# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 8_42 - 154 UPF0054 PF02130.12 145 4.8e-34 113.6 0.3 1 1 3.1e-37 5.4e-34 113.5 0.3 9 144 10 140 2 141 0.80 # 45668 # 46129 # 1 # ID=8_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.435 11_39 - 532 Mg_chelatase PF01078.16 207 7.2e-80 263.9 0.0 1 1 1e-81 1.2e-79 263.2 0.0 1 204 225 428 225 431 0.97 # 31841 # 33436 # 1 # ID=11_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.421 13_21 - 429 Mg_chelatase PF01078.16 207 3.5e-08 29.8 0.1 1 2 1.9e-06 0.00021 17.4 0.1 22 46 125 149 109 166 0.83 # 19638 # 20924 # 1 # ID=13_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.419 13_21 - 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531 Thymidylate_kin PF02223.12 186 0.043 10.1 3.7 2 2 0.0077 1.7 4.9 0.0 3 21 353 371 352 377 0.88 # 41155 # 42747 # 1 # ID=11_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.372 11_23 - 332 GTP1_OBG PF01018.17 156 1e-63 210.6 4.3 1 1 8.1e-67 1.4e-63 210.1 4.3 1 156 2 157 2 157 0.99 # 17238 # 18233 # 1 # ID=11_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.447 21_10 - 750 Torsin PF06309.6 127 0.0057 13.5 0.0 1 1 3.2e-05 0.018 11.8 0.0 13 75 446 510 438 529 0.83 # 9164 # 11413 # 1 # ID=21_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 2_46 - 788 Torsin PF06309.6 127 0.0063 13.3 0.1 1 1 0.00015 0.088 9.6 0.0 31 80 330 380 295 385 0.73 # 46193 # 48556 # -1 # ID=2_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 4_40 - 337 Torsin PF06309.6 127 0.013 12.3 0.0 1 1 4e-05 0.023 11.5 0.0 14 77 15 80 7 88 0.86 # 37020 # 38030 # -1 # ID=4_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.437 5_88 - 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89 Ribosomal_S17 PF00366.15 69 3.4e-23 78.4 4.7 1 1 2.5e-26 4.3e-23 78.1 4.7 1 66 13 78 13 81 0.97 # 228865 # 229131 # -1 # ID=1_206;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.397 2_29 - 212 Rad17 PF03215.10 519 3e-05 19.8 0.1 1 1 2.7e-07 5.9e-05 18.8 0.0 46 69 16 39 4 94 0.73 # 28523 # 29158 # 1 # ID=2_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 7_87 - 256 Rad17 PF03215.10 519 4.3e-05 19.2 0.1 1 1 2.5e-07 5.4e-05 18.9 0.1 33 128 15 111 8 170 0.66 # 88622 # 89389 # -1 # ID=7_87;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.428 8_5 - 395 Rad17 PF03215.10 519 0.00028 16.6 0.0 1 1 2.1e-06 0.00045 15.9 0.0 50 87 41 77 29 110 0.79 # 4787 # 5971 # -1 # ID=8_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.451 6_83 - 489 Rad17 PF03215.10 519 0.00035 16.3 0.0 1 1 3.4e-06 0.00073 15.2 0.0 37 73 275 311 254 318 0.84 # 81630 # 83096 # -1 # ID=6_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.412 1_82 - 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531 MobB PF03205.9 140 0.00019 18.1 0.0 2 2 0.00044 0.039 10.6 0.0 3 25 349 371 348 377 0.90 # 41155 # 42747 # 1 # ID=11_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.372 6_92 - 481 MobB PF03205.9 140 0.00031 17.4 0.0 1 1 7.3e-06 0.00066 16.3 0.0 2 36 247 281 246 291 0.91 # 89878 # 91320 # 1 # ID=6_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.430 11_45 - 214 MobB PF03205.9 140 0.00039 17.1 0.0 1 1 4.7e-05 0.0042 13.7 0.0 3 29 30 56 28 73 0.85 # 37119 # 37760 # 1 # ID=11_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.419 20_10 - 492 MobB PF03205.9 140 0.00041 17.0 0.2 1 2 0.0029 0.27 7.9 0.0 2 23 3 24 2 29 0.89 # 9811 # 11286 # 1 # ID=20_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.428 20_10 - 492 MobB PF03205.9 140 0.00041 17.0 0.2 2 2 0.0083 0.75 6.4 0.0 3 21 222 240 220 276 0.89 # 9811 # 11286 # 1 # ID=20_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.428 21_10 - 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291 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 6.8e-07 25.7 0.3 2 2 3.8e-07 3.4e-05 20.2 0.1 88 137 186 234 180 260 0.83 # 43 # 915 # 1 # ID=40_1;partial=01;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.310 5_17 - 317 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1.7e-05 21.2 0.0 1 2 1.5e-05 0.0014 15.0 0.0 96 144 8 55 1 72 0.75 # 17078 # 18028 # 1 # ID=5_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.328 5_17 - 317 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1.7e-05 21.2 0.0 2 2 0.036 3.3 4.0 0.0 42 87 203 247 196 263 0.82 # 17078 # 18028 # 1 # ID=5_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.328 24_2 - 262 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1.9e-05 21.0 0.3 1 2 0.0014 0.13 8.6 0.0 95 127 10 40 1 54 0.76 # 862 # 1647 # 1 # ID=24_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.341 24_2 - 262 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1.9e-05 21.0 0.3 2 2 0.00045 0.041 10.2 0.0 30 58 204 232 178 251 0.76 # 862 # 1647 # 1 # ID=24_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.341 38_1 - 336 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 2.2e-05 20.8 0.0 1 2 0.0043 0.39 7.0 0.0 40 57 17 44 5 69 0.80 # 2 # 1009 # 1 # ID=38_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.332 38_1 - 336 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 2.2e-05 20.8 0.0 2 2 0.00023 0.021 11.1 0.0 104 132 203 226 172 240 0.69 # 2 # 1009 # 1 # ID=38_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.332 7_12 - 831 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 2.6e-05 20.6 0.0 1 2 0.0018 0.16 8.2 0.0 42 61 234 253 214 274 0.84 # 15768 # 18260 # -1 # ID=7_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.376 7_12 - 831 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 2.6e-05 20.6 0.0 2 2 0.00086 0.078 9.3 0.0 98 127 511 538 484 550 0.70 # 15768 # 18260 # -1 # ID=7_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.376 8_19 - 287 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00011 18.6 0.0 1 1 3.1e-05 0.0028 13.9 0.0 87 127 5 43 2 55 0.72 # 20536 # 21396 # -1 # ID=8_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.410 5_12 - 430 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00019 17.8 0.0 1 2 0.00047 0.042 10.1 0.0 40 113 69 138 62 143 0.79 # 12665 # 13954 # 1 # ID=5_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.297 5_12 - 430 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00019 17.8 0.0 2 2 0.017 1.5 5.1 0.1 93 129 239 273 212 288 0.62 # 12665 # 13954 # 1 # ID=5_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.297 4_73 - 254 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00027 17.3 0.0 1 1 4.6e-06 0.00042 16.7 0.0 42 126 34 114 24 129 0.80 # 65698 # 66459 # -1 # ID=4_73;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.432 7_9 - 459 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00042 16.7 1.2 1 1 2e-05 0.0019 14.6 0.0 72 136 76 144 70 190 0.74 # 12402 # 13778 # -1 # ID=7_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.341 4_136 - 309 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00047 16.5 0.0 1 2 0.0029 0.26 7.5 0.0 87 132 13 55 2 73 0.66 # 131459 # 132385 # 1 # ID=4_136;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.347 4_136 - 309 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00047 16.5 0.0 2 2 0.0067 0.61 6.4 0.0 42 85 261 303 251 306 0.77 # 131459 # 132385 # 1 # ID=4_136;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.347 30_4 - 260 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00055 16.3 0.2 1 1 1.1e-05 0.001 15.4 0.2 71 141 175 243 172 249 0.74 # 2136 # 2915 # -1 # ID=30_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.273 5_29 - 208 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00079 15.8 0.0 1 1 3.2e-05 0.0029 13.9 0.0 68 131 39 100 1 110 0.74 # 28005 # 28628 # 1 # ID=5_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.438 23_2 - 309 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0008 15.7 0.1 1 1 0.00028 0.025 10.9 0.1 75 129 173 223 169 246 0.68 # 279 # 1205 # 1 # ID=23_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.274 13_25 - 371 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0013 15.1 0.0 1 2 0.00046 0.041 10.2 0.0 94 126 7 38 1 46 0.74 # 24387 # 25499 # 1 # ID=13_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.385 13_25 - 371 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0013 15.1 0.0 2 2 0.093 8.4 2.6 0.0 44 93 221 270 206 288 0.73 # 24387 # 25499 # 1 # ID=13_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.385 5_18 - 286 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0022 14.3 0.2 1 1 0.0006 0.054 9.8 0.1 105 126 180 201 160 224 0.67 # 18267 # 19124 # 1 # ID=5_18;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.323 7_4 - 371 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0062 12.8 0.0 1 2 0.025 2.3 4.5 0.0 37 56 42 61 37 104 0.85 # 6417 # 7529 # 1 # ID=7_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.267 7_4 - 371 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0062 12.8 0.0 2 2 0.009 0.82 5.9 0.0 88 127 204 242 185 265 0.74 # 6417 # 7529 # 1 # ID=7_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.267 5_25 - 275 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0079 12.5 0.0 1 2 0.025 2.2 4.5 0.0 108 128 36 56 13 74 0.76 # 23981 # 24805 # 1 # ID=5_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.381 5_25 - 275 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0079 12.5 0.0 2 2 0.0095 0.86 5.9 0.0 45 78 222 254 213 269 0.74 # 23981 # 24805 # 1 # ID=5_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.381 19_16 - 510 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.008 12.5 0.0 1 1 0.00021 0.019 11.3 0.0 80 150 257 322 207 344 0.75 # 11894 # 13423 # -1 # ID=19_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 5_15 - 421 Eco57I PF07669.6 106 6.2e-15 52.4 0.0 1 1 8e-17 1.7e-14 51.0 0.0 2 104 82 192 81 194 0.89 # 14834 # 16096 # 1 # ID=5_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 14_23 - 1454 Eco57I PF07669.6 106 1.2e-09 35.4 3.6 1 1 1.1e-09 2.4e-07 28.0 0.3 3 94 816 961 814 972 0.82 # 21536 # 25897 # 1 # ID=14_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.361 3_90 - 818 Eco57I PF07669.6 106 3.4e-07 27.5 6.2 1 1 2.2e-09 4.7e-07 27.1 0.1 3 103 538 622 536 625 0.85 # 91478 # 93931 # 1 # ID=3_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.293 5_23 - 369 Eco57I PF07669.6 106 2.1e-06 25.0 0.0 1 1 3.1e-08 6.7e-06 23.4 0.0 5 78 112 194 111 211 0.81 # 22125 # 23231 # 1 # ID=5_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.316 24_7 - 1225 Eco57I PF07669.6 106 5.2e-06 23.7 0.0 1 1 1e-07 2.2e-05 21.7 0.0 2 55 840 899 839 920 0.71 # 4799 # 8473 # -1 # ID=24_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 7_2 - 1689 Eco57I PF07669.6 106 6.3e-06 23.4 0.0 1 1 2.9e-08 6.3e-06 23.4 0.0 3 102 547 664 544 667 0.89 # 196 # 5262 # -1 # ID=7_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 5_29 - 208 Eco57I PF07669.6 106 2.8e-05 21.4 0.0 1 1 2e-07 4.3e-05 20.7 0.0 2 104 83 193 82 195 0.89 # 28005 # 28628 # 1 # ID=5_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.438 19_16 - 510 Eco57I PF07669.6 106 0.0006 17.1 0.0 1 1 2.7e-05 0.0057 13.9 0.0 3 105 288 401 285 402 0.78 # 11894 # 13423 # -1 # ID=19_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.377 3_88 - 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