# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 27_11 - 306 UPF0054 PF02130.12 145 4.2e-32 107.8 0.1 1 1 3.5e-35 8.3e-32 106.8 0.1 14 145 165 289 151 289 0.82 # 11292 # 12209 # -1 # ID=27_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.342 8_53 - 511 Mg_chelatase PF01078.16 207 6.6e-75 248.1 0.0 1 1 8.3e-77 9.8e-75 247.6 0.0 1 201 199 399 199 404 0.96 # 53343 # 54875 # -1 # ID=8_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.385 8_58 - 764 Mg_chelatase PF01078.16 207 5.3e-07 26.3 0.1 1 3 0.083 9.7 2.6 0.0 23 47 198 222 184 258 0.71 # 58525 # 60816 # 1 # ID=8_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.368 8_58 - 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615 Helicase_C PF00271.26 78 4.8e-10 36.6 0.0 1 1 4.5e-12 1.3e-09 35.1 0.0 12 78 474 539 466 539 0.92 # 102431 # 104275 # 1 # ID=4_97;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.371 1_76 - 873 Helicase_C PF00271.26 78 6e-05 20.2 0.1 1 1 2e-07 6e-05 20.2 0.1 4 78 467 547 430 547 0.80 # 98932 # 101550 # -1 # ID=1_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.363 1_186 - 804 Helicase_C PF00271.26 78 9.9e-05 19.5 0.3 1 1 2e-06 0.0006 17.0 0.1 24 76 495 550 478 552 0.83 # 225391 # 227802 # -1 # ID=1_186;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.391 20_43 - 1770 Helicase_C PF00271.26 78 0.00011 19.4 0.1 1 1 3e-06 0.0009 16.5 0.0 21 78 873 932 859 932 0.85 # 45714 # 51023 # -1 # ID=20_43;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.328 4_5 - 229 ArsA_ATPase PF02374.10 305 3.1e-09 33.7 0.1 1 1 1.6e-10 2.9e-08 30.5 0.0 8 44 8 44 1 63 0.86 # 3532 # 4218 # 1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.316 22_36 - 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596 PhoH PF02562.11 205 0.01 12.5 1.3 2 2 0.038 6 3.4 0.1 16 36 368 388 359 398 0.84 # 5974 # 7761 # 1 # ID=39_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.349 1_186 - 804 PhoH PF02562.11 205 0.011 12.3 0.0 1 1 0.00018 0.029 11.0 0.0 13 54 181 227 168 237 0.71 # 225391 # 227802 # -1 # ID=1_186;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.391 13_7 - 220 PhoH PF02562.11 205 0.013 12.1 0.0 1 1 0.0004 0.063 9.8 0.0 23 48 5 30 1 86 0.84 # 2971 # 3630 # 1 # ID=13_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.306 25_7 - 601 PhoH PF02562.11 205 0.013 12.0 0.1 1 1 0.00018 0.028 11.0 0.1 6 55 172 221 169 236 0.87 # 3943 # 5745 # 1 # ID=25_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.351 2_98 - 1279 PhoH PF02562.11 205 0.016 11.8 0.3 1 1 0.0019 0.3 7.6 0.0 9 47 580 619 575 640 0.80 # 116612 # 120448 # -1 # ID=2_98;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 1_172 - 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400 MMR_HSR1 PF01926.18 116 3e-06 24.5 0.0 1 1 8.9e-08 6.2e-06 23.5 0.0 2 114 15 134 14 137 0.69 # 79950 # 81149 # -1 # ID=6_69;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.413 1_75 - 601 MMR_HSR1 PF01926.18 116 5.1e-06 23.8 0.3 1 1 2e-07 1.4e-05 22.4 0.2 2 116 7 128 6 128 0.58 # 96843 # 98645 # -1 # ID=1_75;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 11_57 - 483 MMR_HSR1 PF01926.18 116 3.4e-05 21.1 0.0 1 1 1.7e-06 0.00012 19.4 0.0 2 77 287 390 286 436 0.67 # 61743 # 63191 # -1 # ID=11_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.382 28_9 - 1187 MMR_HSR1 PF01926.18 116 7e-05 20.1 0.8 1 1 4.9e-06 0.00034 17.9 0.1 2 104 127 260 126 283 0.55 # 8203 # 11763 # 1 # ID=28_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.297 1_2 - 536 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.00035 17.9 2.9 1 2 0.0077 0.54 7.6 0.2 2 26 30 54 29 72 0.84 # 724 # 2331 # -1 # ID=1_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.379 1_2 - 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61 RecA PF00154.16 323 0.021 11.2 0.0 1 1 6.3e-05 0.021 11.2 0.0 62 91 10 39 1 53 0.85 # 664 # 846 # -1 # ID=84_2;partial=01;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.372 2_55 - 431 Trigger_N PF05697.8 145 2.6e-26 89.5 3.8 1 2 1.1e-29 2.6e-26 89.5 3.8 4 144 2 144 1 145 0.95 # 68257 # 69549 # 1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.356 2_55 - 431 Trigger_N PF05697.8 145 2.6e-26 89.5 3.8 2 2 0.013 31 1.7 2.5 4 33 291 320 268 383 0.65 # 68257 # 69549 # 1 # ID=2_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.356 6_89 - 94 Ribosomal_L23 PF00276.15 92 2.2e-13 47.3 0.3 1 1 1.1e-16 2.6e-13 47.1 0.3 4 87 7 89 4 92 0.91 # 90929 # 91210 # -1 # ID=6_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.319 2_24 - 978 tRNA-synt_1f PF01921.13 360 1.9e-07 27.4 0.0 1 1 1.4e-09 5.7e-07 25.9 0.0 263 341 643 722 622 741 0.82 # 28020 # 30953 # 1 # ID=2_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.359 17_47 - 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362 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1.4e-05 22.0 0.3 2 2 4.5e-05 0.012 12.4 0.2 74 131 168 227 158 247 0.76 # 159318 # 160403 # 1 # ID=1_127;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.343 2_22 - 329 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1.9e-05 21.5 0.0 1 1 1.2e-07 3.1e-05 20.8 0.0 33 130 154 249 143 260 0.77 # 25525 # 26511 # -1 # ID=2_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.357 8_70 - 635 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00016 18.5 0.1 1 2 4.2e-05 0.011 12.5 0.0 84 129 158 199 148 243 0.73 # 76198 # 78102 # -1 # ID=8_70;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.298 8_70 - 635 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00016 18.5 0.1 2 2 0.076 20 1.9 0.0 42 55 464 477 447 508 0.84 # 76198 # 78102 # -1 # ID=8_70;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.298 3_98 - 351 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00017 18.3 0.1 1 2 0.075 20 1.9 0.0 41 57 26 42 12 43 0.77 # 95814 # 96866 # -1 # ID=3_98;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.341 3_98 - 351 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00017 18.3 0.1 2 2 2.1e-05 0.0056 13.4 0.0 109 137 218 245 197 260 0.79 # 95814 # 96866 # -1 # ID=3_98;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.341 7_5 - 99 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00033 17.5 0.0 1 1 1.3e-06 0.00034 17.4 0.0 93 138 35 80 4 95 0.60 # 2419 # 2715 # -1 # ID=7_5;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.407 1_25 - 408 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00092 16.0 0.0 1 1 1.4e-05 0.0037 14.0 0.0 41 127 58 136 46 152 0.80 # 32508 # 33731 # -1 # ID=1_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.292 1_89 - 266 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.019 11.7 0.0 1 2 0.0041 1.1 6.0 0.0 104 127 22 45 5 62 0.77 # 113229 # 114026 # -1 # ID=1_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 1_89 - 266 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.019 11.7 0.0 2 2 0.022 5.8 3.6 0.0 45 61 212 228 204 258 0.76 # 113229 # 114026 # -1 # ID=1_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 9_50 - 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