# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 16_2 - 150 IstB_IS21 PF01695.12 178 1.9e-34 113.0 0.1 1 1 1.2e-35 6.8e-34 111.1 0.0 1 90 51 140 51 148 0.96 # 163 # 612 # 1 # ID=16_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.504 7_3 - 119 IstB_IS21 PF01695.12 178 7.1e-30 98.0 0.0 1 1 1.6e-31 8.9e-30 97.7 0.0 100 178 14 94 8 94 0.91 # 1104 # 1460 # 1 # ID=7_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 7_2 - 311 IstB_IS21 PF01695.12 178 1.3e-26 87.5 0.0 1 1 3.8e-28 2.1e-26 86.7 0.0 112 178 219 286 213 286 0.97 # 167 # 1099 # 1 # ID=7_2;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.535 2_17 - 78 IstB_IS21 PF01695.12 178 3.1e-13 43.8 0.0 1 1 6e-15 3.3e-13 43.7 0.0 1 62 11 72 11 77 0.92 # 8207 # 8440 # -1 # ID=2_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.487 16_3 - 62 IstB_IS21 PF01695.12 178 2.5e-11 37.6 0.0 1 1 5.6e-13 3.1e-11 37.3 0.0 143 178 1 37 1 37 0.95 # 744 # 929 # 1 # ID=16_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.500 7_5 - 400 MipZ PF09140.6 261 3.6e-08 27.1 0.1 1 2 0.0004 0.11 5.8 0.0 2 48 110 161 109 186 0.76 # 2187 # 3386 # 1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.443 7_5 - 400 MipZ PF09140.6 261 3.6e-08 27.1 0.1 2 2 3.8e-08 1e-05 19.0 0.0 88 135 234 281 216 288 0.87 # 2187 # 3386 # 1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.443 7_5 - 400 YhjQ PF06564.7 244 0.0014 12.3 0.7 1 3 0.076 21 -1.3 0.0 175 199 28 53 2 95 0.53 # 2187 # 3386 # 1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.443 7_5 - 400 YhjQ PF06564.7 244 0.0014 12.3 0.7 2 3 0.038 10 -0.4 0.0 9 46 116 159 110 169 0.63 # 2187 # 3386 # 1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.443 7_5 - 400 YhjQ PF06564.7 244 0.0014 12.3 0.7 3 3 3.7e-05 0.01 9.5 0.0 106 183 235 311 215 322 0.78 # 2187 # 3386 # 1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.443 3_10 - 954 UvrD_C_2 PF13538.1 104 4.1e-07 24.5 1.0 1 1 5.1e-08 6.9e-06 20.5 1.0 46 104 451 553 409 553 0.73 # 7342 # 10203 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.510 4_6 - 1627 UvrD_C_2 PF13538.1 104 8.3e-07 23.5 0.4 1 2 0.032 4.4 1.9 0.0 6 44 1097 1135 1093 1165 0.75 # 2951 # 7831 # 1 # ID=4_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.601 4_6 - 1627 UvrD_C_2 PF13538.1 104 8.3e-07 23.5 0.4 2 2 2.3e-07 3.2e-05 18.4 0.1 3 102 1211 1314 1209 1316 0.73 # 2951 # 7831 # 1 # ID=4_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.601 1_39 - 431 DUF87 PF01935.12 229 0.00053 14.2 0.1 1 1 7e-06 0.0019 12.3 0.0 24 45 153 174 152 183 0.92 # 26538 # 27830 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.393 3_10 - 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