3 1 1 7.2e-06 0.00058 13.8 4.0 22 88 166 332 148 504 0.55 # 36299 # 38113 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 4_2 - 89 AAA_18 PF13238.1 129 0.0005 14.0 0.5 1 1 7.6e-06 0.0012 12.7 0.1 1 14 62 75 62 86 0.92 # 2928 # 3194 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.401 1_19 - 403 CbiA PF01656.18 195 1.5e-23 76.7 0.1 1 1 5.9e-25 3.2e-23 75.7 0.0 1 147 114 300 114 350 0.75 # 14045 # 15253 # -1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 4_12 - 403 CbiA PF01656.18 195 2e-23 76.4 0.0 1 1 7.6e-25 4.1e-23 75.4 0.0 1 147 114 300 114 350 0.75 # 10620 # 11828 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_49 - 213 CbiA PF01656.18 195 3.6e-12 39.7 0.9 1 1 2.1e-13 1.1e-11 38.0 0.3 3 170 7 155 5 179 0.70 # 41086 # 41724 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.493 4_2 - 89 AAA_29 PF13555.1 62 9.4e-06 18.7 0.0 1 1 8.1e-08 1.3e-05 18.3 0.0 15 40 50 76 43 83 0.75 # 2928 # 3194 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.401 1_48 - 443 AAA PF00004.24 132 4.4e-05 17.3 0.0 1 2 0.00015 0.024 8.4 0.0 2 22 29 49 28 76 0.75 # 39435 # 40763 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.439 1_48 - 443 AAA PF00004.24 132 4.4e-05 17.3 0.0 2 2 0.00061 0.098 6.5 0.0 34 79 177 217 144 270 0.79 # 39435 # 40763 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.439 4_15 - 82 TK PF00265.13 176 6.5e-05 16.1 0.0 1 1 4.5e-07 7.3e-05 16.0 0.0 69 115 4 50 1 59 0.85 # 14400 # 14645 # 1 # ID=4_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.516 3_21 - 127 Val_tRNA-synt_C PF10458.4 66 0.00073 13.2 0.5 1 1 7.4e-06 0.0012 12.5 0.5 1 21 17 37 17 43 0.86 # 17068 # 17448 # -1 # ID=3_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.496 1_46 - 605 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.001 12.6 0.0 1 1 2.2e-05 0.0035 10.9 0.0 1 63 165 219 165 295 0.66 # 36299 # 38113 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 1_19 - 403 AAA_31 PF13614.1 157 1.3e-07 25.3 0.1 1 2 3.3e-05 0.0018 11.8 0.0 2 91 113 207 112 222 0.83 # 14045 # 15253 # -1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 1_19 - 403 AAA_31 PF13614.1 157 1.3e-07 25.3 0.1 2 2 5.7e-05 0.0031 11.0 0.0 109 148 239 277 232 282 0.87 # 14045 # 15253 # -1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.499 4_12 - 403 AAA_31 PF13614.1 157 1.1e-06 22.3 0.0 1 2 0.00029 0.016 8.8 0.0 2 63 113 177 112 212 0.74 # 10620 # 11828 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 4_12 - 403 AAA_31 PF13614.1 157 1.1e-06 22.3 0.0 2 2 5.7e-05 0.0031 11.0 0.0 109 148 239 277 232 282 0.87 # 10620 # 11828 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.497 1_49 - 213 AAA_31 PF13614.1 157 0.002 11.6 0.3 1 1 0.00024 0.013 9.0 0.1 2 24 4 26 4 34 0.91 # 41086 # 41724 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.493 4_2 - 89 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00099 12.4 0.1 1 1 9.9e-06 0.0016 11.7 0.1 1 18 61 78 61 87 0.78 # 2928 # 3194 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.401 1_46 - 605 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 2.6e-06 20.6 0.0 1 2 9.7e-08 1.6e-05 18.1 0.1 32 61 153 186 132 194 0.80 # 36299 # 38113 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 1_46 - 605 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 2.6e-06 20.6 0.0 2 2 0.042 6.8 -0.3 0.0 99 203 390 515 376 517 0.68 # 36299 # 38113 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 1_48 - 443 ABC_tran PF00005.22 137 4.2e-06 20.7 0.0 1 1 1.9e-06 0.0001 16.2 0.0 4 134 18 207 16 209 0.59 # 39435 # 40763 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.439 4_2 - 89 ABC_tran PF00005.22 137 0.00045 14.1 0.1 1 1 1.3e-05 0.00068 13.5 0.0 7 28 55 76 47 86 0.77 # 2928 # 3194 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.401 1_46 - 605 ABC_tran PF00005.22 137 0.00062 13.7 0.0 1 1 3.6e-05 0.0019 12.1 0.0 12 34 164 186 160 234 0.91 # 36299 # 38113 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 4_2 - 89 AAA_19 PF13245.1 76 0.00018 14.9 0.0 1 1 1.5e-06 0.00024 14.5 0.0 12 35 62 84 50 87 0.82 # 2928 # 3194 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.401 2_31 - 302 NAD_binding_10 PF13460.1 183 5.5e-19 62.4 0.0 1 1 4.5e-21 7.3e-19 62.0 0.0 1 152 8 156 8 186 0.88 # 29482 # 30387 # 1 # ID=2_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_46 - 605 AAA_10 PF12846.2 304 3.3e-18 59.7 0.5 1 1 3.3e-20 5.3e-18 59.0 0.5 1 290 163 537 163 549 0.79 # 36299 # 38113 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 2_31 - 302 3Beta_HSD PF01073.14 280 0.00025 13.4 0.0 1 1 2.5e-06 0.00041 12.7 0.0 2 112 10 104 9 116 0.71 # 29482 # 30387 # 1 # ID=2_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_46 - 605 ResIII PF04851.10 184 0.00049 13.5 0.1 1 2 0.0052 0.85 3.0 0.0 27 47 165 185 146 239 0.78 # 36299 # 38113 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 1_46 - 605 ResIII PF04851.10 184 0.00049 13.5 0.1 2 2 0.00015 0.025 8.0 0.1 110 168 423 484 368 509 0.51 # 36299 # 38113 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 2_31 - 302 Epimerase PF01370.16 236 0.00096 12.2 0.1 1 1 1.2e-05 0.002 11.1 0.0 1 71 8 73 8 95 0.82 # 29482 # 30387 # 1 # ID=2_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 1_46 - 605 DEAD PF00270.24 169 0.00018 14.6 0.0 1 1 1.4e-05 0.0022 11.1 0.0 16 139 165 490 147 512 0.66 # 36299 # 38113 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 1_46 - 605 DUF853 PF05872.7 504 0.00017 13.6 0.0 1 2 0.0012 0.2 3.5 0.0 18 43 160 185 143 190 0.83 # 36299 # 38113 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 1_46 - 605 DUF853 PF05872.7 504 0.00017 13.6 0.0 2 2 5.7e-05 0.0093 7.8 0.0 259 321 464 534 461 570 0.76 # 36299 # 38113 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 1_46 - 605 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 2e-07 23.5 0.0 1 2 9.3e-08 1.5e-05 17.3 0.0 15 63 163 222 152 234 0.86 # 36299 # 38113 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 1_46 - 605 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 2e-07 23.5 0.0 2 2 0.0013 0.21 3.7 0.0 257 283 490 516 482 536 0.89 # 36299 # 38113 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 2_31 - 302 DapB_N PF01113.15 124 0.0012 12.3 0.0 1 1 1.3e-05 0.0021 11.6 0.0 3 42 8 46 6 75 0.77 # 29482 # 30387 # 1 # ID=2_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.504 4_2 - 89 AAA_32 PF13654.1 509 0.0012 11.1 0.0 1 1 7.6e-06 0.0012 11.1 0.0 18 57 48 86 16 88 0.89 # 2928 # 3194 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.401 4_2 - 89 AAA_28 PF13521.1 163 0.001 12.7 0.1 1 1 9.4e-06 0.0015 12.1 0.1 1 16 61 76 61 86 0.88 # 2928 # 3194 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.401 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b2 (February 2015) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/2e66b610-54cb-4791-94de-297c66101205 # Target file: checkm_output/bins/pm859/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm859/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/2e66b610-54cb-4791-94de-297c66101205 checkm_output/bins/pm859/genes.faa # Current dir: /mnt/DGK_KLIF/data/klif/reads-for-assembly/trainingsets2/combined/rfplasmid_combined_jellynew2 # Date: Tue Jul 7 17:10:30 2020 # [ok]