# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 3_4 - 1560 UPF0020 PF01170.13 180 7.1e-06 17.9 1.3 1 1 4.3e-06 0.00027 12.8 1.0 28 134 896 1107 891 1119 0.89 # 2003 # 6682 # 1 # ID=3_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AATAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.347 5_3 - 252 IstB_IS21 PF01695.12 178 1.4e-62 202.5 0.0 1 1 3.2e-64 2e-62 202.0 0.0 3 177 56 230 54 231 0.98 # 720 # 1475 # -1 # ID=5_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 4_5 - 349 MipZ PF09140.6 261 9.3e-09 26.9 1.3 1 2 2.1e-06 0.00013 13.3 0.3 1 41 48 89 48 130 0.80 # 3453 # 4499 # 1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.301 4_5 - 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