# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 1_774 - 159 UPF0054 PF02130.12 145 2.1e-39 131.8 0.1 1 1 7.7e-43 2.3e-39 131.7 0.1 19 145 22 145 5 145 0.84 # 848809 # 849285 # -1 # ID=1_774;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.371 8_13 - 504 Mg_chelatase PF01078.16 207 3.6e-95 314.7 0.0 1 1 6.3e-97 8.9e-95 313.4 0.0 1 206 190 395 190 396 0.99 # 10886 # 12397 # -1 # ID=8_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.412 1_1208 - 425 Mg_chelatase PF01078.16 207 5.3e-08 30.0 0.4 1 2 7.8e-08 1.1e-05 22.4 0.7 20 47 108 135 74 162 0.78 # 1355788 # 1357062 # -1 # ID=1_1208;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.376 1_1208 - 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248 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 7.6e-06 22.7 0.5 1 1 6.2e-08 1.1e-05 22.2 0.5 2 127 7 141 6 184 0.66 # 478403 # 479146 # -1 # ID=1_426;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.409 1_111 - 295 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 1.1e-05 22.2 0.4 1 2 0.0029 0.51 6.9 0.1 1 22 3 24 3 29 0.89 # 137423 # 138307 # 1 # ID=1_111;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.379 1_111 - 295 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 1.1e-05 22.2 0.4 2 2 4.5e-05 0.0079 12.8 0.0 60 129 34 102 25 144 0.85 # 137423 # 138307 # 1 # ID=1_111;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.379 1_174 - 282 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 1.8e-05 21.5 0.0 1 1 1.5e-07 2.6e-05 21.0 0.0 1 113 4 120 4 128 0.72 # 213665 # 214510 # -1 # ID=1_174;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 1_715 - 270 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 8.9e-05 19.2 0.0 1 1 7.4e-07 0.00013 18.6 0.0 1 75 5 80 5 97 0.88 # 787785 # 788594 # 1 # ID=1_715;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.386 6_8 - 249 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 0.00011 18.9 0.4 1 1 1.2e-06 0.00022 17.9 0.4 1 150 7 175 7 192 0.59 # 6733 # 7479 # -1 # ID=6_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 6_205 - 296 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 0.00033 17.3 0.0 1 1 2.7e-06 0.00048 16.8 0.0 2 166 55 227 54 247 0.70 # 205161 # 206048 # -1 # ID=6_205;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.402 1_1142 - 241 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 0.00052 16.7 0.0 1 1 3.9e-06 0.00069 16.3 0.0 97 169 100 176 7 180 0.77 # 1275654 # 1276376 # 1 # ID=1_1142;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.362 3_311 - 258 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 0.0016 15.1 0.0 1 1 1.4e-05 0.0025 14.5 0.0 1 92 9 101 9 164 0.73 # 364734 # 365507 # 1 # ID=3_311;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 3_152 - 341 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 0.0027 14.4 0.1 1 1 0.00011 0.019 11.5 0.0 1 80 24 104 24 112 0.81 # 182808 # 183830 # 1 # ID=3_152;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.341 6_9 - 247 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 0.0073 12.9 0.0 1 1 5.9e-05 0.01 12.4 0.0 2 127 7 140 6 143 0.48 # 7655 # 8395 # -1 # ID=6_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 5_26 - 2317 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 0.023 11.3 0.0 1 1 0.00032 0.057 10.0 0.0 2 127 1735 1882 1734 1887 0.63 # 31011 # 37961 # 1 # ID=5_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 6_212 - 119 Ribosomal_S13 PF00416.17 107 4.3e-39 131.0 0.4 1 1 4.8e-42 4.8e-39 130.8 0.4 1 107 3 108 3 108 0.99 # 210548 # 210904 # -1 # ID=6_212;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 1_632 - 200 Ribosomal_S13 PF00416.17 107 0.0031 15.7 0.1 1 2 6.2e-05 0.062 11.5 0.0 9 77 68 134 63 136 0.74 # 687813 # 688412 # 1 # ID=1_632;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.397 1_632 - 200 Ribosomal_S13 PF00416.17 107 0.0031 15.7 0.1 2 2 0.017 17 3.6 0.0 17 35 111 129 104 160 0.73 # 687813 # 688412 # 1 # ID=1_632;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.397 8_39 - 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249 Ubie_methyltran PF01209.13 233 0.0028 14.5 0.1 1 1 3.9e-05 0.0055 13.5 0.1 49 108 4 65 2 86 0.79 # 6733 # 7479 # -1 # ID=6_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 1_571 - 391 Ubie_methyltran PF01209.13 233 0.005 13.7 0.0 1 1 7e-05 0.01 12.7 0.0 40 122 213 293 205 340 0.79 # 631635 # 632807 # 1 # ID=1_571;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 5_144 - 308 Ubie_methyltran PF01209.13 233 0.011 12.5 0.0 1 1 0.00015 0.021 11.6 0.0 48 96 138 185 127 201 0.82 # 185717 # 186640 # -1 # ID=5_144;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.397 1_952 - 219 Ubie_methyltran PF01209.13 233 0.016 12.0 0.0 1 1 0.00027 0.038 10.8 0.0 45 118 45 122 21 126 0.70 # 1041392 # 1042048 # 1 # ID=1_952;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.344 1_867 - 248 Ubie_methyltran PF01209.13 233 0.026 11.3 0.0 1 1 0.00037 0.053 10.3 0.0 102 152 78 128 58 136 0.87 # 953541 # 954284 # -1 # ID=1_867;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.332 6_222 - 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666 UvrD_C PF13361.1 351 1.1e-88 295.7 0.1 1 1 2.8e-91 2.1e-88 294.8 0.1 1 350 271 610 271 611 0.96 # 211851 # 213848 # 1 # ID=4_196;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.390 1_1159 - 1077 UvrD_C PF13361.1 351 3.9e-43 145.9 0.2 1 1 5.2e-46 3.9e-43 145.9 0.2 2 347 478 845 477 849 0.85 # 1298994 # 1302224 # 1 # ID=1_1159;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.385 5_116 - 859 UvrD_C PF13361.1 351 0.0086 13.2 0.6 1 1 4e-05 0.03 11.4 0.1 183 319 356 487 261 500 0.75 # 152290 # 154866 # 1 # ID=5_116;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.374 3_138 - 397 PGK PF00162.14 384 5.1e-144 477.2 0.0 1 1 1.9e-147 5.8e-144 477.0 0.0 2 384 6 378 5 378 0.99 # 165331 # 166521 # -1 # ID=3_138;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.445 5_32 - 3780 KR PF08659.5 181 1.6e-116 384.0 0.0 1 2 1.3e-56 1.3e-54 182.3 0.0 1 180 1486 1665 1486 1666 0.97 # 43480 # 54819 # 1 # ID=5_32;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.396 5_32 - 3780 KR PF08659.5 181 1.6e-116 384.0 0.0 2 2 6.9e-62 7.3e-60 199.4 0.0 1 179 2916 3093 2916 3095 0.98 # 43480 # 54819 # 1 # ID=5_32;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.396 5_26 - 2317 KR PF08659.5 181 1.6e-44 149.4 0.0 1 1 2.6e-46 2.8e-44 148.7 0.0 1 180 1732 1927 1732 1928 0.93 # 31011 # 37961 # 1 # ID=5_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 1_426 - 248 KR PF08659.5 181 5.1e-24 82.6 0.0 1 1 6.6e-26 7e-24 82.2 0.0 3 169 6 175 5 190 0.87 # 478403 # 479146 # -1 # ID=1_426;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.409 6_8 - 249 KR PF08659.5 181 1.8e-23 80.9 0.1 1 1 2e-25 2.1e-23 80.6 0.1 2 162 6 168 5 189 0.90 # 6733 # 7479 # -1 # ID=6_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 6_9 - 247 KR PF08659.5 181 9e-22 75.3 0.0 1 1 1.1e-23 1.2e-21 74.9 0.0 4 162 7 167 5 188 0.86 # 7655 # 8395 # -1 # ID=6_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 1_64 - 270 KR PF08659.5 181 8.7e-18 62.3 0.0 1 1 1.2e-19 1.2e-17 61.8 0.0 2 164 17 172 17 183 0.89 # 83799 # 84608 # 1 # ID=1_64;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.421 1_729 - 249 KR PF08659.5 181 6.2e-16 56.3 0.1 1 1 1.1e-17 1.2e-15 55.4 0.1 3 173 9 183 8 191 0.81 # 800477 # 801223 # 1 # ID=1_729;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.404 6_205 - 296 KR PF08659.5 181 1.9e-12 44.9 0.9 1 1 5.3e-14 5.7e-12 43.4 0.7 4 164 55 214 53 233 0.86 # 205161 # 206048 # -1 # ID=6_205;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.402 1_761 - 260 KR PF08659.5 181 1.4e-11 42.1 0.2 1 1 1.9e-13 2.1e-11 41.5 0.2 3 163 3 164 2 178 0.89 # 837679 # 838458 # 1 # ID=1_761;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.396 3_311 - 258 KR PF08659.5 181 3.6e-11 40.7 0.0 1 1 4.6e-13 4.9e-11 40.3 0.0 3 165 9 173 8 190 0.86 # 364734 # 365507 # 1 # ID=3_311;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 9_25 - 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447 MMR_HSR1 PF01926.18 116 2.7e-26 89.5 0.1 1 1 6.5e-28 5.1e-26 88.6 0.1 2 116 218 333 217 333 0.88 # 3109 # 4449 # 1 # ID=4_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.385 1_293 - 296 MMR_HSR1 PF01926.18 116 8.3e-26 87.9 0.1 1 1 1.8e-27 1.4e-25 87.2 0.1 2 116 8 122 7 122 0.87 # 332442 # 333329 # 1 # ID=1_293;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 2_308 - 342 MMR_HSR1 PF01926.18 116 3.2e-23 79.6 0.0 1 1 6.2e-25 4.9e-23 79.0 0.0 1 116 161 284 161 284 0.83 # 342016 # 343041 # -1 # ID=2_308;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.420 3_10 - 415 MMR_HSR1 PF01926.18 116 5.5e-23 78.9 0.0 1 1 1.5e-24 1.2e-22 77.7 0.0 2 116 200 318 199 318 0.85 # 12629 # 13873 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 2_313 - 364 MMR_HSR1 PF01926.18 116 1e-20 71.5 0.0 1 1 2.6e-22 2e-20 70.6 0.0 1 91 4 109 4 208 0.82 # 345471 # 346562 # 1 # ID=2_313;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.429 3_126 - 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145 Ribosomal_L11 PF00298.14 69 7.2e-31 103.9 2.0 1 1 3.7e-34 1.1e-30 103.3 2.0 1 69 72 140 72 140 0.99 # 13600 # 14034 # -1 # ID=10_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.421 6_30 - 292 CoA_binding PF02629.14 96 1.5e-34 116.1 1.8 1 2 2.6e-36 1.9e-33 112.5 0.2 1 96 6 99 6 99 0.99 # 29302 # 30177 # -1 # ID=6_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 6_30 - 292 CoA_binding PF02629.14 96 1.5e-34 116.1 1.8 2 2 0.055 41 2.5 0.1 4 84 147 228 145 239 0.69 # 29302 # 30177 # -1 # ID=6_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 8_44 - 134 CoA_binding PF02629.14 96 3.3e-10 38.1 0.0 1 1 6.5e-13 4.9e-10 37.5 0.0 7 92 16 97 11 98 0.91 # 37183 # 37584 # -1 # ID=8_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.400 1_318 - 626 CoA_binding PF02629.14 96 2.7e-05 22.3 0.1 1 1 1.1e-07 8e-05 20.8 0.1 3 82 154 234 152 237 0.93 # 367570 # 369447 # 1 # ID=1_318;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.409 7_42 - 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353 ABC_tran PF00005.22 137 5e-06 24.6 2.0 1 2 4.9e-05 0.0023 15.9 0.1 15 34 27 46 20 51 0.88 # 2460 # 3518 # 1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.349 3_3 - 353 ABC_tran PF00005.22 137 5e-06 24.6 2.0 2 2 0.039 1.9 6.5 0.2 85 125 241 284 137 301 0.55 # 2460 # 3518 # 1 # ID=3_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.349 1_887 - 463 ABC_tran PF00005.22 137 7.3e-06 24.0 0.1 1 2 0.0033 0.16 10.0 0.0 13 36 4 27 3 112 0.86 # 975048 # 976436 # -1 # ID=1_887;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.371 1_887 - 463 ABC_tran PF00005.22 137 7.3e-06 24.0 0.1 2 2 0.0011 0.053 11.5 0.0 12 79 175 241 166 312 0.66 # 975048 # 976436 # -1 # ID=1_887;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.371 2_336 - 378 ABC_tran PF00005.22 137 8.2e-06 23.9 0.0 1 1 2.9e-07 1.4e-05 23.1 0.0 11 42 149 180 140 280 0.74 # 368137 # 369270 # 1 # ID=2_336;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.423 2_330 - 369 ABC_tran PF00005.22 137 2.6e-05 22.2 1.3 1 1 8.7e-07 4.1e-05 21.6 0.1 13 96 165 281 152 320 0.73 # 362381 # 363487 # -1 # ID=2_330;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.422 1_1097 - 859 ABC_tran PF00005.22 137 2.8e-05 22.1 1.3 1 1 0.002 0.095 10.7 0.0 16 49 603 637 599 678 0.82 # 1224584 # 1227160 # 1 # ID=1_1097;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.407 1_283 - 176 ABC_tran PF00005.22 137 0.00011 20.2 0.1 1 1 3.8e-06 0.00018 19.5 0.1 10 45 5 42 1 171 0.70 # 317645 # 318172 # 1 # ID=1_283;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.403 1_1131 - 380 ABC_tran PF00005.22 137 0.00015 19.8 0.3 1 1 9.2e-06 0.00044 18.3 0.2 7 36 156 185 152 334 0.84 # 1265609 # 1266748 # -1 # ID=1_1131;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.396 3_10 - 415 ABC_tran PF00005.22 137 0.00019 19.4 0.0 1 1 2.3e-05 0.0011 17.0 0.0 13 70 199 255 195 329 0.63 # 12629 # 13873 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 6_43 - 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