# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_9 - 509 UPF0020 PF01170.13 180 2.2e-06 21.4 0.0 1 1 4e-08 4.6e-06 20.4 0.0 28 118 191 279 176 288 0.79 # 9231 # 10757 # -1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.409 12_4 - 541 UPF0020 PF01170.13 180 5.9e-06 20.0 0.0 1 1 1e-07 1.2e-05 19.0 0.0 27 118 230 319 218 328 0.85 # 2763 # 4385 # 1 # ID=12_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.437 2_29 - 437 Terminase_6 PF03237.10 384 1.4e-37 123.4 5.1 1 1 6.9e-40 1.6e-37 123.2 5.1 2 382 30 401 29 403 0.93 # 19642 # 20952 # -1 # ID=2_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.420 12_3 - 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264 VirC1 PF07015.6 231 2.1e-08 27.6 0.0 2 2 0.014 0.66 3.0 0.0 72 112 106 146 94 224 0.84 # 821 # 1612 # -1 # ID=13_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.338 12_3 - 267 VirC1 PF07015.6 231 1.5e-06 21.5 0.9 1 1 4.3e-08 2e-06 21.1 0.2 3 39 4 40 2 55 0.90 # 761 # 1561 # -1 # ID=12_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 11_11 - 263 VirC1 PF07015.6 231 0.00033 13.8 0.1 1 2 0.00057 0.026 7.6 0.0 8 40 10 42 4 60 0.82 # 3790 # 4578 # -1 # ID=11_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.360 11_11 - 263 VirC1 PF07015.6 231 0.00033 13.8 0.1 2 2 0.0075 0.34 4.0 0.0 65 131 105 170 92 191 0.67 # 3790 # 4578 # -1 # ID=11_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.360 2_18 - 279 VirC1 PF07015.6 231 0.001 12.2 0.2 1 2 0.00016 0.0072 9.5 0.0 4 37 6 39 3 75 0.80 # 11497 # 12333 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.357 2_18 - 279 VirC1 PF07015.6 231 0.001 12.2 0.2 2 2 0.077 3.6 0.6 0.0 82 134 132 184 116 202 0.82 # 11497 # 12333 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.357 1_26 - 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144 adh_short PF00106.20 167 0.00011 16.3 0.4 1 1 5.8e-07 0.00013 15.9 0.4 11 115 22 128 16 134 0.87 # 6967 # 7398 # 1 # ID=8_8;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.481 2_18 - 279 CbiA PF01656.18 195 1.2e-33 110.2 0.0 1 1 3.5e-35 1.6e-33 109.8 0.0 2 192 7 235 6 238 0.80 # 11497 # 12333 # 1 # ID=2_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.357 12_3 - 267 CbiA PF01656.18 195 5.6e-31 101.5 0.0 1 1 1.5e-32 7.1e-31 101.2 0.0 1 193 5 232 5 234 0.79 # 761 # 1561 # -1 # ID=12_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 11_11 - 263 CbiA PF01656.18 195 1.8e-29 96.6 0.2 1 1 4.9e-31 2.3e-29 96.3 0.2 5 187 10 217 6 224 0.77 # 3790 # 4578 # -1 # ID=11_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.360 1_26 - 269 CbiA PF01656.18 195 3.8e-28 92.3 0.0 1 1 1.1e-29 4.9e-28 91.9 0.0 1 158 4 195 4 228 0.72 # 25144 # 25950 # -1 # ID=1_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.348 13_3 - 264 CbiA PF01656.18 195 1.1e-24 80.9 0.0 1 1 3.2e-26 1.5e-24 80.6 0.0 1 188 4 218 4 225 0.75 # 821 # 1612 # -1 # ID=13_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.338 13_3 - 264 AAA_14 PF13173.1 128 4e-05 17.6 1.2 1 1 1.5e-06 0.00011 16.2 0.4 12 57 12 64 8 168 0.77 # 821 # 1612 # -1 # ID=13_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.338 2_4 - 241 AAA_14 PF13173.1 128 0.00045 14.2 0.1 1 1 8.7e-06 0.00067 13.7 0.1 3 73 17 101 15 206 0.81 # 3098 # 3820 # -1 # ID=2_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.404 2_1 - 426 AAA_14 PF13173.1 128 0.00079 13.4 0.1 1 1 9.5e-05 0.0073 10.3 0.0 7 43 188 221 183 259 0.69 # 326 # 1603 # -1 # ID=2_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.404 7_5 - 345 Glyco_hydro_4 PF02056.11 183 1.7e-05 18.3 0.1 1 1 1.3e-07 3.1e-05 17.4 0.1 40 95 191 245 156 260 0.76 # 3706 # 4740 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.444 4_24 - 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