# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_69 - 250 Methyltransf_12 PF08242.7 99 0.00029 14.3 0.0 1 1 1.1e-05 0.00059 13.3 0.0 1 58 61 112 61 154 0.75 # 55009 # 55758 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AATAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.233 1_21 - 195 Methyltransf_12 PF08242.7 99 0.00061 13.3 1.0 1 2 0.0092 0.47 4.0 0.1 47 93 35 81 9 84 0.65 # 13334 # 13918 # 1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=13bp;gc_cont=0.356 1_21 - 195 Methyltransf_12 PF08242.7 99 0.00061 13.3 1.0 2 2 0.00046 0.024 8.1 0.1 19 72 116 169 103 182 0.85 # 13334 # 13918 # 1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=13bp;gc_cont=0.356 1_4 - 84 RNA_pol_L_2 PF13656.1 77 0.00014 14.3 0.1 1 2 8.3e-06 0.00086 11.7 0.0 25 38 14 27 3 32 0.87 # 1785 # 2036 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.310 1_4 - 84 RNA_pol_L_2 PF13656.1 77 0.00014 14.3 0.1 2 2 0.025 2.6 0.6 0.0 4 34 44 76 41 80 0.71 # 1785 # 2036 # 1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.310 1_39 - 179 cobW PF02492.14 178 0.0014 11.1 0.9 1 2 0.0056 0.57 2.5 0.0 84 103 25 44 11 52 0.79 # 29383 # 29919 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 1_39 - 179 cobW PF02492.14 178 0.0014 11.1 0.9 2 2 0.00021 0.022 7.1 0.5 4 37 52 86 49 125 0.84 # 29383 # 29919 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 1_39 - 179 IstB_IS21 PF01695.12 178 2.4e-05 16.7 0.0 1 1 3.7e-07 3.8e-05 16.1 0.0 40 136 41 144 7 157 0.66 # 29383 # 29919 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 1_69 - 250 Methyltransf_18 PF12847.2 112 4.5e-06 20.2 0.0 1 1 7.5e-08 7.7e-06 19.5 0.0 2 58 57 109 56 162 0.66 # 55009 # 55758 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AATAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.233 1_39 - 179 AAA_2 PF07724.9 171 0.00069 12.5 0.3 1 1 6.7e-06 0.00069 12.5 0.3 3 76 48 126 46 127 0.80 # 29383 # 29919 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 1_17 - 388 DUF87 PF01935.12 229 2.5e-08 26.9 0.1 1 1 6.4e-09 1.7e-07 24.2 0.0 23 50 141 168 123 184 0.90 # 9328 # 10491 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=12bp;gc_cont=0.353 1_39 - 179 DUF87 PF01935.12 229 3.2e-07 23.3 0.0 1 1 1.7e-08 4.4e-07 22.9 0.0 26 86 51 114 48 162 0.70 # 29383 # 29919 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 1_49 - 853 DUF87 PF01935.12 229 5.5e-06 19.3 0.8 1 1 8.6e-07 2.2e-05 17.3 0.1 30 63 495 527 490 697 0.83 # 36785 # 39343 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.393 1_42 - 908 DUF87 PF01935.12 229 8e-06 18.7 0.9 1 1 1.2e-06 3.2e-05 16.8 0.0 20 228 374 620 354 621 0.73 # 30551 # 33274 # 1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.394 1_17 - 388 AAA_22 PF13401.1 131 2.5e-06 20.6 0.0 1 1 2e-07 5.2e-06 19.6 0.0 6 113 143 271 138 290 0.72 # 9328 # 10491 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=12bp;gc_cont=0.353 1_76 - 231 AAA_22 PF13401.1 131 1.5e-05 18.1 0.0 1 1 1.1e-06 2.8e-05 17.2 0.0 7 58 62 116 56 158 0.73 # 63334 # 64026 # 1 # ID=1_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=10bp;gc_cont=0.333 1_42 - 908 AAA_22 PF13401.1 131 1.7e-05 17.9 0.0 1 1 7.2e-06 0.00019 14.6 0.0 4 27 377 400 376 517 0.88 # 30551 # 33274 # 1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.394 1_72 - 298 AAA_22 PF13401.1 131 3.7e-05 16.8 0.3 1 1 5.7e-06 0.00015 14.9 0.3 5 122 27 184 23 189 0.58 # 57767 # 58660 # 1 # ID=1_72;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.310 1_69 - 250 Methyltransf_11 PF08241.7 95 1.6e-05 18.4 0.0 1 1 3.1e-07 3.2e-05 17.4 0.0 1 94 61 156 61 157 0.72 # 55009 # 55758 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AATAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.233 1_76 - 231 PRK PF00485.13 194 5.7e-05 15.7 0.0 1 1 1.8e-06 0.00019 14.0 0.0 2 30 62 90 61 112 0.80 # 63334 # 64026 # 1 # ID=1_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=10bp;gc_cont=0.333 1_46 - 344 XS PF03468.9 116 0.00024 14.0 0.1 1 1 7.5e-06 0.00077 12.4 0.1 16 83 228 293 221 311 0.79 # 34942 # 35973 # 1 # ID=1_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.397 1_76 - 231 AAA_17 PF13207.1 121 1.2e-07 25.5 0.1 1 1 6.6e-09 2.3e-07 24.6 0.1 1 101 61 162 61 191 0.63 # 63334 # 64026 # 1 # ID=1_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=10bp;gc_cont=0.333 1_42 - 908 AAA_17 PF13207.1 121 0.0002 15.2 0.0 1 1 2.8e-05 0.00096 12.9 0.0 4 22 382 400 381 477 0.65 # 30551 # 33274 # 1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.394 1_72 - 298 AAA_17 PF13207.1 121 0.00083 13.2 0.1 1 1 6.4e-05 0.0022 11.8 0.1 2 63 29 115 28 203 0.75 # 57767 # 58660 # 1 # ID=1_72;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.310 1_72 - 298 AAA_21 PF13304.1 303 8.1e-11 35.3 11.3 1 2 1.1e-11 1.1e-09 31.6 5.7 3 297 30 186 28 189 0.78 # 57767 # 58660 # 1 # ID=1_72;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.310 1_72 - 298 AAA_21 PF13304.1 303 8.1e-11 35.3 11.3 2 2 0.087 8.9 -1.0 0.2 40 79 234 273 204 292 0.60 # 57767 # 58660 # 1 # ID=1_72;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.310 1_39 - 179 Miro PF08477.8 119 0.00025 14.5 0.0 1 1 3.8e-06 0.0004 13.9 0.0 2 79 51 124 50 152 0.77 # 29383 # 29919 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 1_39 - 179 MobB PF03205.9 140 0.00022 13.9 0.1 1 1 8.3e-06 0.00043 13.0 0.1 3 127 51 154 49 166 0.75 # 29383 # 29919 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 1_76 - 231 MobB PF03205.9 140 0.00076 12.2 1.2 1 2 0.00019 0.0099 8.5 0.0 3 20 62 79 60 90 0.82 # 63334 # 64026 # 1 # ID=1_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=10bp;gc_cont=0.333 1_76 - 231 MobB PF03205.9 140 0.00076 12.2 1.2 2 2 0.021 1.1 1.9 0.1 85 109 117 143 93 170 0.65 # 63334 # 64026 # 1 # ID=1_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=10bp;gc_cont=0.333 1_5 - 145 Prok_Ub PF14454.1 65 0.0006 12.4 0.0 1 1 8.6e-06 0.00089 11.9 0.0 13 46 25 57 20 72 0.81 # 2059 # 2493 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.382 1_39 - 179 AFG1_ATPase PF03969.11 362 0.00038 12.2 1.3 1 2 0.00049 0.051 5.2 0.3 66 91 52 77 37 128 0.65 # 29383 # 29919 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 1_39 - 179 AFG1_ATPase PF03969.11 362 0.00038 12.2 1.3 2 2 0.00019 0.02 6.6 0.0 303 335 133 165 102 173 0.86 # 29383 # 29919 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 1_39 - 179 T2SE PF00437.15 272 2.4e-06 19.5 0.1 1 1 5.4e-08 2.8e-06 19.3 0.1 127 168 47 88 23 126 0.78 # 29383 # 29919 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 1_17 - 388 T2SE PF00437.15 272 0.00012 13.9 0.0 1 1 7.2e-06 0.00037 12.3 0.0 128 154 141 167 77 176 0.77 # 9328 # 10491 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=12bp;gc_cont=0.353 1_76 - 231 G-alpha PF00503.15 389 8.4e-06 17.6 1.1 1 2 2.8e-07 2.9e-05 15.8 0.1 51 84 52 85 48 117 0.83 # 63334 # 64026 # 1 # ID=1_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=10bp;gc_cont=0.333 1_76 - 231 G-alpha PF00503.15 389 8.4e-06 17.6 1.1 2 2 0.013 1.3 0.5 0.1 189 228 140 209 124 225 0.66 # 63334 # 64026 # 1 # ID=1_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=10bp;gc_cont=0.333 1_17 - 388 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00012 14.2 0.0 1 1 5.8e-06 0.0002 13.4 0.0 19 94 144 220 134 238 0.81 # 9328 # 10491 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=12bp;gc_cont=0.353 1_76 - 231 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00022 13.3 0.0 1 1 1.2e-05 0.0004 12.4 0.0 12 55 55 96 46 156 0.83 # 63334 # 64026 # 1 # ID=1_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=10bp;gc_cont=0.333 1_72 - 298 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00047 12.2 0.0 1 1 2.2e-05 0.00076 11.5 0.0 21 45 31 56 15 81 0.81 # 57767 # 58660 # 1 # ID=1_72;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.310 1_72 - 298 SMC_N PF02463.14 220 1.4e-05 17.3 0.4 1 2 0.00013 0.013 7.6 0.1 16 49 17 51 3 61 0.69 # 57767 # 58660 # 1 # ID=1_72;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.310 1_72 - 298 SMC_N PF02463.14 220 1.4e-05 17.3 0.4 2 2 9.5e-05 0.0098 8.0 0.0 116 205 102 194 83 206 0.75 # 57767 # 58660 # 1 # ID=1_72;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.310 1_17 - 388 Arch_ATPase PF01637.13 234 8.1e-06 18.6 0.1 1 1 1.5e-07 1.6e-05 17.7 0.1 20 131 141 257 132 271 0.68 # 9328 # 10491 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=12bp;gc_cont=0.353 1_17 - 388 AAA_16 PF13191.1 185 7.8e-06 18.9 0.0 1 1 2.6e-07 1.3e-05 18.2 0.0 22 57 139 175 128 261 0.82 # 9328 # 10491 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=12bp;gc_cont=0.353 1_76 - 231 AAA_16 PF13191.1 185 1.7e-05 17.8 0.0 1 1 4.2e-07 2.1e-05 17.5 0.0 26 78 61 116 58 185 0.80 # 63334 # 64026 # 1 # ID=1_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=10bp;gc_cont=0.333 1_17 - 388 AAA_23 PF13476.1 202 2.3e-06 21.0 0.0 1 1 2.4e-07 6.2e-06 19.6 0.0 22 172 144 350 134 386 0.51 # 9328 # 10491 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=12bp;gc_cont=0.353 1_72 - 298 AAA_23 PF13476.1 202 9e-06 19.1 8.8 1 1 1.2e-06 3.1e-05 17.3 8.8 4 68 10 78 8 291 0.60 # 57767 # 58660 # 1 # ID=1_72;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.310 1_76 - 231 AAA_23 PF13476.1 202 0.00016 14.9 0.3 1 1 9.9e-06 0.00025 14.3 0.3 21 106 61 174 56 225 0.61 # 63334 # 64026 # 1 # ID=1_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=10bp;gc_cont=0.333 1_42 - 908 AAA_23 PF13476.1 202 0.0046 10.2 6.7 1 2 0.06 1.5 2.0 0.0 72 129 197 249 163 272 0.77 # 30551 # 33274 # 1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.394 1_42 - 908 AAA_23 PF13476.1 202 0.0046 10.2 6.7 2 2 0.0025 0.066 6.4 0.0 23 36 381 394 365 401 0.85 # 30551 # 33274 # 1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.394 1_76 - 231 AAA_18 PF13238.1 129 1.2e-07 25.1 0.2 1 1 5.3e-09 2.7e-07 23.9 0.2 1 90 62 141 62 181 0.72 # 63334 # 64026 # 1 # ID=1_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=10bp;gc_cont=0.333 1_42 - 908 AAA_18 PF13238.1 129 3.6e-05 17.0 0.0 1 1 2.8e-06 0.00014 15.1 0.0 2 42 381 440 381 480 0.74 # 30551 # 33274 # 1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.394 1_71 - 241 adh_short PF00106.20 167 2.4e-14 46.5 0.0 1 1 2.9e-16 3e-14 46.2 0.0 3 162 4 157 2 162 0.87 # 57028 # 57750 # 1 # ID=1_71;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.270 1_69 - 250 Methyltransf_25 PF13649.1 101 1.2e-05 18.6 0.0 1 1 2.1e-07 2.2e-05 17.8 0.0 1 94 60 146 60 153 0.83 # 55009 # 55758 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AATAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.233 1_76 - 231 AAA_14 PF13173.1 128 0.00018 14.4 0.5 1 1 3.2e-06 0.00033 13.5 0.4 4 98 61 160 58 175 0.71 # 63334 # 64026 # 1 # ID=1_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=10bp;gc_cont=0.333 1_92 - 68 CSD PF00313.17 66 1.3e-32 104.4 2.0 1 1 1.4e-34 1.4e-32 104.3 2.0 2 65 3 65 2 66 0.98 # 74986 # 75189 # 1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.407 1_72 - 298 AAA_29 PF13555.1 62 4e-06 19.3 0.1 1 1 3.9e-07 8.1e-06 18.3 0.1 13 51 17 54 9 62 0.83 # 57767 # 58660 # 1 # ID=1_72;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.310 1_17 - 388 AAA_29 PF13555.1 62 2.4e-05 16.8 0.0 1 1 2.3e-06 4.7e-05 15.9 0.0 20 45 138 163 128 172 0.80 # 9328 # 10491 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=12bp;gc_cont=0.353 1_76 - 231 AAA_29 PF13555.1 62 6.1e-05 15.5 0.0 1 1 6e-06 0.00012 14.5 0.0 25 45 61 81 44 93 0.72 # 63334 # 64026 # 1 # ID=1_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=10bp;gc_cont=0.333 1_39 - 179 AAA_29 PF13555.1 62 0.00025 13.5 0.1 1 1 2.1e-05 0.00043 12.8 0.1 14 53 39 78 26 82 0.81 # 29383 # 29919 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 1_42 - 908 AAA_29 PF13555.1 62 0.00069 12.1 0.0 1 1 7.2e-05 0.0015 11.1 0.0 26 39 380 393 366 397 0.85 # 30551 # 33274 # 1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.394 1_39 - 179 Bac_DnaA PF00308.13 219 8.5e-07 21.7 0.1 1 1 3e-08 3.1e-06 19.9 0.1 27 145 31 164 15 172 0.75 # 29383 # 29919 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 1_71 - 241 KR PF08659.5 181 0.00038 13.1 0.0 1 1 5.7e-06 0.00058 12.5 0.0 59 158 51 152 31 158 0.88 # 57028 # 57750 # 1 # ID=1_71;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.270 1_76 - 231 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00027 13.4 0.0 1 1 8.1e-06 0.00042 12.8 0.0 17 43 54 80 43 126 0.81 # 63334 # 64026 # 1 # ID=1_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=10bp;gc_cont=0.333 1_17 - 388 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00055 12.4 0.0 1 1 2e-05 0.001 11.5 0.0 20 45 139 164 128 182 0.79 # 9328 # 10491 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=12bp;gc_cont=0.353 1_49 - 853 DUF258 PF03193.11 161 0.00019 13.6 0.0 1 1 1.2e-05 0.00041 12.5 0.0 9 56 462 509 456 529 0.84 # 36785 # 39343 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.393 1_76 - 231 DUF258 PF03193.11 161 0.00071 11.7 0.0 1 1 2.8e-05 0.00095 11.3 0.0 31 57 55 81 37 156 0.85 # 63334 # 64026 # 1 # ID=1_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=10bp;gc_cont=0.333 1_72 - 298 DUF258 PF03193.11 161 0.00093 11.3 0.7 1 1 8.4e-05 0.0029 9.8 0.0 19 57 9 48 1 92 0.81 # 57767 # 58660 # 1 # ID=1_72;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.310 2_3 - 151 mRNA_cap_C PF03919.10 105 9.3e-05 15.7 0.5 1 1 1.1e-06 0.00011 15.5 0.5 41 76 71 115 25 146 0.60 # 674 # 1126 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAAAAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.252 1_76 - 231 AAA_33 PF13671.1 143 1.6e-08 27.5 0.0 1 1 2.3e-10 2.4e-08 26.9 0.0 1 125 61 177 61 190 0.77 # 63334 # 64026 # 1 # ID=1_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=10bp;gc_cont=0.333 1_76 - 231 KTI12 PF08433.5 270 7.5e-05 14.9 0.0 1 1 1.2e-06 0.00013 14.2 0.0 3 28 61 94 59 153 0.80 # 63334 # 64026 # 1 # ID=1_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=10bp;gc_cont=0.333 1_69 - 250 Methyltransf_26 PF13659.1 117 0.0012 11.8 0.0 1 1 2.9e-05 0.003 10.6 0.0 2 31 58 86 57 90 0.93 # 55009 # 55758 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AATAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.233 1_39 - 179 AAA_30 PF13604.1 196 0.0011 11.6 0.1 1 1 1.6e-05 0.0017 10.9 0.1 17 102 47 127 41 152 0.71 # 29383 # 29919 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 1_92 - 68 OB_RNB PF08206.6 58 2.3e-05 16.9 0.5 1 1 3e-07 3.1e-05 16.4 0.5 7 29 12 33 4 35 0.85 # 74986 # 75189 # 1 # ID=1_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.407 1_17 - 388 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 1.1e-30 99.6 0.0 1 1 4.4e-32 1.5e-30 99.1 0.0 17 204 118 288 107 289 0.94 # 9328 # 10491 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=12bp;gc_cont=0.353 1_39 - 179 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 3.2e-05 16.4 0.1 1 2 3.7e-06 0.00013 14.5 0.1 16 64 25 74 12 94 0.77 # 29383 # 29919 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 1_39 - 179 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 3.2e-05 16.4 0.1 2 2 0.053 1.8 0.9 0.0 126 172 77 136 65 151 0.74 # 29383 # 29919 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 1_42 - 908 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00087 11.7 0.0 1 1 5.7e-05 0.0019 10.6 0.0 39 63 375 402 342 411 0.80 # 30551 # 33274 # 1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.394 1_25 - 298 Ribosomal_L9_C PF03948.9 87 0.00013 15.0 0.2 1 1 3.5e-06 0.00036 13.6 0.2 6 44 54 92 50 98 0.91 # 16145 # 17038 # -1 # ID=1_25;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=TATAA;rbs_spacer=4bp;gc_cont=0.332 1_72 - 298 ABC_tran PF00005.22 137 2.8e-32 104.8 0.2 1 1 1.8e-33 4.5e-32 104.2 0.2 1 136 16 156 16 157 0.96 # 57767 # 58660 # 1 # ID=1_72;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.310 1_39 - 179 ABC_tran PF00005.22 137 1.7e-05 18.1 0.0 1 1 9e-07 2.3e-05 17.7 0.0 10 80 47 122 42 167 0.80 # 29383 # 29919 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 1_17 - 388 ABC_tran PF00005.22 137 4.1e-05 16.9 0.0 1 1 2.9e-06 7.5e-05 16.0 0.0 14 39 144 169 139 293 0.80 # 9328 # 10491 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=12bp;gc_cont=0.353 1_76 - 231 ABC_tran PF00005.22 137 0.00053 13.3 0.3 1 1 3.3e-05 0.00084 12.6 0.3 14 35 62 83 55 221 0.88 # 63334 # 64026 # 1 # ID=1_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=10bp;gc_cont=0.333 1_49 - 853 AAA_10 PF12846.2 304 1.9e-39 128.8 0.0 1 1 1.5e-40 3.9e-39 127.8 0.0 3 303 490 796 488 797 0.88 # 36785 # 39343 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.393 1_42 - 908 AAA_10 PF12846.2 304 2.5e-11 36.4 0.0 1 1 1.8e-12 4.6e-11 35.6 0.0 3 299 379 707 377 710 0.68 # 30551 # 33274 # 1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.394 1_17 - 388 AAA_10 PF12846.2 304 4.1e-09 29.2 0.1 1 2 1.8e-05 0.00045 12.6 0.0 2 27 142 167 141 215 0.72 # 9328 # 10491 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=12bp;gc_cont=0.353 1_17 - 388 AAA_10 PF12846.2 304 4.1e-09 29.2 0.1 2 2 4.3e-06 0.00011 14.6 0.0 216 264 239 288 204 308 0.79 # 9328 # 10491 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=12bp;gc_cont=0.353 1_39 - 179 AAA_10 PF12846.2 304 9e-09 28.1 0.1 1 1 6.8e-10 1.8e-08 27.1 0.1 1 59 48 105 48 151 0.89 # 29383 # 29919 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 1_71 - 241 adh_short_C2 PF13561.1 241 5.4e-24 78.2 0.0 1 1 6.2e-26 6.4e-24 77.9 0.0 50 241 51 238 32 238 0.90 # 57028 # 57750 # 1 # ID=1_71;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.270 1_72 - 298 SbcCD_C PF13558.1 90 0.00033 13.5 0.0 1 1 7.7e-06 0.00079 12.3 0.0 62 83 145 166 124 172 0.84 # 57767 # 58660 # 1 # ID=1_72;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.310 1_39 - 179 ResIII PF04851.10 184 0.0007 12.4 2.0 1 2 0.0001 0.011 8.6 1.0 22 47 36 70 15 115 0.76 # 29383 # 29919 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 1_39 - 179 ResIII PF04851.10 184 0.0007 12.4 2.0 2 2 0.0039 0.4 3.4 0.1 143 163 115 135 72 162 0.59 # 29383 # 29919 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 1_69 - 250 Methyltransf_31 PF13847.1 152 5.8e-05 15.7 0.9 1 2 1.8e-06 0.00019 14.0 0.2 4 112 57 161 55 191 0.71 # 55009 # 55758 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AATAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.233 1_69 - 250 Methyltransf_31 PF13847.1 152 5.8e-05 15.7 0.9 2 2 0.064 6.6 -0.7 0.0 49 83 205 240 196 248 0.66 # 55009 # 55758 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AATAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.233 1_39 - 179 Viral_helicase1 PF01443.13 234 0.00025 13.5 0.0 1 1 3.2e-06 0.00033 13.1 0.0 1 74 51 130 51 153 0.75 # 29383 # 29919 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 1_39 - 179 DUF2075 PF09848.4 352 1.3e-07 23.7 0.0 1 1 1.7e-09 1.7e-07 23.4 0.0 3 98 50 133 48 162 0.80 # 29383 # 29919 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 1_71 - 241 Epimerase PF01370.16 236 5.1e-06 19.0 0.0 1 1 2.8e-07 2.8e-05 16.5 0.0 1 93 4 105 4 233 0.84 # 57028 # 57750 # 1 # ID=1_71;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.270 1_39 - 179 DEAD PF00270.24 169 0.00038 12.9 1.6 1 2 0.00024 0.025 7.0 0.6 13 33 47 67 36 83 0.75 # 29383 # 29919 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 1_39 - 179 DEAD PF00270.24 169 0.00038 12.9 1.6 2 2 0.0006 0.061 5.7 0.1 92 134 94 133 65 159 0.63 # 29383 # 29919 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 1_17 - 388 DUF815 PF05673.8 250 4.2e-05 15.5 0.0 1 1 1.4e-06 7.4e-05 14.7 0.0 52 82 140 176 129 199 0.77 # 9328 # 10491 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=12bp;gc_cont=0.353 1_39 - 179 DUF815 PF05673.8 250 0.00063 11.6 0.0 1 1 1.8e-05 0.00091 11.1 0.0 45 78 40 73 19 83 0.84 # 29383 # 29919 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 1_39 - 179 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 7.2e-09 27.6 0.1 1 1 4e-10 1e-08 27.1 0.1 13 57 46 90 40 101 0.91 # 29383 # 29919 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 1_49 - 853 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 3.2e-06 18.9 0.0 1 1 2.5e-07 6.6e-06 17.8 0.0 11 55 484 528 478 531 0.92 # 36785 # 39343 # 1 # ID=1_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.393 1_17 - 388 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.9e-05 16.3 0.0 1 2 2.8e-05 0.00072 11.1 0.0 12 42 138 168 132 172 0.88 # 9328 # 10491 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=12bp;gc_cont=0.353 1_17 - 388 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.9e-05 16.3 0.0 2 2 0.0081 0.21 3.0 0.0 245 281 246 286 201 289 0.85 # 9328 # 10491 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=12bp;gc_cont=0.353 1_42 - 908 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 4.6e-05 15.1 0.1 1 2 5e-05 0.0013 10.3 0.0 7 40 369 402 365 407 0.88 # 30551 # 33274 # 1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.394 1_42 - 908 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 4.6e-05 15.1 0.1 2 2 0.025 0.64 1.4 0.0 248 287 638 677 570 703 0.79 # 30551 # 33274 # 1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.394 1_76 - 231 CPT PF07931.7 174 0.00013 14.5 0.0 1 1 2.2e-06 0.00023 13.7 0.0 3 29 61 87 59 106 0.90 # 63334 # 64026 # 1 # ID=1_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=10bp;gc_cont=0.333 1_69 - 250 TIGR00755 TIGR00755 256 7.3e-05 14.8 0.0 1 1 1.1e-06 0.00011 14.2 0.0 27 85 54 113 30 125 0.79 # 55009 # 55758 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AATAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.233 1_17 - 388 Pox_A32 PF04665.7 241 2.1e-05 16.8 0.1 1 1 4.2e-07 4.4e-05 15.8 0.1 15 82 143 214 131 230 0.81 # 9328 # 10491 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=12bp;gc_cont=0.353 1_69 - 250 Methyltransf_23 PF13489.1 161 5.5e-09 28.9 0.0 1 1 3.7e-10 3.9e-08 26.1 0.0 18 60 51 107 31 160 0.75 # 55009 # 55758 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AATAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.233 1_17 - 388 Gtr1_RagA PF04670.7 232 0.00065 11.8 0.0 1 1 1.2e-05 0.0012 10.9 0.0 2 26 144 168 143 207 0.79 # 9328 # 10491 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=12bp;gc_cont=0.353 1_76 - 231 RNA_helicase PF00910.17 107 0.0002 14.5 0.0 1 1 1.7e-05 0.00057 13.0 0.0 1 26 62 87 62 163 0.76 # 63334 # 64026 # 1 # ID=1_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=10bp;gc_cont=0.333 1_17 - 388 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00031 13.9 0.0 1 1 2e-05 0.0007 12.7 0.0 2 44 145 187 144 215 0.73 # 9328 # 10491 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=12bp;gc_cont=0.353 1_39 - 179 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00067 12.8 0.9 1 1 3.4e-05 0.0012 12.0 0.2 1 44 51 108 51 145 0.63 # 29383 # 29919 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 1_72 - 298 UPF0079 PF02367.12 123 0.00013 14.6 0.1 1 1 4.3e-06 0.00044 12.8 0.0 8 39 19 50 13 71 0.87 # 57767 # 58660 # 1 # ID=1_72;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.310 1_76 - 231 NACHT PF05729.7 166 0.00014 14.5 0.0 1 1 5.2e-06 0.00027 13.6 0.0 2 25 61 84 60 94 0.88 # 63334 # 64026 # 1 # ID=1_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=10bp;gc_cont=0.333 1_39 - 179 NACHT PF05729.7 166 0.00032 13.3 0.5 1 1 1.3e-05 0.00068 12.3 0.5 3 29 51 77 49 82 0.85 # 29383 # 29919 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 1_42 - 908 AAA_25 PF13481.1 194 6.1e-05 15.4 0.0 1 1 3.5e-06 0.00018 13.9 0.0 36 140 380 482 365 487 0.66 # 30551 # 33274 # 1 # ID=1_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.394 1_17 - 388 AAA_25 PF13481.1 194 0.00023 13.5 0.0 1 1 6.6e-06 0.00034 13.0 0.0 36 117 144 223 130 259 0.75 # 9328 # 10491 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=12bp;gc_cont=0.353 1_69 - 250 Methyltransf_4 PF02390.12 197 0.00017 13.6 0.0 1 1 2.8e-06 0.00029 12.8 0.0 14 77 51 111 26 125 0.79 # 55009 # 55758 # 1 # ID=1_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AATAA;rbs_spacer=3bp;gc_cont=0.233 1_39 - 179 AAA_5 PF07728.9 139 0.00015 14.4 0.2 1 1 1.1e-05 0.00036 13.2 0.2 2 91 51 144 50 165 0.78 # 29383 # 29919 # 1 # ID=1_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 1_76 - 231 AAA_5 PF07728.9 139 0.00076 12.2 0.0 1 1 3.2e-05 0.0011 11.6 0.0 2 28 62 88 61 157 0.85 # 63334 # 64026 # 1 # ID=1_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=10bp;gc_cont=0.333 1_17 - 388 AAA_5 PF07728.9 139 0.00086 12.0 0.1 1 1 5.2e-05 0.0018 11.0 0.1 1 24 143 168 143 240 0.85 # 9328 # 10491 # 1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=12bp;gc_cont=0.353 1_76 - 231 APS_kinase PF01583.15 157 0.00024 13.7 0.0 1 1 2.8e-06 0.00029 13.5 0.0 3 29 60 86 58 167 0.87 # 63334 # 64026 # 1 # ID=1_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=10bp;gc_cont=0.333 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b2 (February 2015) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/7c7f9a8c-fa0d-4d06-88ac-bd4136b6ebae # Target file: checkm_output/bins/pGCA_000496285.1.assembled/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pGCA_000496285.1.assembled/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/7c7f9a8c-fa0d-4d06-88ac-bd4136b6ebae checkm_output/bins/pGCA_000496285.1.assembled/genes.faa # Current dir: /mnt/DGK_KLIF/data/klif/reads-for-assembly/trainingsets2/combined/rfplasmid_combined_jellynew2 # Date: Tue Jul 7 16:41:31 2020 # [ok]