# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 2_19 - 513 ThiI PF02568.9 197 0.00023 15.6 0.0 1 1 1e-06 0.00044 14.7 0.0 4 163 216 382 213 391 0.69 # 19085 # 20623 # 1 # ID=2_19;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.301 2_19 - 513 ATP_bind_3 PF01171.15 182 0.00034 15.1 0.0 1 1 1.6e-06 0.00068 14.1 0.0 1 77 217 289 217 380 0.68 # 19085 # 20623 # 1 # ID=2_19;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.301 6_5 - 208 Seryl_tRNA_N PF02403.17 108 0.017 10.2 6.5 1 2 3.3e-05 0.007 11.4 0.7 62 98 39 75 31 80 0.84 # 4981 # 5604 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.373 6_5 - 208 Seryl_tRNA_N PF02403.17 108 0.017 10.2 6.5 2 2 0.041 8.9 1.4 0.7 38 79 121 162 114 198 0.46 # 4981 # 5604 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.373 38_1 - 208 Seryl_tRNA_N PF02403.17 108 0.033 9.2 7.3 1 2 0.00014 0.031 9.3 1.0 42 71 57 84 41 116 0.77 # 3 # 626 # 1 # ID=38_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 38_1 - 208 Seryl_tRNA_N PF02403.17 108 0.033 9.2 7.3 2 2 0.017 3.7 2.6 1.1 27 101 109 187 101 201 0.64 # 3 # 626 # 1 # ID=38_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 21_2 - 451 Terminase_6 PF03237.10 384 1.2e-60 200.2 0.0 1 1 3.5e-62 1.4e-60 200.0 0.0 3 382 67 431 65 433 0.95 # 696 # 2048 # -1 # ID=21_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 19_2 - 451 Terminase_6 PF03237.10 384 2.4e-59 195.9 0.0 1 1 7.2e-61 2.8e-59 195.7 0.0 3 382 67 431 65 433 0.94 # 687 # 2039 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.297 1_14 - 451 Terminase_6 PF03237.10 384 8.3e-45 148.1 0.0 1 1 2.5e-46 1e-44 147.8 0.0 1 381 65 430 65 433 0.93 # 12161 # 13513 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.293 12_7 - 283 Terminase_6 PF03237.10 384 6.6e-27 89.2 0.1 1 1 2.6e-28 1e-26 88.6 0.1 3 152 120 269 118 280 0.94 # 2734 # 3582 # -1 # ID=12_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.283 3_19 - 138 Terminase_6 PF03237.10 384 2.7e-21 70.7 0.0 1 1 7.6e-23 3e-21 70.5 0.0 5 137 3 135 1 137 0.96 # 17552 # 17965 # 1 # ID=3_19;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.329 10_7 - 92 Terminase_6 PF03237.10 384 1.5e-17 58.3 0.5 1 1 4.1e-19 1.6e-17 58.3 0.5 85 180 4 90 1 91 0.95 # 4197 # 4472 # -1 # ID=10_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.297 3_20 - 191 Terminase_6 PF03237.10 384 1.7e-17 58.2 0.0 1 1 4.8e-19 1.9e-17 58.0 0.0 195 382 2 175 1 177 0.93 # 18094 # 18666 # 1 # ID=3_20;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.312 10_8 - 151 Terminase_6 PF03237.10 384 1.6e-07 25.4 0.0 1 1 4.9e-09 1.9e-07 25.1 0.0 3 83 67 149 65 150 0.90 # 4462 # 4914 # -1 # ID=10_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.256 10_14 - 61 Terminase_6 PF03237.10 384 3.5e-06 20.9 0.0 1 1 9.7e-08 3.8e-06 20.8 0.0 3 49 1 52 1 59 0.86 # 8620 # 8802 # -1 # ID=10_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.333 10_13 - 88 Terminase_6 PF03237.10 384 0.00015 15.6 0.0 1 1 4.3e-06 0.00017 15.4 0.0 322 382 13 68 7 70 0.84 # 8036 # 8299 # -1 # ID=10_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.295 12_6 - 60 Terminase_6 PF03237.10 384 0.003 11.3 0.0 1 1 8e-05 0.0031 11.2 0.0 222 265 10 52 4 57 0.90 # 2461 # 2640 # -1 # ID=12_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.344 10_8 - 151 IstB_IS21 PF01695.12 178 8.5e-05 17.0 0.0 1 1 8e-07 0.00011 16.6 0.0 19 71 35 85 24 104 0.79 # 4462 # 4914 # -1 # ID=10_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.256 12_7 - 283 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.00039 14.8 0.0 1 1 5.7e-06 0.00083 13.8 0.0 19 71 88 138 80 152 0.79 # 2734 # 3582 # -1 # ID=12_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.283 19_2 - 451 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.00098 13.5 0.0 1 1 1.3e-05 0.0018 12.7 0.0 19 70 35 84 27 101 0.79 # 687 # 2039 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.297 1_11 - 252 MipZ PF09140.6 261 5.7e-11 36.9 0.1 1 1 1.1e-10 4.9e-09 30.6 0.1 2 129 8 154 7 196 0.67 # 9306 # 10061 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.263 2_4 - 254 MipZ PF09140.6 261 8.3e-11 36.4 0.1 1 1 3.6e-11 1.6e-09 32.2 0.1 2 128 8 154 7 170 0.63 # 2272 # 3033 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.260 23_4 - 250 MipZ PF09140.6 261 2.7e-10 34.7 0.3 1 1 8.9e-10 3.9e-08 27.6 0.3 2 128 8 153 7 160 0.58 # 2292 # 3041 # 1 # ID=23_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.251 16_4 - 249 MipZ PF09140.6 261 4.9e-10 33.9 0.4 1 1 9.8e-10 4.2e-08 27.5 0.4 2 128 8 153 7 169 0.57 # 2277 # 3023 # -1 # ID=16_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.261 20_4 - 255 MipZ PF09140.6 261 1.3e-09 32.5 0.1 1 1 6.5e-10 2.8e-08 28.1 0.0 2 129 8 155 7 158 0.64 # 2336 # 3100 # -1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.242 26_4 - 247 MipZ PF09140.6 261 3.5e-09 31.0 0.2 1 1 4.2e-09 1.8e-07 25.4 0.2 2 52 8 56 7 161 0.59 # 1620 # 2360 # 1 # ID=26_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.246 13_3 - 252 MipZ PF09140.6 261 2.1e-08 28.5 0.4 1 1 1.2e-08 5.4e-07 23.9 0.4 2 58 8 59 7 157 0.62 # 3810 # 4565 # -1 # ID=13_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.286 24_6 - 136 MipZ PF09140.6 261 6.6e-08 26.9 0.0 1 1 6.7e-09 2.9e-07 24.8 0.0 2 62 8 67 7 133 0.81 # 2024 # 2431 # -1 # ID=24_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.233 9_12 - 129 MipZ PF09140.6 261 1.3e-07 25.9 0.0 1 1 3.7e-09 1.6e-07 25.6 0.0 2 55 8 60 7 86 0.79 # 10272 # 10658 # 1 # ID=9_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.235 17_2 - 250 MipZ PF09140.6 261 1.7e-07 25.5 0.0 1 1 6.8e-08 2.9e-06 21.5 0.0 2 128 4 148 3 163 0.67 # 640 # 1389 # -1 # ID=17_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.295 9_12 - 129 YhjQ PF06564.7 244 1.3e-10 36.0 0.0 1 1 2e-12 1.4e-10 35.9 0.0 3 84 8 91 6 126 0.71 # 10272 # 10658 # 1 # ID=9_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.235 24_6 - 136 YhjQ PF06564.7 244 7.4e-09 30.3 0.0 1 1 1.2e-10 8.4e-09 30.1 0.0 3 49 8 54 7 133 0.66 # 2024 # 2431 # -1 # ID=24_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.233 20_4 - 255 YhjQ PF06564.7 244 2.5e-07 25.3 0.0 1 1 7.1e-09 5.1e-07 24.2 0.0 2 144 7 151 6 166 0.61 # 2336 # 3100 # -1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.242 17_2 - 250 YhjQ PF06564.7 244 0.00014 16.3 0.0 1 1 1.5e-05 0.0011 13.4 0.0 3 209 4 223 1 232 0.61 # 640 # 1389 # -1 # ID=17_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.295 13_3 - 252 YhjQ PF06564.7 244 0.0013 13.1 0.0 1 1 2.8e-05 0.002 12.4 0.0 2 143 7 148 6 165 0.72 # 3810 # 4565 # -1 # ID=13_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.286 2_4 - 254 YhjQ PF06564.7 244 0.0014 13.0 0.0 1 1 2.7e-05 0.002 12.5 0.0 3 143 8 150 6 162 0.69 # 2272 # 3033 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.260 2_4 - 254 AAA_22 PF13401.1 131 0.0013 13.8 0.0 1 1 8e-06 0.0035 12.5 0.0 14 69 17 103 15 175 0.71 # 2272 # 3033 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.260 20_4 - 255 ATP_bind_1 PF03029.12 238 0.00084 13.9 0.5 1 1 1.6e-05 0.0017 12.8 0.5 6 54 17 67 15 134 0.67 # 2336 # 3100 # -1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.242 2_4 - 254 ATP_bind_1 PF03029.12 238 0.002 12.7 0.0 1 1 3.1e-05 0.0033 11.9 0.0 6 44 17 55 15 132 0.88 # 2272 # 3033 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.260 24_6 - 136 ATP_bind_1 PF03029.12 238 0.0025 12.3 0.1 1 1 4.9e-05 0.0053 11.3 0.1 6 42 17 53 15 132 0.92 # 2024 # 2431 # -1 # ID=24_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.233 9_12 - 129 ATP_bind_1 PF03029.12 238 0.0028 12.2 0.0 1 1 3.4e-05 0.0037 11.8 0.0 6 42 17 53 15 88 0.82 # 10272 # 10658 # 1 # ID=9_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.235 2_4 - 254 SRP54 PF00448.17 196 0.0018 12.7 0.1 1 2 0.00017 0.075 7.4 0.0 11 38 17 44 6 52 0.83 # 2272 # 3033 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.260 2_4 - 254 SRP54 PF00448.17 196 0.0018 12.7 0.1 2 2 0.0064 2.8 2.3 0.0 80 92 121 133 88 143 0.74 # 2272 # 3033 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.260 12_7 - 283 AAA_17 PF13207.1 121 0.0092 11.8 2.5 1 1 6.1e-05 0.027 10.3 0.8 1 97 116 250 116 269 0.51 # 2734 # 3582 # -1 # ID=12_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.283 2_20 - 486 GTP_EFTU_D4 PF14578.1 81 0.00092 13.8 0.5 1 2 2.6e-05 0.011 10.3 0.5 45 72 75 105 64 115 0.79 # 20643 # 22100 # 1 # ID=2_20;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.342 2_20 - 486 GTP_EFTU_D4 PF14578.1 81 0.00092 13.8 0.5 2 2 0.07 30 -0.6 0.0 41 57 452 468 439 473 0.83 # 20643 # 22100 # 1 # ID=2_20;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.342 2_19 - 513 NAD_synthase PF02540.12 242 2.5e-13 44.4 0.7 1 2 1e-12 4.5e-10 33.8 0.1 4 93 201 289 198 300 0.85 # 19085 # 20623 # 1 # ID=2_19;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.301 2_19 - 513 NAD_synthase PF02540.12 242 2.5e-13 44.4 0.7 2 2 4.9e-05 0.021 8.6 0.0 148 177 360 389 358 393 0.95 # 19085 # 20623 # 1 # ID=2_19;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.301 4_14 - 174 CTP_synth_N PF06418.9 276 0.00039 14.5 0.0 1 1 1.3e-06 0.00056 14.0 0.0 44 102 91 151 43 160 0.80 # 10790 # 11311 # 1 # ID=4_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.351 2_4 - 254 ArsA_ATPase PF02374.10 305 5.4e-13 43.6 0.2 1 1 3.4e-14 1.5e-12 42.1 0.2 6 137 12 135 6 144 0.62 # 2272 # 3033 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.260 20_4 - 255 ArsA_ATPase PF02374.10 305 6.7e-12 40.0 0.2 1 1 2.6e-13 1.1e-11 39.2 0.2 7 141 13 139 6 246 0.71 # 2336 # 3100 # -1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.242 13_3 - 252 ArsA_ATPase PF02374.10 305 2.6e-10 34.7 0.7 1 2 3e-10 1.3e-08 29.2 0.1 6 70 12 74 6 92 0.84 # 3810 # 4565 # -1 # ID=13_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.286 13_3 - 252 ArsA_ATPase PF02374.10 305 2.6e-10 34.7 0.7 2 2 0.012 0.51 4.2 0.0 124 137 120 133 101 170 0.86 # 3810 # 4565 # -1 # ID=13_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.286 9_12 - 129 ArsA_ATPase PF02374.10 305 4.3e-10 34.0 0.0 1 1 9.9e-12 4.3e-10 34.0 0.0 7 53 13 59 7 126 0.90 # 10272 # 10658 # 1 # ID=9_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.235 24_6 - 136 ArsA_ATPase PF02374.10 305 8.9e-10 33.0 0.0 1 1 2.8e-11 1.2e-09 32.6 0.0 9 134 15 132 7 133 0.83 # 2024 # 2431 # -1 # ID=24_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.233 23_4 - 250 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.8e-07 25.4 1.4 1 1 2.1e-08 8.9e-07 23.2 0.3 7 136 13 133 6 138 0.65 # 2292 # 3041 # 1 # ID=23_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.251 16_4 - 249 ArsA_ATPase PF02374.10 305 9.5e-07 23.0 4.1 1 1 9.2e-08 4e-06 21.0 1.6 4 136 9 133 6 139 0.58 # 2277 # 3023 # -1 # ID=16_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.261 26_4 - 247 ArsA_ATPase PF02374.10 305 2.7e-06 21.5 0.5 1 1 3.4e-07 1.5e-05 19.2 0.5 7 64 13 68 7 139 0.64 # 1620 # 2360 # 1 # ID=26_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.246 1_11 - 252 ArsA_ATPase PF02374.10 305 5.5e-06 20.5 1.3 1 1 2.6e-06 0.00011 16.2 1.3 7 72 13 74 6 136 0.48 # 9306 # 10061 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.263 17_2 - 250 ArsA_ATPase PF02374.10 305 0.00034 14.7 0.7 1 1 4.2e-05 0.0018 12.3 0.5 9 136 11 128 3 194 0.72 # 640 # 1389 # -1 # ID=17_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.295 19_2 - 451 PhoH PF02562.11 205 0.00024 15.3 0.0 1 2 0.00012 0.011 10.0 0.0 5 47 45 89 43 142 0.85 # 687 # 2039 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.297 19_2 - 451 PhoH PF02562.11 205 0.00024 15.3 0.0 2 2 0.015 1.3 3.2 0.0 115 152 159 196 150 213 0.84 # 687 # 2039 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.297 12_7 - 283 PhoH PF02562.11 205 0.00034 14.9 0.0 1 2 7.2e-05 0.0063 10.7 0.0 5 47 98 142 96 148 0.76 # 2734 # 3582 # -1 # ID=12_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.283 12_7 - 283 PhoH PF02562.11 205 0.00034 14.9 0.0 2 2 0.051 4.4 1.4 0.0 116 152 213 249 205 265 0.83 # 2734 # 3582 # -1 # ID=12_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.283 21_2 - 451 PhoH PF02562.11 205 0.0005 14.3 0.0 1 2 0.00027 0.024 8.8 0.0 5 46 45 88 43 106 0.77 # 696 # 2048 # -1 # ID=21_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 21_2 - 451 PhoH PF02562.11 205 0.0005 14.3 0.0 2 2 0.016 1.4 3.1 0.0 115 152 159 196 152 210 0.84 # 696 # 2048 # -1 # ID=21_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 10_8 - 151 PhoH PF02562.11 205 0.00085 13.5 0.0 1 1 1.6e-05 0.0014 12.9 0.0 5 44 45 86 42 144 0.82 # 4462 # 4914 # -1 # ID=10_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.256 1_14 - 451 PhoH PF02562.11 205 0.0014 12.8 0.0 1 2 0.00074 0.064 7.4 0.0 5 48 45 90 43 124 0.81 # 12161 # 13513 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.293 1_14 - 451 PhoH PF02562.11 205 0.0014 12.8 0.0 2 2 0.017 1.5 2.9 0.0 119 153 163 197 154 221 0.84 # 12161 # 13513 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.293 10_8 - 151 T2SE PF00437.15 272 0.00066 13.6 0.0 1 1 7.6e-06 0.00082 13.3 0.0 96 151 29 85 17 100 0.74 # 4462 # 4914 # -1 # ID=10_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.256 12_7 - 283 T2SE PF00437.15 272 0.0021 12.0 0.0 1 1 6e-05 0.0065 10.3 0.0 96 150 82 137 68 146 0.70 # 2734 # 3582 # -1 # ID=12_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.283 21_2 - 451 T2SE PF00437.15 272 0.0029 11.5 0.1 1 1 6.4e-05 0.007 10.2 0.0 94 155 24 89 16 100 0.69 # 696 # 2048 # -1 # ID=21_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 19_2 - 451 T2SE PF00437.15 272 0.0048 10.8 0.1 1 1 0.0001 0.011 9.5 0.0 97 151 30 85 17 97 0.71 # 687 # 2039 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.297 25_2 - 357 TIGR00810 TIGR00810 73 0.098 7.5 6.4 1 1 3.2e-05 0.014 10.2 1.7 7 55 12 60 8 67 0.79 # 601 # 1671 # 1 # ID=25_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.364 38_1 - 208 Phe_tRNA-synt_N PF02912.13 73 0.0042 11.8 3.6 1 3 0.011 4.6 2.1 0.1 43 63 65 85 54 89 0.83 # 3 # 626 # 1 # ID=38_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 38_1 - 208 Phe_tRNA-synt_N PF02912.13 73 0.0042 11.8 3.6 2 3 0.012 5.3 1.9 0.1 44 61 126 143 111 147 0.86 # 3 # 626 # 1 # ID=38_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 38_1 - 208 Phe_tRNA-synt_N PF02912.13 73 0.0042 11.8 3.6 3 3 0.00012 0.054 8.3 0.7 11 68 140 199 130 203 0.87 # 3 # 626 # 1 # ID=38_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 26_4 - 247 VirC1 PF07015.6 231 4.4e-07 24.1 0.2 1 2 3.4e-06 0.00018 15.6 0.0 3 45 8 49 6 73 0.80 # 1620 # 2360 # 1 # ID=26_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.246 26_4 - 247 VirC1 PF07015.6 231 4.4e-07 24.1 0.2 2 2 0.0017 0.092 6.7 0.0 81 150 121 186 101 217 0.73 # 1620 # 2360 # 1 # ID=26_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.246 13_3 - 252 VirC1 PF07015.6 231 4.9e-07 24.0 0.0 1 2 8.3e-07 4.5e-05 17.6 0.0 2 46 7 50 6 71 0.84 # 3810 # 4565 # -1 # ID=13_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.286 13_3 - 252 VirC1 PF07015.6 231 4.9e-07 24.0 0.0 2 2 0.0093 0.5 4.3 0.0 81 117 120 156 99 173 0.75 # 3810 # 4565 # -1 # ID=13_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.286 16_4 - 249 VirC1 PF07015.6 231 1.4e-06 22.5 0.0 1 2 1.3e-06 6.9e-05 17.0 0.0 2 43 7 47 6 86 0.84 # 2277 # 3023 # -1 # ID=16_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.261 16_4 - 249 VirC1 PF07015.6 231 1.4e-06 22.5 0.0 2 2 0.014 0.75 3.8 0.0 82 120 122 160 101 194 0.79 # 2277 # 3023 # -1 # ID=16_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.261 2_4 - 254 VirC1 PF07015.6 231 1.4e-05 19.2 0.5 1 2 3.4e-06 0.00018 15.6 0.0 2 40 7 45 6 70 0.89 # 2272 # 3033 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.260 2_4 - 254 VirC1 PF07015.6 231 1.4e-05 19.2 0.5 2 2 0.062 3.4 1.6 0.1 83 113 124 154 102 178 0.78 # 2272 # 3033 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.260 23_4 - 250 VirC1 PF07015.6 231 2.3e-05 18.5 0.5 1 1 3e-06 0.00016 15.7 0.0 2 42 7 46 6 64 0.77 # 2292 # 3041 # 1 # ID=23_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.251 1_11 - 252 VirC1 PF07015.6 231 0.00015 15.9 2.6 1 2 2.2e-05 0.0012 12.9 0.1 2 40 7 44 6 57 0.76 # 9306 # 10061 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.263 1_11 - 252 VirC1 PF07015.6 231 0.00015 15.9 2.6 2 2 0.038 2 2.3 0.1 84 132 124 171 108 216 0.75 # 9306 # 10061 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.263 20_4 - 255 VirC1 PF07015.6 231 0.00015 15.9 0.0 1 2 3.6e-05 0.002 12.2 0.0 2 45 7 50 6 59 0.87 # 2336 # 3100 # -1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.242 20_4 - 255 VirC1 PF07015.6 231 0.00015 15.9 0.0 2 2 0.068 3.7 1.5 0.1 78 156 119 197 101 210 0.80 # 2336 # 3100 # -1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.242 9_12 - 129 VirC1 PF07015.6 231 0.00027 15.0 0.0 1 1 6.1e-06 0.00033 14.7 0.0 3 47 8 52 6 79 0.83 # 10272 # 10658 # 1 # ID=9_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.235 2_19 - 513 TIGR02432 TIGR02432 189 6.9e-05 17.5 0.0 1 1 3.6e-07 0.00016 16.3 0.0 1 158 217 373 217 382 0.70 # 19085 # 20623 # 1 # ID=2_19;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.301 2_4 - 254 Fer4_NifH PF00142.13 273 7e-08 26.9 0.3 1 1 6.9e-09 3.3e-07 24.7 0.1 8 57 15 63 9 95 0.78 # 2272 # 3033 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.260 24_6 - 136 Fer4_NifH PF00142.13 273 1.4e-06 22.6 0.0 1 1 3.7e-08 1.8e-06 22.3 0.0 8 48 15 55 9 92 0.85 # 2024 # 2431 # -1 # ID=24_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.233 20_4 - 255 Fer4_NifH PF00142.13 273 4e-06 21.1 0.1 1 1 2.6e-07 1.3e-05 19.5 0.0 8 48 15 55 7 93 0.86 # 2336 # 3100 # -1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.242 9_12 - 129 Fer4_NifH PF00142.13 273 1e-05 19.8 0.0 1 1 2.5e-07 1.2e-05 19.6 0.0 8 46 15 53 9 96 0.76 # 10272 # 10658 # 1 # ID=9_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.235 23_4 - 250 Fer4_NifH PF00142.13 273 1.4e-05 19.3 0.3 1 1 7.8e-07 3.8e-05 17.9 0.1 8 60 15 65 8 91 0.76 # 2292 # 3041 # 1 # ID=23_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.251 13_3 - 252 Fer4_NifH PF00142.13 273 2e-05 18.8 0.2 1 1 1.2e-06 6e-05 17.3 0.0 8 48 15 53 9 84 0.75 # 3810 # 4565 # -1 # ID=13_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.286 16_4 - 249 Fer4_NifH PF00142.13 273 2.2e-05 18.7 0.3 1 1 1.3e-06 6.3e-05 17.2 0.0 8 75 15 83 8 93 0.76 # 2277 # 3023 # -1 # ID=16_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.261 26_4 - 247 Fer4_NifH PF00142.13 273 7.8e-05 16.9 0.1 1 1 3.3e-06 0.00016 15.9 0.1 8 74 15 82 8 92 0.70 # 1620 # 2360 # 1 # ID=26_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.246 1_11 - 252 Fer4_NifH PF00142.13 273 8.7e-05 16.7 0.0 1 1 3.8e-06 0.00018 15.7 0.0 8 51 15 57 8 84 0.81 # 9306 # 10061 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.263 2_19 - 513 QueC PF06508.8 210 2.9e-06 21.6 0.1 1 1 6.2e-08 2.7e-05 18.5 0.1 2 176 218 381 217 388 0.72 # 19085 # 20623 # 1 # ID=2_19;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.301 13_3 - 252 AAA_18 PF13238.1 129 0.0013 14.0 0.4 1 1 2e-05 0.0044 12.3 0.0 8 102 17 132 16 136 0.73 # 3810 # 4565 # -1 # ID=13_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.286 23_4 - 250 AAA_18 PF13238.1 129 0.0014 13.9 0.7 1 1 2.4e-05 0.0052 12.1 0.1 8 87 17 101 15 137 0.71 # 2292 # 3041 # 1 # ID=23_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.251 3_5 - 229 AAA_13 PF13166.1 712 4.7e-07 23.6 35.5 1 1 6.9e-09 6e-07 23.2 35.5 263 433 41 204 38 207 0.81 # 5367 # 6053 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.249 12_3 - 199 AAA_13 PF13166.1 712 1.5e-05 18.6 14.9 1 1 2.1e-07 1.8e-05 18.3 14.9 263 386 37 163 15 169 0.72 # 735 # 1331 # -1 # ID=12_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.283 15_1 - 201 AAA_13 PF13166.1 712 0.00018 15.1 19.2 1 1 2.5e-06 0.00022 14.7 19.2 310 460 26 175 8 179 0.67 # 308 # 910 # 1 # ID=15_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.262 19_1 - 211 AAA_13 PF13166.1 712 0.0002 14.9 15.6 1 1 2.9e-06 0.00025 14.5 15.6 263 368 37 153 26 183 0.66 # 13 # 645 # -1 # ID=19_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.281 9_1 - 119 AAA_13 PF13166.1 712 0.0039 10.6 19.7 1 1 5e-05 0.0043 10.5 19.7 358 446 7 96 1 103 0.48 # 3 # 359 # 1 # ID=9_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.216 16_4 - 249 CbiA PF01656.18 195 2.9e-39 129.5 0.3 1 1 8.4e-41 3.6e-39 129.1 0.3 1 170 9 195 9 222 0.87 # 2277 # 3023 # -1 # ID=16_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.261 23_4 - 250 CbiA PF01656.18 195 9.3e-38 124.5 0.6 1 1 2.8e-39 1.2e-37 124.2 0.6 1 189 9 211 9 217 0.78 # 2292 # 3041 # 1 # ID=23_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.251 26_4 - 247 CbiA PF01656.18 195 8.2e-36 118.2 0.2 1 1 2.2e-37 9.7e-36 118.0 0.2 1 175 9 201 9 221 0.84 # 1620 # 2360 # 1 # ID=26_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.246 1_11 - 252 CbiA PF01656.18 195 1.2e-34 114.4 0.1 1 1 3.5e-36 1.5e-34 114.1 0.1 1 174 9 202 9 219 0.81 # 9306 # 10061 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.263 2_4 - 254 CbiA PF01656.18 195 2.1e-34 113.6 0.1 1 1 5.8e-36 2.5e-34 113.3 0.1 1 191 9 218 9 222 0.82 # 2272 # 3033 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.260 13_3 - 252 CbiA PF01656.18 195 4.5e-34 112.5 0.2 1 1 1.7e-35 7.4e-34 111.8 0.2 1 193 9 214 9 232 0.75 # 3810 # 4565 # -1 # ID=13_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.286 20_4 - 255 CbiA PF01656.18 195 2.4e-32 106.9 0.4 1 1 6.8e-34 2.9e-32 106.6 0.4 1 192 9 222 9 225 0.78 # 2336 # 3100 # -1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.242 17_2 - 250 CbiA PF01656.18 195 4.9e-29 96.1 0.0 1 1 1.5e-30 6.4e-29 95.7 0.0 1 194 5 220 5 221 0.77 # 640 # 1389 # -1 # ID=17_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.295 24_6 - 136 CbiA PF01656.18 195 2.4e-19 64.5 0.0 1 1 6.3e-21 2.7e-19 64.3 0.0 1 102 9 132 9 134 0.68 # 2024 # 2431 # -1 # ID=24_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.233 9_12 - 129 CbiA PF01656.18 195 3.3e-16 54.2 0.0 1 1 8.8e-18 3.8e-16 54.0 0.0 1 98 9 126 9 126 0.77 # 10272 # 10658 # 1 # ID=9_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.235 10_3 - 184 RNA_pol_Rpb1_5 PF04998.12 277 0.047 7.9 4.7 1 1 0.00015 0.064 7.4 4.7 103 215 29 175 4 180 0.63 # 1792 # 2343 # 1 # ID=10_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.306 2_19 - 513 PAPS_reduct PF01507.14 174 1.4e-07 26.5 0.0 1 1 5.4e-10 2.3e-07 25.7 0.0 2 80 218 297 217 396 0.69 # 19085 # 20623 # 1 # ID=2_19;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.301 27_4 - 78 ThiS PF02597.15 77 0.00024 16.5 0.0 1 1 1.4e-06 0.00031 16.1 0.0 22 64 30 73 7 75 0.79 # 2043 # 2276 # 1 # ID=27_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.291 9_13 - 78 ThiS PF02597.15 77 0.00024 16.5 0.0 1 1 1.4e-06 0.00031 16.1 0.0 22 64 30 73 7 75 0.79 # 10848 # 11081 # 1 # ID=9_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.291 1_50 - 322 POT1 PF02765.12 146 0.0005 15.0 0.0 1 1 2.2e-06 0.00094 14.1 0.0 56 103 97 143 65 178 0.86 # 42548 # 43513 # 1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.313 2_19 - 513 Asn_synthase PF00733.16 255 0.00022 15.7 0.0 1 2 0.061 26 -0.9 0.0 19 27 47 55 39 60 0.86 # 19085 # 20623 # 1 # ID=2_19;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.301 2_19 - 513 Asn_synthase PF00733.16 255 0.00022 15.7 0.0 2 2 2.3e-06 0.001 13.6 0.0 9 73 208 271 199 297 0.77 # 19085 # 20623 # 1 # ID=2_19;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.301 23_4 - 250 AAA_31 PF13614.1 157 2.3e-17 58.3 1.4 1 1 7.6e-19 3.3e-17 57.8 1.4 1 155 7 160 7 162 0.80 # 2292 # 3041 # 1 # ID=23_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.251 16_4 - 249 AAA_31 PF13614.1 157 2.2e-16 55.2 0.6 1 1 1.2e-17 5.3e-16 53.9 0.6 1 156 7 161 7 162 0.81 # 2277 # 3023 # -1 # ID=16_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.261 1_11 - 252 AAA_31 PF13614.1 157 2.6e-15 51.7 0.6 1 1 9.2e-17 4e-15 51.1 0.6 1 152 7 157 7 162 0.84 # 9306 # 10061 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.263 13_3 - 252 AAA_31 PF13614.1 157 4.5e-15 50.9 1.3 1 1 2.7e-16 1.2e-14 49.5 1.3 1 153 7 157 7 161 0.79 # 3810 # 4565 # -1 # ID=13_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.286 20_4 - 255 AAA_31 PF13614.1 157 1.8e-13 45.7 0.6 1 1 6.6e-15 2.9e-13 45.0 0.6 1 151 7 157 7 162 0.89 # 2336 # 3100 # -1 # ID=20_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.242 2_4 - 254 AAA_31 PF13614.1 157 3e-13 45.0 0.8 1 1 9.9e-15 4.3e-13 44.5 0.8 1 148 7 154 7 163 0.81 # 2272 # 3033 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.260 26_4 - 247 AAA_31 PF13614.1 157 4.3e-13 44.4 2.5 1 1 1.4e-14 5.9e-13 44.0 0.6 2 152 8 157 7 162 0.75 # 1620 # 2360 # 1 # ID=26_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.246 17_2 - 250 AAA_31 PF13614.1 157 6.4e-13 43.9 0.0 1 1 2.6e-14 1.1e-12 43.1 0.0 2 151 4 151 3 157 0.82 # 640 # 1389 # -1 # ID=17_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.295 24_6 - 136 AAA_31 PF13614.1 157 1.2e-10 36.5 0.3 1 1 3.3e-12 1.4e-10 36.3 0.3 2 126 8 133 7 135 0.91 # 2024 # 2431 # -1 # ID=24_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.233 9_12 - 129 AAA_31 PF13614.1 157 2.2e-09 32.4 0.0 1 1 6.2e-11 2.7e-09 32.1 0.0 2 88 8 86 7 106 0.77 # 10272 # 10658 # 1 # ID=9_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.235 9_8 - 1272 Methyltransf_26 PF13659.1 117 1.7e-07 26.3 0.0 1 1 1.2e-09 5.2e-07 24.7 0.0 3 115 503 866 501 868 0.77 # 3801 # 7616 # -1 # ID=9_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.251 8_9 - 222 ApbA PF02558.11 151 0.0022 12.4 0.0 1 1 1.1e-05 0.0047 11.4 0.0 1 37 114 150 114 191 0.78 # 8079 # 8744 # -1 # ID=8_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.230 26_4 - 247 MukB PF04310.7 227 0.0019 12.5 0.0 1 1 6.7e-06 0.0029 11.9 0.0 27 83 7 63 4 87 0.85 # 1620 # 2360 # 1 # ID=26_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.246 9_8 - 1272 Eco57I PF07669.6 106 1.5e-08 29.9 8.4 1 2 4.9e-06 0.0021 13.4 0.0 3 33 761 789 757 805 0.76 # 3801 # 7616 # -1 # ID=9_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.251 9_8 - 1272 Eco57I PF07669.6 106 1.5e-08 29.9 8.4 2 2 2.4e-07 0.00011 17.6 1.4 28 103 841 916 811 919 0.84 # 3801 # 7616 # -1 # ID=9_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.251 8_9 - 222 ThiF PF00899.16 136 1.5e-24 81.4 0.1 1 1 6.4e-27 2.8e-24 80.5 0.0 2 102 111 214 110 219 0.90 # 8079 # 8744 # -1 # ID=8_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.230 12_3 - 199 DUF3584 PF12128.3 1201 6.7e-07 22.0 4.9 1 1 1.2e-08 7.6e-07 21.8 4.9 683 804 55 173 16 179 0.78 # 735 # 1331 # -1 # ID=12_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.283 3_5 - 229 DUF3584 PF12128.3 1201 8.3e-07 21.6 14.2 1 1 2.3e-08 1.4e-06 20.9 14.2 606 748 56 204 24 207 0.49 # 5367 # 6053 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.249 9_1 - 119 DUF3584 PF12128.3 1201 5.4e-05 15.6 6.7 1 1 9.4e-07 5.8e-05 15.5 6.7 682 766 6 90 1 101 0.61 # 3 # 359 # 1 # ID=9_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.216 15_1 - 201 DUF3584 PF12128.3 1201 6.1e-05 15.5 7.4 1 1 1.2e-06 7.6e-05 15.1 7.4 372 490 53 174 28 178 0.66 # 308 # 910 # 1 # ID=15_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.262 4_25 - 170 DUF3584 PF12128.3 1201 0.00032 13.1 3.8 1 1 6.3e-06 0.00039 12.8 3.8 671 789 57 140 25 149 0.31 # 20065 # 20574 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.265 21_1 - 214 DUF3584 PF12128.3 1201 0.00045 12.6 11.1 1 1 1.3e-05 0.0008 11.8 11.1 695 788 49 143 14 185 0.38 # 13 # 654 # -1 # ID=21_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.287 19_1 - 211 DUF3584 PF12128.3 1201 0.00073 11.9 9.9 1 1 1.4e-05 0.00087 11.6 9.9 370 484 50 165 22 180 0.77 # 13 # 645 # -1 # ID=19_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.281 26_4 - 247 CmcI PF04989.7 206 0.00069 13.9 0.2 1 1 8.5e-06 0.0018 12.5 0.1 32 93 5 67 1 108 0.80 # 1620 # 2360 # 1 # ID=26_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.246 16_4 - 249 CmcI PF04989.7 206 0.002 12.4 0.2 1 2 4.7e-05 0.01 10.1 0.1 37 90 14 64 8 70 0.86 # 2277 # 3023 # -1 # ID=16_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.261 16_4 - 249 CmcI PF04989.7 206 0.002 12.4 0.2 2 2 0.057 12 0.0 0.0 164 183 187 205 117 236 0.79 # 2277 # 3023 # -1 # ID=16_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.261 4_11 - 398 Terminase_3 PF04466.8 387 8.4e-90 296.5 0.0 1 1 9e-92 1.3e-89 295.9 0.0 2 386 19 394 18 395 0.96 # 7929 # 9122 # 1 # ID=4_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.347 19_2 - 451 Terminase_3 PF04466.8 387 6.4e-12 40.2 0.2 1 1 5.5e-14 7.9e-12 39.9 0.2 2 245 61 300 60 377 0.81 # 687 # 2039 # -1 # ID=19_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.297 21_2 - 451 Terminase_3 PF04466.8 387 4e-11 37.5 0.2 1 1 3.5e-13 5.1e-11 37.2 0.2 2 239 61 294 60 375 0.81 # 696 # 2048 # -1 # ID=21_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 27_4 - 78 TIGR00344 TIGR00344 847 0.0064 9.3 2.2 1 1 4.2e-05 0.0061 9.4 2.2 711 758 4 51 1 74 0.81 # 2043 # 2276 # 1 # ID=27_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.291 9_13 - 78 TIGR00344 TIGR00344 847 0.0064 9.3 2.2 1 1 4.2e-05 0.0061 9.4 2.2 711 758 4 51 1 74 0.81 # 10848 # 11081 # 1 # ID=9_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.291 9_1 - 119 TIGR00344 TIGR00344 847 0.021 7.6 10.2 1 1 0.00016 0.024 7.5 10.2 707 793 7 97 1 105 0.49 # 3 # 359 # 1 # ID=9_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.216 21_1 - 214 Kinesin-relat_1 PF12711.2 86 0.078 8.4 10.3 1 2 0.0031 1.3 4.5 0.5 8 42 73 108 70 114 0.79 # 13 # 654 # -1 # ID=21_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.287 21_1 - 214 Kinesin-relat_1 PF12711.2 86 0.078 8.4 10.3 2 2 0.00044 0.19 7.2 4.3 17 56 100 140 87 171 0.77 # 13 # 654 # -1 # ID=21_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.287 12_3 - 199 AAA_32 PF13654.1 509 0.0011 12.6 8.0 1 2 3.2e-05 0.0046 10.6 7.2 162 257 37 135 30 149 0.79 # 735 # 1331 # -1 # ID=12_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.283 12_3 - 199 AAA_32 PF13654.1 509 0.0011 12.6 8.0 2 2 0.0018 0.26 4.8 0.7 167 234 100 165 92 174 0.74 # 735 # 1331 # -1 # ID=12_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.283 9_1 - 119 AAA_32 PF13654.1 509 0.0023 11.6 5.6 1 1 2.1e-05 0.0031 11.2 5.6 176 263 3 86 1 103 0.61 # 3 # 359 # 1 # ID=9_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.216 3_5 - 229 AAA_32 PF13654.1 509 0.0029 11.2 15.8 1 2 0.00064 0.092 6.3 2.4 168 218 58 108 31 120 0.78 # 5367 # 6053 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.249 3_5 - 229 AAA_32 PF13654.1 509 0.0029 11.2 15.8 2 2 6.4e-05 0.0093 9.6 7.1 166 250 118 198 109 205 0.83 # 5367 # 6053 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.249 29_1 - 267 MethyltransfD12 PF02086.10 260 3.8e-14 47.7 3.6 1 1 1.8e-16 7.9e-14 46.7 3.6 3 204 8 183 7 231 0.74 # 3 # 803 # -1 # ID=29_1;partial=10;start_type=TTG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.293 24_6 - 136 ArgK PF03308.11 267 0.0023 11.7 0.0 1 1 7.6e-06 0.0033 11.2 0.0 38 71 16 49 5 52 0.89 # 2024 # 2431 # -1 # ID=24_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.233 1_66 - 301 tRNA-synt_His PF13393.1 311 0.0051 10.8 3.8 1 2 0.04 17 -0.8 0.1 158 191 83 116 66 131 0.66 # 57898 # 58800 # -1 # ID=1_66;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.281 1_66 - 301 tRNA-synt_His PF13393.1 311 0.0051 10.8 3.8 2 2 7.4e-06 0.0032 11.5 0.8 170 248 171 244 150 253 0.76 # 57898 # 58800 # -1 # ID=1_66;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.281 19_1 - 211 GTP_EFTU PF00009.22 188 0.038 8.4 8.4 1 2 0.0004 0.17 6.2 0.7 129 151 63 85 52 108 0.79 # 13 # 645 # -1 # ID=19_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.281 19_1 - 211 GTP_EFTU PF00009.22 188 0.038 8.4 8.4 2 2 0.0005 0.22 5.9 1.7 123 151 112 148 101 201 0.67 # 13 # 645 # -1 # ID=19_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.281 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b2 (February 2015) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/3f138c5a-5254-4d83-b35e-d7e0f9917deb # Target file: checkm_output/bins/pGCA_002741785.1.assembled/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pGCA_002741785.1.assembled/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/3f138c5a-5254-4d83-b35e-d7e0f9917deb checkm_output/bins/pGCA_002741785.1.assembled/genes.faa # Current dir: /mnt/DGK_KLIF/data/klif/reads-for-assembly/trainingsets2/combined/rfplasmid_combined_jellynew2 # Date: Tue Jul 7 16:50:15 2020 # [ok]