# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_15 - 313 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.00022 11.9 0.0 1 1 1.4e-05 0.00049 10.7 0.0 11 54 132 175 126 199 0.78 # 10248 # 11186 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 1_18 - 822 cobW PF02492.14 178 0.00023 12.1 0.0 1 1 1.3e-05 0.00047 11.1 0.0 3 21 457 475 455 487 0.84 # 11783 # 14248 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.319 1_4 - 229 Thymidylate_kin PF02223.12 186 8.3e-06 16.7 0.2 1 2 9.2e-06 0.00033 11.5 0.0 6 44 11 51 10 62 0.77 # 1572 # 2258 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.309 1_4 - 229 Thymidylate_kin PF02223.12 186 8.3e-06 16.7 0.2 2 2 0.0039 0.14 2.9 0.3 133 169 187 225 150 228 0.74 # 1572 # 2258 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.309 1_15 - 313 ABC_ATPase PF09818.4 448 6.5e-05 13.0 0.1 1 1 2.8e-06 0.0001 12.4 0.1 218 287 116 185 104 205 0.78 # 10248 # 11186 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 1_26 - 148 FeoB_N PF02421.13 156 0.00012 12.9 1.2 1 1 4.6e-06 0.00016 12.4 1.2 13 94 56 135 47 139 0.92 # 19946 # 20389 # 1 # ID=1_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.241 1_15 - 313 IstB_IS21 PF01695.12 178 3.3e-06 18.1 0.0 1 1 1.7e-07 6.1e-06 17.2 0.0 38 82 136 180 110 208 0.66 # 10248 # 11186 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 1_4 - 229 MipZ PF09140.6 261 1.4e-16 51.7 0.3 1 2 3.5e-15 6.2e-14 43.1 0.2 2 140 2 121 1 136 0.83 # 1572 # 2258 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.309 1_4 - 229 MipZ PF09140.6 261 1.4e-16 51.7 0.3 2 2 0.077 1.4 -0.7 0.0 127 169 131 173 123 205 0.74 # 1572 # 2258 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.309 1_34 - 240 MipZ PF09140.6 261 3.2e-05 14.5 0.0 1 1 2.4e-06 4.4e-05 14.1 0.0 5 46 7 48 3 85 0.90 # 26807 # 27526 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.292 1_4 - 229 YhjQ PF06564.7 244 2.8e-05 15.0 0.0 1 1 1.3e-06 4.8e-05 14.2 0.0 10 42 9 41 1 54 0.89 # 1572 # 2258 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.309 1_30 - 121 SSB PF00436.20 104 6.3e-22 69.0 0.0 1 1 2.1e-23 7.6e-22 68.7 0.0 1 103 2 98 2 99 0.96 # 22269 # 22631 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.309 1_24 - 232 DNA_pack_N PF02500.10 284 9e-06 16.8 0.1 1 1 5e-07 1.8e-05 15.8 0.1 201 262 41 103 39 110 0.74 # 18318 # 19013 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.306 1_15 - 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251 Adenylsucc_synt PF00709.16 421 0.00019 11.6 5.1 2 2 2.4e-05 0.00086 9.4 0.9 139 216 159 233 147 239 0.83 # 16109 # 16861 # 1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.305 1_4 - 229 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.6e-10 31.9 0.6 1 1 1.8e-11 3.3e-10 30.9 0.6 6 109 6 110 1 217 0.86 # 1572 # 2258 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.309 1_34 - 240 ArsA_ATPase PF02374.10 305 2e-06 18.4 0.0 1 1 2.2e-07 3.9e-06 17.5 0.0 4 40 6 42 3 59 0.92 # 26807 # 27526 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.292 1_15 - 313 PhoH PF02562.11 205 4.4e-05 14.2 0.3 1 1 2.5e-06 8.9e-05 13.2 0.1 5 56 128 180 125 203 0.75 # 10248 # 11186 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 1_15 - 313 T2SE PF00437.15 272 1.6e-83 271.2 0.6 1 1 5.3e-85 1.9e-83 270.9 0.6 7 269 23 285 18 288 0.98 # 10248 # 11186 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 1_15 - 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822 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.00011 13.4 3.0 3 3 0.067 2.4 -0.8 0.1 85 146 611 670 551 692 0.60 # 11783 # 14248 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.319 1_18 - 822 AAA_16 PF13191.1 185 2.2e-05 15.9 0.0 1 1 1.1e-05 0.0001 13.8 0.0 25 51 455 481 445 590 0.90 # 11783 # 14248 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.319 1_34 - 240 AAA_16 PF13191.1 185 5.4e-05 14.7 0.0 1 1 8e-06 7.2e-05 14.3 0.0 27 119 6 102 5 147 0.78 # 26807 # 27526 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.292 1_15 - 313 AAA_16 PF13191.1 185 8.4e-05 14.1 0.1 1 1 3e-05 0.00027 12.4 0.1 22 49 141 168 133 184 0.84 # 10248 # 11186 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 1_4 - 229 AAA_16 PF13191.1 185 0.00013 13.4 0.0 1 1 2.3e-05 0.00021 12.8 0.0 34 77 11 61 9 180 0.70 # 1572 # 2258 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.309 1_18 - 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822 AAA PF00004.24 132 2.7e-07 22.3 0.1 3 3 0.011 0.38 2.4 0.0 49 113 635 691 630 708 0.77 # 11783 # 14248 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.319 1_3 - 132 Ribosomal_L20 PF00453.13 108 6.8e-05 14.3 0.5 1 1 3.2e-06 0.00011 13.6 0.5 17 65 61 115 47 119 0.72 # 1085 # 1480 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.242 1_15 - 313 Sigma54_activat PF00158.21 168 9e-05 13.5 0.0 1 1 4.9e-06 0.00018 12.5 0.0 14 45 135 166 124 198 0.73 # 10248 # 11186 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 1_18 - 822 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.0003 12.2 0.1 1 1 8.3e-05 0.0015 10.0 0.0 3 20 458 475 456 616 0.90 # 11783 # 14248 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.319 1_15 - 313 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.0004 11.8 2.1 1 1 0.00012 0.0022 9.4 2.1 2 26 146 169 145 311 0.75 # 10248 # 11186 # 1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 1_33 - 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