# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_21 - 598 IstB_IS21 PF01695.12 178 2.4e-06 19.1 0.0 1 2 1.1e-06 5.8e-05 14.6 0.0 46 85 32 71 27 92 0.86 # 17789 # 19582 # 1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.269 1_21 - 598 IstB_IS21 PF01695.12 178 2.4e-06 19.1 0.0 2 2 0.012 0.66 1.4 0.0 98 140 110 160 98 187 0.71 # 17789 # 19582 # 1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.269 1_48 - 640 AIG1 PF04548.11 212 0.00015 12.9 0.0 1 1 6.6e-06 0.00036 11.7 0.0 32 62 51 81 43 108 0.84 # 41066 # 42985 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 1_29 - 142 SSB PF00436.20 104 3e-28 89.9 0.2 1 1 7.1e-30 3.8e-28 89.5 0.2 1 102 1 102 1 104 0.98 # 25492 # 25917 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.326 1_37 - 331 DUF87 PF01935.12 229 5.9e-05 15.0 0.1 1 1 2.2e-06 0.00012 14.0 0.1 28 48 165 185 157 193 0.84 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_37 - 331 Septin PF00735.13 281 4e-05 14.7 0.0 1 1 2.3e-06 6.3e-05 14.1 0.0 6 29 162 185 158 209 0.80 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_48 - 640 Septin PF00735.13 281 0.00015 12.9 0.1 1 1 9.7e-06 0.00026 12.0 0.1 7 77 6 82 3 91 0.68 # 41066 # 42985 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 1_37 - 331 AAA_22 PF13401.1 131 1e-05 17.7 0.0 1 1 3.9e-07 2.1e-05 16.7 0.0 4 41 160 208 156 256 0.70 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_37 - 331 ATP_bind_1 PF03029.12 238 0.00012 13.6 0.0 1 1 3.7e-06 0.0002 13.0 0.0 1 23 165 187 165 193 0.87 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_37 - 331 PRK PF00485.13 194 0.00033 12.3 0.0 1 1 1.2e-05 0.00062 11.4 0.0 2 24 163 185 162 221 0.83 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_37 - 331 AAA_17 PF13207.1 121 4.8e-06 19.5 0.1 1 1 2.2e-07 1.2e-05 18.2 0.1 2 49 163 207 162 303 0.82 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_48 - 640 Miro PF08477.8 119 1.1e-05 18.0 0.0 1 1 4.4e-07 2.4e-05 16.9 0.0 9 119 13 131 5 131 0.75 # 41066 # 42985 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 1_37 - 331 MobB PF03205.9 140 3.2e-05 15.7 0.6 1 2 2.2e-06 0.00012 13.8 0.0 3 27 163 187 161 199 0.81 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_37 - 331 MobB PF03205.9 140 3.2e-05 15.7 0.6 2 2 0.074 4 -0.8 0.1 20 44 296 320 294 321 0.80 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_8 - 1933 Helicase_C PF00271.26 78 1.4e-07 23.4 0.3 1 2 0.055 3 -0.1 0.0 14 40 1079 1105 1065 1107 0.84 # 4374 # 10172 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.297 1_8 - 1933 Helicase_C PF00271.26 78 1.4e-07 23.4 0.3 2 2 4.2e-08 2.3e-06 19.5 0.0 12 78 1516 1584 1509 1584 0.86 # 4374 # 10172 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.297 1_37 - 331 T2SE PF00437.15 272 1.8e-63 206.0 0.0 1 1 3.8e-65 2e-63 205.8 0.0 5 269 13 312 9 315 0.94 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_37 - 331 Zeta_toxin PF06414.7 201 6.7e-05 14.1 0.0 1 1 2e-06 0.00011 13.4 0.0 17 49 161 194 146 218 0.85 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_37 - 331 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.00014 13.6 0.0 1 1 4.1e-06 0.00022 13.0 0.0 23 81 163 225 151 273 0.83 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_37 - 331 AAA_16 PF13191.1 185 2.6e-05 16.3 0.0 1 1 6.4e-07 3.5e-05 15.9 0.0 24 81 160 234 144 305 0.76 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_37 - 331 AAA_23 PF13476.1 202 0.0021 10.4 6.5 1 2 0.09 4.8 -0.6 0.3 106 106 110 110 7 158 0.50 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_37 - 331 AAA_23 PF13476.1 202 0.0021 10.4 6.5 2 2 8.7e-06 0.00047 12.5 1.5 22 37 163 178 160 184 0.89 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_49 - 153 AAA_18 PF13238.1 129 2.7e-08 26.2 0.0 1 1 1.4e-09 3.8e-08 25.8 0.0 47 120 27 104 4 117 0.78 # 43718 # 44176 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.394 1_37 - 331 AAA_18 PF13238.1 129 0.00016 14.1 1.3 1 1 9.9e-06 0.00027 13.3 0.0 1 18 163 180 163 227 0.76 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_6 - 187 CbiA PF01656.18 195 1.9e-08 25.9 0.1 1 2 6.4e-07 3.5e-05 15.3 0.0 1 24 3 26 3 32 0.92 # 3499 # 4059 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.253 1_6 - 187 CbiA PF01656.18 195 1.9e-08 25.9 0.1 2 2 5.1e-05 0.0028 9.1 0.0 95 178 54 131 29 151 0.68 # 3499 # 4059 # 1 # ID=1_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.253 1_21 - 598 KaiC PF06745.8 227 2.2e-05 15.7 0.0 1 2 1.9e-06 0.0001 13.5 0.0 16 71 30 84 23 214 0.85 # 17789 # 19582 # 1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.269 1_21 - 598 KaiC PF06745.8 227 2.2e-05 15.7 0.0 2 2 0.086 4.6 -1.7 0.0 133 156 329 352 322 358 0.85 # 17789 # 19582 # 1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.269 1_37 - 331 AAA_14 PF13173.1 128 2.6e-05 16.2 0.1 1 1 2.2e-06 0.00012 14.0 0.0 2 54 160 211 159 254 0.75 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_37 - 331 GvpD PF07088.6 484 0.00025 11.4 0.0 1 1 6.1e-06 0.00033 11.0 0.0 8 42 158 192 150 258 0.83 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_48 - 640 TIGR03594 TIGR03594 432 3.3e-08 24.6 0.3 1 3 0.044 2.4 -1.3 0.0 176 211 4 42 2 50 0.74 # 41066 # 42985 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 1_48 - 640 TIGR03594 TIGR03594 432 3.3e-08 24.6 0.3 2 3 2e-08 1.1e-06 19.6 0.1 31 123 51 135 47 154 0.87 # 41066 # 42985 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 1_48 - 640 TIGR03594 TIGR03594 432 3.3e-08 24.6 0.3 3 3 0.006 0.33 1.5 0.0 304 347 196 239 187 265 0.79 # 41066 # 42985 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 1_37 - 331 AAA_29 PF13555.1 62 2.5e-05 15.8 0.0 1 1 1.1e-06 5.9e-05 14.6 0.0 22 40 159 177 142 184 0.85 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_21 - 598 AAA PF00004.24 132 3.8e-05 15.9 0.1 1 2 1.7e-05 0.00092 11.5 0.0 2 105 37 166 36 177 0.66 # 17789 # 19582 # 1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.269 1_21 - 598 AAA PF00004.24 132 3.8e-05 15.9 0.1 2 2 0.025 1.4 1.2 0.0 47 74 411 434 377 459 0.70 # 17789 # 19582 # 1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.269 1_37 - 331 Sigma54_activat PF00158.21 168 5.4e-05 14.8 0.0 1 1 2.1e-06 0.00012 13.7 0.0 11 43 149 181 142 198 0.84 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_48 - 640 MMR_HSR1 PF01926.18 116 2.5e-08 26.0 0.1 1 1 8.6e-10 4.7e-08 25.1 0.1 4 116 8 129 5 129 0.68 # 41066 # 42985 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 1_38 - 568 TraG-D_C PF12696.2 128 2.2e-28 90.7 0.0 1 1 1.7e-29 9e-28 88.8 0.0 2 127 370 492 369 493 0.89 # 32160 # 33863 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.317 1_37 - 331 NTPase_1 PF03266.10 168 0.00037 12.2 0.1 1 1 1.3e-05 0.00072 11.3 0.1 1 23 162 184 162 192 0.88 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_49 - 153 AAA_33 PF13671.1 143 8e-08 24.3 0.0 1 1 2.1e-09 1.1e-07 23.8 0.0 46 127 26 106 3 117 0.76 # 43718 # 44176 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.394 1_21 - 598 DnaB_C PF03796.10 259 3.4e-06 18.1 0.0 1 1 2e-07 1.1e-05 16.5 0.0 13 117 27 136 21 157 0.79 # 17789 # 19582 # 1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.269 1_8 - 1933 Methyltransf_26 PF13659.1 117 3.1e-13 41.9 0.0 1 1 1.8e-14 9.5e-13 40.3 0.0 3 116 312 422 310 423 0.84 # 4374 # 10172 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.297 1_37 - 331 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 8.7e-08 23.9 0.0 1 1 2.7e-09 1.4e-07 23.1 0.0 39 59 157 181 132 187 0.81 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_8 - 1933 MTS PF05175.9 170 2.8e-05 15.6 0.0 1 1 1.5e-06 8e-05 14.1 0.0 31 142 309 423 302 443 0.75 # 4374 # 10172 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.297 1_1 - 267 VirE PF05272.6 198 0.00034 12.1 0.1 1 1 1.1e-05 0.0006 11.3 0.1 44 117 122 197 96 198 0.81 # 111 # 911 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.483 1_37 - 331 ABC_tran PF00005.22 137 1.8e-07 23.6 0.0 1 1 6.9e-09 3.7e-07 22.6 0.0 4 50 153 200 151 226 0.84 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_8 - 1933 Eco57I PF07669.6 106 7e-08 24.9 0.3 1 1 1.3e-09 7e-08 24.9 0.3 3 104 372 473 370 475 0.83 # 4374 # 10172 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.297 1_26 - 923 AAA_10 PF12846.2 304 2.8e-38 124.0 1.7 1 1 3.8e-39 6.8e-38 122.8 0.4 2 301 546 843 545 845 0.84 # 21460 # 24228 # 1 # ID=1_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.293 1_37 - 331 AAA_10 PF12846.2 304 3.1e-06 18.8 0.0 1 1 2e-07 3.7e-06 18.6 0.0 2 37 161 196 160 323 0.79 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_38 - 568 AAA_10 PF12846.2 304 0.00012 13.5 0.0 1 1 1.2e-05 0.00021 12.8 0.0 27 302 113 454 91 455 0.72 # 32160 # 33863 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.317 1_8 - 1933 ResIII PF04851.10 184 2.8e-10 32.3 9.7 1 1 1e-11 2.8e-10 32.3 9.7 2 161 1000 1196 999 1243 0.57 # 4374 # 10172 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.297 1_37 - 331 ResIII PF04851.10 184 4e-05 15.5 0.0 1 1 2.9e-06 7.9e-05 14.6 0.0 3 64 145 201 140 237 0.70 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_48 - 640 GTP_EFTU_D2 PF03144.20 74 3.5e-09 28.8 0.0 1 1 1.3e-10 7.2e-09 27.8 0.0 3 60 265 316 263 323 0.90 # 41066 # 42985 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 1_8 - 1933 DEAD PF00270.24 169 1.2e-08 26.7 0.7 1 2 6.2e-08 1.7e-06 19.7 0.1 2 107 1004 1110 1003 1245 0.78 # 4374 # 10172 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.297 1_8 - 1933 DEAD PF00270.24 169 1.2e-08 26.7 0.7 2 2 0.07 1.9 -0.0 0.0 120 148 1886 1919 1844 1926 0.70 # 4374 # 10172 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.297 1_37 - 331 DEAD PF00270.24 169 5e-06 18.1 0.0 1 1 3.4e-07 9.3e-06 17.2 0.0 3 69 149 212 147 243 0.69 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_38 - 568 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 2.2e-20 64.6 0.0 1 2 1.1e-05 0.00029 11.5 0.0 43 150 115 234 89 261 0.70 # 32160 # 33863 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.317 1_38 - 568 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 2.2e-20 64.6 0.0 2 2 1e-17 2.8e-16 51.1 0.0 185 380 309 506 270 508 0.84 # 32160 # 33863 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.317 1_37 - 331 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 0.00011 12.9 0.0 1 1 5.8e-06 0.00016 12.4 0.0 16 42 161 187 153 217 0.85 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_49 - 153 CPT PF07931.7 174 1.1e-08 26.9 0.0 1 1 2.4e-10 1.3e-08 26.7 0.0 59 172 26 143 5 145 0.80 # 43718 # 44176 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.394 1_38 - 568 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 2.2e-108 354.7 0.1 1 1 5.6e-110 3e-108 354.3 0.1 3 460 58 527 46 535 0.88 # 32160 # 33863 # 1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.317 1_48 - 640 GTP_EFTU PF00009.22 188 1.2e-59 192.9 0.4 1 1 3.2e-61 1.7e-59 192.4 0.4 2 185 2 237 1 240 0.92 # 41066 # 42985 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 1_37 - 331 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00011 14.4 0.0 1 1 5.8e-06 0.00032 13.0 0.0 1 23 163 185 163 224 0.79 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_37 - 331 UPF0079 PF02367.12 123 1.5e-05 16.7 0.0 1 1 5.3e-07 2.8e-05 15.8 0.0 8 42 153 187 147 205 0.85 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_48 - 640 EFG_IV PF03764.13 120 6.8e-26 82.3 0.0 1 1 3.5e-27 1.9e-25 80.8 0.0 1 120 416 532 416 532 0.98 # 41066 # 42985 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 1_37 - 331 AAA_24 PF13479.1 213 0.00014 13.5 0.0 1 1 4.9e-06 0.00026 12.6 0.0 5 33 162 188 159 217 0.84 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_37 - 331 NACHT PF05729.7 166 1.8e-05 16.4 0.0 1 1 5.9e-07 3.2e-05 15.7 0.0 3 22 163 182 161 188 0.89 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_21 - 598 AAA_25 PF13481.1 194 2e-21 68.3 0.0 1 1 1.4e-22 3.7e-21 67.4 0.0 30 193 30 175 20 176 0.90 # 17789 # 19582 # 1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.269 1_37 - 331 AAA_25 PF13481.1 194 0.00014 13.3 0.0 1 1 7.7e-06 0.00021 12.8 0.0 26 56 154 183 128 200 0.76 # 31060 # 32052 # 1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_8 - 1933 SNF2_N PF00176.18 299 4.2e-21 67.0 4.6 1 3 1.7e-22 9.2e-21 65.8 0.4 24 204 1015 1275 955 1336 0.76 # 4374 # 10172 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.297 1_8 - 1933 SNF2_N PF00176.18 299 4.2e-21 67.0 4.6 2 3 0.0096 0.52 1.0 0.1 194 286 1462 1558 1445 1567 0.73 # 4374 # 10172 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.297 1_8 - 1933 SNF2_N PF00176.18 299 4.2e-21 67.0 4.6 3 3 0.063 3.4 -1.7 0.0 123 151 1873 1902 1837 1921 0.75 # 4374 # 10172 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.297 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b2 (February 2015) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/54bd0eba-575b-4974-84a9-57fbf8b3ce78 # Target file: checkm_output/bins/pGCA_000583775.1.assembled/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pGCA_000583775.1.assembled/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/54bd0eba-575b-4974-84a9-57fbf8b3ce78 checkm_output/bins/pGCA_000583775.1.assembled/genes.faa # Current dir: /mnt/DGK_KLIF/data/klif/reads-for-assembly/trainingsets2/combined/rfplasmid_combined_jellynew2 # Date: Tue Jul 7 16:41:44 2020 # [ok]