# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 18_44 - 162 UPF0054 PF02130.12 145 2.9e-43 144.9 0.0 1 1 7.5e-47 3.3e-43 144.7 0.0 21 145 29 152 16 152 0.89 # 66122 # 66607 # -1 # ID=18_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.658 47_18 - 530 Sulfotransfer_3 PF13469.1 215 2.1e-17 62.7 4.5 1 1 1.9e-20 2.1e-17 62.7 4.5 1 212 282 470 282 473 0.61 # 25278 # 26867 # 1 # ID=47_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.651 2_155 - 691 Sulfotransfer_3 PF13469.1 215 5.3e-07 29.0 7.8 1 1 4.7e-10 5.3e-07 29.0 7.8 38 206 469 640 446 677 0.76 # 173106 # 175178 # -1 # ID=2_155;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.717 1_54 - 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989 PRK PF00485.13 194 0.038 11.8 0.0 2 2 0.011 7.8 4.2 0.0 3 32 639 668 637 693 0.67 # 72227 # 75193 # 1 # ID=13_61;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.641 20_30 - 240 PRK PF00485.13 194 0.042 11.7 0.0 1 1 9.1e-05 0.067 11.0 0.0 2 17 34 49 33 84 0.83 # 27874 # 28593 # -1 # ID=20_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.647 22_67 - 195 PRK PF00485.13 194 0.042 11.6 0.0 1 1 8.4e-05 0.062 11.1 0.0 2 24 17 39 16 61 0.81 # 77131 # 77715 # 1 # ID=22_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.658 22_3 - 927 PRK PF00485.13 194 0.046 11.5 0.0 1 2 0.0019 1.4 6.7 0.0 5 39 238 272 236 301 0.82 # 384 # 3164 # -1 # ID=22_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.638 22_3 - 927 PRK PF00485.13 194 0.046 11.5 0.0 2 2 0.056 42 1.9 0.0 4 27 653 676 650 697 0.76 # 384 # 3164 # -1 # ID=22_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.638 28_47 - 95 Ribonuclease_P PF00825.13 111 1.3e-16 58.7 0.8 1 1 6.9e-20 1.5e-16 58.5 0.8 47 110 2 64 1 65 0.97 # 61294 # 61578 # -1 # ID=28_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.670 4_38 - 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989 MobB PF03205.9 140 0.0033 15.4 0.1 1 1 0.0026 0.25 9.3 0.0 4 32 639 667 637 677 0.86 # 72227 # 75193 # 1 # ID=13_61;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.641 6_111 - 862 MobB PF03205.9 140 0.0033 15.4 0.0 1 1 0.0028 0.27 9.2 0.0 4 25 602 623 600 635 0.86 # 141442 # 144027 # -1 # ID=6_111;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.634 2_43 - 104 MobB PF03205.9 140 0.0033 15.4 0.0 1 1 4.7e-05 0.0046 14.9 0.0 3 45 14 53 12 58 0.81 # 47954 # 48265 # -1 # ID=2_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.635 16_44 - 556 MobB PF03205.9 140 0.0034 15.3 1.3 1 1 9.3e-05 0.0091 14.0 1.3 2 30 351 379 350 437 0.92 # 47084 # 48751 # -1 # ID=16_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.694 24_47 - 761 MobB PF03205.9 140 0.0061 14.5 0.0 1 2 0.015 1.4 6.9 0.0 5 30 215 240 214 254 0.88 # 43892 # 46174 # 1 # ID=24_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.629 24_47 - 761 MobB PF03205.9 140 0.0061 14.5 0.0 2 2 0.07 6.7 4.7 0.0 4 23 495 514 493 521 0.86 # 43892 # 46174 # 1 # ID=24_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.629 15_9 - 266 MobB PF03205.9 140 0.0076 14.2 0.1 1 1 0.00025 0.025 12.6 0.0 10 62 13 65 3 94 0.71 # 9038 # 9835 # 1 # ID=15_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.664 66_8 - 205 MobB PF03205.9 140 0.011 13.7 0.0 1 1 0.00018 0.017 13.1 0.0 2 21 25 44 24 52 0.89 # 7677 # 8291 # -1 # ID=66_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.668 22_3 - 927 MobB PF03205.9 140 0.014 13.4 0.0 1 1 0.0044 0.42 8.6 0.0 5 39 237 270 235 308 0.87 # 384 # 3164 # -1 # ID=22_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.638 35_5 - 336 MobB PF03205.9 140 0.014 13.4 0.1 1 1 0.00043 0.041 11.8 0.0 2 24 33 54 32 76 0.81 # 2668 # 3675 # -1 # ID=35_5;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.680 1_87 - 202 MobB PF03205.9 140 0.014 13.3 0.0 1 1 0.00027 0.026 12.5 0.0 3 19 11 27 10 45 0.91 # 106717 # 107322 # -1 # ID=1_87;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.705 12_44 - 277 MobB PF03205.9 140 0.017 13.1 0.1 1 1 0.0033 0.32 9.0 0.0 2 20 57 75 56 81 0.84 # 40987 # 41817 # 1 # ID=12_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.611 40_19 - 697 MobB PF03205.9 140 0.019 12.9 0.1 1 1 0.0004 0.038 11.9 0.1 2 71 240 307 239 323 0.79 # 22008 # 24098 # -1 # ID=40_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.510 37_5 - 730 MobB PF03205.9 140 0.021 12.8 0.0 1 1 0.00055 0.053 11.5 0.0 2 22 517 537 516 549 0.80 # 2674 # 4863 # -1 # ID=37_5;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 14_57 - 440 MobB PF03205.9 140 0.022 12.7 0.0 1 1 0.0011 0.1 10.6 0.0 1 18 199 216 199 222 0.89 # 56713 # 58032 # 1 # ID=14_57;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.656 34_50 - 344 MobB PF03205.9 140 0.024 12.6 0.0 1 1 0.00045 0.043 11.8 0.0 3 22 31 50 29 67 0.82 # 41234 # 42265 # 1 # ID=34_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.666 8_21 - 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843 KaiC PF06745.8 227 0.041 11.2 0.0 2 2 0.012 2.5 5.4 0.0 16 41 516 541 510 547 0.85 # 25691 # 28219 # -1 # ID=8_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.667 8_71 - 533 KaiC PF06745.8 227 0.044 11.1 0.0 1 1 0.00039 0.083 10.2 0.0 17 41 238 262 231 285 0.79 # 97789 # 99387 # 1 # ID=8_71;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.668 28_11 - 731 KaiC PF06745.8 227 0.06 10.7 0.0 1 1 0.00043 0.091 10.1 0.0 18 40 166 188 162 233 0.80 # 12562 # 14754 # -1 # ID=28_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.715 7_121 - 228 Cytidylate_kin PF02224.13 158 9.5e-50 166.4 0.3 1 1 2.5e-53 1.1e-49 166.1 0.3 5 157 65 218 61 219 0.94 # 132171 # 132854 # 1 # ID=7_121;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.654 6_111 - 862 AAA_14 PF13173.1 128 1.2e-06 26.7 0.0 1 2 0.0033 0.34 9.1 0.0 6 74 203 284 198 324 0.73 # 141442 # 144027 # -1 # ID=6_111;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.634 6_111 - 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287 Ubie_methyltran PF01209.13 233 0.032 11.6 0.0 1 1 0.00015 0.047 11.0 0.0 45 103 110 167 102 185 0.83 # 46181 # 47041 # -1 # ID=36_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.697 3_71 - 357 Ubie_methyltran PF01209.13 233 0.037 11.4 0.0 1 1 0.00017 0.054 10.9 0.0 46 156 129 238 121 268 0.78 # 78065 # 79135 # -1 # ID=3_71;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.656 34_14 - 106 TIGR01079 TIGR01079 104 3.2e-32 109.0 5.8 1 1 7.9e-36 3.5e-32 108.9 5.8 2 103 3 102 2 103 0.97 # 5981 # 6298 # 1 # ID=34_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.616 34_17 - 133 Ribosomal_S8 PF00410.14 129 4.6e-47 157.3 0.1 1 1 1.1e-50 5.1e-47 157.2 0.1 1 128 5 131 5 132 0.99 # 7382 # 7780 # 1 # ID=34_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.589 22_15 - 724 UvrD_C PF13361.1 351 6.7e-97 323.3 0.0 1 1 9.5e-100 8.5e-97 323.0 0.0 2 350 274 616 273 617 0.97 # 13422 # 15593 # -1 # ID=22_15;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.650 51_19 - 659 UvrD_C PF13361.1 351 1e-82 276.7 0.0 1 1 6e-85 5.4e-82 274.3 0.0 1 350 269 603 269 604 0.93 # 24081 # 26057 # -1 # ID=51_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.634 28_12 - 1261 UvrD_C PF13361.1 351 2.3e-38 130.8 0.0 1 1 1.5e-39 1.4e-36 125.0 0.0 3 347 503 887 502 889 0.80 # 14751 # 18533 # -1 # ID=28_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.699 38_10 - 571 UvrD_C PF13361.1 351 2.5e-06 25.5 0.0 1 1 8.1e-09 7.2e-06 23.9 0.0 278 343 493 556 427 563 0.80 # 13642 # 15354 # 1 # ID=38_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.572 28_11 - 731 UvrD_C PF13361.1 351 0.024 12.4 0.0 1 1 4.9e-05 0.044 11.5 0.0 291 348 630 675 628 678 0.81 # 12562 # 14754 # -1 # ID=28_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.715 48_23 - 392 PGK PF00162.14 384 1.5e-142 473.0 0.0 1 1 3.8e-146 1.7e-142 472.8 0.0 2 384 6 378 5 378 0.99 # 28795 # 29970 # -1 # ID=48_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.661 11_45 - 244 KR PF08659.5 181 1.9e-28 97.6 6.2 1 1 2.8e-30 2.9e-28 97.0 6.2 4 174 9 180 7 189 0.87 # 63483 # 64214 # 1 # ID=11_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.658 7_20 - 247 KR PF08659.5 181 1.8e-26 91.1 0.4 1 1 2.7e-28 2.9e-26 90.5 0.4 3 168 6 171 5 185 0.88 # 24178 # 24918 # -1 # ID=7_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.640 1_146 - 247 KR PF08659.5 181 1.5e-18 65.3 1.0 1 1 1.9e-20 2.1e-18 64.9 1.0 5 172 8 177 5 188 0.91 # 171038 # 171778 # -1 # ID=1_146;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 19_69 - 300 KR PF08659.5 181 1.2e-17 62.4 7.5 1 1 2e-19 2.1e-17 61.6 7.5 3 165 5 173 4 185 0.86 # 84085 # 84984 # -1 # ID=19_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.686 8_79 - 248 KR PF08659.5 181 1.3e-17 62.3 5.9 1 1 1.8e-19 1.9e-17 61.7 5.3 3 165 10 170 9 189 0.80 # 106354 # 107097 # -1 # ID=8_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 17_24 - 267 KR PF08659.5 181 6.2e-14 50.3 0.6 1 1 8.5e-16 9.1e-14 49.8 0.6 4 162 9 167 7 182 0.85 # 22806 # 23606 # -1 # ID=17_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.677 19_70 - 246 KR PF08659.5 181 6.2e-14 50.3 5.5 1 1 8.3e-16 8.8e-14 49.8 5.5 3 165 8 169 7 184 0.83 # 85043 # 85780 # -1 # ID=19_70;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.668 24_6 - 245 KR PF08659.5 181 1e-13 49.6 0.4 1 1 1.2e-15 1.3e-13 49.3 0.4 2 158 15 165 14 185 0.84 # 2824 # 3558 # -1 # ID=24_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.592 39_37 - 289 KR PF08659.5 181 6.9e-13 46.9 0.0 1 1 8.4e-15 8.9e-13 46.5 0.0 4 125 48 168 46 205 0.85 # 32160 # 33026 # -1 # ID=39_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.632 9_35 - 253 KR PF08659.5 181 1.3e-12 46.1 3.9 1 1 1.7e-14 1.8e-12 45.5 3.9 3 165 11 169 10 187 0.85 # 41215 # 41973 # 1 # ID=9_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 10_37 - 259 KR PF08659.5 181 2.3e-12 45.2 0.8 1 1 2.8e-14 3e-12 44.8 0.8 2 161 12 173 11 192 0.84 # 46025 # 46801 # -1 # ID=10_37;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 15_23 - 252 KR PF08659.5 181 2.5e-12 45.1 4.1 1 1 3.1e-14 3.3e-12 44.7 4.1 2 166 4 166 3 184 0.84 # 23102 # 23857 # 1 # ID=15_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.672 3_182 - 244 KR PF08659.5 181 6.2e-12 43.8 1.1 1 1 8.6e-14 9.2e-12 43.2 1.1 3 104 7 104 6 154 0.76 # 213182 # 213913 # 1 # ID=3_182;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 26_18 - 253 KR PF08659.5 181 6.6e-12 43.7 9.2 1 1 8.7e-14 9.3e-12 43.2 7.8 3 162 4 160 3 173 0.89 # 22963 # 23721 # 1 # ID=26_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.665 24_7 - 255 KR PF08659.5 181 7.5e-12 43.5 1.4 1 1 1e-13 1.1e-11 43.0 1.4 3 175 15 185 14 190 0.83 # 3555 # 4319 # -1 # ID=24_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.578 31_22 - 257 KR PF08659.5 181 9.2e-12 43.2 10.4 1 1 2.5e-13 2.7e-11 41.7 10.4 4 153 9 166 7 194 0.86 # 25764 # 26534 # 1 # ID=31_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.676 17_55 - 248 KR PF08659.5 181 1.3e-11 42.7 1.6 1 1 1.3e-13 1.3e-11 42.7 1.6 2 166 17 184 16 201 0.85 # 55005 # 55748 # 1 # ID=17_55;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.694 8_30 - 301 KR PF08659.5 181 3.2e-11 41.5 0.0 1 1 4.4e-13 4.6e-11 40.9 0.0 4 177 59 237 57 240 0.87 # 37364 # 38266 # 1 # ID=8_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.617 8_27 - 327 KR PF08659.5 181 3.6e-11 41.3 2.8 1 1 5.1e-13 5.4e-11 40.7 2.8 2 164 8 170 7 175 0.85 # 33323 # 34303 # 1 # ID=8_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.665 5_100 - 246 KR PF08659.5 181 5.7e-11 40.7 2.1 1 1 8.3e-13 8.8e-11 40.0 1.9 2 115 7 118 6 132 0.84 # 124006 # 124743 # -1 # ID=5_100;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.688 7_127 - 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300 MMR_HSR1 PF01926.18 116 1.3e-22 78.2 0.0 1 1 2.2e-24 1.8e-22 77.7 0.0 2 116 13 127 12 127 0.84 # 28741 # 29640 # 1 # ID=3_22;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.669 28_44 - 447 MMR_HSR1 PF01926.18 116 3.3e-22 76.9 0.0 1 1 7e-24 5.8e-22 76.1 0.0 2 94 219 310 218 338 0.86 # 55258 # 56598 # -1 # ID=28_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 14_57 - 440 MMR_HSR1 PF01926.18 116 2.7e-21 74.0 0.0 1 1 7.1e-23 5.8e-21 72.9 0.0 1 116 200 318 200 318 0.81 # 56713 # 58032 # 1 # ID=14_57;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.656 13_58 - 356 MMR_HSR1 PF01926.18 116 6.2e-21 72.8 0.0 1 1 1.1e-22 9.3e-21 72.2 0.0 1 116 161 293 161 293 0.83 # 70022 # 71089 # -1 # ID=13_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.652 36_2 - 364 MMR_HSR1 PF01926.18 116 2.3e-19 67.7 0.0 1 1 5.6e-21 4.6e-19 66.7 0.0 1 99 4 114 4 147 0.77 # 625 # 1716 # -1 # ID=36_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.633 5_139 - 215 MMR_HSR1 PF01926.18 116 1.7e-17 61.7 0.0 1 1 2.6e-19 2.1e-17 61.4 0.0 1 104 27 132 27 166 0.85 # 175047 # 175691 # 1 # ID=5_139;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.659 31_17 - 620 MMR_HSR1 PF01926.18 116 1.8e-15 55.2 0.0 1 1 3.9e-17 3.2e-15 54.3 0.0 2 115 10 126 9 127 0.73 # 21229 # 23088 # -1 # ID=31_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.659 48_5 - 659 MMR_HSR1 PF01926.18 116 4.3e-08 31.4 0.1 1 1 4.5e-08 3.7e-06 25.1 0.0 5 97 58 176 54 195 0.78 # 5265 # 7241 # -1 # ID=48_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.656 1_139 - 364 MMR_HSR1 PF01926.18 116 1.1e-07 30.1 0.0 1 1 2.9e-09 2.4e-07 29.0 0.0 2 67 206 275 205 330 0.68 # 160106 # 161197 # 1 # ID=1_139;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.678 17_43 - 905 MMR_HSR1 PF01926.18 116 4.4e-07 28.1 1.3 1 1 7.2e-09 6e-07 27.7 0.0 2 116 408 513 407 513 0.75 # 42698 # 45412 # 1 # ID=17_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 42_33 - 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712 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 6e-14 50.1 0.6 1 2 0.034 8.4 4.0 0.0 71 132 265 322 253 332 0.70 # 19666 # 21801 # -1 # ID=12_23;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.672 12_23 - 712 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 6e-14 50.1 0.6 2 2 1.3e-13 3.2e-11 41.2 0.0 36 128 545 634 541 658 0.84 # 19666 # 21801 # -1 # ID=12_23;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.672 28_38 - 390 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1.3e-10 39.2 0.0 1 1 8.5e-13 2.1e-10 38.5 0.0 35 139 209 309 204 324 0.86 # 46704 # 47873 # -1 # ID=28_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.670 3_25 - 478 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 3.7e-06 24.7 0.0 1 1 2.6e-08 6.4e-06 23.9 0.0 43 123 331 409 319 429 0.87 # 31779 # 33212 # 1 # ID=3_25;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 32_2 - 307 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 4.1e-05 21.3 0.1 1 1 4.5e-07 0.00011 19.9 0.1 39 98 167 227 158 240 0.86 # 823 # 1743 # 1 # ID=32_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.673 36_45 - 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277 Adeno_IVa2 PF02456.10 370 0.0035 14.3 0.0 2 2 0.099 2.2e+02 -1.5 0.0 235 246 221 232 213 239 0.84 # 40987 # 41817 # 1 # ID=12_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.611 17_77 - 818 Adeno_IVa2 PF02456.10 370 0.051 10.5 0.0 1 1 3.7e-05 0.083 9.8 0.0 76 123 425 474 395 480 0.75 # 81086 # 83539 # 1 # ID=17_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.575 3_119 - 293 EF_TS PF00889.14 221 2.5e-70 234.5 7.1 1 1 7.1e-74 3.2e-70 234.2 7.1 1 221 56 272 56 272 0.97 # 134065 # 134943 # -1 # ID=3_119;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.635 34_19 - 120 Ribosomal_L18p PF00861.17 119 1.7e-31 107.2 5.7 1 1 4.5e-35 2e-31 106.9 5.7 6 119 8 119 4 119 0.93 # 8412 # 8771 # 1 # ID=34_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.644 22_16 - 464 NAD_binding_9 PF13454.1 156 1.8e-35 120.3 0.5 1 1 1.1e-36 2.4e-34 116.7 0.2 1 155 13 164 13 165 0.91 # 15848 # 17239 # -1 # ID=22_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.695 9_34 - 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812 Plug PF07715.10 108 6.4e-24 82.6 0.7 1 1 2.8e-25 1.8e-23 81.2 0.7 4 108 50 171 47 171 0.91 # 159239 # 161674 # 1 # ID=6_126;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.650 25_46 - 997 Plug PF07715.10 108 1.4e-23 81.5 0.8 1 1 2.1e-25 1.4e-23 81.5 0.8 5 108 61 173 59 173 0.89 # 59081 # 62071 # -1 # ID=25_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.633 6_92 - 714 Plug PF07715.10 108 2.1e-23 80.9 0.9 1 1 8.5e-25 5.6e-23 79.6 0.9 2 108 65 176 64 176 0.93 # 119952 # 122093 # 1 # ID=6_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.636 11_77 - 727 Plug PF07715.10 108 8.3e-23 79.0 1.2 1 1 2.9e-24 1.9e-22 77.9 1.2 2 108 65 166 64 166 0.94 # 100761 # 102941 # 1 # ID=11_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.636 27_19 - 474 Plug PF07715.10 108 8.4e-23 79.0 1.7 1 1 3.4e-24 2.2e-22 77.7 1.7 4 108 32 147 29 147 0.92 # 19546 # 20967 # 1 # ID=27_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.653 6_81 - 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924 Plug PF07715.10 108 1e-19 69.1 3.3 1 1 4.6e-21 3e-19 67.6 3.3 4 108 64 179 62 179 0.95 # 78498 # 81269 # 1 # ID=1_66;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.625 4_154 - 773 Plug PF07715.10 108 2.3e-19 68.0 4.2 1 1 1e-20 6.8e-19 66.5 4.2 2 107 58 157 57 158 0.95 # 168864 # 171182 # 1 # ID=4_154;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 48_11 - 676 Plug PF07715.10 108 1.1e-18 65.7 0.2 1 1 3.8e-20 2.5e-18 64.6 0.2 5 107 52 158 48 159 0.97 # 14457 # 16484 # -1 # ID=48_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.661 6_118 - 752 Plug PF07715.10 108 2.5e-18 64.6 0.8 1 1 3.9e-20 2.5e-18 64.6 0.8 2 108 68 176 67 176 0.97 # 149616 # 151871 # -1 # ID=6_118;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.667 1_143 - 819 Plug PF07715.10 108 4e-18 64.0 1.1 1 1 3.2e-19 2.1e-17 61.7 1.1 3 108 63 175 61 175 0.88 # 165577 # 168033 # -1 # ID=1_143;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.653 21_4 - 729 Plug PF07715.10 108 4.9e-18 63.7 0.4 1 1 2.3e-19 1.5e-17 62.1 0.4 2 106 77 177 76 179 0.96 # 1713 # 3899 # -1 # ID=21_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 39_20 - 714 Plug PF07715.10 108 9.5e-18 62.8 1.9 1 1 2.2e-19 1.4e-17 62.2 0.3 2 108 65 168 64 168 0.94 # 13219 # 15360 # 1 # ID=39_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.650 6_84 - 808 Plug PF07715.10 108 2.5e-17 61.4 1.0 1 1 7.8e-19 5.1e-17 60.4 0.2 41 108 93 171 76 171 0.86 # 107554 # 109977 # 1 # ID=6_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.623 59_6 - 853 Plug PF07715.10 108 3.5e-17 61.0 2.8 1 1 1.2e-18 7.9e-17 59.8 0.5 10 108 70 167 60 167 0.90 # 3204 # 5762 # -1 # ID=59_6;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.635 6_37 - 879 Plug PF07715.10 108 1.2e-16 59.2 0.0 1 1 6.4e-18 4.2e-16 57.5 0.0 2 108 52 162 51 162 0.95 # 53611 # 56247 # 1 # ID=6_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.621 52_5 - 1034 Plug PF07715.10 108 1.6e-16 58.9 0.7 1 1 2.4e-18 1.6e-16 58.9 0.7 2 108 71 179 70 179 0.93 # 2685 # 5786 # -1 # ID=52_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.657 11_91 - 1005 Plug PF07715.10 108 2.8e-16 58.1 1.3 1 1 1.8e-17 1.2e-15 56.0 1.3 2 100 69 172 68 180 0.90 # 117218 # 120232 # -1 # ID=11_91;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.640 11_6 - 645 Plug PF07715.10 108 4.3e-16 57.5 3.6 1 1 1.4e-17 9.3e-16 56.4 1.1 6 108 152 259 147 259 0.93 # 5339 # 7273 # -1 # ID=11_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.677 5_103 - 698 Plug PF07715.10 108 4.3e-16 57.4 0.2 1 1 1.4e-17 8.9e-16 56.4 0.2 4 107 63 170 60 171 0.97 # 126650 # 128743 # -1 # ID=5_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.635 5_119 - 947 Plug PF07715.10 108 4.4e-16 57.4 2.0 1 1 2.1e-17 1.4e-15 55.8 2.0 8 107 74 171 67 172 0.89 # 145926 # 148766 # 1 # ID=5_119;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 19_61 - 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978 Plug PF07715.10 108 2.1e-14 52.0 0.5 1 1 3.1e-16 2.1e-14 52.0 0.5 3 104 73 180 71 185 0.90 # 37686 # 40619 # 1 # ID=41_30;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.636 5_129 - 890 Plug PF07715.10 108 2.9e-14 51.6 0.3 1 1 4.5e-16 2.9e-14 51.6 0.3 2 108 92 204 91 204 0.96 # 161863 # 164532 # 1 # ID=5_129;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.611 66_2 - 547 Plug PF07715.10 108 7.1e-14 50.3 1.7 1 1 2.6e-15 1.7e-13 49.1 1.7 4 108 54 165 51 165 0.91 # 151 # 1791 # -1 # ID=66_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.628 4_47 - 794 Plug PF07715.10 108 7.6e-14 50.2 0.0 1 1 4.7e-15 3.1e-13 48.3 0.0 2 106 56 166 55 167 0.86 # 51231 # 53612 # 1 # ID=4_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.641 37_9 - 734 Plug PF07715.10 108 1.2e-13 49.6 4.0 1 1 7.3e-15 4.8e-13 47.7 0.9 2 106 88 183 87 185 0.90 # 9055 # 11256 # -1 # ID=37_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.658 28_42 - 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