# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_24 - 421 Mg_chelatase PF01078.16 207 1.3e-05 16.8 0.1 1 1 3.6e-07 2.5e-05 15.9 0.1 20 42 199 221 195 225 0.91 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_24 - 421 Parvo_NS1 PF01057.12 272 0.00023 12.4 0.0 1 1 8e-06 0.00054 11.2 0.0 114 134 201 221 195 235 0.88 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_24 - 421 IstB_IS21 PF01695.12 178 3.4e-06 18.9 0.0 1 1 8.2e-08 5.6e-06 18.2 0.0 49 86 203 237 197 256 0.73 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 2_7 - 221 MipZ PF09140.6 261 5.1e-10 31.2 1.8 1 1 2.5e-09 1.7e-07 22.9 1.3 2 130 4 111 3 132 0.75 # 3238 # 3900 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 3_1 - 172 3HCDH_N PF02737.13 180 5.5e-08 25.0 1.1 1 1 4.3e-09 2.9e-07 22.6 1.0 1 41 6 46 6 117 0.90 # 1 # 516 # -1 # ID=3_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.690 3_1 - 172 GIDA PF01134.17 392 0.00067 10.9 2.6 1 1 1.3e-05 0.00088 10.5 2.6 2 72 7 78 6 91 0.89 # 1 # 516 # -1 # ID=3_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.690 1_24 - 421 AAA_22 PF13401.1 131 2e-06 20.4 0.1 1 2 2.8e-07 1.9e-05 17.2 0.1 7 45 204 234 198 241 0.85 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_24 - 421 AAA_22 PF13401.1 131 2e-06 20.4 0.1 2 2 0.047 3.2 0.3 0.0 77 113 239 274 234 291 0.63 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 2_7 - 221 ATP_bind_1 PF03029.12 238 0.00056 11.8 0.2 1 1 0.00015 0.01 7.7 0.2 6 40 13 47 10 115 0.83 # 3238 # 3900 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_17 - 92 Stn1 PF10451.4 256 0.00071 10.8 0.1 1 1 1.1e-05 0.00073 10.7 0.1 74 123 16 64 5 80 0.88 # 15335 # 15610 # -1 # ID=1_17;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.431 1_24 - 421 SRP54 PF00448.17 196 0.00029 12.6 0.0 1 1 1.4e-05 0.00048 11.9 0.0 3 41 203 239 201 266 0.80 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 2_7 - 221 SRP54 PF00448.17 196 0.00034 12.4 0.1 1 1 2.1e-05 0.00072 11.4 0.1 10 98 12 94 3 134 0.78 # 3238 # 3900 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_24 - 421 AAA_17 PF13207.1 121 8.4e-12 38.4 0.3 1 1 5.7e-13 3.9e-11 36.2 0.1 1 110 203 304 203 418 0.75 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_37 - 257 Adenylsucc_synt PF00709.16 421 0.0013 9.8 4.4 1 2 1.2e-05 0.00079 10.4 0.2 157 229 49 122 31 126 0.75 # 31257 # 32027 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_37 - 257 Adenylsucc_synt PF00709.16 421 0.0013 9.8 4.4 2 2 0.011 0.71 0.7 0.7 142 177 194 230 147 253 0.53 # 31257 # 32027 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 2_7 - 221 MobB PF03205.9 140 7.1e-06 18.1 0.7 1 2 1e-05 0.00069 11.7 0.3 2 37 4 40 3 52 0.86 # 3238 # 3900 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 2_7 - 221 MobB PF03205.9 140 7.1e-06 18.1 0.7 2 2 0.0016 0.11 4.6 0.0 44 75 85 119 72 133 0.81 # 3238 # 3900 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 2_7 - 221 ArsA_ATPase PF02374.10 305 4.6e-09 28.0 0.1 1 1 1.2e-10 8.3e-09 27.2 0.1 4 43 6 45 3 61 0.91 # 3238 # 3900 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_24 - 421 PhoH PF02562.11 205 0.00042 11.9 0.1 1 1 1.2e-05 0.00085 10.9 0.1 22 45 204 227 192 232 0.85 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_30 - 345 T2SE PF00437.15 272 3.6e-46 149.5 0.0 1 1 1.3e-47 4.4e-46 149.3 0.0 12 246 26 286 15 317 0.88 # 25624 # 26658 # -1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.423 1_24 - 421 T2SE PF00437.15 272 0.00031 12.0 0.0 1 1 2e-05 0.00068 10.9 0.0 129 155 202 228 167 250 0.85 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_24 - 421 SKI PF01202.17 158 0.00055 12.2 0.0 1 1 1.9e-05 0.0013 11.0 0.0 1 32 210 243 210 266 0.77 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_24 - 421 Zeta_toxin PF06414.7 201 2.7e-06 18.9 0.0 1 1 1.5e-07 5.1e-06 18.1 0.0 19 56 204 240 191 276 0.81 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_30 - 345 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00027 12.4 0.0 1 1 1.6e-05 0.00056 11.4 0.0 17 59 166 209 153 235 0.76 # 25624 # 26658 # -1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.423 3_1 - 172 F420_oxidored PF03807.12 96 5.6e-07 22.3 1.2 1 2 1.9e-08 1.3e-06 21.2 0.2 2 78 7 79 6 99 0.82 # 1 # 516 # -1 # ID=3_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.690 3_1 - 172 F420_oxidored PF03807.12 96 5.6e-07 22.3 1.2 2 2 0.069 4.7 0.2 0.1 33 51 103 133 82 155 0.56 # 1 # 516 # -1 # ID=3_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.690 2_7 - 221 VirC1 PF07015.6 231 9.7e-09 26.9 0.0 1 1 2.6e-10 1.8e-08 26.1 0.0 3 55 4 56 2 61 0.92 # 3238 # 3900 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 2_7 - 221 Fer4_NifH PF00142.13 273 1e-06 20.4 0.2 1 1 3.7e-08 2.5e-06 19.2 0.1 6 41 9 44 5 52 0.91 # 3238 # 3900 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_24 - 421 AAA_16 PF13191.1 185 5.1e-06 18.9 0.0 1 2 6.5e-07 4.4e-05 15.9 0.0 25 51 202 228 191 242 0.81 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_24 - 421 AAA_16 PF13191.1 185 5.1e-06 18.9 0.0 2 2 0.054 3.6 -0.2 0.0 146 171 246 274 234 285 0.74 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_24 - 421 AAA_23 PF13476.1 202 0.0002 14.0 0.3 1 1 3e-06 0.0002 14.0 0.3 15 39 190 221 181 223 0.76 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_24 - 421 AAA_18 PF13238.1 129 1.1e-07 24.6 0.0 1 1 6.4e-09 4.4e-07 22.7 0.0 1 23 204 228 204 303 0.78 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_37 - 257 AAA_13 PF13166.1 712 9.4e-05 13.3 7.2 1 2 1.7e-06 0.00011 13.0 0.0 316 409 29 122 8 141 0.89 # 31257 # 32027 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_37 - 257 AAA_13 PF13166.1 712 9.4e-05 13.3 7.2 2 2 0.014 0.96 0.1 5.6 87 155 161 229 146 254 0.40 # 31257 # 32027 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 2_7 - 221 CbiA PF01656.18 195 2.7e-15 48.6 0.6 1 1 1.1e-16 7.4e-15 47.2 0.6 2 167 6 155 5 180 0.73 # 3238 # 3900 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_24 - 421 AAA_14 PF13173.1 128 1.2e-05 17.5 0.0 1 1 6.4e-07 4.3e-05 15.8 0.0 4 51 203 251 200 285 0.63 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_52 - 172 B5 PF03484.10 70 7.5e-05 14.9 0.0 1 2 0.032 2.2 0.6 0.0 12 38 7 35 1 50 0.76 # 41218 # 41733 # -1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.411 1_52 - 172 B5 PF03484.10 70 7.5e-05 14.9 0.0 2 2 1e-05 0.00069 11.9 0.0 16 59 91 144 77 155 0.67 # 41218 # 41733 # -1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.411 1_24 - 421 AAA_29 PF13555.1 62 0.00035 12.5 0.1 1 1 9.8e-06 0.00067 11.6 0.1 24 43 202 221 193 223 0.84 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_24 - 421 AAA PF00004.24 132 5.8e-16 51.3 0.0 1 1 4e-17 2.7e-15 49.1 0.0 1 131 204 315 204 316 0.85 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_24 - 421 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00052 11.9 0.0 1 1 1.9e-05 0.0013 10.6 0.0 23 47 202 226 180 246 0.80 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_29 - 612 TraG-D_C PF12696.2 128 6.8e-29 92.7 0.0 1 1 1.7e-30 1.2e-28 92.0 0.0 2 127 416 534 415 535 0.86 # 23786 # 25621 # -1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_32 - 405 DLIC PF05783.6 472 0.0098 6.8 5.0 1 1 0.00026 0.017 6.0 5.0 353 459 90 202 78 209 0.70 # 26854 # 28068 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.489 3_1 - 172 NAD_binding_2 PF03446.10 163 6.3e-42 135.5 3.7 1 1 1.1e-43 7.3e-42 135.3 3.7 2 162 5 166 4 167 0.96 # 1 # 516 # -1 # ID=3_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.690 2_7 - 221 AAA_31 PF13614.1 157 5.4e-07 22.0 0.0 1 2 8.5e-07 5.8e-05 15.4 0.0 1 41 3 43 3 57 0.90 # 3238 # 3900 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 2_7 - 221 AAA_31 PF13614.1 157 5.4e-07 22.0 0.0 2 2 0.0021 0.14 4.4 0.0 111 151 73 112 63 115 0.83 # 3238 # 3900 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_24 - 421 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00011 14.3 0.1 1 1 4.1e-06 0.00028 13.0 0.1 2 26 204 228 203 233 0.83 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_24 - 421 AAA_33 PF13671.1 143 7.2e-08 24.8 0.0 1 1 2.1e-09 1.4e-07 23.8 0.0 2 44 204 248 204 282 0.87 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_24 - 421 KTI12 PF08433.5 270 2e-05 16.2 0.0 1 1 4.8e-07 3.3e-05 15.5 0.0 1 29 201 229 201 264 0.76 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 3_1 - 172 Methyltransf_26 PF13659.1 117 0.00016 14.1 4.6 1 1 3.9e-06 0.00026 13.4 4.6 13 105 14 155 6 163 0.68 # 1 # 516 # -1 # ID=3_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.690 3_1 - 172 2-Hacid_dh_C PF02826.14 178 2.1e-07 22.6 0.1 1 1 4.5e-09 3e-07 22.1 0.1 36 146 4 118 2 124 0.86 # 1 # 516 # -1 # ID=3_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.690 1_24 - 421 AAA_30 PF13604.1 196 9.3e-05 14.4 0.0 1 1 2.3e-06 0.00016 13.7 0.0 16 45 199 235 192 280 0.74 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_24 - 421 ABC_tran PF00005.22 137 0.00025 13.7 0.0 1 1 1e-05 0.00069 12.3 0.0 12 37 202 227 189 258 0.88 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 3_1 - 172 UDPG_MGDP_dh_N PF03721.9 185 1e-06 20.6 0.1 1 2 8.2e-07 5.6e-05 14.9 0.1 2 39 6 43 5 50 0.92 # 1 # 516 # -1 # ID=3_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.690 3_1 - 172 UDPG_MGDP_dh_N PF03721.9 185 1e-06 20.6 0.1 2 2 0.0026 0.17 3.5 0.0 107 139 86 117 82 127 0.77 # 1 # 516 # -1 # ID=3_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.690 1_24 - 421 RuvB_N PF05496.7 234 2.2e-05 15.9 0.0 1 1 1.5e-06 5.2e-05 14.7 0.0 47 73 198 224 156 232 0.79 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 2_8 - 221 RuvB_N PF05496.7 234 0.00027 12.4 0.2 1 1 1.5e-05 0.00052 11.4 0.0 78 119 46 86 40 101 0.90 # 4283 # 4945 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.520 1_24 - 421 AAA_19 PF13245.1 76 8.6e-07 21.1 0.0 1 1 2.8e-08 1.9e-06 20.0 0.0 10 35 202 225 197 257 0.79 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_38 - 918 AAA_10 PF12846.2 304 4.9e-35 113.7 0.0 1 1 3.7e-36 1.3e-34 112.4 0.0 3 294 539 825 538 832 0.93 # 32037 # 34790 # -1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.463 1_16 - 93 AAA_10 PF12846.2 304 1.5e-06 20.2 0.0 1 1 5.3e-08 1.8e-06 19.9 0.0 241 267 6 32 2 51 0.90 # 15060 # 15338 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.502 1_24 - 421 TIP49 PF06068.8 398 0.0002 12.5 0.0 1 1 5.1e-06 0.00035 11.7 0.0 49 81 200 232 193 253 0.85 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_30 - 345 DEAD PF00270.24 169 0.00029 12.7 0.0 1 1 7.8e-06 0.00053 11.9 0.0 7 39 156 188 152 241 0.79 # 25624 # 26658 # -1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.423 1_29 - 612 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 8.5e-23 72.8 0.0 1 1 2e-24 1.4e-22 72.2 0.0 165 380 331 548 300 552 0.86 # 23786 # 25621 # -1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_24 - 421 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.00023 13.6 0.0 1 1 9.3e-06 0.00063 12.2 0.0 21 47 201 227 198 279 0.77 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_29 - 612 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 1.1e-147 484.6 0.0 1 1 2.1e-149 1.4e-147 484.3 0.0 2 462 102 572 101 580 0.98 # 23786 # 25621 # -1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 2_7 - 221 ArgK PF03308.11 267 0.00037 11.6 0.1 1 2 1.6e-05 0.0011 10.1 0.1 37 66 11 40 3 45 0.88 # 3238 # 3900 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 2_7 - 221 ArgK PF03308.11 267 0.00037 11.6 0.1 2 2 0.071 4.8 -1.8 0.0 154 174 88 107 63 144 0.54 # 3238 # 3900 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 2_7 - 221 GTP_EFTU PF00009.22 188 1.6e-07 23.3 0.1 1 1 2.6e-09 1.8e-07 23.1 0.1 15 139 15 153 6 211 0.72 # 3238 # 3900 # -1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 1_24 - 421 RNA_helicase PF00910.17 107 7.1e-05 15.4 0.0 1 1 3.9e-06 0.00027 13.5 0.0 1 26 204 229 204 253 0.77 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 3_1 - 172 TrkA_N PF02254.13 116 8.2e-06 18.2 0.1 1 1 3e-07 2e-05 17.0 0.0 1 42 7 48 7 79 0.85 # 1 # 516 # -1 # ID=3_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.690 1_25 - 165 Nup35_RRM PF05172.8 101 0.00071 11.7 0.0 1 1 1.6e-05 0.0011 11.1 0.0 28 73 94 137 84 144 0.86 # 22092 # 22586 # -1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.491 3_1 - 172 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 1.6e-05 16.9 1.3 1 2 1.5e-06 0.0001 14.2 0.1 21 66 5 50 2 64 0.90 # 1 # 516 # -1 # ID=3_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.690 3_1 - 172 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 1.6e-05 16.9 1.3 2 2 0.011 0.76 1.7 0.2 13 42 84 113 72 119 0.84 # 1 # 516 # -1 # ID=3_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.690 1_24 - 421 AAA_24 PF13479.1 213 1.9e-05 16.7 0.0 1 1 5.1e-07 3.5e-05 15.8 0.0 5 56 203 259 201 291 0.80 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_42 - 217 TIGR00922 TIGR00922 172 8.4e-08 24.3 0.0 1 1 2.6e-09 1.8e-07 23.2 0.0 55 109 98 152 50 169 0.86 # 35966 # 36616 # -1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.415 1_24 - 421 AAA_25 PF13481.1 194 3.8e-05 15.5 0.0 1 1 2e-06 6.8e-05 14.7 0.0 36 58 204 226 197 311 0.80 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_30 - 345 AAA_25 PF13481.1 194 0.00021 13.1 0.0 1 1 9.6e-06 0.00033 12.5 0.0 21 52 152 183 137 226 0.87 # 25624 # 26658 # -1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.423 1_24 - 421 AAA_28 PF13521.1 163 8e-08 24.8 0.0 1 1 2.5e-09 1.7e-07 23.7 0.0 1 40 203 247 203 276 0.71 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_24 - 421 AAA_5 PF07728.9 139 3e-06 19.4 0.0 1 1 2.1e-07 1.4e-05 17.2 0.0 2 31 204 233 203 274 0.93 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 1_24 - 421 APS_kinase PF01583.15 157 0.00025 13.1 0.0 1 1 8.7e-06 0.00059 11.9 0.0 5 33 204 232 201 237 0.85 # 20747 # 22009 # -1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.409 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b2 (February 2015) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/49936a36-a6c6-4438-b304-05b7168185e6 # Target file: checkm_output/bins/pm1747/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm1747/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/49936a36-a6c6-4438-b304-05b7168185e6 checkm_output/bins/pm1747/genes.faa # Current dir: /mnt/DGK_KLIF/data/klif/reads-for-assembly/trainingsets2/combined/rfplasmid_combined_jellynew2 # Date: Tue Jul 7 17:00:07 2020 # [ok]