# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 8_88 - 136 UPF0054 PF02130.12 145 1.6e-35 118.5 0.5 1 1 1.1e-38 1.9e-35 118.3 0.5 35 144 21 122 4 123 0.91 # 68972 # 69379 # 1 # ID=8_88;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 10_7 - 502 Mg_chelatase PF01078.16 207 1.1e-74 247.1 0.0 1 1 1.6e-76 1.5e-74 246.5 0.0 1 204 198 400 198 403 0.98 # 4791 # 6296 # 1 # ID=10_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.309 4_11 - 408 Mg_chelatase PF01078.16 207 6.5e-08 28.9 0.1 1 2 3.4e-06 0.00031 16.9 0.1 24 46 111 133 108 151 0.90 # 7776 # 8999 # 1 # ID=4_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.312 4_11 - 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858 Torsin PF06309.6 127 0.0039 14.0 0.1 1 2 0.041 36 1.2 0.0 59 119 206 266 197 276 0.76 # 185216 # 187789 # 1 # ID=2_186;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 2_186 - 858 Torsin PF06309.6 127 0.0039 14.0 0.1 2 2 0.00013 0.11 9.3 0.0 14 80 560 628 551 641 0.85 # 185216 # 187789 # 1 # ID=2_186;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 1_113 - 567 ABC_ATPase PF09818.4 448 1.1e-06 24.5 0.1 1 1 2.2e-08 3.5e-06 22.8 0.0 295 355 456 517 450 546 0.87 # 109760 # 111460 # 1 # ID=1_113;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.295 7_87 - 337 ABC_ATPase PF09818.4 448 2.6e-06 23.2 1.3 1 2 3.9e-05 0.0063 12.1 0.0 240 265 22 48 18 51 0.92 # 84818 # 85828 # 1 # ID=7_87;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.317 7_87 - 337 ABC_ATPase PF09818.4 448 2.6e-06 23.2 1.3 2 2 0.00096 0.15 7.5 0.2 323 412 154 228 125 234 0.73 # 84818 # 85828 # 1 # ID=7_87;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.317 1_290 - 243 ABC_ATPase PF09818.4 448 4.6e-05 19.1 0.4 1 1 1.1e-05 0.0017 13.9 0.0 324 413 137 211 127 230 0.90 # 289483 # 290211 # 1 # ID=1_290;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.332 2_225 - 246 ABC_ATPase PF09818.4 448 5.1e-05 19.0 0.3 1 2 0.0015 0.23 6.9 0.0 242 265 26 50 16 54 0.86 # 230028 # 230765 # -1 # ID=2_225;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.332 2_225 - 246 ABC_ATPase PF09818.4 448 5.1e-05 19.0 0.3 2 2 0.00075 0.12 7.8 0.1 324 413 140 213 131 223 0.70 # 230028 # 230765 # -1 # ID=2_225;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.332 1_308 - 243 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.00012 17.7 0.0 1 2 0.0027 0.44 6.0 0.0 242 266 24 49 13 80 0.90 # 306124 # 306852 # -1 # ID=1_308;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.322 1_308 - 243 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.00012 17.7 0.0 2 2 0.00088 0.14 7.6 0.0 322 353 136 167 126 241 0.79 # 306124 # 306852 # -1 # ID=1_308;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.322 4_48 - 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206 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0011 15.1 0.0 1 1 4.6e-05 0.0035 13.4 0.0 19 46 6 33 2 62 0.87 # 75472 # 76089 # 1 # ID=1_75;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.312 1_125 - 649 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0012 14.9 0.0 1 1 4.2e-05 0.0032 13.5 0.0 15 45 212 241 203 278 0.84 # 123558 # 125504 # 1 # ID=1_125;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 1_234 - 232 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0012 14.9 0.0 1 1 2e-05 0.0016 14.5 0.0 18 48 29 59 19 126 0.77 # 233436 # 234131 # 1 # ID=1_234;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.342 10_34 - 289 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0014 14.7 0.0 1 1 0.00034 0.026 10.5 0.0 21 53 7 36 4 57 0.89 # 29146 # 30012 # -1 # ID=10_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.288 3_100 - 199 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0014 14.7 0.0 1 1 2.7e-05 0.0021 14.1 0.0 13 75 18 100 8 119 0.71 # 101834 # 102430 # 1 # ID=3_100;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.261 5_148 - 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774 B5 PF03484.10 70 2.3e-19 65.9 3.1 2 2 8e-21 1.4e-17 60.2 0.3 3 70 395 462 394 462 0.97 # 309916 # 312237 # 1 # ID=1_314;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.299 1_77 - 531 tRNA-synt_1d PF00750.14 354 1.1e-68 228.6 0.1 1 1 2.5e-70 8.9e-68 225.6 0.1 3 353 87 398 85 399 0.92 # 76341 # 77933 # 1 # ID=1_77;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.312 1_152 - 811 tRNA-synt_1d PF00750.14 354 2.6e-09 33.3 0.0 1 2 2e-08 7.2e-06 22.0 0.0 29 62 40 73 17 89 0.88 # 149088 # 151520 # 1 # ID=1_152;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.332 1_152 - 811 tRNA-synt_1d PF00750.14 354 2.6e-09 33.3 0.0 2 2 0.00022 0.078 8.7 0.0 272 304 568 596 539 605 0.74 # 149088 # 151520 # 1 # ID=1_152;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.332 7_23 - 629 tRNA-synt_1d PF00750.14 354 0.00014 17.7 0.1 1 2 1.2e-05 0.0043 12.8 0.0 36 87 16 67 11 116 0.78 # 18355 # 20241 # 1 # ID=7_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 7_23 - 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257 ABC_tran PF00005.22 137 6.6e-39 130.3 0.0 1 1 2.9e-40 9e-39 129.9 0.0 2 136 19 178 18 179 0.98 # 232679 # 233449 # 1 # ID=1_233;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.316 1_113 - 567 ABC_tran PF00005.22 137 3.5e-38 127.9 0.1 1 1 2.1e-39 6.6e-38 127.1 0.1 4 137 368 513 365 513 0.88 # 109760 # 111460 # 1 # ID=1_113;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.295 2_3 - 330 ABC_tran PF00005.22 137 8.1e-38 126.8 0.0 1 1 5.2e-39 1.6e-37 125.8 0.0 2 136 20 161 19 162 0.94 # 1666 # 2655 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.313 7_87 - 337 ABC_tran PF00005.22 137 1.5e-37 125.9 0.1 1 1 7.5e-39 2.3e-37 125.3 0.1 2 137 18 182 17 182 0.93 # 84818 # 85828 # 1 # ID=7_87;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.317 2_225 - 246 ABC_tran PF00005.22 137 1.3e-36 122.8 0.1 1 1 6e-38 1.9e-36 122.4 0.1 1 137 19 167 19 167 0.89 # 230028 # 230765 # -1 # ID=2_225;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.332 1_308 - 243 ABC_tran PF00005.22 137 3e-36 121.7 0.2 1 1 1.5e-37 4.6e-36 121.1 0.2 2 137 18 165 17 165 0.94 # 306124 # 306852 # -1 # ID=1_308;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.322 2_100 - 247 ABC_tran PF00005.22 137 5.9e-36 120.7 0.1 1 1 3.4e-37 1e-35 119.9 0.1 3 137 20 171 18 171 0.94 # 94769 # 95509 # -1 # ID=2_100;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.327 1_290 - 243 ABC_tran PF00005.22 137 1.4e-35 119.5 0.0 1 1 6.4e-37 2e-35 119.0 0.0 1 137 17 164 17 164 0.95 # 289483 # 290211 # 1 # ID=1_290;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.332 4_48 - 295 ABC_tran PF00005.22 137 1.4e-35 119.5 0.0 1 1 8.2e-37 2.5e-35 118.7 0.0 4 136 21 158 19 159 0.92 # 41628 # 42512 # -1 # ID=4_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.325 2_56 - 243 ABC_tran PF00005.22 137 2e-34 115.8 0.0 1 1 8.8e-36 2.7e-34 115.4 0.0 2 137 20 165 19 165 0.87 # 53070 # 53798 # -1 # ID=2_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.339 1_72 - 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222 ABC_tran PF00005.22 137 2.1e-31 106.0 0.1 1 1 8.7e-33 2.7e-31 105.7 0.1 2 137 28 176 27 176 0.92 # 16634 # 17299 # -1 # ID=5_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.266 3_198 - 252 ABC_tran PF00005.22 137 8.6e-31 104.0 0.1 1 1 4.4e-32 1.4e-30 103.4 0.1 2 137 18 164 17 164 0.98 # 205876 # 206631 # -1 # ID=3_198;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 5_103 - 241 ABC_tran PF00005.22 137 2.3e-30 102.7 0.0 1 1 1e-31 3.2e-30 102.2 0.0 2 137 19 168 18 168 0.93 # 94778 # 95500 # 1 # ID=5_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.335 5_25 - 542 ABC_tran PF00005.22 137 4.3e-30 101.7 0.0 1 1 2.5e-31 7.6e-30 100.9 0.0 1 136 336 473 336 474 0.96 # 25244 # 26869 # -1 # ID=5_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.288 8_112 - 285 ABC_tran PF00005.22 137 5.2e-29 98.3 0.0 1 1 5.1e-30 1.6e-28 96.7 0.0 1 137 19 159 19 159 0.91 # 89839 # 90693 # -1 # ID=8_112;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.309 10_28 - 302 ABC_tran PF00005.22 137 2.8e-28 95.9 0.1 1 1 2.7e-29 8.3e-28 94.4 0.1 1 136 17 145 17 146 0.93 # 24417 # 25322 # 1 # ID=10_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.291 1_234 - 232 ABC_tran PF00005.22 137 5.7e-26 88.4 0.0 1 1 2.4e-27 7.4e-26 88.0 0.0 2 136 18 159 17 160 0.86 # 233436 # 234131 # 1 # ID=1_234;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.342 5_18 - 237 ABC_tran PF00005.22 137 3.2e-21 73.0 0.0 1 1 1.6e-22 5.1e-21 72.4 0.0 2 137 17 174 16 174 0.85 # 17292 # 18002 # -1 # ID=5_18;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.288 4_94 - 941 ABC_tran PF00005.22 137 4.6e-20 69.3 2.3 1 3 1.1e-05 0.00033 17.9 0.1 1 28 15 42 15 52 0.95 # 81978 # 84800 # -1 # ID=4_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.356 4_94 - 941 ABC_tran PF00005.22 137 4.6e-20 69.3 2.3 2 3 0.0093 0.29 8.4 0.0 100 135 474 511 416 513 0.77 # 81978 # 84800 # -1 # ID=4_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.356 4_94 - 941 ABC_tran PF00005.22 137 4.6e-20 69.3 2.3 3 3 8.2e-12 2.5e-10 37.7 0.2 2 136 616 852 615 853 0.75 # 81978 # 84800 # -1 # ID=4_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.356 3_36 - 332 ABC_tran PF00005.22 137 1.5e-18 64.4 0.0 1 1 7.2e-20 2.2e-18 63.8 0.0 6 137 22 158 17 158 0.83 # 35432 # 36427 # 1 # ID=3_36;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.262 3_126 - 221 ABC_tran PF00005.22 137 2.2e-15 54.1 0.0 1 1 2.5e-16 7.6e-15 52.4 0.0 2 135 23 153 22 155 0.78 # 122792 # 123454 # 1 # ID=3_126;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.330 4_136 - 461 ABC_tran PF00005.22 137 4.8e-07 27.1 0.1 1 2 0.00074 0.023 12.0 0.0 13 84 3 99 1 164 0.74 # 122176 # 123558 # 1 # ID=4_136;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.319 4_136 - 461 ABC_tran PF00005.22 137 4.8e-07 27.1 0.1 2 2 0.00032 0.0098 13.1 0.0 13 42 197 226 193 359 0.67 # 122176 # 123558 # 1 # ID=4_136;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.319 2_77 - 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1029 Eco57I PF07669.6 106 0.00015 19.0 0.9 1 1 4.3e-07 0.00015 19.0 0.9 5 72 487 579 483 619 0.71 # 197812 # 200898 # 1 # ID=1_200;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.259 3_19 - 496 Eco57I PF07669.6 106 0.00017 18.8 0.2 1 1 3e-06 0.0011 16.3 0.0 2 104 287 391 286 393 0.76 # 15801 # 17288 # -1 # ID=3_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.331 2_200 - 234 Eco57I PF07669.6 106 0.0025 15.1 0.2 1 1 1.6e-05 0.0058 13.9 0.1 2 39 98 133 97 187 0.68 # 202499 # 203200 # -1 # ID=2_200;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.285 10_34 - 289 IPPT PF01715.12 253 4.7e-50 166.9 0.3 1 1 3.5e-53 6.2e-50 166.5 0.3 2 243 37 266 36 274 0.93 # 29146 # 30012 # -1 # ID=10_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.288 7_57 - 461 tRNA-synt_1e PF01406.14 301 1e-111 369.8 0.3 1 1 3.6e-114 1e-111 369.8 0.3 5 300 14 303 10 304 0.96 # 53255 # 54637 # -1 # ID=7_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 7_23 - 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