# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 5_4 - 254 UPF0020 PF01170.13 180 0.00015 16.0 0.0 1 1 1.8e-06 0.00059 14.0 0.0 15 126 87 185 76 221 0.72 # 1545 # 2306 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 5_18 - 203 RrnaAD PF00398.15 262 4.5e-05 17.1 0.0 1 1 2.1e-07 6.8e-05 16.5 0.0 47 92 98 144 80 183 0.85 # 12255 # 12863 # 1 # ID=5_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.498 1_8 - 260 IstB_IS21 PF01695.12 178 2.8e-65 213.6 0.0 1 1 2.2e-67 7.2e-65 212.3 0.0 2 177 56 233 55 234 0.96 # 9391 # 10170 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 6_9 - 418 MipZ PF09140.6 261 1.5e-11 38.4 0.1 1 2 1.4e-08 4.6e-06 20.4 0.1 2 39 116 156 115 170 0.78 # 6061 # 7314 # -1 # ID=6_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 6_9 - 418 MipZ PF09140.6 261 1.5e-11 38.4 0.1 2 2 5.4e-07 0.00018 15.2 0.0 77 126 236 287 213 297 0.75 # 6061 # 7314 # -1 # ID=6_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 6_9 - 418 YhjQ PF06564.7 244 0.0025 11.8 0.2 1 2 0.00059 0.19 5.6 0.1 6 41 119 157 115 170 0.78 # 6061 # 7314 # -1 # ID=6_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 6_9 - 418 YhjQ PF06564.7 244 0.0025 11.8 0.2 2 2 0.002 0.66 3.8 0.0 115 149 257 291 233 297 0.83 # 6061 # 7314 # -1 # ID=6_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 1_31 - 562 3HCDH_N PF02737.13 180 0.052 7.7 6.6 1 2 0.0086 2.8 2.1 2.8 1 30 100 129 100 133 0.93 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_31 - 562 3HCDH_N PF02737.13 180 0.052 7.7 6.6 2 2 0.0003 0.098 6.9 0.1 2 36 273 307 272 359 0.75 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_31 - 562 GIDA PF01134.17 392 8.5e-06 19.4 5.3 1 2 2.6e-08 8.5e-06 19.4 5.3 1 53 100 154 100 290 0.87 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_31 - 562 GIDA PF01134.17 392 8.5e-06 19.4 5.3 2 2 0.01 3.3 1.0 0.3 349 385 390 426 376 430 0.79 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_14 - 126 SSB PF00436.20 104 0.0017 12.8 0.1 1 2 3.3e-05 0.011 10.2 0.1 2 83 8 87 7 94 0.74 # 17344 # 17721 # 1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.370 4_14 - 126 SSB PF00436.20 104 0.0017 12.8 0.1 2 2 0.033 11 0.6 0.0 43 60 92 109 88 112 0.83 # 17344 # 17721 # 1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.370 5_4 - 254 Methyltransf_18 PF12847.2 112 6.1e-06 21.4 0.0 1 1 3.5e-08 1.1e-05 20.5 0.0 3 107 102 198 100 203 0.77 # 1545 # 2306 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 4_12 - 595 UvrD_C_2 PF13538.1 104 2.8e-12 41.3 0.0 1 1 4e-14 6.6e-12 40.1 0.0 47 103 496 562 450 563 0.79 # 14235 # 16019 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_50 - 680 UvrD_C_2 PF13538.1 104 6.6e-11 36.9 0.0 1 1 1.4e-12 2.4e-10 35.1 0.0 23 104 505 607 490 607 0.83 # 44014 # 46053 # 1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_31 - 562 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 2.3e-42 139.7 0.0 1 1 1.6e-44 5.2e-42 138.6 0.0 1 199 100 407 100 409 0.96 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 3_12 - 276 Usp PF00582.21 140 7.5e-39 127.7 0.1 1 3 4e-19 1.3e-16 55.6 0.1 1 140 1 152 1 152 0.93 # 9679 # 10506 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 3_12 - 276 Usp PF00582.21 140 7.5e-39 127.7 0.1 2 3 0.001 0.34 5.7 0.0 4 24 160 180 158 200 0.74 # 9679 # 10506 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 3_12 - 276 Usp PF00582.21 140 7.5e-39 127.7 0.1 3 3 1.5e-21 4.8e-19 63.5 0.0 70 140 203 275 179 275 0.87 # 9679 # 10506 # -1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.517 4_16 - 284 AAA_2 PF07724.9 171 1e-05 20.1 0.0 1 1 7.6e-08 2.5e-05 18.8 0.0 5 83 98 177 95 184 0.74 # 18817 # 19668 # 1 # ID=4_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.413 2_52 - 695 DUF87 PF01935.12 229 0.00057 14.3 0.0 1 1 4e-06 0.0013 13.1 0.0 25 68 200 242 189 278 0.89 # 35423 # 37507 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 5_4 - 254 MetW PF07021.7 193 0.00023 15.1 0.0 1 1 2.1e-06 0.00034 14.6 0.0 13 102 100 192 90 202 0.77 # 1545 # 2306 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 13_1 - 376 MetW PF07021.7 193 0.0012 12.8 0.0 1 1 1.2e-05 0.002 12.1 0.0 17 83 235 299 222 311 0.85 # 272 # 1399 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 1_8 - 260 AAA_22 PF13401.1 131 4.1e-06 21.6 0.0 1 2 1.2e-05 0.0014 13.4 0.1 4 28 101 125 98 148 0.75 # 9391 # 10170 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_8 - 260 AAA_22 PF13401.1 131 4.1e-06 21.6 0.0 2 2 0.0025 0.27 6.0 0.0 77 101 151 178 124 201 0.64 # 9391 # 10170 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_50 - 680 AAA_22 PF13401.1 131 3.9e-05 18.4 0.2 1 2 0.00019 0.021 9.6 0.0 4 65 17 75 13 106 0.77 # 44014 # 46053 # 1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_50 - 680 AAA_22 PF13401.1 131 3.9e-05 18.4 0.2 2 2 0.002 0.22 6.2 0.0 41 108 152 232 112 246 0.62 # 44014 # 46053 # 1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 2_52 - 695 AAA_22 PF13401.1 131 0.00054 14.7 0.1 1 2 0.00011 0.012 10.3 0.1 5 24 199 218 198 295 0.71 # 35423 # 37507 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 2_52 - 695 AAA_22 PF13401.1 131 0.00054 14.7 0.1 2 2 0.065 7.1 1.4 0.0 89 121 505 534 458 544 0.72 # 35423 # 37507 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 5_4 - 254 Methyltransf_11 PF08241.7 95 0.0007 14.7 0.0 1 1 4.7e-06 0.0015 13.6 0.0 5 86 109 191 105 198 0.82 # 1545 # 2306 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 3_22 - 476 DNA_methylase PF00145.12 335 1.1e-75 249.4 0.0 1 1 4.2e-78 1.4e-75 249.0 0.0 1 333 92 455 92 457 0.87 # 16417 # 17844 # 1 # ID=3_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.467 1_31 - 562 Trp_halogenase PF04820.9 454 0.015 8.5 3.3 1 1 8.1e-05 0.026 7.6 3.3 1 47 100 143 100 151 0.76 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_16 - 284 KAP_NTPase PF07693.9 325 0.0031 11.1 0.0 1 1 1.4e-05 0.0045 10.5 0.0 6 45 84 121 80 252 0.83 # 18817 # 19668 # 1 # ID=4_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.413 1_31 - 562 NAD_binding_7 PF13241.1 103 1.3e-05 20.0 1.2 1 2 2e-05 0.0064 11.4 0.2 9 38 100 129 97 164 0.90 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_31 - 562 NAD_binding_7 PF13241.1 103 1.3e-05 20.0 1.2 2 2 0.00049 0.16 6.9 0.1 8 45 271 314 264 382 0.66 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 5_19 - 417 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 6.7e-22 72.6 0.0 1 1 3.1e-24 1e-21 72.1 0.0 1 227 128 389 128 393 0.81 # 13034 # 14284 # 1 # ID=5_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.509 1_8 - 260 AAA_17 PF13207.1 121 0.0013 14.2 0.0 1 1 6.5e-06 0.0021 13.4 0.0 2 26 104 131 103 216 0.74 # 9391 # 10170 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 6_9 - 418 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.9e-09 31.5 0.6 1 2 0.0088 2.9 1.4 0.0 214 274 14 76 6 85 0.80 # 6061 # 7314 # -1 # ID=6_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 6_9 - 418 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.9e-09 31.5 0.6 2 2 2.4e-10 7.9e-08 26.2 0.1 8 136 122 269 115 274 0.80 # 6061 # 7314 # -1 # ID=6_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 4_12 - 595 PhoH PF02562.11 205 1e-06 22.7 0.5 1 1 1.8e-07 2.9e-05 17.9 0.5 6 177 5 246 2 258 0.76 # 14235 # 16019 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_8 - 260 PhoH PF02562.11 205 1e-06 22.7 0.1 1 1 1e-08 1.6e-06 22.0 0.1 14 56 96 138 84 163 0.80 # 9391 # 10170 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 4_16 - 284 MCM PF00493.18 331 0.0036 10.7 0.0 1 1 4.4e-05 0.014 8.7 0.0 57 176 96 218 94 254 0.69 # 18817 # 19668 # 1 # ID=4_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.413 1_8 - 260 AFG1_ATPase PF03969.11 362 0.001 12.5 0.0 1 1 5.8e-06 0.0019 11.6 0.0 64 214 103 251 81 258 0.78 # 9391 # 10170 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_31 - 562 NAD_binding_8 PF13450.1 68 0.00022 15.8 1.2 1 1 6.9e-07 0.00022 15.8 1.2 1 35 103 136 103 155 0.91 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 6_9 - 418 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.0003 14.6 0.0 1 2 2.7e-06 0.00087 13.1 0.0 7 58 122 176 116 201 0.79 # 6061 # 7314 # -1 # ID=6_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 6_9 - 418 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.0003 14.6 0.0 2 2 0.1 33 -1.9 0.0 30 65 324 358 321 391 0.61 # 6061 # 7314 # -1 # ID=6_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 1_8 - 260 AAA_16 PF13191.1 185 4.8e-05 18.0 2.4 1 3 1.2e-06 0.00039 15.0 0.1 23 51 100 128 86 149 0.80 # 9391 # 10170 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_8 - 260 AAA_16 PF13191.1 185 4.8e-05 18.0 2.4 2 3 0.035 12 0.4 0.0 124 162 143 175 125 192 0.74 # 9391 # 10170 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_8 - 260 AAA_16 PF13191.1 185 4.8e-05 18.0 2.4 3 3 0.072 24 -0.6 0.0 38 62 217 242 207 252 0.75 # 9391 # 10170 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 6_9 - 418 CbiA PF01656.18 195 2.5e-22 73.8 0.0 1 1 2.2e-24 3.6e-22 73.3 0.0 1 178 117 348 117 365 0.73 # 6061 # 7314 # -1 # ID=6_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 1_8 - 260 CbiA PF01656.18 195 0.0032 11.5 0.0 1 1 2.5e-05 0.0041 11.1 0.0 3 42 105 145 104 254 0.75 # 9391 # 10170 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 2_52 - 695 KaiC PF06745.8 227 6.2e-05 16.7 0.0 1 2 7e-06 0.0023 11.6 0.0 22 78 201 259 199 342 0.79 # 35423 # 37507 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 2_52 - 695 KaiC PF06745.8 227 6.2e-05 16.7 0.0 2 2 0.0039 1.3 2.6 0.0 48 105 357 414 348 425 0.85 # 35423 # 37507 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 1_8 - 260 AAA_14 PF13173.1 128 1.2e-06 23.1 0.0 1 2 1.7e-08 5.6e-06 20.9 0.0 3 97 102 203 100 219 0.64 # 9391 # 10170 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_8 - 260 AAA_14 PF13173.1 128 1.2e-06 23.1 0.0 2 2 0.048 16 0.0 0.0 14 46 215 247 212 257 0.80 # 9391 # 10170 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 3_7 - 468 B5 PF03484.10 70 0.0033 11.8 0.4 1 1 4.1e-05 0.014 9.9 0.0 6 51 95 139 93 141 0.91 # 5299 # 6702 # 1 # ID=3_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.518 1_31 - 562 HI0933_like PF03486.9 409 1.4e-08 28.1 5.0 1 2 4.3e-07 0.00014 15.0 2.8 2 33 100 131 99 139 0.91 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_31 - 562 HI0933_like PF03486.9 409 1.4e-08 28.1 5.0 2 2 1.7e-06 0.00056 13.0 0.0 83 163 286 362 281 379 0.85 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_31 - 562 FAD_binding_2 PF00890.19 417 3.1e-06 20.8 5.3 1 3 9.5e-09 3.1e-06 20.8 5.3 2 32 101 131 100 138 0.91 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_31 - 562 FAD_binding_2 PF00890.19 417 3.1e-06 20.8 5.3 2 3 0.034 11 -0.8 0.2 142 204 311 366 286 382 0.67 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_31 - 562 FAD_binding_2 PF00890.19 417 3.1e-06 20.8 5.3 3 3 0.0019 0.61 3.4 0.1 373 402 374 405 368 419 0.86 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_8 - 260 AAA PF00004.24 132 6.9e-08 27.3 0.0 1 1 8.2e-10 1.3e-07 26.4 0.0 1 70 104 175 104 207 0.82 # 9391 # 10170 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 4_16 - 284 AAA PF00004.24 132 0.00046 15.0 0.0 1 1 6.9e-06 0.0011 13.7 0.0 1 74 99 178 99 218 0.71 # 18817 # 19668 # 1 # ID=4_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.413 1_8 - 260 Bac_DnaA PF00308.13 219 1.7e-08 28.9 0.0 1 1 7.8e-11 2.5e-08 28.4 0.0 36 136 103 201 90 209 0.84 # 9391 # 10170 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 4_12 - 595 UvrD_C PF13361.1 351 5.2e-42 139.1 0.0 1 1 5.9e-44 9.6e-42 138.2 0.0 2 348 254 564 253 567 0.86 # 14235 # 16019 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_50 - 680 UvrD_C PF13361.1 351 9e-23 75.8 0.0 1 2 0.0018 0.3 5.0 0.0 74 118 332 377 289 388 0.79 # 44014 # 46053 # 1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_50 - 680 UvrD_C PF13361.1 351 9e-23 75.8 0.0 2 2 2e-22 3.2e-20 67.4 0.0 290 347 538 607 519 611 0.91 # 44014 # 46053 # 1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_31 - 562 Thi4 PF01946.12 230 0.00087 13.0 0.4 1 1 6.4e-06 0.0021 11.7 0.4 19 70 100 150 95 158 0.88 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 15_1 - 93 Val_tRNA-synt_C PF10458.4 66 0.001 13.8 0.6 1 1 3.1e-06 0.001 13.8 0.6 1 23 58 80 58 89 0.87 # 65 # 343 # 1 # ID=15_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.487 4_16 - 284 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00023 15.2 0.0 1 1 5e-06 0.0016 12.5 0.0 20 120 94 189 78 223 0.65 # 18817 # 19668 # 1 # ID=4_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.413 1_31 - 562 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 5.8e-18 60.2 0.1 1 3 1.8e-06 0.0006 14.5 0.1 165 199 96 130 49 137 0.86 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_31 - 562 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 5.8e-18 60.2 0.1 2 3 5.7e-09 1.9e-06 22.7 0.0 115 201 219 304 173 306 0.80 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_31 - 562 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 5.8e-18 60.2 0.1 3 3 5.6e-08 1.8e-05 19.4 0.0 89 147 317 372 309 431 0.82 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 5_4 - 254 N6_Mtase PF02384.11 311 1.4e-08 28.7 0.0 1 2 1.3e-05 0.0015 12.2 0.0 55 136 109 176 79 179 0.58 # 1545 # 2306 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 5_4 - 254 N6_Mtase PF02384.11 311 1.4e-08 28.7 0.0 2 2 6.1e-06 0.00067 13.3 0.0 161 200 179 219 176 247 0.76 # 1545 # 2306 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 13_1 - 376 N6_Mtase PF02384.11 311 5.2e-06 20.3 0.0 1 1 7.1e-08 7.8e-06 19.7 0.0 89 138 257 304 236 318 0.87 # 272 # 1399 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 2_16 - 164 N6_Mtase PF02384.11 311 0.0028 11.3 0.0 1 1 3.2e-05 0.0034 11.0 0.0 37 78 14 59 5 84 0.72 # 9986 # 10477 # 1 # ID=2_16;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 1_8 - 260 DUF258 PF03193.11 161 0.00069 13.4 0.0 1 1 3.7e-06 0.0012 12.6 0.0 26 59 92 125 80 153 0.82 # 9391 # 10170 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 2_52 - 695 TraG-D_C PF12696.2 128 2.3e-11 38.2 0.0 1 1 1.5e-13 4.7e-11 37.2 0.0 2 112 505 617 504 631 0.82 # 35423 # 37507 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 6_9 - 418 AAA_31 PF13614.1 157 6.4e-08 27.2 0.4 1 2 9.4e-08 3.1e-05 18.5 0.0 9 128 123 270 121 292 0.83 # 6061 # 7314 # -1 # ID=6_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 6_9 - 418 AAA_31 PF13614.1 157 6.4e-08 27.2 0.4 2 2 0.00088 0.29 5.6 0.1 14 89 299 381 284 410 0.72 # 6061 # 7314 # -1 # ID=6_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 1_8 - 260 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00075 13.8 0.1 1 2 0.0015 0.5 4.6 0.1 2 30 104 132 103 143 0.82 # 9391 # 10170 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_8 - 260 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00075 13.8 0.1 2 2 0.0003 0.098 6.9 0.0 87 108 155 176 141 202 0.77 # 9391 # 10170 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 5_4 - 254 Methyltransf_26 PF13659.1 117 3.2e-13 44.4 0.1 1 1 8.2e-15 1.3e-12 42.3 0.0 1 115 101 201 101 207 0.81 # 1545 # 2306 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 13_1 - 376 Methyltransf_26 PF13659.1 117 8.8e-09 30.0 0.0 1 1 9.4e-11 1.5e-08 29.2 0.0 3 116 234 328 227 329 0.80 # 272 # 1399 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 1_31 - 562 XdhC_C PF13478.1 136 0.0027 12.6 1.0 1 2 0.08 26 -0.3 0.1 1 29 101 129 101 163 0.86 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_31 - 562 XdhC_C PF13478.1 136 0.0027 12.6 1.0 2 2 6.9e-05 0.023 9.6 0.1 1 66 273 351 273 371 0.64 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 4_12 - 595 AAA_30 PF13604.1 196 0.00011 16.3 0.3 1 2 2.9e-05 0.0048 11.1 0.0 4 66 6 66 4 90 0.72 # 14235 # 16019 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 4_12 - 595 AAA_30 PF13604.1 196 0.00011 16.3 0.3 2 2 0.018 2.9 2.0 0.0 91 132 187 227 162 261 0.83 # 14235 # 16019 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_50 - 680 AAA_30 PF13604.1 196 0.00098 13.3 0.0 1 2 0.00018 0.029 8.5 0.0 7 42 10 42 4 80 0.71 # 44014 # 46053 # 1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_50 - 680 AAA_30 PF13604.1 196 0.00098 13.3 0.0 2 2 0.014 2.2 2.3 0.0 97 133 213 248 196 300 0.84 # 44014 # 46053 # 1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 2_52 - 695 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 4e-07 24.2 0.0 1 2 5.4e-07 0.00018 15.6 0.0 22 80 181 236 170 243 0.86 # 35423 # 37507 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 2_52 - 695 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 4e-07 24.2 0.0 2 2 0.00047 0.15 6.0 0.0 169 204 510 542 500 543 0.81 # 35423 # 37507 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 5_4 - 254 MTS PF05175.9 170 2.4e-08 28.1 0.0 1 1 2.3e-10 3.8e-08 27.4 0.0 35 144 104 205 89 224 0.72 # 1545 # 2306 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 13_1 - 376 MTS PF05175.9 170 6e-07 23.5 0.0 1 1 5.8e-09 9.5e-07 22.9 0.0 94 156 287 344 258 355 0.79 # 272 # 1399 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 1_8 - 260 ABC_tran PF00005.22 137 0.0017 13.2 0.2 1 1 4.1e-05 0.0066 11.3 0.1 8 31 98 121 95 132 0.86 # 9391 # 10170 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 4_16 - 284 ABC_tran PF00005.22 137 0.0032 12.4 0.1 1 1 5.3e-05 0.0087 10.9 0.1 14 42 99 129 96 229 0.59 # 18817 # 19668 # 1 # ID=4_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.413 1_31 - 562 K_oxygenase PF13434.1 341 1.1e-05 19.0 0.3 1 3 0.0042 1.4 2.3 0.2 187 223 95 129 86 132 0.75 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_31 - 562 K_oxygenase PF13434.1 341 1.1e-05 19.0 0.3 2 3 2.9e-06 0.00094 12.7 0.0 130 231 217 309 200 339 0.79 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_31 - 562 K_oxygenase PF13434.1 341 1.1e-05 19.0 0.3 3 3 0.022 7 -0.0 0.0 139 160 345 366 314 376 0.63 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 13_1 - 376 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0011 13.0 0.0 1 1 5.5e-06 0.0018 12.2 0.0 105 138 283 314 262 328 0.71 # 272 # 1399 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 1_50 - 680 AAA_19 PF13245.1 76 1.4e-10 35.4 0.1 1 1 3.6e-12 2.9e-10 34.4 0.1 14 75 21 86 11 87 0.87 # 44014 # 46053 # 1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 4_12 - 595 AAA_19 PF13245.1 76 4.8e-09 30.5 0.0 1 1 8.1e-10 6.6e-08 26.8 0.0 3 75 12 86 10 87 0.84 # 14235 # 16019 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 6_9 - 418 AAA_19 PF13245.1 76 0.0012 13.2 0.0 1 1 3.6e-05 0.003 11.9 0.0 20 48 125 152 123 182 0.82 # 6061 # 7314 # -1 # ID=6_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 1_8 - 260 AAA_19 PF13245.1 76 0.0022 12.3 0.2 1 1 0.00011 0.0086 10.5 0.0 11 35 103 126 95 157 0.81 # 9391 # 10170 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 6_11 - 894 AAA_10 PF12846.2 304 2.7e-65 215.3 0.0 1 1 5e-67 4.1e-65 214.7 0.0 1 303 456 812 456 813 0.93 # 11153 # 13834 # -1 # ID=6_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.422 2_52 - 695 AAA_10 PF12846.2 304 1.1e-16 55.7 0.0 1 1 2.7e-18 2.2e-16 54.7 0.0 2 296 199 578 198 585 0.73 # 35423 # 37507 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 1_8 - 260 AAA_10 PF12846.2 304 0.00012 16.1 0.2 1 2 0.058 4.7 1.1 0.0 106 155 28 69 4 89 0.61 # 9391 # 10170 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_8 - 260 AAA_10 PF12846.2 304 0.00012 16.1 0.2 2 2 1.8e-05 0.0014 12.6 0.1 3 35 103 135 101 172 0.84 # 9391 # 10170 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 4_12 - 595 AAA_10 PF12846.2 304 0.00093 13.2 0.3 1 1 4.7e-05 0.0038 11.2 0.0 1 25 16 40 16 49 0.80 # 14235 # 16019 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 4_12 - 595 AAA_12 PF13087.1 200 2.2e-08 28.3 0.1 1 3 0.00079 0.26 5.2 0.0 98 153 33 84 13 94 0.78 # 14235 # 16019 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 4_12 - 595 AAA_12 PF13087.1 200 2.2e-08 28.3 0.1 2 3 0.0026 0.85 3.5 0.0 5 52 240 287 237 400 0.74 # 14235 # 16019 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 4_12 - 595 AAA_12 PF13087.1 200 2.2e-08 28.3 0.1 3 3 5.1e-07 0.00017 15.6 0.0 136 196 497 563 409 567 0.81 # 14235 # 16019 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_31 - 562 FAD_oxidored PF12831.2 428 1.9e-06 21.7 3.8 1 2 5.9e-09 1.9e-06 21.7 3.8 1 41 100 139 100 159 0.83 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_31 - 562 FAD_oxidored PF12831.2 428 1.9e-06 21.7 3.8 2 2 0.01 3.3 1.2 0.0 84 120 305 341 261 364 0.71 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_31 - 562 DAO PF01266.19 358 2.2e-11 37.8 7.5 1 2 1.9e-08 6.1e-06 19.9 1.5 2 35 101 134 100 161 0.85 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_31 - 562 DAO PF01266.19 358 2.2e-11 37.8 7.5 2 2 7.7e-09 2.5e-06 21.1 0.5 151 239 314 400 274 529 0.80 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 5_4 - 254 Methyltransf_31 PF13847.1 152 0.00046 14.4 0.0 1 1 2.6e-06 0.00085 13.5 0.0 7 106 104 197 99 240 0.78 # 1545 # 2306 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 1_50 - 680 Viral_helicase1 PF01443.13 234 6e-11 36.8 0.0 1 3 7.7e-07 0.00013 16.2 0.0 2 60 21 78 20 86 0.84 # 44014 # 46053 # 1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_50 - 680 Viral_helicase1 PF01443.13 234 6e-11 36.8 0.0 2 3 0.00023 0.037 8.1 0.0 62 118 209 263 186 343 0.73 # 44014 # 46053 # 1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_50 - 680 Viral_helicase1 PF01443.13 234 6e-11 36.8 0.0 3 3 0.0011 0.17 5.9 0.0 213 232 572 606 528 608 0.62 # 44014 # 46053 # 1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 4_12 - 595 Viral_helicase1 PF01443.13 234 9.1e-08 26.4 0.1 1 3 0.0057 0.93 3.5 0.0 2 21 20 39 19 91 0.63 # 14235 # 16019 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 4_12 - 595 Viral_helicase1 PF01443.13 234 9.1e-08 26.4 0.1 2 3 0.0086 1.4 2.9 0.0 40 135 167 261 132 297 0.74 # 14235 # 16019 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 4_12 - 595 Viral_helicase1 PF01443.13 234 9.1e-08 26.4 0.1 3 3 7e-07 0.00011 16.3 0.0 183 232 494 562 401 563 0.72 # 14235 # 16019 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 3_27 - 273 ThiS-like PF14453.1 57 0.0025 12.2 0.0 1 1 1.7e-05 0.0054 11.2 0.0 25 54 165 194 146 196 0.94 # 20896 # 21714 # -1 # ID=3_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 4_12 - 595 DEAD PF00270.24 169 9.8e-05 16.5 0.7 1 1 3.8e-06 0.0012 12.9 0.7 4 105 8 107 5 222 0.77 # 14235 # 16019 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_31 - 562 Pyr_redox PF00070.22 80 3.1e-19 63.8 5.4 1 2 1.2e-06 0.00041 15.4 1.5 2 31 101 130 100 132 0.95 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_31 - 562 Pyr_redox PF00070.22 80 3.1e-19 63.8 5.4 2 2 3.2e-17 1e-14 49.3 0.1 1 72 272 342 272 351 0.91 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 2_52 - 695 DUF853 PF05872.7 504 9.3e-05 15.4 0.0 1 1 6.2e-07 0.0002 14.3 0.0 10 60 187 237 179 245 0.87 # 35423 # 37507 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 3_27 - 273 Methyltransf_27 PF13708.1 194 1.6e-46 152.8 0.0 1 1 1.8e-48 1.9e-46 152.6 0.0 3 194 72 266 70 266 0.95 # 20896 # 21714 # -1 # ID=3_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.490 13_1 - 376 Methyltransf_27 PF13708.1 194 5.6e-21 69.5 0.0 1 1 1.2e-22 1.3e-20 68.3 0.0 92 194 2 108 1 108 0.87 # 272 # 1399 # 1 # ID=13_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.480 14_3 - 170 Methyltransf_27 PF13708.1 194 3.7e-18 60.3 0.2 1 1 5.7e-20 6.2e-18 59.6 0.0 2 66 93 164 92 169 0.96 # 1479 # 1988 # 1 # ID=14_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.447 2_52 - 695 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.6e-16 54.5 0.0 1 2 6.5e-07 0.00021 14.5 0.0 16 52 199 235 191 341 0.88 # 35423 # 37507 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 2_52 - 695 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.6e-16 54.5 0.0 2 2 8.1e-14 2.7e-11 37.2 0.0 164 345 412 604 391 646 0.77 # 35423 # 37507 # -1 # ID=2_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 5_4 - 254 N6-adenineMlase PF10237.4 162 2.4e-05 18.6 0.0 1 1 1.1e-07 3.7e-05 18.0 0.0 84 133 163 214 133 225 0.77 # 1545 # 2306 # -1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.492 1_50 - 680 AAA_11 PF13086.1 236 0.00077 13.6 0.1 1 1 1.1e-05 0.0035 11.5 0.0 17 72 17 67 4 146 0.73 # 44014 # 46053 # 1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_8 - 260 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.0013 13.4 0.0 1 1 6.3e-06 0.002 12.7 0.0 9 64 87 144 84 229 0.70 # 9391 # 10170 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 5_18 - 203 TIGR00755 TIGR00755 256 8.1e-05 16.2 0.1 1 1 4.8e-07 0.00016 15.3 0.1 32 86 83 139 61 150 0.86 # 12255 # 12863 # 1 # ID=5_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.498 10_3 - 271 MethyltransfD12 PF02086.10 260 2.1e-47 156.3 0.0 1 1 7.3e-50 2.4e-47 156.1 0.0 1 256 6 248 6 252 0.91 # 560 # 1372 # 1 # ID=10_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.445 1_50 - 680 Herpes_ori_bp PF02399.10 824 0.0012 11.4 0.0 1 1 7.3e-06 0.0024 10.4 0.0 52 109 20 83 9 102 0.80 # 44014 # 46053 # 1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 1_31 - 562 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 3.4e-06 21.3 2.4 1 2 4.6e-06 0.0015 12.7 0.3 16 50 94 128 80 131 0.87 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_31 - 562 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 3.4e-06 21.3 2.4 2 2 0.00012 0.038 8.1 0.1 19 60 269 310 260 341 0.84 # 27108 # 28793 # 1 # ID=1_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 1_8 - 260 AAA_24 PF13479.1 213 0.0043 11.2 0.1 1 1 3e-05 0.01 10.0 0.1 5 23 103 121 99 127 0.85 # 9391 # 10170 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_50 - 680 UvrD-helicase PF00580.16 315 9.8e-39 128.0 0.2 1 1 7e-40 1.1e-37 124.5 0.2 2 307 6 260 5 266 0.90 # 44014 # 46053 # 1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.505 4_12 - 595 UvrD-helicase PF00580.16 315 1.4e-30 101.2 2.8 1 3 1.1e-16 1.7e-14 48.4 0.0 2 105 5 91 4 95 0.92 # 14235 # 16019 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 4_12 - 595 UvrD-helicase PF00580.16 315 1.4e-30 101.2 2.8 2 3 1.1e-17 1.8e-15 51.6 0.3 208 314 145 248 107 249 0.86 # 14235 # 16019 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 4_12 - 595 UvrD-helicase PF00580.16 315 1.4e-30 101.2 2.8 3 3 0.072 12 -0.4 0.0 91 128 412 455 373 525 0.73 # 14235 # 16019 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_8 - 260 NACHT PF05729.7 166 0.00042 14.6 0.0 1 1 2.1e-06 0.00068 13.9 0.0 3 49 104 151 102 200 0.81 # 9391 # 10170 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 1_8 - 260 AAA_25 PF13481.1 194 2.3e-06 21.7 0.1 1 1 4.4e-08 7.3e-06 20.1 0.1 9 60 72 128 68 201 0.77 # 9391 # 10170 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 4_12 - 595 AAA_25 PF13481.1 194 0.0011 12.9 0.0 1 1 3.5e-05 0.0058 10.6 0.0 17 63 3 46 1 62 0.78 # 14235 # 16019 # 1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 5_18 - 203 Spermine_synth PF01564.12 246 0.0012 12.4 0.0 1 1 5e-06 0.0016 11.9 0.0 79 143 83 141 65 156 0.84 # 12255 # 12863 # 1 # ID=5_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.498 1_8 - 260 AAA_28 PF13521.1 163 0.00082 13.9 0.0 1 1 5e-06 0.0016 13.0 0.0 1 49 103 156 103 171 0.73 # 9391 # 10170 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 4_16 - 284 AAA_5 PF07728.9 139 4.9e-34 111.6 0.0 1 1 4.7e-36 7.7e-34 111.0 0.0 1 139 98 238 98 238 0.96 # 18817 # 19668 # 1 # ID=4_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.413 1_8 - 260 AAA_5 PF07728.9 139 6e-05 17.4 0.0 1 1 9.1e-07 0.00015 16.1 0.0 1 74 103 172 103 177 0.80 # 9391 # 10170 # -1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b2 (February 2015) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/9b407147-6070-4fd0-9dfe-51a7026dbe66 # Target file: checkm_output/bins/pm1523/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm1523/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/9b407147-6070-4fd0-9dfe-51a7026dbe66 checkm_output/bins/pm1523/genes.faa # Current dir: /mnt/DGK_KLIF/data/klif/reads-for-assembly/trainingsets2/combined/rfplasmid_combined_jellynew2 # Date: Tue Jul 7 16:57:46 2020 # [ok]