# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_21 - 347 Mg_chelatase PF01078.16 207 2.5e-05 16.9 0.1 1 1 9e-07 6.3e-05 15.6 0.0 20 44 122 146 105 158 0.80 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 2_19 - 421 Mg_chelatase PF01078.16 207 2.6e-05 16.8 0.1 1 1 7.3e-07 5.1e-05 15.9 0.1 20 42 199 221 195 225 0.91 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_39 - 234 UPF0020 PF01170.13 180 4.9e-06 19.6 0.0 1 2 5.1e-05 0.0071 9.3 0.0 103 120 17 34 5 80 0.83 # 35905 # 36606 # -1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.608 1_39 - 234 UPF0020 PF01170.13 180 4.9e-06 19.6 0.0 2 2 9.4e-05 0.013 8.4 0.0 28 51 170 193 165 227 0.75 # 35905 # 36606 # -1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.608 2_19 - 421 Parvo_NS1 PF01057.12 272 0.00048 12.4 0.0 1 1 8e-06 0.0011 11.2 0.0 114 134 201 221 195 235 0.88 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_6 - 260 IstB_IS21 PF01695.12 178 1.2e-65 213.6 0.0 1 1 6.6e-67 3.1e-65 212.3 0.0 2 177 56 233 55 234 0.96 # 7464 # 8243 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 2_19 - 421 IstB_IS21 PF01695.12 178 6.9e-06 18.9 0.0 1 1 2.5e-07 1.2e-05 18.2 0.0 49 86 203 237 197 256 0.73 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_21 - 347 IstB_IS21 PF01695.12 178 8.7e-06 18.6 0.0 1 1 4.4e-07 2e-05 17.4 0.0 28 70 105 147 90 171 0.79 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 2_55 - 221 MipZ PF09140.6 261 1e-09 31.2 1.8 1 1 5e-09 3.5e-07 22.9 1.3 2 130 4 111 3 132 0.75 # 40315 # 40977 # -1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_46 - 402 MipZ PF09140.6 261 2.5e-06 20.1 0.0 1 2 0.0053 0.37 3.1 0.0 3 50 111 163 109 193 0.73 # 41971 # 43176 # -1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 1_46 - 402 MipZ PF09140.6 261 2.5e-06 20.1 0.0 2 2 1.6e-06 0.00011 14.6 0.0 86 136 232 282 220 296 0.87 # 41971 # 43176 # -1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 2_4 - 301 3HCDH_N PF02737.13 180 3.5e-07 23.4 0.7 1 1 1.1e-08 1.5e-06 21.3 0.7 1 40 6 45 6 116 0.91 # 2105 # 3007 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 2_4 - 301 GIDA PF01134.17 392 0.007 8.6 3.4 1 1 7e-05 0.0098 8.1 3.4 2 72 7 78 6 90 0.89 # 2105 # 3007 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 1_29 - 181 SSB PF00436.20 104 9.6e-41 131.3 0.2 1 1 8.4e-43 1.2e-40 131.0 0.2 1 99 6 105 6 113 0.96 # 30527 # 31069 # -1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.632 1_21 - 347 AAA_2 PF07724.9 171 4e-07 23.5 0.0 1 1 7.6e-09 1.1e-06 22.1 0.0 5 105 126 220 122 226 0.85 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 1_6 - 260 AAA_22 PF13401.1 131 1.8e-06 21.6 0.0 1 2 1.2e-05 0.00058 13.4 0.1 4 28 101 125 98 148 0.75 # 7464 # 8243 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_6 - 260 AAA_22 PF13401.1 131 1.8e-06 21.6 0.0 2 2 0.0025 0.11 6.0 0.0 77 101 151 178 124 201 0.64 # 7464 # 8243 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 2_19 - 421 AAA_22 PF13401.1 131 4e-06 20.4 0.1 1 1 8.4e-07 3.9e-05 17.2 0.1 7 45 204 234 198 241 0.85 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_21 - 347 AAA_22 PF13401.1 131 1.6e-05 18.5 3.5 1 3 2.6e-05 0.0012 12.4 0.1 7 26 127 146 118 153 0.87 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 1_21 - 347 AAA_22 PF13401.1 131 1.6e-05 18.5 3.5 2 3 0.014 0.68 3.5 0.0 71 117 167 223 152 238 0.66 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 1_21 - 347 AAA_22 PF13401.1 131 1.6e-05 18.5 3.5 3 3 0.05 2.3 1.7 0.3 37 112 245 327 207 338 0.72 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 2_55 - 221 ATP_bind_1 PF03029.12 238 0.0012 11.8 0.2 1 1 0.00015 0.021 7.7 0.2 6 40 13 47 10 115 0.83 # 40315 # 40977 # -1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_12 - 307 Methyltransf_11 PF08241.7 95 2.5e-06 21.3 0.0 1 1 4e-08 5.6e-06 20.2 0.0 49 95 183 229 139 229 0.83 # 12358 # 13278 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.550 3_6 - 478 DNA_methylase PF00145.12 335 3.1e-79 259.8 0.0 1 1 4.4e-81 6.2e-79 258.8 0.0 1 331 96 457 96 460 0.86 # 4427 # 5860 # -1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.481 2_12 - 92 Stn1 PF10451.4 256 0.0015 10.8 0.1 1 1 1.1e-05 0.0015 10.7 0.1 74 123 16 64 5 80 0.88 # 9316 # 9591 # -1 # ID=2_12;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.431 2_19 - 421 SRP54 PF00448.17 196 0.00061 12.6 0.0 1 1 1.4e-05 0.00099 11.9 0.0 3 41 203 239 201 266 0.80 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 2_55 - 221 SRP54 PF00448.17 196 0.0007 12.4 0.1 1 1 2.1e-05 0.0015 11.4 0.1 10 98 12 94 3 134 0.78 # 40315 # 40977 # -1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 5_7 - 79 AAA_15 PF13175.1 415 9.5e-10 31.4 0.0 1 1 6.8e-12 9.6e-10 31.3 0.0 2 46 5 48 4 65 0.89 # 4181 # 4417 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_39 - 234 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 1.6e-32 106.2 0.0 1 2 6.8e-13 9.5e-11 34.9 0.0 1 113 21 130 21 137 0.85 # 35905 # 36606 # -1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.608 1_39 - 234 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 1.6e-32 106.2 0.0 2 2 2e-23 2.8e-21 69.4 0.0 170 227 149 206 135 210 0.92 # 35905 # 36606 # -1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.608 2_19 - 421 AAA_17 PF13207.1 121 1.7e-11 38.4 0.3 1 1 1.7e-12 8e-11 36.2 0.1 1 110 203 304 203 418 0.75 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_21 - 347 AAA_17 PF13207.1 121 3.3e-08 27.8 0.0 1 1 2.5e-09 1.2e-07 26.0 0.0 1 55 126 181 126 324 0.69 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 1_6 - 260 AAA_17 PF13207.1 121 0.00054 14.2 0.0 1 1 2e-05 0.00091 13.4 0.0 2 26 104 131 103 216 0.74 # 7464 # 8243 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 5_7 - 79 AAA_21 PF13304.1 303 4.3e-06 20.2 0.0 1 1 3.4e-08 4.8e-06 20.0 0.0 2 24 27 49 26 69 0.82 # 4181 # 4417 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 2_33 - 257 Adenylsucc_synt PF00709.16 421 0.0026 9.8 4.4 1 2 1.2e-05 0.0016 10.4 0.2 157 229 49 122 31 126 0.75 # 25238 # 26008 # -1 # ID=2_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 2_33 - 257 Adenylsucc_synt PF00709.16 421 0.0026 9.8 4.4 2 2 0.011 1.5 0.7 0.7 142 177 194 230 147 253 0.53 # 25238 # 26008 # -1 # ID=2_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 2_55 - 221 MobB PF03205.9 140 1.5e-05 18.1 0.7 1 2 1e-05 0.0014 11.7 0.3 2 37 4 40 3 52 0.86 # 40315 # 40977 # -1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 2_55 - 221 MobB PF03205.9 140 1.5e-05 18.1 0.7 2 2 0.0016 0.22 4.6 0.0 44 75 85 119 72 133 0.81 # 40315 # 40977 # -1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 2_55 - 221 ArsA_ATPase PF02374.10 305 9.4e-09 28.0 0.1 1 1 1.2e-10 1.7e-08 27.2 0.1 4 43 6 45 3 61 0.91 # 40315 # 40977 # -1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_6 - 260 PhoH PF02562.11 205 4.4e-07 22.7 0.1 1 1 1.5e-08 7e-07 22.0 0.1 14 56 96 138 84 163 0.80 # 7464 # 8243 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_21 - 347 PhoH PF02562.11 205 0.00083 12.0 0.0 1 1 3.6e-05 0.0017 11.0 0.0 19 40 124 145 103 153 0.77 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 2_19 - 421 PhoH PF02562.11 205 0.00086 11.9 0.1 1 1 3.7e-05 0.0017 10.9 0.1 22 45 204 227 192 232 0.85 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_6 - 260 AFG1_ATPase PF03969.11 362 0.00043 12.5 0.0 1 1 5.8e-06 0.00081 11.6 0.0 64 214 103 251 81 258 0.78 # 7464 # 8243 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 2_25 - 345 T2SE PF00437.15 272 7.4e-46 149.5 0.0 1 1 1.9e-47 9e-46 149.3 0.0 12 246 26 286 15 317 0.88 # 19606 # 20640 # -1 # ID=2_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.423 1_21 - 347 T2SE PF00437.15 272 0.00052 12.3 0.0 1 1 1.9e-05 0.0009 11.5 0.0 101 152 100 148 25 151 0.82 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 2_19 - 421 T2SE PF00437.15 272 0.00064 12.0 0.0 1 1 3e-05 0.0014 10.9 0.0 129 155 202 228 167 250 0.85 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_21 - 347 SKI PF01202.17 158 0.00055 13.2 0.2 1 1 3.7e-05 0.0026 11.0 0.0 1 37 133 171 133 179 0.88 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 2_19 - 421 SKI PF01202.17 158 0.0011 12.2 0.0 1 1 3.8e-05 0.0027 11.0 0.0 1 32 210 243 210 266 0.77 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 5_7 - 79 G-alpha PF00503.15 389 0.00052 12.1 0.0 1 1 4e-06 0.00056 12.0 0.0 62 106 28 72 17 76 0.82 # 4181 # 4417 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 2_19 - 421 Zeta_toxin PF06414.7 201 5.5e-06 18.9 0.0 1 1 2.2e-07 1e-05 18.1 0.0 19 56 204 240 191 276 0.81 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_21 - 347 Zeta_toxin PF06414.7 201 3.7e-05 16.3 0.0 1 1 1.8e-06 8.4e-05 15.1 0.0 14 52 122 159 109 183 0.80 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 2_25 - 345 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00056 12.4 0.0 1 1 2.5e-05 0.0012 11.4 0.0 17 59 166 209 153 235 0.76 # 19606 # 20640 # -1 # ID=2_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.423 2_4 - 301 F420_oxidored PF03807.12 96 3e-06 21.0 0.6 1 1 6.5e-08 9.1e-06 19.5 0.2 2 78 7 79 6 98 0.82 # 2105 # 3007 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 5_7 - 79 SMC_N PF02463.14 220 2.9e-11 36.4 0.0 1 1 2.2e-13 3.1e-11 36.3 0.0 2 73 4 72 3 77 0.86 # 4181 # 4417 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 2_55 - 221 VirC1 PF07015.6 231 2e-08 26.9 0.0 1 1 2.6e-10 3.7e-08 26.1 0.0 3 55 4 56 2 61 0.92 # 40315 # 40977 # -1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 2_55 - 221 Fer4_NifH PF00142.13 273 2.1e-06 20.4 0.2 1 1 3.7e-08 5.2e-06 19.2 0.1 6 41 9 44 5 52 0.91 # 40315 # 40977 # -1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 2_19 - 421 AAA_16 PF13191.1 185 1e-05 18.9 0.0 1 1 1.9e-06 9e-05 15.9 0.0 25 51 202 228 191 242 0.81 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_21 - 347 AAA_16 PF13191.1 185 1.3e-05 18.6 1.1 1 1 8.1e-07 3.8e-05 17.1 0.2 25 81 125 182 101 325 0.81 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 1_6 - 260 AAA_16 PF13191.1 185 2.1e-05 18.0 2.4 1 1 3.6e-06 0.00017 15.0 0.1 23 51 100 128 86 149 0.80 # 7464 # 8243 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 5_7 - 79 AAA_23 PF13476.1 202 5e-12 39.9 0.0 1 1 7.5e-14 5.2e-12 39.9 0.0 1 51 6 56 6 73 0.90 # 4181 # 4417 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 2_19 - 421 AAA_23 PF13476.1 202 0.00042 14.0 0.3 1 1 6e-06 0.00042 14.0 0.3 15 39 190 221 181 223 0.76 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 2_19 - 421 AAA_18 PF13238.1 129 2.3e-07 24.6 0.0 1 1 1.3e-08 9e-07 22.7 0.0 1 23 204 228 204 303 0.78 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_21 - 347 AAA_18 PF13238.1 129 4.1e-06 20.5 0.2 1 1 3.7e-07 2.6e-05 17.9 0.0 1 75 127 225 127 261 0.62 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 2_33 - 257 AAA_13 PF13166.1 712 0.00019 13.3 7.2 1 2 1.7e-06 0.00023 13.0 0.0 316 409 29 122 8 141 0.89 # 25238 # 26008 # -1 # ID=2_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 2_33 - 257 AAA_13 PF13166.1 712 0.00019 13.3 7.2 2 2 0.014 2 0.1 5.6 87 155 161 229 146 254 0.40 # 25238 # 26008 # -1 # ID=2_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_46 - 402 CbiA PF01656.18 195 1.5e-18 60.2 0.0 1 1 7.6e-20 3.5e-18 59.0 0.0 1 142 111 292 111 327 0.75 # 41971 # 43176 # -1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 2_55 - 221 CbiA PF01656.18 195 5.5e-15 48.6 0.6 1 1 3.2e-16 1.5e-14 47.2 0.6 2 167 6 155 5 180 0.73 # 40315 # 40977 # -1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_6 - 260 CbiA PF01656.18 195 0.0013 11.5 0.0 1 1 3.8e-05 0.0018 11.1 0.0 3 42 105 145 104 254 0.75 # 7464 # 8243 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_21 - 347 KaiC PF06745.8 227 7.3e-06 18.6 0.0 1 2 1.9e-06 0.00026 13.5 0.0 10 37 115 142 105 147 0.88 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 1_21 - 347 KaiC PF06745.8 227 7.3e-06 18.6 0.0 2 2 0.0035 0.49 2.8 0.0 122 160 192 231 160 253 0.84 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 1_6 - 260 AAA_14 PF13173.1 128 5e-07 23.1 0.0 1 1 5.1e-08 2.4e-06 20.9 0.0 3 97 102 203 100 219 0.64 # 7464 # 8243 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 2_19 - 421 AAA_14 PF13173.1 128 2.6e-05 17.5 0.0 1 1 1.9e-06 8.9e-05 15.8 0.0 4 51 203 251 200 285 0.63 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_21 - 347 AAA_14 PF13173.1 128 0.00023 14.5 0.0 1 1 1e-05 0.00048 13.4 0.0 3 99 125 233 123 259 0.71 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 2_48 - 172 B5 PF03484.10 70 0.00015 14.9 0.0 1 2 0.032 4.5 0.6 0.0 12 38 7 35 1 50 0.76 # 35199 # 35714 # -1 # ID=2_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.411 2_48 - 172 B5 PF03484.10 70 0.00015 14.9 0.0 2 2 1e-05 0.0014 11.9 0.0 16 59 91 144 77 155 0.67 # 35199 # 35714 # -1 # ID=2_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.411 5_7 - 79 AAA_29 PF13555.1 62 9.7e-09 28.1 0.0 1 1 1.7e-10 1.2e-08 27.8 0.0 2 50 5 51 4 57 0.83 # 4181 # 4417 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 2_19 - 421 AAA_29 PF13555.1 62 0.00072 12.5 0.1 1 1 2e-05 0.0014 11.6 0.1 24 43 202 221 193 223 0.84 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_21 - 347 AAA PF00004.24 132 1.1e-32 106.4 0.0 1 2 0.093 4.3 0.9 0.0 76 99 32 55 21 83 0.80 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 1_21 - 347 AAA PF00004.24 132 1.1e-32 106.4 0.0 2 2 2.6e-33 1.2e-31 103.0 0.0 1 130 127 251 127 253 0.94 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 2_19 - 421 AAA PF00004.24 132 1.2e-15 51.3 0.0 1 1 1.2e-16 5.6e-15 49.1 0.0 1 131 204 315 204 316 0.85 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_6 - 260 AAA PF00004.24 132 3e-08 27.3 0.0 1 1 1.2e-09 5.7e-08 26.4 0.0 1 70 104 175 104 207 0.82 # 7464 # 8243 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_6 - 260 Bac_DnaA PF00308.13 219 7.2e-09 28.9 0.0 1 1 7.8e-11 1.1e-08 28.4 0.0 36 136 103 201 90 209 0.84 # 7464 # 8243 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 2_19 - 421 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.0011 11.9 0.0 1 1 1.9e-05 0.0027 10.6 0.0 23 47 202 226 180 246 0.80 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 2_4 - 301 NAD_binding_11 PF14833.1 122 6.6e-38 122.9 0.3 1 2 0.029 4 0.9 1.1 8 53 96 141 92 153 0.85 # 2105 # 3007 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 2_4 - 301 NAD_binding_11 PF14833.1 122 6.6e-38 122.9 0.3 2 2 4.7e-40 6.6e-38 122.9 0.3 1 121 170 289 170 290 0.98 # 2105 # 3007 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 1_6 - 260 DUF258 PF03193.11 161 0.0003 13.4 0.0 1 1 3.7e-06 0.00051 12.6 0.0 26 59 92 125 80 153 0.82 # 7464 # 8243 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 2_24 - 612 TraG-D_C PF12696.2 128 1.4e-28 92.7 0.0 1 1 1.7e-30 2.4e-28 92.0 0.0 2 127 416 534 415 535 0.86 # 17768 # 19603 # -1 # ID=2_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 2_27 - 405 DLIC PF05783.6 472 0.02 6.8 5.0 1 1 0.00026 0.036 6.0 5.0 353 459 90 202 78 209 0.70 # 20836 # 22050 # -1 # ID=2_27;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.489 2_4 - 301 NAD_binding_2 PF03446.10 163 6.1e-41 133.3 3.7 1 1 6.4e-43 9e-41 132.8 3.7 2 162 5 166 4 167 0.96 # 2105 # 3007 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 2_55 - 221 AAA_31 PF13614.1 157 1.1e-06 22.0 0.0 1 2 1.7e-06 0.00012 15.4 0.0 1 41 3 43 3 57 0.90 # 40315 # 40977 # -1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 2_55 - 221 AAA_31 PF13614.1 157 1.1e-06 22.0 0.0 2 2 0.0042 0.3 4.4 0.0 111 151 73 112 63 115 0.83 # 40315 # 40977 # -1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_46 - 402 AAA_31 PF13614.1 157 0.00014 15.2 0.0 1 1 1.1e-05 0.00077 12.8 0.0 108 147 235 273 231 279 0.86 # 41971 # 43176 # -1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 2_19 - 421 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00023 14.3 0.1 1 1 8.1e-06 0.00057 13.0 0.1 2 26 204 228 203 233 0.83 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_6 - 260 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00032 13.8 0.1 1 2 0.003 0.21 4.6 0.1 2 30 104 132 103 143 0.82 # 7464 # 8243 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_6 - 260 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00032 13.8 0.1 2 2 0.0006 0.042 6.9 0.0 87 108 155 176 141 202 0.77 # 7464 # 8243 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 2_19 - 421 AAA_33 PF13671.1 143 1.5e-07 24.8 0.0 1 1 4.2e-09 2.9e-07 23.8 0.0 2 44 204 248 204 282 0.87 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_21 - 347 AAA_33 PF13671.1 143 2.1e-07 24.3 0.0 1 1 9.4e-09 6.6e-07 22.7 0.0 2 91 127 248 127 267 0.71 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 2_19 - 421 KTI12 PF08433.5 270 4.1e-05 16.2 0.0 1 1 4.8e-07 6.7e-05 15.5 0.0 1 29 201 229 201 264 0.76 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_39 - 234 Methyltransf_26 PF13659.1 117 3.7e-11 36.5 0.2 1 2 9.6e-07 4.5e-05 16.9 0.0 63 113 13 70 3 86 0.72 # 35905 # 36606 # -1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.608 1_39 - 234 Methyltransf_26 PF13659.1 117 3.7e-11 36.5 0.2 2 2 5.9e-07 2.8e-05 17.6 0.1 4 44 174 213 171 228 0.80 # 35905 # 36606 # -1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.608 1_12 - 307 Methyltransf_26 PF13659.1 117 0.0005 13.5 0.0 1 1 1.5e-05 0.00069 13.0 0.0 92 113 188 229 92 233 0.80 # 12358 # 13278 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.550 2_4 - 301 Methyltransf_26 PF13659.1 117 0.0034 10.8 6.3 1 1 0.00014 0.0064 9.9 6.3 13 105 14 155 6 246 0.76 # 2105 # 3007 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 2_4 - 301 2-Hacid_dh_C PF02826.14 178 1.5e-06 20.9 0.1 1 1 1.9e-08 2.7e-06 20.0 0.1 36 146 4 118 2 124 0.86 # 2105 # 3007 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 2_19 - 421 AAA_30 PF13604.1 196 0.00019 14.4 0.0 1 1 2.3e-06 0.00033 13.7 0.0 16 45 199 235 192 280 0.74 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 5_7 - 79 DUF2813 PF11398.3 373 2.5e-05 16.8 0.0 1 1 2.1e-07 3e-05 16.6 0.0 11 50 12 52 3 56 0.79 # 4181 # 4417 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 2_19 - 421 ABC_tran PF00005.22 137 0.00052 13.7 0.0 1 1 4.1e-05 0.0014 12.3 0.0 12 37 202 227 189 258 0.88 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_21 - 347 ABC_tran PF00005.22 137 0.00055 13.6 0.0 1 1 5.2e-05 0.0018 12.0 0.0 8 35 121 148 117 176 0.92 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 1_6 - 260 ABC_tran PF00005.22 137 0.00073 13.2 0.2 1 1 8.1e-05 0.0028 11.3 0.1 8 31 98 121 95 132 0.86 # 7464 # 8243 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 5_7 - 79 ABC_tran PF00005.22 137 0.00083 13.1 0.0 1 1 2.5e-05 0.00086 13.0 0.0 15 42 28 55 17 75 0.78 # 4181 # 4417 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_39 - 234 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 5.6e-06 19.2 0.0 1 2 0.00016 0.023 7.4 0.0 113 169 19 77 12 86 0.70 # 35905 # 36606 # -1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.608 1_39 - 234 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 5.6e-06 19.2 0.0 2 2 3.1e-05 0.0044 9.8 0.0 20 60 149 188 142 225 0.73 # 35905 # 36606 # -1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.608 2_4 - 301 UDPG_MGDP_dh_N PF03721.9 185 1e-05 18.4 0.2 1 2 2e-06 0.00028 13.7 0.1 2 39 6 43 5 50 0.92 # 2105 # 3007 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 2_4 - 301 UDPG_MGDP_dh_N PF03721.9 185 1e-05 18.4 0.2 2 2 0.0061 0.85 2.3 0.0 107 139 86 117 82 126 0.77 # 2105 # 3007 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 5_7 - 79 DAP3 PF10236.4 309 0.0013 11.1 0.0 1 1 1e-05 0.0014 10.9 0.0 11 41 12 42 3 47 0.81 # 4181 # 4417 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.540 1_21 - 347 RuvB_N PF05496.7 234 4.4e-05 16.0 0.0 1 1 2e-06 9.4e-05 14.9 0.0 51 78 125 152 86 195 0.79 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 2_19 - 421 RuvB_N PF05496.7 234 4.6e-05 15.9 0.0 1 1 2.3e-06 0.00011 14.7 0.0 47 73 198 224 156 232 0.79 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 2_56 - 221 RuvB_N PF05496.7 234 0.00055 12.4 0.2 1 1 2.3e-05 0.0011 11.4 0.0 78 119 46 86 40 101 0.90 # 41358 # 42020 # 1 # ID=2_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.520 1_21 - 347 AAA_19 PF13245.1 76 1.5e-06 21.3 0.0 1 1 1.1e-07 5e-06 19.6 0.0 10 34 125 148 115 186 0.78 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 2_19 - 421 AAA_19 PF13245.1 76 1.8e-06 21.1 0.0 1 1 8.3e-08 3.9e-06 20.0 0.0 10 35 202 225 197 257 0.79 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_6 - 260 AAA_19 PF13245.1 76 0.00094 12.3 0.2 1 1 7.9e-05 0.0037 10.5 0.0 11 35 103 126 95 157 0.81 # 7464 # 8243 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 2_34 - 918 AAA_10 PF12846.2 304 1e-34 113.7 0.0 1 1 5.5e-36 2.6e-34 112.4 0.0 3 294 539 825 538 832 0.93 # 26018 # 28771 # -1 # ID=2_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.463 2_11 - 93 AAA_10 PF12846.2 304 3e-06 20.2 0.0 1 1 8e-08 3.7e-06 19.9 0.0 241 267 6 32 2 51 0.90 # 9041 # 9319 # -1 # ID=2_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_6 - 260 AAA_10 PF12846.2 304 5.2e-05 16.1 0.2 1 2 0.043 2 1.1 0.0 106 155 28 69 4 89 0.61 # 7464 # 8243 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_6 - 260 AAA_10 PF12846.2 304 5.2e-05 16.1 0.2 2 2 1.3e-05 0.00061 12.6 0.1 3 35 103 135 101 172 0.84 # 7464 # 8243 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_21 - 347 ResIII PF04851.10 184 0.00041 13.6 0.0 1 1 6.2e-06 0.00087 12.5 0.0 22 48 119 147 96 191 0.80 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 1_12 - 307 Methyltransf_31 PF13847.1 152 0.00038 13.4 0.0 1 1 4.8e-06 0.00067 12.7 0.0 66 113 185 234 180 269 0.82 # 12358 # 13278 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.550 1_21 - 347 TIP49 PF06068.8 398 5e-05 15.5 0.1 1 1 1.5e-06 0.0001 14.4 0.0 42 79 115 151 103 176 0.82 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 2_19 - 421 TIP49 PF06068.8 398 0.0004 12.5 0.0 1 1 1e-05 0.00071 11.7 0.0 49 81 200 232 193 253 0.85 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 2_25 - 345 DEAD PF00270.24 169 0.0006 12.7 0.0 1 1 7.8e-06 0.0011 11.9 0.0 7 39 156 188 152 241 0.79 # 19606 # 20640 # -1 # ID=2_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.423 2_24 - 612 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.8e-22 72.8 0.0 1 1 2e-24 2.8e-22 72.2 0.0 165 380 331 548 300 552 0.86 # 17768 # 19603 # -1 # ID=2_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_21 - 347 AAA_11 PF13086.1 236 0.00019 14.4 0.0 1 1 2.9e-06 0.0004 13.3 0.0 14 42 121 153 95 343 0.73 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 2_19 - 421 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.00048 13.6 0.0 1 1 1.9e-05 0.0013 12.2 0.0 21 47 201 227 198 279 0.77 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_6 - 260 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.00055 13.4 0.0 1 1 1.3e-05 0.00088 12.7 0.0 9 64 87 144 84 229 0.70 # 7464 # 8243 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 2_24 - 612 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 2.3e-147 484.6 0.0 1 1 2.1e-149 2.9e-147 484.3 0.0 2 462 102 572 101 580 0.98 # 17768 # 19603 # -1 # ID=2_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 2_55 - 221 ArgK PF03308.11 267 0.00077 11.6 0.1 1 2 1.6e-05 0.0022 10.1 0.1 37 66 11 40 3 45 0.88 # 40315 # 40977 # -1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 2_55 - 221 ArgK PF03308.11 267 0.00077 11.6 0.1 2 2 0.071 9.9 -1.8 0.0 154 174 88 107 63 144 0.54 # 40315 # 40977 # -1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_12 - 307 Methyltransf_23 PF13489.1 161 0.00061 12.9 0.0 1 1 7.1e-06 0.001 12.2 0.0 74 115 186 231 80 253 0.63 # 12358 # 13278 # 1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.550 2_55 - 221 GTP_EFTU PF00009.22 188 3.3e-07 23.3 0.1 1 1 2.6e-09 3.7e-07 23.1 0.1 15 139 15 153 6 211 0.72 # 40315 # 40977 # -1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_21 - 347 RNA_helicase PF00910.17 107 2.7e-05 17.7 0.0 1 1 9e-07 6.3e-05 16.5 0.0 1 106 127 232 127 233 0.82 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 2_19 - 421 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00015 15.4 0.0 1 1 7.9e-06 0.00055 13.5 0.0 1 26 204 229 204 253 0.77 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 2_4 - 301 TrkA_N PF02254.13 116 4.7e-05 16.8 0.0 1 1 8e-07 0.00011 15.6 0.0 1 42 7 48 7 79 0.86 # 2105 # 3007 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 2_20 - 165 Nup35_RRM PF05172.8 101 0.0015 11.7 0.0 1 1 1.6e-05 0.0022 11.1 0.0 28 73 94 137 84 144 0.86 # 16074 # 16568 # -1 # ID=2_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.491 2_4 - 301 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 0.00018 14.5 1.6 1 2 4.2e-06 0.00059 12.8 0.1 21 66 5 50 2 62 0.90 # 2105 # 3007 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 2_4 - 301 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 0.00018 14.5 1.6 2 2 0.028 3.9 0.4 0.2 13 42 84 113 72 117 0.84 # 2105 # 3007 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 1_17 - 137 tRNA_anti-codon PF01336.20 75 5.3e-05 16.5 0.0 1 2 0.023 3.2 1.1 0.0 43 62 61 80 51 83 0.80 # 17314 # 17724 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_17 - 137 tRNA_anti-codon PF01336.20 75 5.3e-05 16.5 0.0 2 2 1.9e-06 0.00026 14.2 0.0 3 68 71 129 69 135 0.82 # 17314 # 17724 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 2_19 - 421 AAA_24 PF13479.1 213 3.9e-05 16.7 0.0 1 1 1.5e-06 7.2e-05 15.8 0.0 5 56 203 259 201 291 0.80 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_21 - 347 AAA_24 PF13479.1 213 0.0008 12.4 0.1 1 1 4.6e-05 0.0021 11.0 0.1 5 23 126 144 124 154 0.84 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 1_6 - 260 AAA_24 PF13479.1 213 0.0018 11.2 0.1 1 1 9.1e-05 0.0043 10.0 0.1 5 23 103 121 99 127 0.85 # 7464 # 8243 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_17 - 137 BOF PF04076.8 103 4.3e-22 71.3 0.3 1 1 4.2e-24 5.9e-22 70.9 0.2 9 102 40 134 29 135 0.85 # 17314 # 17724 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 2_38 - 217 TIGR00922 TIGR00922 172 1.7e-07 24.3 0.0 1 1 2.6e-09 3.6e-07 23.2 0.0 55 109 98 152 50 169 0.86 # 29947 # 30597 # -1 # ID=2_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.415 1_6 - 260 NACHT PF05729.7 166 0.00018 14.6 0.0 1 1 2.1e-06 0.00029 13.9 0.0 3 49 104 151 102 200 0.81 # 7464 # 8243 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_6 - 260 AAA_25 PF13481.1 194 1e-06 21.7 0.1 1 1 8.9e-08 3.1e-06 20.1 0.1 9 60 72 128 68 201 0.77 # 7464 # 8243 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_21 - 347 AAA_25 PF13481.1 194 2.7e-05 17.0 0.3 1 1 2.5e-06 8.8e-05 15.3 0.1 28 56 120 147 97 176 0.83 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 2_19 - 421 AAA_25 PF13481.1 194 7.7e-05 15.5 0.0 1 1 4e-06 0.00014 14.7 0.0 36 58 204 226 197 311 0.80 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 2_25 - 345 AAA_25 PF13481.1 194 0.00043 13.1 0.0 1 1 1.9e-05 0.00067 12.5 0.0 21 52 152 183 137 226 0.87 # 19606 # 20640 # -1 # ID=2_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.423 1_39 - 234 Methyltransf_15 PF09445.5 164 0.001 12.0 0.0 1 2 0.023 3.2 0.6 0.0 53 80 4 30 2 38 0.91 # 35905 # 36606 # -1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.608 1_39 - 234 Methyltransf_15 PF09445.5 164 0.001 12.0 0.0 2 2 7e-05 0.0098 8.8 0.0 3 30 173 200 171 213 0.90 # 35905 # 36606 # -1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.608 2_19 - 421 AAA_28 PF13521.1 163 1.6e-07 24.8 0.0 1 1 7.4e-09 3.5e-07 23.7 0.0 1 40 203 247 203 276 0.71 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_21 - 347 AAA_28 PF13521.1 163 9.7e-06 19.0 0.1 1 1 5.4e-07 2.5e-05 17.7 0.0 1 51 126 177 126 257 0.86 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 1_6 - 260 AAA_28 PF13521.1 163 0.00035 13.9 0.0 1 1 1.5e-05 0.0007 13.0 0.0 1 49 103 156 103 171 0.73 # 7464 # 8243 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 1_21 - 347 AAA_5 PF07728.9 139 2.2e-06 20.9 3.4 1 1 1.8e-07 8.3e-06 19.0 0.3 2 37 127 162 126 245 0.64 # 23863 # 24903 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 2_19 - 421 AAA_5 PF07728.9 139 6.1e-06 19.4 0.0 1 1 6.3e-07 2.9e-05 17.2 0.0 2 31 204 233 203 274 0.93 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_6 - 260 AAA_5 PF07728.9 139 2.6e-05 17.4 0.0 1 1 1.4e-06 6.4e-05 16.1 0.0 1 74 103 172 103 177 0.80 # 7464 # 8243 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 2_19 - 421 APS_kinase PF01583.15 157 0.00052 13.1 0.0 1 1 8.7e-06 0.0012 11.9 0.0 5 33 204 232 201 237 0.85 # 14729 # 15991 # -1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b2 (February 2015) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/1bcf317c-0f6f-4afc-97b3-9c3bcd6fd1d0 # Target file: checkm_output/bins/pm673/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm673/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/1bcf317c-0f6f-4afc-97b3-9c3bcd6fd1d0 checkm_output/bins/pm673/genes.faa # Current dir: /mnt/DGK_KLIF/data/klif/reads-for-assembly/trainingsets2/combined/rfplasmid_combined_jellynew2 # Date: Tue Jul 7 17:08:29 2020 # [ok]