# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 2_15 - 313 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.00058 11.8 0.0 1 1 1.4e-05 0.0012 10.7 0.0 11 54 132 175 126 199 0.78 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 2_7 - 229 Thymidylate_kin PF02223.12 186 2e-05 16.7 0.2 1 2 9.2e-06 0.00081 11.5 0.0 6 44 11 51 10 62 0.77 # 3016 # 3702 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 2_7 - 229 Thymidylate_kin PF02223.12 186 2e-05 16.7 0.2 2 2 0.0039 0.34 2.9 0.3 133 169 187 225 150 228 0.74 # 3016 # 3702 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 2_25 - 148 FeoB_N PF02421.13 156 0.00028 12.9 1.2 1 1 4.6e-06 0.0004 12.4 1.2 13 94 56 135 47 139 0.92 # 18694 # 19137 # 1 # ID=2_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.243 1_11 - 598 IstB_IS21 PF01695.12 178 4.2e-06 19.0 0.0 1 2 2.1e-06 9.4e-05 14.6 0.0 46 85 32 71 27 92 0.86 # 4943 # 6736 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.274 1_11 - 598 IstB_IS21 PF01695.12 178 4.2e-06 19.0 0.0 2 2 0.026 1.1 1.3 0.0 98 140 110 160 98 187 0.71 # 4943 # 6736 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.274 2_15 - 313 IstB_IS21 PF01695.12 178 1.2e-05 17.5 0.0 1 1 4.9e-07 2.2e-05 16.7 0.0 44 82 140 180 112 209 0.72 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 2_7 - 229 MipZ PF09140.6 261 3.5e-16 51.7 0.3 1 2 3.5e-15 1.5e-13 43.1 0.2 2 140 2 121 1 136 0.83 # 3016 # 3702 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 2_7 - 229 MipZ PF09140.6 261 3.5e-16 51.7 0.3 2 2 0.077 3.4 -0.7 0.0 127 169 131 173 123 205 0.74 # 3016 # 3702 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 2_2 - 240 MipZ PF09140.6 261 7.7e-05 14.6 0.0 1 1 2.4e-06 0.00011 14.1 0.0 5 46 7 48 3 85 0.90 # 269 # 988 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 2_7 - 229 YhjQ PF06564.7 244 6.8e-05 15.0 0.0 1 1 2.7e-06 0.00012 14.2 0.0 10 42 9 41 1 54 0.89 # 3016 # 3702 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 2_2 - 240 YhjQ PF06564.7 244 0.00087 11.4 0.0 1 1 3.7e-05 0.0016 10.5 0.0 7 45 9 46 3 55 0.87 # 269 # 988 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 1_40 - 640 AIG1 PF04548.11 212 0.00023 13.0 0.0 1 1 6.6e-06 0.00058 11.7 0.0 32 62 51 81 43 108 0.84 # 30553 # 32472 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.403 1_20 - 141 SSB PF00436.20 104 3.7e-28 90.2 0.1 1 1 1.1e-29 4.7e-28 89.9 0.1 1 102 1 102 1 104 0.98 # 13925 # 14347 # 1 # ID=1_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.331 2_29 - 121 SSB PF00436.20 104 1.5e-21 69.0 0.0 1 1 4.2e-23 1.8e-21 68.7 0.0 1 103 2 98 2 99 0.96 # 21017 # 21379 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.309 2_23 - 232 DNA_pack_N PF02500.10 284 2.2e-05 16.8 0.1 1 1 5e-07 4.4e-05 15.8 0.1 201 262 41 103 39 110 0.74 # 16831 # 17526 # 1 # ID=2_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 2_18 - 822 DUF87 PF01935.12 229 2.4e-06 20.2 4.4 1 1 4.3e-07 7.5e-06 18.6 0.0 10 59 441 490 436 492 0.75 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 2_15 - 313 DUF87 PF01935.12 229 6.1e-06 18.9 0.0 1 1 6.6e-07 1.2e-05 18.0 0.0 25 58 145 179 126 216 0.90 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 1_28 - 338 DUF87 PF01935.12 229 8.3e-05 15.2 0.0 1 1 8.8e-06 0.00016 14.3 0.0 27 48 164 185 142 193 0.84 # 19485 # 20498 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 1_16 - 923 DUF87 PF01935.12 229 0.00011 14.8 3.0 1 2 0.00036 0.0064 9.0 0.0 26 49 548 571 539 584 0.84 # 8644 # 11412 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.296 1_16 - 923 DUF87 PF01935.12 229 0.00011 14.8 3.0 2 2 0.029 0.5 2.8 0.2 101 165 639 700 631 732 0.75 # 8644 # 11412 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.296 2_7 - 229 DUF87 PF01935.12 229 0.00018 14.1 1.4 1 2 0.00034 0.0061 9.1 0.0 33 60 11 37 9 39 0.94 # 3016 # 3702 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 2_7 - 229 DUF87 PF01935.12 229 0.00018 14.1 1.4 2 2 0.012 0.21 4.0 0.4 54 146 81 182 63 225 0.66 # 3016 # 3702 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 1_28 - 338 Septin PF00735.13 281 6.6e-05 14.7 0.0 1 1 2.4e-06 0.00011 14.0 0.0 6 29 162 185 158 209 0.80 # 19485 # 20498 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 1_40 - 640 Septin PF00735.13 281 0.00024 12.9 0.1 1 1 9.7e-06 0.00043 12.0 0.1 7 77 6 82 3 91 0.68 # 30553 # 32472 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.403 2_18 - 822 AAA_22 PF13401.1 131 4.1e-10 32.6 0.2 1 2 0.047 2.1 1.3 0.0 86 112 130 162 84 176 0.74 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 2_18 - 822 AAA_22 PF13401.1 131 4.1e-10 32.6 0.2 2 2 2e-08 9e-07 21.8 0.0 5 88 455 569 451 690 0.75 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 1_28 - 338 AAA_22 PF13401.1 131 1.5e-05 17.9 0.0 1 1 7.8e-07 3.4e-05 16.7 0.0 4 42 160 209 156 260 0.71 # 19485 # 20498 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 1_28 - 338 ATP_bind_1 PF03029.12 238 0.00021 13.6 0.0 1 1 1.1e-05 0.00033 12.9 0.0 1 23 165 187 165 193 0.87 # 19485 # 20498 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 2_15 - 313 ATP_bind_1 PF03029.12 238 0.00032 13.0 0.2 1 1 3e-05 0.00087 11.6 0.0 1 24 148 171 148 189 0.82 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 2_18 - 822 ATP_bind_1 PF03029.12 238 0.00063 12.0 0.1 1 2 0.006 0.18 4.0 0.1 193 237 149 205 105 206 0.69 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 2_18 - 822 ATP_bind_1 PF03029.12 238 0.00063 12.0 0.1 2 2 0.0021 0.06 5.5 0.0 1 20 459 478 459 490 0.79 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 2_7 - 229 SRP54 PF00448.17 196 3.4e-08 25.8 0.1 1 1 1e-09 9.2e-08 24.4 0.0 11 99 11 95 2 141 0.84 # 3016 # 3702 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 1_28 - 338 AAA_17 PF13207.1 121 7.9e-06 19.5 0.1 1 1 1.2e-06 2e-05 18.1 0.1 2 49 163 207 162 303 0.82 # 19485 # 20498 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 2_2 - 240 AAA_17 PF13207.1 121 9.7e-05 15.9 0.2 1 1 1.1e-05 0.0002 14.9 0.2 5 78 9 113 6 215 0.69 # 269 # 988 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 2_15 - 313 AAA_17 PF13207.1 121 0.00011 15.7 1.4 1 1 2.3e-05 0.0004 14.0 1.4 2 19 146 163 145 230 0.89 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 2_7 - 229 AAA_17 PF13207.1 121 0.00013 15.5 0.4 1 1 3.9e-05 0.00068 13.2 0.4 9 32 11 39 10 222 0.81 # 3016 # 3702 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 2_18 - 822 AAA_17 PF13207.1 121 0.00044 13.8 2.1 1 1 0.00014 0.0024 11.4 0.0 3 19 458 474 457 561 0.87 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 1_2 - 94 AAA_21 PF13304.1 303 0.0022 10.6 11.7 1 1 3e-05 0.0026 10.4 11.7 80 162 6 88 2 92 0.93 # 331 # 612 # 1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.195 1_40 - 640 Miro PF08477.8 119 1.5e-05 18.2 0.0 1 1 4.4e-07 3.8e-05 16.9 0.0 9 119 13 131 5 131 0.75 # 30553 # 32472 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.403 1_28 - 338 MobB PF03205.9 140 3.7e-05 16.2 0.4 1 1 4.6e-06 0.0002 13.8 0.0 3 27 163 187 161 199 0.81 # 19485 # 20498 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 2_18 - 822 MobB PF03205.9 140 0.00095 11.6 0.1 1 1 0.00025 0.011 8.2 0.0 4 38 458 490 456 498 0.76 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 1_49 - 1933 Helicase_C PF00271.26 78 2.4e-07 23.4 0.3 1 2 0.055 4.9 -0.1 0.0 14 40 1079 1105 1065 1107 0.84 # 36598 # 42396 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.295 1_49 - 1933 Helicase_C PF00271.26 78 2.4e-07 23.4 0.3 2 2 4.2e-08 3.7e-06 19.5 0.0 12 78 1516 1584 1509 1584 0.86 # 36598 # 42396 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.295 2_7 - 229 ArsA_ATPase PF02374.10 305 3.9e-10 31.9 0.6 1 1 1.8e-11 7.9e-10 30.9 0.6 6 109 6 110 1 217 0.86 # 3016 # 3702 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 2_2 - 240 ArsA_ATPase PF02374.10 305 4.3e-06 18.6 0.1 1 1 2.2e-07 9.6e-06 17.5 0.0 4 40 6 42 3 59 0.92 # 269 # 988 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 2_15 - 313 PhoH PF02562.11 205 0.00013 13.9 0.3 1 1 3e-06 0.00027 12.9 0.1 6 56 129 180 126 202 0.75 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 2_15 - 313 T2SE PF00437.15 272 4.2e-82 267.8 0.7 1 1 1.8e-83 5.2e-82 267.4 0.7 8 270 24 286 19 288 0.98 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 1_28 - 338 T2SE PF00437.15 272 1.1e-63 207.3 0.0 1 1 4.5e-65 1.3e-63 207.1 0.0 6 269 14 312 9 315 0.95 # 19485 # 20498 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 2_18 - 822 T2SE PF00437.15 272 2.4e-05 16.1 0.0 1 1 1.5e-06 4.5e-05 15.1 0.0 121 155 447 481 423 490 0.80 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 2_15 - 313 Zeta_toxin PF06414.7 201 4.8e-05 15.2 0.0 1 1 3.1e-06 9e-05 14.3 0.0 15 48 142 179 130 215 0.82 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 1_28 - 338 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00011 14.0 0.0 1 1 6.5e-06 0.00019 13.3 0.0 17 49 161 194 147 218 0.85 # 19485 # 20498 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 2_7 - 229 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00014 13.7 0.2 1 2 2.8e-05 0.00083 11.2 0.0 25 55 10 42 8 103 0.72 # 3016 # 3702 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 2_7 - 229 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00014 13.7 0.2 2 2 0.086 2.5 -0.2 0.0 154 188 144 178 138 191 0.80 # 3016 # 3702 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 2_18 - 822 SMC_N PF02463.14 220 0.00066 11.6 3.4 1 2 0.034 3 -0.3 0.1 70 125 53 108 42 118 0.67 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 2_18 - 822 SMC_N PF02463.14 220 0.00066 11.6 3.4 2 2 1e-05 0.00091 11.2 0.0 25 55 455 483 447 491 0.84 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 2_7 - 229 VirC1 PF07015.6 231 6.1e-13 41.0 0.1 1 1 1.2e-14 1.1e-12 40.2 0.1 4 150 3 145 1 205 0.76 # 3016 # 3702 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 2_7 - 229 Fer4_NifH PF00142.13 273 1.7e-07 23.3 0.1 1 1 1.3e-08 5.9e-07 21.6 0.0 7 54 8 53 2 92 0.74 # 3016 # 3702 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 2_2 - 240 Fer4_NifH PF00142.13 273 1.5e-05 17.0 0.0 1 1 5.7e-07 2.5e-05 16.2 0.0 4 74 7 75 4 92 0.77 # 269 # 988 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 2_18 - 822 Arch_ATPase PF01637.13 234 5e-05 15.8 3.6 1 2 8.2e-07 7.2e-05 15.3 0.0 23 59 457 493 455 502 0.90 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 2_18 - 822 Arch_ATPase PF01637.13 234 5e-05 15.8 3.6 2 2 0.057 5 -0.6 0.1 84 146 610 670 548 692 0.58 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 1_28 - 338 AAA_16 PF13191.1 185 4.6e-05 16.2 0.0 1 1 3.6e-06 6.3e-05 15.7 0.0 24 81 160 234 147 306 0.76 # 19485 # 20498 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 2_2 - 240 AAA_16 PF13191.1 185 0.00013 14.7 0.0 1 1 9.9e-06 0.00018 14.3 0.0 27 119 6 102 5 147 0.78 # 269 # 988 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 2_15 - 313 AAA_16 PF13191.1 185 0.00017 14.3 0.1 1 1 2.3e-05 0.0004 13.1 0.1 22 50 141 169 133 280 0.86 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 2_18 - 822 AAA_16 PF13191.1 185 0.0003 13.5 0.2 1 1 8.9e-05 0.0016 11.2 0.0 26 50 456 480 446 504 0.84 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 2_7 - 229 AAA_16 PF13191.1 185 0.00032 13.4 0.0 1 1 2.9e-05 0.00051 12.8 0.0 34 77 11 61 9 180 0.70 # 3016 # 3702 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 2_18 - 822 AAA_23 PF13476.1 202 2.6e-06 20.6 1.5 1 2 0.0037 0.11 5.5 0.8 102 200 90 168 14 201 0.50 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 2_18 - 822 AAA_23 PF13476.1 202 2.6e-06 20.6 1.5 2 2 8.9e-08 2.6e-06 20.6 1.5 20 44 455 479 443 626 0.75 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 1_28 - 338 AAA_23 PF13476.1 202 0.0016 11.5 5.1 1 1 2.9e-05 0.00085 12.4 2.1 22 37 163 178 141 185 0.89 # 19485 # 20498 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 2_15 - 313 AAA_23 PF13476.1 202 0.0025 10.9 5.3 1 1 7.9e-05 0.0023 11.0 2.9 18 39 142 163 125 306 0.91 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 2_7 - 229 AAA_18 PF13238.1 129 1.7e-06 21.1 1.0 1 1 6.2e-07 1.4e-05 18.2 0.0 8 81 11 110 9 129 0.65 # 3016 # 3702 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 1_28 - 338 AAA_18 PF13238.1 129 0.00012 15.2 0.1 1 1 2e-05 0.00045 13.3 0.0 1 18 163 180 163 227 0.76 # 19485 # 20498 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 2_18 - 822 AAA_18 PF13238.1 129 0.00059 12.9 2.0 1 2 0.048 1 2.4 0.6 11 69 95 183 95 203 0.59 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 2_18 - 822 AAA_18 PF13238.1 129 0.00059 12.9 2.0 2 2 0.00075 0.016 8.2 0.0 2 17 458 473 458 510 0.88 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 2_15 - 313 AAA_18 PF13238.1 129 0.0024 10.9 7.3 1 2 0.00048 0.01 8.9 1.5 1 17 146 162 146 170 0.91 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 2_15 - 313 AAA_18 PF13238.1 129 0.0024 10.9 7.3 2 2 0.0088 0.19 4.8 0.1 72 113 173 210 161 225 0.81 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 2_7 - 229 CbiA PF01656.18 195 2e-25 82.0 0.7 1 1 1.7e-26 3.7e-25 81.2 0.7 1 176 3 161 3 193 0.74 # 3016 # 3702 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 2_2 - 240 CbiA PF01656.18 195 5.2e-11 35.0 0.2 1 1 2.9e-12 6.3e-11 34.7 0.2 3 48 7 50 5 185 0.75 # 269 # 988 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 1_47 - 187 CbiA PF01656.18 195 3.2e-08 25.9 0.1 1 2 2.6e-06 5.7e-05 15.3 0.0 1 24 3 26 3 32 0.92 # 35722 # 36282 # 1 # ID=1_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.253 1_47 - 187 CbiA PF01656.18 195 3.2e-08 25.9 0.1 2 2 0.00021 0.0045 9.1 0.0 95 178 54 131 29 151 0.68 # 35722 # 36282 # 1 # ID=1_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.253 2_18 - 822 CbiA PF01656.18 195 0.00034 12.8 0.0 1 1 4.2e-05 0.00092 11.3 0.0 8 49 463 515 457 593 0.67 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 2_15 - 313 KaiC PF06745.8 227 2.1e-05 16.4 0.0 1 1 9.4e-07 4.1e-05 15.5 0.0 12 46 136 169 114 203 0.80 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 1_11 - 598 KaiC PF06745.8 227 3.5e-05 15.7 0.0 1 1 3.8e-06 0.00017 13.5 0.0 16 71 30 84 23 214 0.85 # 4943 # 6736 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.274 1_28 - 338 AAA_14 PF13173.1 128 1.6e-05 17.6 0.1 1 2 0.057 2.5 0.8 0.0 70 102 35 66 11 74 0.85 # 19485 # 20498 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 1_28 - 338 AAA_14 PF13173.1 128 1.6e-05 17.6 0.1 2 2 4.6e-06 0.0002 14.0 0.0 2 54 160 211 159 254 0.75 # 19485 # 20498 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 2_18 - 822 AAA_14 PF13173.1 128 0.0024 10.5 0.0 1 3 5.5e-05 0.0024 10.5 0.0 5 39 457 491 455 503 0.79 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 2_18 - 822 AAA_14 PF13173.1 128 0.0024 10.5 0.0 2 3 0.016 0.72 2.5 0.0 48 108 630 699 598 710 0.58 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 2_18 - 822 AAA_14 PF13173.1 128 0.0024 10.5 0.0 3 3 0.097 4.3 0.0 0.1 14 42 769 808 767 820 0.57 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 1_28 - 338 GvpD PF07088.6 484 0.00044 11.3 0.0 1 1 6.5e-06 0.00058 10.9 0.0 8 42 158 192 150 258 0.83 # 19485 # 20498 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 1_40 - 640 TIGR03594 TIGR03594 432 5e-08 24.7 0.3 1 3 0.044 3.9 -1.3 0.0 176 211 4 42 2 50 0.74 # 30553 # 32472 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.403 1_40 - 640 TIGR03594 TIGR03594 432 5e-08 24.7 0.3 2 3 2e-08 1.8e-06 19.6 0.1 31 123 51 135 47 154 0.87 # 30553 # 32472 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.403 1_40 - 640 TIGR03594 TIGR03594 432 5e-08 24.7 0.3 3 3 0.006 0.53 1.5 0.0 304 347 196 239 187 265 0.79 # 30553 # 32472 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.403 2_18 - 822 AAA_29 PF13555.1 62 1.1e-06 20.9 0.0 1 1 9.9e-08 2.9e-06 19.5 0.0 22 41 454 472 444 484 0.81 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 2_15 - 313 AAA_29 PF13555.1 62 2.9e-05 16.3 1.3 1 1 1.1e-06 3.4e-05 16.1 0.1 22 44 142 164 131 174 0.85 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 1_28 - 338 AAA_29 PF13555.1 62 3.6e-05 16.0 0.0 1 1 2.8e-06 8.3e-05 14.9 0.0 22 40 159 177 140 184 0.81 # 19485 # 20498 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 2_18 - 822 AAA PF00004.24 132 3.6e-05 16.7 0.4 1 3 0.0056 0.25 4.3 0.0 31 74 287 331 258 344 0.84 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 2_18 - 822 AAA PF00004.24 132 3.6e-05 16.7 0.4 2 3 0.0038 0.17 4.9 0.0 2 21 458 477 457 500 0.80 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 2_18 - 822 AAA PF00004.24 132 3.6e-05 16.7 0.4 3 3 0.021 0.94 2.4 0.0 49 113 635 691 630 708 0.77 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 1_11 - 598 AAA PF00004.24 132 9.4e-05 15.4 0.2 1 2 5e-05 0.0022 10.9 0.0 2 105 37 166 36 177 0.66 # 4943 # 6736 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.274 1_11 - 598 AAA PF00004.24 132 9.4e-05 15.4 0.2 2 2 0.05 2.2 1.2 0.0 47 74 411 434 377 459 0.70 # 4943 # 6736 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.274 1_28 - 338 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00013 14.2 0.0 1 1 6.5e-06 0.00028 13.1 0.0 14 43 152 181 143 198 0.84 # 19485 # 20498 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 2_15 - 313 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00022 13.4 0.0 1 1 9.9e-06 0.00044 12.5 0.0 14 45 135 166 124 198 0.73 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 1_40 - 640 MMR_HSR1 PF01926.18 116 3.8e-08 26.1 0.1 1 1 1.7e-09 7.6e-08 25.1 0.1 4 116 8 129 5 129 0.68 # 30553 # 32472 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.403 2_15 - 313 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.00097 11.8 2.1 1 1 0.00012 0.0055 9.4 2.1 2 26 146 169 145 311 0.74 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 1_30 - 604 TraG-D_C PF12696.2 128 4.2e-28 90.5 0.0 1 1 5.6e-29 1.6e-27 88.6 0.0 2 127 406 528 405 529 0.89 # 21058 # 22869 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.308 2_32 - 517 TraG-D_C PF12696.2 128 2.8e-23 75.0 0.2 1 1 1.9e-24 5.6e-23 74.0 0.2 2 87 432 515 431 517 0.95 # 23721 # 25271 # 1 # ID=2_32;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 2_1 - 86 TraG-D_C PF12696.2 128 0.00034 13.2 0.0 1 1 1.8e-05 0.00052 12.6 0.0 107 127 10 30 3 31 0.84 # 1 # 258 # 1 # ID=2_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.364 2_7 - 229 AAA_31 PF13614.1 157 9.8e-13 41.0 0.1 1 1 6e-13 2.6e-11 36.4 0.0 2 124 2 120 1 120 0.88 # 3016 # 3702 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 2_2 - 240 AAA_31 PF13614.1 157 3.5e-06 19.7 0.1 1 2 8.8e-07 3.9e-05 16.4 0.0 1 79 3 75 3 110 0.77 # 269 # 988 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 2_2 - 240 AAA_31 PF13614.1 157 3.5e-06 19.7 0.1 2 2 0.039 1.7 1.3 0.1 25 63 175 214 173 226 0.76 # 269 # 988 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 1_28 - 338 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00059 12.3 0.1 1 1 1.4e-05 0.0012 11.3 0.1 1 23 162 184 162 192 0.88 # 19485 # 20498 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 2_15 - 313 AAA_33 PF13671.1 143 0.00068 12.3 1.1 1 1 2.1e-05 0.0019 10.8 1.1 2 20 146 164 146 280 0.81 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 1_11 - 598 DnaB_C PF03796.10 259 4.6e-06 18.4 0.0 1 2 2.1e-07 1.9e-05 16.3 0.0 13 117 27 136 23 156 0.79 # 4943 # 6736 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.274 1_11 - 598 DnaB_C PF03796.10 259 4.6e-06 18.4 0.0 2 2 0.011 0.99 0.9 0.0 129 185 119 177 101 179 0.77 # 4943 # 6736 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.274 1_49 - 1933 Methyltransf_26 PF13659.1 117 4.9e-13 41.9 0.0 1 1 1.7e-14 1.5e-12 40.3 0.0 3 116 312 422 310 423 0.84 # 36598 # 42396 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.295 2_15 - 313 AAA_30 PF13604.1 196 8.7e-06 18.1 0.0 1 1 4.1e-07 1.8e-05 17.1 0.0 2 51 128 178 127 209 0.81 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 1_28 - 338 AAA_30 PF13604.1 196 0.0012 11.1 0.0 1 1 4.3e-05 0.0019 10.5 0.0 12 44 155 186 146 193 0.72 # 19485 # 20498 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 2_15 - 313 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 2.6e-09 29.5 0.0 1 1 2.3e-10 5.1e-09 28.6 0.0 34 93 139 197 124 218 0.79 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 1_28 - 338 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 9.9e-08 24.4 0.0 1 1 7.6e-09 1.7e-07 23.6 0.0 36 59 154 181 134 187 0.77 # 19485 # 20498 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 2_18 - 822 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 2e-06 20.1 0.0 1 1 2.4e-07 5.3e-06 18.7 0.0 33 64 447 480 428 498 0.77 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 1_16 - 923 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 8.8e-05 14.7 0.0 1 1 8.7e-06 0.00019 13.7 0.0 39 63 539 570 514 576 0.74 # 8644 # 11412 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.296 1_49 - 1933 MTS PF05175.9 170 4.3e-05 15.6 0.0 1 1 1.4e-06 0.00012 14.2 0.0 32 142 310 423 302 443 0.75 # 36598 # 42396 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.295 1_28 - 338 ABC_tran PF00005.22 137 3.7e-07 23.3 0.0 1 1 2.5e-08 7.4e-07 22.3 0.0 5 50 154 200 152 226 0.84 # 19485 # 20498 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 2_18 - 822 ABC_tran PF00005.22 137 3.8e-06 20.0 0.2 1 1 8.4e-07 2.5e-05 17.3 0.0 4 37 447 480 445 597 0.81 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 2_15 - 313 ABC_tran PF00005.22 137 0.0002 14.4 0.6 1 1 1.5e-05 0.00044 13.3 0.4 8 37 140 169 136 233 0.82 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 1_49 - 1933 Eco57I PF07669.6 106 5.9e-08 25.8 0.3 1 1 6.8e-10 5.9e-08 25.8 0.3 3 104 372 473 370 475 0.84 # 36598 # 42396 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.295 2_15 - 313 AAA_19 PF13245.1 76 1.6e-05 17.3 0.0 1 1 8.4e-07 3.7e-05 16.2 0.0 2 48 135 179 134 197 0.79 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 2_7 - 229 AAA_19 PF13245.1 76 5e-05 15.8 0.0 1 1 2.7e-06 0.00012 14.6 0.0 20 48 11 35 3 48 0.89 # 3016 # 3702 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 1_16 - 923 AAA_10 PF12846.2 304 5.2e-39 127.1 1.1 1 1 1.5e-39 1.7e-38 125.4 0.3 2 297 546 839 545 845 0.83 # 8644 # 11412 # 1 # ID=1_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.296 2_18 - 822 AAA_10 PF12846.2 304 8.5e-36 116.6 0.2 1 2 0.014 0.15 4.1 0.1 84 185 117 279 78 286 0.56 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 2_18 - 822 AAA_10 PF12846.2 304 8.5e-36 116.6 0.2 2 2 7.3e-35 8.1e-34 110.1 0.0 2 290 455 716 454 725 0.87 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 2_32 - 517 AAA_10 PF12846.2 304 3.3e-08 26.0 0.0 1 1 6e-09 6.6e-08 25.0 0.0 3 298 152 505 150 511 0.69 # 23721 # 25271 # 1 # ID=2_32;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 1_28 - 338 AAA_10 PF12846.2 304 4.3e-06 19.0 0.0 1 1 4.9e-07 5.4e-06 18.7 0.0 2 37 161 196 160 333 0.74 # 19485 # 20498 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 2_15 - 313 AAA_10 PF12846.2 304 6.5e-06 18.4 0.0 1 1 8.9e-07 9.8e-06 17.8 0.0 2 37 144 182 143 292 0.82 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 2_2 - 240 AAA_10 PF12846.2 304 3.3e-05 16.1 0.2 1 1 5.4e-06 6e-05 15.3 0.2 3 64 5 67 4 221 0.78 # 269 # 988 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 2_7 - 229 AAA_10 PF12846.2 304 0.00011 14.4 0.1 1 1 1.6e-05 0.00018 13.7 0.1 11 115 11 128 9 226 0.60 # 3016 # 3702 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 1_30 - 604 AAA_10 PF12846.2 304 0.00017 13.7 0.0 1 1 2.7e-05 0.0003 13.0 0.0 32 302 154 490 127 491 0.75 # 21058 # 22869 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.308 1_49 - 1933 ResIII PF04851.10 184 4.6e-10 32.3 9.7 1 1 1.6e-11 4.6e-10 32.3 9.7 2 161 1000 1196 999 1243 0.57 # 36598 # 42396 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.295 2_15 - 313 ResIII PF04851.10 184 8.8e-06 18.4 0.1 1 1 6.2e-07 1.8e-05 17.3 0.1 5 63 129 186 123 207 0.85 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 1_28 - 338 ResIII PF04851.10 184 6.2e-05 15.6 0.0 1 1 4.3e-06 0.00013 14.6 0.0 3 64 145 201 143 237 0.72 # 19485 # 20498 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 2_18 - 822 Zot PF05707.7 193 8.9e-06 18.0 0.2 1 2 0.035 3.1 -0.1 0.0 80 127 273 325 244 354 0.68 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 2_18 - 822 Zot PF05707.7 193 8.9e-06 18.0 0.2 2 2 2.1e-06 0.00019 13.7 0.0 81 127 648 690 629 694 0.83 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 1_40 - 640 GTP_EFTU_D2 PF03144.20 74 2.4e-09 30.0 0.0 1 1 5.6e-11 5e-09 29.0 0.0 3 60 265 316 263 323 0.90 # 30553 # 32472 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.403 2_7 - 229 DUF2075 PF09848.4 352 0.00051 11.7 0.2 1 2 2e-05 0.0018 10.0 0.0 5 90 5 86 2 130 0.79 # 3016 # 3702 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 2_7 - 229 DUF2075 PF09848.4 352 0.00051 11.7 0.2 2 2 0.03 2.6 -0.5 0.1 200 225 152 177 150 210 0.75 # 3016 # 3702 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 2_2 - 240 Epimerase PF01370.16 236 0.00011 14.4 0.0 1 1 2.5e-06 0.00022 13.4 0.0 7 123 16 122 14 147 0.80 # 269 # 988 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 1_49 - 1933 DEAD PF00270.24 169 1.9e-08 26.7 0.7 1 1 9.2e-08 2.7e-06 19.7 0.1 2 107 1004 1110 1003 1245 0.78 # 36598 # 42396 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.295 2_15 - 313 DEAD PF00270.24 169 1.9e-07 23.4 0.1 1 1 1.1e-08 3.3e-07 22.7 0.1 1 64 129 193 129 235 0.77 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 1_28 - 338 DEAD PF00270.24 169 4.9e-06 18.8 0.0 1 1 2.8e-07 8.3e-06 18.1 0.0 2 69 148 212 147 243 0.71 # 19485 # 20498 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 2_32 - 517 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 7.2e-22 70.2 0.0 1 1 5.7e-22 1.2e-20 66.1 0.0 11 323 146 508 138 516 0.73 # 23721 # 25271 # 1 # ID=2_32;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 1_30 - 604 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 9.7e-21 66.4 0.0 1 2 5e-06 0.00011 13.6 0.0 39 150 147 270 124 297 0.71 # 21058 # 22869 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.308 1_30 - 604 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 9.7e-21 66.4 0.0 2 2 2.4e-17 5.2e-16 50.9 0.0 185 380 345 542 306 544 0.84 # 21058 # 22869 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.308 2_15 - 313 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 4.2e-07 21.5 0.2 1 1 4.4e-08 9.6e-07 20.4 0.1 8 52 136 182 131 200 0.82 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 1_28 - 338 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 0.00017 13.0 0.0 1 1 1.2e-05 0.00027 12.3 0.0 16 42 161 187 154 217 0.85 # 19485 # 20498 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 2_6 - 132 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.00023 13.9 0.2 1 1 3.9e-06 0.00034 13.4 0.2 74 119 60 104 45 111 0.86 # 2529 # 2924 # 1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.247 1_30 - 604 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 2.4e-108 355.3 0.1 1 1 1.1e-109 3.4e-108 354.9 0.1 3 460 94 563 82 571 0.88 # 21058 # 22869 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.308 2_32 - 517 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 5.5e-81 265.1 0.1 1 1 2.7e-82 7.8e-81 264.6 0.1 10 392 110 516 101 517 0.81 # 23721 # 25271 # 1 # ID=2_32;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 2_1 - 86 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 1.8e-15 49.1 0.0 1 1 6.4e-17 1.9e-15 49.0 0.0 401 459 6 76 1 83 0.91 # 1 # 258 # 1 # ID=2_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.364 2_7 - 229 NAD_binding_5 PF07994.7 295 0.00054 12.2 0.1 1 1 7.9e-06 0.0007 11.8 0.1 124 184 148 206 91 215 0.74 # 3016 # 3702 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 2_15 - 313 Pox_A32 PF04665.7 241 0.0017 10.4 2.5 1 2 2.1e-05 0.0019 10.2 0.2 15 37 145 167 135 179 0.83 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 2_15 - 313 Pox_A32 PF04665.7 241 0.0017 10.4 2.5 2 2 0.028 2.4 0.0 0.0 185 220 167 204 160 212 0.73 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 1_40 - 640 GTP_EFTU PF00009.22 188 1.9e-59 193.0 0.4 1 1 6.4e-61 2.8e-59 192.4 0.4 2 185 2 237 1 240 0.92 # 30553 # 32472 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.403 2_15 - 313 GTP_EFTU PF00009.22 188 0.0011 11.1 1.8 1 2 9.2e-05 0.0041 9.3 0.1 4 33 144 173 141 202 0.83 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 2_15 - 313 GTP_EFTU PF00009.22 188 0.0011 11.1 1.8 2 2 0.031 1.4 1.0 0.2 107 135 262 290 244 311 0.71 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 1_28 - 338 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00022 14.1 0.0 1 1 1.2e-05 0.00053 12.9 0.0 1 23 163 185 163 224 0.79 # 19485 # 20498 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 2_15 - 313 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00039 13.4 0.1 1 1 4.7e-05 0.0021 11.0 0.1 1 25 146 170 146 200 0.80 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 1_28 - 338 UPF0079 PF02367.12 123 2.8e-05 16.5 0.0 1 1 1.2e-06 5.3e-05 15.6 0.0 8 42 153 187 147 205 0.85 # 19485 # 20498 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 2_15 - 313 UPF0079 PF02367.12 123 0.0003 13.2 0.2 1 1 3.4e-05 0.0015 10.9 0.0 12 41 140 169 131 186 0.80 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 1_40 - 640 EFG_IV PF03764.13 120 1.1e-25 82.3 0.0 1 1 3.5e-27 3.1e-25 80.8 0.0 1 120 416 532 416 532 0.98 # 30553 # 32472 # 1 # ID=1_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.403 2_7 - 229 AAA_24 PF13479.1 213 9.9e-05 14.7 0.4 1 1 4.5e-06 0.0002 13.7 0.1 11 79 9 90 3 104 0.74 # 3016 # 3702 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 1_28 - 338 AAA_24 PF13479.1 213 0.0002 13.7 0.0 1 1 1e-05 0.00044 12.6 0.0 5 33 162 188 159 217 0.84 # 19485 # 20498 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 1_28 - 338 NACHT PF05729.7 166 3.1e-05 16.4 0.0 1 1 1.8e-06 5.3e-05 15.6 0.0 3 22 163 182 161 188 0.89 # 19485 # 20498 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 2_15 - 313 NACHT PF05729.7 166 5.2e-05 15.7 0.0 1 1 4.2e-06 0.00012 14.4 0.0 3 47 146 187 144 203 0.82 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 2_18 - 822 NACHT PF05729.7 166 0.00056 12.3 0.0 1 1 7.8e-05 0.0023 10.3 0.0 4 28 458 482 456 489 0.83 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 1_11 - 598 AAA_25 PF13481.1 194 1.1e-21 69.9 0.0 1 1 1.1e-22 2e-21 69.0 0.0 30 193 30 175 20 176 0.90 # 4943 # 6736 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.274 2_18 - 822 AAA_25 PF13481.1 194 7.1e-05 15.0 0.0 1 1 1.2e-05 0.00021 13.4 0.0 33 57 455 478 432 539 0.85 # 11404 # 13869 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 2_7 - 229 AAA_25 PF13481.1 194 0.00017 13.7 0.1 1 1 2.6e-05 0.00046 12.3 0.0 42 66 10 36 5 87 0.86 # 3016 # 3702 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 1_28 - 338 AAA_25 PF13481.1 194 0.00024 13.3 0.0 1 1 2.1e-05 0.00037 12.7 0.0 29 56 157 183 130 200 0.76 # 19485 # 20498 # 1 # ID=1_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 2_15 - 313 AAA_25 PF13481.1 194 0.00058 12.0 0.0 1 1 7e-05 0.0012 10.9 0.0 19 54 129 164 110 216 0.80 # 9871 # 10809 # 1 # ID=2_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 1_49 - 1933 SNF2_N PF00176.18 299 7.1e-21 66.9 4.6 1 3 1.7e-22 1.5e-20 65.8 0.4 24 204 1015 1275 955 1336 0.76 # 36598 # 42396 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.295 1_49 - 1933 SNF2_N PF00176.18 299 7.1e-21 66.9 4.6 2 3 0.011 0.95 0.8 0.1 194 286 1462 1558 1444 1567 0.73 # 36598 # 42396 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.295 1_49 - 1933 SNF2_N PF00176.18 299 7.1e-21 66.9 4.6 3 3 0.063 5.5 -1.7 0.0 123 151 1873 1902 1837 1921 0.75 # 36598 # 42396 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.295 2_7 - 229 APS_kinase PF01583.15 157 0.00021 13.7 0.0 1 1 7e-06 0.00061 12.2 0.0 11 39 10 38 3 50 0.91 # 3016 # 3702 # 1 # ID=2_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b2 (February 2015) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/74a210d6-5054-4b1b-91a2-4aa1967fb0c3 # Target file: checkm_output/bins/pGCA_001865555.1.assembled/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pGCA_001865555.1.assembled/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/74a210d6-5054-4b1b-91a2-4aa1967fb0c3 checkm_output/bins/pGCA_001865555.1.assembled/genes.faa # Current dir: /mnt/DGK_KLIF/data/klif/reads-for-assembly/trainingsets2/combined/rfplasmid_combined_jellynew2 # Date: Tue Jul 7 16:46:49 2020 # [ok]