# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 7_9 - 270 Methyltransf_32 PF13679.1 141 0.00063 13.4 0.0 1 2 0.0028 0.6 3.8 0.0 32 77 11 56 4 97 0.84 # 6847 # 7656 # -1 # ID=7_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.283 7_9 - 270 Methyltransf_32 PF13679.1 141 0.00063 13.4 0.0 2 2 0.00021 0.044 7.4 0.0 23 50 169 195 158 228 0.79 # 6847 # 7656 # -1 # ID=7_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.283 2_4 - 504 UPF0020 PF01170.13 180 1.1e-09 32.0 0.0 1 1 4.1e-11 2.1e-09 31.1 0.0 31 118 198 284 186 293 0.90 # 2903 # 4414 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 2_3 - 601 UPF0020 PF01170.13 180 2.3e-06 21.2 0.0 1 1 8.2e-08 4.3e-06 20.3 0.0 14 123 119 219 109 226 0.86 # 1079 # 2881 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.363 10_1 - 344 UPF0020 PF01170.13 180 1.8e-05 18.4 0.0 1 1 5.8e-07 3.1e-05 17.6 0.0 31 120 219 306 202 314 0.77 # 2 # 1033 # -1 # ID=10_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 16_1 - 344 UPF0020 PF01170.13 180 0.0004 13.9 0.0 1 1 1.3e-05 0.00069 13.2 0.0 31 120 219 306 207 314 0.78 # 2 # 1033 # -1 # ID=16_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.402 4_11 - 339 cobW PF02492.14 178 0.0012 12.2 0.3 1 1 3.3e-05 0.0069 9.8 0.3 2 121 38 170 37 205 0.61 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 4_11 - 339 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.00016 14.3 1.6 1 2 5.1e-05 0.011 8.3 0.0 240 264 31 56 11 61 0.89 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 4_11 - 339 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.00016 14.3 1.6 2 2 0.00082 0.17 4.3 0.4 322 413 156 232 141 257 0.68 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 1_12 - 171 ubiquitin PF00240.18 69 0.0023 11.4 5.1 1 2 9.2e-06 0.002 11.6 0.6 18 60 66 103 57 111 0.87 # 9045 # 9557 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.339 1_12 - 171 ubiquitin PF00240.18 69 0.0023 11.4 5.1 2 2 0.034 7.2 0.1 0.2 14 30 123 139 120 149 0.78 # 9045 # 9557 # -1 # ID=1_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.339 4_11 - 339 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.00096 12.6 0.0 1 1 1.1e-05 0.0023 11.3 0.0 44 67 33 56 23 61 0.90 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 7_9 - 270 MipZ PF09140.6 261 7.8e-12 38.7 0.0 1 1 1.2e-11 1.2e-09 31.5 0.0 3 132 4 155 2 177 0.66 # 6847 # 7656 # -1 # ID=7_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.283 1_20 - 253 MipZ PF09140.6 261 5.3e-10 32.7 0.7 1 2 1.9e-07 2e-05 17.7 0.1 3 59 4 60 2 66 0.91 # 15310 # 16068 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.289 1_20 - 253 MipZ PF09140.6 261 5.3e-10 32.7 0.7 2 2 3.4e-06 0.00036 13.6 0.1 36 129 65 153 58 159 0.83 # 15310 # 16068 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.289 7_9 - 270 YhjQ PF06564.7 244 1.1e-11 38.5 0.0 1 1 1.6e-13 1.7e-11 37.9 0.0 1 150 1 154 1 201 0.78 # 6847 # 7656 # -1 # ID=7_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.283 1_20 - 253 YhjQ PF06564.7 244 1.6e-05 18.3 0.0 1 1 2.3e-07 2.4e-05 17.7 0.0 1 150 1 155 1 179 0.79 # 15310 # 16068 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.289 11_8 - 450 3HCDH_N PF02737.13 180 2.2e-08 27.9 0.0 1 2 0.0048 1 2.9 0.1 4 32 10 38 7 108 0.91 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 11_8 - 450 3HCDH_N PF02737.13 180 2.2e-08 27.9 0.0 2 2 4.1e-09 8.7e-07 22.7 0.0 2 49 165 212 164 233 0.89 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 2_4 - 504 Methyltransf_18 PF12847.2 112 5.3e-05 17.8 0.0 1 2 0.084 18 -0.0 0.0 29 103 46 118 17 127 0.73 # 2903 # 4414 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 2_4 - 504 Methyltransf_18 PF12847.2 112 5.3e-05 17.8 0.0 2 2 2.9e-06 0.00062 14.3 0.0 3 107 197 326 196 331 0.80 # 2903 # 4414 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 11_8 - 450 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 3.9e-32 105.7 0.1 1 1 7.6e-34 1.6e-31 103.7 0.1 3 198 9 300 7 303 0.92 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 19_3 - 146 Usp PF00582.21 140 1.6e-24 80.7 0.0 1 1 8.6e-27 1.8e-24 80.5 0.0 2 140 7 145 6 145 0.97 # 2150 # 2587 # 1 # ID=19_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.354 9_3 - 449 DUF87 PF01935.12 229 0.00072 13.3 0.0 1 1 5.4e-06 0.0011 12.7 0.0 24 107 210 280 190 371 0.72 # 2295 # 3641 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.422 4_11 - 339 NB-ARC PF00931.17 287 0.00021 14.2 0.1 1 1 5.3e-06 0.00056 12.7 0.0 20 40 37 57 24 69 0.86 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 4_10 - 320 NB-ARC PF00931.17 287 0.0013 11.5 0.0 1 1 2e-05 0.0021 10.9 0.0 19 44 41 66 31 138 0.88 # 9187 # 10146 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 4_11 - 339 AAA_22 PF13401.1 131 9.9e-08 26.2 0.8 1 1 5.5e-08 2.9e-06 21.4 0.8 4 123 36 214 33 220 0.71 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 8_2 - 822 AAA_22 PF13401.1 131 6.5e-05 17.1 0.4 1 1 4e-05 0.0021 12.2 0.1 5 115 173 314 169 324 0.67 # 1480 # 3945 # 1 # ID=8_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.320 4_10 - 320 AAA_22 PF13401.1 131 0.00025 15.2 1.7 1 1 0.00012 0.0063 10.6 1.7 9 123 46 212 39 221 0.60 # 9187 # 10146 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 16_2 - 814 AAA_22 PF13401.1 131 0.0032 11.6 7.5 1 1 2.1e-05 0.0011 13.1 1.0 68 125 148 235 69 240 0.55 # 1033 # 3474 # -1 # ID=16_2;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.384 7_9 - 270 ATP_bind_1 PF03029.12 238 7.3e-05 16.3 0.1 1 1 2.4e-06 0.0005 13.6 0.1 6 99 12 130 10 137 0.67 # 6847 # 7656 # -1 # ID=7_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.283 4_10 - 320 PRK PF00485.13 194 0.00016 15.2 0.2 1 1 1.9e-06 0.00039 14.0 0.0 2 81 44 124 43 140 0.80 # 9187 # 10146 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 7_9 - 270 SRP54 PF00448.17 196 3.2e-05 17.4 0.7 1 1 9.7e-07 0.0001 15.7 0.1 10 40 11 41 1 46 0.84 # 6847 # 7656 # -1 # ID=7_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.283 1_20 - 253 SRP54 PF00448.17 196 0.0013 12.1 4.6 1 2 4.5e-05 0.0048 10.3 0.6 11 42 12 43 2 50 0.87 # 15310 # 16068 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.289 1_20 - 253 SRP54 PF00448.17 196 0.0013 12.1 4.6 2 2 0.01 1.1 2.6 0.0 46 92 82 131 69 135 0.67 # 15310 # 16068 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.289 4_11 - 339 AAA_15 PF13175.1 415 6.4e-09 29.2 0.1 1 2 9.2e-05 0.0097 8.9 0.0 17 56 30 70 14 132 0.75 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 4_11 - 339 AAA_15 PF13175.1 415 6.4e-09 29.2 0.1 2 2 1.1e-07 1.1e-05 18.5 0.0 361 411 172 216 154 220 0.81 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 4_10 - 320 AAA_15 PF13175.1 415 2e-05 17.7 0.6 1 2 1.1e-05 0.0012 11.9 0.9 27 99 46 132 6 141 0.83 # 9187 # 10146 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 4_10 - 320 AAA_15 PF13175.1 415 2e-05 17.7 0.6 2 2 0.0046 0.49 3.3 0.0 370 410 173 213 162 218 0.81 # 9187 # 10146 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 11_8 - 450 NAD_binding_7 PF13241.1 103 3.3e-05 18.1 0.2 1 2 0.0021 0.44 4.8 0.2 10 39 8 37 3 102 0.82 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 11_8 - 450 NAD_binding_7 PF13241.1 103 3.3e-05 18.1 0.2 2 2 4.3e-05 0.0092 10.2 0.0 8 54 163 213 156 262 0.74 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 17_2 - 184 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 4.6e-16 52.9 1.2 1 2 0.047 10 -0.5 0.1 65 88 55 79 9 97 0.54 # 282 # 833 # -1 # ID=17_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.286 17_2 - 184 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 4.6e-16 52.9 1.2 2 2 4e-18 8.4e-16 52.1 0.1 1 60 114 177 114 182 0.94 # 282 # 833 # -1 # ID=17_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.286 4_11 - 339 AAA_17 PF13207.1 121 0.00016 16.4 0.1 1 1 4e-06 0.00043 15.1 0.1 1 20 38 57 38 82 0.90 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 4_10 - 320 AAA_17 PF13207.1 121 0.018 9.8 3.9 1 1 0.00067 0.071 7.9 3.9 2 19 44 61 43 300 0.79 # 9187 # 10146 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 4_11 - 339 AAA_21 PF13304.1 303 1.4e-15 51.9 0.1 1 2 7.2e-06 0.00076 13.4 0.0 2 25 39 64 38 89 0.76 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 4_11 - 339 AAA_21 PF13304.1 303 1.4e-15 51.9 0.1 2 2 6e-13 6.4e-11 36.6 0.0 227 300 147 218 88 221 0.84 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 4_10 - 320 AAA_21 PF13304.1 303 1.8e-12 41.7 2.8 1 1 1.9e-13 2e-11 38.3 0.9 3 299 45 215 44 219 0.95 # 9187 # 10146 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 4_11 - 339 Miro PF08477.8 119 5.6e-05 17.6 0.2 1 1 7.4e-07 0.00016 16.2 0.1 3 51 40 84 39 106 0.80 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 4_11 - 339 MobB PF03205.9 140 0.00022 14.9 0.0 1 1 2e-06 0.00043 14.0 0.0 2 48 38 83 37 124 0.72 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 1_8 - 123 Ribosomal_L35p PF01632.14 61 0.0053 10.7 2.6 1 1 3.1e-05 0.0066 10.4 0.6 33 61 1 29 1 29 0.95 # 4343 # 4711 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.263 7_9 - 270 ArsA_ATPase PF02374.10 305 2.8e-14 46.8 0.4 1 1 5.1e-16 5.4e-14 45.8 0.0 5 137 6 132 1 137 0.79 # 6847 # 7656 # -1 # ID=7_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.283 1_20 - 253 ArsA_ATPase PF02374.10 305 8.4e-10 32.1 0.8 1 1 1.7e-11 1.8e-09 31.0 0.8 9 141 10 137 2 222 0.72 # 15310 # 16068 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.289 4_11 - 339 PhoH PF02562.11 205 5e-05 16.5 0.0 1 2 5.8e-06 0.0012 12.0 0.0 16 70 33 91 19 127 0.67 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 4_11 - 339 PhoH PF02562.11 205 5e-05 16.5 0.0 2 2 0.0058 1.2 2.2 0.0 92 117 297 322 258 326 0.81 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 11_8 - 450 NAD_binding_8 PF13450.1 68 1.9e-05 18.6 0.9 1 2 0.00056 0.12 6.5 0.2 1 28 10 37 10 45 0.91 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 11_8 - 450 NAD_binding_8 PF13450.1 68 1.9e-05 18.6 0.9 2 2 3.8e-05 0.0081 10.2 0.0 1 28 167 194 167 197 0.93 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 11_8 - 450 F420_oxidored PF03807.12 96 0.0031 11.9 1.4 1 2 0.0013 0.28 5.6 0.1 4 32 10 35 7 40 0.86 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 11_8 - 450 F420_oxidored PF03807.12 96 0.0031 11.9 1.4 2 2 0.0043 0.91 4.0 0.0 2 29 165 189 164 193 0.88 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 11_8 - 450 FAD_binding_3 PF01494.14 356 1.6e-05 18.1 0.2 1 2 4.6e-05 0.0097 8.9 0.1 3 33 7 37 5 42 0.90 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 11_8 - 450 FAD_binding_3 PF01494.14 356 1.6e-05 18.1 0.2 2 2 0.00025 0.054 6.4 0.0 5 31 166 192 164 200 0.91 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 4_11 - 339 SMC_N PF02463.14 220 3e-10 33.6 0.1 1 1 7.1e-12 7.5e-10 32.3 0.1 26 213 38 231 27 238 0.83 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 4_10 - 320 SMC_N PF02463.14 220 1.2e-07 25.1 0.5 1 1 2.1e-09 2.2e-07 24.3 0.5 26 213 43 229 30 235 0.76 # 9187 # 10146 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 1_20 - 253 VirC1 PF07015.6 231 5.1e-08 26.2 2.7 1 2 2.7e-05 0.0029 10.6 0.1 1 74 1 75 1 120 0.77 # 15310 # 16068 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.289 1_20 - 253 VirC1 PF07015.6 231 5.1e-08 26.2 2.7 2 2 8.2e-07 8.7e-05 15.6 0.5 82 165 121 202 117 215 0.88 # 15310 # 16068 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.289 7_9 - 270 VirC1 PF07015.6 231 4e-05 16.7 0.0 1 1 6.3e-07 6.6e-05 16.0 0.0 1 46 1 46 1 80 0.89 # 6847 # 7656 # -1 # ID=7_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.283 1_20 - 253 Fer4_NifH PF00142.13 273 5.6e-06 19.6 4.9 1 1 1.4e-06 0.00015 15.0 4.9 8 53 10 55 3 252 0.81 # 15310 # 16068 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.289 7_9 - 270 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.00016 14.8 0.4 1 2 0.0012 0.12 5.4 0.0 8 41 10 43 3 58 0.87 # 6847 # 7656 # -1 # ID=7_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.283 7_9 - 270 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.00016 14.8 0.4 2 2 0.0003 0.031 7.3 0.1 186 240 195 251 182 268 0.79 # 6847 # 7656 # -1 # ID=7_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.283 4_11 - 339 AAA_16 PF13191.1 185 3.6e-05 17.8 0.7 1 1 2.8e-07 5.9e-05 17.1 0.7 19 45 31 57 23 245 0.92 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 4_11 - 339 AAA_23 PF13476.1 202 0.00014 16.2 0.1 1 1 1.4e-06 0.00029 15.1 0.1 15 40 29 57 20 95 0.80 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 4_10 - 320 AAA_18 PF13238.1 129 3.1e-05 18.2 0.5 1 1 9.9e-07 7e-05 17.1 0.1 1 72 44 130 44 150 0.68 # 9187 # 10146 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 4_11 - 339 AAA_18 PF13238.1 129 0.00067 14.0 1.7 1 2 5e-05 0.0035 11.6 0.1 2 19 40 57 39 90 0.78 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 4_11 - 339 AAA_18 PF13238.1 129 0.00067 14.0 1.7 2 2 0.095 6.7 1.0 0.0 43 81 179 215 103 244 0.77 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 7_9 - 270 AAA_18 PF13238.1 129 0.0029 11.9 1.1 1 1 0.00018 0.013 9.8 0.3 8 69 12 98 11 158 0.52 # 6847 # 7656 # -1 # ID=7_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.283 4_11 - 339 AAA_13 PF13166.1 712 0.00053 12.5 0.1 1 2 0.0026 0.55 2.5 0.0 21 40 41 60 33 90 0.77 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 4_11 - 339 AAA_13 PF13166.1 712 0.00053 12.5 0.1 2 2 6.1e-05 0.013 7.9 0.0 527 579 174 225 168 253 0.89 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 1_20 - 253 CbiA PF01656.18 195 2.1e-32 106.0 2.0 1 1 3.6e-34 2.5e-32 105.8 2.0 1 180 4 212 4 231 0.81 # 15310 # 16068 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.289 7_9 - 270 CbiA PF01656.18 195 6.9e-28 91.3 0.3 1 2 3.3e-29 2.4e-27 89.6 0.3 1 178 4 214 4 228 0.72 # 6847 # 7656 # -1 # ID=7_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.283 7_9 - 270 CbiA PF01656.18 195 6.9e-28 91.3 0.3 2 2 0.013 0.93 2.8 0.0 132 179 201 245 194 258 0.78 # 6847 # 7656 # -1 # ID=7_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.283 4_11 - 339 CbiA PF01656.18 195 0.00019 14.9 1.2 1 2 0.00065 0.046 7.1 0.1 4 21 41 58 38 66 0.84 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 4_11 - 339 CbiA PF01656.18 195 0.00019 14.9 1.2 2 2 0.00092 0.064 6.6 0.1 111 169 169 226 154 253 0.83 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 7_9 - 270 AAA_14 PF13173.1 128 5e-06 20.4 2.0 1 1 6.4e-08 1.3e-05 19.0 0.9 12 109 12 100 6 119 0.65 # 6847 # 7656 # -1 # ID=7_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.283 20_3 - 67 CSD PF00313.17 66 1.9e-33 108.1 1.5 1 1 3.9e-35 2e-33 108.0 1.5 2 65 3 65 2 66 0.98 # 1841 # 2041 # 1 # ID=20_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.363 34_2 - 76 CSD PF00313.17 66 2.4e-33 107.8 1.4 1 1 5.2e-35 2.7e-33 107.6 1.4 2 65 12 74 11 75 0.98 # 351 # 578 # 1 # ID=34_2;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.351 20_2 - 67 CSD PF00313.17 66 5.7e-22 71.3 0.2 1 1 1.2e-23 6.2e-22 71.2 0.2 2 65 3 65 2 66 0.97 # 1364 # 1564 # 1 # ID=20_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.318 45_1 - 37 CSD PF00313.17 66 4.2e-18 58.9 0.6 1 1 8.4e-20 4.4e-18 58.8 0.6 2 37 3 37 2 37 0.96 # 207 # 317 # 1 # ID=45_1;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.369 4_11 - 339 AAA_29 PF13555.1 62 4.1e-07 23.4 0.1 1 1 7.3e-09 7.7e-07 22.6 0.1 21 51 34 64 20 68 0.77 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 4_10 - 320 AAA_29 PF13555.1 62 1.8e-05 18.2 0.4 1 1 3.4e-07 3.6e-05 17.3 0.4 13 39 32 57 29 62 0.84 # 9187 # 10146 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 9_3 - 449 AAA PF00004.24 132 2.3e-06 21.8 0.1 1 1 5.9e-08 4.2e-06 21.0 0.1 3 130 214 374 212 376 0.77 # 2295 # 3641 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.422 4_11 - 339 AAA PF00004.24 132 6.7e-06 20.3 0.3 1 2 7.1e-05 0.005 11.0 0.0 3 44 41 84 39 108 0.78 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 4_11 - 339 AAA PF00004.24 132 6.7e-06 20.3 0.3 2 2 0.002 0.14 6.3 0.0 82 117 146 180 131 195 0.85 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 8_2 - 822 AAA PF00004.24 132 0.0015 12.7 0.6 1 2 0.013 0.94 3.7 0.0 3 20 177 194 175 223 0.59 # 1480 # 3945 # 1 # ID=8_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.320 8_2 - 822 AAA PF00004.24 132 0.0015 12.7 0.6 2 2 0.0064 0.45 4.7 0.1 42 74 509 540 493 569 0.81 # 1480 # 3945 # 1 # ID=8_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.320 11_8 - 450 Thi4 PF01946.12 230 4.3e-05 16.6 1.0 1 2 7.6e-06 0.0016 11.5 0.5 19 57 7 45 1 130 0.75 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 11_8 - 450 Thi4 PF01946.12 230 4.3e-05 16.6 1.0 2 2 0.0025 0.52 3.3 0.0 9 47 155 192 146 194 0.76 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 31_1 - 217 Ribosomal_L20 PF00453.13 108 0.00058 13.8 0.3 1 1 5.2e-06 0.0011 12.9 0.3 37 96 17 79 3 84 0.83 # 3 # 653 # -1 # ID=31_1;partial=10;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.401 4_10 - 320 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00065 13.2 0.3 1 2 9.1e-05 0.019 8.4 0.1 19 54 38 73 23 88 0.82 # 9187 # 10146 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 4_10 - 320 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00065 13.2 0.3 2 2 0.0047 1 2.8 0.0 78 118 155 198 149 230 0.83 # 9187 # 10146 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 11_8 - 450 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 1.2e-05 19.4 0.0 1 2 1.1e-06 0.00024 15.2 0.0 75 195 72 190 9 195 0.63 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 11_8 - 450 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 1.2e-05 19.4 0.0 2 2 0.021 4.5 1.2 0.0 114 147 233 266 202 301 0.70 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 4_10 - 320 MMR_HSR1 PF01926.18 116 7.4e-05 16.7 0.2 1 1 1.5e-06 0.00016 15.6 0.1 2 61 44 147 43 208 0.68 # 9187 # 10146 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 4_11 - 339 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.0022 11.9 0.6 1 1 3.6e-05 0.0038 11.2 0.6 2 21 39 58 38 247 0.89 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 2_4 - 504 N6_Mtase PF02384.11 311 3.7e-122 401.2 0.0 1 1 1.6e-123 4.8e-122 400.8 0.0 2 311 152 463 151 463 0.99 # 2903 # 4414 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 39_1 - 172 N6_Mtase PF02384.11 311 3.6e-65 214.0 0.0 1 1 1.3e-66 4e-65 213.8 0.0 138 308 3 172 1 172 0.97 # 1 # 516 # 1 # ID=39_1;partial=11;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.401 16_1 - 344 N6_Mtase PF02384.11 311 1.4e-63 208.8 0.0 1 1 7e-65 2.1e-63 208.2 0.0 2 175 168 344 167 344 0.97 # 2 # 1033 # -1 # ID=16_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.402 10_1 - 344 N6_Mtase PF02384.11 311 1.9e-63 208.3 0.0 1 1 9.7e-65 2.9e-63 207.7 0.0 2 175 168 344 167 344 0.97 # 2 # 1033 # -1 # ID=10_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 2_3 - 601 N6_Mtase PF02384.11 311 1.3e-54 179.3 0.2 1 1 8.4e-56 2.5e-54 178.3 0.2 33 297 120 375 109 385 0.94 # 1079 # 2881 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.363 4_1 - 99 N6_Mtase PF02384.11 311 3.7e-13 43.1 0.3 1 1 1.7e-14 5.3e-13 42.6 0.3 268 310 1 43 1 44 0.97 # 3 # 299 # 1 # ID=4_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.364 32_1 - 99 N6_Mtase PF02384.11 311 3.7e-13 43.1 0.3 1 1 1.7e-14 5.3e-13 42.6 0.3 268 310 1 43 1 44 0.97 # 3 # 299 # 1 # ID=32_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.360 4_11 - 339 DUF258 PF03193.11 161 2e-05 17.8 0.1 1 1 3.1e-07 3.3e-05 17.1 0.1 21 62 21 63 2 90 0.75 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 4_10 - 320 DUF258 PF03193.11 161 0.0004 13.6 0.2 1 1 6.9e-06 0.00072 12.7 0.2 33 65 38 71 17 93 0.80 # 9187 # 10146 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 7_9 - 270 AAA_31 PF13614.1 157 4.4e-17 56.4 0.0 1 1 1.7e-18 1.8e-16 54.4 0.0 2 151 3 154 2 159 0.86 # 6847 # 7656 # -1 # ID=7_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.283 1_20 - 253 AAA_31 PF13614.1 157 3.9e-11 37.1 1.9 1 1 5.7e-13 6e-11 36.5 0.4 1 155 2 159 2 161 0.80 # 15310 # 16068 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.289 4_11 - 339 AAA_33 PF13671.1 143 0.00025 14.9 0.0 1 1 2.2e-06 0.00047 14.0 0.0 1 22 38 59 38 166 0.71 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 7_9 - 270 KTI12 PF08433.5 270 0.00022 14.4 0.0 1 2 3.3e-06 0.0007 12.8 0.0 12 50 13 58 10 85 0.78 # 6847 # 7656 # -1 # ID=7_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.283 7_9 - 270 KTI12 PF08433.5 270 0.00022 14.4 0.0 2 2 0.084 18 -1.7 0.0 10 21 178 189 177 208 0.88 # 6847 # 7656 # -1 # ID=7_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.283 2_4 - 504 Methyltransf_26 PF13659.1 117 1.4e-13 44.9 0.0 1 1 9.5e-15 4e-13 43.4 0.0 2 115 197 330 196 332 0.78 # 2903 # 4414 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 2_3 - 601 Methyltransf_26 PF13659.1 117 1e-12 42.1 0.0 1 1 3.9e-14 1.6e-12 41.4 0.0 1 117 134 261 134 261 0.91 # 1079 # 2881 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.363 10_1 - 344 Methyltransf_26 PF13659.1 117 1.6e-12 41.5 0.0 1 1 6.4e-14 2.7e-12 40.7 0.0 2 86 218 308 217 337 0.82 # 2 # 1033 # -1 # ID=10_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 16_1 - 344 Methyltransf_26 PF13659.1 117 6e-12 39.6 0.0 1 1 2.3e-13 9.8e-12 38.9 0.0 2 86 218 308 217 337 0.82 # 2 # 1033 # -1 # ID=16_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.402 17_2 - 184 Methyltransf_26 PF13659.1 117 0.0019 12.2 0.0 1 1 5.7e-05 0.0024 11.9 0.0 62 114 105 172 40 175 0.79 # 282 # 833 # -1 # ID=17_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.286 11_8 - 450 NAD_Gly3P_dh_N PF01210.18 157 4.4e-05 17.2 0.0 1 2 0.00025 0.053 7.2 0.1 4 29 10 35 7 78 0.93 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 11_8 - 450 NAD_Gly3P_dh_N PF01210.18 157 4.4e-05 17.2 0.0 2 2 0.00018 0.037 7.7 0.0 2 28 165 191 164 252 0.90 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 11_8 - 450 2-Hacid_dh_C PF02826.14 178 9.7e-06 18.8 0.0 1 2 0.0018 0.37 3.9 0.1 41 68 10 37 4 41 0.89 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 11_8 - 450 2-Hacid_dh_C PF02826.14 178 9.7e-06 18.8 0.0 2 2 6e-06 0.0013 11.9 0.0 38 70 164 196 146 214 0.85 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 11_8 - 450 XdhC_C PF13478.1 136 0.00074 13.8 0.0 1 2 0.011 2.4 2.4 0.0 2 31 9 38 9 97 0.86 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 11_8 - 450 XdhC_C PF13478.1 136 0.00074 13.8 0.0 2 2 0.0001 0.021 9.1 0.0 1 49 165 214 165 236 0.85 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 1_8 - 123 Ribosomal_S15 PF00312.17 83 0.00061 13.5 2.3 1 1 1.1e-05 0.0023 11.7 2.3 22 66 70 120 55 122 0.77 # 4343 # 4711 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.263 45_1 - 37 OB_RNB PF08206.6 58 0.00046 13.7 0.1 1 1 6.5e-06 0.00046 13.7 0.1 7 24 12 28 4 35 0.80 # 207 # 317 # 1 # ID=45_1;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.369 20_3 - 67 OB_RNB PF08206.6 58 0.00098 12.6 0.9 1 1 1.7e-05 0.0012 12.3 0.9 7 24 12 28 4 58 0.86 # 1841 # 2041 # 1 # ID=20_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.363 20_2 - 67 OB_RNB PF08206.6 58 0.0014 12.1 1.2 1 1 3.3e-05 0.0023 11.4 1.2 7 42 12 51 7 65 0.68 # 1364 # 1564 # 1 # ID=20_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.318 9_3 - 449 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 4.6e-10 33.2 0.0 1 1 3.6e-12 7.6e-10 32.5 0.0 27 204 198 356 173 357 0.81 # 2295 # 3641 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.422 2_4 - 504 MTS PF05175.9 170 5.5e-06 19.8 0.0 1 1 3.2e-07 3.4e-05 17.2 0.0 27 109 192 283 184 339 0.69 # 2903 # 4414 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 10_1 - 344 MTS PF05175.9 170 0.0013 12.0 0.0 1 1 2.1e-05 0.0022 11.3 0.0 54 112 242 306 209 317 0.69 # 2 # 1033 # -1 # ID=10_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 4_10 - 320 ABC_tran PF00005.22 137 6.7e-35 114.3 0.1 1 1 1.1e-36 1.2e-34 113.5 0.1 2 136 32 182 31 183 0.93 # 9187 # 10146 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 4_11 - 339 ABC_tran PF00005.22 137 3.2e-32 105.7 0.1 1 1 6.5e-34 6.9e-32 104.6 0.0 3 136 28 184 26 185 0.93 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 11_8 - 450 K_oxygenase PF13434.1 341 3.2e-05 16.9 0.0 1 2 1.3e-06 0.00027 13.9 0.0 134 212 109 184 89 211 0.77 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 11_8 - 450 K_oxygenase PF13434.1 341 3.2e-05 16.9 0.0 2 2 0.015 3.2 0.4 0.0 134 160 234 260 223 263 0.79 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 17_2 - 184 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1.2e-05 18.8 0.0 1 2 1.2e-06 8.8e-05 15.9 0.0 108 128 108 127 70 149 0.74 # 282 # 833 # -1 # ID=17_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.286 17_2 - 184 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1.2e-05 18.8 0.0 2 2 0.084 5.9 0.2 0.0 135 157 155 177 135 182 0.81 # 282 # 833 # -1 # ID=17_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.286 10_1 - 344 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0018 11.6 0.0 1 1 6.4e-05 0.0045 10.3 0.0 72 127 250 305 222 316 0.89 # 2 # 1033 # -1 # ID=10_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 16_1 - 344 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0023 11.3 0.0 1 1 5.3e-05 0.0037 10.6 0.0 72 127 250 305 210 317 0.86 # 2 # 1033 # -1 # ID=16_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.402 11_8 - 450 UDPG_MGDP_dh_N PF03721.9 185 1.3e-07 25.1 0.2 1 2 0.026 5.5 0.2 0.3 5 32 10 37 7 45 0.86 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 11_8 - 450 UDPG_MGDP_dh_N PF03721.9 185 1.3e-07 25.1 0.2 2 2 6.6e-09 1.4e-06 21.7 0.0 3 32 165 194 163 215 0.91 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 9_3 - 449 AAA_10 PF12846.2 304 2.9e-11 37.2 0.4 1 2 1.2e-06 8.7e-05 16.0 0.1 2 45 210 253 209 268 0.90 # 2295 # 3641 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.422 9_3 - 449 AAA_10 PF12846.2 304 2.9e-11 37.2 0.4 2 2 1e-07 7.4e-06 19.5 0.0 219 295 305 384 275 387 0.78 # 2295 # 3641 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.422 4_11 - 339 AAA_10 PF12846.2 304 2.9e-06 20.8 0.2 1 2 2.7e-05 0.0019 11.6 0.1 4 21 39 56 37 71 0.85 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 4_11 - 339 AAA_10 PF12846.2 304 2.9e-06 20.8 0.2 2 2 0.00055 0.039 7.3 0.0 216 268 170 222 131 249 0.74 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 4_10 - 320 AAA_10 PF12846.2 304 0.00039 13.8 0.5 1 2 3e-05 0.0021 11.4 0.3 6 32 46 73 42 139 0.72 # 9187 # 10146 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 4_10 - 320 AAA_10 PF12846.2 304 0.00039 13.8 0.5 2 2 0.081 5.7 0.2 0.0 215 265 167 217 137 235 0.79 # 9187 # 10146 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 11_8 - 450 DAO PF01266.19 358 1e-05 18.5 0.1 1 3 0.00098 0.21 4.3 0.0 3 40 9 46 7 107 0.88 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 11_8 - 450 DAO PF01266.19 358 1e-05 18.5 0.1 2 3 0.0001 0.022 7.6 0.0 2 29 165 192 164 195 0.94 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 11_8 - 450 DAO PF01266.19 358 1e-05 18.5 0.1 3 3 0.0022 0.46 3.2 0.0 155 245 211 301 201 346 0.74 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 16_2 - 814 ResIII PF04851.10 184 5.6e-44 144.1 2.0 1 1 1.1e-45 5.6e-44 144.1 2.0 2 183 50 236 49 237 0.95 # 1033 # 3474 # -1 # ID=16_2;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.384 10_5 - 156 ResIII PF04851.10 184 7.6e-33 107.8 2.9 1 1 1.6e-34 8.2e-33 107.7 2.9 2 150 1 153 1 155 0.93 # 2866 # 3333 # -1 # ID=10_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 2_10 - 1006 ResIII PF04851.10 184 7.8e-19 62.2 0.1 1 1 3.4e-20 1.8e-18 61.0 0.1 6 183 254 428 249 429 0.82 # 9359 # 12376 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.391 8_2 - 822 ResIII PF04851.10 184 3.8e-09 30.6 0.0 1 1 7.3e-11 3.8e-09 30.6 0.0 1 170 150 311 150 323 0.81 # 1480 # 3945 # 1 # ID=8_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.320 2_4 - 504 Methyltransf_31 PF13847.1 152 5.4e-06 20.0 0.0 1 1 1.1e-07 1.1e-05 19.0 0.0 6 113 198 341 196 394 0.68 # 2903 # 4414 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 16_1 - 344 Methyltransf_31 PF13847.1 152 0.001 12.6 0.0 1 1 2.5e-05 0.0026 11.3 0.0 6 83 219 302 215 325 0.84 # 2 # 1033 # -1 # ID=16_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.402 16_2 - 814 DEAD PF00270.24 169 7.7e-12 39.0 0.4 1 1 1.1e-13 7.7e-12 39.0 0.4 13 162 69 235 53 242 0.70 # 1033 # 3474 # -1 # ID=16_2;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.384 10_5 - 156 DEAD PF00270.24 169 3.2e-09 30.5 0.7 1 1 5.3e-11 3.7e-09 30.2 0.7 2 113 5 131 4 144 0.73 # 2866 # 3333 # -1 # ID=10_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 8_2 - 822 DEAD PF00270.24 169 0.00025 14.5 0.1 1 1 8.2e-05 0.0058 10.1 0.0 10 147 167 311 154 328 0.58 # 1480 # 3945 # 1 # ID=8_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.320 11_8 - 450 Pyr_redox PF00070.22 80 9e-22 71.3 1.6 1 2 0.0028 0.58 4.6 0.3 3 31 9 37 7 44 0.91 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 11_8 - 450 Pyr_redox PF00070.22 80 9e-22 71.3 1.6 2 2 4.5e-22 9.6e-20 64.8 0.0 1 72 164 235 164 249 0.94 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 9_3 - 449 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 0.00055 12.5 0.0 1 2 0.00033 0.069 5.6 0.0 13 52 207 246 201 266 0.82 # 2295 # 3641 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.422 9_3 - 449 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 0.00055 12.5 0.0 2 2 0.00073 0.15 4.5 0.0 249 283 322 356 310 385 0.80 # 2295 # 3641 # -1 # ID=9_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.422 4_11 - 339 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.00036 14.6 0.0 1 2 8.9e-05 0.019 9.0 0.0 20 50 35 65 21 88 0.79 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 4_11 - 339 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.00036 14.6 0.0 2 2 0.012 2.5 2.1 0.0 73 96 289 312 269 320 0.85 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 1_8 - 123 AAA_32 PF13654.1 509 0.00022 13.9 3.6 1 1 1.2e-06 0.00025 13.7 3.6 123 242 3 119 1 121 0.84 # 4343 # 4711 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.263 17_2 - 184 MethyltransfD12 PF02086.10 260 7.2e-06 19.5 3.1 1 1 5.8e-08 1.2e-05 18.8 3.1 100 214 37 147 5 167 0.66 # 282 # 833 # -1 # ID=17_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.286 11_8 - 450 TrkA_N PF02254.13 116 5e-06 20.5 0.2 1 2 3.4e-06 0.00071 13.5 0.1 2 30 9 37 8 40 0.90 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 11_8 - 450 TrkA_N PF02254.13 116 5e-06 20.5 0.2 2 2 0.0023 0.49 4.4 0.0 3 35 167 199 165 225 0.75 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 7_4 - 54 Terminase_GpA PF05876.7 557 0.00086 11.6 0.2 1 1 4.2e-06 0.00089 11.6 0.2 203 244 13 50 8 53 0.85 # 3206 # 3367 # -1 # ID=7_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.253 11_8 - 450 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 0.0013 12.3 0.0 1 1 1.4e-05 0.003 11.1 0.0 19 53 161 195 152 218 0.85 # 3079 # 4428 # 1 # ID=11_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 7_9 - 270 AAA_24 PF13479.1 213 5.9e-05 16.7 0.1 1 1 7.4e-07 0.00016 15.3 0.1 11 75 10 128 6 129 0.77 # 6847 # 7656 # -1 # ID=7_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.283 4_11 - 339 NACHT PF05729.7 166 0.00056 13.6 0.0 1 1 5.1e-06 0.0011 12.6 0.0 2 21 38 57 37 67 0.87 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 4_11 - 339 AAA_25 PF13481.1 194 3.4e-06 20.5 0.1 1 2 3.8e-07 4e-05 17.0 0.0 29 54 32 57 4 60 0.80 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 4_11 - 339 AAA_25 PF13481.1 194 3.4e-06 20.5 0.1 2 2 0.029 3.1 1.1 0.0 134 188 166 215 126 216 0.66 # 10143 # 11159 # -1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 4_10 - 320 AAA_25 PF13481.1 194 0.0014 12.0 0.1 1 2 0.00019 0.02 8.2 0.0 30 50 38 58 30 107 0.91 # 9187 # 10146 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 4_10 - 320 AAA_25 PF13481.1 194 0.0014 12.0 0.1 2 2 0.024 2.5 1.4 0.0 165 188 190 213 161 214 0.80 # 9187 # 10146 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 2_4 - 504 Methyltransf_15 PF09445.5 164 0.0014 12.2 0.0 1 1 1.3e-05 0.0027 11.2 0.0 4 82 199 289 196 300 0.81 # 2903 # 4414 # 1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 8_2 - 822 SNF2_N PF00176.18 299 5.3e-11 35.8 0.1 1 1 2.5e-12 1.3e-10 34.5 0.1 24 185 171 334 157 476 0.71 # 1480 # 3945 # 1 # ID=8_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.320 16_2 - 814 SNF2_N PF00176.18 299 8.8e-10 31.7 0.2 1 1 1.7e-11 8.8e-10 31.7 0.2 15 174 60 237 33 247 0.76 # 1033 # 3474 # -1 # ID=16_2;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.384 10_5 - 156 SNF2_N PF00176.18 299 2.2e-05 17.3 0.4 1 1 5e-07 2.6e-05 17.1 0.4 1 138 6 151 6 153 0.69 # 2866 # 3333 # -1 # ID=10_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.404 2_10 - 1006 SNF2_N PF00176.18 299 7e-05 15.7 0.2 1 1 1e-05 0.00053 12.8 0.0 1 180 255 435 255 445 0.81 # 9359 # 12376 # 1 # ID=2_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.391 7_9 - 270 APS_kinase PF01583.15 157 0.0014 12.2 0.0 1 2 4.4e-05 0.0092 9.6 0.0 10 41 10 41 2 91 0.73 # 6847 # 7656 # -1 # ID=7_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.283 7_9 - 270 APS_kinase PF01583.15 157 0.0014 12.2 0.0 2 2 0.054 11 -0.5 0.0 69 89 135 155 132 167 0.86 # 6847 # 7656 # -1 # ID=7_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.283 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b2 (February 2015) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/73f75c06-9834-4987-9979-e8bb1fd6b185 # Target file: checkm_output/bins/pGCA_002078915.1.assembled/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pGCA_002078915.1.assembled/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/73f75c06-9834-4987-9979-e8bb1fd6b185 checkm_output/bins/pGCA_002078915.1.assembled/genes.faa # Current dir: /mnt/DGK_KLIF/data/klif/reads-for-assembly/trainingsets2/combined/rfplasmid_combined_jellynew2 # Date: Tue Jul 7 16:48:20 2020 # [ok]