# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 4_18 - 742 cobW PF02492.14 178 0.0012 12.6 0.1 1 1 7.7e-06 0.002 11.8 0.1 2 23 48 71 47 82 0.78 # 13760 # 15985 # -1 # ID=4_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 1_9 - 418 MipZ PF09140.6 261 1.2e-11 38.4 0.1 1 2 2.8e-08 3.6e-06 20.4 0.1 2 39 116 156 115 170 0.78 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 1_9 - 418 MipZ PF09140.6 261 1.2e-11 38.4 0.1 2 2 1.1e-06 0.00014 15.2 0.0 77 126 236 287 213 297 0.75 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 2_2 - 389 MipZ PF09140.6 261 1.1e-05 18.8 0.4 1 2 7e-06 0.00091 12.6 0.0 2 47 108 153 107 157 0.87 # 494 # 1660 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 2_2 - 389 MipZ PF09140.6 261 1.1e-05 18.8 0.4 2 2 0.0023 0.29 4.4 0.0 88 134 224 270 197 292 0.84 # 494 # 1660 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_9 - 418 YhjQ PF06564.7 244 0.0019 11.8 0.2 1 2 0.00059 0.15 5.6 0.1 6 41 119 157 115 170 0.78 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 1_9 - 418 YhjQ PF06564.7 244 0.0019 11.8 0.2 2 2 0.002 0.52 3.8 0.0 115 149 257 291 233 297 0.83 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 2_5 - 180 SSB PF00436.20 104 7.2e-41 132.6 0.4 1 1 7e-43 9.1e-41 132.2 0.4 1 101 6 109 6 112 0.96 # 4002 # 4541 # 1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 1_29 - 126 SSB PF00436.20 104 0.0013 12.8 0.1 1 2 6.7e-05 0.0086 10.2 0.1 2 83 8 87 7 94 0.74 # 36238 # 36615 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.370 1_29 - 126 SSB PF00436.20 104 0.0013 12.8 0.1 2 2 0.066 8.5 0.6 0.0 43 60 92 109 88 112 0.83 # 36238 # 36615 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.370 1_27 - 595 UvrD_C_2 PF13538.1 104 2.2e-12 41.3 0.0 1 1 4e-14 5.2e-12 40.1 0.0 47 103 496 562 450 563 0.79 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 2_50 - 1757 UvrD_C_2 PF13538.1 104 1.7e-07 25.6 0.6 1 2 0.026 3.3 2.2 0.0 6 44 1227 1265 1223 1295 0.74 # 36245 # 41515 # 1 # ID=2_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 2_50 - 1757 UvrD_C_2 PF13538.1 104 1.7e-07 25.6 0.6 2 2 4.7e-08 6e-06 20.6 0.1 3 102 1341 1444 1339 1446 0.82 # 36245 # 41515 # 1 # ID=2_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 1_31 - 353 AAA_2 PF07724.9 171 1.2e-05 19.5 0.0 1 1 1.1e-07 2.9e-05 18.3 0.0 5 83 98 177 95 184 0.74 # 37711 # 38769 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.409 2_29 - 876 DUF87 PF01935.12 229 2.9e-07 24.7 0.0 1 1 3.3e-09 8.4e-07 23.2 0.0 26 222 482 669 468 676 0.77 # 17341 # 19968 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 4_18 - 742 NB-ARC PF00931.17 287 0.0034 10.4 0.9 1 1 6.6e-05 0.017 8.2 0.9 17 110 44 205 30 219 0.72 # 13760 # 15985 # -1 # ID=4_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 4_10 - 487 AAA_22 PF13401.1 131 1.1e-06 23.1 0.0 1 2 7.9e-05 0.02 9.3 0.0 6 27 38 59 34 90 0.84 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 AAA_22 PF13401.1 131 1.1e-06 23.1 0.0 2 2 2.1e-05 0.0054 11.1 0.1 69 121 209 265 163 274 0.75 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 MutS_V PF00488.16 235 3.3e-05 17.6 1.1 1 2 2.9e-05 0.0075 9.9 0.1 37 67 32 60 6 63 0.78 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 MutS_V PF00488.16 235 3.3e-05 17.6 1.1 2 2 0.00063 0.16 5.5 0.1 117 177 222 281 209 301 0.73 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_18 - 742 KAP_NTPase PF07693.9 325 3.6e-72 237.3 0.0 1 1 2.1e-74 5.3e-72 236.7 0.0 1 325 27 334 27 334 0.96 # 13760 # 15985 # -1 # ID=4_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 4_10 - 487 AAA_15 PF13175.1 415 7.2e-15 49.1 18.2 1 2 1e-09 1.3e-07 25.2 0.1 2 47 15 61 14 118 0.81 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 AAA_15 PF13175.1 415 7.2e-15 49.1 18.2 2 2 9e-11 1.2e-08 28.7 10.1 286 411 149 269 137 273 0.72 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 5_3 - 275 AAA_15 PF13175.1 415 5.1e-07 23.2 0.0 1 2 2.9e-05 0.0038 10.5 0.0 23 42 33 52 18 86 0.82 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 5_3 - 275 AAA_15 PF13175.1 415 5.1e-07 23.2 0.0 2 2 2.4e-05 0.0031 10.8 0.0 370 410 159 199 150 201 0.91 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 2_47 - 718 AAA_17 PF13207.1 121 0.00076 14.6 0.0 1 1 2.9e-05 0.0025 12.9 0.0 3 27 189 217 187 284 0.70 # 33376 # 35529 # 1 # ID=2_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.524 4_10 - 487 AAA_17 PF13207.1 121 0.001 14.1 0.0 1 1 4.9e-05 0.0042 12.2 0.0 3 26 40 67 39 154 0.85 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_18 - 742 AAA_17 PF13207.1 121 0.0027 12.8 0.1 1 1 0.0001 0.0087 11.1 0.1 1 43 48 94 48 284 0.87 # 13760 # 15985 # -1 # ID=4_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 4_10 - 487 AAA_21 PF13304.1 303 6.8e-24 79.5 10.4 1 1 1.6e-24 1.4e-22 75.2 7.0 1 297 38 268 38 272 0.66 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 5_3 - 275 AAA_21 PF13304.1 303 1.9e-17 58.4 0.0 1 2 3.8e-09 3.3e-07 24.7 0.0 1 25 34 62 34 99 0.77 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 5_3 - 275 AAA_21 PF13304.1 303 1.9e-17 58.4 0.0 2 2 2.5e-11 2.2e-09 31.9 0.0 232 298 137 200 106 202 0.84 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 4_13 - 713 AAA_21 PF13304.1 303 4.4e-08 27.6 0.2 1 2 2.1e-05 0.0018 12.5 0.0 7 69 29 104 27 211 0.64 # 9292 # 11430 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 4_13 - 713 AAA_21 PF13304.1 303 4.4e-08 27.6 0.2 2 2 2e-05 0.0017 12.6 0.1 219 298 386 487 302 489 0.75 # 9292 # 11430 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 2_29 - 876 MobB PF03205.9 140 0.00065 13.7 0.2 1 2 5.4e-05 0.0069 10.3 0.0 4 37 483 515 481 523 0.79 # 17341 # 19968 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 2_29 - 876 MobB PF03205.9 140 0.00065 13.7 0.2 2 2 0.069 8.9 0.3 0.0 25 64 695 732 690 744 0.86 # 17341 # 19968 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 2_47 - 718 MobB PF03205.9 140 0.0024 11.8 0.0 1 1 5.1e-05 0.0066 10.4 0.0 7 34 192 219 188 225 0.89 # 33376 # 35529 # 1 # ID=2_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.524 2_18 - 122 CTP_transf_2 PF01467.21 157 0.002 12.4 0.0 1 1 8.5e-06 0.0022 12.3 0.0 32 67 7 41 2 98 0.65 # 11865 # 12230 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 1_9 - 418 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.6e-09 31.4 0.8 1 2 0.015 2 1.6 0.0 214 274 14 76 6 87 0.78 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 1_9 - 418 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.6e-09 31.4 0.8 2 2 4.9e-10 6.3e-08 26.2 0.1 8 136 122 269 115 274 0.80 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 2_2 - 389 ArsA_ATPase PF02374.10 305 4.5e-06 20.1 0.4 1 2 3.3e-06 0.00043 13.6 0.1 9 36 115 142 109 151 0.89 # 494 # 1660 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 2_2 - 389 ArsA_ATPase PF02374.10 305 4.5e-06 20.1 0.4 2 2 0.0022 0.29 4.3 0.0 123 136 231 244 221 251 0.84 # 494 # 1660 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_27 - 595 PhoH PF02562.11 205 8e-07 22.7 0.5 1 1 8.8e-08 2.3e-05 17.9 0.5 6 177 5 246 2 258 0.76 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 4_10 - 487 G-alpha PF00503.15 389 0.00069 12.6 0.1 1 2 3.4e-05 0.0087 8.9 0.0 63 86 41 64 33 86 0.89 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 G-alpha PF00503.15 389 0.00069 12.6 0.1 2 2 0.0077 2 1.2 0.3 98 191 163 296 135 326 0.53 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 2_56 - 86 Cytidylate_kin2 PF13189.1 179 0.00039 14.6 0.3 1 1 1.8e-06 0.00046 14.4 0.3 112 155 40 83 30 85 0.85 # 45325 # 45582 # 1 # ID=2_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.496 2_47 - 718 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0017 11.7 0.0 1 1 3.4e-05 0.0088 9.4 0.0 21 49 190 219 182 236 0.85 # 33376 # 35529 # 1 # ID=2_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.524 4_10 - 487 SMC_N PF02463.14 220 6.3e-15 49.2 4.4 1 2 9.8e-10 8.4e-08 25.9 0.2 2 45 14 57 13 61 0.92 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 SMC_N PF02463.14 220 6.3e-15 49.2 4.4 2 2 3e-09 2.6e-07 24.3 0.2 135 208 176 279 123 289 0.69 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 5_3 - 275 SMC_N PF02463.14 220 5.7e-08 26.5 0.2 1 1 1.7e-09 1.4e-07 25.2 0.2 25 198 33 200 21 217 0.75 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 4_13 - 713 SMC_N PF02463.14 220 0.00057 13.4 0.0 1 2 0.0015 0.13 5.7 0.0 5 45 3 42 1 50 0.78 # 9292 # 11430 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 4_13 - 713 SMC_N PF02463.14 220 0.00057 13.4 0.0 2 2 0.0015 0.13 5.6 0.0 135 186 243 470 100 500 0.73 # 9292 # 11430 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 2_2 - 389 VirC1 PF07015.6 231 0.00017 14.9 0.1 1 2 0.00028 0.072 6.3 0.0 4 42 109 147 107 154 0.91 # 494 # 1660 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 2_2 - 389 VirC1 PF07015.6 231 0.00017 14.9 0.1 2 2 0.0003 0.077 6.2 0.1 84 139 235 290 222 312 0.77 # 494 # 1660 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_9 - 418 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.00024 14.6 0.0 1 2 2.7e-06 0.00068 13.1 0.0 7 58 122 176 116 201 0.79 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 1_9 - 418 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.00024 14.6 0.0 2 2 0.1 26 -1.9 0.0 30 65 324 358 321 391 0.61 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 4_10 - 487 Arch_ATPase PF01637.13 234 2.7e-07 24.7 0.7 1 2 2.1e-05 0.0028 11.6 0.0 7 41 24 57 19 71 0.87 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 Arch_ATPase PF01637.13 234 2.7e-07 24.7 0.7 2 2 4e-05 0.0051 10.7 0.4 103 163 212 267 143 287 0.87 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_18 - 742 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.0014 12.6 0.1 1 1 0.00012 0.015 9.2 0.1 20 51 46 80 38 235 0.75 # 13760 # 15985 # -1 # ID=4_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 2_47 - 718 AAA_16 PF13191.1 185 1.2e-05 19.6 0.0 1 1 7.8e-07 5e-05 17.6 0.0 21 60 182 222 179 263 0.81 # 33376 # 35529 # 1 # ID=2_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.524 4_18 - 742 AAA_16 PF13191.1 185 5.1e-05 17.5 3.0 1 1 5.9e-06 0.00038 14.7 1.1 24 175 46 225 36 233 0.49 # 13760 # 15985 # -1 # ID=4_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 4_10 - 487 AAA_16 PF13191.1 185 0.00056 14.2 0.0 1 2 0.00015 0.0095 10.2 0.0 27 46 39 58 34 67 0.87 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 AAA_16 PF13191.1 185 0.00056 14.2 0.0 2 2 0.069 4.4 1.5 0.0 138 166 215 243 186 276 0.74 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 5_3 - 275 AAA_16 PF13191.1 185 0.00056 14.2 0.2 1 1 2.1e-05 0.0014 12.9 0.0 12 63 22 73 15 91 0.72 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 4_10 - 487 AAA_23 PF13476.1 202 5.7e-12 40.6 0.2 1 1 6.6e-14 5.7e-12 40.6 0.2 1 190 16 252 16 280 0.59 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_13 - 713 AAA_23 PF13476.1 202 6.5e-08 27.3 0.5 1 1 2.5e-09 2.1e-07 25.7 0.5 2 177 3 268 2 385 0.68 # 9292 # 11430 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 5_3 - 275 AAA_23 PF13476.1 202 2.8e-05 18.7 0.2 1 1 5.7e-07 4.9e-05 18.0 0.2 21 40 34 53 21 63 0.86 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 6_8 - 370 adh_short PF00106.20 167 0.0018 12.5 0.1 1 1 2.4e-05 0.0063 10.7 0.1 3 49 4 48 2 175 0.83 # 5697 # 6806 # -1 # ID=6_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.383 4_13 - 713 AAA_13 PF13166.1 712 2.3e-26 86.7 0.0 1 3 2.5e-11 3.2e-09 30.0 0.0 15 125 20 147 10 163 0.76 # 9292 # 11430 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 4_13 - 713 AAA_13 PF13166.1 712 2.3e-26 86.7 0.0 2 3 7.5e-06 0.00097 11.9 0.0 240 390 195 383 187 387 0.60 # 9292 # 11430 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 4_13 - 713 AAA_13 PF13166.1 712 2.3e-26 86.7 0.0 3 3 4.9e-15 6.3e-13 42.2 0.0 461 572 376 489 309 509 0.77 # 9292 # 11430 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 5_3 - 275 AAA_13 PF13166.1 712 0.0031 10.2 0.1 1 2 0.0015 0.2 4.2 0.2 23 36 39 52 28 65 0.83 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 5_3 - 275 AAA_13 PF13166.1 712 0.0031 10.2 0.1 2 2 0.0021 0.27 3.8 0.0 529 572 161 202 151 209 0.90 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 2_2 - 389 CbiA PF01656.18 195 2.6e-36 119.1 0.0 1 1 2.7e-38 3.4e-36 118.7 0.0 2 194 110 339 109 340 0.80 # 494 # 1660 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_9 - 418 CbiA PF01656.18 195 1.9e-22 73.8 0.0 1 1 2.2e-24 2.8e-22 73.3 0.0 1 178 117 348 117 365 0.73 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 4_10 - 487 AAA_14 PF13173.1 128 1.5e-05 19.2 0.0 1 2 0.00016 0.04 8.1 0.0 5 27 39 61 36 79 0.84 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 AAA_14 PF13173.1 128 1.5e-05 19.2 0.0 2 2 0.00014 0.035 8.2 0.1 50 102 218 273 172 298 0.67 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 AAA_29 PF13555.1 62 3.1e-10 33.7 0.1 1 2 1.3e-10 1.6e-08 28.2 0.0 15 51 29 64 14 67 0.82 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 AAA_29 PF13555.1 62 3.1e-10 33.7 0.1 2 2 0.012 1.6 2.7 0.1 25 41 356 372 343 375 0.83 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 5_3 - 275 AAA_29 PF13555.1 62 1.9e-06 21.6 0.2 1 1 3.4e-08 4.4e-06 20.4 0.2 18 44 28 53 13 62 0.83 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 4_10 - 487 AAA PF00004.24 132 2.2e-07 25.4 0.1 1 2 0.00025 0.032 8.7 0.0 3 21 41 59 39 105 0.80 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 AAA PF00004.24 132 2.2e-07 25.4 0.1 2 2 6.5e-06 0.00084 13.8 0.2 39 114 208 274 173 288 0.80 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_31 - 353 AAA PF00004.24 132 0.00056 14.4 0.0 1 1 9.4e-06 0.0012 13.3 0.0 1 74 99 178 99 237 0.73 # 37711 # 38769 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.409 1_27 - 595 UvrD_C PF13361.1 351 4.4e-42 139.0 0.0 1 1 3.1e-44 8.1e-42 138.1 0.0 2 348 254 564 253 567 0.86 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 6_8 - 370 KR PF08659.5 181 0.0018 12.2 0.0 1 1 1.3e-05 0.0034 11.3 0.0 4 49 5 51 3 101 0.75 # 5697 # 6806 # -1 # ID=6_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.383 3_5 - 166 Ribosomal_L20 PF00453.13 108 0.00047 14.3 0.1 1 1 3.1e-06 0.00079 13.6 0.1 45 98 67 121 47 128 0.87 # 3362 # 3859 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.536 1_31 - 353 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00032 14.4 0.0 1 1 7.9e-06 0.002 11.8 0.0 20 120 94 189 78 223 0.65 # 37711 # 38769 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.409 5_13 - 426 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 5.7e-18 59.9 0.0 1 2 2e-16 5.1e-14 47.0 0.0 78 200 93 218 64 221 0.87 # 11785 # 13062 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 5_13 - 426 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 5.7e-18 59.9 0.0 2 2 2.2e-05 0.0057 10.9 0.0 48 172 234 375 225 381 0.65 # 11785 # 13062 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 5_3 - 275 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.00095 13.4 0.5 1 1 6.3e-06 0.0016 12.6 0.5 2 21 35 54 34 199 0.75 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 5_3 - 275 DUF258 PF03193.11 161 0.00065 13.1 0.1 1 1 4.8e-06 0.0012 12.3 0.1 26 67 22 64 3 70 0.79 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 2_47 - 718 TraG-D_C PF12696.2 128 1.9e-20 67.3 0.0 1 1 1.3e-22 3.5e-20 66.4 0.0 1 127 419 541 419 542 0.86 # 33376 # 35529 # 1 # ID=2_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.524 2_2 - 389 AAA_31 PF13614.1 157 2.5e-09 31.5 0.0 1 2 2.7e-08 3.5e-06 21.3 0.0 2 49 108 155 107 195 0.91 # 494 # 1660 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 2_2 - 389 AAA_31 PF13614.1 157 2.5e-09 31.5 0.0 2 2 0.00036 0.046 7.9 0.1 110 152 227 268 223 272 0.84 # 494 # 1660 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.471 1_9 - 418 AAA_31 PF13614.1 157 4.6e-08 27.4 0.2 1 2 1.9e-07 2.4e-05 18.5 0.0 9 128 123 270 121 292 0.83 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 1_9 - 418 AAA_31 PF13614.1 157 4.6e-08 27.4 0.2 2 2 0.0018 0.23 5.6 0.1 14 89 299 381 284 410 0.72 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 4_10 - 487 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00011 16.2 0.2 1 2 0.00039 0.1 6.5 0.0 4 22 41 59 39 72 0.83 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00011 16.2 0.2 2 2 0.00029 0.074 7.0 0.3 86 147 219 282 203 295 0.77 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 5_3 - 275 AAA_33 PF13671.1 143 2e-05 18.7 0.1 1 1 3.3e-07 8.6e-05 16.7 0.1 3 33 36 81 34 202 0.61 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 2_50 - 1757 AAA_30 PF13604.1 196 7.7e-44 143.8 14.3 1 2 3.3e-05 0.0017 12.2 4.1 7 147 420 552 416 562 0.82 # 36245 # 41515 # 1 # ID=2_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 2_50 - 1757 AAA_30 PF13604.1 196 7.7e-44 143.8 14.3 2 2 5.1e-43 2.7e-41 135.6 1.1 1 186 968 1156 968 1162 0.94 # 36245 # 41515 # 1 # ID=2_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 1_27 - 595 AAA_30 PF13604.1 196 8.7e-05 16.4 0.3 1 2 7.3e-05 0.0038 11.1 0.0 4 66 6 66 4 90 0.72 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_27 - 595 AAA_30 PF13604.1 196 8.7e-05 16.4 0.3 2 2 0.044 2.3 2.0 0.0 91 132 187 227 162 261 0.83 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 4_10 - 487 AAA_30 PF13604.1 196 0.0011 12.8 0.0 1 1 5.5e-05 0.0028 11.5 0.0 12 44 30 62 26 76 0.85 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 2_47 - 718 AAA_30 PF13604.1 196 0.0015 12.4 0.0 1 1 6.3e-05 0.0033 11.3 0.0 21 57 188 224 180 230 0.85 # 33376 # 35529 # 1 # ID=2_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.524 5_3 - 275 AAA_30 PF13604.1 196 0.0016 12.3 0.3 1 1 7.3e-05 0.0038 11.1 0.1 15 53 29 67 20 82 0.74 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 2_29 - 876 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 1.1e-05 19.3 0.2 1 2 4.1e-06 0.00052 13.7 0.0 39 63 476 504 463 507 0.84 # 17341 # 19968 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 2_29 - 876 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 1.1e-05 19.3 0.2 2 2 0.0077 0.99 3.0 0.1 75 167 530 626 529 632 0.85 # 17341 # 19968 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 4_10 - 487 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00062 13.5 0.0 1 1 9.4e-06 0.0012 12.5 0.0 36 58 34 56 15 63 0.82 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 5_13 - 426 Lycopene_cycl PF05834.7 374 7.1e-05 16.0 0.0 1 1 4.5e-07 0.00012 15.3 0.0 1 144 6 157 6 182 0.73 # 11785 # 13062 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 5_3 - 275 ABC_tran PF00005.22 137 9.7e-30 97.9 0.0 1 1 2.2e-31 1.4e-29 97.4 0.0 1 136 22 169 22 170 0.89 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 4_10 - 487 ABC_tran PF00005.22 137 3.3e-11 37.9 0.3 1 1 1.6e-11 1e-09 33.1 0.3 8 134 33 235 29 237 0.53 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_13 - 713 ABC_tran PF00005.22 137 8e-07 23.7 0.5 1 2 0.0014 0.088 7.3 1.2 19 37 29 47 16 175 0.65 # 9292 # 11430 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 4_13 - 713 ABC_tran PF00005.22 137 8e-07 23.7 0.5 2 2 6.2e-05 0.004 11.7 0.0 87 136 398 452 283 453 0.74 # 9292 # 11430 # 1 # ID=4_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.500 4_18 - 742 ABC_tran PF00005.22 137 5.1e-05 17.8 0.0 1 1 3e-06 0.00019 16.0 0.0 5 36 40 71 37 88 0.89 # 13760 # 15985 # -1 # ID=4_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 5_13 - 426 K_oxygenase PF13434.1 341 7.8e-118 387.5 0.0 1 1 3.6e-120 9.4e-118 387.2 0.0 2 340 4 333 3 334 0.96 # 11785 # 13062 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 6_8 - 370 NAD_binding_4 PF07993.7 249 2.4e-53 174.8 0.0 1 1 1.1e-55 3e-53 174.5 0.0 1 248 6 237 6 238 0.94 # 5697 # 6806 # -1 # ID=6_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.383 1_27 - 595 AAA_19 PF13245.1 76 3.8e-09 30.5 0.0 1 1 1e-09 5.2e-08 26.8 0.0 3 75 12 86 10 87 0.84 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 2_50 - 1757 AAA_19 PF13245.1 76 6.4e-07 23.4 3.1 1 1 2.2e-08 1.2e-06 22.5 0.3 7 76 981 1047 974 1047 0.74 # 36245 # 41515 # 1 # ID=2_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 4_10 - 487 AAA_19 PF13245.1 76 3e-05 18.0 0.0 1 1 1.3e-06 6.7e-05 16.9 0.0 9 37 35 62 30 74 0.84 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_9 - 418 AAA_19 PF13245.1 76 0.00093 13.2 0.0 1 1 4.6e-05 0.0024 11.9 0.0 20 48 125 152 123 182 0.82 # 12048 # 13301 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 4_18 - 742 AAA_19 PF13245.1 76 0.0015 12.6 0.0 1 1 7.1e-05 0.0037 11.3 0.0 10 50 46 85 38 86 0.82 # 13760 # 15985 # -1 # ID=4_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 6_8 - 370 NAD_binding_10 PF13460.1 183 3.6e-06 21.3 0.0 1 1 1.6e-06 0.00042 14.6 0.0 2 148 5 193 4 204 0.70 # 5697 # 6806 # -1 # ID=6_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.383 1_8 - 894 AAA_10 PF12846.2 304 2.2e-65 215.3 0.0 1 1 7.4e-67 3.2e-65 214.7 0.0 1 303 456 812 456 813 0.93 # 5530 # 8211 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.422 2_29 - 876 AAA_10 PF12846.2 304 1e-48 160.6 0.0 1 1 4e-50 1.7e-48 159.8 0.0 1 294 479 768 479 774 0.88 # 17341 # 19968 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 2_47 - 718 AAA_10 PF12846.2 304 3.3e-10 34.1 0.0 1 1 1.4e-10 6.2e-09 29.9 0.0 3 296 187 494 186 499 0.69 # 33376 # 35529 # 1 # ID=2_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.524 4_10 - 487 AAA_10 PF12846.2 304 0.00023 14.9 0.1 1 2 0.00011 0.0046 10.6 0.0 3 22 38 57 36 66 0.87 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 AAA_10 PF12846.2 304 0.00023 14.9 0.1 2 2 0.049 2.1 1.9 0.0 212 262 222 269 204 277 0.83 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 5_3 - 275 AAA_10 PF12846.2 304 0.00047 13.9 1.4 1 1 6e-05 0.0026 11.4 1.0 4 34 35 65 32 158 0.89 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_27 - 595 AAA_10 PF12846.2 304 0.00068 13.3 0.2 1 1 7e-05 0.003 11.2 0.0 1 25 16 40 16 49 0.80 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 5_3 - 275 SbcCD_C PF13558.1 90 1.7e-06 22.1 0.0 1 1 4.7e-08 1.2e-05 19.4 0.0 26 89 135 185 118 186 0.79 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_27 - 595 AAA_12 PF13087.1 200 1.8e-08 28.2 0.0 1 3 0.00079 0.2 5.2 0.0 98 153 33 84 13 94 0.78 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_27 - 595 AAA_12 PF13087.1 200 1.8e-08 28.2 0.0 2 3 0.0028 0.72 3.4 0.0 5 51 240 286 237 391 0.75 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_27 - 595 AAA_12 PF13087.1 200 1.8e-08 28.2 0.0 3 3 5.2e-07 0.00013 15.6 0.0 136 196 497 563 412 567 0.81 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 6_8 - 370 3Beta_HSD PF01073.14 280 1.4e-08 27.9 0.0 1 1 8.7e-11 2.2e-08 27.3 0.0 1 158 5 175 5 196 0.75 # 5697 # 6806 # -1 # ID=6_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.383 1_27 - 595 Viral_helicase1 PF01443.13 234 6e-08 26.7 0.1 1 3 0.0057 0.73 3.5 0.0 2 21 20 39 19 91 0.63 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_27 - 595 Viral_helicase1 PF01443.13 234 6e-08 26.7 0.1 2 3 0.0086 1.1 2.9 0.0 40 135 167 261 132 297 0.74 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_27 - 595 Viral_helicase1 PF01443.13 234 6e-08 26.7 0.1 3 3 5.6e-07 7.2e-05 16.6 0.0 174 232 485 562 400 563 0.67 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 2_50 - 1757 Viral_helicase1 PF01443.13 234 0.0019 11.9 0.0 1 2 0.00067 0.086 6.5 0.0 1 23 988 1011 988 1188 0.79 # 36245 # 41515 # 1 # ID=2_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 2_50 - 1757 Viral_helicase1 PF01443.13 234 0.0019 11.9 0.0 2 2 0.012 1.6 2.4 0.0 167 234 1380 1447 1334 1447 0.64 # 36245 # 41515 # 1 # ID=2_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 5_13 - 426 FMO-like PF00743.14 532 7.1e-06 18.6 0.0 1 2 3.9e-06 0.001 11.5 0.0 142 200 143 198 95 219 0.87 # 11785 # 13062 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 5_13 - 426 FMO-like PF00743.14 532 7.1e-06 18.6 0.0 2 2 0.00035 0.09 5.1 0.0 317 342 319 344 311 377 0.81 # 11785 # 13062 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 5_13 - 426 NAD_binding_9 PF13454.1 156 9e-09 29.5 0.0 1 3 5.8e-08 1.5e-05 19.1 0.0 3 155 10 151 7 152 0.68 # 11785 # 13062 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 5_13 - 426 NAD_binding_9 PF13454.1 156 9e-09 29.5 0.0 2 3 0.02 5.2 1.1 0.0 2 31 186 214 185 229 0.79 # 11785 # 13062 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 5_13 - 426 NAD_binding_9 PF13454.1 156 9e-09 29.5 0.0 3 3 0.00086 0.22 5.5 0.0 116 155 287 332 254 333 0.73 # 11785 # 13062 # 1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.472 6_8 - 370 Epimerase PF01370.16 236 4.6e-12 40.1 0.0 1 1 2.7e-14 7e-12 39.5 0.0 2 174 5 195 4 255 0.70 # 5697 # 6806 # -1 # ID=6_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.383 1_27 - 595 DEAD PF00270.24 169 7.8e-05 16.5 0.7 1 1 3.8e-06 0.00098 12.9 0.7 4 105 8 107 5 222 0.77 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 2_47 - 718 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 5.5e-150 493.5 0.0 1 1 5.2e-152 6.7e-150 493.2 0.0 2 386 172 561 171 561 0.99 # 33376 # 35529 # 1 # ID=2_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.524 2_29 - 876 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1e-06 21.8 0.1 1 2 4.8e-08 6.2e-06 19.2 0.0 15 53 479 517 470 547 0.80 # 17341 # 19968 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 2_29 - 876 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1e-06 21.8 0.1 2 2 0.041 5.2 -0.3 0.0 261 317 713 769 684 772 0.92 # 17341 # 19968 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 2_50 - 1757 AAA_11 PF13086.1 236 0.00024 15.0 1.5 1 1 3.2e-06 0.00084 13.2 0.0 2 72 969 1036 968 1063 0.82 # 36245 # 41515 # 1 # ID=2_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.598 2_47 - 718 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 1.8e-09 30.9 0.0 1 1 3.9e-11 5e-09 29.4 0.0 264 361 382 476 198 500 0.83 # 33376 # 35529 # 1 # ID=2_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.524 2_29 - 876 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 0.00053 12.8 0.0 1 2 0.0031 0.4 3.3 0.0 105 184 533 606 470 625 0.82 # 17341 # 19968 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 2_29 - 876 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 0.00053 12.8 0.0 2 2 0.00021 0.028 7.2 0.0 319 378 711 769 662 771 0.90 # 17341 # 19968 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 2_29 - 876 Pox_A32 PF04665.7 241 0.0022 11.5 0.0 1 1 2.3e-05 0.0059 10.1 0.0 7 38 473 504 469 519 0.85 # 17341 # 19968 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.543 5_14 - 734 Plug PF07715.10 108 1.2e-19 65.0 2.2 1 1 4.8e-22 1.2e-19 64.9 0.6 3 107 45 146 43 147 0.94 # 13144 # 15345 # 1 # ID=5_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.546 4_18 - 742 UPF0079 PF02367.12 123 0.00089 13.1 0.0 1 1 7.9e-06 0.002 12.0 0.0 10 42 41 73 31 81 0.84 # 13760 # 15985 # -1 # ID=4_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 1_27 - 595 UvrD-helicase PF00580.16 315 9.5e-31 101.4 2.9 1 3 5.3e-17 1.4e-14 48.4 0.0 2 105 5 91 4 95 0.92 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_27 - 595 UvrD-helicase PF00580.16 315 9.5e-31 101.4 2.9 2 3 5.5e-18 1.4e-15 51.6 0.3 208 314 145 248 107 249 0.86 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 1_27 - 595 UvrD-helicase PF00580.16 315 9.5e-31 101.4 2.9 3 3 0.028 7.2 -0.0 0.0 92 128 413 455 374 528 0.75 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 4_10 - 487 NACHT PF05729.7 166 7e-06 20.0 0.0 1 2 9.8e-06 0.0013 12.7 0.0 3 40 39 77 37 91 0.77 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_10 - 487 NACHT PF05729.7 166 7e-06 20.0 0.0 2 2 0.0022 0.29 5.0 0.0 73 112 219 251 176 293 0.74 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_18 - 742 NACHT PF05729.7 166 2.2e-05 18.4 1.3 1 2 2.4e-05 0.003 11.4 0.0 2 32 48 78 47 86 0.84 # 13760 # 15985 # -1 # ID=4_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 4_18 - 742 NACHT PF05729.7 166 2.2e-05 18.4 1.3 2 2 0.0041 0.53 4.2 0.0 48 99 478 541 461 582 0.81 # 13760 # 15985 # -1 # ID=4_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.484 4_10 - 487 AAA_25 PF13481.1 194 0.00057 13.6 0.0 1 1 1.5e-05 0.0013 12.4 0.0 30 58 33 61 22 85 0.81 # 6368 # 7828 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 1_27 - 595 AAA_25 PF13481.1 194 0.00089 12.9 0.0 1 1 5.3e-05 0.0046 10.6 0.0 17 63 3 46 1 62 0.78 # 33129 # 34913 # 1 # ID=1_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 5_3 - 275 AAA_25 PF13481.1 194 0.0023 11.6 0.5 1 1 6.5e-05 0.0056 10.3 0.1 30 57 29 56 22 86 0.85 # 1510 # 2334 # 1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.519 1_31 - 353 AAA_5 PF07728.9 139 6.3e-34 110.9 0.0 1 1 3.9e-36 1e-33 110.3 0.0 1 139 98 238 98 238 0.96 # 37711 # 38769 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.409 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b2 (February 2015) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/fba7cb32-f656-457c-a5f2-98616a30ffc7 # Target file: checkm_output/bins/pm839/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm839/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/fba7cb32-f656-457c-a5f2-98616a30ffc7 checkm_output/bins/pm839/genes.faa # Current dir: /mnt/DGK_KLIF/data/klif/reads-for-assembly/trainingsets2/combined/rfplasmid_combined_jellynew2 # Date: Tue Jul 7 17:10:16 2020 # [ok]