# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_1 - 521 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.00022 12.8 0.1 1 1 0.00016 0.0058 8.2 0.1 24 43 267 286 264 400 0.91 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_72 - 173 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.00028 12.5 0.0 1 1 1.1e-05 0.00039 12.0 0.0 17 65 113 161 96 171 0.79 # 61371 # 61889 # 1 # ID=1_72;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.389 1_3 - 240 Torsin PF06309.6 127 1.4e-05 17.4 0.2 1 1 1.4e-06 5.1e-05 15.6 0.1 55 89 74 106 59 121 0.81 # 3369 # 4088 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.328 1_1 - 521 Torsin PF06309.6 127 0.00013 14.3 0.1 1 1 1.4e-05 0.00052 12.4 0.0 12 78 223 290 217 299 0.81 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_11 - 260 IstB_IS21 PF01695.12 178 1.6e-62 202.5 0.0 1 1 1e-63 2.5e-62 201.9 0.0 3 177 64 238 62 239 0.98 # 11321 # 12100 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_72 - 173 IstB_IS21 PF01695.12 178 6.6e-05 14.8 0.0 1 1 5.2e-06 0.00012 13.9 0.0 44 72 115 143 101 148 0.79 # 61371 # 61889 # 1 # ID=1_72;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.389 1_1 - 521 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.00015 13.7 0.0 1 1 1.9e-05 0.00046 12.1 0.0 50 71 268 289 263 315 0.84 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_7 - 349 MipZ PF09140.6 261 1.1e-08 26.9 1.3 1 2 4.3e-06 0.00015 13.3 0.3 1 41 48 89 48 130 0.80 # 6230 # 7276 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.299 1_7 - 349 MipZ PF09140.6 261 1.1e-08 26.9 1.3 2 2 6.7e-06 0.00024 12.6 0.0 79 125 149 195 132 199 0.90 # 6230 # 7276 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.299 1_3 - 240 MipZ PF09140.6 261 0.00024 12.7 0.1 1 1 1.7e-05 0.00061 11.3 0.0 7 39 76 108 70 114 0.89 # 3369 # 4088 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.328 1_7 - 349 YhjQ PF06564.7 244 0.00014 13.7 0.0 1 1 4.3e-06 0.00031 12.5 0.0 10 149 56 200 49 226 0.70 # 6230 # 7276 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.299 1_28 - 455 3HCDH_N PF02737.13 180 1.7e-07 23.5 0.4 1 1 8.1e-09 5.9e-07 21.7 0.4 2 56 149 204 148 241 0.65 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_28 - 455 GIDA PF01134.17 392 6.7e-06 17.5 10.3 1 3 0.0047 0.34 2.1 0.0 3 35 4 37 2 54 0.75 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_28 - 455 GIDA PF01134.17 392 6.7e-06 17.5 10.3 2 3 5.8e-07 4.2e-05 14.9 3.2 2 28 149 175 148 185 0.89 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_28 - 455 GIDA PF01134.17 392 6.7e-06 17.5 10.3 3 3 0.002 0.15 3.3 0.4 102 161 195 253 183 284 0.67 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_28 - 455 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 7.5e-31 100.0 10.9 1 3 2.8e-19 2e-17 56.1 0.1 1 159 2 153 2 153 0.83 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_28 - 455 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 7.5e-31 100.0 10.9 2 3 2.3e-08 1.7e-06 20.5 6.1 2 124 149 247 148 252 0.71 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_28 - 455 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 7.5e-31 100.0 10.9 3 3 1.5e-11 1.1e-09 30.9 0.1 168 199 253 284 247 286 0.86 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_68 - 589 DEAD_2 PF06733.10 174 4.7e-05 15.3 0.5 1 1 1.6e-06 0.00012 14.0 0.5 65 140 56 133 49 142 0.77 # 56715 # 58481 # 1 # ID=1_68;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.293 1_1 - 521 AAA_2 PF07724.9 171 5.9e-47 152.2 2.4 1 3 0.0082 0.59 2.4 0.0 67 109 4 46 1 64 0.72 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_1 - 521 AAA_2 PF07724.9 171 5.9e-47 152.2 2.4 2 3 0.047 3.4 -0.0 0.6 30 42 182 194 131 251 0.60 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_1 - 521 AAA_2 PF07724.9 171 5.9e-47 152.2 2.4 3 3 2.9e-47 2.1e-45 147.2 0.0 2 169 264 422 263 424 0.97 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_36 - 618 DUF87 PF01935.12 229 1.8e-24 79.3 5.6 1 2 9e-25 6.5e-23 74.1 1.2 3 188 141 329 139 348 0.77 # 31423 # 33276 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 1_36 - 618 DUF87 PF01935.12 229 1.8e-24 79.3 5.6 2 2 0.00026 0.018 7.2 0.3 134 229 377 465 333 465 0.57 # 31423 # 33276 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 1_1 - 521 AAA_22 PF13401.1 131 3.1e-08 26.3 0.7 1 1 8.5e-09 2e-07 23.6 0.0 5 113 266 363 262 382 0.83 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_11 - 260 AAA_22 PF13401.1 131 8.1e-07 21.7 0.2 1 2 0.0002 0.0048 9.5 0.1 7 21 111 125 106 134 0.87 # 11321 # 12100 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_11 - 260 AAA_22 PF13401.1 131 8.1e-07 21.7 0.2 2 2 0.00032 0.0077 8.8 0.0 73 113 145 196 126 213 0.68 # 11321 # 12100 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_72 - 173 AAA_22 PF13401.1 131 2.4e-05 16.9 0.1 1 1 3.2e-06 7.7e-05 15.3 0.0 2 49 116 165 108 171 0.81 # 61371 # 61889 # 1 # ID=1_72;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.389 1_72 - 173 MutS_V PF00488.16 235 0.00029 12.7 0.1 1 1 5.4e-06 0.00039 12.3 0.1 108 145 104 142 84 167 0.82 # 61371 # 61889 # 1 # ID=1_72;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.389 1_39 - 116 tRNA_anti-like PF12869.2 144 0.00011 14.1 3.9 1 1 9.3e-05 0.0067 8.4 3.9 1 70 1 48 1 94 0.62 # 35886 # 36233 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AAAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.319 1_1 - 521 AAA_3 PF07726.6 131 6.6e-07 21.5 0.1 1 1 4.5e-08 3.2e-06 19.2 0.1 5 112 271 388 267 393 0.70 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_28 - 455 NAD_binding_7 PF13241.1 103 6.2e-06 18.9 2.3 1 2 0.0011 0.079 5.7 0.0 9 41 2 38 1 98 0.63 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_28 - 455 NAD_binding_7 PF13241.1 103 6.2e-06 18.9 2.3 2 2 1.2e-05 0.00087 12.0 1.1 7 39 146 178 143 311 0.77 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_1 - 521 AAA_17 PF13207.1 121 1.3e-06 21.7 1.0 1 1 3.3e-07 1.2e-05 18.6 0.0 3 49 269 323 268 474 0.63 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_11 - 260 AAA_17 PF13207.1 121 0.00034 13.9 0.6 1 1 3.5e-05 0.0012 12.1 0.1 2 19 111 128 110 231 0.73 # 11321 # 12100 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_72 - 173 Miro PF08477.8 119 0.00014 14.9 0.0 1 1 3.9e-06 0.00028 13.8 0.0 3 39 122 157 120 170 0.81 # 61371 # 61889 # 1 # ID=1_72;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.389 1_7 - 349 ArsA_ATPase PF02374.10 305 4.8e-05 14.9 3.0 1 2 0.07 2.5 -0.6 0.0 190 208 30 48 18 55 0.78 # 6230 # 7276 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.299 1_7 - 349 ArsA_ATPase PF02374.10 305 4.8e-05 14.9 3.0 2 2 2.1e-06 7.5e-05 14.3 0.4 8 38 55 86 48 181 0.79 # 6230 # 7276 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.299 1_11 - 260 ArsA_ATPase PF02374.10 305 0.00022 12.7 0.2 1 2 0.098 3.5 -1.1 0.1 242 268 45 69 6 86 0.60 # 11321 # 12100 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_11 - 260 ArsA_ATPase PF02374.10 305 0.00022 12.7 0.2 2 2 1.7e-05 0.00062 11.3 0.0 4 37 111 145 108 225 0.83 # 11321 # 12100 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_11 - 260 PhoH PF02562.11 205 4.3e-07 21.8 0.0 1 1 1.8e-08 6.4e-07 21.2 0.0 2 87 91 178 90 245 0.79 # 11321 # 12100 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_1 - 521 PhoH PF02562.11 205 8.4e-05 14.3 0.4 1 2 0.023 0.83 1.2 0.1 155 195 187 227 178 236 0.88 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_1 - 521 PhoH PF02562.11 205 8.4e-05 14.3 0.4 2 2 9e-05 0.0032 9.1 0.0 23 47 269 293 249 301 0.89 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_72 - 173 Ras PF00071.17 162 0.00032 12.6 0.0 1 1 7.6e-06 0.00054 11.8 0.0 3 42 122 160 120 169 0.84 # 61371 # 61889 # 1 # ID=1_72;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.389 1_1 - 521 T2SE PF00437.15 272 4.2e-05 15.0 0.1 1 1 2.6e-06 0.00019 12.8 0.0 129 224 266 367 253 369 0.78 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_1 - 521 Zeta_toxin PF06414.7 201 1.9e-05 16.2 0.0 1 1 7.5e-07 5.4e-05 14.8 0.0 9 53 256 304 248 338 0.81 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_28 - 455 NAD_binding_8 PF13450.1 68 9.2e-06 18.1 3.4 1 2 0.0013 0.09 5.4 0.0 1 31 5 37 5 45 0.87 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_28 - 455 NAD_binding_8 PF13450.1 68 9.2e-06 18.1 3.4 2 2 8.7e-06 0.00063 12.3 1.1 1 26 151 176 151 181 0.94 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_28 - 455 FAD_binding_3 PF01494.14 356 9.2e-05 14.0 8.5 1 3 0.026 1.9 -0.2 0.1 122 152 67 97 61 103 0.85 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_28 - 455 FAD_binding_3 PF01494.14 356 9.2e-05 14.0 8.5 2 3 1.8e-05 0.0013 10.2 0.8 4 31 149 176 147 184 0.91 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_28 - 455 FAD_binding_3 PF01494.14 356 9.2e-05 14.0 8.5 3 3 0.00019 0.013 6.9 0.2 111 159 188 237 182 239 0.85 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_7 - 349 Fer4_NifH PF00142.13 273 4.1e-05 15.3 0.1 1 1 1.9e-06 0.00014 13.6 0.0 7 48 55 97 49 132 0.84 # 6230 # 7276 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.299 1_72 - 173 Arch_ATPase PF01637.13 234 1.5e-06 20.5 0.1 1 1 4.2e-08 3e-06 19.5 0.0 2 57 100 161 99 169 0.75 # 61371 # 61889 # 1 # ID=1_72;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.389 1_72 - 173 AAA_16 PF13191.1 185 2.4e-09 29.9 0.0 1 1 2.3e-10 5.5e-09 28.7 0.0 2 48 99 142 98 155 0.92 # 61371 # 61889 # 1 # ID=1_72;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.389 1_1 - 521 AAA_16 PF13191.1 185 9.6e-08 24.6 4.7 1 2 6.1e-08 1.5e-06 20.8 0.0 2 67 237 305 236 337 0.81 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_1 - 521 AAA_16 PF13191.1 185 9.6e-08 24.6 4.7 2 2 0.0081 0.19 4.1 0.1 149 175 336 363 308 370 0.79 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_11 - 260 AAA_16 PF13191.1 185 0.00022 13.7 0.1 1 1 2.2e-05 0.00053 12.4 0.0 24 41 108 125 92 178 0.85 # 11321 # 12100 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_1 - 521 AAA_23 PF13476.1 202 1e-05 18.4 6.3 1 2 7.8e-05 0.0056 9.4 2.2 151 200 151 193 55 242 0.65 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_1 - 521 AAA_23 PF13476.1 202 1e-05 18.4 6.3 2 2 3.1e-05 0.0022 10.7 0.1 20 115 266 385 258 509 0.48 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_1 - 521 AAA_18 PF13238.1 129 5e-05 16.1 0.9 1 1 5.6e-06 0.0002 14.1 0.0 3 23 270 307 269 380 0.68 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_3 - 240 AAA_18 PF13238.1 129 0.00022 14.0 0.6 1 1 1.9e-05 0.00068 12.4 0.6 8 42 80 113 78 236 0.71 # 3369 # 4088 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.328 1_28 - 455 GFO_IDH_MocA PF01408.17 120 0.00012 15.1 1.5 1 2 0.004 0.29 4.1 0.0 1 38 1 38 1 73 0.80 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_28 - 455 GFO_IDH_MocA PF01408.17 120 0.00012 15.1 1.5 2 2 0.00033 0.024 7.6 0.5 2 39 148 185 147 256 0.72 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_7 - 349 CbiA PF01656.18 195 1.9e-29 94.8 1.0 1 1 7.5e-31 2.7e-29 94.4 1.0 1 192 50 272 50 274 0.78 # 6230 # 7276 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.299 1_3 - 240 CbiA PF01656.18 195 4.2e-12 38.3 1.3 1 2 1.3e-09 4.5e-08 25.1 0.1 3 38 74 109 72 113 0.94 # 3369 # 4088 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.328 1_3 - 240 CbiA PF01656.18 195 4.2e-12 38.3 1.3 2 2 9.3e-06 0.00034 12.5 0.1 95 178 117 200 109 216 0.86 # 3369 # 4088 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.328 1_11 - 260 KaiC PF06745.8 227 7.7e-05 14.3 0.2 1 3 0.095 6.9 -1.9 0.1 97 129 21 54 5 73 0.64 # 11321 # 12100 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_11 - 260 KaiC PF06745.8 227 7.7e-05 14.3 0.2 2 3 4.3e-06 0.00031 12.3 0.0 19 68 108 156 94 178 0.84 # 11321 # 12100 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_11 - 260 KaiC PF06745.8 227 7.7e-05 14.3 0.2 3 3 0.088 6.4 -1.8 0.0 117 146 171 197 159 221 0.59 # 11321 # 12100 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_1 - 521 AAA_14 PF13173.1 128 1.4e-09 30.4 0.3 1 2 0.014 0.51 2.7 0.0 62 87 6 43 2 76 0.76 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_1 - 521 AAA_14 PF13173.1 128 1.4e-09 30.4 0.3 2 2 4.6e-09 1.7e-07 23.7 0.0 7 87 270 365 266 414 0.69 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_3 - 240 AAA_14 PF13173.1 128 3e-05 16.4 4.9 1 2 0.0057 0.2 4.0 0.1 10 27 33 50 23 78 0.76 # 3369 # 4088 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.328 1_3 - 240 AAA_14 PF13173.1 128 3e-05 16.4 4.9 2 2 9.2e-06 0.00033 13.0 1.7 12 68 80 137 68 235 0.80 # 3369 # 4088 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.328 1_28 - 455 HI0933_like PF03486.9 409 1.7e-09 29.0 3.1 1 3 0.00052 0.037 4.8 0.0 118 164 65 112 53 120 0.79 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_28 - 455 HI0933_like PF03486.9 409 1.7e-09 29.0 3.1 2 3 1.7e-05 0.0012 9.7 0.6 2 33 148 179 147 184 0.90 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_28 - 455 HI0933_like PF03486.9 409 1.7e-09 29.0 3.1 3 3 1.7e-06 0.00013 13.0 0.1 113 163 192 242 185 248 0.90 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_72 - 173 AAA_29 PF13555.1 62 0.00014 13.9 0.0 1 1 4e-06 0.00029 12.8 0.0 21 51 116 146 105 151 0.81 # 61371 # 61889 # 1 # ID=1_72;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.389 1_28 - 455 FAD_binding_2 PF00890.19 417 3.6e-06 18.4 4.1 1 2 4.4e-06 0.00032 12.0 2.4 2 29 149 176 148 181 0.93 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_28 - 455 FAD_binding_2 PF00890.19 417 3.6e-06 18.4 4.1 2 2 0.0009 0.065 4.4 0.0 376 411 262 291 254 297 0.88 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_1 - 521 AAA PF00004.24 132 3.8e-16 52.0 0.9 1 2 5.4e-06 0.00013 14.6 0.0 59 124 6 70 1 77 0.63 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_1 - 521 AAA PF00004.24 132 3.8e-16 52.0 0.9 2 2 4.2e-12 1e-10 34.4 0.0 2 110 269 387 268 396 0.84 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_11 - 260 AAA PF00004.24 132 5.2e-09 28.9 0.2 1 1 5.4e-10 1.3e-08 27.6 0.0 1 111 111 210 111 240 0.78 # 11321 # 12100 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_72 - 173 AAA PF00004.24 132 6.6e-07 22.1 0.1 1 2 0.0029 0.069 5.8 0.0 80 115 13 48 8 57 0.87 # 61371 # 61889 # 1 # ID=1_72;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.389 1_72 - 173 AAA PF00004.24 132 6.6e-07 22.1 0.1 2 2 7.9e-06 0.00019 14.1 0.0 2 35 122 165 121 172 0.73 # 61371 # 61889 # 1 # ID=1_72;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.389 1_11 - 260 Bac_DnaA PF00308.13 219 4.1e-14 45.1 0.0 1 1 1.1e-15 8e-14 44.2 0.0 33 136 107 208 101 213 0.93 # 11321 # 12100 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_28 - 455 Thi4 PF01946.12 230 0.0003 12.3 3.5 1 3 0.0024 0.17 3.3 0.0 21 48 4 33 1 40 0.89 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_28 - 455 Thi4 PF01946.12 230 0.0003 12.3 3.5 2 3 0.00024 0.017 6.6 0.3 20 47 149 176 135 181 0.87 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_28 - 455 Thi4 PF01946.12 230 0.0003 12.3 3.5 3 3 0.009 0.65 1.4 0.0 98 141 190 233 186 262 0.77 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_1 - 521 Sigma54_activat PF00158.21 168 5.1e-12 38.0 0.2 1 2 0.075 2.7 -0.1 0.0 90 105 2 17 1 21 0.83 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_1 - 521 Sigma54_activat PF00158.21 168 5.1e-12 38.0 0.2 2 2 8.8e-13 3.2e-11 35.4 0.0 23 143 266 387 237 402 0.84 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_11 - 260 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00024 13.0 0.1 1 1 5.7e-05 0.0021 10.0 0.0 17 65 103 151 90 207 0.72 # 11321 # 12100 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_28 - 455 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 3.4e-16 52.3 1.5 1 3 6.5e-05 0.0047 9.4 0.0 169 192 2 25 1 35 0.83 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_28 - 455 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 3.4e-16 52.3 1.5 2 3 3.3e-10 2.4e-08 26.7 0.1 88 196 62 175 38 181 0.78 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_28 - 455 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 3.4e-16 52.3 1.5 3 3 3.3e-06 0.00023 13.7 0.0 86 144 192 251 185 285 0.74 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_72 - 173 DUF258 PF03193.11 161 5.1e-05 14.9 0.0 1 1 2.1e-06 7.5e-05 14.4 0.0 20 58 103 141 85 158 0.74 # 61371 # 61889 # 1 # ID=1_72;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.389 1_11 - 260 DUF258 PF03193.11 161 0.00025 12.7 0.0 1 1 1.5e-05 0.00052 11.7 0.0 18 53 91 126 74 177 0.75 # 11321 # 12100 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_36 - 618 TraG-D_C PF12696.2 128 2e-05 16.9 0.4 1 2 0.061 4.4 -0.3 0.2 57 95 289 328 275 347 0.59 # 31423 # 33276 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 1_36 - 618 TraG-D_C PF12696.2 128 2e-05 16.9 0.4 2 2 4.1e-06 0.0003 13.1 0.0 16 80 504 560 500 577 0.88 # 31423 # 33276 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 1_3 - 240 AAA_31 PF13614.1 157 3.6e-09 29.2 0.1 1 2 2.5e-07 8.9e-06 18.2 0.0 1 39 70 108 70 113 0.95 # 3369 # 4088 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.328 1_3 - 240 AAA_31 PF13614.1 157 3.6e-09 29.2 0.1 2 2 0.0002 0.0072 8.7 0.0 119 152 118 150 113 154 0.90 # 3369 # 4088 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.328 1_7 - 349 AAA_31 PF13614.1 157 7.7e-08 24.9 0.3 1 1 6.5e-09 2.3e-07 23.3 0.3 9 152 56 202 54 206 0.85 # 6230 # 7276 # -1 # ID=1_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.299 1_1 - 521 AAA_33 PF13671.1 143 7.9e-05 15.0 0.8 1 2 0.037 2.6 0.3 0.1 105 120 144 159 65 210 0.60 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_1 - 521 AAA_33 PF13671.1 143 7.9e-05 15.0 0.8 2 2 1.1e-05 0.00078 11.8 0.0 3 23 269 287 268 346 0.74 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_28 - 455 2-Hacid_dh_C PF02826.14 178 0.00043 11.9 0.8 1 2 2e-05 0.0015 10.2 0.2 18 67 130 177 119 200 0.86 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_28 - 455 2-Hacid_dh_C PF02826.14 178 0.00043 11.9 0.8 2 2 0.07 5.1 -1.4 0.0 75 108 217 250 190 257 0.71 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_72 - 173 AAA_30 PF13604.1 196 7.8e-05 14.7 0.1 1 1 2.6e-06 0.00019 13.5 0.0 18 44 118 144 103 162 0.80 # 61371 # 61889 # 1 # ID=1_72;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.389 1_36 - 618 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 2.1e-07 23.0 0.0 1 2 7.6e-08 5.5e-06 18.4 0.0 30 80 151 205 125 219 0.79 # 31423 # 33276 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 1_36 - 618 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 2.1e-07 23.0 0.0 2 2 0.0069 0.5 2.2 0.0 179 205 503 529 393 529 0.81 # 31423 # 33276 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 1_1 - 521 ABC_tran PF00005.22 137 0.00021 14.0 1.4 1 1 2.7e-05 0.00096 11.9 0.0 16 115 270 401 264 411 0.64 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_36 - 618 ABC_tran PF00005.22 137 0.0016 11.2 1.9 1 1 0.00016 0.0056 9.4 1.8 11 67 161 217 152 332 0.66 # 31423 # 33276 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 1_28 - 455 UDPG_MGDP_dh_N PF03721.9 185 1.5e-06 20.2 4.5 1 1 1.1e-07 7.6e-06 17.8 4.5 2 34 148 180 147 258 0.68 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_1 - 521 RuvB_N PF05496.7 234 6.9e-06 17.6 1.4 1 2 0.08 2.9 -0.7 0.0 104 113 8 17 3 20 0.85 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_1 - 521 RuvB_N PF05496.7 234 6.9e-06 17.6 1.4 2 2 5.2e-06 0.00019 13.0 0.1 20 75 231 290 216 389 0.85 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_11 - 260 RuvB_N PF05496.7 234 0.00017 13.1 0.0 1 1 7.4e-06 0.00027 12.5 0.0 48 113 106 181 56 196 0.76 # 11321 # 12100 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_11 - 260 AAA_19 PF13245.1 76 0.00036 12.8 0.0 1 1 9.4e-06 0.00068 11.9 0.0 16 52 114 146 105 163 0.88 # 11321 # 12100 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_36 - 618 AAA_10 PF12846.2 304 1.2e-22 73.1 2.8 1 1 1.1e-23 2.5e-22 72.0 2.8 2 295 162 555 161 561 0.66 # 31423 # 33276 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 1_1 - 521 AAA_10 PF12846.2 304 2.9e-06 19.3 1.5 1 2 0.058 1.4 0.6 0.0 223 237 8 23 4 36 0.84 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_1 - 521 AAA_10 PF12846.2 304 2.9e-06 19.3 1.5 2 2 1e-06 2.5e-05 16.2 0.1 3 157 267 436 266 503 0.69 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_11 - 260 AAA_10 PF12846.2 304 0.00011 14.2 0.1 1 1 1.7e-05 0.0004 12.3 0.0 3 30 110 145 108 181 0.72 # 11321 # 12100 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_28 - 455 FAD_oxidored PF12831.2 428 0.016 6.7 8.6 1 2 0.0001 0.0074 7.7 3.1 3 29 150 176 149 181 0.95 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_28 - 455 FAD_oxidored PF12831.2 428 0.016 6.7 8.6 2 2 0.008 0.58 1.5 0.1 91 143 189 238 179 238 0.78 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_28 - 455 DAO PF01266.19 358 4.1e-16 51.2 7.9 1 3 0.00015 0.011 7.0 0.0 156 201 65 112 56 132 0.81 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_28 - 455 DAO PF01266.19 358 4.1e-16 51.2 7.9 2 3 6.4e-07 4.6e-05 14.8 4.0 2 29 149 176 148 178 0.96 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_28 - 455 DAO PF01266.19 358 4.1e-16 51.2 7.9 3 3 2.8e-11 2e-09 29.2 0.1 148 273 189 307 185 337 0.75 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_1 - 521 ResIII PF04851.10 184 0.00011 14.5 3.1 1 1 1.3e-05 0.00047 12.4 0.0 8 50 240 290 234 300 0.84 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_11 - 260 ResIII PF04851.10 184 0.00013 14.2 0.0 1 2 2.1e-05 0.00077 11.7 0.0 22 70 90 155 49 171 0.72 # 11321 # 12100 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_11 - 260 ResIII PF04851.10 184 0.00013 14.2 0.0 2 2 0.047 1.7 0.8 0.0 143 163 166 186 141 210 0.58 # 11321 # 12100 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_72 - 173 TIP49 PF06068.8 398 5.9e-06 17.6 0.1 1 1 1e-07 7.6e-06 17.2 0.1 47 101 116 169 74 171 0.74 # 61371 # 61889 # 1 # ID=1_72;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.389 1_72 - 173 DUF815 PF05673.8 250 1.3e-05 16.6 0.0 1 1 2.5e-07 1.8e-05 16.2 0.0 41 79 106 144 89 166 0.84 # 61371 # 61889 # 1 # ID=1_72;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.389 1_28 - 455 Pyr_redox PF00070.22 80 1.1e-24 79.1 6.4 1 2 4.1e-05 0.003 10.5 0.3 3 77 4 91 2 98 0.59 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_28 - 455 Pyr_redox PF00070.22 80 1.1e-24 79.1 6.4 2 2 2.7e-23 1.9e-21 68.7 1.3 1 78 148 228 148 231 0.96 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_36 - 618 DUF853 PF05872.7 504 0.00031 11.5 0.0 1 2 0.019 1.4 -0.5 0.0 22 59 162 205 149 244 0.70 # 31423 # 33276 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 1_36 - 618 DUF853 PF05872.7 504 0.00031 11.5 0.0 2 2 2.2e-05 0.0016 9.2 0.0 254 361 476 580 453 585 0.76 # 31423 # 33276 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 1_36 - 618 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.8e-08 25.8 0.0 1 2 5.3e-08 1.9e-06 19.1 0.0 17 61 163 213 157 258 0.92 # 31423 # 33276 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 1_36 - 618 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.8e-08 25.8 0.0 2 2 0.0021 0.074 4.0 0.0 196 291 434 536 387 563 0.64 # 31423 # 33276 # -1 # ID=1_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 1_72 - 173 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 0.00014 13.0 0.0 1 2 0.017 0.62 0.9 0.0 104 136 6 38 3 61 0.77 # 61371 # 61889 # 1 # ID=1_72;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.389 1_72 - 173 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 0.00014 13.0 0.0 2 2 3.5e-05 0.0012 9.8 0.0 11 51 114 154 106 157 0.85 # 61371 # 61889 # 1 # ID=1_72;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.389 1_28 - 455 Amino_oxidase PF01593.19 450 1.3e-05 16.8 1.3 1 2 0.0024 0.17 3.2 0.0 216 254 63 103 37 109 0.79 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_28 - 455 Amino_oxidase PF01593.19 450 1.3e-05 16.8 1.3 2 2 1.1e-05 0.00082 10.9 0.9 222 263 201 243 161 254 0.87 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_11 - 260 RNA_helicase PF00910.17 107 2.6e-06 20.0 0.0 1 1 4.1e-07 9.8e-06 18.2 0.0 1 77 111 198 111 211 0.84 # 11321 # 12100 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_1 - 521 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00013 14.7 0.1 1 1 3.1e-05 0.00074 12.2 0.0 2 23 269 290 268 328 0.86 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_72 - 173 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00018 14.1 0.0 1 1 1.3e-05 0.00031 13.4 0.0 2 36 122 158 121 173 0.78 # 61371 # 61889 # 1 # ID=1_72;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.389 1_72 - 173 UPF0079 PF02367.12 123 0.00027 13.0 0.0 1 1 6.5e-06 0.00047 12.3 0.0 18 39 121 142 106 152 0.78 # 61371 # 61889 # 1 # ID=1_72;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.389 1_28 - 455 TrkA_N PF02254.13 116 0.00012 14.5 0.4 1 2 0.0046 0.33 3.5 0.0 1 28 3 32 3 38 0.85 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_28 - 455 TrkA_N PF02254.13 116 0.00012 14.5 0.4 2 2 0.00022 0.016 7.7 0.0 2 39 150 187 149 203 0.85 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_28 - 455 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 0.0001 14.3 2.4 1 2 0.07 5.1 -0.9 0.0 22 50 2 30 1 80 0.63 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_28 - 455 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 0.0001 14.3 2.4 2 2 2.6e-06 0.00018 13.5 0.5 19 108 145 239 139 248 0.68 # 23717 # 25081 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=5bp;gc_cont=0.404 1_72 - 173 NACHT PF05729.7 166 6.6e-06 18.3 0.0 1 1 1.6e-07 1.1e-05 17.5 0.0 4 31 122 149 119 164 0.91 # 61371 # 61889 # 1 # ID=1_72;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.389 1_1 - 521 AAA_25 PF13481.1 194 6.8e-07 21.3 0.4 1 1 2.3e-07 5.5e-06 18.3 0.0 34 94 266 338 239 377 0.71 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_11 - 260 AAA_25 PF13481.1 194 4.8e-05 15.2 0.0 1 1 4e-06 9.6e-05 14.3 0.0 28 63 103 139 85 177 0.82 # 11321 # 12100 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_72 - 173 AAA_25 PF13481.1 194 0.00023 13.0 0.0 1 1 2.4e-05 0.00059 11.7 0.0 33 61 118 146 94 155 0.81 # 61371 # 61889 # 1 # ID=1_72;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.389 1_1 - 521 AAA_5 PF07728.9 139 8.4e-13 40.7 1.2 1 1 1.2e-13 3e-12 38.9 0.1 2 124 268 389 267 401 0.78 # 1 # 1563 # 1 # ID=1_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 1_72 - 173 AAA_5 PF07728.9 139 1.4e-06 20.5 0.0 1 2 0.032 0.76 1.9 0.0 24 68 31 79 18 81 0.73 # 61371 # 61889 # 1 # ID=1_72;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.389 1_72 - 173 AAA_5 PF07728.9 139 1.4e-06 20.5 0.0 2 2 1.1e-06 2.6e-05 16.4 0.0 2 31 121 152 120 160 0.87 # 61371 # 61889 # 1 # ID=1_72;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.389 1_11 - 260 AAA_5 PF07728.9 139 0.00021 13.5 0.3 1 2 0.013 0.3 3.2 0.0 69 94 33 58 12 85 0.81 # 11321 # 12100 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_11 - 260 AAA_5 PF07728.9 139 0.00021 13.5 0.3 2 2 0.00076 0.018 7.2 0.0 1 17 110 126 110 137 0.90 # 11321 # 12100 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b2 (February 2015) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/defa2088-b14f-4795-a04d-c6094754207f # Target file: checkm_output/bins/pGCA_002285835.1.assembled/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pGCA_002285835.1.assembled/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/defa2088-b14f-4795-a04d-c6094754207f checkm_output/bins/pGCA_002285835.1.assembled/genes.faa # Current dir: /mnt/DGK_KLIF/data/klif/reads-for-assembly/trainingsets2/combined/rfplasmid_combined_jellynew2 # Date: Tue Jul 7 16:49:36 2020 # [ok]