# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_30 - 321 Mg_chelatase PF01078.16 207 3.3e-05 15.0 0.0 1 1 1.3e-06 6.4e-05 14.0 0.0 12 44 139 171 132 224 0.75 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 cobW PF02492.14 178 9.5e-06 17.0 0.5 1 1 5.4e-07 2.6e-05 15.6 0.5 4 44 153 195 151 277 0.81 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 IstB_IS21 PF01695.12 178 1.6e-05 16.3 0.0 1 1 5.5e-07 2.6e-05 15.5 0.0 44 74 146 176 127 206 0.87 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_16 - 255 MipZ PF09140.6 261 1.3e-10 32.6 0.1 1 1 5.6e-11 1.3e-09 29.3 0.1 3 129 4 145 2 166 0.72 # 19009 # 19773 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.646 1_10 - 242 MipZ PF09140.6 261 0.00013 12.9 0.1 1 2 2.9e-05 0.0007 10.5 0.0 6 47 8 49 3 66 0.86 # 14184 # 14909 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.629 1_10 - 242 MipZ PF09140.6 261 0.00013 12.9 0.1 2 2 0.04 0.95 0.3 0.0 73 106 55 88 48 99 0.81 # 14184 # 14909 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.629 1_16 - 255 YhjQ PF06564.7 244 4.8e-05 14.6 0.3 1 1 2.6e-05 0.0013 10.0 0.3 4 238 4 249 1 254 0.60 # 19009 # 19773 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.646 1_30 - 321 AIG1 PF04548.11 212 0.00015 12.8 0.1 1 1 5e-06 0.00024 12.1 0.1 1 27 150 176 150 197 0.85 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_28 - 114 SSB PF00436.20 104 3.5e-30 95.9 0.0 1 1 8e-32 3.9e-30 95.7 0.0 2 104 4 104 3 104 0.96 # 27160 # 27501 # -1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.596 1_46 - 166 Methyltransf_18 PF12847.2 112 8.5e-05 15.0 0.0 1 1 2.5e-06 0.00012 14.5 0.0 20 71 38 86 31 123 0.74 # 41813 # 42310 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.643 1_30 - 321 AAA_2 PF07724.9 171 0.00038 12.3 0.1 1 2 0.059 2.8 -0.4 0.1 142 165 5 28 2 33 0.84 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 AAA_2 PF07724.9 171 0.00038 12.3 0.1 2 2 3.9e-05 0.0019 10.0 0.0 4 54 150 200 147 207 0.85 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 DUF87 PF01935.12 229 1.7e-07 23.1 0.0 1 1 5.5e-09 2.7e-07 22.5 0.0 24 63 150 190 136 231 0.81 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 NB-ARC PF00931.17 287 0.00019 12.2 0.0 1 1 5.7e-06 0.00027 11.7 0.0 22 58 152 188 140 200 0.80 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 Septin PF00735.13 281 6.4e-06 17.2 0.1 1 1 2e-07 9.6e-06 16.6 0.1 6 50 151 192 148 215 0.70 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_33 - 853 AAA_22 PF13401.1 131 2.2e-05 16.5 0.1 1 2 0.00072 0.017 7.1 0.0 5 30 489 514 485 559 0.85 # 30042 # 32600 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.639 1_33 - 853 AAA_22 PF13401.1 131 2.2e-05 16.5 0.1 2 2 0.00087 0.021 6.9 0.0 75 100 676 701 620 733 0.77 # 30042 # 32600 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.639 1_30 - 321 AAA_22 PF13401.1 131 5.2e-05 15.3 0.0 1 1 3.9e-06 9.4e-05 14.5 0.0 5 36 150 181 146 220 0.72 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 ATP_bind_1 PF03029.12 238 0.00023 12.6 0.0 1 1 6.9e-06 0.00033 12.1 0.0 1 19 154 172 154 210 0.87 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_16 - 255 SRP54 PF00448.17 196 0.00032 12.0 0.6 1 2 0.0005 0.024 5.9 0.1 11 43 12 44 3 55 0.90 # 19009 # 19773 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.646 1_16 - 255 SRP54 PF00448.17 196 0.00032 12.0 0.6 2 2 0.0024 0.11 3.7 0.0 48 92 80 123 74 133 0.70 # 19009 # 19773 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.646 1_30 - 321 AAA_17 PF13207.1 121 5.1e-05 16.0 0.0 1 1 2.3e-06 0.00011 14.9 0.0 2 20 152 170 151 237 0.81 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 Miro PF08477.8 119 1.2e-05 17.7 0.0 1 1 4.7e-07 2.3e-05 16.8 0.0 2 26 152 177 151 243 0.75 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 MobB PF03205.9 140 6.5e-06 17.8 0.0 1 1 3.2e-07 1.6e-05 16.6 0.0 3 28 152 177 150 200 0.81 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_10 - 242 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.2e-08 26.2 0.0 1 1 8.5e-10 2e-08 25.4 0.0 4 41 6 43 3 87 0.91 # 14184 # 14909 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.629 1_16 - 255 ArsA_ATPase PF02374.10 305 0.00024 12.0 0.3 1 2 0.00013 0.0031 8.4 0.0 9 39 10 40 2 52 0.88 # 19009 # 19773 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.646 1_16 - 255 ArsA_ATPase PF02374.10 305 0.00024 12.0 0.3 2 2 0.02 0.47 1.2 0.1 125 137 113 125 93 177 0.76 # 19009 # 19773 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.646 1_30 - 321 PhoH PF02562.11 205 3.8e-05 14.8 0.1 1 1 1.4e-06 6.8e-05 14.0 0.1 9 56 139 186 133 198 0.83 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 T2SE PF00437.15 272 6.1e-89 289.3 0.1 1 1 1.5e-90 7e-89 289.1 0.1 5 271 27 295 23 296 0.97 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 Zeta_toxin PF06414.7 201 2.6e-05 15.3 0.0 1 1 1.9e-06 4.7e-05 14.4 0.0 16 46 149 182 137 219 0.69 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_10 - 242 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00035 11.5 0.0 1 1 2.4e-05 0.00057 10.9 0.0 19 85 6 76 2 123 0.75 # 14184 # 14909 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.629 1_10 - 242 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.0002 12.4 0.1 1 1 6.5e-06 0.00031 11.8 0.1 4 39 7 42 4 60 0.91 # 14184 # 14909 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.629 1_30 - 321 Arch_ATPase PF01637.13 234 3.1e-05 15.6 0.0 1 1 1.1e-06 5.2e-05 14.9 0.0 22 56 151 186 141 220 0.74 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 AAA_16 PF13191.1 185 2.6e-06 19.4 0.0 1 1 8.5e-08 4.1e-06 18.7 0.0 24 48 149 173 136 285 0.75 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 AAA_23 PF13476.1 202 0.00013 14.2 0.7 1 1 4.9e-06 0.00023 13.4 0.7 22 39 152 169 148 170 0.92 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 AAA_18 PF13238.1 129 0.00044 12.5 0.0 1 1 1.9e-05 0.0009 11.4 0.0 1 18 152 169 152 209 0.82 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_16 - 255 CbiA PF01656.18 195 1.7e-48 156.5 0.0 1 1 8.7e-50 2.1e-48 156.2 0.0 2 195 5 216 4 216 0.84 # 19009 # 19773 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.646 1_10 - 242 CbiA PF01656.18 195 7.8e-10 30.3 0.2 1 1 3.8e-11 9.2e-10 30.1 0.2 2 45 6 49 5 216 0.80 # 14184 # 14909 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.629 1_30 - 321 AAA_14 PF13173.1 128 0.00033 12.5 0.0 1 1 1.1e-05 0.00051 11.8 0.0 3 36 150 185 148 226 0.74 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 AAA_29 PF13555.1 62 1.6e-07 22.7 0.0 1 1 1.3e-08 3.2e-07 21.7 0.0 22 45 148 171 140 182 0.84 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_33 - 853 AAA_29 PF13555.1 62 0.00026 12.4 0.0 1 1 2.9e-05 0.00069 11.1 0.0 23 40 489 505 479 513 0.80 # 30042 # 32600 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.639 1_30 - 321 AAA PF00004.24 132 3.5e-05 15.9 0.0 1 1 1.4e-06 6.9e-05 14.9 0.0 1 23 152 174 152 225 0.80 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 Bac_DnaA PF00308.13 219 7.8e-05 14.2 0.0 1 1 2.1e-06 0.0001 13.8 0.0 34 71 149 186 123 230 0.80 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00015 13.1 0.0 1 1 6e-06 0.00029 12.2 0.0 13 55 140 185 130 198 0.73 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 MMR_HSR1 PF01926.18 116 3.1e-05 15.8 0.1 1 1 1.2e-06 5.8e-05 15.0 0.1 2 26 152 175 151 216 0.73 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 DUF258 PF03193.11 161 3.5e-05 14.9 0.0 1 1 1.1e-06 5.5e-05 14.3 0.0 27 60 140 174 122 217 0.75 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_6 - 638 TraG-D_C PF12696.2 128 6.4e-35 111.7 0.0 1 1 4.3e-36 1e-34 111.0 0.0 1 127 444 568 444 569 0.90 # 8853 # 10766 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.662 1_33 - 853 TraG-D_C PF12696.2 128 0.00035 12.3 0.0 1 1 3.4e-05 0.00082 11.1 0.0 4 72 691 763 688 781 0.74 # 30042 # 32600 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.639 1_10 - 242 AAA_31 PF13614.1 157 0.00014 13.7 0.0 1 1 2e-05 0.00047 12.0 0.0 1 47 3 49 3 91 0.84 # 14184 # 14909 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.629 1_16 - 255 AAA_31 PF13614.1 157 0.00027 12.8 0.1 1 1 3.7e-05 0.00088 11.1 0.1 9 155 10 151 9 153 0.71 # 19009 # 19773 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.646 1_46 - 166 Methyltransf_26 PF13659.1 117 6.7e-05 14.8 0.0 1 1 1.7e-06 8e-05 14.6 0.0 3 93 25 105 23 155 0.79 # 41813 # 42310 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.643 1_30 - 321 AAA_30 PF13604.1 196 3.7e-06 18.5 0.0 1 1 1.2e-07 5.9e-06 17.8 0.0 3 53 135 186 133 218 0.81 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 3e-10 31.8 0.0 1 1 1.2e-11 5.8e-10 30.8 0.0 28 85 139 195 128 219 0.83 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 Dynamin_N PF00350.18 168 8.7e-05 14.2 0.0 1 1 2.8e-06 0.00013 13.7 0.0 1 23 152 174 152 210 0.88 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_33 - 853 ABC_tran PF00005.22 137 2.1e-06 20.0 0.0 1 2 3.3e-06 7.8e-05 14.9 0.0 5 41 482 518 480 594 0.88 # 30042 # 32600 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.639 1_33 - 853 ABC_tran PF00005.22 137 2.1e-06 20.0 0.0 2 2 0.059 1.4 1.1 0.0 119 135 680 696 678 697 0.90 # 30042 # 32600 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.639 1_30 - 321 ABC_tran PF00005.22 137 5.4e-06 18.6 0.0 1 1 3.7e-07 8.9e-06 17.9 0.0 8 36 146 174 141 230 0.80 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 AAA_19 PF13245.1 76 4.2e-08 24.8 0.1 1 1 2.6e-09 1.2e-07 23.3 0.1 2 52 141 189 140 195 0.73 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_33 - 853 AAA_10 PF12846.2 304 6.6e-35 112.8 0.1 1 1 7.2e-36 1.1e-34 112.0 0.1 2 294 489 761 488 773 0.86 # 30042 # 32600 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.639 1_30 - 321 AAA_10 PF12846.2 304 2.8e-08 25.4 0.0 1 1 2.1e-09 3.4e-08 25.1 0.0 2 41 150 191 149 289 0.86 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_10 - 242 AAA_10 PF12846.2 304 1.4e-05 16.4 0.0 1 1 1.3e-06 2e-05 15.9 0.0 3 47 5 49 3 119 0.82 # 14184 # 14909 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.629 1_30 - 321 ResIII PF04851.10 184 2.5e-05 16.0 0.0 1 1 7.9e-07 3.8e-05 15.4 0.0 7 62 65 191 60 214 0.68 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_14 - 344 DUF3584 PF12128.3 1201 0.00041 9.6 51.4 1 1 0.00011 0.0054 5.8 52.0 251 484 88 329 82 338 0.81 # 16752 # 17783 # -1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.748 1_30 - 321 DUF2075 PF09848.4 352 0.00021 12.2 0.0 1 1 5.8e-06 0.00028 11.7 0.0 2 46 150 193 149 220 0.77 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 Adeno_IVa2 PF02456.10 370 3.2e-05 14.5 0.0 1 1 9.4e-07 4.5e-05 14.0 0.0 91 129 153 191 140 218 0.84 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 PduV-EutP PF10662.4 143 3.6e-06 18.4 0.1 1 1 1.3e-07 6.3e-06 17.6 0.1 2 43 150 193 149 216 0.80 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 DEAD PF00270.24 169 1.8e-06 19.4 0.1 1 1 6e-08 2.9e-06 18.7 0.1 3 60 137 195 135 229 0.76 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 DUF815 PF05673.8 250 0.0001 13.2 0.0 1 1 3.1e-06 0.00015 12.6 0.0 50 79 145 175 123 203 0.83 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_6 - 638 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 5.3e-29 92.8 0.0 1 1 5.1e-30 1.2e-28 91.6 0.0 17 366 177 568 169 574 0.82 # 8853 # 10766 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.662 1_30 - 321 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 2.2e-06 18.3 0.0 1 1 1.3e-07 3.2e-06 17.8 0.0 13 55 147 191 142 208 0.85 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 AAA_11 PF13086.1 236 0.00015 13.2 0.0 1 1 4.8e-06 0.00023 12.6 0.0 4 42 136 185 133 247 0.67 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.00017 13.5 0.0 1 1 6.4e-06 0.00031 12.7 0.0 12 44 140 172 135 199 0.86 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_6 - 638 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 6.3e-165 541.0 0.0 1 1 1.6e-166 7.8e-165 540.7 0.0 1 464 121 620 121 624 0.98 # 8853 # 10766 # -1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.662 1_46 - 166 MethyltransfD12 PF02086.10 260 3.8e-06 18.3 0.1 1 2 0.00043 0.021 6.1 0.0 8 60 12 61 3 68 0.83 # 41813 # 42310 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.643 1_46 - 166 MethyltransfD12 PF02086.10 260 3.8e-06 18.3 0.1 2 2 2.3e-05 0.0011 10.3 0.1 175 189 83 97 67 114 0.80 # 41813 # 42310 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.643 1_48 - 234 TIGR00615 TIGR00615 196 0.00035 11.6 0.0 1 1 1.2e-05 0.00059 10.9 0.0 111 147 134 173 125 180 0.79 # 42873 # 43574 # -1 # ID=1_48;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.601 1_30 - 321 Pox_A32 PF04665.7 241 5.1e-05 14.5 0.0 1 1 1.8e-06 8.4e-05 13.8 0.0 14 40 150 176 138 211 0.77 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 GTP_EFTU PF00009.22 188 7.9e-06 17.3 0.1 1 1 2.4e-07 1.2e-05 16.7 0.1 2 30 148 176 147 212 0.84 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00039 12.5 0.0 1 1 1.6e-05 0.00078 11.5 0.0 1 29 152 178 152 209 0.82 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_10 - 242 AAA_24 PF13479.1 213 2.5e-05 15.8 0.0 1 1 7.3e-07 3.5e-05 15.3 0.0 3 56 3 66 1 112 0.71 # 14184 # 14909 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.629 1_30 - 321 UvrD-helicase PF00580.16 315 5.7e-05 14.3 0.1 1 1 1.8e-06 8.7e-05 13.7 0.1 8 41 144 177 134 190 0.74 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_30 - 321 NACHT PF05729.7 166 1.2e-05 16.9 0.0 1 1 2e-06 4.8e-05 14.9 0.0 2 26 151 175 150 204 0.84 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 1_10 - 242 NACHT PF05729.7 166 0.00028 12.4 0.6 1 1 2.4e-05 0.00057 11.4 0.6 3 25 6 28 5 37 0.82 # 14184 # 14909 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.629 1_16 - 255 AAA_25 PF13481.1 194 0.00028 12.2 0.0 1 1 9.5e-06 0.00046 11.5 0.0 42 150 11 122 2 128 0.70 # 19009 # 19773 # -1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.646 1_12 - 218 Ribosomal_L4 PF00573.17 192 0.00018 12.8 3.9 1 1 6.5e-06 0.00031 12.0 3.9 14 111 86 189 75 209 0.80 # 15552 # 16205 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.696 1_30 - 321 AAA_28 PF13521.1 163 5.8e-05 15.0 0.0 1 1 1.9e-06 9.2e-05 14.3 0.0 2 20 152 170 151 207 0.84 # 28287 # 29249 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b2 (February 2015) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/9a76830e-4924-4529-90c8-ee839f81845e # Target file: checkm_output/bins/pm1007/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pm1007/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/9a76830e-4924-4529-90c8-ee839f81845e checkm_output/bins/pm1007/genes.faa # Current dir: /mnt/DGK_KLIF/data/klif/reads-for-assembly/trainingsets2/combined/rfplasmid_combined_jellynew2 # Date: Tue Jul 7 16:52:19 2020 # [ok]