# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 6_8 - 135 UPF0054 PF02130.12 145 1.1e-35 119.1 0.2 1 1 6.7e-39 1.3e-35 118.9 0.2 22 144 11 122 3 123 0.90 # 7713 # 8117 # 1 # ID=6_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 4_133 - 505 Mg_chelatase PF01078.16 207 2.3e-72 239.5 0.0 1 1 2.5e-74 3.4e-72 239.0 0.0 1 205 201 404 201 406 0.97 # 124583 # 126097 # -1 # ID=4_133;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.391 3_163 - 408 Mg_chelatase PF01078.16 207 5.7e-08 29.2 0.5 1 2 2.3e-06 0.00032 17.0 0.1 23 46 109 132 104 147 0.89 # 145259 # 146482 # 1 # ID=3_163;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.382 3_163 - 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160 Citrate_ly_lig PF08218.6 182 4e-07 26.7 0.0 2 2 0.0066 12 2.3 0.0 149 177 123 149 112 153 0.83 # 218696 # 219175 # 1 # ID=2_231;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.381 1_539 - 83 DNA_methylase PF00145.12 335 2.3e-06 24.0 0.3 1 1 3.6e-09 2.3e-06 24.0 0.3 1 31 1 51 1 79 0.70 # 493269 # 493517 # 1 # ID=1_539;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.261 1_384 - 290 DNA_methylase PF00145.12 335 8.2e-05 18.9 0.1 1 1 1.8e-07 0.00011 18.4 0.1 4 79 107 190 105 206 0.90 # 344794 # 345663 # 1 # ID=1_384;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.362 6_76 - 194 DNA_methylase PF00145.12 335 0.00046 16.4 0.2 1 1 9.9e-07 0.00062 16.0 0.2 3 61 52 110 50 126 0.83 # 69455 # 70036 # -1 # ID=6_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.323 5_104 - 209 Ub-Mut7C PF14451.1 81 0.012 12.2 0.0 1 1 1.1e-05 0.021 11.4 0.0 50 79 123 153 120 155 0.87 # 89353 # 89979 # 1 # ID=5_104;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.362 5_82 - 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289 AAA_17 PF13207.1 121 0.0074 14.2 1.3 1 1 0.0032 0.1 10.5 0.8 4 24 87 109 85 242 0.67 # 5499 # 6365 # 1 # ID=6_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.399 1_465 - 573 AAA_17 PF13207.1 121 0.012 13.5 0.3 1 1 0.0012 0.039 11.8 0.3 2 39 365 405 364 536 0.74 # 419393 # 421111 # -1 # ID=1_465;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 5_11 - 356 AAA_17 PF13207.1 121 0.012 13.5 0.0 1 1 0.0008 0.026 12.4 0.0 1 64 28 88 28 161 0.62 # 13965 # 15032 # -1 # ID=5_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.336 2_162 - 602 AAA_17 PF13207.1 121 0.027 12.4 8.4 1 1 0.0013 0.044 11.7 2.7 1 15 357 371 357 372 0.93 # 141761 # 143566 # -1 # ID=2_162;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.364 6_40 - 689 AAA_17 PF13207.1 121 0.083 10.8 4.2 1 1 0.012 0.4 8.6 0.0 2 40 166 217 165 313 0.67 # 34242 # 36308 # -1 # ID=6_40;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.355 5_86 - 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281 MobB PF03205.9 140 0.0023 14.7 0.3 1 1 7.8e-05 0.0049 13.6 0.3 2 30 33 61 32 66 0.88 # 285972 # 286814 # -1 # ID=2_300;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 10_1 - 424 MobB PF03205.9 140 0.0028 14.4 0.0 1 1 0.00014 0.0088 12.8 0.0 5 36 126 157 124 164 0.90 # 1 # 1272 # 1 # ID=10_1;partial=10;start_type=Edge;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.351 3_191 - 944 MobB PF03205.9 140 0.0029 14.3 0.8 1 2 0.018 1.1 6.0 0.0 2 17 27 42 26 54 0.88 # 172618 # 175449 # -1 # ID=3_191;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 3_191 - 944 MobB PF03205.9 140 0.0029 14.3 0.8 2 2 0.023 1.4 5.6 0.0 2 25 628 652 627 677 0.68 # 172618 # 175449 # -1 # ID=3_191;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.400 2_3 - 323 MobB PF03205.9 140 0.0038 14.0 0.1 1 1 0.00042 0.027 11.2 0.0 2 19 29 46 28 70 0.91 # 2417 # 3385 # -1 # ID=2_3;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 1_19 - 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203 Cytidylate_kin2 PF13189.1 179 0.00073 16.5 0.1 1 2 0.053 20 2.1 0.0 4 34 9 39 8 55 0.72 # 40862 # 41470 # 1 # ID=7_47;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 7_47 - 203 Cytidylate_kin2 PF13189.1 179 0.00073 16.5 0.1 2 2 4e-05 0.015 12.2 0.0 118 149 128 159 120 186 0.89 # 40862 # 41470 # 1 # ID=7_47;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 1_531 - 191 Cytidylate_kin2 PF13189.1 179 0.0034 14.3 1.7 1 1 4e-05 0.015 12.2 0.1 1 46 5 50 5 95 0.82 # 484907 # 485479 # 1 # ID=1_531;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.335 7_44 - 392 Cytidylate_kin2 PF13189.1 179 0.013 12.4 0.1 1 1 0.0003 0.11 9.4 0.1 7 30 42 65 39 123 0.88 # 38193 # 39368 # 1 # ID=7_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 5_83 - 94 Ribosomal_S19 PF00203.16 81 4.8e-34 112.9 0.1 1 1 2.9e-37 5.5e-34 112.7 0.1 1 81 3 83 3 83 0.99 # 79846 # 80127 # 1 # ID=5_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.365 1_362 - 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191 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00026 17.2 0.2 1 1 9.7e-06 0.00065 15.9 0.0 18 43 5 29 2 38 0.81 # 484907 # 485479 # 1 # ID=1_531;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.335 2_21 - 858 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0003 17.0 0.6 1 1 0.00015 0.01 12.0 0.0 4 62 587 658 584 695 0.74 # 21873 # 24446 # 1 # ID=2_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.390 2_332 - 449 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00032 16.9 0.1 1 1 1.2e-05 0.00083 15.5 0.1 13 55 95 138 86 203 0.81 # 315029 # 316375 # -1 # ID=2_332;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.362 1_313 - 192 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00037 16.7 0.2 1 1 1.2e-05 0.00078 15.6 0.2 16 146 2 134 1 161 0.84 # 281617 # 282192 # -1 # ID=1_313;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.385 2_314 - 699 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00045 16.4 0.0 1 1 0.00013 0.0084 12.2 0.0 10 67 437 503 427 548 0.76 # 299025 # 301121 # 1 # ID=2_314;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.360 6_6 - 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249 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 8.9e-06 21.8 0.0 1 1 1.6e-07 2.7e-05 20.3 0.0 2 168 6 190 5 197 0.76 # 173367 # 174113 # 1 # ID=2_187;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.384 1_41 - 350 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 0.0002 17.4 0.1 1 1 8.4e-06 0.0014 14.6 0.1 61 128 40 108 6 138 0.79 # 38288 # 39337 # 1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.307 5_102 - 123 Ribosomal_S13 PF00416.17 107 3.7e-36 120.9 0.1 1 1 6.7e-39 4.2e-36 120.7 0.1 1 107 3 109 3 109 0.99 # 88555 # 88923 # 1 # ID=5_102;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.382 1_483 - 185 Ribosomal_S13 PF00416.17 107 0.0003 18.3 0.0 1 1 0.0001 0.066 10.7 0.0 9 43 67 101 60 152 0.86 # 438934 # 439488 # 1 # ID=1_483;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.396 2_141 - 453 Ribosomal_S13 PF00416.17 107 0.011 13.3 0.7 1 1 0.00011 0.071 10.6 0.1 17 81 94 157 86 161 0.93 # 122637 # 123995 # 1 # ID=2_141;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 4_58 - 221 Methyltransf_25 PF13649.1 101 4.9e-15 52.8 0.0 1 1 1e-16 1.1e-14 51.7 0.0 1 100 39 132 39 133 0.96 # 49516 # 50178 # -1 # ID=4_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.305 5_23 - 286 Methyltransf_25 PF13649.1 101 9e-11 39.1 0.1 1 1 1.7e-12 1.8e-10 38.1 0.1 2 93 122 210 121 215 0.92 # 23529 # 24386 # 1 # ID=5_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.289 3_126 - 264 Methyltransf_25 PF13649.1 101 2.8e-10 37.5 0.0 1 1 5.1e-12 5.7e-10 36.5 0.0 1 95 65 151 65 157 0.88 # 116392 # 117183 # 1 # ID=3_126;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.372 5_21 - 125 Methyltransf_25 PF13649.1 101 3.7e-10 37.1 0.1 1 1 1.5e-11 1.7e-09 35.1 0.0 1 62 60 112 60 120 0.90 # 22904 # 23278 # 1 # ID=5_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.277 7_82 - 238 Methyltransf_25 PF13649.1 101 1.2e-09 35.5 0.0 1 1 2.1e-11 2.3e-09 34.6 0.0 1 90 42 123 42 139 0.83 # 76707 # 77420 # -1 # ID=7_82;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 3_102 - 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270 Methyltransf_25 PF13649.1 101 0.00013 19.3 0.0 1 1 2.1e-06 0.00024 18.5 0.0 2 73 143 207 142 228 0.88 # 88744 # 89553 # 1 # ID=1_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.326 2_179 - 994 Methyltransf_25 PF13649.1 101 0.0003 18.2 0.0 1 1 1.5e-05 0.0016 15.8 0.0 1 101 471 610 471 610 0.63 # 161984 # 164965 # 1 # ID=2_179;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.323 1_480 - 263 Methyltransf_25 PF13649.1 101 0.0003 18.2 0.0 1 1 7.1e-06 0.00079 16.8 0.0 1 101 100 232 100 232 0.73 # 435549 # 436337 # -1 # ID=1_480;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.330 2_381 - 265 Methyltransf_25 PF13649.1 101 0.00032 18.1 0.0 1 1 5.6e-06 0.00062 17.2 0.0 1 73 108 175 108 195 0.85 # 368569 # 369363 # -1 # ID=2_381;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.362 1_431 - 283 Methyltransf_25 PF13649.1 101 0.00037 17.9 0.0 1 1 6.8e-06 0.00075 16.9 0.0 1 101 88 181 88 181 0.76 # 386136 # 386984 # -1 # ID=1_431;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.340 5_76 - 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334 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 3.6e-06 23.5 0.4 1 2 0.046 9.6 2.6 0.0 69 95 110 136 103 159 0.79 # 63633 # 64634 # -1 # ID=3_70;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.270 3_70 - 334 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 3.6e-06 23.5 0.4 2 2 2.7e-06 0.00057 16.4 0.0 108 148 194 233 173 253 0.65 # 63633 # 64634 # -1 # ID=3_70;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.270 3_36 - 338 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 7e-06 22.6 0.1 1 2 0.052 11 2.4 0.0 36 57 27 48 21 50 0.69 # 33858 # 34871 # -1 # ID=3_36;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.301 3_36 - 338 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 7e-06 22.6 0.1 2 2 1.1e-06 0.00024 17.6 0.0 96 149 190 238 167 254 0.65 # 33858 # 34871 # -1 # ID=3_36;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.301 1_384 - 290 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00038 16.9 0.0 1 1 3.6e-06 0.00075 16.0 0.0 46 124 106 182 96 195 0.81 # 344794 # 345663 # 1 # ID=1_384;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.362 3_69 - 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