# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 8_54 - 134 UPF0054 PF02130.12 145 4.1e-32 107.4 0.1 1 1 2.6e-35 4.7e-32 107.2 0.1 36 144 23 122 6 123 0.91 # 54327 # 54728 # 1 # ID=8_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.361 8_24 - 504 Mg_chelatase PF01078.16 207 6e-73 241.4 0.0 1 1 5.2e-75 8.5e-73 240.9 0.0 1 205 200 403 200 405 0.98 # 21117 # 22628 # -1 # ID=8_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.321 15_25 - 411 Mg_chelatase PF01078.16 207 7.7e-08 28.7 0.1 1 2 7.2e-07 0.00012 18.3 0.1 8 46 97 132 90 160 0.82 # 33215 # 34447 # -1 # ID=15_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.337 15_25 - 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239 DNA_methylase PF00145.12 335 2e-37 126.0 2.4 1 1 2.6e-39 1.2e-36 123.5 2.4 2 222 6 232 5 238 0.76 # 882 # 1598 # -1 # ID=20_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 20_4 - 53 DNA_methylase PF00145.12 335 2.8e-07 26.9 0.0 1 1 6.9e-10 3.1e-07 26.8 0.0 297 333 1 37 1 39 0.95 # 720 # 878 # -1 # ID=20_4;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.327 4_21 - 209 Ub-Mut7C PF14451.1 81 0.0054 13.2 0.0 1 1 5.6e-06 0.01 12.4 0.0 50 79 123 153 120 155 0.87 # 21076 # 21702 # -1 # ID=4_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 18_18 - 278 Ribosomal_L2_C PF03947.13 130 9.7e-57 187.4 3.3 1 1 5.4e-60 9.7e-57 187.4 3.3 1 130 126 254 126 254 0.99 # 12338 # 13171 # 1 # ID=18_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.382 4_84 - 228 Methyltrn_RNA_4 PF09936.4 185 4.5e-05 20.0 0.0 1 1 4e-08 7.2e-05 19.3 0.0 122 184 165 226 157 227 0.88 # 83789 # 84472 # -1 # ID=4_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.348 10_57 - 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548 AAA_17 PF13207.1 121 0.003 15.4 0.1 1 1 0.0093 0.28 9.0 0.0 3 80 40 128 39 167 0.67 # 50925 # 52568 # 1 # ID=5_63;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.327 12_24 - 834 AAA_17 PF13207.1 121 0.003 15.3 0.8 1 1 0.001 0.031 12.1 0.0 4 77 483 568 482 635 0.52 # 22365 # 24866 # 1 # ID=12_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.305 21_18 - 327 AAA_17 PF13207.1 121 0.0035 15.1 0.2 1 1 0.00034 0.01 13.7 0.2 1 32 9 47 9 144 0.61 # 15064 # 16044 # -1 # ID=21_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.341 1_252 - 505 AAA_17 PF13207.1 121 0.0042 14.9 4.0 1 1 0.004 0.12 10.2 4.0 4 66 27 106 26 333 0.75 # 249485 # 250999 # 1 # ID=1_252;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 18_1 - 363 AAA_17 PF13207.1 121 0.0044 14.8 0.3 1 1 0.0004 0.012 13.4 0.3 3 77 30 113 28 250 0.68 # 146 # 1234 # -1 # ID=18_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.270 12_30 - 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603 Miro PF08477.8 119 5.4e-05 20.7 0.2 1 1 1.4e-06 9.7e-05 19.8 0.2 2 87 7 104 6 130 0.82 # 33192 # 35000 # 1 # ID=10_37;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.372 7_53 - 395 Miro PF08477.8 119 5.5e-05 20.6 0.6 1 1 2e-06 0.00014 19.3 0.4 1 119 10 126 10 126 0.74 # 52420 # 53604 # -1 # ID=7_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.308 7_71 - 204 Miro PF08477.8 119 0.0001 19.8 0.3 1 1 1.9e-05 0.0013 16.2 0.2 1 45 5 49 5 130 0.77 # 73602 # 74213 # 1 # ID=7_71;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.359 10_68 - 348 Miro PF08477.8 119 0.00012 19.5 0.0 1 1 3.7e-06 0.00026 18.5 0.0 2 91 161 254 160 272 0.81 # 68121 # 69164 # 1 # ID=10_68;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 16_5 - 288 Miro PF08477.8 119 0.00015 19.3 0.0 1 1 5.8e-06 0.0004 17.9 0.0 4 117 98 201 96 202 0.76 # 4451 # 5314 # 1 # ID=16_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.381 12_30 - 315 Miro PF08477.8 119 0.00015 19.2 0.0 1 1 3.8e-06 0.00027 18.4 0.0 2 33 145 181 144 234 0.73 # 28244 # 29188 # 1 # ID=12_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.322 1_164 - 287 Miro PF08477.8 119 0.00016 19.1 0.3 1 1 1.8e-05 0.0013 16.3 0.0 2 66 31 96 31 144 0.64 # 166418 # 167278 # -1 # ID=1_164;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.317 9_19 - 405 Miro PF08477.8 119 0.00034 18.1 0.5 1 1 6.4e-05 0.0044 14.5 0.0 2 68 144 206 144 241 0.70 # 18150 # 19364 # 1 # ID=9_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.323 6_53 - 366 Miro PF08477.8 119 0.00059 17.3 0.0 1 1 2.2e-05 0.0015 16.0 0.0 2 91 138 225 137 234 0.78 # 50622 # 51719 # -1 # ID=6_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.341 1_260 - 202 Miro PF08477.8 119 0.0021 15.5 0.0 1 1 5.1e-05 0.0035 14.8 0.0 2 60 27 89 26 130 0.61 # 256639 # 257244 # 1 # ID=1_260;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.295 1_358 - 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