# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_11 - 313 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.00024 11.8 0.0 1 1 1.4e-05 0.00052 10.7 0.0 10 52 131 173 126 198 0.79 # 7591 # 8529 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.347 1_14 - 822 cobW PF02492.14 178 0.00025 12.1 0.0 1 1 1.3e-05 0.0005 11.1 0.0 3 21 457 475 455 487 0.84 # 9115 # 11580 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 1_3 - 229 Thymidylate_kin PF02223.12 186 7.9e-06 16.9 0.2 1 2 1.8e-05 0.00035 11.5 0.0 6 44 11 51 10 62 0.77 # 925 # 1611 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.297 1_3 - 229 Thymidylate_kin PF02223.12 186 7.9e-06 16.9 0.2 2 2 0.0069 0.13 3.1 0.3 132 169 186 225 150 228 0.75 # 925 # 1611 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.297 1_10 - 140 Thymidylate_kin PF02223.12 186 0.00025 12.0 0.3 1 1 1.8e-05 0.00034 11.5 0.3 54 120 8 75 1 89 0.85 # 6766 # 7185 # 1 # ID=1_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.257 1_11 - 313 ABC_ATPase PF09818.4 448 1.3e-06 18.7 0.1 1 1 5.4e-08 2.1e-06 18.0 0.1 219 301 117 199 106 207 0.81 # 7591 # 8529 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.347 1_11 - 313 IstB_IS21 PF01695.12 178 7.4e-06 17.0 0.0 1 1 3.5e-07 1.3e-05 16.2 0.0 44 82 140 180 112 208 0.72 # 7591 # 8529 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.347 1_3 - 229 MipZ PF09140.6 261 1.2e-16 52.1 0.5 1 2 2.8e-15 5.4e-14 43.4 0.3 2 140 2 121 1 130 0.83 # 925 # 1611 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.297 1_3 - 229 MipZ PF09140.6 261 1.2e-16 52.1 0.5 2 2 0.071 1.3 -0.6 0.0 127 169 131 173 121 205 0.74 # 925 # 1611 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.297 1_30 - 240 MipZ PF09140.6 261 3.3e-05 14.5 0.0 1 1 2.4e-06 4.5e-05 14.1 0.0 5 46 7 48 3 86 0.90 # 23492 # 24211 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.289 1_3 - 229 YhjQ PF06564.7 244 2.9e-05 15.0 0.0 1 1 2.8e-06 5.3e-05 14.2 0.0 10 42 9 41 1 54 0.89 # 925 # 1611 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.297 1_30 - 240 YhjQ PF06564.7 244 0.0004 11.3 0.0 1 1 3.8e-05 0.00073 10.4 0.0 7 45 9 46 3 54 0.87 # 23492 # 24211 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.289 1_26 - 121 SSB PF00436.20 104 2.6e-22 70.3 0.0 1 1 8e-24 3.1e-22 70.0 0.0 1 103 2 98 2 99 0.96 # 18948 # 19310 # 1 # ID=1_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.303 1_19 - 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822 AAA_21 PF13304.1 303 1.2e-06 20.2 3.8 1 2 0.067 2.6 -0.6 0.3 137 196 254 305 225 362 0.54 # 9115 # 11580 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 1_14 - 822 AAA_21 PF13304.1 303 1.2e-06 20.2 3.8 2 2 3.1e-08 1.2e-06 20.2 3.8 2 299 457 689 456 690 0.63 # 9115 # 11580 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 1_3 - 229 ArsA_ATPase PF02374.10 305 4e-10 30.7 0.6 1 1 3.8e-11 7.2e-10 29.8 0.6 6 110 6 111 1 221 0.82 # 925 # 1611 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.297 1_30 - 240 ArsA_ATPase PF02374.10 305 1.8e-06 18.7 0.1 1 1 2.1e-07 4e-06 17.6 0.0 4 40 6 42 3 63 0.91 # 23492 # 24211 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.289 1_11 - 313 PhoH PF02562.11 205 8.4e-05 13.4 0.0 1 1 4.5e-06 0.00017 12.4 0.0 6 39 129 163 126 203 0.74 # 7591 # 8529 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.347 1_11 - 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822 Arch_ATPase PF01637.13 234 0.00016 13.0 1.5 2 2 2.5e-05 0.00094 10.4 0.0 23 57 457 491 455 501 0.84 # 9115 # 11580 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 1_30 - 240 AAA_16 PF13191.1 185 3.1e-05 15.6 0.0 1 1 4.3e-06 4.1e-05 15.1 0.0 27 119 6 102 5 149 0.78 # 23492 # 24211 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.289 1_14 - 822 AAA_16 PF13191.1 185 4.1e-05 15.1 0.0 1 1 1.4e-05 0.00013 13.5 0.0 25 51 455 481 445 503 0.84 # 9115 # 11580 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 1_3 - 229 AAA_16 PF13191.1 185 0.00016 13.2 0.0 1 1 2.6e-05 0.00025 12.6 0.0 34 75 11 59 9 180 0.73 # 925 # 1611 # 1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.297 1_11 - 313 AAA_16 PF13191.1 185 0.00022 12.8 0.2 1 1 7e-05 0.00067 11.2 0.1 24 50 143 169 136 186 0.85 # 7591 # 8529 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.347 1_14 - 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240 CbiA PF01656.18 195 1.9e-11 35.2 0.1 1 1 1.5e-12 2.8e-11 34.7 0.1 3 48 7 50 5 146 0.71 # 23492 # 24211 # 1 # ID=1_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.289 1_11 - 313 KaiC PF06745.8 227 7.2e-06 16.8 0.5 1 1 3.4e-07 1.3e-05 15.9 0.0 12 45 136 168 114 193 0.79 # 7591 # 8529 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.347 1_14 - 822 AAA_14 PF13173.1 128 0.0037 8.7 0.0 1 2 9.7e-05 0.0037 8.7 0.0 5 27 457 479 455 502 0.76 # 9115 # 11580 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 1_14 - 822 AAA_14 PF13173.1 128 0.0037 8.7 0.0 2 2 0.015 0.56 1.7 0.0 50 110 631 701 599 711 0.63 # 9115 # 11580 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 1_14 - 822 AAA_29 PF13555.1 62 1.4e-06 19.3 0.0 1 1 2e-07 3.7e-06 18.0 0.0 22 42 454 473 444 494 0.78 # 9115 # 11580 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 1_11 - 313 AAA_29 PF13555.1 62 7.4e-06 17.0 1.0 1 1 5.2e-07 1e-05 16.6 0.0 23 44 143 164 131 175 0.86 # 7591 # 8529 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.347 1_14 - 822 AAA PF00004.24 132 2.2e-06 19.5 0.0 1 3 0.00084 0.032 6.0 0.0 29 74 285 331 270 345 0.82 # 9115 # 11580 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 1_14 - 822 AAA PF00004.24 132 2.2e-06 19.5 0.0 2 3 0.00014 0.0054 8.5 0.0 2 19 458 475 457 498 0.82 # 9115 # 11580 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 1_14 - 822 AAA PF00004.24 132 2.2e-06 19.5 0.0 3 3 0.083 3.1 -0.4 0.0 49 111 635 688 630 703 0.66 # 9115 # 11580 # 1 # ID=1_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 1_11 - 313 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00011 13.3 0.0 1 1 5.5e-06 0.00021 12.3 0.0 17 45 138 166 125 198 0.74 # 7591 # 8529 # 1 # ID=1_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.347 1_11 - 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