# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 10_17 - 134 UPF0054 PF02130.12 145 3.5e-32 107.5 0.1 1 1 2.5e-35 4e-32 107.3 0.1 36 144 23 122 5 123 0.91 # 19868 # 20269 # -1 # ID=10_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.366 8_25 - 504 Mg_chelatase PF01078.16 207 5.3e-73 241.4 0.0 1 1 5.2e-75 7.5e-73 240.9 0.0 1 205 200 403 200 405 0.98 # 24958 # 26469 # 1 # ID=8_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.319 3_97 - 411 Mg_chelatase PF01078.16 207 4.9e-08 29.2 0.1 1 2 8.6e-07 0.00012 18.0 0.1 9 46 98 132 91 147 0.80 # 93628 # 94860 # 1 # ID=3_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.339 3_97 - 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235 Methyltransf_11 PF08241.7 95 1.2e-06 25.7 0.0 1 1 3.5e-08 3.3e-06 24.4 0.0 1 67 36 104 36 150 0.91 # 396861 # 397565 # -1 # ID=1_385;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.281 1_340 - 236 Methyltransf_11 PF08241.7 95 4.9e-06 23.8 0.1 1 1 1.5e-07 1.4e-05 22.4 0.0 1 82 78 161 78 166 0.80 # 355629 # 356336 # -1 # ID=1_340;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.294 1_614 - 395 Methyltransf_11 PF08241.7 95 5.6e-06 23.6 0.0 1 1 1.6e-07 1.5e-05 22.2 0.0 2 93 129 232 128 234 0.87 # 615177 # 616361 # 1 # ID=1_614;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.280 17_3 - 235 Methyltransf_11 PF08241.7 95 1.1e-05 22.7 0.0 1 1 2.4e-07 2.2e-05 21.7 0.0 2 95 46 136 45 136 0.88 # 1981 # 2685 # 1 # ID=17_3;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.292 1_68 - 271 Methyltransf_11 PF08241.7 95 2.6e-05 21.5 0.0 1 1 6.2e-07 5.8e-05 20.3 0.0 2 67 115 182 114 184 0.84 # 74521 # 75333 # -1 # ID=1_68;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.277 1_447 - 276 Methyltransf_11 PF08241.7 95 3.4e-05 21.1 0.0 1 1 6.9e-07 6.4e-05 20.2 0.0 1 80 149 231 149 239 0.79 # 453058 # 453885 # -1 # ID=1_447;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.280 1_332 - 278 Methyltransf_11 PF08241.7 95 4.9e-05 20.6 0.1 1 1 1.4e-05 0.0013 16.0 0.1 21 94 144 250 120 251 0.70 # 347976 # 348809 # 1 # ID=1_332;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 3_79 - 213 Methyltransf_11 PF08241.7 95 0.00071 16.9 0.0 1 1 1.4e-05 0.0013 16.0 0.0 1 45 81 124 81 171 0.88 # 79099 # 79737 # 1 # ID=3_79;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.330 1_51 - 82 RRM_1 PF00076.17 70 2.1e-26 88.2 0.3 1 1 1.5e-29 2.3e-26 88.0 0.3 1 70 3 73 3 73 0.99 # 57317 # 57562 # -1 # ID=1_51;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.329 3_20 - 739 MutS_V PF00488.16 235 5.5e-18 62.0 0.0 1 1 3e-20 1.2e-17 60.9 0.0 35 229 297 487 275 493 0.88 # 16548 # 18764 # 1 # ID=3_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.311 10_13 - 250 MutS_V PF00488.16 235 3.8e-05 20.0 0.0 1 1 1.8e-07 7.3e-05 19.1 0.0 27 61 12 46 5 59 0.89 # 13510 # 14259 # 1 # ID=10_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.308 5_60 - 647 MutS_V PF00488.16 235 0.0047 13.1 0.1 1 2 0.00037 0.15 8.3 0.1 34 64 20 50 6 71 0.78 # 58473 # 60413 # 1 # ID=5_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.314 5_60 - 647 MutS_V PF00488.16 235 0.0047 13.1 0.1 2 2 0.024 9.4 2.3 0.0 46 61 361 376 342 382 0.82 # 58473 # 60413 # 1 # ID=5_60;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.314 2_176 - 243 MutS_V PF00488.16 235 0.0047 13.1 0.0 1 1 2.4e-05 0.0095 12.1 0.0 31 63 15 47 7 50 0.85 # 175653 # 176381 # 1 # ID=2_176;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.320 1_243 - 391 DFP PF04127.10 185 5.3e-48 159.9 0.0 1 1 9.4e-51 1.5e-47 158.4 0.1 2 184 183 362 182 363 0.92 # 255635 # 256807 # 1 # ID=1_243;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.295 8_26 - 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161 PRK PF00485.13 194 0.0059 13.0 0.1 2 2 0.09 28 1.0 0.0 89 117 74 102 68 118 0.74 # 475235 # 475717 # 1 # ID=1_469;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.308 1_482 - 505 PRK PF00485.13 194 0.078 9.3 6.3 1 1 3e-05 0.0096 12.3 0.3 5 51 28 74 25 107 0.78 # 489844 # 491358 # 1 # ID=1_482;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.275 2_153 - 70 Ribonuclease_P PF00825.13 111 2.8e-16 56.2 0.2 1 1 1.9e-19 3e-16 56.1 0.2 45 110 2 65 1 66 0.96 # 153996 # 154205 # -1 # ID=2_153;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.290 12_23 - 103 Ribosomal_S10 PF00338.17 97 1.4e-39 130.7 0.1 1 1 9.8e-43 1.6e-39 130.5 0.1 1 96 4 99 4 100 0.99 # 10884 # 11192 # -1 # ID=12_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.421 2_143 - 158 Citrate_ly_lig PF08218.6 182 2.1e-09 33.9 0.2 1 2 7.9e-10 6.3e-07 25.8 0.0 9 66 11 70 9 80 0.88 # 143975 # 144448 # -1 # ID=2_143;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.302 2_143 - 158 Citrate_ly_lig PF08218.6 182 2.1e-09 33.9 0.2 2 2 0.00072 0.57 6.4 0.0 149 182 122 153 95 153 0.85 # 143975 # 144448 # -1 # ID=2_143;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.302 1_184 - 384 Citrate_ly_lig PF08218.6 182 0.0013 15.0 0.0 1 1 4e-06 0.0032 13.8 0.0 1 51 149 200 149 216 0.85 # 187091 # 188242 # -1 # ID=1_184;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.269 1_394 - 287 DUF927 PF06048.6 286 0.006 12.7 0.4 1 2 4e-05 0.063 9.3 0.1 191 212 26 47 8 51 0.79 # 406777 # 407637 # -1 # ID=1_394;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.321 1_394 - 287 DUF927 PF06048.6 286 0.006 12.7 0.4 2 2 0.0094 15 1.5 0.0 54 107 129 180 96 227 0.75 # 406777 # 407637 # -1 # ID=1_394;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.321 2_84 - 343 DNA_methylase PF00145.12 335 2.9e-87 289.7 1.0 1 1 3.6e-90 5.7e-87 288.7 1.0 1 334 1 309 1 310 0.90 # 79172 # 80200 # 1 # ID=2_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.296 5_82 - 209 Ub-Mut7C PF14451.1 81 0.0048 13.2 0.0 1 1 5.6e-06 0.0089 12.4 0.0 50 79 123 153 120 155 0.87 # 79896 # 80522 # 1 # ID=5_82;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.338 12_19 - 278 Ribosomal_L2_C PF03947.13 130 8.5e-57 187.4 3.3 1 1 5.4e-60 8.5e-57 187.4 3.3 1 130 126 254 126 254 0.99 # 8566 # 9399 # -1 # ID=12_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.381 5_17 - 228 Methyltrn_RNA_4 PF09936.4 185 4e-05 20.0 0.0 1 1 4e-08 6.3e-05 19.3 0.0 122 184 165 226 157 227 0.88 # 17094 # 17777 # 1 # ID=5_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.339 4_12 - 429 Trp_halogenase PF04820.9 454 6.5e-08 28.4 1.0 1 2 1.9e-05 0.03 9.7 0.7 1 33 7 36 7 44 0.89 # 11942 # 13228 # -1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.331 4_12 - 429 Trp_halogenase PF04820.9 454 6.5e-08 28.4 1.0 2 2 1.3e-07 0.00021 16.8 0.0 140 216 91 169 61 177 0.84 # 11942 # 13228 # -1 # ID=4_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.331 2_102 - 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326 Mur_ligase PF01225.20 83 0.00093 16.1 0.1 1 1 2.7e-06 0.0022 14.9 0.1 3 76 24 93 22 94 0.75 # 478699 # 479676 # 1 # ID=1_473;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.265 11_5 - 130 Ribosomal_S9 PF00380.14 121 3.2e-44 146.9 1.2 1 1 2.2e-47 3.6e-44 146.7 1.2 1 121 8 129 8 129 0.99 # 6454 # 6843 # -1 # ID=11_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.392 1_579 - 1503 RNA_pol_Rpb1_4 PF05000.12 108 8.3e-19 64.1 0.2 1 1 1.5e-21 2.3e-18 62.7 0.2 1 107 670 749 670 750 0.85 # 578292 # 582800 # -1 # ID=1_579;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.354 8_44 - 172 SKI PF01202.17 158 6.5e-36 120.4 0.2 1 1 2.3e-38 7.4e-36 120.2 0.2 1 157 12 169 12 170 0.93 # 40197 # 40712 # 1 # ID=8_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.308 4_48 - 200 SKI PF01202.17 158 1.7e-05 21.6 1.8 1 2 1.2e-05 0.0038 13.9 0.1 2 45 15 57 14 67 0.77 # 50301 # 50900 # 1 # ID=4_48;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.300 4_48 - 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224 Methyltransf_25 PF13649.1 101 1.3e-14 51.2 0.0 1 1 2.3e-16 2.6e-14 50.2 0.0 1 101 40 135 40 135 0.95 # 7989 # 8660 # -1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.289 3_13 - 223 Methyltransf_25 PF13649.1 101 1.8e-11 41.1 0.0 1 1 6.3e-13 7.2e-11 39.2 0.0 1 100 39 133 39 134 0.91 # 11974 # 12642 # -1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.274 1_385 - 235 Methyltransf_25 PF13649.1 101 1.7e-10 38.0 0.1 1 1 3.4e-12 3.9e-10 36.8 0.0 1 97 35 142 35 168 0.81 # 396861 # 397565 # -1 # ID=1_385;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.281 2_31 - 257 Methyltransf_25 PF13649.1 101 4.7e-10 36.6 0.0 1 1 7.5e-12 8.5e-10 35.7 0.0 1 101 47 144 47 144 0.83 # 31462 # 32232 # 1 # ID=2_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.236 14_7 - 241 Methyltransf_25 PF13649.1 101 2e-09 34.5 0.0 1 1 3.2e-11 3.6e-09 33.7 0.0 1 92 43 127 43 132 0.88 # 2596 # 3318 # 1 # ID=14_7;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.289 3_2 - 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255 tRNA_Me_trans PF03054.11 356 2e-07 26.6 0.0 2 2 0.025 7.9 1.7 0.0 161 194 151 186 145 193 0.79 # 38234 # 38998 # -1 # ID=2_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.273 10_18 - 222 tRNA_Me_trans PF03054.11 356 9.2e-07 24.5 0.1 1 1 5.7e-09 1.8e-06 23.5 0.1 2 83 3 75 2 81 0.72 # 20333 # 20998 # 1 # ID=10_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.378 2_72 - 512 tRNA_Me_trans PF03054.11 356 3.9e-06 22.4 0.1 1 1 2.1e-08 6.8e-06 21.6 0.1 2 34 217 250 216 283 0.78 # 68534 # 70069 # 1 # ID=2_72;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.360 12_4 - 134 Ribosomal_L18e PF00828.14 129 2.9e-12 43.9 1.5 1 1 2.7e-15 4.3e-12 43.4 1.5 3 97 27 113 26 129 0.77 # 2740 # 3141 # -1 # ID=12_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.356 1_409 - 205 RecO_N_2 PF13114.1 71 3.4e-31 103.6 0.5 1 1 4.7e-34 7.5e-31 102.5 0.5 1 71 1 71 1 71 0.99 # 418370 # 418984 # -1 # ID=1_409;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.286 1_8 - 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