# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_50 - 352 Mg_chelatase PF01078.16 207 3.5e-06 18.8 0.0 1 1 8.5e-08 6.3e-06 17.9 0.0 9 53 171 214 166 244 0.81 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_45 - 513 Rad17 PF03215.10 519 0.00067 10.8 0.0 1 1 1.4e-05 0.0011 10.2 0.0 42 69 231 258 220 275 0.79 # 33138 # 34676 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.480 1_50 - 352 IstB_IS21 PF01695.12 178 2.1e-05 16.5 0.0 1 1 5.2e-07 3.9e-05 15.6 0.0 44 68 180 204 155 238 0.91 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_8 - 222 MipZ PF09140.6 261 6.9e-13 40.7 0.4 1 1 1.9e-12 1.4e-10 33.1 0.4 3 131 5 112 3 133 0.81 # 5576 # 6241 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_50 - 352 NB-ARC PF00931.17 287 0.0002 12.7 0.0 1 1 6.2e-06 0.00046 11.5 0.0 11 40 175 204 165 213 0.84 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_45 - 513 AAA_22 PF13401.1 131 1.2e-05 18.0 0.0 1 1 6.7e-07 2.5e-05 16.9 0.0 4 28 234 258 230 330 0.82 # 33138 # 34676 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.480 1_50 - 352 AAA_22 PF13401.1 131 0.00011 14.8 0.0 1 1 1.6e-05 0.00059 12.5 0.0 6 30 185 209 177 251 0.80 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_50 - 352 ATP_bind_1 PF03029.12 238 0.00036 12.6 0.0 1 1 9.6e-06 0.00071 11.6 0.0 1 25 188 212 188 219 0.85 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_8 - 222 SRP54 PF00448.17 196 3e-05 16.0 0.1 1 1 1.3e-06 9.9e-05 14.3 0.1 11 56 13 54 4 104 0.66 # 5576 # 6241 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_50 - 352 AAA_17 PF13207.1 121 5.2e-07 23.0 0.0 1 1 4.6e-08 1.1e-06 21.9 0.0 3 38 187 235 185 306 0.66 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_45 - 513 AAA_17 PF13207.1 121 4.8e-06 19.9 0.0 1 1 4.3e-07 1.1e-05 18.8 0.0 1 35 236 276 236 370 0.66 # 33138 # 34676 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.480 1_8 - 222 AAA_17 PF13207.1 121 6e-06 19.6 0.0 1 1 7e-07 1.7e-05 18.1 0.0 9 101 13 111 12 128 0.60 # 5576 # 6241 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_50 - 352 AAA_21 PF13304.1 303 9.4e-05 14.9 0.0 1 1 3.4e-06 0.00025 13.5 0.0 3 29 187 214 186 328 0.86 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_50 - 352 Miro PF08477.8 119 0.00025 14.0 0.0 1 1 7.5e-06 0.00056 12.9 0.0 2 95 186 300 185 316 0.75 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_8 - 222 MobB PF03205.9 140 3.2e-07 22.6 0.1 1 2 1.3e-06 4.7e-05 15.6 0.1 10 38 13 41 3 48 0.81 # 5576 # 6241 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_8 - 222 MobB PF03205.9 140 3.2e-07 22.6 0.1 2 2 0.0025 0.091 5.0 0.0 44 75 85 119 75 137 0.78 # 5576 # 6241 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_50 - 352 MobB PF03205.9 140 0.00031 13.0 0.0 1 1 5.4e-05 0.002 10.3 0.0 4 24 187 207 185 221 0.81 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_8 - 222 ArsA_ATPase PF02374.10 305 9.9e-07 20.5 0.0 1 1 2.2e-08 1.6e-06 19.8 0.0 4 39 6 41 3 55 0.88 # 5576 # 6241 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_50 - 352 T2SE PF00437.15 272 1.3e-65 213.4 0.0 1 1 6.4e-67 1.6e-65 213.1 0.0 5 266 29 327 26 333 0.95 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_45 - 513 T2SE PF00437.15 272 3.9e-39 126.6 0.0 1 1 2.4e-40 6e-39 126.0 0.0 66 271 166 385 151 386 0.87 # 33138 # 34676 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.480 1_54 - 786 T2SE PF00437.15 272 0.00047 11.5 0.0 1 1 5.2e-05 0.0013 10.1 0.0 124 155 421 450 403 461 0.79 # 44073 # 46430 # -1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 1_50 - 352 G-alpha PF00503.15 389 4.2e-07 21.4 0.0 1 1 1.5e-08 1.1e-06 20.0 0.0 44 124 169 260 147 344 0.78 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_50 - 352 Zeta_toxin PF06414.7 201 3.6e-05 15.4 0.0 1 1 2.3e-06 8.7e-05 14.1 0.0 14 47 181 215 168 231 0.82 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_45 - 513 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00047 11.8 0.0 1 1 2.4e-05 0.00089 10.8 0.0 18 39 236 257 222 270 0.85 # 33138 # 34676 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.480 1_8 - 222 VirC1 PF07015.6 231 1.7e-08 26.2 0.0 1 1 4.8e-10 3.6e-08 25.2 0.0 5 55 6 56 3 61 0.93 # 5576 # 6241 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_8 - 222 Fer4_NifH PF00142.13 273 3.8e-06 18.7 0.1 1 1 9e-08 6.7e-06 17.9 0.1 8 41 11 44 6 74 0.92 # 5576 # 6241 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_45 - 513 Arch_ATPase PF01637.13 234 9.4e-05 14.6 0.0 1 1 2.6e-06 0.00019 13.6 0.0 8 43 223 257 221 270 0.90 # 33138 # 34676 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.480 1_45 - 513 AAA_16 PF13191.1 185 6.8e-06 18.6 0.1 1 1 4.2e-07 1.6e-05 17.5 0.1 8 49 222 259 221 382 0.84 # 33138 # 34676 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.480 1_50 - 352 AAA_16 PF13191.1 185 0.00014 14.4 0.0 1 1 5.9e-06 0.00022 13.7 0.0 24 51 183 210 155 235 0.79 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_50 - 352 AAA_23 PF13476.1 202 1.3e-06 21.3 0.0 1 1 7.6e-08 2.8e-06 20.2 0.0 22 40 186 204 169 210 0.91 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_45 - 513 AAA_23 PF13476.1 202 1.8e-05 17.6 0.0 1 1 1.8e-06 6.7e-05 15.7 0.0 19 36 234 251 218 279 0.88 # 33138 # 34676 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.480 1_50 - 352 AAA_18 PF13238.1 129 4.4e-06 19.5 0.0 1 1 3.4e-07 8.4e-06 18.6 0.0 2 56 187 243 187 278 0.71 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_45 - 513 AAA_18 PF13238.1 129 3.3e-05 16.7 0.0 1 1 4.1e-06 0.0001 15.1 0.0 1 29 237 269 237 362 0.90 # 33138 # 34676 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.480 1_8 - 222 AAA_18 PF13238.1 129 4.7e-05 16.2 0.0 1 1 3.3e-06 8.1e-05 15.4 0.0 8 79 13 86 12 110 0.66 # 5576 # 6241 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_8 - 222 CbiA PF01656.18 195 2.3e-19 62.0 0.3 1 1 1.4e-20 5.2e-19 60.9 0.3 2 174 6 161 5 182 0.70 # 5576 # 6241 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_23 - 234 CbiA PF01656.18 195 0.00023 13.0 2.3 1 2 4.1e-05 0.0015 10.4 0.4 1 20 5 24 5 86 0.92 # 13326 # 14027 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.345 1_23 - 234 CbiA PF01656.18 195 0.00023 13.0 2.3 2 2 0.0094 0.35 2.7 0.2 117 171 93 145 36 169 0.81 # 13326 # 14027 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.345 1_23 - 234 AAA_14 PF13173.1 128 0.00012 14.5 0.2 1 1 8.5e-06 0.00031 13.1 0.1 13 68 14 70 11 97 0.67 # 13326 # 14027 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.345 1_45 - 513 AAA_14 PF13173.1 128 0.00012 14.4 0.0 1 1 8.8e-06 0.00033 13.1 0.0 3 39 235 268 233 341 0.80 # 33138 # 34676 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.480 1_50 - 352 AAA_29 PF13555.1 62 1.1e-06 20.6 0.0 1 1 6.8e-08 2.5e-06 19.5 0.0 25 51 185 211 174 216 0.86 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_45 - 513 AAA_29 PF13555.1 62 2e-05 16.6 0.0 1 1 1.2e-06 4.3e-05 15.5 0.0 19 40 231 251 221 257 0.82 # 33138 # 34676 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.480 1_50 - 352 AAA PF00004.24 132 4.2e-05 16.2 0.0 1 1 1.3e-06 9.8e-05 15.1 0.0 2 31 187 216 186 263 0.62 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_50 - 352 Sigma54_activat PF00158.21 168 3.2e-06 19.2 0.0 1 2 5e-07 3.7e-05 15.7 0.0 10 46 171 207 163 223 0.81 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_50 - 352 Sigma54_activat PF00158.21 168 3.2e-06 19.2 0.0 2 2 0.017 1.2 1.0 0.0 42 91 234 284 229 291 0.76 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_23 - 234 MMR_HSR1 PF01926.18 116 4e-05 16.1 0.1 1 1 9e-07 6.7e-05 15.4 0.1 9 85 13 98 11 175 0.61 # 13326 # 14027 # -1 # ID=1_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.345 1_49 - 571 TraG-D_C PF12696.2 128 1.7e-27 88.3 0.0 1 1 4.5e-29 3.4e-27 87.4 0.0 2 127 345 469 344 470 0.87 # 38234 # 39946 # -1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.423 1_8 - 222 AAA_31 PF13614.1 157 1.7e-07 23.7 0.1 1 2 1.7e-06 0.00013 14.4 0.0 3 41 5 43 3 57 0.87 # 5576 # 6241 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_8 - 222 AAA_31 PF13614.1 157 1.7e-07 23.7 0.1 2 2 0.00027 0.02 7.3 0.0 106 151 68 112 63 115 0.90 # 5576 # 6241 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_45 - 513 AAA_33 PF13671.1 143 0.00029 13.2 0.0 1 1 9.2e-06 0.00068 12.0 0.0 2 81 237 325 236 337 0.63 # 33138 # 34676 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.480 1_8 - 222 KTI12 PF08433.5 270 0.00036 12.2 0.1 1 1 9.8e-06 0.00072 11.2 0.1 11 41 13 43 4 57 0.81 # 5576 # 6241 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_45 - 513 AAA_30 PF13604.1 196 4.1e-07 22.2 0.0 1 1 2e-08 7.5e-07 21.4 0.0 3 42 219 258 217 267 0.92 # 33138 # 34676 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.480 1_50 - 352 AAA_30 PF13604.1 196 0.00028 13.0 0.0 1 1 1.3e-05 0.00048 12.2 0.0 10 42 176 207 168 216 0.74 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_50 - 352 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 7.3e-06 18.0 0.0 1 1 3.4e-07 1.3e-05 17.3 0.0 20 58 163 203 150 205 0.82 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_54 - 786 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00017 13.5 0.2 1 1 8.5e-06 0.00032 12.7 0.2 39 54 418 439 380 442 0.78 # 44073 # 46430 # -1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 1_50 - 352 ABC_tran PF00005.22 137 4.9e-07 22.6 0.0 1 1 2.6e-08 9.8e-07 21.6 0.0 14 73 186 243 178 310 0.78 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_45 - 513 ABC_tran PF00005.22 137 0.00018 14.3 0.0 1 1 1.3e-05 0.00047 13.0 0.0 12 37 235 260 228 338 0.89 # 33138 # 34676 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.480 1_50 - 352 AAA_19 PF13245.1 76 5.4e-07 21.8 0.0 1 1 2.5e-08 9.2e-07 21.1 0.0 5 35 178 207 174 287 0.86 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_45 - 513 AAA_19 PF13245.1 76 1.5e-05 17.2 0.0 1 1 1.8e-06 6.6e-05 15.1 0.0 5 35 228 258 224 281 0.82 # 33138 # 34676 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.480 1_54 - 786 AAA_10 PF12846.2 304 1.5e-22 72.8 0.0 1 1 2.4e-23 6e-22 70.8 0.0 2 291 424 698 423 709 0.78 # 44073 # 46430 # -1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 1_50 - 352 AAA_10 PF12846.2 304 0.0001 14.3 0.0 1 1 8.1e-06 0.0002 13.3 0.0 3 34 185 216 183 224 0.81 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_45 - 513 AAA_10 PF12846.2 304 0.0007 11.5 0.1 1 1 5.5e-05 0.0014 10.6 0.1 4 26 237 259 234 264 0.85 # 33138 # 34676 # -1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.480 1_50 - 352 ResIII PF04851.10 184 0.00025 13.4 0.0 1 1 6.6e-06 0.00049 12.4 0.0 22 49 174 206 140 223 0.76 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_50 - 352 PduV-EutP PF10662.4 143 1.4e-05 17.1 0.0 1 2 0.00041 0.03 6.3 0.0 103 135 12 44 6 48 0.87 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_50 - 352 PduV-EutP PF10662.4 143 1.4e-05 17.1 0.0 2 2 0.00013 0.0095 7.9 0.0 5 22 187 204 184 212 0.90 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_54 - 786 DUF853 PF05872.7 504 0.0006 10.6 0.0 1 1 1.3e-05 0.00099 9.9 0.0 19 36 421 438 409 459 0.79 # 44073 # 46430 # -1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 1_49 - 571 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.9e-19 61.9 0.0 1 2 2.6e-07 9.7e-06 16.8 0.0 74 128 139 195 136 213 0.83 # 38234 # 39946 # -1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.423 1_49 - 571 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.9e-19 61.9 0.0 2 2 2.6e-15 9.5e-14 43.2 0.0 163 369 258 472 205 480 0.82 # 38234 # 39946 # -1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.423 1_50 - 352 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 0.00039 11.5 0.0 1 1 2.2e-05 0.0008 10.5 0.0 15 36 183 204 176 218 0.85 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_50 - 352 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.00059 12.4 0.0 1 1 1.5e-05 0.0011 11.5 0.0 13 42 175 204 164 224 0.89 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_34 - 257 TIGR00344 TIGR00344 847 2.6e-05 14.7 0.4 1 1 4.9e-07 3.6e-05 14.2 0.4 683 778 38 130 31 144 0.75 # 24340 # 25110 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.515 1_49 - 571 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 6.4e-90 294.3 0.0 1 1 1.1e-91 8.3e-90 294.0 0.0 20 456 45 509 19 519 0.88 # 38234 # 39946 # -1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.423 1_50 - 352 Pox_A32 PF04665.7 241 2.8e-05 16.0 0.0 1 1 8.3e-07 6.2e-05 14.8 0.0 4 74 175 241 172 258 0.80 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_8 - 222 GTP_EFTU PF00009.22 188 5.7e-08 24.9 0.0 1 1 1.2e-09 9.1e-08 24.2 0.0 15 116 15 124 10 200 0.78 # 5576 # 6241 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 1_50 - 352 AAA_28 PF13521.1 163 1.7e-05 17.3 0.1 1 1 6.2e-07 4.6e-05 15.9 0.0 2 32 186 221 185 291 0.82 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 1_50 - 352 AAA_5 PF07728.9 139 0.00022 13.5 0.0 1 1 5.3e-06 0.00039 12.7 0.0 1 31 185 215 185 280 0.90 # 40207 # 41262 # -1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b2 (February 2015) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/c7ec23b0-6f90-4eb5-84be-f08a56c44a6d # Target file: checkm_output/bins/pm1875/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm1875/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/c7ec23b0-6f90-4eb5-84be-f08a56c44a6d checkm_output/bins/pm1875/genes.faa # Current dir: /mnt/DGK_KLIF/data/klif/reads-for-assembly/trainingsets2/combined/rfplasmid_combined_jellynew2 # Date: Tue Jul 7 17:01:22 2020 # [ok]