# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 4_2 - 342 Mg_chelatase PF01078.16 207 2.2e-05 18.4 0.2 1 1 3.9e-07 4.8e-05 17.3 0.0 22 44 121 143 103 150 0.83 # 3160 # 4185 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 1_32 - 271 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.00028 14.8 0.0 1 1 4.8e-06 0.00059 13.8 0.0 22 55 35 68 18 88 0.79 # 27374 # 28186 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.617 3_15 - 902 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.0022 11.9 0.1 1 2 0.046 5.7 0.8 0.0 24 42 218 236 197 252 0.79 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 3_15 - 902 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.0022 11.9 0.1 2 2 0.00037 0.045 7.6 0.1 5 43 599 648 596 729 0.84 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 10_4 - 710 ABC_ATPase PF09818.4 448 1.3e-06 22.0 0.2 1 2 0.002 0.73 3.0 0.0 240 265 493 519 490 529 0.87 # 2366 # 4495 # 1 # ID=10_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.575 10_4 - 710 ABC_ATPase PF09818.4 448 1.3e-06 22.0 0.2 2 2 1.4e-07 5e-05 16.7 0.0 304 363 589 648 564 679 0.82 # 2366 # 4495 # 1 # ID=10_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.575 4_2 - 342 Rad17 PF03215.10 519 0.00046 13.7 0.0 1 1 1.8e-06 0.00065 13.2 0.0 28 71 97 147 83 168 0.81 # 3160 # 4185 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 5_7 - 209 IstB_IS21 PF01695.12 178 1.5e-74 244.0 0.1 1 1 2.3e-76 1.7e-74 243.8 0.1 2 177 13 189 12 190 0.99 # 3180 # 3806 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 15_3 - 253 IstB_IS21 PF01695.12 178 1.3e-62 205.1 0.0 1 1 2.4e-64 1.8e-62 204.6 0.0 5 177 57 230 54 231 0.99 # 3903 # 4661 # -1 # ID=15_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.676 10_9 - 263 IstB_IS21 PF01695.12 178 3.9e-52 171.0 0.1 1 1 7e-54 5.2e-52 170.6 0.1 2 177 55 231 54 232 0.97 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 3_15 - 902 IstB_IS21 PF01695.12 178 3.4e-07 24.6 0.0 1 2 0.00025 0.018 9.2 0.0 45 91 214 260 189 340 0.80 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 3_15 - 902 IstB_IS21 PF01695.12 178 3.4e-07 24.6 0.0 2 2 2.3e-05 0.0017 12.5 0.0 50 88 630 668 626 679 0.85 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 4_2 - 342 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.00028 15.1 0.0 1 1 7.4e-06 0.00055 14.1 0.0 31 69 105 143 96 182 0.74 # 3160 # 4185 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 5_11 - 403 MipZ PF09140.6 261 4e-11 37.2 0.0 1 2 2.9e-09 1.1e-06 22.7 0.0 2 40 120 158 119 176 0.90 # 8397 # 9605 # -1 # ID=5_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.540 5_11 - 403 MipZ PF09140.6 261 4e-11 37.2 0.0 2 2 4e-06 0.0015 12.4 0.0 86 135 234 283 207 289 0.84 # 8397 # 9605 # -1 # ID=5_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.540 5_11 - 403 YhjQ PF06564.7 244 1.1e-05 19.6 0.1 1 1 1.2e-07 4.3e-05 17.7 0.1 3 145 120 274 118 282 0.71 # 8397 # 9605 # -1 # ID=5_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.540 2_37 - 411 3HCDH_N PF02737.13 180 1.6e-05 19.4 0.1 1 1 6.7e-08 2.5e-05 18.8 0.1 2 30 4 32 3 45 0.93 # 35296 # 36528 # 1 # ID=2_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.663 2_37 - 411 GIDA PF01134.17 392 7.2e-05 16.5 0.1 1 2 1.5e-06 0.00055 13.6 0.1 1 42 3 54 3 57 0.95 # 35296 # 36528 # 1 # ID=2_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.663 2_37 - 411 GIDA PF01134.17 392 7.2e-05 16.5 0.1 2 2 0.013 5 0.6 0.0 114 155 217 256 203 267 0.76 # 35296 # 36528 # 1 # ID=2_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.663 4_24 - 197 SSB PF00436.20 104 1.9e-41 134.9 0.1 1 1 6.4e-44 2.4e-41 134.6 0.1 1 104 4 108 4 108 0.99 # 18452 # 19042 # -1 # ID=4_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.636 2_37 - 411 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 3.7e-05 18.4 0.0 1 2 9e-07 0.00033 15.3 0.0 1 29 3 35 3 108 0.78 # 35296 # 36528 # 1 # ID=2_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.663 2_37 - 411 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 3.7e-05 18.4 0.0 2 2 0.022 8.2 1.0 0.0 95 125 227 257 176 275 0.73 # 35296 # 36528 # 1 # ID=2_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.663 3_15 - 902 AAA_2 PF07724.9 171 5.9e-43 141.5 0.0 1 1 1.1e-44 2e-42 139.7 0.0 1 170 625 791 625 792 0.97 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 4_2 - 342 AAA_2 PF07724.9 171 4.1e-06 21.5 0.0 1 1 5.3e-08 9.8e-06 20.3 0.0 5 105 123 217 119 222 0.87 # 3160 # 4185 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 10_4 - 710 DUF87 PF01935.12 229 0.0013 13.3 0.0 1 1 1.9e-05 0.0023 12.5 0.0 26 45 501 520 490 531 0.81 # 2366 # 4495 # 1 # ID=10_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.575 2_13 - 437 DUF87 PF01935.12 229 0.0035 11.9 0.0 1 1 5.4e-05 0.0066 11.0 0.0 22 46 158 182 156 190 0.91 # 11342 # 12652 # 1 # ID=2_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 10_9 - 263 DUF87 PF01935.12 229 0.0043 11.6 0.0 1 1 6.5e-05 0.008 10.7 0.0 26 43 103 120 91 133 0.83 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 3_15 - 902 AAA_22 PF13401.1 131 6.1e-11 37.3 0.0 1 2 3.5e-07 1.6e-05 19.8 0.0 7 99 219 300 213 322 0.71 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 3_15 - 902 AAA_22 PF13401.1 131 6.1e-11 37.3 0.0 2 2 0.00013 0.0062 11.4 0.0 6 113 629 724 625 749 0.80 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 5_7 - 209 AAA_22 PF13401.1 131 3e-05 18.9 0.2 1 1 1.8e-06 8.2e-05 17.5 0.2 3 45 58 95 54 157 0.86 # 3180 # 3806 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 15_3 - 253 AAA_22 PF13401.1 131 9.2e-05 17.4 0.1 1 1 1.4e-05 0.00063 14.7 0.0 3 33 99 129 97 162 0.82 # 3903 # 4661 # -1 # ID=15_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.676 4_2 - 342 AAA_22 PF13401.1 131 0.00013 16.8 0.9 1 1 6.1e-05 0.0028 12.5 0.1 7 26 124 143 118 160 0.83 # 3160 # 4185 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 10_9 - 263 AAA_22 PF13401.1 131 0.00016 16.6 0.3 1 1 5.1e-05 0.0024 12.8 0.3 6 29 102 125 97 204 0.87 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 10_4 - 710 AAA_22 PF13401.1 131 0.00025 16.0 0.3 1 1 9.4e-05 0.0043 11.9 0.3 8 99 502 639 496 668 0.57 # 2366 # 4495 # 1 # ID=10_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.575 2_13 - 437 AAA_22 PF13401.1 131 0.00049 15.0 0.0 1 1 0.00016 0.0075 11.2 0.0 9 108 164 289 159 405 0.83 # 11342 # 12652 # 1 # ID=2_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 3_24 - 1235 AAA_22 PF13401.1 131 0.0019 13.1 0.0 1 1 0.0001 0.0046 11.8 0.0 7 63 116 168 110 254 0.57 # 28981 # 32685 # 1 # ID=3_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.684 5_11 - 403 ATP_bind_1 PF03029.12 238 0.0018 12.6 0.0 1 1 1.1e-05 0.0041 11.4 0.0 6 36 129 159 127 167 0.94 # 8397 # 9605 # -1 # ID=5_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.540 10_4 - 710 PRK PF00485.13 194 0.0014 12.9 0.0 1 2 1.7e-05 0.0062 10.8 0.0 1 22 500 521 500 537 0.88 # 2366 # 4495 # 1 # ID=10_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.575 10_4 - 710 PRK PF00485.13 194 0.0014 12.9 0.0 2 2 0.081 30 -1.2 0.0 130 170 547 590 543 592 0.78 # 2366 # 4495 # 1 # ID=10_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.575 1_52 - 445 DUF927 PF06048.6 286 0.0047 10.9 0.0 1 2 4.6e-05 0.017 9.1 0.0 192 216 53 77 46 86 0.87 # 48436 # 49770 # -1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 1_52 - 445 DUF927 PF06048.6 286 0.0047 10.9 0.0 2 2 0.071 26 -1.4 0.0 48 108 340 401 337 405 0.82 # 48436 # 49770 # -1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 3_15 - 902 SRP54 PF00448.17 196 0.0015 12.7 0.0 1 2 0.018 6.6 0.8 0.0 5 26 220 241 216 250 0.84 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 3_15 - 902 SRP54 PF00448.17 196 0.0015 12.7 0.0 2 2 6.4e-05 0.024 8.8 0.0 3 38 629 664 627 668 0.88 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 1_32 - 271 AAA_15 PF13175.1 415 0.00011 16.0 0.0 1 2 7.5e-05 0.028 8.2 0.0 26 42 39 55 2 82 0.79 # 27374 # 28186 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.617 1_32 - 271 AAA_15 PF13175.1 415 0.00011 16.0 0.0 2 2 0.00034 0.12 6.0 0.0 367 410 159 199 146 200 0.87 # 27374 # 28186 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.617 10_4 - 710 AAA_17 PF13207.1 121 3.3e-07 25.9 0.0 1 1 1.1e-08 6.8e-07 24.9 0.0 1 47 500 551 500 647 0.73 # 2366 # 4495 # 1 # ID=10_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.575 4_2 - 342 AAA_17 PF13207.1 121 1.2e-06 24.1 0.0 1 1 4.7e-08 2.9e-06 22.9 0.0 2 47 124 170 123 322 0.73 # 3160 # 4185 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 3_15 - 902 AAA_17 PF13207.1 121 9.7e-06 21.2 3.3 1 2 0.046 2.9 3.5 0.0 5 23 222 240 220 302 0.75 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 3_15 - 902 AAA_17 PF13207.1 121 9.7e-06 21.2 3.3 2 2 5.8e-06 0.00035 16.1 0.0 2 33 630 666 629 711 0.88 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 10_9 - 263 AAA_17 PF13207.1 121 1.5e-05 20.6 0.3 1 1 8e-07 4.9e-05 18.9 0.1 2 62 103 199 102 240 0.56 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 5_7 - 209 AAA_17 PF13207.1 121 0.0016 14.0 0.3 1 1 8.6e-05 0.0053 12.3 0.3 3 32 63 95 61 191 0.63 # 3180 # 3806 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 3_24 - 1235 AAA_17 PF13207.1 121 0.0016 14.0 0.1 1 1 0.00021 0.013 11.1 0.0 3 32 117 161 116 271 0.53 # 28981 # 32685 # 1 # ID=3_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.684 1_32 - 271 AAA_21 PF13304.1 303 1.9e-13 45.7 0.1 1 1 6.4e-13 7.9e-11 37.1 0.1 4 298 40 200 38 203 0.75 # 27374 # 28186 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.617 1_52 - 445 AAA_21 PF13304.1 303 5.7e-09 31.0 0.1 1 2 1.9e-05 0.0024 12.6 0.1 3 24 58 79 56 117 0.80 # 48436 # 49770 # -1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 1_52 - 445 AAA_21 PF13304.1 303 5.7e-09 31.0 0.1 2 2 1.4e-06 0.00017 16.3 0.0 234 298 153 218 136 221 0.82 # 48436 # 49770 # -1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 10_4 - 710 AAA_21 PF13304.1 303 1.7e-07 26.2 0.0 1 2 5.6e-06 0.00069 14.3 0.0 2 24 501 523 500 578 0.81 # 2366 # 4495 # 1 # ID=10_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.575 10_4 - 710 AAA_21 PF13304.1 303 1.7e-07 26.2 0.0 2 2 0.00013 0.016 9.8 0.0 236 280 608 649 584 665 0.82 # 2366 # 4495 # 1 # ID=10_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.575 3_15 - 902 MobB PF03205.9 140 0.00088 13.7 0.0 1 2 0.0038 0.35 5.3 0.0 5 35 221 250 219 297 0.78 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 3_15 - 902 MobB PF03205.9 140 0.00088 13.7 0.0 2 2 0.0031 0.29 5.6 0.0 3 34 630 661 628 669 0.85 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 15_3 - 253 MobB PF03205.9 140 0.0019 12.6 0.0 1 1 3.7e-05 0.0034 11.8 0.0 3 33 103 133 101 144 0.90 # 3903 # 4661 # -1 # ID=15_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.676 10_4 - 710 MobB PF03205.9 140 0.0021 12.5 0.0 1 1 5.6e-05 0.0052 11.2 0.0 2 22 500 520 499 531 0.82 # 2366 # 4495 # 1 # ID=10_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.575 10_9 - 263 MobB PF03205.9 140 0.0022 12.4 0.0 1 1 3.6e-05 0.0033 11.9 0.0 2 37 102 137 101 188 0.89 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 5_11 - 403 ArsA_ATPase PF02374.10 305 7.4e-10 33.0 0.0 1 1 4.7e-12 1.7e-09 31.8 0.0 9 137 127 257 119 312 0.83 # 8397 # 9605 # -1 # ID=5_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.540 1_32 - 271 Arf PF00025.16 175 0.0014 12.6 0.1 1 3 0.00019 0.069 7.1 0.1 19 35 40 56 30 68 0.90 # 27374 # 28186 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.617 1_32 - 271 Arf PF00025.16 175 0.0014 12.6 0.1 2 3 0.005 1.8 2.5 0.0 117 146 102 131 89 160 0.83 # 27374 # 28186 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.617 1_32 - 271 Arf PF00025.16 175 0.0014 12.6 0.1 3 3 0.09 33 -1.6 0.0 20 35 169 184 145 201 0.76 # 27374 # 28186 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.617 5_7 - 209 PhoH PF02562.11 205 6.3e-06 20.3 0.0 1 1 9.1e-08 1.1e-05 19.5 0.0 14 48 54 88 48 122 0.84 # 3180 # 3806 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 10_9 - 263 PhoH PF02562.11 205 0.00048 14.1 0.1 1 1 7.5e-06 0.00092 13.2 0.0 16 47 97 128 90 165 0.82 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 15_3 - 253 PhoH PF02562.11 205 0.0016 12.4 0.0 1 1 2.2e-05 0.0027 11.7 0.0 15 47 96 128 90 146 0.89 # 3903 # 4661 # -1 # ID=15_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.676 5_7 - 209 AFG1_ATPase PF03969.11 362 7.3e-06 19.7 0.0 1 1 2.4e-08 8.9e-06 19.4 0.0 61 141 58 134 15 148 0.83 # 3180 # 3806 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 11_11 - 769 T2SE PF00437.15 272 3.7e-24 79.8 0.0 1 1 4.7e-26 5.7e-24 79.1 0.0 25 244 354 592 329 613 0.73 # 8014 # 10320 # -1 # ID=11_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.626 10_9 - 263 T2SE PF00437.15 272 0.00025 14.7 0.0 1 1 2.3e-06 0.00028 14.6 0.0 126 158 98 130 25 163 0.86 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 5_7 - 209 T2SE PF00437.15 272 0.00064 13.4 0.0 1 1 8.2e-06 0.001 12.7 0.0 125 147 56 78 14 90 0.78 # 3180 # 3806 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 10_4 - 710 G-alpha PF00503.15 389 0.0043 10.5 0.0 1 1 1.7e-05 0.0064 9.9 0.0 63 88 503 542 500 568 0.69 # 2366 # 4495 # 1 # ID=10_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.575 2_48 - 717 AAA_26 PF13500.1 199 1.1e-29 98.1 0.0 1 1 7.8e-32 2.9e-29 96.8 0.0 1 199 8 218 8 218 0.88 # 44107 # 46257 # -1 # ID=2_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.662 3_15 - 902 Zeta_toxin PF06414.7 201 9.7e-08 26.1 0.1 1 2 0.02 1.9 2.3 0.0 20 40 220 240 204 246 0.79 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 3_15 - 902 Zeta_toxin PF06414.7 201 9.7e-08 26.1 0.1 2 2 8.1e-08 7.4e-06 19.9 0.0 12 58 622 671 610 718 0.84 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 10_9 - 263 Zeta_toxin PF06414.7 201 1.8e-06 21.9 0.1 1 1 3.3e-08 3e-06 21.2 0.1 14 62 98 148 90 239 0.86 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 4_2 - 342 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00022 15.1 0.1 1 1 8.6e-06 0.00079 13.3 0.0 16 45 121 149 106 180 0.80 # 3160 # 4185 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 8_2 - 176 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0014 12.5 0.0 1 1 2.7e-05 0.0025 11.7 0.0 98 135 105 142 102 144 0.94 # 982 # 1509 # 1 # ID=8_2;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.610 2_37 - 411 NAD_binding_8 PF13450.1 68 4.1e-06 21.5 0.0 1 1 3.1e-08 1.1e-05 20.1 0.0 1 27 6 32 6 68 0.80 # 35296 # 36528 # 1 # ID=2_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.663 10_4 - 710 SMC_N PF02463.14 220 1.4e-07 25.7 0.2 1 2 0.0012 0.44 4.5 0.2 25 41 499 515 486 519 0.83 # 2366 # 4495 # 1 # ID=10_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.575 10_4 - 710 SMC_N PF02463.14 220 1.4e-07 25.7 0.2 2 2 8.7e-08 3.2e-05 18.0 0.0 136 213 608 681 602 685 0.88 # 2366 # 4495 # 1 # ID=10_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.575 5_11 - 403 VirC1 PF07015.6 231 1.5e-05 18.9 0.1 1 2 1.5e-07 5.6e-05 17.0 0.0 2 46 119 163 118 183 0.87 # 8397 # 9605 # -1 # ID=5_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.540 5_11 - 403 VirC1 PF07015.6 231 1.5e-05 18.9 0.1 2 2 0.054 20 -1.1 0.0 83 125 246 288 240 302 0.71 # 8397 # 9605 # -1 # ID=5_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.540 5_11 - 403 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.0038 11.2 0.0 1 1 2e-05 0.0074 10.2 0.0 8 42 127 161 122 182 0.90 # 8397 # 9605 # -1 # ID=5_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.540 3_15 - 902 Arch_ATPase PF01637.13 234 1.9e-05 19.2 0.0 1 3 6.3e-05 0.012 10.1 0.0 2 38 198 234 197 247 0.90 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 3_15 - 902 Arch_ATPase PF01637.13 234 1.9e-05 19.2 0.0 2 3 0.0056 1 3.7 0.0 101 134 271 303 260 374 0.74 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 3_15 - 902 Arch_ATPase PF01637.13 234 1.9e-05 19.2 0.0 3 3 0.045 8.4 0.7 0.0 22 44 629 651 623 676 0.67 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 2_13 - 437 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.00062 14.2 0.0 1 1 5.8e-06 0.0011 13.5 0.0 28 126 167 257 146 274 0.65 # 11342 # 12652 # 1 # ID=2_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 3_15 - 902 AAA_16 PF13191.1 185 9.1e-12 40.1 27.2 1 3 1.1e-08 5.3e-07 24.5 0.0 2 49 197 241 196 253 0.86 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 3_15 - 902 AAA_16 PF13191.1 185 9.1e-12 40.1 27.2 2 3 0.00027 0.012 10.3 0.0 126 161 264 299 243 330 0.81 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 3_15 - 902 AAA_16 PF13191.1 185 9.1e-12 40.1 27.2 3 3 9.7e-06 0.00045 15.0 0.0 4 62 601 665 598 679 0.74 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 10_9 - 263 AAA_16 PF13191.1 185 5.5e-05 17.9 1.9 1 1 1.3e-06 6.1e-05 17.8 0.4 25 63 101 139 81 240 0.78 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 5_7 - 209 AAA_16 PF13191.1 185 9e-05 17.3 0.3 1 1 4.1e-06 0.00019 16.2 0.3 25 80 60 117 50 198 0.71 # 3180 # 3806 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 10_4 - 710 AAA_16 PF13191.1 185 0.00033 15.4 0.6 1 1 2.4e-05 0.0011 13.7 0.6 24 172 498 649 488 663 0.48 # 2366 # 4495 # 1 # ID=10_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.575 1_52 - 445 AAA_16 PF13191.1 185 0.0014 13.4 2.7 1 1 3.3e-05 0.0015 13.3 0.0 22 51 52 80 25 200 0.81 # 48436 # 49770 # -1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 15_3 - 253 AAA_16 PF13191.1 185 0.0016 13.2 5.2 1 2 0.00033 0.015 10.0 0.0 22 52 98 131 80 158 0.80 # 3903 # 4661 # -1 # ID=15_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.676 15_3 - 253 AAA_16 PF13191.1 185 0.0016 13.2 5.2 2 2 0.019 0.86 4.3 1.3 140 180 154 194 139 199 0.75 # 3903 # 4661 # -1 # ID=15_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.676 4_2 - 342 AAA_16 PF13191.1 185 0.0032 12.2 3.2 1 1 0.00016 0.0072 11.0 1.7 22 48 119 145 98 333 0.72 # 3160 # 4185 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 3_24 - 1235 AAA_16 PF13191.1 185 0.018 9.8 13.3 1 1 6.1e-05 0.0028 12.4 1.0 25 144 114 237 86 405 0.74 # 28981 # 32685 # 1 # ID=3_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.684 1_32 - 271 AAA_23 PF13476.1 202 0.0025 12.9 0.0 1 1 2.9e-05 0.0036 12.4 0.0 24 43 40 59 24 99 0.88 # 27374 # 28186 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.617 5_7 - 209 AAA_23 PF13476.1 202 0.0042 12.1 0.0 1 1 6.3e-05 0.0077 11.3 0.0 23 39 63 79 57 88 0.90 # 3180 # 3806 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 11_11 - 769 AAA_23 PF13476.1 202 0.0056 11.7 0.0 1 1 7.4e-05 0.0091 11.1 0.0 20 43 470 493 455 540 0.86 # 8014 # 10320 # -1 # ID=11_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.626 10_4 - 710 AAA_18 PF13238.1 129 2.7e-05 19.3 0.0 1 1 8.7e-07 8e-05 17.7 0.0 1 23 501 535 501 595 0.73 # 2366 # 4495 # 1 # ID=10_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.575 3_15 - 902 AAA_18 PF13238.1 129 6.6e-05 18.0 0.1 1 2 0.007 0.64 5.1 0.0 5 22 223 240 221 284 0.85 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 3_15 - 902 AAA_18 PF13238.1 129 6.6e-05 18.0 0.1 2 2 0.00026 0.024 9.7 0.0 2 27 631 663 631 678 0.75 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 10_9 - 263 AAA_18 PF13238.1 129 0.00032 15.8 0.2 1 1 1.3e-05 0.0012 13.9 0.1 1 18 103 120 103 140 0.80 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 4_2 - 342 AAA_18 PF13238.1 129 0.0017 13.4 1.3 1 1 3.7e-05 0.0034 12.4 0.0 2 26 125 149 124 241 0.79 # 3160 # 4185 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 4_29 - 412 AAA_13 PF13166.1 712 0.002 11.4 17.4 1 2 1.4e-05 0.0051 10.0 9.2 339 453 169 290 111 301 0.64 # 22160 # 23395 # 1 # ID=4_29;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.589 4_29 - 412 AAA_13 PF13166.1 712 0.002 11.4 17.4 2 2 2.4e-05 0.0088 9.2 17.1 282 462 182 348 162 387 0.46 # 22160 # 23395 # 1 # ID=4_29;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.589 5_11 - 403 CbiA PF01656.18 195 4.5e-31 102.5 0.0 1 1 5e-33 6.1e-31 102.1 0.0 1 167 121 328 121 352 0.83 # 8397 # 9605 # -1 # ID=5_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.540 10_9 - 263 CbiA PF01656.18 195 0.00096 13.3 0.1 1 1 1.5e-05 0.0018 12.4 0.1 3 33 104 134 102 136 0.91 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 3_15 - 902 CbiA PF01656.18 195 0.003 11.7 0.4 1 1 0.00018 0.022 8.9 0.0 3 33 631 661 629 664 0.86 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 10_9 - 263 KaiC PF06745.8 227 1.2e-05 19.3 0.0 1 1 1.5e-07 1.8e-05 18.7 0.0 17 65 98 145 87 202 0.73 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 5_7 - 209 KaiC PF06745.8 227 0.00026 14.9 0.0 1 1 2.6e-06 0.00032 14.6 0.0 16 64 56 103 40 150 0.84 # 3180 # 3806 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 4_2 - 342 KaiC PF06745.8 227 0.0011 12.9 0.0 1 1 2.7e-05 0.0033 11.3 0.0 13 37 115 139 96 215 0.87 # 3160 # 4185 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 5_7 - 209 AAA_14 PF13173.1 128 0.00027 15.6 0.0 1 1 3.2e-06 0.00039 15.1 0.0 3 71 60 130 58 165 0.69 # 3180 # 3806 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 3_15 - 902 AAA_14 PF13173.1 128 0.00028 15.6 0.0 1 1 2.6e-05 0.0032 12.1 0.0 4 74 629 712 627 734 0.67 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 4_2 - 342 AAA_14 PF13173.1 128 0.0038 11.9 0.0 1 1 5.8e-05 0.0072 11.0 0.0 3 85 122 213 120 246 0.73 # 3160 # 4185 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 2_37 - 411 HI0933_like PF03486.9 409 0.0052 10.0 0.0 1 2 6.5e-05 0.024 7.8 0.0 2 31 3 32 2 37 0.95 # 35296 # 36528 # 1 # ID=2_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.663 2_37 - 411 HI0933_like PF03486.9 409 0.0052 10.0 0.0 2 2 0.023 8.6 -0.6 0.0 112 166 202 254 183 257 0.74 # 35296 # 36528 # 1 # ID=2_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.663 1_32 - 271 AAA_29 PF13555.1 62 1.7e-05 19.0 0.2 1 1 4.9e-07 3e-05 18.3 0.2 16 51 29 63 24 70 0.81 # 27374 # 28186 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.617 10_4 - 710 AAA_29 PF13555.1 62 2.4e-05 18.6 0.0 1 1 9.7e-07 6e-05 17.3 0.0 15 51 491 526 487 532 0.80 # 2366 # 4495 # 1 # ID=10_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.575 11_11 - 769 AAA_29 PF13555.1 62 5.1e-05 17.5 0.0 1 1 1.8e-06 0.00011 16.4 0.0 23 51 469 496 463 507 0.80 # 8014 # 10320 # -1 # ID=11_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.626 1_52 - 445 AAA_29 PF13555.1 62 7.3e-05 17.0 0.3 1 1 4.7e-06 0.00029 15.1 0.1 22 40 53 71 45 89 0.79 # 48436 # 49770 # -1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 3_15 - 902 AAA_29 PF13555.1 62 0.0015 12.9 0.0 1 2 0.076 4.7 1.6 0.0 22 43 215 236 206 240 0.80 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 3_15 - 902 AAA_29 PF13555.1 62 0.0015 12.9 0.0 2 2 0.0007 0.043 8.1 0.0 23 51 628 655 618 664 0.77 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 10_9 - 263 AAA_29 PF13555.1 62 0.0037 11.6 0.0 1 1 0.00012 0.0073 10.6 0.0 22 42 100 119 87 123 0.80 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 2_37 - 411 FAD_binding_2 PF00890.19 417 0.0014 12.2 0.2 1 2 1e-05 0.0037 10.8 0.1 1 41 3 42 3 52 0.83 # 35296 # 36528 # 1 # ID=2_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.663 2_37 - 411 FAD_binding_2 PF00890.19 417 0.0014 12.2 0.2 2 2 0.09 33 -2.2 0.0 155 178 217 244 186 260 0.64 # 35296 # 36528 # 1 # ID=2_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.663 4_2 - 342 AAA PF00004.24 132 1.2e-29 97.9 0.0 1 1 5.7e-31 3.5e-29 96.4 0.0 1 129 124 247 124 250 0.94 # 3160 # 4185 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 3_15 - 902 AAA PF00004.24 132 2.6e-19 64.5 0.0 1 2 3.1e-11 1.9e-09 32.6 0.0 4 96 222 323 220 353 0.72 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 3_15 - 902 AAA PF00004.24 132 2.6e-19 64.5 0.0 2 2 3.8e-10 2.3e-08 29.1 0.0 2 100 631 738 630 765 0.78 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 5_7 - 209 AAA PF00004.24 132 2e-05 19.6 0.0 1 1 6.6e-07 4.1e-05 18.6 0.0 1 68 62 130 62 164 0.71 # 3180 # 3806 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 15_3 - 253 AAA PF00004.24 132 0.00016 16.6 0.0 1 1 4.3e-06 0.00026 15.9 0.0 1 107 103 198 103 241 0.82 # 3903 # 4661 # -1 # ID=15_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.676 10_9 - 263 AAA PF00004.24 132 0.0011 13.9 0.0 1 1 3.2e-05 0.002 13.1 0.0 1 38 103 148 103 173 0.69 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 1_32 - 271 AAA PF00004.24 132 0.0014 13.6 0.2 1 1 0.00033 0.02 9.8 0.2 3 66 40 166 38 199 0.60 # 27374 # 28186 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.617 10_9 - 263 Bac_DnaA PF00308.13 219 6.6e-07 23.9 0.0 1 1 7.9e-09 9.7e-07 23.4 0.0 37 132 103 196 88 205 0.81 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 15_3 - 253 Bac_DnaA PF00308.13 219 1.4e-05 19.6 0.0 1 1 1.7e-07 2.1e-05 19.0 0.0 37 135 103 199 89 203 0.90 # 3903 # 4661 # -1 # ID=15_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.676 5_7 - 209 Bac_DnaA PF00308.13 219 9.6e-05 16.8 0.0 1 1 1.1e-06 0.00013 16.4 0.0 35 133 60 156 44 162 0.83 # 3180 # 3806 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 2_37 - 411 Thi4 PF01946.12 230 0.0014 12.4 0.1 1 1 6e-06 0.0022 11.8 0.1 18 47 2 31 1 49 0.85 # 35296 # 36528 # 1 # ID=2_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.663 3_15 - 902 Sigma54_activat PF00158.21 168 3.4e-06 21.4 0.0 1 2 0.078 7.2 0.8 0.0 22 40 216 234 197 261 0.73 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 3_15 - 902 Sigma54_activat PF00158.21 168 3.4e-06 21.4 0.0 2 2 5.1e-07 4.7e-05 17.7 0.0 4 139 602 744 599 755 0.76 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 10_9 - 263 Sigma54_activat PF00158.21 168 5.4e-06 20.7 0.0 1 1 1.1e-07 1e-05 19.8 0.0 17 57 95 135 87 157 0.79 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 5_7 - 209 Sigma54_activat PF00158.21 168 1.4e-05 19.4 0.0 1 1 3e-07 2.7e-05 18.4 0.0 20 121 57 150 43 159 0.86 # 3180 # 3806 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 15_3 - 253 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.0021 12.3 0.0 1 1 0.0004 0.037 8.2 0.0 20 120 98 190 87 201 0.73 # 3903 # 4661 # -1 # ID=15_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.676 2_37 - 411 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 0.0024 12.7 0.0 1 2 0.00014 0.052 8.3 0.0 1 38 5 40 5 67 0.87 # 35296 # 36528 # 1 # ID=2_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.663 2_37 - 411 Pyr_redox_3 PF13738.1 203 0.0024 12.7 0.0 2 2 0.01 3.7 2.3 0.0 89 138 206 254 141 276 0.85 # 35296 # 36528 # 1 # ID=2_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.663 2_14 - 155 GHMP_kinases_N PF00288.21 67 0.0038 12.1 0.1 1 1 2e-05 0.0074 11.1 0.1 35 60 119 152 96 154 0.68 # 12649 # 13113 # 1 # ID=2_14;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 10_4 - 710 DUF258 PF03193.11 161 0.0016 12.4 0.0 1 1 2.3e-05 0.0028 11.6 0.0 34 57 497 520 479 534 0.79 # 2366 # 4495 # 1 # ID=10_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.575 1_52 - 445 DUF258 PF03193.11 161 0.0018 12.2 0.0 1 1 2.3e-05 0.0028 11.6 0.0 27 57 45 76 25 90 0.79 # 48436 # 49770 # -1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 3_15 - 902 DUF258 PF03193.11 161 0.0021 12.0 0.0 1 2 0.002 0.24 5.3 0.0 19 56 200 237 182 263 0.76 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 3_15 - 902 DUF258 PF03193.11 161 0.0021 12.0 0.0 2 2 0.005 0.62 4.0 0.0 37 49 629 641 598 666 0.88 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 5_11 - 403 AAA_31 PF13614.1 157 5.2e-11 37.5 0.0 1 1 1.4e-12 5.1e-10 34.3 0.0 1 148 119 276 119 281 0.66 # 8397 # 9605 # -1 # ID=5_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.540 4_2 - 342 AAA_33 PF13671.1 143 1.1e-06 23.4 0.0 1 1 1.9e-08 3.5e-06 21.7 0.0 3 47 125 179 124 251 0.72 # 3160 # 4185 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 10_9 - 263 AAA_33 PF13671.1 143 0.00031 15.4 0.0 1 1 2.8e-06 0.00052 14.7 0.0 2 46 103 151 102 202 0.78 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 10_9 - 263 AAA_30 PF13604.1 196 0.00015 16.2 0.1 1 1 1.3e-06 0.00024 15.5 0.1 17 56 99 138 91 155 0.87 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 1_32 - 271 AAA_30 PF13604.1 196 0.0022 12.3 0.1 1 1 3.9e-05 0.0073 10.6 0.1 19 46 36 70 25 93 0.69 # 27374 # 28186 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.617 2_37 - 411 ApbA PF02558.11 151 0.0022 12.2 0.1 1 1 1e-05 0.0038 11.4 0.1 1 28 4 31 4 39 0.94 # 35296 # 36528 # 1 # ID=2_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.663 10_9 - 263 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.0013 13.0 0.0 1 1 9.6e-06 0.0035 11.5 0.0 39 58 95 120 79 133 0.77 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 15_3 - 253 AAA_35 PF14516.1 331 0.0011 12.3 0.0 1 1 5.9e-06 0.0022 11.4 0.0 15 74 84 143 72 162 0.81 # 3903 # 4661 # -1 # ID=15_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.676 6_20 - 98 RBD PF02196.10 71 0.0002 15.9 0.1 1 1 7.7e-07 0.00028 15.4 0.1 18 61 15 59 7 62 0.81 # 10662 # 10955 # -1 # ID=6_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.541 10_4 - 710 ABC_tran PF00005.22 137 5.4e-38 125.1 0.0 1 1 1.2e-39 9e-38 124.4 0.0 1 137 488 637 488 637 0.94 # 2366 # 4495 # 1 # ID=10_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.575 1_52 - 445 ABC_tran PF00005.22 137 8.8e-32 105.0 0.0 1 1 1.7e-33 1.3e-31 104.5 0.0 1 136 44 183 44 184 0.94 # 48436 # 49770 # -1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 1_32 - 271 ABC_tran PF00005.22 137 1.8e-31 104.0 0.0 1 1 3.5e-33 2.6e-31 103.5 0.0 2 136 26 168 25 169 0.97 # 27374 # 28186 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.617 4_2 - 342 ABC_tran PF00005.22 137 0.0028 12.7 0.1 1 1 9.3e-05 0.0068 11.5 0.1 8 34 118 144 114 147 0.90 # 3160 # 4185 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 11_11 - 769 ABC_tran PF00005.22 137 0.0042 12.2 0.0 1 1 0.00012 0.009 11.1 0.0 11 42 469 499 463 582 0.76 # 8014 # 10320 # -1 # ID=11_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.626 2_13 - 437 ATP-synt_ab PF00006.20 215 2e-71 234.6 0.0 1 1 7.9e-74 2.9e-71 234.1 0.0 1 215 145 355 145 355 1.00 # 11342 # 12652 # 1 # ID=2_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 2_37 - 411 UDPG_MGDP_dh_N PF03721.9 185 0.00028 15.1 0.1 1 1 1.2e-06 0.00043 14.4 0.1 2 30 3 31 2 34 0.93 # 35296 # 36528 # 1 # ID=2_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.663 10_9 - 263 DAP3 PF10236.4 309 0.00059 13.5 0.0 1 1 2.5e-06 0.00091 12.9 0.0 21 84 98 160 84 168 0.79 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 4_2 - 342 RuvB_N PF05496.7 234 2e-06 21.7 0.0 1 2 0.02 7.3 0.3 0.0 21 47 30 56 10 62 0.78 # 3160 # 4185 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 4_2 - 342 RuvB_N PF05496.7 234 2e-06 21.7 0.0 2 2 5.1e-08 1.9e-05 18.5 0.0 51 79 122 150 85 193 0.75 # 3160 # 4185 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 3_15 - 902 AAA_19 PF13245.1 76 5.3e-06 20.9 0.1 1 2 5.1e-05 0.0047 11.5 0.2 8 37 215 242 208 264 0.74 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 3_15 - 902 AAA_19 PF13245.1 76 5.3e-06 20.9 0.1 2 2 5.8e-08 5.3e-06 20.9 0.1 11 49 628 662 612 681 0.87 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 4_2 - 342 AAA_19 PF13245.1 76 1.5e-05 19.5 0.0 1 1 7.2e-07 6.7e-05 17.4 0.0 10 34 122 145 111 190 0.76 # 3160 # 4185 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 10_9 - 263 AAA_19 PF13245.1 76 1.5e-05 19.4 0.0 1 1 3.2e-07 2.9e-05 18.5 0.0 13 62 103 149 91 185 0.80 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 5_7 - 209 AAA_19 PF13245.1 76 0.00014 16.3 0.1 1 1 4.1e-06 0.00038 15.0 0.0 13 48 62 93 54 122 0.75 # 3180 # 3806 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 10_4 - 710 AAA_10 PF12846.2 304 0.00028 15.1 0.0 1 1 3.5e-05 0.0021 12.2 0.0 6 33 503 530 499 542 0.80 # 2366 # 4495 # 1 # ID=10_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.575 3_15 - 902 AAA_10 PF12846.2 304 0.00039 14.6 0.1 1 3 0.073 4.5 1.3 0.0 3 24 218 239 216 249 0.79 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 3_15 - 902 AAA_10 PF12846.2 304 0.00039 14.6 0.1 2 3 0.038 2.3 2.2 0.0 212 236 283 304 273 317 0.80 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 3_15 - 902 AAA_10 PF12846.2 304 0.00039 14.6 0.1 3 3 0.008 0.49 4.5 0.0 4 93 630 749 628 856 0.65 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 15_3 - 253 AAA_10 PF12846.2 304 0.0005 14.3 0.0 1 1 1.1e-05 0.00067 13.9 0.0 2 35 101 134 100 245 0.68 # 3903 # 4661 # -1 # ID=15_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.676 2_13 - 437 AAA_10 PF12846.2 304 0.001 13.2 0.0 1 1 5.9e-05 0.0036 11.5 0.0 6 48 164 212 160 373 0.61 # 11342 # 12652 # 1 # ID=2_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 5_11 - 403 AAA_10 PF12846.2 304 0.0013 12.9 0.0 1 1 3.3e-05 0.002 12.3 0.0 11 47 129 167 127 197 0.89 # 8397 # 9605 # -1 # ID=5_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.540 10_9 - 263 AAA_10 PF12846.2 304 0.0018 12.5 0.5 1 1 0.00015 0.009 10.2 0.0 4 35 103 134 101 200 0.85 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 1_35 - 81 Mqo PF06039.10 489 0.0053 9.6 0.0 1 1 1.4e-05 0.0053 9.6 0.0 376 407 36 67 5 73 0.90 # 30930 # 31172 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 2_37 - 411 DAO PF01266.19 358 6.5e-56 184.4 0.0 1 1 2e-58 7.3e-56 184.3 0.0 1 358 3 392 3 392 0.95 # 35296 # 36528 # 1 # ID=2_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.663 3_15 - 902 ResIII PF04851.10 184 1.3e-05 19.8 0.0 1 3 0.095 7 1.2 0.0 13 51 205 242 178 255 0.78 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 3_15 - 902 ResIII PF04851.10 184 1.3e-05 19.8 0.0 2 3 0.067 4.9 1.6 0.0 146 159 288 301 263 332 0.78 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 3_15 - 902 ResIII PF04851.10 184 1.3e-05 19.8 0.0 3 3 3.4e-05 0.0025 12.4 0.0 7 61 601 665 598 672 0.84 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 5_7 - 209 ResIII PF04851.10 184 5.4e-05 17.8 0.0 1 1 9.8e-07 7.2e-05 17.4 0.0 21 49 40 83 13 106 0.75 # 3180 # 3806 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 15_3 - 253 ResIII PF04851.10 184 0.00037 15.1 0.0 1 1 6.4e-06 0.00047 14.8 0.0 23 49 98 124 36 167 0.85 # 3903 # 4661 # -1 # ID=15_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.676 4_2 - 342 ResIII PF04851.10 184 0.00051 14.6 0.0 1 1 1.6e-05 0.0011 13.5 0.0 22 57 107 152 94 188 0.71 # 3160 # 4185 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 10_9 - 263 ResIII PF04851.10 184 0.0019 12.8 0.0 1 1 3.6e-05 0.0026 12.3 0.0 16 60 72 137 45 161 0.74 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 10_9 - 263 DUF2075 PF09848.4 352 0.0051 10.5 0.0 1 1 1.8e-05 0.0065 10.2 0.0 2 52 101 148 100 184 0.71 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 3_15 - 902 TIP49 PF06068.8 398 9.8e-05 15.9 0.0 1 3 0.059 7.2 -0.1 0.0 55 79 221 246 203 254 0.80 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 3_15 - 902 TIP49 PF06068.8 398 9.8e-05 15.9 0.0 2 3 0.011 1.4 2.2 0.0 258 290 268 300 263 301 0.88 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 3_15 - 902 TIP49 PF06068.8 398 9.8e-05 15.9 0.0 3 3 8.8e-05 0.011 9.2 0.0 53 88 630 666 620 674 0.84 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 4_2 - 342 TIP49 PF06068.8 398 0.00075 13.0 1.0 1 2 2.3e-05 0.0028 11.1 0.0 43 78 113 149 87 172 0.81 # 3160 # 4185 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 4_2 - 342 TIP49 PF06068.8 398 0.00075 13.0 1.0 2 2 0.057 7 -0.1 0.3 94 127 279 312 275 328 0.75 # 3160 # 4185 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 10_9 - 263 TIP49 PF06068.8 398 0.0048 10.3 0.0 1 1 5.5e-05 0.0067 9.8 0.0 52 88 102 139 92 147 0.75 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 2_37 - 411 NAD_binding_9 PF13454.1 156 7.6e-06 20.5 0.1 1 2 0.00022 0.08 7.5 0.0 1 74 5 89 5 113 0.76 # 35296 # 36528 # 1 # ID=2_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.663 2_37 - 411 NAD_binding_9 PF13454.1 156 7.6e-06 20.5 0.1 2 2 1.8e-05 0.0068 10.9 0.1 115 155 212 252 199 253 0.83 # 35296 # 36528 # 1 # ID=2_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.663 15_3 - 253 DEAD PF00270.24 169 0.0013 13.0 0.0 1 1 5.2e-06 0.0019 12.4 0.0 10 42 96 128 90 225 0.80 # 3903 # 4661 # -1 # ID=15_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.676 15_3 - 253 DUF815 PF05673.8 250 0.00014 15.6 0.0 1 1 2.1e-06 0.00026 14.7 0.0 54 133 101 188 88 198 0.85 # 3903 # 4661 # -1 # ID=15_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.676 5_7 - 209 DUF815 PF05673.8 250 0.00038 14.2 0.0 1 1 3.8e-06 0.00046 13.9 0.0 51 136 57 150 8 158 0.76 # 3180 # 3806 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 10_9 - 263 DUF815 PF05673.8 250 0.0017 12.1 0.0 1 1 1.9e-05 0.0023 11.6 0.0 55 94 102 141 90 197 0.81 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 2_37 - 411 Pyr_redox PF00070.22 80 6.9e-05 18.0 0.0 1 1 7.3e-07 0.00027 16.1 0.0 2 30 4 32 3 34 0.93 # 35296 # 36528 # 1 # ID=2_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.663 4_2 - 342 AAA_11 PF13086.1 236 0.00059 14.2 0.0 1 1 3.1e-06 0.0011 13.3 0.0 13 75 117 302 97 338 0.58 # 3160 # 4185 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 4_5 - 366 Guanylate_kin PF00625.16 183 0.0011 13.1 0.1 1 1 5.8e-06 0.0022 12.2 0.1 137 177 244 284 236 291 0.88 # 5562 # 6659 # -1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.562 5_7 - 209 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 1.1e-05 20.3 0.0 1 1 1.3e-07 1.6e-05 19.7 0.0 19 125 57 180 44 191 0.72 # 3180 # 3806 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 15_3 - 253 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 7.4e-05 17.6 0.0 1 1 1.1e-06 0.00014 16.7 0.0 19 113 98 206 81 227 0.73 # 3903 # 4661 # -1 # ID=15_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.676 10_9 - 263 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.0019 13.0 0.0 1 1 2.9e-05 0.0035 12.1 0.0 20 47 99 126 92 171 0.79 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 2_37 - 411 Amino_oxidase PF01593.19 450 0.00094 13.0 0.0 1 2 0.0055 2 2.0 0.0 3 22 13 32 13 34 0.96 # 35296 # 36528 # 1 # ID=2_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.663 2_37 - 411 Amino_oxidase PF01593.19 450 0.00094 13.0 0.0 2 2 4.5e-05 0.017 8.9 0.0 182 260 175 250 46 254 0.67 # 35296 # 36528 # 1 # ID=2_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.663 10_4 - 710 ArgK PF03308.11 267 0.00077 13.0 0.0 1 1 3.9e-06 0.0014 12.1 0.0 15 62 484 531 479 565 0.82 # 2366 # 4495 # 1 # ID=10_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.575 11_11 - 769 PIF1 PF05970.9 364 0.0041 10.8 0.0 1 1 1.7e-05 0.0064 10.2 0.0 12 51 459 498 453 504 0.88 # 8014 # 10320 # -1 # ID=11_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.626 16_5 - 249 PB1 PF00564.19 84 0.0036 11.7 0.0 1 1 3.8e-05 0.014 9.9 0.0 16 56 122 163 111 164 0.84 # 4475 # 5221 # 1 # ID=16_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 10_9 - 263 RNA_helicase PF00910.17 107 9.7e-05 17.3 0.0 1 1 1.4e-06 0.00018 16.5 0.0 1 72 103 185 103 196 0.82 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 3_15 - 902 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00046 15.1 0.0 1 2 0.0033 0.4 5.7 0.0 3 23 221 241 220 251 0.88 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 3_15 - 902 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00046 15.1 0.0 2 2 0.0035 0.43 5.6 0.0 2 23 631 652 630 671 0.82 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 4_2 - 342 RNA_helicase PF00910.17 107 0.0013 13.7 0.0 1 1 2e-05 0.0024 12.8 0.0 2 81 125 212 124 230 0.79 # 3160 # 4185 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 1_32 - 271 UPF0079 PF02367.12 123 0.0019 12.6 0.0 1 1 8.6e-06 0.0032 11.9 0.0 9 53 29 74 14 84 0.78 # 27374 # 28186 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.617 4_2 - 342 AAA_24 PF13479.1 213 0.002 12.5 0.1 1 1 1.7e-05 0.0063 10.8 0.0 5 28 123 150 121 156 0.80 # 3160 # 4185 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 3_15 - 902 NACHT PF05729.7 166 8.6e-06 20.2 0.0 1 2 8.9e-06 0.0011 13.4 0.0 6 32 222 248 219 335 0.66 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 3_15 - 902 NACHT PF05729.7 166 8.6e-06 20.2 0.0 2 2 0.018 2.2 2.6 0.0 3 24 630 651 628 678 0.76 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 10_9 - 263 NACHT PF05729.7 166 0.00095 13.6 0.5 1 1 1.8e-05 0.0022 12.4 0.3 3 28 103 128 102 171 0.80 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 4_2 - 342 NACHT PF05729.7 166 0.0016 12.9 0.2 1 2 0.00045 0.056 7.8 0.1 2 23 123 144 122 148 0.83 # 3160 # 4185 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 4_2 - 342 NACHT PF05729.7 166 0.0016 12.9 0.2 2 2 0.028 3.5 2.0 0.0 53 125 153 224 148 238 0.74 # 3160 # 4185 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 10_9 - 263 AAA_25 PF13481.1 194 6.4e-08 26.9 0.1 1 1 2.5e-09 1.3e-07 25.9 0.1 27 94 94 147 77 202 0.65 # 9214 # 10002 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.643 3_15 - 902 AAA_25 PF13481.1 194 7.5e-07 23.5 8.8 1 2 7.8e-06 0.00041 14.5 0.1 37 115 220 299 201 328 0.73 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 3_15 - 902 AAA_25 PF13481.1 194 7.5e-07 23.5 8.8 2 2 0.00064 0.034 8.3 0.0 29 56 624 650 595 668 0.82 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 15_3 - 253 AAA_25 PF13481.1 194 1.7e-06 22.3 0.2 1 1 6.9e-08 3.6e-06 21.2 0.2 24 110 91 172 81 234 0.64 # 3903 # 4661 # -1 # ID=15_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.676 4_2 - 342 AAA_25 PF13481.1 194 7.6e-05 16.9 0.3 1 1 4.2e-06 0.00022 15.4 0.1 27 56 116 144 90 208 0.86 # 3160 # 4185 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 5_7 - 209 AAA_25 PF13481.1 194 0.00026 15.2 0.4 1 1 8.8e-06 0.00046 14.4 0.4 28 59 54 85 31 197 0.77 # 3180 # 3806 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 1_52 - 445 AAA_25 PF13481.1 194 0.00046 14.4 0.2 1 1 2.7e-05 0.0014 12.8 0.1 14 74 33 101 21 106 0.69 # 48436 # 49770 # -1 # ID=1_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 10_4 - 710 AAA_25 PF13481.1 194 0.0018 12.4 0.1 1 1 0.00014 0.0075 10.4 0.0 30 50 495 515 477 521 0.87 # 2366 # 4495 # 1 # ID=10_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.575 4_2 - 342 AAA_28 PF13521.1 163 0.00093 13.9 0.1 1 1 1.6e-05 0.0029 12.3 0.0 2 27 124 150 123 188 0.79 # 3160 # 4185 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 5_7 - 209 AAA_28 PF13521.1 163 0.0017 13.0 0.0 1 1 1.8e-05 0.0033 12.1 0.0 3 48 63 113 61 143 0.81 # 3180 # 3806 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 3_15 - 902 AAA_5 PF07728.9 139 9e-15 49.4 0.0 1 2 0.001 0.074 7.5 0.0 5 23 222 240 219 253 0.84 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 3_15 - 902 AAA_5 PF07728.9 139 9e-15 49.4 0.0 2 2 2.5e-13 1.9e-11 38.6 0.0 2 113 630 747 629 774 0.81 # 15632 # 18337 # 1 # ID=3_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 4_2 - 342 AAA_5 PF07728.9 139 2e-06 22.4 0.8 1 1 1e-07 7.3e-06 20.5 0.1 2 36 124 158 123 174 0.92 # 3160 # 4185 # -1 # ID=4_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 5_7 - 209 AAA_5 PF07728.9 139 0.00073 14.0 0.1 1 1 1.8e-05 0.0013 13.2 0.1 1 48 61 105 61 155 0.64 # 3180 # 3806 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 15_3 - 253 AAA_5 PF07728.9 139 0.0013 13.2 0.0 1 1 5.9e-05 0.0043 11.5 0.0 1 93 102 191 102 199 0.87 # 3903 # 4661 # -1 # ID=15_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.676 11_11 - 769 AAA_5 PF07728.9 139 0.003 12.0 0.0 1 1 0.00012 0.009 10.5 0.0 3 26 473 496 471 509 0.83 # 8014 # 10320 # -1 # ID=11_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.626 5_7 - 209 APS_kinase PF01583.15 157 0.0011 13.4 0.0 1 1 5.4e-06 0.002 12.5 0.0 5 36 62 93 58 121 0.85 # 3180 # 3806 # 1 # ID=5_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b2 (February 2015) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/27dcd7bc-a303-4338-a1e8-bc71c1ba5879 # Target file: checkm_output/bins/pGCA_001524445.2.assembled/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pGCA_001524445.2.assembled/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/27dcd7bc-a303-4338-a1e8-bc71c1ba5879 checkm_output/bins/pGCA_001524445.2.assembled/genes.faa # Current dir: /mnt/DGK_KLIF/data/klif/reads-for-assembly/trainingsets2/combined/rfplasmid_combined_jellynew2 # Date: Tue Jul 7 16:44:21 2020 # [ok]