# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 30_14 - 162 UPF0054 PF02130.12 145 3.9e-42 141.2 0.0 1 1 2e-45 4.6e-42 141.0 0.0 21 145 29 152 16 152 0.89 # 14348 # 14833 # -1 # ID=30_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.634 77_13 - 138 UPF0054 PF02130.12 145 0.035 11.6 0.1 1 1 1.8e-05 0.041 11.4 0.1 82 125 50 93 19 112 0.76 # 11578 # 11991 # -1 # ID=77_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.667 60_6 - 530 Sulfotransfer_3 PF13469.1 215 1.3e-16 60.2 3.9 1 1 1.2e-19 1.3e-16 60.2 3.9 1 212 282 470 282 473 0.62 # 9336 # 10925 # -1 # ID=60_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.660 20_39 - 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632 Zeta_toxin PF06414.7 201 2.5e-06 25.0 0.1 1 2 0.0017 0.24 8.7 0.0 20 48 33 62 17 65 0.85 # 15930 # 17825 # -1 # ID=27_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.632 27_16 - 632 Zeta_toxin PF06414.7 201 2.5e-06 25.0 0.1 2 2 5.7e-05 0.008 13.5 0.0 21 66 345 391 338 404 0.86 # 15930 # 17825 # -1 # ID=27_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.632 22_11 - 208 Zeta_toxin PF06414.7 201 4.6e-06 24.1 0.0 1 1 9.7e-08 1.4e-05 22.6 0.0 18 175 4 143 3 157 0.78 # 9448 # 10071 # 1 # ID=22_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.647 116_4 - 924 Zeta_toxin PF06414.7 201 8e-06 23.4 0.0 1 1 3.6e-06 0.0005 17.5 0.0 18 57 643 684 625 735 0.82 # 775 # 3546 # -1 # ID=116_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.648 18_6 - 195 Zeta_toxin PF06414.7 201 1.2e-05 22.8 0.0 1 1 1.1e-07 1.5e-05 22.4 0.0 8 62 5 57 1 103 0.74 # 4633 # 5217 # -1 # ID=18_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.656 14_40 - 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282 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00063 17.5 0.0 1 1 3.1e-06 0.00099 16.8 0.0 45 126 115 191 104 200 0.82 # 39356 # 40201 # -1 # ID=9_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.681 50_21 - 309 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.001 16.7 0.0 1 1 8.9e-06 0.0029 15.3 0.0 35 129 124 211 112 223 0.77 # 20316 # 21242 # -1 # ID=50_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.654 56_14 - 317 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0046 14.6 0.0 1 1 5.5e-05 0.018 12.7 0.0 110 151 188 230 114 243 0.75 # 10417 # 11367 # 1 # ID=56_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.679 4_37 - 366 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0049 14.6 0.0 1 1 3.1e-05 0.01 13.5 0.0 48 127 221 296 208 316 0.80 # 33535 # 34632 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.678 99_11 - 414 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0072 14.0 0.0 1 1 3.2e-05 0.01 13.5 0.0 33 129 2 98 1 143 0.70 # 12672 # 13913 # -1 # ID=99_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.589 18_37 - 229 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.012 13.2 0.0 1 1 5.5e-05 0.018 12.7 0.0 29 107 74 152 58 167 0.77 # 43148 # 43834 # 1 # ID=18_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.683 11_45 - 332 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.013 13.2 0.0 1 1 9e-05 0.029 12.0 0.0 41 118 146 215 133 246 0.84 # 43336 # 44331 # 1 # ID=11_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.668 18_18 - 257 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.04 11.6 0.1 1 1 0.00019 0.06 11.0 0.1 32 119 5 89 2 94 0.82 # 23276 # 24046 # -1 # ID=18_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.658 12_42 - 328 IPPT PF01715.12 253 4.4e-81 269.9 0.0 1 1 1.1e-84 5.2e-81 269.7 0.0 2 252 42 300 41 301 0.96 # 36680 # 37663 # -1 # ID=12_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.666 1_155 - 475 tRNA-synt_1e PF01406.14 301 2.3e-113 376.6 0.0 1 1 3.7e-116 2.8e-113 376.3 0.0 4 301 18 315 15 315 0.98 # 167661 # 169085 # 1 # ID=1_155;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 44_12 - 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924 TIP49 PF06068.8 398 0.019 12.0 0.0 2 2 0.0022 0.72 6.8 0.0 52 87 643 679 609 686 0.80 # 775 # 3546 # -1 # ID=116_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.648 54_9 - 234 TIP49 PF06068.8 398 0.035 11.1 0.1 1 2 0.0044 1.4 5.8 0.1 53 72 44 63 29 80 0.82 # 6687 # 7388 # -1 # ID=54_9;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.675 54_9 - 234 TIP49 PF06068.8 398 0.035 11.1 0.1 2 2 0.027 8.6 3.2 0.0 351 382 165 196 143 206 0.84 # 6687 # 7388 # -1 # ID=54_9;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.675 95_7 - 824 TIP49 PF06068.8 398 0.085 9.8 3.3 1 2 0.0012 0.39 7.6 0.1 45 77 345 377 336 387 0.84 # 7954 # 10425 # -1 # ID=95_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.625 95_7 - 824 TIP49 PF06068.8 398 0.085 9.8 3.3 2 2 0.056 18 2.2 0.0 330 359 476 505 466 541 0.77 # 7954 # 10425 # -1 # ID=95_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.625 11_34 - 277 Adeno_IVa2 PF02456.10 370 0.0025 14.8 0.0 1 2 1.7e-06 0.0079 13.1 0.0 61 107 28 75 12 87 0.76 # 30734 # 31564 # 1 # ID=11_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.609 11_34 - 277 Adeno_IVa2 PF02456.10 370 0.0025 14.8 0.0 2 2 0.05 2.2e+02 -1.5 0.0 235 246 221 232 213 239 0.84 # 30734 # 31564 # 1 # ID=11_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.609 2_30 - 293 EF_TS PF00889.14 221 1.5e-70 235.2 7.0 1 1 4.1e-74 1.9e-70 234.9 7.0 1 221 56 272 56 272 0.97 # 34518 # 35396 # 1 # ID=2_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.633 45_20 - 120 Ribosomal_L18p PF00861.17 119 7.4e-31 105.1 5.2 1 1 1.9e-34 8.6e-31 104.9 5.2 6 119 8 119 4 119 0.93 # 9812 # 10171 # 1 # ID=45_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 21_5 - 465 NAD_binding_9 PF13454.1 156 8.1e-32 108.4 3.1 1 1 1.6e-33 3.5e-31 106.4 0.2 1 155 13 164 13 165 0.91 # 3590 # 4984 # 1 # ID=21_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.685 159_3 - 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905 Plug PF07715.10 108 1.2e-14 52.8 4.7 1 1 2.5e-16 2.6e-14 51.7 1.8 4 108 54 165 51 165 0.91 # 59292 # 62006 # 1 # ID=5_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.607 83_10 - 243 Plug PF07715.10 108 1.3e-14 52.7 0.1 1 1 1.8e-16 1.9e-14 52.2 0.1 3 103 20 114 18 117 0.89 # 10403 # 11131 # 1 # ID=83_10;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.658 89_10 - 886 Plug PF07715.10 108 1.9e-14 52.2 1.7 1 1 5.5e-16 5.6e-14 50.7 1.7 2 108 74 179 73 179 0.92 # 13209 # 15866 # -1 # ID=89_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.672 96_9 - 978 Plug PF07715.10 108 2.3e-14 51.9 6.0 1 1 2.4e-16 2.5e-14 51.8 0.4 4 104 74 180 71 185 0.90 # 7586 # 10519 # 1 # ID=96_9;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.635 119_2 - 626 Plug PF07715.10 108 3.1e-14 51.5 0.2 1 1 2.7e-15 2.7e-13 48.4 0.0 2 106 56 166 55 167 0.85 # 106 # 1983 # -1 # ID=119_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.630 69_7 - 767 Plug PF07715.10 108 1.3e-12 46.3 1.9 1 1 3.9e-14 4e-12 44.7 1.9 6 93 50 145 47 161 0.78 # 8060 # 10360 # 1 # ID=69_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.626 40_19 - 778 Plug PF07715.10 108 2.2e-11 42.3 0.8 1 1 5.6e-13 5.8e-11 41.0 0.8 5 98 64 165 61 176 0.81 # 18294 # 20627 # -1 # ID=40_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.631 63_4 - 739 Plug PF07715.10 108 2.5e-11 42.2 0.3 1 1 9.7e-13 1e-10 40.2 0.1 3 108 53 162 51 162 0.92 # 2257 # 4473 # 1 # ID=63_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.631 120_9 - 927 Plug PF07715.10 108 5.2e-11 41.1 0.4 1 1 5.1e-13 5.2e-11 41.1 0.4 6 89 66 158 62 176 0.81 # 6972 # 9752 # 1 # ID=120_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 33_9 - 1060 Plug PF07715.10 108 1.4e-10 39.7 3.1 1 1 1.4e-12 1.4e-10 39.7 3.1 7 108 132 235 127 235 0.83 # 8237 # 11416 # 1 # ID=33_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.632 91_14 - 777 Plug PF07715.10 108 1.5e-10 39.6 4.2 1 1 1.8e-12 1.9e-10 39.3 1.3 2 94 79 174 78 188 0.84 # 9925 # 12255 # -1 # ID=91_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.628 37_13 - 1037 Plug PF07715.10 108 2.3e-10 39.1 2.8 1 1 9.3e-12 9.5e-10 37.1 2.8 4 108 150 250 148 250 0.89 # 15101 # 18211 # 1 # ID=37_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 2_145 - 187 Plug PF07715.10 108 5.2e-10 37.9 0.2 1 1 9e-12 9.3e-10 37.1 0.2 2 86 84 167 83 172 0.91 # 157036 # 157596 # 1 # ID=2_145;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.679 80_4 - 72 Plug PF07715.10 108 7.7e-09 34.1 0.1 1 1 8.7e-11 8.9e-09 33.9 0.1 11 70 3 67 1 70 0.89 # 764 # 979 # -1 # ID=80_4;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.616 13_33 - 721 Plug PF07715.10 108 4.5e-08 31.7 0.4 1 1 9.1e-10 9.3e-08 30.7 0.4 3 107 62 159 60 160 0.94 # 44241 # 46403 # -1 # ID=13_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.656 45_31 - 708 Plug PF07715.10 108 4.1e-06 25.4 0.1 1 1 1e-07 1.1e-05 24.0 0.1 7 106 57 150 53 152 0.90 # 17680 # 19803 # -1 # ID=45_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.623 80_3 - 96 Plug PF07715.10 108 4.6e-06 25.2 0.3 1 1 8.9e-08 9.1e-06 24.2 0.3 86 108 1 23 1 23 0.96 # 428 # 715 # -1 # ID=80_3;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.649 35_35 - 1065 Plug PF07715.10 108 0.00011 20.8 1.5 1 1 1e-06 0.00011 20.8 1.5 10 107 145 244 138 245 0.86 # 35017 # 38211 # 1 # ID=35_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.563 48_6 - 1044 PIF1 PF05970.9 364 1.6e-05 22.3 0.0 1 2 1.6e-05 0.018 12.2 0.0 18 55 312 350 296 368 0.76 # 8090 # 11221 # 1 # ID=48_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 48_6 - 1044 PIF1 PF05970.9 364 1.6e-05 22.3 0.0 2 2 0.00041 0.47 7.6 0.1 143 163 762 782 757 789 0.89 # 8090 # 11221 # 1 # ID=48_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.590 59_24 - 699 PIF1 PF05970.9 364 0.0017 15.6 0.0 1 1 2.6e-06 0.0029 14.9 0.0 6 127 21 144 19 150 0.81 # 21807 # 23903 # -1 # ID=59_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.662 80_18 - 229 PIF1 PF05970.9 364 0.0044 14.3 0.0 1 1 5.6e-06 0.0063 13.8 0.0 19 54 27 62 16 64 0.81 # 14030 # 14716 # -1 # ID=80_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.648 33_37 - 718 PIF1 PF05970.9 364 0.0091 13.2 0.0 1 1 1.1e-05 0.012 12.8 0.0 1 59 279 337 279 410 0.82 # 32737 # 34890 # 1 # ID=33_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.663 27_4 - 240 Methyltransf_23 PF13489.1 161 5e-28 96.1 0.0 1 1 4.3e-30 6.4e-28 95.8 0.0 20 159 53 208 28 210 0.83 # 3662 # 4381 # -1 # ID=27_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.647 77_4 - 285 Methyltransf_23 PF13489.1 161 9.5e-19 65.9 0.0 1 1 8.1e-21 1.2e-18 65.6 0.0 2 159 56 232 55 234 0.79 # 2844 # 3698 # 1 # ID=77_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.615 2_77 - 357 Methyltransf_23 PF13489.1 161 1.3e-16 59.0 0.0 1 1 1.3e-18 2e-16 58.4 0.0 6 131 116 254 111 307 0.79 # 86083 # 87153 # 1 # ID=2_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.650 34_16 - 262 Methyltransf_23 PF13489.1 161 8.7e-15 53.1 0.0 1 1 8.8e-17 1.3e-14 52.5 0.0 9 159 40 199 33 201 0.85 # 23642 # 24427 # -1 # ID=34_16;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.631 26_13 - 295 Methyltransf_23 PF13489.1 161 2.1e-14 51.9 0.0 1 1 2.3e-16 3.4e-14 51.1 0.0 5 148 31 181 23 191 0.71 # 13028 # 13912 # 1 # ID=26_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.698 11_45 - 332 Methyltransf_23 PF13489.1 161 2.2e-14 51.7 0.0 1 1 2.3e-16 3.5e-14 51.1 0.0 11 159 136 285 122 287 0.79 # 43336 # 44331 # 1 # ID=11_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.668 31_31 - 294 Methyltransf_23 PF13489.1 161 1.7e-12 45.6 0.0 1 1 1.5e-14 2.3e-12 45.2 0.0 23 118 42 151 17 199 0.83 # 30488 # 31369 # 1 # ID=31_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.654 97_9 - 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