# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_201 - 159 UPF0054 PF02130.12 145 8.5e-40 133.1 0.1 1 1 3.1e-43 9.6e-40 132.9 0.1 18 145 21 145 5 145 0.85 # 216261 # 216737 # -1 # ID=1_201;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.386 11_14 - 504 Mg_chelatase PF01078.16 207 1.3e-95 316.2 0.0 1 1 1.7e-97 2.4e-95 315.3 0.0 1 206 190 395 190 396 0.99 # 9999 # 11510 # -1 # ID=11_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 1_623 - 425 Mg_chelatase PF01078.16 207 5.4e-08 30.0 0.4 1 2 7.8e-08 1.1e-05 22.4 0.7 20 47 108 135 74 162 0.78 # 710238 # 711512 # -1 # ID=1_623;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 1_623 - 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691 IstB_IS21 PF01695.12 178 3.2e-05 21.2 0.1 1 1 1.1e-06 0.00014 19.0 0.0 51 91 291 331 256 342 0.81 # 902868 # 904940 # 1 # ID=1_793;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.412 7_1 - 884 IstB_IS21 PF01695.12 178 6.5e-05 20.1 0.0 1 1 1.8e-06 0.00024 18.3 0.0 42 124 344 437 331 440 0.75 # 232 # 2883 # -1 # ID=7_1;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.399 1_622 - 817 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.00013 19.1 0.0 1 1 2.6e-06 0.00035 17.8 0.0 23 135 332 454 313 461 0.61 # 707550 # 710000 # -1 # ID=1_622;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.398 1_546 - 380 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.00022 18.4 0.2 1 2 0.0043 0.57 7.3 0.0 44 62 157 175 135 192 0.77 # 618789 # 619928 # -1 # ID=1_546;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.401 1_546 - 380 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.00022 18.4 0.2 2 2 0.0014 0.18 8.9 0.1 89 130 219 260 204 284 0.84 # 618789 # 619928 # -1 # ID=1_546;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.401 1_623 - 425 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.00032 17.9 0.1 1 1 5.9e-06 0.00079 16.6 0.0 47 68 110 131 103 134 0.92 # 710238 # 711512 # -1 # ID=1_623;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 2_90 - 361 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.00045 17.4 0.0 1 1 7.9e-06 0.001 16.2 0.0 49 122 54 131 31 162 0.74 # 89988 # 91070 # 1 # ID=2_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.376 1_583 - 589 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.00077 16.6 0.1 1 1 0.00024 0.032 11.4 0.0 21 65 341 386 328 390 0.80 # 664005 # 665771 # -1 # ID=1_583;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.390 11_66 - 442 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.0014 15.8 0.0 1 1 2.9e-05 0.0038 14.4 0.0 48 71 51 74 47 89 0.86 # 65990 # 67315 # 1 # ID=11_66;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.419 1_338 - 344 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.0016 15.6 0.0 1 1 0.00011 0.015 12.5 0.0 49 70 64 85 58 94 0.89 # 368985 # 370016 # -1 # ID=1_338;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.422 1_526 - 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176 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.0081 13.3 0.1 1 1 0.00016 0.021 12.0 0.0 46 70 5 29 2 35 0.89 # 156000 # 156527 # 1 # ID=3_154;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.409 8_42 - 247 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.019 12.1 0.0 1 1 0.003 0.4 7.8 0.0 104 142 170 207 156 224 0.82 # 39514 # 40254 # -1 # ID=8_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.366 5_102 - 228 IstB_IS21 PF01695.12 178 0.022 11.9 0.2 1 1 0.0015 0.19 8.8 0.1 44 63 32 51 18 57 0.81 # 127125 # 127808 # -1 # ID=5_102;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.423 4_140 - 257 MipZ PF09140.6 261 5.1e-16 56.2 0.2 1 1 4.4e-18 3.4e-15 53.5 0.2 2 144 4 163 3 190 0.73 # 170721 # 171491 # 1 # ID=4_140;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.444 1_486 - 277 MipZ PF09140.6 261 1e-09 35.6 0.4 1 1 3.3e-12 2.5e-09 34.3 0.4 2 129 4 143 3 192 0.70 # 550369 # 551199 # 1 # ID=1_486;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.391 1_545 - 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451 ABC_tran PF00005.22 137 0.0036 15.3 0.1 1 1 0.00018 0.0085 14.1 0.1 8 57 85 133 81 205 0.70 # 171347 # 172699 # -1 # ID=5_141;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.462 2_130 - 1165 ABC_tran PF00005.22 137 0.0038 15.3 0.0 1 1 8.2e-05 0.0038 15.3 0.0 10 31 23 44 18 86 0.84 # 137073 # 140567 # 1 # ID=2_130;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.401 4_260 - 447 ABC_tran PF00005.22 137 0.0038 15.2 0.0 1 1 0.00021 0.0096 13.9 0.0 8 42 212 246 206 324 0.81 # 291302 # 292642 # -1 # ID=4_260;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.381 1_773 - 345 ABC_tran PF00005.22 137 0.0045 15.0 0.0 1 1 0.00018 0.0082 14.2 0.0 13 42 125 155 120 273 0.72 # 880078 # 881112 # -1 # ID=1_773;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.385 2_49 - 161 ABC_tran PF00005.22 137 0.0046 15.0 0.1 1 1 0.00018 0.0085 14.1 0.1 3 34 26 57 24 64 0.88 # 44755 # 45237 # 1 # ID=2_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.371 1_623 - 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220 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1.6e-07 28.6 0.0 1 1 1.1e-09 2.6e-07 27.9 0.0 37 125 41 131 27 138 0.77 # 398930 # 399589 # 1 # ID=1_366;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.338 9_122 - 708 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1.8e-07 28.5 0.0 1 2 0.0099 2.3 5.3 0.0 45 61 197 213 184 256 0.85 # 143756 # 145879 # -1 # ID=9_122;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.389 9_122 - 708 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1.8e-07 28.5 0.0 2 2 1.7e-06 0.00041 17.5 0.0 43 135 542 632 534 667 0.80 # 143756 # 145879 # -1 # ID=9_122;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.389 6_133 - 290 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 9.8e-07 26.0 0.0 1 1 6.5e-09 1.5e-06 25.4 0.0 35 95 148 206 143 231 0.87 # 120532 # 121401 # -1 # ID=6_133;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.439 5_117 - 311 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1.1e-06 25.9 0.0 1 1 9.1e-09 2.1e-06 24.9 0.0 35 153 134 250 122 267 0.79 # 147077 # 148009 # -1 # ID=5_117;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.393 1_217 - 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428 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0078 13.3 0.0 1 1 5.6e-05 0.013 12.6 0.0 64 130 261 323 233 352 0.74 # 170469 # 171752 # 1 # ID=2_157;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.431 12_30 - 273 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.011 12.8 0.2 1 2 0.06 14 2.7 0.0 41 58 26 43 8 69 0.81 # 32073 # 32891 # 1 # ID=12_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.363 12_30 - 273 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.011 12.8 0.2 2 2 0.0017 0.41 7.7 0.2 107 127 170 187 151 238 0.73 # 32073 # 32891 # 1 # ID=12_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.363 1_602 - 244 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.024 11.7 0.0 1 1 0.00016 0.038 11.1 0.0 46 148 87 194 72 216 0.65 # 685694 # 686425 # -1 # ID=1_602;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.383 7_80 - 239 DUF2791 PF10923.3 417 0.0099 12.2 0.1 1 1 5e-06 0.015 11.6 0.1 49 82 12 45 8 51 0.90 # 85429 # 86145 # -1 # ID=7_80;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.338 1_366 - 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