# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 5_5 - 509 UPF0020 PF01170.13 180 4.8e-06 21.0 0.0 1 1 5.6e-08 1.1e-05 19.9 0.0 28 116 191 277 176 287 0.79 # 3086 # 4612 # 1 # ID=5_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.410 1_4 - 541 UPF0020 PF01170.13 180 4.9e-06 21.0 0.0 1 1 5.2e-08 9.9e-06 20.0 0.0 25 118 228 319 217 328 0.86 # 2142 # 3764 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.437 6_11 - 720 ABC_ATPase PF09818.4 448 5.4e-05 16.7 0.4 1 2 0.0051 1.9 1.7 0.1 241 265 501 526 490 534 0.84 # 7886 # 10045 # 1 # ID=6_11;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.319 6_11 - 720 ABC_ATPase PF09818.4 448 5.4e-05 16.7 0.4 2 2 2.2e-06 0.00085 12.7 0.0 296 351 587 643 581 665 0.90 # 7886 # 10045 # 1 # ID=6_11;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.319 26_2 - 270 MipZ PF09140.6 261 5.6e-11 36.7 0.1 1 2 1.7e-07 9.4e-06 19.6 0.0 2 51 4 53 3 88 0.81 # 1125 # 1934 # 1 # ID=26_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 26_2 - 270 MipZ PF09140.6 261 5.6e-11 36.7 0.1 2 2 3.6e-06 0.00019 15.3 0.0 62 125 91 153 77 160 0.75 # 1125 # 1934 # 1 # ID=26_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 12_4 - 287 MipZ PF09140.6 261 4.2e-10 33.9 0.2 1 2 9.8e-09 5.3e-07 23.7 0.2 2 57 18 72 17 102 0.77 # 960 # 1820 # -1 # ID=12_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 12_4 - 287 MipZ PF09140.6 261 4.2e-10 33.9 0.2 2 2 0.00053 0.029 8.2 0.0 76 122 119 165 95 178 0.80 # 960 # 1820 # -1 # ID=12_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 37_3 - 263 MipZ PF09140.6 261 1.1e-07 26.0 0.0 1 1 1.7e-07 9e-06 19.7 0.0 7 118 10 142 4 152 0.56 # 773 # 1561 # -1 # ID=37_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.361 6_5 - 256 MipZ PF09140.6 261 1.9e-07 25.2 1.1 1 1 2.3e-07 1.3e-05 19.2 0.5 2 110 4 135 3 158 0.57 # 2673 # 3440 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.349 30_3 - 262 MipZ PF09140.6 261 1.5e-06 22.3 0.0 1 2 1.9e-05 0.001 13.0 0.0 7 46 10 48 5 70 0.81 # 647 # 1432 # -1 # ID=30_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.346 30_3 - 262 MipZ PF09140.6 261 1.5e-06 22.3 0.0 2 2 0.001 0.056 7.2 0.0 87 122 111 146 74 153 0.79 # 647 # 1432 # -1 # ID=30_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.346 8_11 - 262 MipZ PF09140.6 261 4.1e-06 20.8 1.2 1 1 8.3e-07 4.5e-05 17.4 0.1 2 131 3 149 2 155 0.59 # 8359 # 9144 # -1 # ID=8_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 7_2 - 275 MipZ PF09140.6 261 1.3e-05 19.1 0.7 1 2 1.5e-05 0.00081 13.3 0.2 2 42 5 46 4 65 0.85 # 957 # 1781 # -1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.375 7_2 - 275 MipZ PF09140.6 261 1.3e-05 19.1 0.7 2 2 0.0087 0.47 4.2 0.0 67 127 93 154 75 165 0.81 # 957 # 1781 # -1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.375 30_3 - 262 YhjQ PF06564.7 244 3.1e-10 34.5 0.0 1 1 9.3e-12 5e-10 33.9 0.0 10 154 12 159 5 172 0.82 # 647 # 1432 # -1 # ID=30_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.346 26_2 - 270 YhjQ PF06564.7 244 3.7e-10 34.3 0.0 1 1 9.1e-12 4.9e-10 33.9 0.0 7 151 8 160 1 178 0.84 # 1125 # 1934 # 1 # ID=26_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 8_11 - 262 YhjQ PF06564.7 244 2.1e-09 31.8 0.0 1 1 5e-11 2.7e-09 31.5 0.0 1 149 1 148 1 184 0.79 # 8359 # 9144 # -1 # ID=8_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 37_3 - 263 YhjQ PF06564.7 244 8.8e-09 29.8 0.0 1 1 3.1e-10 1.7e-08 28.9 0.0 9 154 11 159 4 172 0.80 # 773 # 1561 # -1 # ID=37_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.361 6_5 - 256 YhjQ PF06564.7 244 4e-08 27.7 0.0 1 1 9.8e-10 5.3e-08 27.3 0.0 3 153 4 158 2 211 0.77 # 2673 # 3440 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.349 12_4 - 287 YhjQ PF06564.7 244 6e-08 27.1 0.0 1 1 2.1e-09 1.1e-07 26.2 0.0 10 147 25 171 17 179 0.75 # 960 # 1820 # -1 # ID=12_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 7_2 - 275 YhjQ PF06564.7 244 9.8e-05 16.6 0.0 1 1 8.4e-06 0.00045 14.4 0.0 9 150 11 158 4 162 0.70 # 957 # 1781 # -1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.375 22_4 - 455 3HCDH_N PF02737.13 180 3e-06 21.7 0.0 1 1 5.4e-08 6.9e-06 20.6 0.0 1 31 154 184 154 226 0.90 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 24_4 - 253 3HCDH_N PF02737.13 180 0.0012 13.3 0.9 1 1 1.4e-05 0.0018 12.7 0.5 1 43 8 52 8 95 0.86 # 1046 # 1804 # -1 # ID=24_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.501 1_24 - 402 3HCDH_N PF02737.13 180 0.0022 12.5 0.0 1 1 2.5e-05 0.0032 11.9 0.0 1 52 149 201 149 238 0.76 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 22_4 - 455 GIDA PF01134.17 392 2.5e-06 21.3 0.0 1 2 0.00039 0.074 6.6 0.0 1 52 5 57 5 67 0.76 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 22_4 - 455 GIDA PF01134.17 392 2.5e-06 21.3 0.0 2 2 1.3e-05 0.0024 11.5 0.0 2 28 155 181 154 210 0.88 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 1_24 - 402 GIDA PF01134.17 392 0.00019 15.1 0.2 1 2 0.0043 0.82 3.2 0.0 92 150 59 115 17 127 0.79 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_24 - 402 GIDA PF01134.17 392 0.00019 15.1 0.2 2 2 6.5e-05 0.012 9.2 0.0 2 30 150 178 149 203 0.84 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 5_5 - 509 Methyltransf_18 PF12847.2 112 0.0026 13.2 0.0 1 1 1.8e-05 0.0067 11.8 0.0 3 106 192 320 191 331 0.73 # 3086 # 4612 # 1 # ID=5_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.410 22_4 - 455 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 2.5e-33 110.4 0.2 1 1 1.9e-35 3.5e-33 109.9 0.2 1 197 5 285 5 288 0.94 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 1_24 - 402 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 1.6e-29 98.0 0.1 1 1 1.5e-30 2.8e-28 93.9 0.1 1 200 11 285 11 286 0.91 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 29_2 - 161 Usp PF00582.21 140 1.1e-30 101.4 0.2 1 1 3.4e-33 1.3e-30 101.2 0.2 2 140 5 145 4 145 0.99 # 1002 # 1484 # -1 # ID=29_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.466 5_9 - 548 DUF87 PF01935.12 229 9.2e-18 59.6 0.1 1 1 9.8e-20 1.8e-17 58.6 0.1 11 153 168 293 159 373 0.80 # 10211 # 11854 # 1 # ID=5_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 6_12 - 315 DUF87 PF01935.12 229 0.019 9.6 6.2 1 2 6.5e-05 0.012 10.2 0.8 27 45 38 56 24 64 0.88 # 10045 # 10989 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 6_12 - 315 DUF87 PF01935.12 229 0.019 9.6 6.2 2 2 0.025 4.8 1.7 0.4 169 218 219 271 170 284 0.80 # 10045 # 10989 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 5_9 - 548 AAA_22 PF13401.1 131 8.3e-05 17.5 0.1 1 3 0.00048 0.061 8.3 0.0 5 28 181 204 180 236 0.82 # 10211 # 11854 # 1 # ID=5_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 5_9 - 548 AAA_22 PF13401.1 131 8.3e-05 17.5 0.1 2 3 0.011 1.4 3.9 0.0 77 114 408 458 345 470 0.68 # 10211 # 11854 # 1 # ID=5_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 5_9 - 548 AAA_22 PF13401.1 131 8.3e-05 17.5 0.1 3 3 0.059 7.4 1.5 0.3 47 98 469 518 449 544 0.70 # 10211 # 11854 # 1 # ID=5_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 6_11 - 720 AAA_22 PF13401.1 131 0.00051 15.0 0.5 1 1 2.7e-05 0.0034 12.3 0.5 7 99 508 645 503 680 0.56 # 7886 # 10045 # 1 # ID=6_11;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.319 10_6 - 140 AAA_22 PF13401.1 131 0.0025 12.8 0.7 1 1 7.3e-05 0.0092 10.9 0.6 4 23 5 24 2 114 0.87 # 2214 # 2633 # 1 # ID=10_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.414 37_3 - 263 ATP_bind_1 PF03029.12 238 0.00049 14.5 0.2 1 1 1.1e-05 0.002 12.4 0.2 6 112 14 144 12 226 0.75 # 773 # 1561 # -1 # ID=37_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.361 8_11 - 262 ATP_bind_1 PF03029.12 238 0.00095 13.5 1.3 1 1 7.2e-06 0.0014 13.0 0.3 6 98 12 124 10 126 0.66 # 8359 # 9144 # -1 # ID=8_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 6_11 - 720 PRK PF00485.13 194 0.0016 12.8 0.6 1 2 0.025 9.4 0.5 0.1 159 188 172 201 169 206 0.89 # 7886 # 10045 # 1 # ID=6_11;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.319 6_11 - 720 PRK PF00485.13 194 0.0016 12.8 0.6 2 2 3.6e-05 0.014 9.7 0.0 2 25 508 531 507 560 0.82 # 7886 # 10045 # 1 # ID=6_11;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.319 4_12 - 318 Citrate_ly_lig PF08218.6 182 4.8e-73 239.2 0.6 1 1 1.3e-75 4.8e-73 239.2 0.6 2 182 118 297 117 297 0.99 # 10500 # 11453 # -1 # ID=4_12;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.431 6_12 - 315 AAA_15 PF13175.1 415 0.00046 14.1 11.4 1 3 0.00021 0.078 6.7 1.0 17 76 28 83 16 145 0.65 # 10045 # 10989 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 6_12 - 315 AAA_15 PF13175.1 415 0.00046 14.1 11.4 2 3 2.7e-06 0.001 12.9 0.1 365 411 156 199 141 200 0.86 # 10045 # 10989 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 6_12 - 315 AAA_15 PF13175.1 415 0.00046 14.1 11.4 3 3 0.022 8.2 0.1 0.9 73 118 242 285 210 305 0.62 # 10045 # 10989 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 1_24 - 402 NAD_binding_7 PF13241.1 103 3.2e-10 35.0 0.1 1 2 3.3e-05 0.0062 11.6 0.0 7 71 9 92 5 113 0.68 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_24 - 402 NAD_binding_7 PF13241.1 103 3.2e-10 35.0 0.1 2 2 3.7e-08 7.1e-06 21.1 0.0 7 41 147 186 144 240 0.75 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 22_4 - 455 NAD_binding_7 PF13241.1 103 2.1e-05 19.5 0.4 1 2 0.0063 1.2 4.3 0.0 6 45 2 53 1 111 0.67 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 22_4 - 455 NAD_binding_7 PF13241.1 103 2.1e-05 19.5 0.4 2 2 1.1e-05 0.0022 13.1 0.1 8 38 153 183 147 263 0.83 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 10_6 - 140 AAA_17 PF13207.1 121 1e-05 21.1 0.0 1 1 1.1e-07 1.4e-05 20.7 0.0 2 75 8 92 7 130 0.53 # 2214 # 2633 # 1 # ID=10_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.414 6_11 - 720 AAA_17 PF13207.1 121 0.00011 17.8 0.0 1 1 2.5e-06 0.00031 16.3 0.0 1 23 507 529 507 617 0.79 # 7886 # 10045 # 1 # ID=6_11;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.319 2_27 - 85 AAA_17 PF13207.1 121 0.00014 17.4 0.0 1 1 1.5e-06 0.00018 17.1 0.0 2 62 8 70 7 82 0.70 # 23924 # 24178 # -1 # ID=2_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.431 6_12 - 315 AAA_21 PF13304.1 303 1.4e-11 39.6 9.7 1 1 1.6e-12 3.1e-10 35.2 6.9 3 297 38 198 36 204 0.65 # 10045 # 10989 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 20_2 - 227 AAA_21 PF13304.1 303 0.0006 14.6 0.3 1 1 5.4e-06 0.001 13.8 0.0 3 81 9 87 7 120 0.85 # 107 # 787 # 1 # ID=20_2;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.363 5_9 - 548 MobB PF03205.9 140 0.0004 14.9 0.1 1 1 7.5e-06 0.00095 13.7 0.1 3 34 183 214 181 307 0.92 # 10211 # 11854 # 1 # ID=5_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 8_11 - 262 MobB PF03205.9 140 0.00045 14.7 0.0 1 1 8.9e-06 0.0011 13.4 0.0 10 54 12 53 3 92 0.68 # 8359 # 9144 # -1 # ID=8_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 6_11 - 720 MobB PF03205.9 140 0.001 13.6 0.3 1 1 2.1e-05 0.0026 12.2 0.1 1 23 506 528 506 538 0.90 # 7886 # 10045 # 1 # ID=6_11;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.319 11_3 - 530 NAD_synthase PF02540.12 242 1.3e-07 25.5 0.0 1 1 6e-10 2.3e-07 24.7 0.0 7 161 209 364 203 375 0.73 # 1454 # 3043 # -1 # ID=11_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.550 4_12 - 318 CTP_transf_2 PF01467.21 157 2.1e-05 19.4 0.0 1 1 1.9e-07 7.1e-05 17.7 0.0 7 67 125 178 123 187 0.84 # 10500 # 11453 # -1 # ID=4_12;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.431 5_7 - 1047 Helicase_C PF00271.26 78 0.0015 13.2 0.1 1 1 1.8e-05 0.0069 11.1 0.1 17 76 618 678 607 680 0.88 # 5728 # 8868 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.393 26_2 - 270 ArsA_ATPase PF02374.10 305 7.9e-13 42.8 1.1 1 1 2.6e-13 1.4e-11 38.7 1.1 4 137 5 137 2 141 0.68 # 1125 # 1934 # 1 # ID=26_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 37_3 - 263 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.6e-12 41.8 0.1 1 1 9.7e-14 5.2e-12 40.1 0.1 4 137 7 133 4 138 0.77 # 773 # 1561 # -1 # ID=37_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.361 6_5 - 256 ArsA_ATPase PF02374.10 305 4e-11 37.2 0.9 1 1 2.1e-12 1.1e-10 35.7 0.9 5 137 7 133 3 239 0.82 # 2673 # 3440 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.349 8_11 - 262 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.6e-10 35.2 1.0 1 1 1.1e-11 6.1e-10 33.4 0.6 1 140 1 130 1 235 0.79 # 8359 # 9144 # -1 # ID=8_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 30_3 - 262 ArsA_ATPase PF02374.10 305 3.4e-09 30.9 0.2 1 1 4.6e-10 2.5e-08 28.1 0.2 6 70 9 68 4 138 0.62 # 647 # 1432 # -1 # ID=30_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.346 12_4 - 287 ArsA_ATPase PF02374.10 305 7.8e-08 26.4 0.2 1 1 3.6e-09 2e-07 25.1 0.2 8 136 24 151 17 154 0.75 # 960 # 1820 # -1 # ID=12_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 7_2 - 275 ArsA_ATPase PF02374.10 305 6.5e-05 16.8 0.3 1 1 3e-06 0.00016 15.5 0.3 8 49 9 53 4 137 0.77 # 957 # 1781 # -1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.375 5_9 - 548 T2SE PF00437.15 272 3.7e-05 17.5 0.0 1 1 2.2e-07 8.5e-05 16.3 0.0 129 171 181 223 151 239 0.89 # 10211 # 11854 # 1 # ID=5_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 4_14 - 381 AdoHcyase_NAD PF00670.16 162 0.0004 15.0 0.9 1 1 3.7e-06 0.0014 13.3 0.9 22 121 182 294 161 306 0.76 # 12597 # 13739 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.449 23_6 - 83 Terminase_1 PF03354.10 477 2.4e-16 53.9 0.1 1 1 1.4e-18 2.6e-16 53.8 0.1 32 92 3 69 1 81 0.90 # 1815 # 2063 # 1 # ID=23_6;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.382 23_5 - 132 Terminase_1 PF03354.10 477 1.5e-09 31.5 0.0 1 1 1e-11 2e-09 31.1 0.0 1 32 100 131 100 131 0.98 # 1423 # 1818 # 1 # ID=23_5;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.437 4_14 - 381 Shikimate_DH PF01488.15 135 0.00021 16.2 2.9 1 3 0.026 4.9 2.0 0.0 105 131 131 159 102 161 0.81 # 12597 # 13739 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.449 4_14 - 381 Shikimate_DH PF01488.15 135 0.00021 16.2 2.9 2 3 0.0012 0.22 6.4 0.6 3 42 174 213 172 216 0.89 # 12597 # 13739 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.449 4_14 - 381 Shikimate_DH PF01488.15 135 0.00021 16.2 2.9 3 3 0.0014 0.27 6.1 0.0 67 125 244 300 226 305 0.81 # 12597 # 13739 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.449 1_24 - 402 Shikimate_DH PF01488.15 135 0.0012 13.8 0.1 1 2 0.018 3.4 2.6 0.0 9 41 6 39 2 45 0.79 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_24 - 402 Shikimate_DH PF01488.15 135 0.0012 13.8 0.1 2 2 0.00037 0.069 8.0 0.0 12 38 147 173 137 177 0.79 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 20_2 - 227 Zeta_toxin PF06414.7 201 4.1e-16 53.4 0.3 1 1 3.6e-17 3.5e-15 50.4 0.3 15 192 4 164 2 174 0.85 # 107 # 787 # 1 # ID=20_2;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.363 10_6 - 140 Zeta_toxin PF06414.7 201 1.9e-13 44.7 0.7 1 1 2.2e-14 2.1e-12 41.3 0.7 16 145 5 125 1 133 0.84 # 2214 # 2633 # 1 # ID=10_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.414 2_27 - 85 Zeta_toxin PF06414.7 201 4.7e-05 17.3 0.1 1 1 2.8e-06 0.00026 14.9 0.1 16 56 5 43 2 84 0.73 # 23924 # 24178 # -1 # ID=2_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.431 6_12 - 315 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0013 12.6 0.9 1 2 0.00023 0.021 8.7 0.0 15 42 33 62 21 114 0.73 # 10045 # 10989 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 6_12 - 315 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0013 12.6 0.9 2 2 0.018 1.7 2.4 0.2 159 191 233 265 228 273 0.81 # 10045 # 10989 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 22_4 - 455 NAD_binding_8 PF13450.1 68 2e-05 19.3 0.1 1 2 0.00027 0.1 7.5 0.0 1 31 8 40 8 47 0.84 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 22_4 - 455 NAD_binding_8 PF13450.1 68 2e-05 19.3 0.1 2 2 8.7e-05 0.033 9.1 0.0 1 31 157 187 157 194 0.92 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 1_24 - 402 F420_oxidored PF03807.12 96 0.0063 11.8 1.3 1 2 0.029 11 1.3 0.4 3 35 13 43 11 100 0.85 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_24 - 402 F420_oxidored PF03807.12 96 0.0063 11.8 1.3 2 2 0.00018 0.067 8.5 0.0 1 30 149 175 149 192 0.88 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 22_4 - 455 FAD_binding_3 PF01494.14 356 0.00062 13.6 0.4 1 2 0.023 8.8 -0.0 0.1 119 156 67 104 53 116 0.77 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 22_4 - 455 FAD_binding_3 PF01494.14 356 0.00062 13.6 0.4 2 2 1.5e-05 0.0055 10.5 0.0 3 34 154 185 153 245 0.86 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 3_22 - 474 SMC_N PF02463.14 220 6.2e-06 20.4 5.3 1 1 7.3e-07 9.2e-05 16.5 5.3 13 197 6 452 2 467 0.83 # 12911 # 14332 # -1 # ID=3_22;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.282 6_11 - 720 SMC_N PF02463.14 220 2.2e-05 18.5 4.1 1 1 4.8e-06 0.00061 13.8 3.9 115 211 576 683 492 688 0.67 # 7886 # 10045 # 1 # ID=6_11;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.319 3_14 - 474 SMC_N PF02463.14 220 0.00018 15.5 8.6 1 2 0.003 0.37 4.7 0.3 12 61 5 57 2 127 0.79 # 6114 # 7535 # -1 # ID=3_14;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.281 3_14 - 474 SMC_N PF02463.14 220 0.00018 15.5 8.6 2 2 5.9e-06 0.00075 13.5 3.0 135 197 290 452 203 468 0.70 # 6114 # 7535 # -1 # ID=3_14;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.281 8_11 - 262 VirC1 PF07015.6 231 2e-10 34.9 0.2 1 2 6.9e-09 5.2e-07 23.7 0.0 1 47 1 47 1 72 0.89 # 8359 # 9144 # -1 # ID=8_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 8_11 - 262 VirC1 PF07015.6 231 2e-10 34.9 0.2 2 2 0.00023 0.017 8.9 0.1 79 113 112 146 82 257 0.69 # 8359 # 9144 # -1 # ID=8_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 37_3 - 263 VirC1 PF07015.6 231 0.00055 13.8 0.1 1 2 0.00057 0.043 7.6 0.0 8 40 10 42 4 60 0.82 # 773 # 1561 # -1 # ID=37_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.361 37_3 - 263 VirC1 PF07015.6 231 0.00055 13.8 0.1 2 2 0.0075 0.57 4.0 0.0 65 131 105 170 92 191 0.67 # 773 # 1561 # -1 # ID=37_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.361 6_5 - 256 VirC1 PF07015.6 231 0.0011 12.9 0.2 1 1 3.5e-05 0.0027 11.6 0.0 2 39 3 40 2 46 0.93 # 2673 # 3440 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.349 30_3 - 262 VirC1 PF07015.6 231 0.0011 12.9 0.1 1 2 0.00022 0.017 9.0 0.0 8 40 10 42 4 55 0.85 # 647 # 1432 # -1 # ID=30_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.346 30_3 - 262 VirC1 PF07015.6 231 0.0011 12.9 0.1 2 2 0.038 2.9 1.7 0.0 82 148 121 189 109 208 0.75 # 647 # 1432 # -1 # ID=30_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.346 26_2 - 270 VirC1 PF07015.6 231 0.0013 12.6 0.2 1 2 0.00016 0.012 9.4 0.0 2 39 3 40 2 48 0.82 # 1125 # 1934 # 1 # ID=26_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 26_2 - 270 VirC1 PF07015.6 231 0.0013 12.6 0.2 2 2 0.06 4.5 1.0 0.0 83 134 126 177 116 243 0.74 # 1125 # 1934 # 1 # ID=26_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 4_14 - 381 Malic_M PF03949.10 255 3.1e-57 188.8 3.3 1 1 1.1e-59 4.3e-57 188.3 3.3 1 251 159 376 159 379 0.96 # 12597 # 13739 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.449 8_11 - 262 Fer4_NifH PF00142.13 273 4.5e-07 24.0 1.6 1 2 4.1e-05 0.0022 12.0 0.0 8 70 10 73 2 82 0.86 # 8359 # 9144 # -1 # ID=8_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 8_11 - 262 Fer4_NifH PF00142.13 273 4.5e-07 24.0 1.6 2 2 6.8e-05 0.0037 11.2 0.4 181 247 187 253 169 259 0.80 # 8359 # 9144 # -1 # ID=8_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 6_5 - 256 Fer4_NifH PF00142.13 273 7.9e-07 23.3 0.0 1 1 1.5e-08 7.9e-07 23.3 0.0 2 48 4 50 3 68 0.85 # 2673 # 3440 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.349 12_4 - 287 Fer4_NifH PF00142.13 273 1.3e-06 22.6 2.2 1 1 2.9e-08 1.6e-06 22.3 0.4 8 57 25 76 18 97 0.83 # 960 # 1820 # -1 # ID=12_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 26_2 - 270 Fer4_NifH PF00142.13 273 1.6e-05 19.0 0.6 1 1 7.9e-07 4.3e-05 17.6 0.1 8 52 11 55 3 73 0.93 # 1125 # 1934 # 1 # ID=26_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 30_3 - 262 Fer4_NifH PF00142.13 273 3.5e-05 17.8 0.0 1 1 1.3e-06 7.2e-05 16.8 0.0 8 48 12 52 7 61 0.90 # 647 # 1432 # -1 # ID=30_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.346 37_3 - 263 Fer4_NifH PF00142.13 273 5e-05 17.3 0.1 1 1 3e-06 0.00016 15.7 0.0 8 50 12 54 7 65 0.86 # 773 # 1561 # -1 # ID=37_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.361 7_2 - 275 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.00011 16.3 0.2 1 1 3.8e-06 0.00021 15.3 0.2 8 55 12 60 5 78 0.82 # 957 # 1781 # -1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.375 6_12 - 315 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.00068 14.1 0.2 1 1 4.3e-06 0.0016 12.9 0.2 19 112 33 126 25 136 0.71 # 10045 # 10989 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 11_3 - 530 QueC PF06508.8 210 0.0027 11.7 0.0 1 1 1.2e-05 0.0047 11.0 0.0 5 58 228 282 225 310 0.82 # 1454 # 3043 # -1 # ID=11_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.550 10_6 - 140 AAA_16 PF13191.1 185 0.0002 16.2 0.0 1 1 1.3e-06 0.00024 15.9 0.0 23 110 4 89 1 123 0.66 # 2214 # 2633 # 1 # ID=10_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.414 2_27 - 85 AAA_16 PF13191.1 185 0.00054 14.8 0.0 1 1 3.3e-06 0.00063 14.5 0.0 24 95 5 78 1 84 0.71 # 23924 # 24178 # -1 # ID=2_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.431 20_2 - 227 AAA_23 PF13476.1 202 0.00079 14.6 4.4 1 1 1.3e-05 0.0016 13.6 4.4 21 143 7 191 3 222 0.58 # 107 # 787 # 1 # ID=20_2;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.363 2_27 - 85 AAA_23 PF13476.1 202 0.0032 12.6 0.4 1 1 5.6e-05 0.0071 11.4 0.2 22 38 8 24 5 44 0.88 # 23924 # 24178 # -1 # ID=2_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.431 6_12 - 315 AAA_23 PF13476.1 202 0.007 11.5 11.7 1 1 0.00041 0.052 8.6 11.7 11 143 25 289 21 308 0.60 # 10045 # 10989 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 10_6 - 140 AAA_18 PF13238.1 129 3.6e-05 18.9 0.2 1 1 5.8e-07 5.4e-05 18.3 0.2 1 112 8 122 8 133 0.59 # 2214 # 2633 # 1 # ID=10_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.414 2_27 - 85 AAA_18 PF13238.1 129 0.00023 16.2 0.0 1 1 2.8e-06 0.00026 16.1 0.0 1 55 8 65 8 82 0.71 # 23924 # 24178 # -1 # ID=2_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.431 6_11 - 720 AAA_18 PF13238.1 129 0.00098 14.2 0.6 1 1 4.2e-05 0.004 12.3 0.0 1 23 508 540 508 574 0.80 # 7886 # 10045 # 1 # ID=6_11;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.319 8_11 - 262 AAA_18 PF13238.1 129 0.0016 13.6 0.2 1 1 5.3e-05 0.0051 11.9 0.1 8 82 12 126 10 143 0.73 # 8359 # 9144 # -1 # ID=8_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 24_4 - 253 adh_short PF00106.20 167 3.6e-33 109.6 0.4 1 1 2.3e-35 4.3e-33 109.3 0.4 1 163 8 171 8 175 0.91 # 1046 # 1804 # -1 # ID=24_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.501 2_18 - 144 adh_short PF00106.20 167 0.00018 16.3 0.4 1 1 1.2e-06 0.00022 15.9 0.4 11 115 22 128 16 134 0.87 # 16675 # 17106 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.481 2_27 - 85 AAA_13 PF13166.1 712 0.0021 11.3 0.1 1 1 6.5e-06 0.0025 11.1 0.1 13 34 2 23 1 77 0.86 # 23924 # 24178 # -1 # ID=2_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.431 26_2 - 270 CbiA PF01656.18 195 5.7e-34 112.0 0.1 1 1 1.3e-35 7.2e-34 111.7 0.1 1 191 5 228 5 232 0.75 # 1125 # 1934 # 1 # ID=26_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 30_3 - 262 CbiA PF01656.18 195 1.5e-30 100.8 0.0 1 1 3.5e-32 1.9e-30 100.5 0.0 4 193 9 223 6 225 0.79 # 647 # 1432 # -1 # ID=30_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.346 37_3 - 263 CbiA PF01656.18 195 2.9e-29 96.6 0.2 1 1 6.9e-31 3.7e-29 96.3 0.2 5 187 10 217 6 224 0.77 # 773 # 1561 # -1 # ID=37_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.361 12_4 - 287 CbiA PF01656.18 195 3e-28 93.3 0.5 1 1 6.9e-30 3.8e-28 93.0 0.5 1 190 19 240 19 245 0.81 # 960 # 1820 # -1 # ID=12_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 7_2 - 275 CbiA PF01656.18 195 9.3e-27 88.5 0.1 1 1 2.2e-28 1.2e-26 88.1 0.1 2 193 7 226 6 228 0.79 # 957 # 1781 # -1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.375 6_5 - 256 CbiA PF01656.18 195 3.2e-26 86.7 0.7 1 1 7e-28 3.8e-26 86.5 0.7 1 191 5 222 5 226 0.77 # 2673 # 3440 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.349 8_11 - 262 CbiA PF01656.18 195 2.3e-22 74.1 0.0 1 1 6.7e-24 3.6e-22 73.5 0.0 1 180 4 211 4 227 0.68 # 8359 # 9144 # -1 # ID=8_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 8_2 - 88 B5 PF03484.10 70 0.0011 13.6 0.1 1 2 0.0014 0.53 5.0 0.0 18 45 10 41 2 49 0.76 # 249 # 512 # -1 # ID=8_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.295 8_2 - 88 B5 PF03484.10 70 0.0011 13.6 0.1 2 2 0.00037 0.14 6.8 0.0 56 70 65 79 63 79 0.92 # 249 # 512 # -1 # ID=8_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.295 1_24 - 402 HI0933_like PF03486.9 409 1.2e-07 25.3 0.1 1 3 5.3e-05 0.0067 9.7 0.0 122 165 76 116 70 127 0.84 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_24 - 402 HI0933_like PF03486.9 409 1.2e-07 25.3 0.1 2 3 0.00079 0.1 5.8 0.0 2 36 149 183 148 190 0.89 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_24 - 402 HI0933_like PF03486.9 409 1.2e-07 25.3 0.1 3 3 0.00055 0.069 6.3 0.0 114 163 194 242 185 249 0.87 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 22_4 - 455 HI0933_like PF03486.9 409 3.3e-05 17.2 0.8 1 3 0.00059 0.074 6.2 0.0 111 163 61 115 17 120 0.79 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 22_4 - 455 HI0933_like PF03486.9 409 3.3e-05 17.2 0.8 2 3 0.00026 0.033 7.4 0.2 2 33 154 185 153 189 0.91 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 22_4 - 455 HI0933_like PF03486.9 409 3.3e-05 17.2 0.8 3 3 0.072 9.1 -0.7 0.0 121 163 205 245 194 249 0.79 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 55_1 - 228 HI0933_like PF03486.9 409 0.0024 11.1 0.0 1 1 3.1e-05 0.0039 10.4 0.0 287 363 125 199 86 211 0.74 # 51 # 734 # 1 # ID=55_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.455 2_5 - 306 CSD PF00313.17 66 0.0042 11.7 1.4 1 2 2.8e-05 0.01 10.4 0.2 19 53 127 161 126 173 0.80 # 4880 # 5797 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.411 2_5 - 306 CSD PF00313.17 66 0.0042 11.7 1.4 2 2 0.095 36 -0.9 0.1 26 44 199 218 192 232 0.57 # 4880 # 5797 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.411 2_27 - 85 AAA_29 PF13555.1 62 6.8e-05 17.2 0.0 1 1 1.4e-06 0.0001 16.6 0.0 25 52 7 34 1 40 0.82 # 23924 # 24178 # -1 # ID=2_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.431 20_2 - 227 AAA_29 PF13555.1 62 9.5e-05 16.7 0.0 1 1 2.7e-06 0.00021 15.6 0.0 26 47 8 29 2 38 0.80 # 107 # 787 # 1 # ID=20_2;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.363 6_12 - 315 AAA_29 PF13555.1 62 0.00013 16.3 0.5 1 1 3.3e-06 0.00025 15.3 0.5 20 49 32 60 23 66 0.78 # 10045 # 10989 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 10_6 - 140 AAA_29 PF13555.1 62 0.00025 15.4 0.0 1 1 7.6e-06 0.00058 14.2 0.0 25 51 7 33 1 39 0.79 # 2214 # 2633 # 1 # ID=10_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.414 6_11 - 720 AAA_29 PF13555.1 62 0.0024 12.2 0.1 1 1 7.2e-05 0.0055 11.1 0.1 18 40 501 522 493 537 0.82 # 7886 # 10045 # 1 # ID=6_11;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.319 2_5 - 306 FAD_binding_2 PF00890.19 417 0.0012 12.5 0.0 1 1 8e-06 0.0015 12.1 0.0 258 354 103 212 77 248 0.79 # 4880 # 5797 # -1 # ID=2_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.411 22_4 - 455 FAD_binding_2 PF00890.19 417 0.0037 10.9 0.0 1 3 0.0023 0.43 4.1 0.0 2 99 6 100 5 129 0.79 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 22_4 - 455 FAD_binding_2 PF00890.19 417 0.0037 10.9 0.0 2 3 0.017 3.2 1.2 0.0 2 29 155 182 154 187 0.92 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 22_4 - 455 FAD_binding_2 PF00890.19 417 0.0037 10.9 0.0 3 3 0.014 2.6 1.5 0.0 376 401 265 284 215 289 0.82 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 5_9 - 548 AAA PF00004.24 132 0.00042 15.3 0.0 1 2 0.014 5.4 2.0 0.0 1 29 183 214 183 239 0.80 # 10211 # 11854 # 1 # ID=5_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 5_9 - 548 AAA PF00004.24 132 0.00042 15.3 0.0 2 2 3.2e-05 0.012 10.6 0.0 53 122 419 479 390 487 0.81 # 10211 # 11854 # 1 # ID=5_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 24_4 - 253 KR PF08659.5 181 1.2e-15 52.4 0.1 1 1 5.4e-18 2e-15 51.7 0.1 3 153 10 160 9 171 0.82 # 1046 # 1804 # -1 # ID=24_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.501 22_4 - 455 Thi4 PF01946.12 230 0.001 12.9 0.1 1 2 0.012 4.6 1.0 0.0 19 48 5 36 2 54 0.80 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 22_4 - 455 Thi4 PF01946.12 230 0.001 12.9 0.1 2 2 3.5e-05 0.013 9.3 0.0 6 47 141 182 136 189 0.87 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 4_12 - 318 HIGH_NTase1 PF05636.6 388 3.5e-07 24.3 0.3 1 2 4.7e-06 0.0018 12.1 0.0 2 31 116 145 115 153 0.79 # 10500 # 11453 # -1 # ID=4_12;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.431 4_12 - 318 HIGH_NTase1 PF05636.6 388 3.5e-07 24.3 0.3 2 2 1.7e-05 0.0064 10.3 0.1 198 235 264 301 253 310 0.83 # 10500 # 11453 # -1 # ID=4_12;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.431 1_24 - 402 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 7.6e-14 47.0 0.1 1 2 1.1e-13 2e-11 39.1 0.0 95 200 76 180 59 183 0.84 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_24 - 402 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 7.6e-14 47.0 0.1 2 2 0.0032 0.61 4.9 0.0 84 142 191 247 184 295 0.79 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 22_4 - 455 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 1.6e-13 46.0 0.1 1 3 0.00047 0.09 7.6 0.0 167 194 3 32 1 38 0.81 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 22_4 - 455 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 1.6e-13 46.0 0.1 2 3 2.5e-11 4.8e-09 31.3 0.0 96 196 73 181 50 187 0.80 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 22_4 - 455 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 1.6e-13 46.0 0.1 3 3 0.01 1.9 3.2 0.0 82 147 194 255 190 283 0.78 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 1_4 - 541 N6_Mtase PF02384.11 311 4.3e-117 385.3 0.0 1 1 5.2e-119 6.6e-117 384.8 0.0 2 308 181 489 180 492 0.96 # 2142 # 3764 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.437 5_5 - 509 N6_Mtase PF02384.11 311 1.1e-110 364.3 0.0 1 1 1.2e-112 1.5e-110 363.9 0.0 2 309 150 465 149 467 0.97 # 3086 # 4612 # 1 # ID=5_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.410 5_4 - 458 N6_Mtase PF02384.11 311 4e-68 224.5 0.0 1 1 4.9e-70 6.2e-68 223.9 0.0 21 305 135 419 127 421 0.94 # 1641 # 3014 # 1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.385 6_12 - 315 DUF258 PF03193.11 161 0.00033 14.7 0.2 1 1 8.3e-06 0.00079 13.4 0.2 24 97 22 96 9 117 0.80 # 10045 # 10989 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 10_6 - 140 DUF258 PF03193.11 161 0.00078 13.4 0.1 1 1 1.5e-05 0.0014 12.6 0.1 36 69 6 43 2 128 0.84 # 2214 # 2633 # 1 # ID=10_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.414 6_11 - 720 DUF258 PF03193.11 161 0.00087 13.3 0.1 1 1 1.9e-05 0.0018 12.3 0.1 10 57 477 527 470 544 0.76 # 7886 # 10045 # 1 # ID=6_11;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.319 20_2 - 227 DUF258 PF03193.11 161 0.0033 11.4 0.3 1 1 0.0004 0.038 8.0 0.3 36 55 6 25 1 144 0.71 # 107 # 787 # 1 # ID=20_2;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.363 11_3 - 530 Asn_synthase PF00733.16 255 1.5e-61 202.9 0.0 1 1 6.1e-64 2.3e-61 202.2 0.0 2 255 207 435 206 435 0.96 # 1454 # 3043 # -1 # ID=11_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.550 6_5 - 256 AAA_31 PF13614.1 157 1.2e-16 55.8 0.5 1 1 6e-18 3.2e-16 54.4 0.5 1 153 3 157 3 161 0.74 # 2673 # 3440 # -1 # ID=6_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.349 26_2 - 270 AAA_31 PF13614.1 157 2.8e-12 41.6 0.2 1 1 1.2e-13 6.8e-12 40.4 0.2 4 149 6 157 3 162 0.75 # 1125 # 1934 # 1 # ID=26_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 37_3 - 263 AAA_31 PF13614.1 157 6.1e-11 37.3 0.4 1 1 1.4e-11 7.5e-10 33.7 0.4 9 150 12 154 9 161 0.67 # 773 # 1561 # -1 # ID=37_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.361 7_2 - 275 AAA_31 PF13614.1 157 5.6e-10 34.1 0.2 1 1 3.2e-11 1.7e-09 32.5 0.2 8 151 11 158 4 162 0.78 # 957 # 1781 # -1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.375 30_3 - 262 AAA_31 PF13614.1 157 3.9e-09 31.4 0.1 1 2 8.8e-07 4.8e-05 18.1 0.0 9 56 12 58 9 95 0.84 # 647 # 1432 # -1 # ID=30_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.346 30_3 - 262 AAA_31 PF13614.1 157 3.9e-09 31.4 0.1 2 2 0.00012 0.0066 11.2 0.0 109 149 114 153 112 161 0.78 # 647 # 1432 # -1 # ID=30_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.346 8_11 - 262 AAA_31 PF13614.1 157 2e-08 29.1 0.2 1 1 7.5e-10 4.1e-08 28.1 0.2 1 151 2 149 2 152 0.85 # 8359 # 9144 # -1 # ID=8_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.304 12_4 - 287 AAA_31 PF13614.1 157 2.9e-06 22.1 0.3 1 1 3.7e-07 2e-05 19.4 0.3 9 135 25 159 18 179 0.64 # 960 # 1820 # -1 # ID=12_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 10_6 - 140 AAA_33 PF13671.1 143 9e-12 39.9 0.1 1 1 8.3e-14 1e-11 39.7 0.1 2 120 8 124 7 134 0.82 # 2214 # 2633 # 1 # ID=10_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.414 20_2 - 227 AAA_33 PF13671.1 143 1e-10 36.4 0.0 1 1 1.2e-12 1.5e-10 35.9 0.0 2 137 8 139 7 146 0.80 # 107 # 787 # 1 # ID=20_2;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.363 2_27 - 85 AAA_33 PF13671.1 143 2.6e-07 25.4 0.0 1 1 2.2e-09 2.7e-07 25.3 0.0 2 79 8 81 7 84 0.73 # 23924 # 24178 # -1 # ID=2_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.431 5_5 - 509 Methyltransf_26 PF13659.1 117 8.6e-12 39.9 0.0 1 1 1.7e-13 2.2e-11 38.6 0.0 3 115 193 325 191 327 0.77 # 3086 # 4612 # 1 # ID=5_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.410 1_4 - 541 Methyltransf_26 PF13659.1 117 2.6e-11 38.4 0.0 1 1 6.9e-13 8.7e-11 36.7 0.0 3 116 234 368 232 369 0.78 # 2142 # 3764 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.437 5_4 - 458 Methyltransf_26 PF13659.1 117 2.5e-07 25.6 0.0 1 2 0.066 8.3 1.3 0.0 24 44 36 57 22 147 0.77 # 1641 # 3014 # 1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.385 5_4 - 458 Methyltransf_26 PF13659.1 117 2.5e-07 25.6 0.0 2 2 3e-08 3.8e-06 21.7 0.0 2 113 166 297 165 301 0.74 # 1641 # 3014 # 1 # ID=5_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.385 1_24 - 402 NAD_Gly3P_dh_N PF01210.18 157 8.6e-05 17.1 0.0 1 1 4.3e-07 0.00016 16.2 0.0 2 33 150 181 149 208 0.84 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 22_4 - 455 2-Hacid_dh_C PF02826.14 178 0.00045 14.2 0.0 1 1 5.9e-06 0.0011 12.9 0.0 18 68 134 184 129 197 0.86 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 4_14 - 381 2-Hacid_dh_C PF02826.14 178 0.0013 12.6 0.5 1 1 1.6e-05 0.0031 11.5 0.0 26 70 173 218 153 255 0.82 # 12597 # 13739 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.449 1_25 - 77 AAA_30 PF13604.1 196 0.00068 14.0 0.0 1 1 7.2e-06 0.00068 14.0 0.0 47 88 11 52 3 72 0.83 # 26995 # 27225 # 1 # ID=1_25;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.450 24_2 - 84 AAA_30 PF13604.1 196 0.00081 13.8 0.0 1 1 8.6e-06 0.00082 13.8 0.0 47 88 11 52 3 75 0.83 # 253 # 504 # -1 # ID=24_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 41_1 - 84 AAA_30 PF13604.1 196 0.00081 13.8 0.0 1 1 8.8e-06 0.00083 13.7 0.0 47 88 11 52 3 74 0.83 # 185 # 436 # -1 # ID=41_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.456 10_6 - 140 AAA_30 PF13604.1 196 0.00082 13.8 0.1 1 1 3.1e-05 0.0029 12.0 0.1 15 44 2 31 1 105 0.88 # 2214 # 2633 # 1 # ID=10_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.414 1_24 - 402 ApbA PF02558.11 151 0.002 12.3 0.0 1 1 2e-05 0.0074 10.5 0.0 1 31 150 180 150 234 0.91 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 5_9 - 548 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 1.3e-10 35.8 0.0 1 2 2.7e-09 1e-06 23.1 0.0 33 80 171 218 162 230 0.87 # 10211 # 11854 # 1 # ID=5_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 5_9 - 548 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 1.3e-10 35.8 0.0 2 2 1.8e-05 0.007 10.6 0.0 151 203 420 470 294 472 0.88 # 10211 # 11854 # 1 # ID=5_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 5_5 - 509 MTS PF05175.9 170 0.00019 15.6 0.0 1 1 1.4e-06 0.00052 14.2 0.0 24 112 184 281 179 294 0.75 # 3086 # 4612 # 1 # ID=5_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.410 1_24 - 402 Lycopene_cycl PF05834.7 374 0.00021 15.0 0.0 1 4 0.058 22 -1.5 0.0 3 38 13 48 12 61 0.80 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_24 - 402 Lycopene_cycl PF05834.7 374 0.00021 15.0 0.0 2 4 0.099 38 -2.2 0.0 106 143 83 118 75 129 0.82 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_24 - 402 Lycopene_cycl PF05834.7 374 0.00021 15.0 0.0 3 4 7.9e-05 0.03 7.9 0.0 2 30 150 176 149 186 0.79 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_24 - 402 Lycopene_cycl PF05834.7 374 0.00021 15.0 0.0 4 4 0.0024 0.89 3.1 0.0 94 149 196 254 188 270 0.74 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 4_14 - 381 ELFV_dehydrog PF00208.16 244 1.3e-05 19.6 1.1 1 1 5.9e-08 2.2e-05 18.9 1.1 4 69 156 220 154 268 0.86 # 12597 # 13739 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.449 6_12 - 315 ABC_tran PF00005.22 137 3.4e-31 103.1 1.9 1 1 1.1e-32 8.1e-31 101.9 0.1 1 137 24 168 24 168 0.92 # 10045 # 10989 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 6_11 - 720 ABC_tran PF00005.22 137 2.4e-30 100.4 0.2 1 1 8.4e-32 6.4e-30 99.0 0.2 1 137 495 643 495 643 0.89 # 7886 # 10045 # 1 # ID=6_11;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.319 20_2 - 227 ABC_tran PF00005.22 137 0.00012 17.2 0.9 1 1 3.5e-06 0.00026 16.1 0.9 12 80 6 118 2 221 0.72 # 107 # 787 # 1 # ID=20_2;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.363 2_27 - 85 ABC_tran PF00005.22 137 0.00017 16.7 0.0 1 1 2.7e-06 0.0002 16.4 0.0 13 62 7 63 2 80 0.61 # 23924 # 24178 # -1 # ID=2_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.431 10_6 - 140 ABC_tran PF00005.22 137 0.00024 16.2 1.6 1 1 5.6e-06 0.00042 15.4 1.6 12 88 6 119 2 136 0.61 # 2214 # 2633 # 1 # ID=10_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.414 1_24 - 402 K_oxygenase PF13434.1 341 3.5e-06 20.9 0.1 1 3 0.083 16 -1.0 0.0 188 224 7 43 2 72 0.80 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_24 - 402 K_oxygenase PF13434.1 341 3.5e-06 20.9 0.1 2 3 2.8e-07 5.4e-05 17.0 0.0 112 222 80 177 53 185 0.74 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_24 - 402 K_oxygenase PF13434.1 341 3.5e-06 20.9 0.1 3 3 0.034 6.5 0.3 0.0 130 161 220 247 191 259 0.72 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 22_4 - 455 K_oxygenase PF13434.1 341 3.9e-06 20.7 0.1 1 2 0.0023 0.43 4.2 0.0 190 221 3 34 1 44 0.88 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 22_4 - 455 K_oxygenase PF13434.1 341 3.9e-06 20.7 0.1 2 2 2.1e-06 0.00041 14.1 0.0 112 216 76 178 67 191 0.75 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 1_4 - 541 Eco57I PF07669.6 106 1.1e-08 30.2 0.0 1 1 1.7e-10 6.3e-08 27.8 0.0 3 104 308 418 306 420 0.87 # 2142 # 3764 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.437 5_5 - 509 AviRa PF11599.3 246 0.0022 11.8 0.0 1 1 1e-05 0.0039 11.0 0.0 42 99 181 243 177 253 0.75 # 3086 # 4612 # 1 # ID=5_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.410 22_4 - 455 UDPG_MGDP_dh_N PF03721.9 185 1.1e-06 22.9 0.1 1 1 1.4e-08 2.6e-06 21.7 0.0 2 54 154 207 153 251 0.83 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 1_24 - 402 UDPG_MGDP_dh_N PF03721.9 185 0.00062 14.0 0.0 1 1 6e-06 0.0011 13.1 0.0 2 29 149 176 148 181 0.93 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 24_4 - 253 NAD_binding_10 PF13460.1 183 0.0023 12.8 0.6 1 1 1.8e-05 0.007 11.2 0.6 3 52 12 75 11 233 0.74 # 1046 # 1804 # -1 # ID=24_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.501 5_9 - 548 AAA_10 PF12846.2 304 2.7e-22 74.3 0.2 1 1 6.9e-23 8.7e-21 69.4 0.1 2 297 181 500 180 505 0.73 # 10211 # 11854 # 1 # ID=5_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 6_11 - 720 AAA_10 PF12846.2 304 0.00076 13.7 0.2 1 1 2.7e-05 0.0034 11.6 0.1 4 25 508 529 506 566 0.89 # 7886 # 10045 # 1 # ID=6_11;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.319 6_12 - 315 AAA_10 PF12846.2 304 0.002 12.4 2.4 1 2 0.00012 0.015 9.5 1.1 6 22 39 55 36 63 0.91 # 10045 # 10989 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 6_12 - 315 AAA_10 PF12846.2 304 0.002 12.4 2.4 2 2 0.022 2.8 2.0 0.0 215 296 152 250 124 257 0.78 # 10045 # 10989 # 1 # ID=6_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 30_3 - 262 SPOUT_MTase_2 PF14419.1 174 0.00088 13.3 0.0 1 2 2.6e-05 0.01 9.8 0.0 74 119 15 60 9 70 0.90 # 647 # 1432 # -1 # ID=30_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.346 30_3 - 262 SPOUT_MTase_2 PF14419.1 174 0.00088 13.3 0.0 2 2 0.017 6.3 0.7 0.0 143 167 125 151 118 159 0.73 # 647 # 1432 # -1 # ID=30_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.346 24_4 - 253 adh_short_C2 PF13561.1 241 7.4e-20 66.5 0.0 1 1 2.3e-22 8.8e-20 66.2 0.0 7 241 18 250 14 250 0.89 # 1046 # 1804 # -1 # ID=24_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.501 29_1 - 241 DNA_photolyase PF00875.13 165 0.00044 14.8 0.1 1 1 1.6e-06 0.00061 14.3 0.1 29 131 108 213 96 230 0.77 # 224 # 946 # 1 # ID=29_1;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.434 1_24 - 402 DAO PF01266.19 358 3.9e-11 37.2 3.9 1 3 2.9e-05 0.0055 10.4 0.0 161 212 77 126 60 144 0.81 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_24 - 402 DAO PF01266.19 358 3.9e-11 37.2 3.9 2 3 1.6e-05 0.003 11.2 0.0 2 28 150 176 149 186 0.88 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_24 - 402 DAO PF01266.19 358 3.9e-11 37.2 3.9 3 3 1.2e-06 0.00024 14.9 0.0 154 202 196 244 188 283 0.91 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 22_4 - 455 DAO PF01266.19 358 8e-10 32.9 1.4 1 4 0.045 8.5 -0.1 0.0 2 33 6 39 5 46 0.88 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 22_4 - 455 DAO PF01266.19 358 8e-10 32.9 1.4 2 4 0.00012 0.024 8.3 0.0 156 212 68 126 61 140 0.74 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 22_4 - 455 DAO PF01266.19 358 8e-10 32.9 1.4 3 4 5.6e-05 0.011 9.4 0.1 2 32 155 185 154 190 0.89 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 22_4 - 455 DAO PF01266.19 358 8e-10 32.9 1.4 4 4 2.2e-05 0.0042 10.8 0.0 165 202 211 247 199 267 0.84 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 4_14 - 381 ThiF PF00899.16 136 1.3e-06 23.0 1.6 1 1 9.8e-09 1.9e-06 22.6 0.4 3 38 184 219 182 262 0.92 # 12597 # 13739 # -1 # ID=4_14;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.449 22_4 - 455 ThiF PF00899.16 136 0.00063 14.4 0.1 1 1 2.4e-05 0.0046 11.6 0.0 4 34 154 183 152 186 0.91 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 1_5 - 1056 ResIII PF04851.10 184 2.5e-33 110.2 0.9 1 1 1.3e-35 2.5e-33 110.2 0.9 4 183 261 431 258 432 0.92 # 3778 # 6945 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.447 5_7 - 1047 ResIII PF04851.10 184 5.8e-20 66.6 0.0 1 1 1.3e-21 2.4e-19 64.6 0.0 10 183 284 454 276 455 0.81 # 5728 # 8868 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.393 11_3 - 530 Methyltransf_31 PF13847.1 152 0.0014 13.0 0.0 1 1 7.1e-06 0.0027 12.1 0.0 20 76 240 305 235 366 0.79 # 1454 # 3043 # -1 # ID=11_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.550 5_9 - 548 Zot PF05707.7 193 0.0018 12.5 0.1 1 2 0.079 30 -1.2 0.0 4 27 184 206 183 215 0.78 # 10211 # 11854 # 1 # ID=5_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 5_9 - 548 Zot PF05707.7 193 0.0018 12.5 0.1 2 2 2.5e-05 0.0095 10.2 0.0 82 138 426 482 415 529 0.81 # 10211 # 11854 # 1 # ID=5_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 1_24 - 402 NAD_binding_9 PF13454.1 156 7.5e-07 23.8 2.4 1 4 0.036 14 0.3 0.0 1 33 13 42 13 59 0.78 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_24 - 402 NAD_binding_9 PF13454.1 156 7.5e-07 23.8 2.4 2 4 0.00015 0.058 8.0 0.0 117 155 80 115 62 116 0.77 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_24 - 402 NAD_binding_9 PF13454.1 156 7.5e-07 23.8 2.4 3 4 0.00089 0.34 5.5 0.0 1 38 151 184 151 195 0.76 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_24 - 402 NAD_binding_9 PF13454.1 156 7.5e-07 23.8 2.4 4 4 0.0002 0.077 7.5 0.0 101 154 189 242 177 244 0.76 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 24_4 - 253 Epimerase PF01370.16 236 0.0013 13.0 0.1 1 1 4.8e-06 0.0018 12.5 0.1 2 83 11 100 10 118 0.74 # 1046 # 1804 # -1 # ID=24_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.501 1_5 - 1056 DEAD PF00270.24 169 1.7e-09 32.2 5.3 1 2 5.2e-12 2e-09 32.0 0.1 3 141 264 415 262 437 0.70 # 3778 # 6945 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.447 1_5 - 1056 DEAD PF00270.24 169 1.7e-09 32.2 5.3 2 2 0.0087 3.3 1.9 0.1 45 95 539 623 458 639 0.70 # 3778 # 6945 # -1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.447 22_4 - 455 Pyr_redox PF00070.22 80 2.4e-19 64.3 2.9 1 2 0.00019 0.037 9.3 0.8 1 77 5 94 5 102 0.62 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 22_4 - 455 Pyr_redox PF00070.22 80 2.4e-19 64.3 2.9 2 2 4.4e-17 8.4e-15 49.8 0.1 1 78 154 231 154 234 0.94 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 1_24 - 402 Pyr_redox PF00070.22 80 1e-15 52.7 7.3 1 2 0.0048 0.91 4.8 0.0 51 77 72 98 52 102 0.69 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_24 - 402 Pyr_redox PF00070.22 80 1e-15 52.7 7.3 2 2 1.1e-16 2.1e-14 48.5 0.0 1 74 149 223 149 229 0.93 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 5_9 - 548 DUF853 PF05872.7 504 1.8e-09 31.2 0.0 1 2 0.0023 0.86 2.6 0.0 18 59 177 218 169 228 0.84 # 10211 # 11854 # 1 # ID=5_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 5_9 - 548 DUF853 PF05872.7 504 1.8e-09 31.2 0.0 2 2 1.6e-10 6e-08 26.2 0.0 259 328 425 494 410 525 0.76 # 10211 # 11854 # 1 # ID=5_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 5_9 - 548 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 8.4e-10 32.5 0.0 1 1 1.2e-11 4.4e-09 30.2 0.0 15 162 180 334 170 517 0.61 # 10211 # 11854 # 1 # ID=5_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 26_2 - 270 ParA PF10609.4 81 0.00079 14.1 0.2 1 1 6e-06 0.0023 12.6 0.0 2 52 128 176 127 192 0.79 # 1125 # 1934 # 1 # ID=26_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 22_4 - 455 Amino_oxidase PF01593.19 450 0.0016 12.3 0.2 1 3 0.0039 1.5 2.5 0.0 7 26 19 40 18 40 0.85 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 22_4 - 455 Amino_oxidase PF01593.19 450 0.0016 12.3 0.2 2 3 0.0004 0.15 5.8 0.0 222 261 72 114 62 118 0.79 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 22_4 - 455 Amino_oxidase PF01593.19 450 0.0016 12.3 0.2 3 3 0.043 16 -0.9 0.0 237 262 221 245 193 254 0.81 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 1_24 - 402 TrkA_N PF02254.13 116 0.00012 16.9 0.7 1 2 0.012 2.3 3.1 0.1 1 31 12 44 12 52 0.84 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_24 - 402 TrkA_N PF02254.13 116 0.00012 16.9 0.7 2 2 3.2e-05 0.006 11.4 0.0 1 27 150 176 150 182 0.89 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 4_10 - 305 TrkA_N PF02254.13 116 0.0019 13.0 1.3 1 2 0.00041 0.078 7.8 0.0 49 113 17 95 2 98 0.84 # 9303 # 10217 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.459 4_10 - 305 TrkA_N PF02254.13 116 0.0019 13.0 1.3 2 2 0.03 5.7 1.8 0.2 57 102 243 288 242 297 0.84 # 9303 # 10217 # -1 # ID=4_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.459 22_4 - 455 IlvN PF07991.7 165 0.0036 11.5 1.0 1 2 3.7e-05 0.014 9.5 0.1 3 79 2 79 1 149 0.71 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 22_4 - 455 IlvN PF07991.7 165 0.0036 11.5 1.0 2 2 0.029 11 0.1 0.1 5 31 153 179 149 183 0.85 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 22_4 - 455 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 0.00093 13.6 0.1 1 1 1.2e-05 0.0023 12.3 0.1 11 51 143 183 136 190 0.86 # 1544 # 2908 # 1 # ID=22_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 1_24 - 402 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 0.006 10.9 3.0 1 3 0.018 3.5 1.9 0.0 21 37 10 26 4 44 0.83 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_24 - 402 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 0.006 10.9 3.0 2 3 0.00053 0.1 7.0 0.2 21 51 148 175 144 218 0.68 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 1_24 - 402 AlaDh_PNT_C PF01262.16 168 0.006 10.9 3.0 3 3 0.064 12 0.2 0.1 5 30 218 243 214 244 0.88 # 25447 # 26652 # 1 # ID=1_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.442 6_11 - 720 NACHT PF05729.7 166 0.0031 11.9 0.5 1 2 0.057 22 -0.5 0.0 53 123 321 402 313 406 0.63 # 7886 # 10045 # 1 # ID=6_11;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.319 6_11 - 720 NACHT PF05729.7 166 0.0031 11.9 0.5 2 2 7.3e-05 0.028 8.9 0.0 2 22 507 527 506 532 0.88 # 7886 # 10045 # 1 # ID=6_11;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.319 5_5 - 509 Methyltransf_15 PF09445.5 164 0.0023 12.3 0.0 1 1 1.2e-05 0.0044 11.4 0.0 4 80 194 277 191 289 0.83 # 3086 # 4612 # 1 # ID=5_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.410 12_6 - 421 AAA_5 PF07728.9 139 8.6e-05 17.1 0.0 1 1 7.2e-07 0.00027 15.4 0.0 32 97 294 366 275 383 0.82 # 3939 # 5201 # -1 # ID=12_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.386 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b2 (February 2015) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/ca832e09-2545-4981-a483-1761de2ff097 # Target file: checkm_output/bins/pGCA_001702195.1.assembled/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pGCA_001702195.1.assembled/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/ca832e09-2545-4981-a483-1761de2ff097 checkm_output/bins/pGCA_001702195.1.assembled/genes.faa # Current dir: /mnt/DGK_KLIF/data/klif/reads-for-assembly/trainingsets2/combined/rfplasmid_combined_jellynew2 # Date: Tue Jul 7 16:46:16 2020 # [ok]