# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 2_14 - 217 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.00021 13.0 0.0 1 2 1e-05 0.00077 11.2 0.0 20 62 29 70 17 88 0.83 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 2_14 - 217 Mg_chelatase PF01078.16 207 0.00021 13.0 0.0 2 2 0.055 4.3 -1.1 0.0 109 137 155 188 153 208 0.59 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 1_53 - 223 Saccharop_dh PF03435.13 386 0.00034 12.1 0.0 1 1 6.9e-06 0.00053 11.5 0.0 1 43 10 50 10 87 0.84 # 49765 # 50433 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.327 1_8 - 339 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.00045 11.4 1.5 1 2 0.00032 0.025 5.6 0.0 240 264 31 56 11 61 0.89 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_8 - 339 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.00045 11.4 1.5 2 2 0.00097 0.075 4.0 0.3 322 413 156 232 141 258 0.67 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 2_14 - 217 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.00029 12.8 0.4 1 2 9.8e-05 0.0075 8.2 0.0 39 63 21 46 8 59 0.80 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 2_14 - 217 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.00029 12.8 0.4 2 2 0.0042 0.32 2.9 0.1 107 171 151 212 136 216 0.67 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 2_3 - 253 MipZ PF09140.6 261 4e-10 31.7 0.6 1 2 2e-07 1.6e-05 16.6 0.1 3 59 4 60 2 68 0.88 # 2658 # 3416 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAAA;rbs_spacer=15bp;gc_cont=0.291 2_3 - 253 MipZ PF09140.6 261 4e-10 31.7 0.6 2 2 1.7e-06 0.00013 13.6 0.1 35 129 64 153 59 159 0.82 # 2658 # 3416 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAAA;rbs_spacer=15bp;gc_cont=0.291 2_3 - 253 YhjQ PF06564.7 244 6.2e-05 14.9 0.0 1 1 1.3e-06 0.0001 14.2 0.0 1 150 1 155 1 179 0.77 # 2658 # 3416 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAAA;rbs_spacer=15bp;gc_cont=0.291 1_53 - 223 3HCDH_N PF02737.13 180 0.00012 14.3 0.0 1 1 2.5e-06 0.00019 13.6 0.0 2 45 10 53 9 70 0.89 # 49765 # 50433 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.327 2_14 - 217 DUF87 PF01935.12 229 0.00044 12.6 2.3 1 1 1.6e-05 0.00061 12.1 0.4 25 59 32 64 29 67 0.89 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 1_8 - 339 DUF87 PF01935.12 229 0.00056 12.3 0.3 1 1 5.5e-05 0.0021 10.4 0.1 26 41 39 54 25 61 0.90 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_8 - 339 NB-ARC PF00931.17 287 0.00041 11.7 0.1 1 1 2.3e-05 0.0009 10.6 0.0 19 40 36 57 22 69 0.83 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_9 - 320 NB-ARC PF00931.17 287 0.00045 11.6 0.0 1 1 1.9e-05 0.00074 10.9 0.0 19 44 41 66 31 138 0.86 # 6675 # 7634 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 1_8 - 339 AAA_22 PF13401.1 131 6e-08 25.5 0.5 1 1 7.7e-08 2e-06 20.5 0.5 4 123 36 214 33 220 0.69 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 2_14 - 217 AAA_22 PF13401.1 131 1e-06 21.5 0.7 1 1 1.3e-07 3.3e-06 19.8 0.7 6 122 32 191 27 198 0.73 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 1_9 - 320 AAA_22 PF13401.1 131 9.6e-05 15.1 1.8 1 1 9.7e-05 0.0025 10.5 1.8 9 123 46 212 39 221 0.59 # 6675 # 7634 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 2_14 - 217 MutS_V PF00488.16 235 1.4e-05 17.1 0.1 1 2 5.5e-06 0.00043 12.2 0.0 31 66 18 53 7 77 0.79 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 2_14 - 217 MutS_V PF00488.16 235 1.4e-05 17.1 0.1 2 2 0.0042 0.32 2.8 0.1 126 178 156 207 146 216 0.76 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 1_9 - 320 PRK PF00485.13 194 6e-05 15.2 0.2 1 1 1.9e-06 0.00015 13.9 0.0 2 81 44 124 43 140 0.80 # 6675 # 7634 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 2_3 - 253 SRP54 PF00448.17 196 0.00047 12.1 4.5 1 2 2.2e-05 0.0017 10.3 0.6 11 42 12 43 2 51 0.87 # 2658 # 3416 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAAA;rbs_spacer=15bp;gc_cont=0.291 2_3 - 253 SRP54 PF00448.17 196 0.00047 12.1 4.5 2 2 0.0054 0.41 2.5 0.0 46 92 82 131 70 135 0.66 # 2658 # 3416 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAAA;rbs_spacer=15bp;gc_cont=0.291 1_8 - 339 AAA_15 PF13175.1 415 1.8e-08 26.3 0.1 1 2 0.00067 0.026 6.0 0.0 15 54 29 68 14 129 0.80 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_8 - 339 AAA_15 PF13175.1 415 1.8e-08 26.3 0.1 2 2 1.1e-07 4.1e-06 18.5 0.0 361 411 172 216 154 220 0.81 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_9 - 320 AAA_15 PF13175.1 415 1e-05 17.2 0.4 1 2 1.5e-05 0.00058 11.4 0.6 27 91 46 124 6 141 0.82 # 6675 # 7634 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 1_9 - 320 AAA_15 PF13175.1 415 1e-05 17.2 0.4 2 2 0.0046 0.18 3.3 0.0 370 410 173 213 162 218 0.81 # 6675 # 7634 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 1_53 - 223 NAD_binding_7 PF13241.1 103 9.4e-06 18.4 0.1 1 1 5.1e-07 2e-05 17.4 0.1 6 69 6 80 3 115 0.69 # 49765 # 50433 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.327 1_29 - 449 NAD_binding_7 PF13241.1 103 0.00014 14.7 0.1 1 1 6.7e-06 0.00026 13.8 0.1 4 41 230 273 229 344 0.73 # 29002 # 30348 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 2_14 - 217 AAA_17 PF13207.1 121 1.2e-05 18.7 0.0 1 1 9.7e-07 2.5e-05 17.7 0.0 2 46 33 88 32 213 0.73 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 1_8 - 339 AAA_17 PF13207.1 121 9.3e-05 15.8 0.0 1 1 8.7e-06 0.00022 14.6 0.0 1 19 38 56 38 81 0.90 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_9 - 320 AAA_17 PF13207.1 121 0.003 10.9 2.6 1 1 0.00046 0.012 9.0 2.6 2 19 44 61 43 292 0.80 # 6675 # 7634 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 1_8 - 339 AAA_21 PF13304.1 303 5.1e-16 51.9 0.1 1 2 1.2e-05 0.00032 13.2 0.0 2 25 39 64 38 91 0.72 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_8 - 339 AAA_21 PF13304.1 303 5.1e-16 51.9 0.1 2 2 7.8e-13 2e-11 36.8 0.0 226 300 146 218 79 221 0.83 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_9 - 320 AAA_21 PF13304.1 303 5e-13 42.1 2.3 1 1 1.8e-13 4.6e-12 38.9 0.7 3 299 45 215 44 219 0.95 # 6675 # 7634 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 2_14 - 217 AAA_21 PF13304.1 303 1.9e-11 36.9 0.2 1 2 8.5e-07 2.2e-05 17.0 0.0 4 62 35 93 33 113 0.78 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 2_14 - 217 AAA_21 PF13304.1 303 1.9e-11 36.9 0.2 2 2 4.6e-07 1.2e-05 17.9 0.1 233 300 131 196 121 199 0.85 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 1_8 - 339 Miro PF08477.8 119 5.4e-05 16.3 0.1 1 1 1.9e-06 0.00015 14.8 0.0 3 49 40 83 39 101 0.79 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_8 - 339 MobB PF03205.9 140 7.7e-05 15.0 0.0 1 1 2e-06 0.00016 14.0 0.0 2 64 38 98 37 124 0.73 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_45 - 123 Ribosomal_L35p PF01632.14 61 0.0025 10.3 3.3 1 2 7e-05 0.0054 9.2 0.3 33 61 1 29 1 29 0.92 # 44105 # 44473 # 1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.252 1_45 - 123 Ribosomal_L35p PF01632.14 61 0.0025 10.3 3.3 2 2 0.019 1.4 1.5 0.2 29 41 84 96 80 114 0.79 # 44105 # 44473 # 1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.252 1_53 - 223 ADH_zinc_N PF00107.21 130 1.5e-05 17.1 0.1 1 2 0.0068 0.53 2.4 0.0 9 78 22 89 14 91 0.52 # 49765 # 50433 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.327 1_53 - 223 ADH_zinc_N PF00107.21 130 1.5e-05 17.1 0.1 2 2 4.5e-06 0.00034 12.7 0.0 7 47 90 130 86 140 0.85 # 49765 # 50433 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.327 2_3 - 253 ArsA_ATPase PF02374.10 305 3.9e-10 31.7 1.1 1 1 1.1e-11 8.6e-10 30.6 1.1 9 141 10 137 2 222 0.71 # 2658 # 3416 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAAA;rbs_spacer=15bp;gc_cont=0.291 1_8 - 339 PhoH PF02562.11 205 1.7e-05 16.7 0.0 1 2 1.7e-05 0.0013 10.5 0.0 16 58 33 76 19 128 0.66 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_8 - 339 PhoH PF02562.11 205 1.7e-05 16.7 0.0 2 2 0.0017 0.13 3.9 0.0 92 117 297 322 258 326 0.81 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 2_14 - 217 T2SE PF00437.15 272 0.00012 13.5 0.1 1 1 3.3e-06 0.00026 12.5 0.0 119 160 21 62 2 78 0.78 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 1_53 - 223 Shikimate_DH PF01488.15 135 3.7e-06 19.6 0.4 1 1 1.3e-07 1e-05 18.2 0.1 11 76 6 70 1 106 0.79 # 49765 # 50433 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.327 1_53 - 223 F420_oxidored PF03807.12 96 6.4e-08 25.5 0.1 1 2 2.9e-08 2.2e-06 20.6 0.0 2 60 10 65 9 85 0.82 # 49765 # 50433 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.327 1_53 - 223 F420_oxidored PF03807.12 96 6.4e-08 25.5 0.1 2 2 0.0092 0.71 3.0 0.0 41 69 184 211 125 222 0.86 # 49765 # 50433 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.327 1_53 - 223 FAD_binding_3 PF01494.14 356 0.00028 12.5 0.0 1 1 6e-06 0.00046 11.8 0.0 3 39 9 45 7 71 0.86 # 49765 # 50433 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.327 2_14 - 217 SMC_N PF02463.14 220 6.3e-12 37.7 1.0 1 1 3.7e-12 9.5e-11 33.8 1.0 29 213 35 209 20 216 0.74 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 1_8 - 339 SMC_N PF02463.14 220 8.7e-11 33.9 0.0 1 1 7.9e-12 2e-10 32.7 0.0 25 213 37 231 23 238 0.85 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_9 - 320 SMC_N PF02463.14 220 6.5e-08 24.5 0.4 1 1 4.8e-09 1.2e-07 23.7 0.4 26 213 43 229 30 235 0.75 # 6675 # 7634 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 2_3 - 253 VirC1 PF07015.6 231 3.9e-09 28.4 2.1 1 2 4.6e-06 0.00036 12.2 0.0 1 74 1 75 1 112 0.79 # 2658 # 3416 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAAA;rbs_spacer=15bp;gc_cont=0.291 2_3 - 253 VirC1 PF07015.6 231 3.9e-09 28.4 2.1 2 2 3.2e-07 2.5e-05 16.0 0.5 82 165 121 202 104 215 0.88 # 2658 # 3416 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAAA;rbs_spacer=15bp;gc_cont=0.291 2_3 - 253 Fer4_NifH PF00142.13 273 2.9e-06 19.1 4.4 1 1 1e-06 7.8e-05 14.5 4.4 8 52 10 54 3 252 0.82 # 2658 # 3416 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAAA;rbs_spacer=15bp;gc_cont=0.291 2_14 - 217 AAA_16 PF13191.1 185 4.4e-05 16.1 1.0 1 2 6.6e-06 0.00026 13.6 0.8 25 58 31 65 17 203 0.74 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 2_14 - 217 AAA_16 PF13191.1 185 4.4e-05 16.1 1.0 2 2 0.038 1.5 1.3 0.1 71 111 169 209 158 215 0.79 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 1_8 - 339 AAA_16 PF13191.1 185 8.3e-05 15.1 0.1 1 1 6.2e-06 0.00024 13.6 0.0 19 44 31 56 23 75 0.85 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_8 - 339 AAA_23 PF13476.1 202 5.4e-05 16.1 0.1 1 1 4.6e-06 0.00012 15.0 0.1 15 40 29 57 20 93 0.82 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 2_14 - 217 AAA_23 PF13476.1 202 0.0004 13.3 0.1 1 1 1.7e-05 0.00044 13.1 0.1 24 63 35 73 24 197 0.81 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 1_45 - 123 AAA_23 PF13476.1 202 0.0063 9.3 12.9 1 1 0.00029 0.0074 9.1 12.9 89 197 8 115 1 120 0.41 # 44105 # 44473 # 1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.252 2_14 - 217 AAA_18 PF13238.1 129 3.1e-08 26.5 0.0 1 2 4.3e-08 1.1e-06 21.5 0.0 1 43 33 75 33 119 0.90 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 2_14 - 217 AAA_18 PF13238.1 129 3.1e-08 26.5 0.0 2 2 0.019 0.48 3.3 0.0 49 92 163 204 123 214 0.81 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 1_9 - 320 AAA_18 PF13238.1 129 1.6e-05 17.8 0.4 1 1 1.4e-06 3.7e-05 16.6 0.1 1 67 44 126 44 148 0.62 # 6675 # 7634 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 1_8 - 339 AAA_18 PF13238.1 129 0.00061 12.7 0.5 1 1 0.00022 0.0057 9.5 0.1 2 19 40 57 39 95 0.83 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_8 - 339 AAA_13 PF13166.1 712 0.00062 10.8 0.1 1 2 0.007 0.54 1.1 0.0 21 40 41 60 31 90 0.77 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_8 - 339 AAA_13 PF13166.1 712 0.00062 10.8 0.1 2 2 8e-05 0.0062 7.5 0.0 527 579 174 225 168 252 0.89 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_53 - 223 GFO_IDH_MocA PF01408.17 120 0.00018 14.6 0.0 1 1 6e-06 0.00046 13.3 0.0 2 83 9 92 8 99 0.74 # 49765 # 50433 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.327 2_3 - 253 CbiA PF01656.18 195 1.1e-32 105.5 2.0 1 1 3.4e-34 1.3e-32 105.3 2.0 1 180 4 212 4 231 0.80 # 2658 # 3416 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAAA;rbs_spacer=15bp;gc_cont=0.291 1_8 - 339 CbiA PF01656.18 195 0.00011 14.2 1.0 1 2 0.00079 0.03 6.2 0.1 4 21 41 58 38 66 0.84 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_8 - 339 CbiA PF01656.18 195 0.00011 14.2 1.0 2 2 0.00059 0.023 6.6 0.1 111 169 169 226 154 252 0.83 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 2_14 - 217 AAA_14 PF13173.1 128 0.00047 12.6 0.1 1 2 0.00015 0.011 8.1 0.0 5 25 33 53 29 91 0.80 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 2_14 - 217 AAA_14 PF13173.1 128 0.00047 12.6 0.1 2 2 0.0066 0.51 2.8 0.0 62 114 153 212 105 216 0.72 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 1_53 - 223 HI0933_like PF03486.9 409 0.00049 11.1 0.1 1 2 1.6e-05 0.0012 9.8 0.1 2 40 9 47 8 49 0.94 # 49765 # 50433 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.327 1_53 - 223 HI0933_like PF03486.9 409 0.00049 11.1 0.1 2 2 0.06 4.6 -2.0 0.0 117 166 167 214 126 215 0.51 # 49765 # 50433 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.327 2_14 - 217 AAA_29 PF13555.1 62 2.8e-07 22.6 0.1 1 1 2.1e-08 5.4e-07 21.7 0.1 6 40 14 47 9 62 0.79 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 1_8 - 339 AAA_29 PF13555.1 62 4.2e-07 22.0 0.1 1 1 3e-08 7.8e-07 21.2 0.1 20 51 34 64 20 68 0.75 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_9 - 320 AAA_29 PF13555.1 62 6.4e-06 18.2 0.4 1 1 5.1e-07 1.3e-05 17.3 0.4 13 39 32 57 29 62 0.84 # 6675 # 7634 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 2_14 - 217 AAA PF00004.24 132 1.6e-06 20.9 1.5 1 1 5.2e-07 2e-05 17.4 1.5 2 119 34 202 33 215 0.68 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 1_8 - 339 AAA PF00004.24 132 1.3e-05 18.0 0.3 1 1 9.8e-06 0.00038 13.2 0.1 3 116 41 179 39 195 0.73 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_5 - 230 rRNA_methylase PF06962.7 140 0.00038 12.7 0.0 1 1 8.8e-06 0.00068 11.9 0.0 12 88 134 209 129 211 0.93 # 4296 # 4985 # 1 # ID=1_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.371 1_9 - 320 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00024 13.2 0.3 1 2 0.00018 0.007 8.4 0.1 19 54 38 73 23 88 0.82 # 6675 # 7634 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 1_9 - 320 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00024 13.2 0.3 2 2 0.0096 0.37 2.8 0.0 78 118 155 198 150 230 0.83 # 6675 # 7634 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 1_8 - 339 Sigma54_activat PF00158.21 168 0.00032 12.7 0.0 1 1 2e-05 0.00076 11.5 0.0 8 48 22 62 17 70 0.74 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_9 - 320 MMR_HSR1 PF01926.18 116 2.6e-05 16.7 0.1 1 1 7.2e-07 5.5e-05 15.7 0.1 2 61 44 147 43 208 0.68 # 6675 # 7634 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 1_8 - 339 DUF258 PF03193.11 161 2.9e-05 15.8 0.0 1 1 1.9e-06 4.9e-05 15.1 0.0 21 62 21 63 2 77 0.72 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 2_14 - 217 DUF258 PF03193.11 161 9.3e-05 14.2 0.0 1 1 6e-06 0.00015 13.5 0.0 26 58 20 53 3 97 0.81 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 1_9 - 320 DUF258 PF03193.11 161 0.00015 13.6 0.2 1 1 1e-05 0.00026 12.7 0.2 33 65 38 71 17 93 0.80 # 6675 # 7634 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 1_53 - 223 NAD_binding_2 PF03446.10 163 2.3e-09 29.8 0.3 1 1 5e-11 3.9e-09 29.1 0.1 2 95 8 107 7 119 0.85 # 49765 # 50433 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.327 2_3 - 253 AAA_31 PF13614.1 157 1.3e-11 37.2 2.2 1 1 2.1e-13 1.6e-11 36.9 0.5 1 155 2 159 2 161 0.80 # 2658 # 3416 # 1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAAA;rbs_spacer=15bp;gc_cont=0.291 2_14 - 217 NTPase_1 PF03266.10 168 0.0001 14.5 3.4 1 2 5e-06 0.00039 12.7 0.4 1 25 32 56 32 63 0.88 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 2_14 - 217 NTPase_1 PF03266.10 168 0.0001 14.5 3.4 2 2 0.0058 0.45 2.7 0.2 66 144 123 204 103 214 0.73 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 1_8 - 339 AAA_33 PF13671.1 143 6.7e-05 15.3 0.0 1 1 1.4e-06 0.00011 14.6 0.0 1 21 38 58 38 165 0.80 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_53 - 223 NAD_Gly3P_dh_N PF01210.18 157 0.00011 14.5 0.0 1 2 8.7e-06 0.00067 11.9 0.0 2 41 10 49 9 56 0.91 # 49765 # 50433 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.327 1_53 - 223 NAD_Gly3P_dh_N PF01210.18 157 0.00011 14.5 0.0 2 2 0.043 3.3 -0.0 0.0 38 76 172 210 147 221 0.71 # 49765 # 50433 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.327 1_53 - 223 2-Hacid_dh_C PF02826.14 178 1.4e-06 20.1 0.0 1 2 5.5e-08 4.3e-06 18.5 0.0 35 75 6 46 1 66 0.84 # 49765 # 50433 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.327 1_53 - 223 2-Hacid_dh_C PF02826.14 178 1.4e-06 20.1 0.0 2 2 0.089 6.8 -1.7 0.0 57 97 177 209 165 212 0.64 # 49765 # 50433 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.327 1_53 - 223 XdhC_C PF13478.1 136 3.9e-06 19.8 0.0 1 1 1.3e-07 1e-05 18.4 0.0 1 83 10 100 10 116 0.79 # 49765 # 50433 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.327 1_45 - 123 Ribosomal_S15 PF00312.17 83 0.00029 13.2 3.3 1 1 1.1e-05 0.00085 11.7 3.3 22 66 70 120 55 122 0.77 # 44105 # 44473 # 1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.252 1_53 - 223 ApbA PF02558.11 151 3.4e-07 22.3 0.0 1 2 5.8e-08 4.4e-06 18.7 0.0 1 40 10 50 10 103 0.77 # 49765 # 50433 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.327 1_53 - 223 ApbA PF02558.11 151 3.4e-07 22.3 0.0 2 2 0.012 0.89 1.5 0.0 67 99 177 209 142 211 0.87 # 49765 # 50433 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.327 1_8 - 339 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00029 12.9 0.0 1 1 1.3e-05 0.0005 12.1 0.0 40 59 38 57 19 67 0.83 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 2_14 - 217 FtsK_SpoIIIE PF01580.13 205 0.00051 12.1 0.1 1 1 2.5e-05 0.00097 11.2 0.1 26 59 17 51 10 60 0.81 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 1_8 - 339 Dynamin_N PF00350.18 168 0.0005 12.4 0.2 1 1 1.6e-05 0.0012 11.2 0.2 1 31 39 68 39 73 0.88 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_29 - 449 ELFV_dehydrog PF00208.16 244 2.7e-89 291.4 1.7 1 1 9.4e-91 3.6e-89 291.0 1.7 1 244 203 446 203 446 0.97 # 29002 # 30348 # 1 # ID=1_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.441 1_53 - 223 ELFV_dehydrog PF00208.16 244 0.00011 14.4 0.2 1 1 8e-06 0.00031 12.9 0.0 31 63 6 37 1 52 0.87 # 49765 # 50433 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.327 1_9 - 320 ABC_tran PF00005.22 137 2.5e-35 114.3 0.1 1 1 1.7e-36 4.4e-35 113.5 0.1 2 136 32 182 31 183 0.93 # 6675 # 7634 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 2_14 - 217 ABC_tran PF00005.22 137 6.8e-33 106.4 0.0 1 1 3.9e-34 9.9e-33 105.9 0.0 1 137 20 163 20 163 0.94 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 1_8 - 339 ABC_tran PF00005.22 137 3.3e-32 104.2 0.0 1 1 2.7e-33 6.9e-32 103.2 0.0 3 136 28 184 26 185 0.93 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_53 - 223 UDPG_MGDP_dh_N PF03721.9 185 6e-06 18.3 0.1 1 1 1.8e-07 1.4e-05 17.1 0.1 2 57 9 66 8 80 0.87 # 49765 # 50433 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.327 2_14 - 217 AAA_19 PF13245.1 76 6.6e-05 15.2 0.2 1 1 2.2e-06 0.00017 13.9 0.2 9 36 30 55 26 70 0.83 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 1_8 - 339 AAA_10 PF12846.2 304 1.4e-06 20.4 0.2 1 2 4.3e-05 0.0011 10.9 0.1 4 21 39 56 37 69 0.85 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_8 - 339 AAA_10 PF12846.2 304 1.4e-06 20.4 0.2 2 2 0.00046 0.012 7.5 0.0 216 268 170 222 131 249 0.73 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 2_14 - 217 AAA_10 PF12846.2 304 7.2e-06 18.1 0.2 1 2 5.4e-06 0.00014 13.9 0.0 2 28 31 57 30 82 0.81 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 2_14 - 217 AAA_10 PF12846.2 304 7.2e-06 18.1 0.2 2 2 0.013 0.33 2.8 0.0 218 270 150 202 89 213 0.77 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 1_9 - 320 AAA_10 PF12846.2 304 0.00014 13.9 0.5 1 2 3.8e-05 0.00098 11.1 0.3 6 32 46 73 42 114 0.71 # 6675 # 7634 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 1_9 - 320 AAA_10 PF12846.2 304 0.00014 13.9 0.5 2 2 0.081 2.1 0.2 0.0 215 265 167 217 137 235 0.79 # 6675 # 7634 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 2_14 - 217 SbcCD_C PF13558.1 90 2.3e-05 16.8 0.0 1 2 0.077 6 -0.5 0.0 33 47 38 52 22 60 0.74 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 2_14 - 217 SbcCD_C PF13558.1 90 2.3e-05 16.8 0.0 2 2 7.5e-05 0.0058 9.1 0.0 64 87 153 176 106 179 0.73 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 1_53 - 223 Pyr_redox PF00070.22 80 0.0001 15.2 0.8 1 2 8.2e-05 0.0063 9.5 0.0 1 32 9 40 9 69 0.88 # 49765 # 50433 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.327 1_53 - 223 Pyr_redox PF00070.22 80 0.0001 15.2 0.8 2 2 0.007 0.54 3.3 0.0 17 65 92 145 83 158 0.70 # 49765 # 50433 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.327 1_8 - 339 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.00012 14.7 0.0 1 2 0.00011 0.0084 8.7 0.0 22 50 37 65 21 86 0.80 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_8 - 339 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 0.00012 14.7 0.0 2 2 0.0086 0.66 2.6 0.0 70 96 286 312 259 319 0.84 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_45 - 123 AAA_32 PF13654.1 509 8.1e-05 13.9 4.1 1 1 1.2e-06 9.4e-05 13.7 4.1 137 242 18 119 2 121 0.87 # 44105 # 44473 # 1 # ID=1_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.252 2_14 - 217 RNA_helicase PF00910.17 107 0.00017 14.3 0.0 1 1 4.8e-06 0.00037 13.2 0.0 1 26 33 58 33 87 0.83 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 1_53 - 223 TrkA_N PF02254.13 116 1.1e-27 88.9 0.2 1 1 5e-29 3.9e-27 87.2 0.1 1 116 10 125 10 125 0.96 # 49765 # 50433 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.327 1_53 - 223 IlvN PF07991.7 165 7.7e-06 17.9 0.1 1 2 4.2e-07 3.2e-05 15.9 0.0 4 46 7 49 4 69 0.91 # 49765 # 50433 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.327 1_53 - 223 IlvN PF07991.7 165 7.7e-06 17.9 0.1 2 2 0.048 3.7 -0.6 0.0 45 69 137 161 107 211 0.58 # 49765 # 50433 # -1 # ID=1_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.327 2_14 - 217 NACHT PF05729.7 166 4.3e-05 15.8 0.7 1 2 2e-05 0.00076 11.7 0.2 3 26 33 56 31 63 0.86 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 2_14 - 217 NACHT PF05729.7 166 4.3e-05 15.8 0.7 2 2 0.011 0.42 2.8 0.0 90 122 158 190 83 210 0.77 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 1_8 - 339 NACHT PF05729.7 166 0.00031 12.9 0.0 1 1 1.5e-05 0.00059 12.0 0.0 2 21 38 57 37 67 0.87 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_8 - 339 AAA_25 PF13481.1 194 1.9e-06 19.9 0.1 1 2 8.2e-07 2.1e-05 16.5 0.0 29 54 32 57 4 60 0.80 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_8 - 339 AAA_25 PF13481.1 194 1.9e-06 19.9 0.1 2 2 0.044 1.1 1.1 0.0 134 188 166 215 126 216 0.66 # 5662 # 6678 # 1 # ID=1_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 2_14 - 217 AAA_25 PF13481.1 194 6.2e-06 18.2 0.1 1 2 1.3e-06 3.3e-05 15.9 0.0 29 63 26 62 13 78 0.80 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 2_14 - 217 AAA_25 PF13481.1 194 6.2e-06 18.2 0.1 2 2 0.099 2.5 -0.1 0.1 159 188 167 193 140 209 0.65 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 1_9 - 320 AAA_25 PF13481.1 194 0.0005 12.0 0.1 1 2 0.00028 0.0073 8.2 0.0 30 50 38 58 30 107 0.91 # 6675 # 7634 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 1_9 - 320 AAA_25 PF13481.1 194 0.0005 12.0 0.1 2 2 0.036 0.91 1.4 0.0 165 188 190 213 161 214 0.80 # 6675 # 7634 # 1 # ID=1_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 2_14 - 217 AAA_28 PF13521.1 163 0.0004 12.9 1.4 1 1 4.9e-06 0.00037 13.0 0.5 2 22 33 53 32 133 0.86 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 2_14 - 217 AAA_5 PF07728.9 139 1.8e-06 20.3 0.1 1 2 1.9e-06 0.00015 14.1 0.0 1 29 32 62 32 90 0.74 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 2_14 - 217 AAA_5 PF07728.9 139 1.8e-06 20.3 0.1 2 2 0.0029 0.22 3.8 0.0 23 76 109 163 102 184 0.78 # 10947 # 11597 # -1 # ID=2_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=TAA;rbs_spacer=14bp;gc_cont=0.435 # # Program: hmmsearch # Version: 3.1b2 (February 2015) # Pipeline mode: SEARCH # Query file: /tmp/7e487306-9171-43ec-9148-b4c008b2f208 # Target file: checkm_output/bins/pAY849557.2.assembled/genes.faa # Option settings: hmmsearch --domtblout checkm_output/bins/pAY849557.2.assembled/hmmer.analyze.txt --noali --notextw -E 0.1 --domE 0.1 --cpu 1 /tmp/7e487306-9171-43ec-9148-b4c008b2f208 checkm_output/bins/pAY849557.2.assembled/genes.faa # Current dir: /mnt/DGK_KLIF/data/klif/reads-for-assembly/trainingsets2/combined/rfplasmid_combined_jellynew2 # Date: Tue Jul 7 16:36:21 2020 # [ok]