# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_177 - 472 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.00035 14.1 0.0 1 1 6.2e-06 0.00086 12.8 0.0 2 58 11 70 10 86 0.78 # 140077 # 141492 # 1 # ID=1_177;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.261 1_73 - 575 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.0024 11.4 0.1 1 1 3.9e-05 0.0054 10.2 0.1 26 43 185 202 182 208 0.91 # 64171 # 65895 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.277 1_222 - 973 UPF0020 PF01170.13 180 1.4e-05 19.1 0.0 1 1 4.4e-06 0.00061 13.7 0.0 31 77 335 392 323 458 0.75 # 184948 # 187866 # 1 # ID=1_222;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.258 3_6 - 187 UPF0020 PF01170.13 180 0.00021 15.2 0.0 1 1 2.9e-06 0.0004 14.3 0.0 24 78 131 174 128 184 0.81 # 1935 # 2495 # 1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.351 1_28 - 621 cobW PF02492.14 178 0.002 11.9 0.0 1 1 1.6e-05 0.0044 10.8 0.0 3 33 261 292 259 318 0.86 # 20426 # 22288 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.296 1_160 - 198 Thymidylate_kin PF02223.12 186 0.0012 12.6 1.2 1 2 0.00014 0.039 7.6 0.0 5 48 16 59 14 71 0.79 # 130489 # 131082 # 1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 1_160 - 198 Thymidylate_kin PF02223.12 186 0.0012 12.6 1.2 2 2 0.0023 0.65 3.7 0.2 117 174 118 174 94 192 0.65 # 130489 # 131082 # 1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 1_53 - 54 S1_2 PF13509.1 61 0.00085 13.6 0.0 1 1 4.1e-06 0.0011 13.2 0.0 28 58 6 36 2 37 0.87 # 44362 # 44523 # 1 # ID=1_53;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.210 1_60 - 273 IstB_IS21 PF01695.12 178 3.6e-15 50.2 0.0 1 1 5.6e-17 5.2e-15 49.6 0.0 18 145 87 216 76 225 0.82 # 49516 # 50334 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.254 1_35 - 422 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.00026 14.8 0.0 1 1 5.3e-06 0.00049 13.9 0.0 44 74 228 258 212 276 0.75 # 29535 # 30800 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.278 1_73 - 575 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.00026 14.8 0.1 1 1 6.4e-06 0.0006 13.6 0.1 50 71 184 205 176 218 0.91 # 64171 # 65895 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.277 1_160 - 198 CoaE PF01121.15 180 2.5e-05 18.1 0.1 1 2 2.9e-06 0.00081 13.2 0.0 1 31 8 38 8 84 0.74 # 130489 # 131082 # 1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 1_160 - 198 CoaE PF01121.15 180 2.5e-05 18.1 0.1 2 2 0.0032 0.9 3.2 0.1 125 166 122 164 90 185 0.84 # 130489 # 131082 # 1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 1_185 - 149 SSB PF00436.20 104 3.2e-39 127.4 0.1 1 1 3.1e-41 4.4e-39 127.0 0.1 1 104 1 102 1 102 0.98 # 146256 # 146702 # 1 # ID=1_185;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.336 1_226 - 217 SSB PF00436.20 104 4.1e-25 82.1 2.1 1 1 2.9e-27 4.1e-25 82.1 2.1 1 104 1 101 1 101 0.96 # 193756 # 194406 # -1 # ID=1_226;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.295 1_140 - 63 Methyltransf_18 PF12847.2 112 0.00051 15.0 0.0 1 1 1.9e-06 0.00054 14.9 0.0 2 42 8 46 7 58 0.85 # 117848 # 118036 # 1 # ID=1_140;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.265 2_12 - 698 UvrD_C_2 PF13538.1 104 8.9e-13 42.7 0.3 1 1 1.7e-14 4.8e-12 40.3 0.1 54 103 544 621 503 622 0.73 # 11171 # 13264 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.229 1_73 - 575 AAA_2 PF07724.9 171 1.5e-05 19.3 0.4 1 1 2.5e-07 6.9e-05 17.2 0.0 8 90 186 262 180 280 0.71 # 64171 # 65895 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.277 1_28 - 621 DUF87 PF01935.12 229 2.2e-08 28.5 0.1 1 1 4.1e-10 5.7e-08 27.2 0.1 26 82 261 316 255 395 0.81 # 20426 # 22288 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.296 1_52 - 649 DUF87 PF01935.12 229 4.9e-08 27.4 0.3 1 1 1.2e-09 1.7e-07 25.6 0.0 3 68 144 207 142 287 0.87 # 42305 # 44251 # 1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 1_73 - 575 AAA_22 PF13401.1 131 3.5e-08 28.0 1.1 1 2 9.8e-07 5.5e-05 17.7 0.3 7 29 184 206 178 297 0.69 # 64171 # 65895 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.277 1_73 - 575 AAA_22 PF13401.1 131 3.5e-08 28.0 1.1 2 2 0.015 0.86 4.1 0.0 72 113 488 547 425 563 0.67 # 64171 # 65895 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.277 1_177 - 472 AAA_22 PF13401.1 131 1.8e-07 25.7 2.2 1 1 4.3e-08 2.4e-06 22.1 0.1 7 123 37 149 30 155 0.65 # 140077 # 141492 # 1 # ID=1_177;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.261 1_160 - 198 AAA_22 PF13401.1 131 0.0001 16.8 0.2 1 1 3e-06 0.00017 16.1 0.1 6 31 9 34 3 107 0.86 # 130489 # 131082 # 1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 1_212 - 801 AAA_22 PF13401.1 131 0.00029 15.3 0.4 1 2 0.0011 0.06 7.9 0.0 8 86 383 495 377 513 0.67 # 170587 # 172989 # -1 # ID=1_212;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.276 1_212 - 801 AAA_22 PF13401.1 131 0.00029 15.3 0.4 2 2 0.028 1.6 3.3 0.0 86 119 633 668 613 676 0.73 # 170587 # 172989 # -1 # ID=1_212;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.276 1_35 - 422 AAA_22 PF13401.1 131 0.00065 14.2 0.0 1 1 2.8e-05 0.0016 13.0 0.0 4 29 231 256 225 382 0.68 # 29535 # 30800 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.278 1_34 - 488 DUF1611 PF07755.6 301 0.0045 10.0 2.9 1 2 1.1e-05 0.0031 10.5 0.1 123 146 11 34 9 38 0.91 # 28004 # 29467 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.247 1_34 - 488 DUF1611 PF07755.6 301 0.0045 10.0 2.9 2 2 0.065 18 -1.9 0.3 247 280 423 457 404 464 0.48 # 28004 # 29467 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.247 1_35 - 422 ATP_bind_1 PF03029.12 238 0.0016 12.3 0.0 1 1 1.3e-05 0.0035 11.2 0.0 2 23 237 258 236 265 0.86 # 29535 # 30800 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.278 1_134 - 153 Methyltransf_11 PF08241.7 95 5e-05 18.1 0.0 1 2 0.00023 0.031 9.2 0.0 2 66 7 67 6 69 0.61 # 115148 # 115606 # 1 # ID=1_134;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.283 1_134 - 153 Methyltransf_11 PF08241.7 95 5e-05 18.1 0.0 2 2 0.0011 0.15 6.9 0.0 75 95 95 115 88 115 0.90 # 115148 # 115606 # 1 # ID=1_134;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.283 3_5 - 123 Methyltransf_11 PF08241.7 95 0.00023 16.0 0.1 1 1 8.2e-06 0.0011 13.8 0.0 71 94 53 76 49 77 0.91 # 1536 # 1904 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.339 1_160 - 198 PRK PF00485.13 194 0.0021 12.0 2.2 1 2 1.9e-05 0.0054 10.6 0.1 1 21 9 29 9 37 0.92 # 130489 # 131082 # 1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 1_160 - 198 PRK PF00485.13 194 0.0021 12.0 2.2 2 2 0.02 5.7 0.8 0.3 123 157 116 150 69 188 0.66 # 130489 # 131082 # 1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 1_144 - 285 DNA_methylase PF00145.12 335 7.6e-46 151.0 0.0 1 2 4.8e-31 1.3e-28 94.3 0.0 5 169 6 167 2 201 0.87 # 120939 # 121793 # 1 # ID=1_144;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 1_144 - 285 DNA_methylase PF00145.12 335 7.6e-46 151.0 0.0 2 2 3.8e-19 1.1e-16 55.2 0.0 279 334 220 280 183 281 0.82 # 120939 # 121793 # 1 # ID=1_144;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 1_35 - 422 SRP54 PF00448.17 196 0.00014 15.7 0.0 1 1 8.5e-07 0.00024 14.9 0.0 3 30 233 260 231 267 0.86 # 29535 # 30800 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.278 1_177 - 472 DNA_pol3_delta2 PF13177.1 162 2.7e-41 135.3 0.0 1 1 9.8e-44 2.7e-41 135.3 0.0 2 161 17 171 16 172 0.94 # 140077 # 141492 # 1 # ID=1_177;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.261 2_8 - 761 NAD_binding_7 PF13241.1 103 0.002 12.8 0.0 1 1 3.6e-05 0.0099 10.5 0.0 6 45 367 416 365 490 0.65 # 6666 # 8948 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.276 3_6 - 187 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 3e-41 135.7 0.1 1 1 6.2e-43 3.5e-41 135.5 0.1 73 231 2 175 1 175 0.85 # 1935 # 2495 # 1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.351 1_135 - 255 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 4.6e-21 69.7 2.4 1 1 1.2e-22 6.5e-21 69.2 2.4 30 231 39 239 24 239 0.75 # 115637 # 116401 # 1 # ID=1_135;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.306 3_5 - 123 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 4.8e-18 59.8 0.0 1 1 1.7e-19 9.3e-18 58.8 0.0 1 63 24 86 24 113 0.88 # 1536 # 1904 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.339 1_155 - 319 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 2.1e-12 41.3 4.9 1 2 8.8e-06 0.00049 14.0 0.0 196 224 61 89 46 92 0.89 # 127197 # 128153 # 1 # ID=1_155;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.276 1_155 - 319 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 2.1e-12 41.3 4.9 2 2 2.5e-09 1.4e-07 25.6 4.6 6 116 109 272 104 315 0.71 # 127197 # 128153 # 1 # ID=1_155;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.276 1_140 - 63 N6_N4_Mtase PF01555.13 231 2.1e-06 21.7 0.0 1 1 4.3e-08 2.4e-06 21.5 0.0 188 228 4 44 1 47 0.92 # 117848 # 118036 # 1 # ID=1_140;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.265 1_160 - 198 AAA_17 PF13207.1 121 2.2e-10 35.8 2.4 1 1 7.4e-12 5.2e-10 34.6 2.4 1 111 9 141 9 191 0.65 # 130489 # 131082 # 1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 1_73 - 575 AAA_17 PF13207.1 121 3.2e-07 25.5 2.7 1 1 3e-08 2.1e-06 23.0 0.0 3 86 185 272 185 326 0.66 # 64171 # 65895 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.277 1_177 - 472 AAA_17 PF13207.1 121 0.00011 17.4 0.4 1 1 5.5e-06 0.00038 15.6 0.1 3 80 38 123 37 250 0.73 # 140077 # 141492 # 1 # ID=1_177;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.261 1_60 - 273 AAA_17 PF13207.1 121 0.0033 12.6 1.0 1 1 0.00027 0.019 10.2 0.2 2 34 121 158 120 219 0.69 # 49516 # 50334 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.254 1_160 - 198 AAA_21 PF13304.1 303 0.00016 16.0 3.1 1 1 1e-06 0.00028 15.2 3.1 1 126 9 143 9 153 0.71 # 130489 # 131082 # 1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 1_64 - 469 Miro PF08477.8 119 0.00026 15.8 0.0 1 1 8.6e-06 0.0012 13.7 0.0 2 25 249 272 248 310 0.77 # 57772 # 59178 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.249 1_35 - 422 Miro PF08477.8 119 0.0011 13.8 0.0 1 1 6.1e-05 0.0085 11.0 0.0 2 21 234 253 233 283 0.85 # 29535 # 30800 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.278 1_35 - 422 MobB PF03205.9 140 0.00012 16.1 0.0 1 1 2.1e-06 0.00029 14.9 0.0 3 36 234 266 232 269 0.78 # 29535 # 30800 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.278 1_28 - 621 MobB PF03205.9 140 0.0017 12.4 0.0 1 1 2.7e-05 0.0037 11.3 0.0 3 34 261 292 259 297 0.90 # 20426 # 22288 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.296 1_35 - 422 T2SE PF00437.15 272 2.2e-51 168.7 0.2 1 1 2e-53 2.7e-51 168.3 0.2 4 268 83 379 80 383 0.95 # 29535 # 30800 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.278 1_64 - 469 T2SE PF00437.15 272 6.7e-23 75.2 0.0 1 1 8e-25 1.1e-22 74.5 0.0 14 259 131 378 126 393 0.81 # 57772 # 59178 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.249 1_73 - 575 SKI PF01202.17 158 0.00054 14.2 0.0 1 1 4.3e-06 0.0012 13.1 0.0 1 44 190 238 190 242 0.87 # 64171 # 65895 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.277 1_34 - 488 AAA_26 PF13500.1 199 0.016 9.1 4.9 1 2 0.00035 0.097 6.6 0.2 11 31 11 31 7 35 0.88 # 28004 # 29467 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.247 1_34 - 488 AAA_26 PF13500.1 199 0.016 9.1 4.9 2 2 0.0024 0.66 3.9 0.5 31 126 352 462 331 465 0.75 # 28004 # 29467 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.247 2_8 - 761 Shikimate_DH PF01488.15 135 4.6e-05 17.9 0.0 1 1 4e-07 0.00011 16.6 0.0 11 43 367 399 356 426 0.86 # 6666 # 8948 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.276 1_34 - 488 Methyltransf_24 PF13578.1 106 0.0015 13.7 0.0 1 1 1.1e-05 0.0031 12.7 0.0 9 80 16 116 11 131 0.73 # 28004 # 29467 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.247 1_177 - 472 Zeta_toxin PF06414.7 201 3.1e-05 17.5 0.5 1 2 0.00027 0.019 8.4 0.0 18 42 36 61 29 70 0.87 # 140077 # 141492 # 1 # ID=1_177;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.261 1_177 - 472 Zeta_toxin PF06414.7 201 3.1e-05 17.5 0.5 2 2 0.001 0.071 6.5 0.4 77 173 238 329 214 358 0.77 # 140077 # 141492 # 1 # ID=1_177;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.261 1_73 - 575 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00018 14.9 0.0 1 1 6.8e-06 0.00047 13.6 0.0 11 58 175 222 165 244 0.83 # 64171 # 65895 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.277 1_160 - 198 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00039 13.9 0.0 1 1 1.5e-05 0.001 12.5 0.0 17 40 8 31 2 40 0.85 # 130489 # 131082 # 1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 1_35 - 422 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00056 13.4 0.0 1 1 1.8e-05 0.0013 12.2 0.0 14 51 229 266 216 287 0.82 # 29535 # 30800 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.278 1_18 - 645 SMC_N PF02463.14 220 1.8e-05 18.4 1.4 1 1 1.3e-07 1.8e-05 18.4 1.4 1 122 4 110 4 120 0.78 # 12480 # 14414 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.227 1_60 - 273 SMC_N PF02463.14 220 0.00088 12.9 0.6 1 1 1.2e-05 0.0017 11.9 0.3 20 70 114 163 96 176 0.76 # 49516 # 50334 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.254 1_28 - 621 Arch_ATPase PF01637.13 234 1.2e-05 19.5 1.0 1 2 0.014 2 2.3 0.3 39 96 103 157 96 182 0.59 # 20426 # 22288 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.296 1_28 - 621 Arch_ATPase PF01637.13 234 1.2e-05 19.5 1.0 2 2 4.6e-06 0.00064 13.8 0.0 23 68 261 306 256 354 0.84 # 20426 # 22288 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.296 1_60 - 273 Arch_ATPase PF01637.13 234 1.5e-05 19.1 0.2 1 1 2e-07 2.7e-05 18.3 0.1 11 68 110 166 104 217 0.76 # 49516 # 50334 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.254 1_73 - 575 AAA_16 PF13191.1 185 2.5e-05 18.6 0.1 1 1 4.7e-06 0.00022 15.6 0.1 24 81 181 227 173 288 0.63 # 64171 # 65895 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.277 1_60 - 273 AAA_16 PF13191.1 185 5.1e-05 17.7 0.0 1 1 1.5e-06 6.9e-05 17.2 0.0 18 59 112 150 104 193 0.82 # 49516 # 50334 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.254 1_160 - 198 AAA_16 PF13191.1 185 0.00013 16.4 0.0 1 1 7.5e-06 0.00035 14.9 0.0 26 45 9 27 2 41 0.88 # 130489 # 131082 # 1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 1_64 - 469 AAA_16 PF13191.1 185 0.0002 15.8 0.0 1 1 7.2e-06 0.00033 15.0 0.0 11 51 234 273 227 331 0.85 # 57772 # 59178 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.249 1_177 - 472 AAA_16 PF13191.1 185 0.00035 14.9 0.0 1 1 4.6e-05 0.0021 12.4 0.0 3 51 15 61 13 67 0.75 # 140077 # 141492 # 1 # ID=1_177;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.261 1_35 - 422 AAA_16 PF13191.1 185 0.0016 12.8 0.0 1 1 8.1e-05 0.0038 11.6 0.0 25 55 232 263 216 271 0.85 # 29535 # 30800 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.278 1_18 - 645 AAA_23 PF13476.1 202 2e-05 19.4 30.5 1 1 2.1e-07 2e-05 19.4 30.5 1 200 7 272 7 273 0.44 # 12480 # 14414 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.227 1_35 - 422 AAA_23 PF13476.1 202 0.00011 16.9 3.3 1 1 1.3e-06 0.00012 16.7 0.3 20 41 232 253 220 259 0.90 # 29535 # 30800 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.278 1_160 - 198 AAA_23 PF13476.1 202 0.00082 14.1 6.3 1 1 5.2e-05 0.0048 11.6 6.3 21 132 9 149 4 197 0.33 # 130489 # 131082 # 1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 1_160 - 198 AAA_18 PF13238.1 129 6.8e-15 49.9 1.9 1 1 1.9e-16 8.9e-15 49.5 1.9 1 117 10 145 10 173 0.88 # 130489 # 131082 # 1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 1_73 - 575 AAA_18 PF13238.1 129 0.00035 15.2 0.0 1 1 7.5e-06 0.00035 15.2 0.0 2 55 185 262 185 327 0.60 # 64171 # 65895 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.277 1_177 - 472 AAA_18 PF13238.1 129 0.00082 14.0 3.6 1 1 3.6e-05 0.0017 13.1 0.0 3 82 39 122 38 155 0.55 # 140077 # 141492 # 1 # ID=1_177;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.261 1_64 - 469 AAA_18 PF13238.1 129 0.0021 12.8 2.6 1 1 0.0017 0.077 7.7 0.0 1 50 249 298 249 333 0.61 # 57772 # 59178 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.249 1_60 - 273 AAA_18 PF13238.1 129 0.013 10.2 0.0 1 1 0.00027 0.013 10.2 0.0 1 63 121 181 121 217 0.69 # 49516 # 50334 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.254 1_61 - 443 AAA_18 PF13238.1 129 0.03 9.0 7.9 1 2 0.0025 0.12 7.1 0.5 12 108 66 246 66 249 0.44 # 50324 # 51652 # 1 # ID=1_61;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.266 1_61 - 443 AAA_18 PF13238.1 129 0.03 9.0 7.9 2 2 0.052 2.4 2.8 0.3 80 109 218 247 203 395 0.76 # 50324 # 51652 # 1 # ID=1_61;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.266 1_60 - 273 Kinesin PF00225.18 335 4.6e-05 16.6 0.2 1 1 1.9e-07 5.3e-05 16.4 0.2 24 116 67 162 33 211 0.75 # 49516 # 50334 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.254 1_34 - 488 CbiA PF01656.18 195 2.9e-11 37.5 0.0 1 1 2.1e-13 2.9e-11 37.5 0.0 7 127 9 138 6 204 0.72 # 28004 # 29467 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.247 1_46 - 370 CbiA PF01656.18 195 0.00015 15.5 0.3 1 1 2.9e-06 0.0004 14.1 0.0 1 37 183 215 183 335 0.79 # 36518 # 37627 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.214 1_35 - 422 IIGP PF05049.8 376 0.00035 13.8 0.5 1 2 4.7e-06 0.0013 11.9 0.1 6 56 201 252 196 259 0.73 # 29535 # 30800 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.278 1_35 - 422 IIGP PF05049.8 376 0.00035 13.8 0.5 2 2 0.033 9 -0.7 0.0 250 292 365 408 337 411 0.81 # 29535 # 30800 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.278 1_134 - 153 Methyltransf_25 PF13649.1 101 6.3e-12 40.1 0.0 1 1 2.9e-14 8.2e-12 39.8 0.0 1 99 5 109 5 111 0.93 # 115148 # 115606 # 1 # ID=1_134;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.283 1_28 - 621 KaiC PF06745.8 227 0.0012 12.4 0.1 1 2 0.027 7.6 -0.1 0.1 157 201 130 174 122 198 0.79 # 20426 # 22288 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.296 1_28 - 621 KaiC PF06745.8 227 0.0012 12.4 0.1 2 2 3.2e-05 0.0088 9.5 0.0 21 110 260 355 249 362 0.71 # 20426 # 22288 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.296 1_177 - 472 AAA_14 PF13173.1 128 2.8e-05 18.4 3.2 1 1 5.3e-07 4.9e-05 17.6 0.0 4 95 36 148 33 164 0.62 # 140077 # 141492 # 1 # ID=1_177;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.261 1_60 - 273 AAA_14 PF13173.1 128 0.00031 15.0 1.4 1 1 4.8e-06 0.00045 14.5 0.3 4 101 120 223 117 241 0.63 # 49516 # 50334 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.254 1_73 - 575 AAA_14 PF13173.1 128 0.00067 13.9 0.0 1 1 7.2e-06 0.00067 13.9 0.0 6 78 185 267 181 297 0.70 # 64171 # 65895 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.277 1_160 - 198 AAA_29 PF13555.1 62 0.00011 16.1 0.0 1 1 2.3e-06 0.00021 15.2 0.0 26 39 10 23 2 25 0.85 # 130489 # 131082 # 1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 1_35 - 422 AAA_29 PF13555.1 62 0.00022 15.1 0.0 1 1 4.7e-06 0.00043 14.2 0.0 23 45 231 253 222 262 0.83 # 29535 # 30800 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.278 1_18 - 645 AAA_29 PF13555.1 62 0.00029 14.7 0.0 1 1 6.8e-06 0.00063 13.6 0.0 17 44 22 46 12 54 0.79 # 12480 # 14414 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.227 1_73 - 575 AAA PF00004.24 132 1e-45 149.5 0.0 1 1 6.4e-47 4.4e-45 147.5 0.0 2 131 185 314 184 315 0.96 # 64171 # 65895 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.277 1_177 - 472 AAA PF00004.24 132 1.2e-15 52.2 1.3 1 1 2.2e-16 1.5e-14 48.6 0.0 2 127 38 166 37 171 0.78 # 140077 # 141492 # 1 # ID=1_177;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.261 1_61 - 443 AAA PF00004.24 132 0.00015 16.3 4.4 1 1 3.7e-06 0.00026 15.6 2.5 2 98 203 346 202 366 0.70 # 50324 # 51652 # 1 # ID=1_61;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.266 1_60 - 273 AAA PF00004.24 132 0.00031 15.3 0.0 1 1 8.9e-06 0.00062 14.3 0.0 2 66 122 187 121 190 0.79 # 49516 # 50334 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.254 1_60 - 273 Bac_DnaA PF00308.13 219 1.6e-07 25.5 0.7 1 1 1.1e-09 3e-07 24.6 0.7 32 147 116 229 82 242 0.73 # 49516 # 50334 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.254 1_210 - 460 MRP-L47 PF06984.8 87 2e-05 18.8 0.1 1 1 1.6e-07 4.6e-05 17.7 0.1 24 86 265 329 255 330 0.85 # 168256 # 169635 # 1 # ID=1_210;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.328 2_12 - 698 UvrD_C PF13361.1 351 1.5e-35 117.6 23.8 1 1 5.5e-38 1.5e-35 117.6 23.8 1 350 294 625 294 626 0.86 # 11171 # 13264 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.229 1_208 - 491 PAPS_reduct PF01507.14 174 1.3e-12 42.2 0.8 1 1 2.4e-14 6.7e-12 39.9 0.2 3 173 267 442 265 443 0.77 # 166044 # 167516 # 1 # ID=1_208;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.251 1_73 - 575 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.0006 13.7 0.0 1 1 2e-05 0.0028 11.5 0.0 17 60 176 216 165 307 0.88 # 64171 # 65895 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.277 1_160 - 198 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00091 13.1 0.0 1 1 1.3e-05 0.0018 12.1 0.0 20 45 5 30 2 44 0.82 # 130489 # 131082 # 1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 2_8 - 761 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 7.3e-05 17.2 0.0 1 1 4.2e-07 0.00012 16.6 0.0 1 33 372 403 372 461 0.73 # 6666 # 8948 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.276 1_160 - 198 MMR_HSR1 PF01926.18 116 5.2e-05 17.6 0.2 1 1 1.2e-06 0.00017 15.9 0.2 2 91 10 130 9 193 0.58 # 130489 # 131082 # 1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 1_35 - 422 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.00016 16.0 0.0 1 1 3.6e-06 0.0005 14.4 0.0 2 28 234 262 233 284 0.80 # 29535 # 30800 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.278 1_222 - 973 N6_Mtase PF02384.11 311 4.6e-18 59.6 0.2 1 1 8.5e-20 1.2e-17 58.3 0.2 4 238 288 556 286 595 0.77 # 184948 # 187866 # 1 # ID=1_222;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.258 1_135 - 255 N6_Mtase PF02384.11 311 0.0019 11.6 1.7 1 2 7e-05 0.0097 9.3 0.0 108 164 6 64 2 74 0.82 # 115637 # 116401 # 1 # ID=1_135;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.306 1_135 - 255 N6_Mtase PF02384.11 311 0.0019 11.6 1.7 2 2 0.023 3.2 1.0 0.1 9 22 188 201 186 205 0.89 # 115637 # 116401 # 1 # ID=1_135;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.306 1_35 - 422 DUF258 PF03193.11 161 2.7e-05 17.7 0.0 1 1 5.2e-07 4.9e-05 16.9 0.0 30 57 226 253 197 269 0.68 # 29535 # 30800 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.278 1_160 - 198 DUF258 PF03193.11 161 9.2e-05 16.0 0.0 1 1 3.2e-06 0.0003 14.4 0.0 35 61 7 33 1 61 0.80 # 130489 # 131082 # 1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 1_60 - 273 DUF258 PF03193.11 161 0.00093 12.7 0.0 1 1 1.7e-05 0.0016 12.0 0.0 23 55 104 138 81 175 0.73 # 49516 # 50334 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.254 1_52 - 649 TraG-D_C PF12696.2 128 3.7e-39 127.9 0.8 1 1 1.4e-40 2e-38 125.5 0.0 2 127 416 537 415 538 0.87 # 42305 # 44251 # 1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 1_212 - 801 TraG-D_C PF12696.2 128 0.001 13.3 0.0 1 1 1.8e-05 0.0025 12.1 0.0 1 83 636 713 636 740 0.88 # 170587 # 172989 # -1 # ID=1_212;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.276 1_34 - 488 AAA_31 PF13614.1 157 3.6e-17 57.1 0.1 1 2 2.6e-19 3.6e-17 57.1 0.1 6 151 6 138 2 141 0.90 # 28004 # 29467 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.247 1_34 - 488 AAA_31 PF13614.1 157 3.6e-17 57.1 0.1 2 2 0.017 2.3 2.5 0.6 55 108 322 374 300 387 0.81 # 28004 # 29467 # 1 # ID=1_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.247 1_46 - 370 AAA_31 PF13614.1 157 9.8e-07 23.2 3.0 1 1 1.1e-08 1.5e-06 22.6 1.1 1 151 181 315 181 321 0.81 # 36518 # 37627 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.214 1_160 - 198 AAA_33 PF13671.1 143 7.7e-08 26.7 0.0 1 1 3.8e-09 5.3e-07 23.9 0.0 2 121 10 143 9 164 0.60 # 130489 # 131082 # 1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 1_35 - 422 AAA_33 PF13671.1 143 0.00053 14.2 0.0 1 1 7e-06 0.00097 13.4 0.0 2 57 234 303 234 315 0.75 # 29535 # 30800 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.278 1_61 - 443 DnaB_C PF03796.10 259 2.3e-87 286.4 2.7 1 1 1.4e-89 4e-87 285.7 2.7 9 258 189 437 182 438 0.96 # 50324 # 51652 # 1 # ID=1_61;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.266 1_222 - 973 Methyltransf_26 PF13659.1 117 1.1e-11 39.2 0.0 1 1 6.1e-13 2.1e-11 38.3 0.0 3 116 335 497 333 498 0.73 # 184948 # 187866 # 1 # ID=1_222;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.258 3_6 - 187 Methyltransf_26 PF13659.1 117 4.4e-07 24.3 0.0 1 1 2.4e-08 8.5e-07 23.4 0.0 4 42 139 176 136 184 0.89 # 1935 # 2495 # 1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.351 3_5 - 123 Methyltransf_26 PF13659.1 117 3.5e-06 21.4 0.0 1 1 1.3e-07 4.5e-06 21.1 0.0 58 114 11 78 4 81 0.73 # 1536 # 1904 # 1 # ID=3_5;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.339 1_155 - 319 Methyltransf_26 PF13659.1 117 4e-06 21.2 0.0 1 1 1.9e-05 0.00065 14.1 0.0 5 115 61 172 58 174 0.79 # 127197 # 128153 # 1 # ID=1_155;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.276 1_134 - 153 Methyltransf_26 PF13659.1 117 6.2e-05 17.4 0.0 1 1 1.2e-05 0.00041 14.7 0.0 57 116 50 118 45 119 0.80 # 115148 # 115606 # 1 # ID=1_134;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.283 1_140 - 63 Methyltransf_26 PF13659.1 117 0.00016 16.0 0.0 1 1 5e-06 0.00017 16.0 0.0 1 39 8 45 8 59 0.87 # 117848 # 118036 # 1 # ID=1_140;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.265 1_144 - 285 Methyltransf_26 PF13659.1 117 0.0018 12.7 0.0 1 1 7.9e-05 0.0027 12.1 0.0 8 87 8 78 6 110 0.76 # 120939 # 121793 # 1 # ID=1_144;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 1_135 - 255 Methyltransf_26 PF13659.1 117 0.0025 12.2 0.0 1 2 0.0028 0.098 7.1 0.0 54 88 7 37 3 84 0.75 # 115637 # 116401 # 1 # ID=1_135;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.306 1_135 - 255 Methyltransf_26 PF13659.1 117 0.0025 12.2 0.0 2 2 0.054 1.9 2.9 0.0 5 45 204 243 201 250 0.87 # 115637 # 116401 # 1 # ID=1_135;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.306 1_177 - 472 AAA_30 PF13604.1 196 0.00042 14.3 0.1 1 1 8e-05 0.011 9.6 0.0 24 126 40 145 30 153 0.61 # 140077 # 141492 # 1 # ID=1_177;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.261 1_35 - 422 AAA_30 PF13604.1 196 0.00049 14.0 0.0 1 1 5.9e-06 0.00082 13.3 0.0 10 46 224 259 215 267 0.76 # 29535 # 30800 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.278 2_8 - 761 ApbA PF02558.11 151 0.0001 16.2 0.0 1 1 7.5e-07 0.00021 15.1 0.0 1 47 371 419 371 462 0.82 # 6666 # 8948 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.276 1_52 - 649 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 2.1e-06 21.7 0.0 1 1 6.1e-08 4.2e-06 20.7 0.0 39 82 160 203 135 212 0.82 # 42305 # 44251 # 1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 1_35 - 422 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.0001 16.1 0.0 1 1 3e-06 0.00021 15.1 0.0 10 58 202 251 195 257 0.86 # 29535 # 30800 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.278 1_28 - 621 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00023 15.0 0.0 1 1 7.8e-06 0.00054 13.8 0.0 37 78 257 294 229 309 0.77 # 20426 # 22288 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.296 1_64 - 469 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.0023 11.8 0.0 1 1 5.9e-05 0.0041 10.9 0.0 35 61 243 269 226 272 0.86 # 57772 # 59178 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.249 1_177 - 472 VirE PF05272.6 198 0.00063 13.6 0.0 1 1 5.3e-06 0.0015 12.4 0.0 53 122 35 104 30 115 0.92 # 140077 # 141492 # 1 # ID=1_177;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.261 1_160 - 198 ABC_tran PF00005.22 137 2.2e-05 19.1 0.4 1 1 3.6e-07 2.5e-05 18.9 0.4 13 34 9 30 4 190 0.90 # 130489 # 131082 # 1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 1_60 - 273 ABC_tran PF00005.22 137 0.00014 16.5 0.0 1 1 3.4e-06 0.00024 15.8 0.0 11 40 118 147 111 201 0.79 # 49516 # 50334 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.254 1_35 - 422 ABC_tran PF00005.22 137 0.00045 14.9 0.0 1 1 1.5e-05 0.0011 13.7 0.0 11 34 231 254 225 270 0.84 # 29535 # 30800 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.278 1_177 - 472 ABC_tran PF00005.22 137 0.0075 10.9 0.0 1 1 0.00011 0.0075 10.9 0.0 11 47 34 70 30 110 0.81 # 140077 # 141492 # 1 # ID=1_177;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.261 1_160 - 198 TIGR03263 TIGR03263 180 5.5e-10 33.2 2.1 1 1 3.5e-12 9.7e-10 32.4 2.1 3 155 9 162 7 197 0.61 # 130489 # 131082 # 1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 1_35 - 422 ATP-synt_ab PF00006.20 215 0.00057 13.7 0.0 1 1 3e-06 0.00082 13.2 0.0 13 51 229 267 226 413 0.72 # 29535 # 30800 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.278 1_222 - 973 Eco57I PF07669.6 106 2.1e-10 35.3 0.4 1 2 4.2e-11 1.2e-08 29.7 0.1 1 104 439 551 439 553 0.85 # 184948 # 187866 # 1 # ID=1_222;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.258 1_222 - 973 Eco57I PF07669.6 106 2.1e-10 35.3 0.4 2 2 0.023 6.3 1.6 0.0 63 94 648 679 640 681 0.87 # 184948 # 187866 # 1 # ID=1_222;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.258 1_135 - 255 AviRa PF11599.3 246 0.0017 11.7 0.0 1 1 9.9e-06 0.0027 11.0 0.0 154 210 7 66 2 80 0.77 # 115637 # 116401 # 1 # ID=1_135;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.306 1_73 - 575 RuvB_N PF05496.7 234 5.4e-06 19.9 0.2 1 1 9.4e-08 2.6e-05 17.7 0.0 20 114 144 253 125 261 0.67 # 64171 # 65895 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.277 2_12 - 698 AAA_19 PF13245.1 76 3.3e-08 27.6 0.0 1 1 2.1e-09 1.4e-07 25.5 0.0 6 75 24 101 22 102 0.86 # 11171 # 13264 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.229 1_61 - 443 AAA_19 PF13245.1 76 0.00042 14.4 0.0 1 1 1.1e-05 0.00079 13.5 0.0 10 41 199 230 191 241 0.83 # 50324 # 51652 # 1 # ID=1_61;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.266 1_73 - 575 AAA_19 PF13245.1 76 0.001 13.2 0.3 1 1 5.1e-05 0.0036 11.4 0.2 14 32 185 202 175 208 0.74 # 64171 # 65895 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.277 1_52 - 649 AAA_19 PF13245.1 76 0.0018 12.4 0.0 1 1 5.7e-05 0.004 11.3 0.0 13 58 165 207 160 218 0.81 # 42305 # 44251 # 1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 1_164 - 120 RmlD_sub_bind PF04321.12 287 0.0024 11.1 0.0 1 1 1.4e-05 0.0039 10.4 0.0 146 179 3 36 2 43 0.93 # 134083 # 134442 # 1 # ID=1_164;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.239 1_28 - 621 AAA_10 PF12846.2 304 2.6e-47 156.0 0.0 1 1 5.4e-49 3.8e-47 155.5 0.0 1 301 258 578 258 581 0.92 # 20426 # 22288 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.296 1_212 - 801 AAA_10 PF12846.2 304 6.9e-20 66.0 0.1 1 1 1.8e-21 1.2e-19 65.1 0.1 5 297 383 707 380 714 0.83 # 170587 # 172989 # -1 # ID=1_212;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.276 1_52 - 649 AAA_10 PF12846.2 304 1.4e-18 61.7 0.0 1 1 3.4e-20 2.3e-18 60.9 0.0 1 303 162 497 162 498 0.77 # 42305 # 44251 # 1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 1_35 - 422 AAA_10 PF12846.2 304 0.00013 15.8 0.1 1 1 3.3e-06 0.00023 15.0 0.1 3 24 233 254 231 377 0.80 # 29535 # 30800 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.278 2_8 - 761 DAO PF01266.19 358 0.0012 12.1 0.0 1 1 6.5e-06 0.0018 11.5 0.0 1 32 370 402 370 411 0.92 # 6666 # 8948 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.276 2_8 - 761 ThiF PF00899.16 136 1.8e-16 54.5 0.0 1 1 1.2e-18 3.3e-16 53.7 0.0 2 124 368 492 367 501 0.78 # 6666 # 8948 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.276 1_35 - 422 ResIII PF04851.10 184 2.5e-06 21.8 0.0 1 1 1.8e-08 5e-06 20.8 0.0 7 63 215 271 205 288 0.88 # 29535 # 30800 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.278 1_222 - 973 Methyltransf_31 PF13847.1 152 0.021 8.8 6.6 1 2 1.8e-05 0.005 10.8 0.1 2 43 331 391 330 397 0.75 # 184948 # 187866 # 1 # ID=1_222;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.258 1_222 - 973 Methyltransf_31 PF13847.1 152 0.021 8.8 6.6 2 2 0.093 26 -1.3 0.0 56 103 576 629 565 672 0.75 # 184948 # 187866 # 1 # ID=1_222;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.258 3_10 - 483 DUF3584 PF12128.3 1201 7.5e-07 21.1 13.5 1 2 2.7e-09 7.5e-07 21.1 13.5 705 862 26 177 9 197 0.83 # 3864 # 5312 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.238 3_10 - 483 DUF3584 PF12128.3 1201 7.5e-07 21.1 13.5 2 2 0.03 8.2 -2.2 0.8 391 427 309 350 292 395 0.41 # 3864 # 5312 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.238 2_12 - 698 Viral_helicase1 PF01443.13 234 9.2e-05 16.4 0.3 1 2 0.013 1.9 2.3 0.0 2 13 33 44 32 89 0.74 # 11171 # 13264 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.229 2_12 - 698 Viral_helicase1 PF01443.13 234 9.2e-05 16.4 0.3 2 2 7.7e-05 0.011 9.6 0.0 158 233 513 622 481 623 0.78 # 11171 # 13264 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.229 1_28 - 621 Viral_helicase1 PF01443.13 234 0.001 13.0 0.0 1 1 1.7e-05 0.0024 11.8 0.0 3 28 263 286 261 305 0.78 # 20426 # 22288 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.296 1_61 - 443 TIP49 PF06068.8 398 8.3e-05 15.7 0.5 1 1 5.4e-07 0.00015 14.9 0.5 53 158 202 310 182 336 0.66 # 50324 # 51652 # 1 # ID=1_61;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.266 1_160 - 198 PduV-EutP PF10662.4 143 0.001 12.9 0.0 1 1 8.7e-06 0.0024 11.7 0.0 4 33 10 39 7 44 0.89 # 130489 # 131082 # 1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 1_35 - 422 DEAD PF00270.24 169 0.00074 13.4 0.0 1 1 1.7e-05 0.0024 11.7 0.0 4 56 221 270 218 274 0.75 # 29535 # 30800 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.278 1_52 - 649 DEAD PF00270.24 169 0.0021 11.9 0.0 1 1 3.7e-05 0.0051 10.6 0.0 14 61 162 208 149 256 0.83 # 42305 # 44251 # 1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 1_111 - 356 CmcI PF04989.7 206 0.0015 12.2 0.0 1 1 1.1e-05 0.003 11.2 0.0 124 159 42 78 27 91 0.87 # 90532 # 91599 # 1 # ID=1_111;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.263 1_52 - 649 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 9e-37 120.9 0.0 1 1 3.6e-38 3.3e-36 119.0 0.0 8 379 155 550 151 553 0.83 # 42305 # 44251 # 1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 1_28 - 621 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 2.1e-05 17.6 0.0 1 1 4.9e-07 4.5e-05 16.5 0.0 16 58 259 301 247 308 0.90 # 20426 # 22288 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.296 1_35 - 422 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 0.00027 13.9 0.0 1 1 5.5e-06 0.00051 13.0 0.0 15 50 231 266 226 269 0.88 # 29535 # 30800 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.278 1_160 - 198 Guanylate_kin PF00625.16 183 1.3e-06 22.3 3.3 1 1 9.7e-09 2.7e-06 21.3 3.3 4 181 9 197 6 197 0.70 # 130489 # 131082 # 1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 1_160 - 198 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.0019 12.6 0.0 1 1 1.4e-05 0.0038 11.6 0.0 24 47 10 33 4 44 0.86 # 130489 # 131082 # 1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 1_52 - 649 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 1.1e-63 209.7 0.6 1 1 6.4e-66 1.8e-63 209.0 0.0 7 446 126 558 121 575 0.86 # 42305 # 44251 # 1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 1_64 - 469 AAA_32 PF13654.1 509 0.00014 14.9 0.0 1 1 7.4e-07 0.00021 14.4 0.0 30 53 246 269 216 276 0.73 # 57772 # 59178 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.249 3_6 - 187 MethyltransfD12 PF02086.10 260 0.0016 12.3 1.6 1 2 0.024 6.7 0.4 0.2 85 141 39 92 17 119 0.57 # 1935 # 2495 # 1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.351 3_6 - 187 MethyltransfD12 PF02086.10 260 0.0016 12.3 1.6 2 2 1.3e-05 0.0035 11.1 0.1 11 64 128 179 123 185 0.81 # 1935 # 2495 # 1 # ID=3_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.351 1_28 - 621 ArgK PF03308.11 267 2.5e-06 20.8 0.0 1 1 1.8e-08 4.9e-06 19.8 0.0 31 66 260 293 250 301 0.90 # 20426 # 22288 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.296 1_35 - 422 GTP_EFTU PF00009.22 188 0.00025 14.9 0.0 1 1 2e-06 0.00055 13.8 0.0 4 30 232 258 230 274 0.86 # 29535 # 30800 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.278 1_160 - 198 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00031 15.3 0.1 1 1 4e-06 0.00055 14.5 0.1 1 57 10 68 10 100 0.74 # 130489 # 131082 # 1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 1_35 - 422 RNA_helicase PF00910.17 107 0.0015 13.1 0.0 1 1 2.5e-05 0.0035 11.9 0.0 1 25 234 258 234 282 0.86 # 29535 # 30800 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.278 1_35 - 422 UPF0079 PF02367.12 123 0.00069 13.6 0.0 1 1 5.3e-06 0.0015 12.5 0.0 16 43 232 259 218 264 0.78 # 29535 # 30800 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.278 2_8 - 761 TrkA_N PF02254.13 116 0.0015 12.9 0.0 1 1 1.6e-05 0.0044 11.4 0.0 1 31 371 402 371 425 0.88 # 6666 # 8948 # 1 # ID=2_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.276 1_55 - 263 S1 PF00575.18 74 8.7e-14 45.8 4.9 1 3 0.013 3.5 2.2 0.1 41 68 57 84 44 89 0.77 # 45443 # 46231 # 1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.299 1_55 - 263 S1 PF00575.18 74 8.7e-14 45.8 4.9 2 3 8.2e-08 2.3e-05 18.8 0.3 1 74 103 175 103 175 0.96 # 45443 # 46231 # 1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.299 1_55 - 263 S1 PF00575.18 74 8.7e-14 45.8 4.9 3 3 1e-09 2.8e-07 24.9 0.0 4 72 191 252 188 253 0.91 # 45443 # 46231 # 1 # ID=1_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.299 1_8 - 300 tRNA_anti-codon PF01336.20 75 7.4e-11 36.2 0.1 1 1 1.7e-12 1.6e-10 35.1 0.1 1 73 20 95 20 97 0.96 # 3463 # 4362 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.266 1_185 - 149 tRNA_anti-codon PF01336.20 75 0.00015 15.9 0.0 1 1 3.1e-06 0.00029 15.0 0.0 27 73 46 100 37 102 0.81 # 146256 # 146702 # 1 # ID=1_185;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.336 1_226 - 217 tRNA_anti-codon PF01336.20 75 0.00016 15.8 0.0 1 1 3.2e-06 0.0003 15.0 0.0 25 70 44 96 42 101 0.81 # 193756 # 194406 # -1 # ID=1_226;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.295 1_73 - 575 AAA_24 PF13479.1 213 9.9e-05 16.3 0.0 1 1 1.4e-06 0.00039 14.4 0.0 7 50 185 230 181 270 0.76 # 64171 # 65895 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.277 2_12 - 698 UvrD-helicase PF00580.16 315 6.9e-43 141.4 14.7 1 1 2.5e-45 6.9e-43 141.4 14.7 1 314 17 288 17 289 0.86 # 11171 # 13264 # 1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.229 1_35 - 422 NACHT PF05729.7 166 0.00015 15.8 0.0 1 1 4.4e-06 0.00041 14.4 0.0 3 63 234 303 232 317 0.70 # 29535 # 30800 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.278 1_60 - 273 NACHT PF05729.7 166 0.00045 14.2 0.0 1 1 7.9e-06 0.00073 13.6 0.0 3 26 121 144 119 192 0.88 # 49516 # 50334 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.254 1_73 - 575 NACHT PF05729.7 166 0.0029 11.6 0.2 1 1 0.00013 0.012 9.6 0.1 4 23 185 204 183 208 0.88 # 64171 # 65895 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.277 1_61 - 443 AAA_25 PF13481.1 194 8.1e-15 49.1 0.0 1 1 2e-16 1.4e-14 48.3 0.0 25 190 192 359 182 363 0.79 # 50324 # 51652 # 1 # ID=1_61;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.266 1_73 - 575 AAA_25 PF13481.1 194 2e-05 18.4 1.5 1 2 8.3e-06 0.00057 13.6 0.2 31 56 181 204 168 223 0.84 # 64171 # 65895 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.277 1_73 - 575 AAA_25 PF13481.1 194 2e-05 18.4 1.5 2 2 0.017 1.2 2.8 0.1 131 184 230 288 224 291 0.71 # 64171 # 65895 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.277 1_64 - 469 AAA_25 PF13481.1 194 0.00054 13.7 0.0 1 1 1.4e-05 0.00099 12.9 0.0 14 57 227 270 218 290 0.86 # 57772 # 59178 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.249 1_160 - 198 AAA_25 PF13481.1 194 0.0026 11.5 0.1 1 2 0.00041 0.028 8.1 0.0 35 50 9 24 4 27 0.89 # 130489 # 131082 # 1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 1_160 - 198 AAA_25 PF13481.1 194 0.0026 11.5 0.1 2 2 0.052 3.6 1.3 0.0 74 118 123 165 109 195 0.70 # 130489 # 131082 # 1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 1_160 - 198 AAA_28 PF13521.1 163 1.2e-05 19.6 0.0 1 1 1.9e-07 2.7e-05 18.5 0.0 2 48 10 56 9 68 0.85 # 130489 # 131082 # 1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 1_73 - 575 AAA_28 PF13521.1 163 0.0019 12.5 0.0 1 1 4.5e-05 0.0062 10.8 0.0 3 35 185 218 184 241 0.78 # 64171 # 65895 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.277 1_73 - 575 AAA_5 PF07728.9 139 6.5e-09 30.0 0.1 1 2 5.4e-09 3.7e-07 24.3 0.0 3 134 185 300 183 304 0.73 # 64171 # 65895 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.277 1_73 - 575 AAA_5 PF07728.9 139 6.5e-09 30.0 0.1 2 2 0.033 2.3 2.3 0.1 69 97 522 550 472 565 0.80 # 64171 # 65895 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.277 1_177 - 472 AAA_5 PF07728.9 139 2e-05 18.7 0.2 1 1 2.4e-06 0.00017 15.7 0.0 3 91 38 138 36 143 0.85 # 140077 # 141492 # 1 # ID=1_177;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.261 1_160 - 198 AAA_5 PF07728.9 139 0.00016 15.8 0.0 1 1 5e-06 0.00035 14.7 0.0 2 20 10 28 9 39 0.92 # 130489 # 131082 # 1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 1_60 - 273 AAA_5 PF07728.9 139 0.0026 11.8 0.0 1 1 8.4e-05 0.0059 10.7 0.0 3 33 122 155 120 249 0.79 # 49516 # 50334 # 1 # ID=1_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.254 1_160 - 198 APS_kinase PF01583.15 157 0.00034 14.6 0.0 1 1 2.6e-06 0.00073 13.6 0.0 3 25 8 30 6 40 0.88 # 130489 # 131082 # 1 # ID=1_160;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b2 (February 2015) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/baeeca51-8777-4347-a172-1e2245aef2d4 # Target file: checkm_output/bins/pGCA_001886775.1.assembled/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pGCA_001886775.1.assembled/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/baeeca51-8777-4347-a172-1e2245aef2d4 checkm_output/bins/pGCA_001886775.1.assembled/genes.faa # Current dir: /mnt/DGK_KLIF/data/klif/reads-for-assembly/trainingsets2/combined/rfplasmid_combined_jellynew2 # Date: Tue Jul 7 16:47:00 2020 # [ok]