# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_48 - 705 Mg_chelatase PF01078.16 207 1.2e-07 23.1 0.5 1 2 2.4e-05 0.0013 9.9 0.0 18 75 114 171 96 201 0.81 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 Mg_chelatase PF01078.16 207 1.2e-07 23.1 0.5 2 2 0.00012 0.0066 7.6 0.1 25 43 452 470 449 581 0.91 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_50 - 240 Torsin PF06309.6 127 1.1e-05 17.4 0.2 1 1 1.4e-06 3.8e-05 15.6 0.1 55 89 74 106 59 121 0.81 # 45759 # 46478 # 1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.328 1_48 - 705 Torsin PF06309.6 127 5.6e-05 15.1 0.2 1 1 2.2e-05 0.00059 11.8 0.0 12 78 407 474 401 483 0.81 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_4 - 260 IstB_IS21 PF01695.12 178 1.2e-62 202.5 0.0 1 1 6.9e-64 1.9e-62 201.9 0.0 3 177 64 238 62 239 0.98 # 3610 # 4389 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_48 - 705 IstB_IS21 PF01695.12 178 2e-08 25.9 0.1 1 2 2.3e-05 0.00063 11.2 0.0 44 72 115 143 101 150 0.80 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 IstB_IS21 PF01695.12 178 2e-08 25.9 0.1 2 2 1.9e-05 0.00052 11.5 0.0 50 71 452 473 448 499 0.84 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_54 - 349 MipZ PF09140.6 261 7.9e-09 26.9 1.3 1 2 4.3e-06 0.00011 13.3 0.3 1 41 48 89 48 130 0.80 # 48620 # 49666 # -1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.299 1_54 - 349 MipZ PF09140.6 261 7.9e-09 26.9 1.3 2 2 6.7e-06 0.00018 12.6 0.0 79 125 149 195 132 199 0.90 # 48620 # 49666 # -1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.299 1_50 - 240 MipZ PF09140.6 261 0.00018 12.7 0.1 1 1 1.7e-05 0.00046 11.3 0.0 7 39 76 108 70 114 0.89 # 45759 # 46478 # 1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.328 1_54 - 349 YhjQ PF06564.7 244 0.0001 13.7 0.0 1 1 4.3e-06 0.00023 12.5 0.0 10 149 56 200 49 226 0.70 # 48620 # 49666 # -1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.299 1_44 - 589 DEAD_2 PF06733.10 174 3.6e-05 15.3 0.5 1 1 1.6e-06 8.8e-05 14.0 0.5 65 140 56 133 49 142 0.77 # 37183 # 38949 # 1 # ID=1_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.293 1_48 - 705 AAA_2 PF07724.9 171 3.2e-50 162.4 5.6 1 3 2.8e-07 1.5e-05 17.0 0.2 3 109 118 230 116 248 0.84 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_2 PF07724.9 171 3.2e-50 162.4 5.6 2 3 0.074 4 -0.7 0.6 30 42 366 378 316 433 0.60 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_2 PF07724.9 171 3.2e-50 162.4 5.6 3 3 5e-47 2.7e-45 146.4 0.0 2 169 448 606 447 608 0.97 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_21 - 618 DUF87 PF01935.12 229 1.3e-24 79.3 5.6 1 2 9e-25 4.9e-23 74.1 1.2 3 188 141 329 139 348 0.77 # 16260 # 18113 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 1_21 - 618 DUF87 PF01935.12 229 1.3e-24 79.3 5.6 2 2 0.00026 0.014 7.2 0.3 134 229 377 465 333 465 0.57 # 16260 # 18113 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 1_48 - 705 NB-ARC PF00931.17 287 2.6e-06 18.5 0.8 1 3 0.00057 0.031 5.1 0.1 1 36 102 135 102 146 0.83 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 NB-ARC PF00931.17 287 2.6e-06 18.5 0.8 2 3 0.0028 0.15 2.8 0.1 81 116 354 394 319 404 0.75 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 NB-ARC PF00931.17 287 2.6e-06 18.5 0.8 3 3 0.00019 0.01 6.7 0.0 22 110 452 531 435 551 0.69 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_22 PF13401.1 131 2.4e-14 45.7 0.8 1 2 1.2e-07 3.3e-06 19.3 0.0 3 99 117 202 114 258 0.87 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_22 PF13401.1 131 2.4e-14 45.7 0.8 2 2 9.2e-09 2.5e-07 23.0 0.0 5 113 450 547 446 566 0.83 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_4 - 260 AAA_22 PF13401.1 131 6.1e-07 21.7 0.2 1 2 0.00013 0.0036 9.5 0.1 7 21 111 125 106 134 0.87 # 3610 # 4389 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_4 - 260 AAA_22 PF13401.1 131 6.1e-07 21.7 0.2 2 2 0.00021 0.0057 8.8 0.0 73 113 145 196 126 213 0.68 # 3610 # 4389 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_48 - 705 MutS_V PF00488.16 235 0.00045 11.7 0.6 1 1 3.2e-05 0.0017 9.8 0.0 108 159 104 155 90 201 0.76 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 SRP54 PF00448.17 196 8.1e-05 14.1 3.1 1 2 0.00069 0.037 5.4 0.0 3 26 120 143 118 166 0.88 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 SRP54 PF00448.17 196 8.1e-05 14.1 3.1 2 2 0.00014 0.0073 7.8 0.0 4 24 452 472 450 497 0.82 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 DNA_pol3_delta2 PF13177.1 162 4.7e-06 18.4 0.7 1 3 0.0012 0.065 4.9 0.0 13 51 112 150 103 204 0.84 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 DNA_pol3_delta2 PF13177.1 162 4.7e-06 18.4 0.7 2 3 0.052 2.8 -0.4 0.4 65 111 326 384 268 394 0.67 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 DNA_pol3_delta2 PF13177.1 162 4.7e-06 18.4 0.7 3 3 7.4e-05 0.004 8.9 0.0 21 124 451 544 423 549 0.67 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_3 PF07726.6 131 6.9e-08 24.2 0.3 1 2 0.0078 0.42 2.3 0.0 3 24 122 143 120 153 0.86 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_3 PF07726.6 131 6.9e-08 24.2 0.3 2 2 7.8e-08 4.2e-06 18.5 0.1 5 111 455 571 451 574 0.69 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_17 PF13207.1 121 1.2e-07 24.7 1.7 1 2 0.015 0.4 3.6 0.5 4 24 123 153 121 441 0.82 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_17 PF13207.1 121 1.2e-07 24.7 1.7 2 2 5.7e-07 1.6e-05 17.8 0.0 3 47 453 505 452 641 0.62 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_4 - 260 AAA_17 PF13207.1 121 0.00026 13.9 0.6 1 1 3.5e-05 0.00093 12.1 0.1 2 19 111 128 110 231 0.73 # 3610 # 4389 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_48 - 705 Miro PF08477.8 119 1.7e-05 17.3 1.7 1 2 1.1e-05 0.00058 12.4 0.0 3 51 122 170 120 200 0.66 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 Miro PF08477.8 119 1.7e-05 17.3 1.7 2 2 0.013 0.68 2.5 0.0 5 25 455 475 452 506 0.73 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 MobB PF03205.9 140 3.7e-06 18.8 1.4 1 2 0.00012 0.0064 8.3 0.0 4 29 122 146 120 162 0.81 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 MobB PF03205.9 140 3.7e-06 18.8 1.4 2 2 0.00011 0.0061 8.3 0.0 4 21 453 470 451 483 0.88 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_54 - 349 ArsA_ATPase PF02374.10 305 3.6e-05 14.9 3.0 1 2 0.07 1.9 -0.6 0.0 190 208 30 48 18 55 0.78 # 48620 # 49666 # -1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.299 1_54 - 349 ArsA_ATPase PF02374.10 305 3.6e-05 14.9 3.0 2 2 2.1e-06 5.6e-05 14.3 0.4 8 38 55 86 48 181 0.79 # 48620 # 49666 # -1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.299 1_4 - 260 ArsA_ATPase PF02374.10 305 0.00017 12.7 0.2 1 2 0.098 2.6 -1.1 0.1 242 268 45 69 6 86 0.60 # 3610 # 4389 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_4 - 260 ArsA_ATPase PF02374.10 305 0.00017 12.7 0.2 2 2 1.7e-05 0.00047 11.3 0.0 4 37 111 145 108 225 0.83 # 3610 # 4389 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_4 - 260 PhoH PF02562.11 205 3.2e-07 21.8 0.0 1 1 1.8e-08 4.8e-07 21.2 0.0 2 87 91 178 90 245 0.79 # 3610 # 4389 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_48 - 705 PhoH PF02562.11 205 1.6e-05 16.2 3.4 1 3 0.002 0.054 4.7 0.0 13 40 110 139 99 203 0.73 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 PhoH PF02562.11 205 1.6e-05 16.2 3.4 2 3 0.038 1 0.5 0.2 155 195 371 411 367 420 0.87 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 PhoH PF02562.11 205 1.6e-05 16.2 3.4 3 3 0.00014 0.0037 8.5 0.0 23 47 453 477 438 484 0.89 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 Ras PF00071.17 162 1.7e-05 16.3 0.0 1 2 5.4e-05 0.0029 9.0 0.0 3 42 122 160 120 170 0.83 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 Ras PF00071.17 162 1.7e-05 16.3 0.0 2 2 0.0015 0.079 4.4 0.0 3 27 453 477 451 496 0.85 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 Zeta_toxin PF06414.7 201 3e-07 21.7 0.1 1 2 0.0011 0.057 4.5 0.0 8 40 109 142 102 154 0.79 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 Zeta_toxin PF06414.7 201 3e-07 21.7 0.1 2 2 1.1e-06 6.1e-05 14.2 0.0 9 53 440 488 432 521 0.81 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_54 - 349 Fer4_NifH PF00142.13 273 3.1e-05 15.3 0.1 1 1 1.9e-06 0.0001 13.6 0.0 7 48 55 97 49 132 0.84 # 48620 # 49666 # -1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.299 1_48 - 705 Arch_ATPase PF01637.13 234 5.9e-11 34.5 12.4 1 3 2.2e-08 1.2e-06 20.4 0.0 3 167 101 239 99 285 0.68 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 Arch_ATPase PF01637.13 234 5.9e-11 34.5 12.4 2 3 0.03 1.6 0.3 7.3 77 131 333 391 291 398 0.66 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 Arch_ATPase PF01637.13 234 5.9e-11 34.5 12.4 3 3 0.0012 0.066 4.9 0.0 26 44 455 473 446 552 0.67 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_16 PF13191.1 185 9.4e-17 53.6 5.0 1 3 2.2e-10 5.9e-09 28.2 0.1 2 88 99 187 98 290 0.73 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_16 PF13191.1 185 9.4e-17 53.6 5.0 2 3 7.2e-08 1.9e-06 20.0 0.0 2 63 421 488 420 517 0.82 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_16 PF13191.1 185 9.4e-17 53.6 5.0 3 3 0.0088 0.24 3.4 0.1 149 176 520 548 505 556 0.79 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_4 - 260 AAA_16 PF13191.1 185 0.00016 13.7 0.1 1 1 1.5e-05 0.0004 12.4 0.0 24 41 108 125 92 178 0.85 # 3610 # 4389 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_48 - 705 AAA_23 PF13476.1 202 5.3e-05 15.6 15.7 1 2 0.00029 0.016 7.6 9.8 20 200 119 377 108 395 0.50 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_23 PF13476.1 202 5.3e-05 15.6 15.7 2 2 6e-05 0.0032 9.8 0.1 20 54 450 494 442 680 0.49 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_18 PF13238.1 129 1.2e-07 24.1 2.5 1 2 0.00023 0.0063 8.9 0.1 2 66 122 188 122 207 0.72 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_18 PF13238.1 129 1.2e-07 24.1 2.5 2 2 8.6e-06 0.00023 13.5 0.0 3 23 454 491 453 561 0.68 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_50 - 240 AAA_18 PF13238.1 129 0.00017 14.0 0.6 1 1 1.9e-05 0.00051 12.4 0.6 8 42 80 113 78 236 0.71 # 45759 # 46478 # 1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.328 1_54 - 349 CbiA PF01656.18 195 1.5e-29 94.8 1.0 1 1 7.5e-31 2e-29 94.4 1.0 1 192 50 272 50 274 0.78 # 48620 # 49666 # -1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.299 1_50 - 240 CbiA PF01656.18 195 3.2e-12 38.3 1.3 1 2 1.3e-09 3.4e-08 25.1 0.1 3 38 74 109 72 113 0.94 # 45759 # 46478 # 1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.328 1_50 - 240 CbiA PF01656.18 195 3.2e-12 38.3 1.3 2 2 9.3e-06 0.00025 12.5 0.1 95 178 117 200 109 216 0.86 # 45759 # 46478 # 1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.328 1_4 - 260 KaiC PF06745.8 227 5.8e-05 14.3 0.2 1 3 0.095 5.2 -1.9 0.1 97 129 21 54 5 73 0.64 # 3610 # 4389 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_4 - 260 KaiC PF06745.8 227 5.8e-05 14.3 0.2 2 3 4.3e-06 0.00023 12.3 0.0 19 68 108 156 94 178 0.84 # 3610 # 4389 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_4 - 260 KaiC PF06745.8 227 5.8e-05 14.3 0.2 3 3 0.088 4.8 -1.8 0.0 117 146 171 197 159 221 0.59 # 3610 # 4389 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_48 - 705 AAA_14 PF13173.1 128 4.9e-14 44.4 0.8 1 2 2e-07 5.4e-06 18.4 0.0 4 87 120 227 117 259 0.75 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_14 PF13173.1 128 4.9e-14 44.4 0.8 2 2 7.6e-09 2.1e-07 23.0 0.0 7 87 454 549 450 596 0.69 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_50 - 240 AAA_14 PF13173.1 128 2.2e-05 16.4 4.9 1 2 0.0057 0.15 4.0 0.1 10 27 33 50 23 78 0.76 # 45759 # 46478 # 1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.328 1_50 - 240 AAA_14 PF13173.1 128 2.2e-05 16.4 4.9 2 2 9.2e-06 0.00025 13.0 1.7 12 68 80 137 68 235 0.80 # 45759 # 46478 # 1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.328 1_48 - 705 AAA_29 PF13555.1 62 7e-06 17.6 0.2 1 2 3e-05 0.0016 10.1 0.0 21 51 116 146 106 151 0.81 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_29 PF13555.1 62 7e-06 17.6 0.2 2 2 0.0012 0.067 4.9 0.1 23 37 450 463 440 471 0.84 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA PF00004.24 132 4.2e-27 87.0 4.5 1 3 0.015 0.4 3.0 0.0 81 115 14 48 9 55 0.86 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA PF00004.24 132 4.2e-27 87.0 4.5 2 3 6.2e-17 1.7e-15 49.5 0.1 2 124 122 254 121 261 0.73 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA PF00004.24 132 4.2e-27 87.0 4.5 3 3 4.6e-12 1.2e-10 33.7 0.0 2 110 453 571 452 580 0.84 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_4 - 260 AAA PF00004.24 132 3.9e-09 28.9 0.2 1 1 3.6e-10 9.7e-09 27.6 0.0 1 111 111 210 111 240 0.78 # 3610 # 4389 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_4 - 260 Bac_DnaA PF00308.13 219 3.1e-14 45.1 0.0 1 1 1.1e-15 6e-14 44.2 0.0 33 136 107 208 101 213 0.93 # 3610 # 4389 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_48 - 705 Sigma54_activat PF00158.21 168 3e-16 51.4 1.2 1 2 1.6e-06 4.3e-05 15.1 0.2 2 105 100 201 99 205 0.87 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 Sigma54_activat PF00158.21 168 3e-16 51.4 1.2 2 2 1.5e-12 4e-11 34.7 0.0 24 143 451 571 421 586 0.84 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_4 - 260 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00018 13.0 0.1 1 1 5.7e-05 0.0015 10.0 0.0 17 65 103 151 90 207 0.72 # 3610 # 4389 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_48 - 705 DUF258 PF03193.11 161 3.6e-07 21.5 0.1 1 2 1.4e-05 0.00039 11.7 0.0 21 58 104 141 85 188 0.77 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 DUF258 PF03193.11 161 3.6e-07 21.5 0.1 2 2 0.00035 0.0094 7.2 0.0 39 57 453 471 446 505 0.85 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_4 - 260 DUF258 PF03193.11 161 0.00019 12.7 0.0 1 1 1.5e-05 0.00039 11.7 0.0 18 53 91 126 74 177 0.75 # 3610 # 4389 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_21 - 618 TraG-D_C PF12696.2 128 1.5e-05 16.9 0.4 1 2 0.061 3.3 -0.3 0.2 57 95 289 328 275 347 0.59 # 16260 # 18113 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 1_21 - 618 TraG-D_C PF12696.2 128 1.5e-05 16.9 0.4 2 2 4.1e-06 0.00022 13.1 0.0 16 80 504 560 500 577 0.88 # 16260 # 18113 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 1_50 - 240 AAA_31 PF13614.1 157 2.7e-09 29.2 0.1 1 2 2.5e-07 6.6e-06 18.2 0.0 1 39 70 108 70 113 0.95 # 45759 # 46478 # 1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.328 1_50 - 240 AAA_31 PF13614.1 157 2.7e-09 29.2 0.1 2 2 0.0002 0.0054 8.7 0.0 119 152 118 150 113 154 0.90 # 45759 # 46478 # 1 # ID=1_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.328 1_54 - 349 AAA_31 PF13614.1 157 5.7e-08 24.9 0.3 1 1 6.5e-09 1.7e-07 23.3 0.3 9 152 56 202 54 206 0.85 # 48620 # 49666 # -1 # ID=1_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.299 1_48 - 705 AAA_33 PF13671.1 143 1.4e-06 20.3 0.2 1 3 0.0025 0.14 4.1 0.0 3 22 122 141 121 194 0.75 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_33 PF13671.1 143 1.4e-06 20.3 0.2 2 3 0.057 3.1 -0.3 0.2 105 120 328 343 249 394 0.61 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_33 PF13671.1 143 1.4e-06 20.3 0.2 3 3 1.6e-05 0.00088 11.2 0.0 3 23 453 471 452 529 0.75 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_30 PF13604.1 196 7.4e-06 17.7 0.0 1 2 2e-05 0.0011 10.6 0.0 18 44 118 144 104 161 0.81 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_30 PF13604.1 196 7.4e-06 17.7 0.0 2 2 0.0025 0.14 3.8 0.0 22 118 453 547 447 551 0.75 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_21 - 618 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 1.6e-07 23.0 0.0 1 2 1.5e-07 4.1e-06 18.4 0.0 30 80 151 205 125 219 0.79 # 16260 # 18113 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 1_21 - 618 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 1.6e-07 23.0 0.0 2 2 0.014 0.38 2.2 0.0 179 205 503 529 393 529 0.81 # 16260 # 18113 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 1_48 - 705 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00028 12.4 1.2 1 3 0.00035 0.0094 7.4 0.0 35 84 115 168 85 194 0.75 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00028 12.4 1.2 2 3 0.044 1.2 0.6 0.5 91 165 321 389 317 444 0.53 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00028 12.4 1.2 3 3 0.061 1.6 0.1 0.0 42 90 453 498 432 519 0.77 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 ABC_tran PF00005.22 137 3.8e-06 19.3 3.4 1 2 0.002 0.055 5.8 1.8 13 67 120 174 113 448 0.86 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 ABC_tran PF00005.22 137 3.8e-06 19.3 3.4 2 2 4.3e-05 0.0011 11.3 0.0 16 115 454 585 446 595 0.63 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_21 - 618 ABC_tran PF00005.22 137 0.0012 11.2 1.9 1 1 0.00016 0.0042 9.4 1.8 11 67 161 217 152 332 0.66 # 16260 # 18113 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 1_48 - 705 RuvB_N PF05496.7 234 5.2e-06 17.6 3.2 1 3 0.025 0.66 0.9 0.0 49 73 117 141 85 152 0.77 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 RuvB_N PF05496.7 234 5.2e-06 17.6 3.2 2 3 0.062 1.7 -0.4 0.0 102 113 190 201 175 204 0.75 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 RuvB_N PF05496.7 234 5.2e-06 17.6 3.2 3 3 8.3e-06 0.00022 12.3 0.1 20 75 415 474 400 570 0.85 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_4 - 260 RuvB_N PF05496.7 234 0.00013 13.1 0.0 1 1 7.4e-06 0.0002 12.5 0.0 48 113 106 181 56 196 0.76 # 3610 # 4389 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_48 - 705 AAA_19 PF13245.1 76 3.4e-05 15.6 0.4 1 2 0.00036 0.0098 7.8 0.2 10 37 119 144 111 152 0.65 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_19 PF13245.1 76 3.4e-05 15.6 0.4 2 2 0.0025 0.069 5.0 0.0 16 35 455 474 444 509 0.83 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_4 - 260 AAA_19 PF13245.1 76 0.00027 12.8 0.0 1 1 1.9e-05 0.00051 11.9 0.0 16 52 114 146 105 163 0.88 # 3610 # 4389 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_21 - 618 AAA_10 PF12846.2 304 9.1e-23 73.1 2.8 1 1 1.1e-23 1.9e-22 72.0 2.8 2 295 162 555 161 561 0.66 # 16260 # 18113 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 1_48 - 705 AAA_10 PF12846.2 304 3.6e-06 18.6 3.9 1 3 0.053 0.95 0.8 0.0 2 24 119 141 118 161 0.83 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_10 PF12846.2 304 3.6e-06 18.6 3.9 2 3 0.06 1.1 0.6 0.0 223 237 192 207 177 220 0.83 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_10 PF12846.2 304 3.6e-06 18.6 3.9 3 3 1.9e-06 3.4e-05 15.4 0.1 3 148 451 611 450 686 0.69 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_4 - 260 AAA_10 PF12846.2 304 8e-05 14.2 0.1 1 1 1.7e-05 0.0003 12.3 0.0 3 30 110 145 108 181 0.72 # 3610 # 4389 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_48 - 705 ResIII PF04851.10 184 1.5e-07 23.5 5.5 1 4 0.0018 0.049 5.5 0.0 11 42 105 135 99 147 0.83 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 ResIII PF04851.10 184 1.5e-07 23.5 5.5 2 4 0.0036 0.097 4.5 0.1 108 158 150 201 136 206 0.85 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 ResIII PF04851.10 184 1.5e-07 23.5 5.5 3 4 0.06 1.6 0.5 0.6 82 122 354 394 306 420 0.63 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 ResIII PF04851.10 184 1.5e-07 23.5 5.5 4 4 2e-05 0.00054 11.9 0.0 8 50 424 474 421 485 0.83 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_4 - 260 ResIII PF04851.10 184 0.0001 14.2 0.0 1 2 2.1e-05 0.00058 11.7 0.0 22 70 90 155 49 171 0.72 # 3610 # 4389 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_4 - 260 ResIII PF04851.10 184 0.0001 14.2 0.0 2 2 0.047 1.3 0.8 0.0 143 163 166 186 141 210 0.58 # 3610 # 4389 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_48 - 705 TIP49 PF06068.8 398 2.3e-05 15.2 0.1 1 3 4.3e-07 2.3e-05 15.2 0.1 51 111 120 178 80 197 0.76 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 TIP49 PF06068.8 398 2.3e-05 15.2 0.1 2 3 0.06 3.2 -1.7 0.2 144 175 346 375 327 411 0.56 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 TIP49 PF06068.8 398 2.3e-05 15.2 0.1 3 3 0.0094 0.51 0.9 0.1 51 73 450 472 399 489 0.62 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 DUF815 PF05673.8 250 8.6e-10 29.9 1.4 1 2 2.4e-06 0.00013 13.0 0.1 41 79 106 144 95 166 0.85 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 DUF815 PF05673.8 250 8.6e-10 29.9 1.4 2 2 1.5e-05 0.00081 10.3 0.1 33 232 428 655 405 671 0.69 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_21 - 618 DUF853 PF05872.7 504 0.00023 11.5 0.0 1 2 0.019 1 -0.5 0.0 22 59 162 205 149 244 0.70 # 16260 # 18113 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 1_21 - 618 DUF853 PF05872.7 504 0.00023 11.5 0.0 2 2 2.2e-05 0.0012 9.2 0.0 254 361 476 580 453 585 0.76 # 16260 # 18113 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 1_21 - 618 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.4e-08 25.8 0.0 1 2 5.3e-08 1.4e-06 19.1 0.0 17 61 163 213 157 258 0.92 # 16260 # 18113 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 1_21 - 618 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.4e-08 25.8 0.0 2 2 0.0021 0.055 4.0 0.0 196 291 434 536 387 563 0.64 # 16260 # 18113 # -1 # ID=1_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 1_48 - 705 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 2.3e-05 15.1 0.1 1 2 0.00026 0.007 6.9 0.0 11 51 114 154 107 157 0.85 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 2.3e-05 15.1 0.1 2 2 0.0014 0.039 4.5 0.0 17 47 451 481 444 488 0.81 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 RNA_helicase PF00910.17 107 3.3e-08 25.8 0.2 1 2 6.4e-05 0.0017 10.6 0.0 2 36 122 158 121 175 0.79 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 RNA_helicase PF00910.17 107 3.3e-08 25.8 0.2 2 2 3.1e-05 0.00082 11.6 0.0 2 23 453 474 452 508 0.86 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_4 - 260 RNA_helicase PF00910.17 107 2e-06 20.0 0.0 1 1 2.7e-07 7.3e-06 18.2 0.0 1 77 111 198 111 211 0.84 # 3610 # 4389 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_48 - 705 UPF0079 PF02367.12 123 2.1e-06 19.4 0.1 1 2 4.7e-05 0.0025 9.5 0.0 19 39 122 142 107 152 0.80 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 UPF0079 PF02367.12 123 2.1e-06 19.4 0.1 2 2 0.00027 0.015 7.0 0.0 19 45 453 480 448 482 0.85 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_24 PF13479.1 213 1.1e-05 17.1 2.4 1 2 0.00069 0.037 5.6 0.1 3 26 118 141 116 146 0.81 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_24 PF13479.1 213 1.1e-05 17.1 2.4 2 2 2.1e-05 0.0011 10.5 0.0 6 86 452 540 450 557 0.76 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 NACHT PF05729.7 166 2.1e-08 26.0 0.0 1 2 1e-06 5.5e-05 14.9 0.0 4 31 122 149 119 169 0.91 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 NACHT PF05729.7 166 2.1e-08 26.0 0.0 2 2 0.00012 0.0063 8.2 0.0 4 24 453 473 451 544 0.91 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_25 PF13481.1 194 4.6e-10 31.2 0.1 1 3 0.0001 0.0028 9.1 0.0 33 61 118 146 96 200 0.86 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_25 PF13481.1 194 4.6e-10 31.2 0.1 2 3 0.1 2.7 -0.7 0.1 86 142 334 396 305 399 0.55 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_25 PF13481.1 194 4.6e-10 31.2 0.1 3 3 2.5e-07 6.6e-06 17.6 0.0 34 94 450 522 423 561 0.71 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_4 - 260 AAA_25 PF13481.1 194 3.6e-05 15.2 0.0 1 1 2.7e-06 7.2e-05 14.3 0.0 28 63 103 139 85 177 0.82 # 3610 # 4389 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_48 - 705 AAA_28 PF13521.1 163 0.00059 11.8 3.3 1 2 0.0041 0.22 3.5 0.0 3 23 122 142 120 196 0.82 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_28 PF13521.1 163 0.00059 11.8 3.3 2 2 0.0003 0.016 7.2 0.0 2 20 452 470 451 491 0.84 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_5 PF07728.9 139 1.6e-17 55.6 4.0 1 2 8.5e-07 2.3e-05 16.2 0.0 2 76 121 200 120 204 0.73 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_48 - 705 AAA_5 PF07728.9 139 1.6e-17 55.6 4.0 2 2 1.4e-13 3.7e-12 38.2 0.1 2 124 452 573 451 585 0.78 # 41839 # 43953 # 1 # ID=1_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.400 1_4 - 260 AAA_5 PF07728.9 139 0.00016 13.5 0.3 1 2 0.0084 0.23 3.2 0.0 69 94 33 58 12 85 0.81 # 3610 # 4389 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 1_4 - 260 AAA_5 PF07728.9 139 0.00016 13.5 0.3 2 2 0.0005 0.014 7.2 0.0 1 17 110 126 110 137 0.90 # 3610 # 4389 # -1 # ID=1_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=11bp;gc_cont=0.368 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b2 (February 2015) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/31137a0a-cb21-48c8-a08d-98fbc70acf61 # Target file: checkm_output/bins/pGCA_000210815.2.assembled/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pGCA_000210815.2.assembled/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/31137a0a-cb21-48c8-a08d-98fbc70acf61 checkm_output/bins/pGCA_000210815.2.assembled/genes.faa # Current dir: /mnt/DGK_KLIF/data/klif/reads-for-assembly/trainingsets2/combined/rfplasmid_combined_jellynew2 # Date: Tue Jul 7 16:40:13 2020 # [ok]