# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 4_26 - 253 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.0009 13.0 0.1 1 1 7.9e-06 0.0026 11.5 0.0 22 39 99 116 86 126 0.90 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 2_28 - 374 UPF0020 PF01170.13 180 9.1e-06 19.9 0.0 1 1 8.9e-08 3e-05 18.3 0.0 32 155 46 159 31 177 0.77 # 45803 # 46924 # 1 # ID=2_28;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 4_26 - 253 IstB_IS21 PF01695.12 178 1.1e-64 211.7 0.0 1 1 4.1e-67 1.4e-64 211.4 0.0 4 177 56 229 53 230 0.98 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 1_128 - 127 KH_5 PF13184.1 69 3.3e-05 18.3 0.7 1 1 1.7e-07 5.8e-05 17.5 0.7 19 67 61 109 55 112 0.89 # 122860 # 123240 # -1 # ID=1_128;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 1_57 - 475 AAA_2 PF07724.9 171 6.7e-05 17.5 0.1 1 2 0.078 26 -0.7 0.0 4 44 184 224 183 231 0.79 # 58019 # 59443 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 1_57 - 475 AAA_2 PF07724.9 171 6.7e-05 17.5 0.1 2 2 1.8e-06 0.0006 14.4 0.0 2 43 234 274 233 283 0.91 # 58019 # 59443 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 3_10 - 927 DUF87 PF01935.12 229 1.9e-05 19.2 0.0 1 1 8.5e-07 9.5e-05 16.9 0.0 20 228 393 639 373 640 0.73 # 6349 # 9129 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.397 3_17 - 857 DUF87 PF01935.12 229 2.5e-05 18.8 0.6 1 1 9.3e-07 0.0001 16.8 0.0 30 63 499 531 495 624 0.95 # 12245 # 14815 # 1 # ID=3_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.395 1_57 - 475 DUF87 PF01935.12 229 0.00081 13.8 0.2 1 1 2.9e-05 0.0033 11.9 0.0 25 56 237 267 228 272 0.82 # 58019 # 59443 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 4_26 - 253 AAA_22 PF13401.1 131 6.9e-06 20.9 0.0 1 2 0.0002 0.013 10.2 0.0 6 21 101 116 96 129 0.85 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 4_26 - 253 AAA_22 PF13401.1 131 6.9e-06 20.9 0.0 2 2 0.00089 0.06 8.1 0.0 72 105 147 177 122 199 0.67 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 3_10 - 927 AAA_22 PF13401.1 131 5.3e-05 18.0 0.2 1 1 8.7e-06 0.00058 14.6 0.1 4 35 396 426 395 545 0.82 # 6349 # 9129 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.397 1_57 - 475 AAA_22 PF13401.1 131 6.1e-05 17.8 0.0 1 1 3e-06 0.0002 16.1 0.0 6 68 237 316 229 371 0.78 # 58019 # 59443 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 2_23 - 292 AAA_22 PF13401.1 131 0.00058 14.6 0.0 1 1 3.1e-05 0.0021 12.8 0.0 10 99 33 158 25 190 0.67 # 39605 # 40480 # 1 # ID=2_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.330 5_20 - 210 AAA_22 PF13401.1 131 0.0027 12.5 0.2 1 1 0.00046 0.031 9.1 0.2 7 80 4 88 2 100 0.64 # 7733 # 8362 # 1 # ID=5_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.325 2_23 - 292 SRP54 PF00448.17 196 0.00064 13.8 0.0 1 1 5.2e-06 0.0017 12.4 0.0 4 47 30 71 27 79 0.87 # 39605 # 40480 # 1 # ID=2_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.330 2_23 - 292 AAA_15 PF13175.1 415 4.4e-06 20.5 0.1 1 3 0.017 5.8 0.4 0.0 28 43 33 51 20 92 0.80 # 39605 # 40480 # 1 # ID=2_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.330 2_23 - 292 AAA_15 PF13175.1 415 4.4e-06 20.5 0.1 2 3 1.3e-08 4.4e-06 20.5 0.1 336 411 122 186 109 188 0.79 # 39605 # 40480 # 1 # ID=2_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.330 2_23 - 292 AAA_15 PF13175.1 415 4.4e-06 20.5 0.1 3 3 0.066 22 -1.5 3.7 200 283 193 267 186 291 0.47 # 39605 # 40480 # 1 # ID=2_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.330 1_57 - 475 AAA_17 PF13207.1 121 1.8e-05 20.2 0.3 1 1 8.6e-07 7.2e-05 18.2 0.0 2 46 238 295 237 399 0.65 # 58019 # 59443 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 3_10 - 927 AAA_17 PF13207.1 121 0.00081 14.8 0.0 1 1 3.8e-05 0.0032 12.9 0.0 4 22 401 419 400 496 0.65 # 6349 # 9129 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.397 4_26 - 253 AAA_17 PF13207.1 121 0.0029 13.0 0.4 1 1 0.00012 0.0099 11.3 0.1 2 16 102 116 101 191 0.93 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 1_100 - 324 AAA_17 PF13207.1 121 0.0046 12.4 1.1 1 1 0.00019 0.016 10.6 0.1 2 17 282 297 281 311 0.89 # 91554 # 92525 # 1 # ID=1_100;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 2_23 - 292 AAA_21 PF13304.1 303 1.9e-15 52.1 4.9 1 2 5.7e-05 0.019 9.5 0.3 3 17 31 45 29 64 0.80 # 39605 # 40480 # 1 # ID=2_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.330 2_23 - 292 AAA_21 PF13304.1 303 1.9e-15 52.1 4.9 2 2 9.6e-16 3.2e-13 44.8 0.1 193 297 106 185 50 189 0.74 # 39605 # 40480 # 1 # ID=2_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.330 1_56 - 284 MobB PF03205.9 140 0.00056 14.2 0.0 1 1 1.2e-05 0.0013 13.0 0.0 7 37 23 53 16 64 0.81 # 57152 # 58003 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.370 2_23 - 292 MobB PF03205.9 140 0.00079 13.8 1.2 1 1 3e-05 0.0033 11.7 0.0 2 25 29 52 28 133 0.92 # 39605 # 40480 # 1 # ID=2_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.330 1_57 - 475 MobB PF03205.9 140 0.0022 12.3 0.2 1 1 0.00013 0.014 9.7 0.0 3 32 238 267 236 272 0.89 # 58019 # 59443 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 2_75 - 372 ADH_zinc_N PF00107.21 130 1.2e-25 84.2 0.1 1 1 6.1e-28 2e-25 83.4 0.1 1 127 197 329 197 332 0.89 # 104313 # 105428 # -1 # ID=2_75;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.392 2_30 - 1099 Helicase_C PF00271.26 78 0.00013 16.4 0.0 1 1 1.1e-06 0.00037 15.0 0.0 16 78 823 885 808 885 0.86 # 47239 # 50535 # 1 # ID=2_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_56 - 284 ArsA_ATPase PF02374.10 305 0.00015 15.5 0.1 1 1 7.6e-07 0.00026 14.7 0.1 12 38 27 53 19 213 0.81 # 57152 # 58003 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.370 4_26 - 253 PhoH PF02562.11 205 4.3e-05 17.4 0.0 1 1 2.4e-07 7.9e-05 16.6 0.0 15 47 95 127 82 135 0.87 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 1_57 - 475 MCM PF00493.18 331 0.00022 14.7 0.0 1 1 1.4e-06 0.00048 13.6 0.0 54 85 232 263 218 269 0.88 # 58019 # 59443 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 4_26 - 253 AFG1_ATPase PF03969.11 362 0.002 11.5 0.0 1 1 7.6e-06 0.0025 11.2 0.0 38 167 78 201 36 249 0.69 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 1_57 - 475 T2SE PF00437.15 272 1.3e-44 146.7 0.0 1 1 6.5e-47 2.2e-44 146.0 0.0 4 268 110 386 107 390 0.90 # 58019 # 59443 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 1_47 - 500 AAA_26 PF13500.1 199 0.0012 13.1 0.0 1 1 1e-05 0.0034 11.6 0.0 1 34 226 259 226 343 0.86 # 47341 # 48840 # 1 # ID=1_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.341 1_57 - 475 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00016 15.4 0.9 1 2 0.00093 0.31 4.7 0.1 64 133 27 95 9 96 0.82 # 58019 # 59443 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 1_57 - 475 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00016 15.4 0.9 2 2 6.4e-05 0.021 8.5 0.0 14 42 233 262 221 279 0.80 # 58019 # 59443 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 2_23 - 292 SMC_N PF02463.14 220 0.0041 11.0 2.3 1 2 0.00051 0.17 5.7 0.2 29 41 32 44 13 56 0.76 # 39605 # 40480 # 1 # ID=2_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.330 2_23 - 292 SMC_N PF02463.14 220 0.0041 11.0 2.3 2 2 0.00083 0.28 5.0 0.1 130 197 121 184 106 207 0.71 # 39605 # 40480 # 1 # ID=2_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.330 1_11 - 311 TIGR02432 TIGR02432 189 0.00078 13.7 0.0 1 1 4.4e-06 0.0015 12.8 0.0 3 27 23 47 21 103 0.73 # 11395 # 12327 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.387 1_56 - 284 Fer4_NifH PF00142.13 273 0.0013 12.5 0.0 1 1 5.8e-06 0.0019 12.0 0.0 2 64 17 81 16 93 0.76 # 57152 # 58003 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.370 4_26 - 253 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.00067 14.0 0.1 1 1 7e-06 0.0023 12.2 0.0 15 81 96 153 84 198 0.64 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 4_26 - 253 AAA_16 PF13191.1 185 3.3e-05 18.5 0.1 1 1 1.1e-06 0.00012 16.7 0.0 23 63 98 138 85 179 0.67 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 2_23 - 292 AAA_16 PF13191.1 185 4e-05 18.3 0.1 1 2 3e-05 0.0034 12.0 0.0 22 58 25 62 6 78 0.83 # 39605 # 40480 # 1 # ID=2_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.330 2_23 - 292 AAA_16 PF13191.1 185 4e-05 18.3 0.1 2 2 0.0075 0.83 4.2 0.0 34 88 175 231 173 270 0.63 # 39605 # 40480 # 1 # ID=2_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.330 1_57 - 475 AAA_16 PF13191.1 185 0.002 12.8 0.0 1 1 3.7e-05 0.0042 11.7 0.0 19 52 230 271 218 359 0.71 # 58019 # 59443 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 2_23 - 292 AAA_23 PF13476.1 202 0.01 10.8 12.2 1 1 0.00032 0.11 7.4 12.2 12 199 19 263 9 283 0.44 # 39605 # 40480 # 1 # ID=2_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.330 1_57 - 475 AAA_18 PF13238.1 129 2.5e-05 19.2 0.1 1 1 1.1e-06 0.00013 16.9 0.0 1 35 238 276 238 331 0.75 # 58019 # 59443 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 3_10 - 927 AAA_18 PF13238.1 129 0.00011 17.2 0.1 1 1 4.3e-06 0.00048 15.1 0.0 2 42 400 459 400 499 0.74 # 6349 # 9129 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.397 4_26 - 253 AAA_18 PF13238.1 129 0.0018 13.2 0.2 1 1 0.0001 0.012 10.6 0.2 1 16 102 117 102 203 0.80 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 2_21 - 3375 adh_short PF00106.20 167 2.7e-33 109.8 0.0 1 1 4.6e-35 7.6e-33 108.4 0.0 2 165 908 1077 907 1079 0.92 # 21256 # 31380 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.373 2_22 - 2682 adh_short PF00106.20 167 1e-29 98.2 0.0 1 1 1.4e-31 2.3e-29 97.1 0.0 1 166 967 1144 967 1145 0.94 # 31394 # 39439 # 1 # ID=2_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.370 1_56 - 284 CbiA PF01656.18 195 8.4e-10 33.0 0.0 1 1 3.8e-12 1.3e-09 32.4 0.0 1 161 18 214 18 237 0.71 # 57152 # 58003 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.370 2_28 - 374 Methyltransf_25 PF13649.1 101 6.1e-06 21.2 0.1 1 1 6.7e-08 2.3e-05 19.4 0.0 3 73 48 113 46 163 0.82 # 45803 # 46924 # 1 # ID=2_28;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 4_26 - 253 KaiC PF06745.8 227 2.1e-05 18.3 0.0 1 1 9.8e-08 3.3e-05 17.7 0.0 13 53 88 132 68 150 0.75 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 4_26 - 253 AAA_14 PF13173.1 128 1.3e-05 19.7 0.0 1 1 1.8e-07 3e-05 18.5 0.0 2 100 99 203 98 211 0.62 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 5_20 - 210 AAA_14 PF13173.1 128 0.00028 15.4 0.0 1 1 2.4e-06 0.0004 14.9 0.0 4 82 3 79 1 200 0.90 # 7733 # 8362 # 1 # ID=5_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.325 2_23 - 292 AAA_29 PF13555.1 62 5.4e-05 17.3 0.1 1 1 6.1e-07 0.0001 16.4 0.1 15 40 20 44 13 59 0.85 # 39605 # 40480 # 1 # ID=2_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.330 3_10 - 927 AAA_29 PF13555.1 62 0.0023 12.1 0.0 1 1 2.9e-05 0.0049 11.0 0.0 26 39 399 412 385 416 0.85 # 6349 # 9129 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.397 4_26 - 253 AAA PF00004.24 132 3.5e-07 25.1 0.0 1 1 8.5e-09 9.5e-07 23.7 0.0 1 68 102 170 102 179 0.77 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 5_20 - 210 AAA PF00004.24 132 2.2e-05 19.3 0.0 1 1 3.6e-07 4.1e-05 18.4 0.0 3 85 6 83 4 118 0.66 # 7733 # 8362 # 1 # ID=5_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.325 2_23 - 292 AAA PF00004.24 132 0.019 9.8 4.3 1 1 0.00037 0.041 8.7 0.5 3 66 32 153 30 157 0.65 # 39605 # 40480 # 1 # ID=2_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.330 4_26 - 253 Bac_DnaA PF00308.13 219 1.1e-12 42.6 0.0 1 1 5.3e-15 1.8e-12 42.0 0.0 37 140 102 202 81 210 0.93 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 1_41 - 436 PGK PF00162.14 384 0.00025 14.3 0.1 1 1 1.4e-06 0.00048 13.3 0.1 98 156 170 225 154 237 0.80 # 39205 # 40512 # -1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.342 2_21 - 3375 KR PF08659.5 181 2e-41 136.3 0.1 1 1 7e-43 1.2e-40 133.7 0.0 1 180 907 1091 907 1092 0.93 # 21256 # 31380 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.373 2_22 - 2682 KR PF08659.5 181 2.5e-36 119.6 0.0 1 1 3e-38 5.1e-36 118.6 0.0 1 180 967 1158 967 1159 0.91 # 31394 # 39439 # 1 # ID=2_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.370 1_11 - 311 PAPS_reduct PF01507.14 174 1.6e-08 29.2 0.0 1 1 1.6e-10 5.5e-08 27.4 0.0 3 153 23 220 21 266 0.78 # 11395 # 12327 # -1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.387 1_57 - 475 Sigma54_activat PF00158.21 168 3e-06 21.4 0.0 1 1 2.3e-08 7.7e-06 20.1 0.0 3 55 216 268 214 279 0.89 # 58019 # 59443 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 2_28 - 374 N6_Mtase PF02384.11 311 1.3e-06 22.3 0.5 1 2 6.3e-08 2.1e-05 18.3 0.0 26 148 20 130 14 162 0.74 # 45803 # 46924 # 1 # ID=2_28;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 2_28 - 374 N6_Mtase PF02384.11 311 1.3e-06 22.3 0.5 2 2 0.012 4 1.0 0.1 224 276 190 244 176 269 0.76 # 45803 # 46924 # 1 # ID=2_28;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 3_17 - 857 DUF258 PF03193.11 161 0.0007 13.4 0.0 1 1 1.4e-05 0.0016 12.3 0.0 11 56 468 513 461 534 0.83 # 12245 # 14815 # 1 # ID=3_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.395 1_57 - 475 DUF258 PF03193.11 161 0.00077 13.3 0.0 1 1 1.5e-05 0.0016 12.2 0.0 5 59 204 259 200 321 0.86 # 58019 # 59443 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 2_23 - 292 DUF258 PF03193.11 161 0.00099 12.9 0.0 1 1 2e-05 0.0023 11.8 0.0 19 57 10 49 2 65 0.83 # 39605 # 40480 # 1 # ID=2_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.330 1_38 - 1167 TraG-D_C PF12696.2 128 5.8e-13 43.4 1.6 1 1 2.7e-15 9.1e-13 42.8 0.0 3 125 539 659 538 661 0.85 # 33386 # 36886 # -1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 3_14 - 326 DUF1442 PF07279.6 218 0.0028 11.4 0.0 1 1 1.3e-05 0.0044 10.7 0.0 110 179 120 188 112 207 0.89 # 10468 # 11445 # 1 # ID=3_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.385 1_56 - 284 AAA_31 PF13614.1 157 2e-20 67.9 0.1 1 1 2.1e-22 3.5e-20 67.1 0.1 1 152 16 181 16 184 0.89 # 57152 # 58003 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.370 1_47 - 500 AAA_31 PF13614.1 157 3.8e-06 21.5 0.1 1 1 5.1e-08 8.5e-06 20.4 0.1 1 152 226 381 226 386 0.79 # 47341 # 48840 # 1 # ID=1_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.341 4_26 - 253 NTPase_1 PF03266.10 168 1e-05 19.9 0.0 1 2 0.00041 0.14 6.5 0.0 2 24 102 125 101 131 0.72 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 4_26 - 253 NTPase_1 PF03266.10 168 1e-05 19.9 0.0 2 2 7.5e-06 0.0025 12.1 0.0 47 130 119 198 116 205 0.64 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 4_26 - 253 AAA_33 PF13671.1 143 0.00061 14.3 0.0 1 1 3e-06 0.001 13.6 0.0 2 46 102 151 102 197 0.74 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 4_26 - 253 KTI12 PF08433.5 270 0.00029 14.7 0.0 1 1 1.6e-06 0.00055 13.8 0.0 4 81 102 171 101 173 0.84 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 2_28 - 374 Methyltransf_26 PF13659.1 117 4.5e-15 50.3 0.0 1 1 3.3e-17 1.1e-14 49.1 0.0 4 116 46 154 44 155 0.88 # 45803 # 46924 # 1 # ID=2_28;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 1_107 - 102 2-Hacid_dh_C PF02826.14 178 0.00061 13.6 0.1 1 1 3.1e-06 0.001 12.8 0.1 37 97 4 55 1 60 0.85 # 103678 # 103983 # 1 # ID=1_107;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.356 1_57 - 475 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 6.8e-05 17.0 0.0 1 1 8.1e-07 0.00014 16.0 0.0 33 58 230 255 207 263 0.77 # 58019 # 59443 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 3_10 - 927 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.0027 11.8 0.0 1 1 3.9e-05 0.0065 10.5 0.0 39 63 394 421 361 430 0.80 # 6349 # 9129 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.397 2_28 - 374 MTS PF05175.9 170 1.1e-09 32.5 0.0 1 1 5.6e-12 1.9e-09 31.7 0.0 23 141 32 154 17 177 0.77 # 45803 # 46924 # 1 # ID=2_28;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 2_23 - 292 ABC_tran PF00005.22 137 3.6e-29 96.4 0.0 1 2 5.2e-30 8.7e-28 91.9 0.0 3 136 19 155 17 156 0.93 # 39605 # 40480 # 1 # ID=2_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.330 2_23 - 292 ABC_tran PF00005.22 137 3.6e-29 96.4 0.0 2 2 0.022 3.7 2.5 0.1 22 79 176 239 170 278 0.54 # 39605 # 40480 # 1 # ID=2_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.330 1_100 - 324 ABC_tran PF00005.22 137 0.0098 10.8 3.1 1 1 8.9e-05 0.015 10.2 0.0 13 30 281 298 277 312 0.82 # 91554 # 92525 # 1 # ID=1_100;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 2_47 - 215 DNA_mis_repair PF01119.14 119 0.0016 12.5 0.1 1 2 5.5e-05 0.019 9.1 0.1 77 101 70 93 50 105 0.76 # 61491 # 62135 # 1 # ID=2_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.363 2_47 - 215 DNA_mis_repair PF01119.14 119 0.0016 12.5 0.1 2 2 0.023 7.7 0.6 0.0 5 36 172 208 168 213 0.76 # 61491 # 62135 # 1 # ID=2_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.363 2_28 - 374 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0024 11.9 0.0 1 1 1.4e-05 0.0049 10.9 0.0 94 141 90 134 36 147 0.76 # 45803 # 46924 # 1 # ID=2_28;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 2_22 - 2682 NAD_binding_4 PF07993.7 249 2.8e-06 21.0 0.1 1 1 2.4e-07 3.9e-05 17.2 0.1 1 143 971 1123 971 1148 0.80 # 31394 # 39439 # 1 # ID=2_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.370 2_21 - 3375 NAD_binding_4 PF07993.7 249 0.0016 12.0 0.2 1 1 2.2e-05 0.0037 10.8 0.2 1 98 911 1003 911 1010 0.78 # 21256 # 31380 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.373 4_26 - 253 RuvB_N PF05496.7 234 7.1e-06 19.8 0.0 1 1 4.5e-08 1.5e-05 18.7 0.0 50 110 99 169 75 173 0.77 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 4_26 - 253 AAA_19 PF13245.1 76 2.5e-05 18.6 0.0 1 1 3.4e-07 5.6e-05 17.5 0.0 9 37 99 126 92 155 0.85 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 1_57 - 475 AAA_19 PF13245.1 76 0.00076 13.9 0.0 1 1 1.6e-05 0.0027 12.1 0.0 6 48 231 268 227 273 0.73 # 58019 # 59443 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 2_19 - 252 Nol1_Nop2_Fmu_2 PF13636.1 102 0.0015 13.3 0.0 1 2 0.0045 1.5 3.6 0.0 52 86 76 112 61 119 0.75 # 19502 # 20257 # 1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 2_19 - 252 Nol1_Nop2_Fmu_2 PF13636.1 102 0.0015 13.3 0.0 2 2 0.00032 0.11 7.3 0.0 29 62 199 233 191 234 0.86 # 19502 # 20257 # 1 # ID=2_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 3_17 - 857 AAA_10 PF12846.2 304 8.9e-39 128.3 0.0 1 1 4.1e-40 2e-38 127.1 0.0 3 303 494 800 492 801 0.87 # 12245 # 14815 # 1 # ID=3_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.395 1_102 - 323 AAA_10 PF12846.2 304 1.3e-32 108.1 0.0 1 1 3.4e-34 1.6e-32 107.7 0.0 78 302 11 261 4 263 0.90 # 95364 # 96332 # 1 # ID=1_102;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.364 3_10 - 927 AAA_10 PF12846.2 304 5.4e-11 37.0 0.0 1 1 2.1e-12 1e-10 36.1 0.0 3 299 398 726 396 729 0.69 # 6349 # 9129 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.397 1_38 - 1167 AAA_10 PF12846.2 304 2.5e-10 34.8 0.1 1 1 1.5e-11 6.9e-10 33.4 0.1 3 267 220 578 218 600 0.68 # 33386 # 36886 # -1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_100 - 324 AAA_10 PF12846.2 304 3.5e-07 24.5 0.5 1 1 1.4e-08 6.5e-07 23.6 0.0 1 39 279 318 279 322 0.95 # 91554 # 92525 # 1 # ID=1_100;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 3_47 - 853 AAA_10 PF12846.2 304 1.4e-06 22.5 0.1 1 1 6.5e-08 3.1e-06 21.4 0.1 4 269 463 754 460 768 0.77 # 33479 # 36037 # 1 # ID=3_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 4_26 - 253 AAA_10 PF12846.2 304 0.0015 12.6 0.0 1 1 9.1e-05 0.0044 11.1 0.0 3 34 101 132 99 171 0.81 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 2_22 - 2682 3Beta_HSD PF01073.14 280 0.00031 14.1 0.0 1 1 2.3e-06 0.00078 12.8 0.0 1 68 970 1043 970 1125 0.72 # 31394 # 39439 # 1 # ID=2_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.370 1_15 - 283 ThiF PF00899.16 136 3.5e-15 50.6 0.0 1 1 1.9e-17 6.2e-15 49.8 0.0 4 116 16 148 15 164 0.78 # 13651 # 14499 # -1 # ID=1_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.367 1_57 - 475 ResIII PF04851.10 184 2.5e-06 22.1 0.0 1 1 5.5e-08 6.1e-06 20.8 0.0 13 64 222 276 194 305 0.80 # 58019 # 59443 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 2_30 - 1099 ResIII PF04851.10 184 2.2e-05 18.9 0.3 1 2 0.014 1.5 3.2 0.0 4 70 262 332 259 408 0.72 # 47239 # 50535 # 1 # ID=2_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 2_30 - 1099 ResIII PF04851.10 184 2.2e-05 18.9 0.3 2 2 3.1e-05 0.0034 11.8 0.0 137 165 511 557 419 579 0.66 # 47239 # 50535 # 1 # ID=2_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 3_10 - 927 ResIII PF04851.10 184 0.0012 13.4 0.0 1 1 4.8e-05 0.0053 11.2 0.0 7 155 382 545 376 563 0.75 # 6349 # 9129 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.397 2_28 - 374 Methyltransf_31 PF13847.1 152 6e-06 20.5 0.0 1 1 2.9e-08 9.7e-06 19.8 0.0 7 111 46 154 40 191 0.79 # 45803 # 46924 # 1 # ID=2_28;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 2_75 - 372 FtsJ PF01728.14 181 0.0011 13.6 0.0 1 1 5.6e-06 0.0019 12.8 0.0 40 134 205 362 177 370 0.87 # 104313 # 105428 # -1 # ID=2_75;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.392 5_20 - 210 Zot PF05707.7 193 9.8e-11 36.1 0.1 1 1 3.7e-11 1.2e-08 29.2 0.1 2 155 3 131 2 166 0.73 # 7733 # 8362 # 1 # ID=5_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.325 4_26 - 253 Viral_helicase1 PF01443.13 234 0.0017 12.5 0.0 1 1 1.2e-05 0.004 11.3 0.0 2 75 103 173 102 184 0.67 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 4_26 - 253 TIP49 PF06068.8 398 0.0015 11.9 0.0 1 1 6.5e-06 0.0022 11.3 0.0 49 73 98 122 84 147 0.84 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 2_22 - 2682 Epimerase PF01370.16 236 9.4e-07 23.1 0.2 1 2 0.095 16 -0.6 0.0 43 108 799 864 775 881 0.74 # 31394 # 39439 # 1 # ID=2_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.370 2_22 - 2682 Epimerase PF01370.16 236 9.4e-07 23.1 0.2 2 2 6e-08 1e-05 19.7 0.0 2 166 970 1152 969 1172 0.69 # 31394 # 39439 # 1 # ID=2_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.370 2_21 - 3375 Epimerase PF01370.16 236 0.00089 13.3 0.1 1 1 1.2e-05 0.002 12.2 0.1 2 117 910 1048 909 1079 0.81 # 21256 # 31380 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.373 1_38 - 1167 DEAD PF00270.24 169 8.8e-05 16.6 0.1 1 1 2.2e-06 0.00038 14.6 0.0 16 70 220 299 204 348 0.77 # 33386 # 36886 # -1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_57 - 475 DEAD PF00270.24 169 0.0021 12.2 0.0 1 1 4.2e-05 0.007 10.5 0.0 13 55 234 273 222 279 0.73 # 58019 # 59443 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 1_57 - 475 DUF853 PF05872.7 504 0.00049 13.1 0.0 1 1 2.7e-06 0.00092 12.2 0.0 23 46 237 260 214 270 0.78 # 58019 # 59443 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 1_38 - 1167 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 3.1e-10 33.8 0.3 1 2 0.032 2.6 1.1 0.0 7 32 210 235 206 245 0.80 # 33386 # 36886 # -1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_38 - 1167 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 3.1e-10 33.8 0.3 2 2 8.9e-11 7.4e-09 29.2 0.0 169 383 465 678 449 680 0.74 # 33386 # 36886 # -1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_57 - 475 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 2e-06 21.2 0.4 1 2 0.093 7.8 -0.5 0.0 212 280 146 219 143 235 0.72 # 58019 # 59443 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 1_57 - 475 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 2e-06 21.2 0.4 2 2 2.1e-07 1.7e-05 18.1 0.0 14 51 234 271 226 291 0.88 # 58019 # 59443 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 3_17 - 857 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 1.1e-05 18.8 0.0 1 1 2.6e-07 2.1e-05 17.8 0.0 11 55 488 532 482 535 0.92 # 12245 # 14815 # 1 # ID=3_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.395 3_10 - 927 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 0.00024 14.4 0.0 1 2 5.1e-05 0.0043 10.3 0.0 7 40 388 421 384 426 0.88 # 6349 # 9129 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.397 3_10 - 927 TrwB_AAD_bind PF10412.4 386 0.00024 14.4 0.0 2 2 0.026 2.1 1.4 0.0 248 287 657 696 589 722 0.79 # 6349 # 9129 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.397 4_26 - 253 AAA_11 PF13086.1 236 0.0027 11.9 0.1 1 2 0.00045 0.076 7.1 0.0 19 41 101 123 85 149 0.77 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 4_26 - 253 AAA_11 PF13086.1 236 0.0027 11.9 0.1 2 2 0.015 2.6 2.1 0.0 182 200 151 168 147 172 0.82 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 1_45 - 379 AAA_11 PF13086.1 236 0.014 9.5 6.0 1 1 0.00012 0.02 9.0 5.7 87 183 156 252 136 297 0.73 # 44522 # 45658 # 1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.330 1_57 - 475 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 1.9e-06 22.6 0.0 1 1 1.5e-08 5.1e-06 21.2 0.0 2 50 216 264 215 277 0.86 # 58019 # 59443 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 1_38 - 1167 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 3.2e-08 27.1 0.6 1 3 0.00075 0.25 4.4 0.0 45 64 219 238 171 244 0.68 # 33386 # 36886 # -1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_38 - 1167 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 3.2e-08 27.1 0.6 2 3 9.5e-11 3.2e-08 27.1 0.6 73 422 276 658 271 662 0.73 # 33386 # 36886 # -1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_38 - 1167 T4SS-DNA_transf PF02534.9 469 3.2e-08 27.1 0.6 3 3 0.018 6 -0.1 0.7 340 396 759 815 757 834 0.86 # 33386 # 36886 # -1 # ID=1_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_57 - 475 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00056 14.7 0.0 1 1 1e-05 0.0017 13.2 0.0 1 25 238 262 238 285 0.77 # 58019 # 59443 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 4_26 - 253 RNA_helicase PF00910.17 107 0.0028 12.4 0.0 1 1 3.8e-05 0.0064 11.3 0.0 1 58 102 169 102 189 0.63 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 1_57 - 475 UPF0079 PF02367.12 123 0.00056 14.2 0.0 1 1 4e-06 0.0013 13.0 0.0 8 42 228 262 221 275 0.85 # 58019 # 59443 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 2_75 - 372 TrkA_N PF02254.13 116 0.00062 14.4 0.0 1 1 3.8e-06 0.0013 13.4 0.0 2 42 191 233 190 245 0.83 # 104313 # 105428 # -1 # ID=2_75;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.392 1_35 - 328 S1 PF00575.18 74 0.00028 15.6 3.9 1 3 0.047 16 0.4 0.0 20 40 82 102 77 129 0.82 # 28259 # 29242 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.392 1_35 - 328 S1 PF00575.18 74 0.00028 15.6 3.9 2 3 5.8e-05 0.02 9.7 0.4 5 68 156 218 152 221 0.89 # 28259 # 29242 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.392 1_35 - 328 S1 PF00575.18 74 0.00028 15.6 3.9 3 3 0.003 1 4.2 0.4 6 27 244 266 240 269 0.88 # 28259 # 29242 # -1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.392 4_26 - 253 AAA_24 PF13479.1 213 0.0031 11.7 0.1 1 1 1.8e-05 0.006 10.8 0.1 5 22 101 118 97 170 0.93 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 4_26 - 253 NACHT PF05729.7 166 0.00043 14.6 0.0 1 1 2.3e-06 0.00078 13.7 0.0 3 55 102 155 100 169 0.73 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 4_26 - 253 AAA_25 PF13481.1 194 6.9e-06 20.2 0.0 1 1 1.9e-07 1.6e-05 19.0 0.0 22 60 88 127 66 151 0.78 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 3_10 - 927 AAA_25 PF13481.1 194 0.00021 15.3 0.0 1 1 7.2e-06 0.00061 13.8 0.0 36 140 399 501 384 506 0.66 # 6349 # 9129 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.397 2_23 - 292 AAA_25 PF13481.1 194 0.0013 12.8 0.0 1 1 2.8e-05 0.0024 11.9 0.0 32 149 26 152 23 164 0.63 # 39605 # 40480 # 1 # ID=2_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.330 1_57 - 475 AAA_25 PF13481.1 194 0.0014 12.6 0.0 1 1 3.5e-05 0.0029 11.6 0.0 35 73 237 272 202 278 0.74 # 58019 # 59443 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 1_57 - 475 AAA_28 PF13521.1 163 0.00081 14.0 0.0 1 1 6.2e-06 0.0021 12.6 0.0 2 34 238 275 237 317 0.71 # 58019 # 59443 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 4_26 - 253 AAA_5 PF07728.9 139 1.8e-05 19.1 0.0 1 1 2.7e-07 4.5e-05 17.8 0.0 1 74 101 169 101 189 0.86 # 22909 # 23667 # -1 # ID=4_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 1_57 - 475 AAA_5 PF07728.9 139 0.00092 13.6 0.0 1 1 1.2e-05 0.002 12.5 0.0 1 28 237 266 237 275 0.82 # 58019 # 59443 # 1 # ID=1_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 1_56 - 284 APS_kinase PF01583.15 157 0.00023 15.4 0.0 1 1 1.3e-06 0.00043 14.6 0.0 9 55 23 69 15 85 0.85 # 57152 # 58003 # 1 # ID=1_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.370 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b2 (February 2015) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/06bb6c9b-38c3-42aa-91b8-11e4e9aa5ac4 # Target file: checkm_output/bins/pGCA_000021225.1.assembled/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pGCA_000021225.1.assembled/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/06bb6c9b-38c3-42aa-91b8-11e4e9aa5ac4 checkm_output/bins/pGCA_000021225.1.assembled/genes.faa # Current dir: /mnt/DGK_KLIF/data/klif/reads-for-assembly/trainingsets2/combined/rfplasmid_combined_jellynew2 # Date: Tue Jul 7 16:39:13 2020 # [ok]