# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 62_7 - 162 UPF0054 PF02130.12 145 1.5e-43 145.8 0.0 1 1 4.1e-47 1.7e-43 145.5 0.0 19 145 27 152 16 152 0.91 # 4991 # 5476 # -1 # ID=62_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.632 15_2 - 691 Sulfotransfer_3 PF13469.1 215 7.5e-07 28.4 7.9 1 1 3.5e-10 7.5e-07 28.4 7.9 38 208 469 642 439 649 0.76 # 671 # 2743 # -1 # ID=15_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.689 35_29 - 228 Sulfotransfer_3 PF13469.1 215 0.0001 21.5 1.1 1 1 1e-07 0.00021 20.4 0.6 3 164 5 118 4 152 0.62 # 26690 # 27373 # -1 # ID=35_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.526 85_10 - 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277 MobB PF03205.9 140 0.024 12.5 0.1 1 1 0.0027 0.3 9.0 0.0 2 20 57 75 56 81 0.84 # 28448 # 29278 # -1 # ID=33_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.584 13_40 - 590 MobB PF03205.9 140 0.024 12.5 0.0 1 1 0.00049 0.055 11.4 0.0 2 23 378 399 377 405 0.92 # 37458 # 39227 # -1 # ID=13_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.654 155_3 - 626 MobB PF03205.9 140 0.028 12.3 0.0 1 1 0.00046 0.051 11.5 0.0 2 23 408 429 407 442 0.89 # 1200 # 3077 # -1 # ID=155_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.620 60_13 - 306 MobB PF03205.9 140 0.031 12.2 0.2 1 1 0.0012 0.13 10.1 0.1 3 24 108 129 106 144 0.89 # 22542 # 23459 # -1 # ID=60_13;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 115_6 - 429 MobB PF03205.9 140 0.033 12.1 0.0 1 1 0.00077 0.086 10.7 0.0 3 24 117 138 116 141 0.91 # 5019 # 6305 # 1 # ID=115_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.592 30_11 - 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540 ABC_tran PF00005.22 137 6.5e-05 21.4 0.1 1 1 3.5e-06 0.00023 19.7 0.0 15 43 50 77 45 146 0.83 # 10986 # 12605 # -1 # ID=97_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.661 53_6 - 862 ABC_tran PF00005.22 137 0.00019 20.0 0.6 1 1 0.0021 0.13 10.7 0.0 15 51 602 639 596 652 0.79 # 7718 # 10303 # 1 # ID=53_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.618 23_39 - 167 ABC_tran PF00005.22 137 0.00022 19.7 0.0 1 1 3.1e-05 0.002 16.6 0.0 10 35 27 52 20 75 0.87 # 38562 # 39062 # -1 # ID=23_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.645 110_1 - 369 ABC_tran PF00005.22 137 0.00056 18.4 0.0 1 1 0.00092 0.059 11.9 0.0 12 32 24 44 18 70 0.87 # 947 # 2053 # 1 # ID=110_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.611 127_10 - 440 ABC_tran PF00005.22 137 0.00057 18.4 0.2 1 1 6.7e-05 0.0043 15.5 0.0 13 42 200 229 194 322 0.84 # 6702 # 8021 # 1 # ID=127_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.654 6_57 - 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712 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 7.1e-13 46.5 0.2 1 2 0.013 4.7 4.7 0.0 71 132 265 322 251 333 0.70 # 12129 # 14264 # 1 # ID=93_17;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.657 93_17 - 712 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 7.1e-13 46.5 0.2 2 2 2.4e-12 8.5e-10 36.5 0.0 38 126 547 632 542 655 0.86 # 12129 # 14264 # 1 # ID=93_17;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.657 30_28 - 389 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 9.6e-11 39.6 0.0 1 1 4.4e-13 1.6e-10 38.9 0.0 35 140 209 310 204 324 0.86 # 30471 # 31637 # -1 # ID=30_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.620 50_9 - 490 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1.1e-07 29.6 0.0 1 1 5.5e-10 2e-07 28.8 0.0 43 124 343 422 331 442 0.87 # 7707 # 9176 # 1 # ID=50_9;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.637 70_12 - 307 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 5e-05 20.9 0.0 1 1 2.6e-07 9.3e-05 20.1 0.0 35 97 163 226 144 236 0.80 # 15758 # 16678 # -1 # ID=70_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.685 9_50 - 287 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00018 19.1 0.0 1 1 8.4e-07 0.0003 18.4 0.0 41 126 114 194 106 205 0.81 # 42269 # 43129 # 1 # ID=9_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.655 12_40 - 309 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00022 18.8 0.0 1 1 1.4e-06 0.00049 17.7 0.0 35 129 124 211 112 224 0.78 # 42072 # 42998 # 1 # ID=12_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.633 45_4 - 238 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0015 16.2 0.0 1 2 0.00067 0.24 9.0 0.0 96 129 5 36 1 55 0.75 # 5103 # 5816 # -1 # ID=45_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.632 45_4 - 238 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0015 16.2 0.0 2 2 0.017 6.2 4.4 0.0 42 55 191 204 182 209 0.83 # 5103 # 5816 # -1 # ID=45_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.632 84_21 - 356 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0034 15.0 0.0 1 1 1.9e-05 0.0067 14.0 0.0 48 126 211 285 198 294 0.81 # 15679 # 16746 # 1 # ID=84_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.677 82_8 - 386 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0063 14.1 0.0 1 1 6.9e-05 0.025 12.2 0.0 50 151 196 299 184 311 0.62 # 12080 # 13237 # -1 # ID=82_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.660 33_19 - 332 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.012 13.2 0.0 1 1 7.7e-05 0.027 12.0 0.0 41 118 146 215 133 246 0.84 # 17282 # 18277 # -1 # ID=33_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 7_11 - 231 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.015 12.9 0.0 1 1 5.7e-05 0.02 12.5 0.0 26 107 73 154 60 169 0.78 # 9201 # 9893 # -1 # ID=7_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.671 56_11 - 503 Eco57I PF07669.6 106 0.00011 20.7 0.0 1 1 9.5e-08 0.0004 18.9 0.0 2 104 282 394 280 397 0.84 # 15688 # 17196 # 1 # ID=56_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 127_8 - 328 IPPT PF01715.12 253 1.9e-82 274.3 0.0 1 1 5.2e-86 2.2e-82 274.0 0.0 2 252 42 300 41 301 0.97 # 5350 # 6333 # 1 # ID=127_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.664 72_7 - 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761 TIP49 PF06068.8 398 0.0051 13.7 0.1 1 1 0.00042 0.13 9.1 0.0 54 93 214 253 183 262 0.84 # 11171 # 13453 # -1 # ID=16_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 20_3 - 320 TIP49 PF06068.8 398 0.013 12.4 0.0 1 1 6.7e-05 0.02 11.8 0.0 46 76 23 52 10 61 0.82 # 2261 # 3220 # -1 # ID=20_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.691 16_2 - 459 TIP49 PF06068.8 398 0.015 12.2 0.0 1 1 0.00017 0.05 10.5 0.0 23 74 34 83 20 97 0.82 # 507 # 1883 # -1 # ID=16_2;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.626 103_8 - 234 TIP49 PF06068.8 398 0.032 11.1 0.1 1 2 0.0013 0.39 7.5 0.1 53 72 44 63 28 75 0.84 # 6182 # 6883 # 1 # ID=103_8;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.660 103_8 - 234 TIP49 PF06068.8 398 0.032 11.1 0.1 2 2 0.099 30 1.3 0.0 343 381 157 195 137 208 0.79 # 6182 # 6883 # 1 # ID=103_8;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.660 115_7 - 826 TIP49 PF06068.8 398 0.058 10.3 3.7 1 2 0.0012 0.36 7.6 0.1 45 77 345 377 336 387 0.84 # 6447 # 8924 # 1 # ID=115_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 115_7 - 826 TIP49 PF06068.8 398 0.058 10.3 3.7 2 2 0.031 9.5 3.0 0.0 330 360 476 506 466 544 0.65 # 6447 # 8924 # 1 # ID=115_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 33_28 - 277 Adeno_IVa2 PF02456.10 370 0.003 14.4 0.0 1 1 7.1e-06 0.01 12.7 0.0 66 107 33 75 15 87 0.76 # 28448 # 29278 # -1 # ID=33_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.584 270_2 - 170 Adeno_IVa2 PF02456.10 370 0.017 11.9 0.0 1 1 1.5e-05 0.021 11.7 0.0 91 128 75 110 44 121 0.83 # 127 # 636 # 1 # ID=270_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.563 30_11 - 265 Adeno_IVa2 PF02456.10 370 0.037 10.8 0.0 1 1 3.8e-05 0.054 10.3 0.0 88 121 35 66 27 74 0.83 # 14388 # 15182 # 1 # ID=30_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.674 21_18 - 293 EF_TS PF00889.14 221 9.2e-70 232.6 4.6 1 1 2.7e-73 1.1e-69 232.3 4.6 1 221 56 272 56 272 0.97 # 22594 # 23472 # 1 # ID=21_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.614 87_19 - 120 Ribosomal_L18p PF00861.17 119 1.2e-31 107.6 5.1 1 1 3.2e-35 1.4e-31 107.4 5.1 6 119 8 119 4 119 0.93 # 8405 # 8764 # 1 # ID=87_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 7_4 - 464 NAD_binding_9 PF13454.1 156 9.5e-36 121.1 0.7 1 1 4.8e-37 1.4e-34 117.3 0.1 1 155 13 164 13 165 0.93 # 3664 # 5055 # -1 # ID=7_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.659 182_4 - 470 NAD_binding_9 PF13454.1 156 2.9e-23 80.6 3.6 1 1 6e-25 1.7e-22 78.1 0.0 2 155 7 149 6 150 0.91 # 2109 # 3518 # 1 # ID=182_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 6_25 - 399 NAD_binding_9 PF13454.1 156 7.2e-05 20.8 0.0 1 1 4.7e-07 0.00013 19.9 0.0 2 78 29 105 28 158 0.83 # 28103 # 29299 # 1 # ID=6_25;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.608 43_10 - 438 NAD_binding_9 PF13454.1 156 7.9e-05 20.7 0.9 1 1 1.1e-06 0.00031 18.7 0.3 2 46 12 51 11 72 0.89 # 12702 # 14015 # -1 # ID=43_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.687 31_5 - 494 NAD_binding_9 PF13454.1 156 0.00065 17.7 0.5 1 1 5.4e-05 0.015 13.2 0.2 1 35 151 180 151 187 0.80 # 5153 # 6634 # -1 # ID=31_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.670 58_6 - 570 NAD_binding_9 PF13454.1 156 0.00081 17.4 1.2 1 2 0.00013 0.036 12.0 0.3 1 40 233 266 233 277 0.85 # 3487 # 5196 # 1 # ID=58_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.652 58_6 - 570 NAD_binding_9 PF13454.1 156 0.00081 17.4 1.2 2 2 0.061 17 3.3 0.0 128 154 315 341 291 343 0.76 # 3487 # 5196 # 1 # ID=58_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.652 50_11 - 343 NAD_binding_9 PF13454.1 156 0.0014 16.6 0.3 1 1 7.6e-05 0.021 12.8 0.1 1 40 17 51 17 62 0.86 # 9824 # 10852 # 1 # ID=50_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.653 51_16 - 417 NAD_binding_9 PF13454.1 156 0.0058 14.6 5.6 1 2 0.0086 2.4 6.1 2.7 1 42 9 45 9 139 0.73 # 20251 # 21501 # -1 # ID=51_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.655 51_16 - 417 NAD_binding_9 PF13454.1 156 0.0058 14.6 5.6 2 2 0.0014 0.39 8.6 0.0 117 154 219 254 201 256 0.70 # 20251 # 21501 # -1 # ID=51_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.655 9_25 - 394 NAD_binding_9 PF13454.1 156 0.0074 14.3 4.1 1 1 9.2e-05 0.026 12.5 0.7 2 154 11 166 10 168 0.71 # 21502 # 22683 # 1 # ID=9_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.673 72_4 - 347 NAD_binding_9 PF13454.1 156 0.0089 14.0 0.1 1 1 5.5e-05 0.015 13.2 0.1 94 146 229 283 203 286 0.85 # 2990 # 4030 # 1 # ID=72_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 44_12 - 417 NAD_binding_9 PF13454.1 156 0.013 13.5 1.1 1 2 0.0029 0.82 7.6 0.0 1 42 7 42 7 67 0.84 # 11905 # 13155 # -1 # ID=44_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.637 44_12 - 417 NAD_binding_9 PF13454.1 156 0.013 13.5 1.1 2 2 0.084 24 2.9 0.0 114 153 223 261 212 262 0.72 # 11905 # 13155 # -1 # ID=44_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.637 8_43 - 550 NAD_binding_9 PF13454.1 156 0.02 12.9 0.1 1 1 0.00019 0.055 11.4 0.1 3 37 26 58 24 65 0.88 # 43631 # 45280 # -1 # ID=8_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.641 37_20 - 72 NAD_binding_9 PF13454.1 156 0.023 12.6 0.0 1 1 9e-05 0.026 12.5 0.0 5 41 22 56 7 67 0.90 # 16401 # 16616 # -1 # ID=37_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.653 14_40 - 541 NAD_binding_9 PF13454.1 156 0.031 12.2 0.1 1 1 0.00066 0.19 9.7 0.0 1 41 9 47 9 56 0.85 # 49845 # 51467 # 1 # ID=14_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.620 67_18 - 680 NAD_binding_9 PF13454.1 156 0.099 10.6 7.2 1 2 0.00026 0.075 11.0 0.1 1 39 387 420 387 427 0.81 # 19141 # 21180 # 1 # ID=67_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.655 67_18 - 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