# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 46_14 - 162 UPF0054 PF02130.12 145 1.9e-42 142.4 0.0 1 1 8.6e-46 2.2e-42 142.2 0.0 21 145 29 152 16 152 0.89 # 13573 # 14058 # -1 # ID=46_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.632 186_6 - 132 UPF0054 PF02130.12 145 0.048 11.4 0.1 1 1 2e-05 0.05 11.3 0.1 82 126 50 94 18 114 0.74 # 3673 # 4068 # 1 # ID=186_6;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.672 20_26 - 534 Sulfotransfer_3 PF13469.1 215 1.3e-16 60.4 3.3 1 1 9.9e-20 1.3e-16 60.4 3.3 1 212 286 474 286 477 0.62 # 25634 # 27235 # -1 # ID=20_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.658 57_11 - 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259 KR PF08659.5 181 2.4e-12 45.3 1.1 1 1 1.4e-14 3e-12 45.0 1.1 2 161 12 173 11 192 0.83 # 11697 # 12473 # 1 # ID=7_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.636 22_25 - 253 KR PF08659.5 181 4.6e-12 44.4 7.3 1 1 3.3e-14 7.1e-12 43.8 7.3 3 162 4 160 3 173 0.90 # 26127 # 26885 # -1 # ID=22_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.675 2_71 - 258 KR PF08659.5 181 5.1e-12 44.3 2.5 1 1 3.4e-14 7.3e-12 43.8 2.5 3 157 18 166 17 192 0.83 # 74453 # 75226 # 1 # ID=2_71;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.615 2_72 - 251 KR PF08659.5 181 8.6e-12 43.5 0.7 1 1 5.5e-14 1.2e-11 43.1 0.7 2 154 15 161 14 176 0.82 # 75223 # 75975 # 1 # ID=2_72;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 47_27 - 246 KR PF08659.5 181 1.2e-11 43.0 2.3 1 1 8.9e-14 1.9e-11 42.4 2.3 2 115 7 118 6 133 0.88 # 28035 # 28772 # -1 # ID=47_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.683 131_7 - 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897 Plug PF07715.10 108 8.2e-16 56.7 0.3 1 1 3.9e-17 3.9e-15 54.5 0.3 3 108 62 173 60 173 0.92 # 15047 # 17737 # -1 # ID=13_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.614 37_23 - 1053 Plug PF07715.10 108 2.2e-15 55.3 0.9 1 1 8.8e-17 9e-15 53.4 0.9 2 107 68 186 67 187 0.93 # 16928 # 20086 # 1 # ID=37_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 40_27 - 996 Plug PF07715.10 108 3.2e-15 54.8 0.2 1 1 1.1e-16 1.1e-14 53.1 0.2 2 108 115 233 114 233 0.95 # 27968 # 30955 # 1 # ID=40_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.605 58_11 - 886 Plug PF07715.10 108 1.2e-14 53.0 1.5 1 1 3.6e-16 3.7e-14 51.4 1.5 2 108 74 179 73 179 0.92 # 11189 # 13846 # 1 # ID=58_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.670 60_4 - 978 Plug PF07715.10 108 1.6e-14 52.6 4.8 1 1 2.7e-16 2.8e-14 51.8 0.4 4 104 74 180 71 185 0.90 # 3384 # 6317 # -1 # ID=60_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.635 206_5 - 486 Plug PF07715.10 108 2.2e-14 52.1 1.8 1 1 3.7e-16 3.7e-14 51.4 0.3 3 108 145 256 143 256 0.95 # 2467 # 3924 # -1 # ID=206_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.615 35_20 - 905 Plug PF07715.10 108 6.6e-14 50.6 5.1 1 1 1.2e-15 1.2e-13 49.8 2.1 4 108 54 165 51 165 0.91 # 17215 # 19929 # 1 # ID=35_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.610 23_1 - 794 Plug PF07715.10 108 7.9e-13 47.1 0.5 1 1 5.1e-14 5.3e-12 44.5 0.0 2 106 56 166 55 167 0.85 # 539 # 2920 # -1 # ID=23_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.634 42_27 - 315 Plug PF07715.10 108 1.3e-12 46.4 1.5 1 1 2.9e-14 3e-12 45.3 1.5 7 93 76 170 72 186 0.78 # 23455 # 24399 # -1 # ID=42_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.634 40_24 - 739 Plug PF07715.10 108 2.3e-11 42.4 0.1 1 1 9.1e-13 9.3e-11 40.5 0.1 3 108 53 162 51 162 0.92 # 23403 # 25619 # 1 # ID=40_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.636 82_4 - 1060 Plug PF07715.10 108 3.6e-11 41.8 3.1 1 1 1.6e-12 1.6e-10 39.7 3.1 7 108 132 235 127 235 0.83 # 1639 # 4818 # -1 # ID=82_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.630 197_5 - 169 Plug PF07715.10 108 1.4e-10 39.9 0.0 1 1 2.2e-12 2.2e-10 39.3 0.0 2 70 39 110 38 128 0.89 # 1243 # 1749 # 1 # ID=197_5;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.669 15_17 - 778 Plug PF07715.10 108 1.4e-10 39.9 0.7 1 1 3.5e-12 3.6e-10 38.6 0.7 5 98 64 165 61 176 0.81 # 16599 # 18932 # -1 # ID=15_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.629 4_7 - 790 Plug PF07715.10 108 1.4e-10 39.9 1.3 1 1 1.4e-12 1.4e-10 39.9 1.3 2 94 92 187 91 201 0.84 # 4424 # 6793 # 1 # ID=4_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.628 6_24 - 187 Plug PF07715.10 108 2.5e-10 39.1 0.4 1 1 4.1e-12 4.2e-10 38.4 0.4 2 86 84 167 83 172 0.91 # 31430 # 31990 # -1 # ID=6_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.690 91_2 - 1038 Plug PF07715.10 108 2.6e-10 39.0 2.8 1 1 1.1e-11 1.1e-09 37.1 2.8 4 108 151 251 149 251 0.89 # 578 # 3691 # 1 # ID=91_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.608 212_6 - 139 Plug PF07715.10 108 2e-09 36.2 0.2 1 1 2.8e-11 2.8e-09 35.7 0.2 10 104 2 88 1 92 0.92 # 3036 # 3452 # -1 # ID=212_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.631 21_29 - 144 Plug PF07715.10 108 1e-08 33.9 1.1 1 1 1.7e-10 1.7e-08 33.2 0.3 4 62 69 133 66 134 0.96 # 41039 # 41470 # 1 # ID=21_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 166_7 - 156 Plug PF07715.10 108 2e-08 33.0 0.1 1 1 3e-10 3.1e-08 32.4 0.1 10 57 70 117 60 144 0.80 # 4975 # 5442 # -1 # ID=166_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.626 17_4 - 721 Plug PF07715.10 108 3.1e-08 32.4 0.4 1 1 6.3e-10 6.4e-08 31.4 0.4 3 107 62 159 60 160 0.94 # 2931 # 5093 # 1 # ID=17_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.654 21_30 - 194 Plug PF07715.10 108 2.1e-06 26.5 0.4 1 1 2e-08 2.1e-06 26.5 0.4 85 108 1 24 1 24 0.97 # 41467 # 42048 # 1 # ID=21_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.637 111_10 - 708 Plug PF07715.10 108 4.7e-06 25.4 0.1 1 1 1.2e-07 1.2e-05 24.0 0.1 7 106 57 150 53 152 0.90 # 9194 # 11317 # 1 # ID=111_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.623 93_8 - 131 Plug PF07715.10 108 1.6e-05 23.6 0.0 1 1 2.3e-07 2.4e-05 23.1 0.0 3 55 72 123 70 129 0.88 # 8646 # 9038 # 1 # ID=93_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.654 35_23 - 205 Plug PF07715.10 108 4.1e-05 22.3 0.0 1 1 8.3e-07 8.4e-05 21.3 0.0 60 106 11 57 6 59 0.92 # 21974 # 22588 # -1 # ID=35_23;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.620 166_6 - 747 Plug PF07715.10 108 0.00011 20.9 0.2 1 1 1e-05 0.0011 17.8 0.0 58 108 8 59 3 59 0.89 # 2705 # 4945 # -1 # ID=166_6;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.614 25_3 - 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