# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 55_6 - 162 UPF0054 PF02130.12 145 4.1e-43 144.3 0.0 1 1 1.2e-46 4.8e-43 144.1 0.0 21 145 29 152 16 152 0.89 # 6080 # 6565 # -1 # ID=55_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.665 33_12 - 691 Sulfotransfer_3 PF13469.1 215 4.8e-07 29.0 7.6 1 1 2.3e-10 4.8e-07 29.0 7.6 34 206 472 640 445 681 0.77 # 13337 # 15409 # -1 # ID=33_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.708 92_8 - 201 Sulfotransfer_3 PF13469.1 215 0.034 13.2 5.7 1 1 3.1e-05 0.064 12.3 5.6 58 208 13 145 2 192 0.51 # 7531 # 8133 # 1 # ID=92_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.617 73_3 - 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639 MobB PF03205.9 140 0.00086 17.2 0.1 2 2 0.0077 0.84 7.5 0.0 2 24 360 382 359 389 0.88 # 82157 # 84073 # 1 # ID=1_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.667 71_9 - 535 MobB PF03205.9 140 0.0011 16.8 0.9 1 1 2.8e-05 0.003 15.4 0.9 2 31 330 359 329 398 0.92 # 8754 # 10358 # 1 # ID=71_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.708 14_28 - 659 MobB PF03205.9 140 0.0012 16.7 0.0 1 2 0.052 5.6 4.8 0.0 3 21 55 73 53 97 0.89 # 31875 # 33851 # 1 # ID=14_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.659 14_28 - 659 MobB PF03205.9 140 0.0012 16.7 0.0 2 2 0.0023 0.25 9.2 0.0 2 34 490 522 489 570 0.79 # 31875 # 33851 # 1 # ID=14_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.659 38_22 - 989 MobB PF03205.9 140 0.003 15.4 0.1 1 1 0.0021 0.23 9.3 0.0 4 32 639 667 637 677 0.86 # 29562 # 32528 # 1 # ID=38_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.641 1_33 - 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248 Methyltransf_24 PF13578.1 106 0.018 14.0 0.0 1 1 0.0001 0.035 13.1 0.0 37 103 84 166 50 167 0.72 # 40915 # 41658 # -1 # ID=36_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.691 52_20 - 122 Methyltransf_24 PF13578.1 106 0.022 13.8 0.0 1 1 8.2e-05 0.028 13.4 0.0 19 81 20 95 7 102 0.73 # 29665 # 30030 # -1 # ID=52_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.689 8_75 - 432 Methyltransf_24 PF13578.1 106 0.027 13.4 0.3 1 1 0.00061 0.21 10.6 0.2 1 66 204 266 204 331 0.66 # 82490 # 83785 # -1 # ID=8_75;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.665 10_72 - 334 Methyltransf_24 PF13578.1 106 0.034 13.2 0.1 1 1 0.0017 0.6 9.1 0.0 41 74 123 156 62 157 0.85 # 71482 # 72483 # -1 # ID=10_72;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.664 148_1 - 313 Zeta_toxin PF06414.7 201 3.8e-56 187.5 0.0 1 1 4e-58 5e-56 187.1 0.0 6 200 28 217 18 218 0.94 # 3 # 941 # -1 # ID=148_1;partial=10;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.600 82_1 - 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499 Zeta_toxin PF06414.7 201 8.2e-06 23.2 0.0 2 2 0.0088 1.1 6.4 0.0 18 51 269 304 265 306 0.76 # 10926 # 12422 # 1 # ID=3_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.639 50_22 - 180 Zeta_toxin PF06414.7 201 1.2e-05 22.6 0.0 1 1 1.3e-07 1.6e-05 22.3 0.0 8 62 5 57 1 93 0.73 # 27226 # 27765 # -1 # ID=50_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.676 3_74 - 647 Zeta_toxin PF06414.7 201 6.2e-05 20.3 0.3 1 1 2.7e-06 0.00034 17.9 0.0 14 56 196 237 184 258 0.83 # 69795 # 71735 # 1 # ID=3_74;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.631 83_14 - 205 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00015 19.1 0.0 1 1 1.8e-06 0.00022 18.5 0.0 12 50 19 58 9 63 0.86 # 15985 # 16599 # -1 # ID=83_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.654 1_33 - 862 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0002 18.7 0.0 1 2 0.097 12 3.0 0.0 15 40 198 223 184 228 0.77 # 40644 # 43229 # 1 # ID=1_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 1_33 - 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301 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 0.017 12.1 0.1 1 1 8.6e-05 0.022 11.8 0.1 47 116 52 126 4 132 0.68 # 9565 # 10467 # 1 # ID=63_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 73_20 - 297 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 0.057 10.4 0.0 1 1 0.00039 0.1 9.6 0.0 1 23 3 25 3 37 0.82 # 19127 # 20017 # 1 # ID=73_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.707 51_24 - 119 Ribosomal_S13 PF00416.17 107 5.9e-36 121.3 0.2 1 1 3.2e-39 6.7e-36 121.2 0.2 1 107 3 108 3 108 0.99 # 12096 # 12452 # 1 # ID=51_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.619 1_79 - 195 Ribosomal_S13 PF00416.17 107 0.00046 18.8 0.1 1 2 0.00033 0.68 8.6 0.0 9 43 67 101 62 108 0.89 # 104649 # 105233 # 1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.692 1_79 - 195 Ribosomal_S13 PF00416.17 107 0.00046 18.8 0.1 2 2 0.00051 1.1 8.0 0.0 15 34 108 127 103 136 0.88 # 104649 # 105233 # 1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.692 22_3 - 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299 MMR_HSR1 PF01926.18 116 6.8e-23 79.0 0.0 1 1 9e-25 1e-22 78.5 0.0 2 116 12 126 11 126 0.84 # 26569 # 27465 # 1 # ID=8_19;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.657 15_51 - 447 MMR_HSR1 PF01926.18 116 2.6e-22 77.1 0.0 1 1 4e-24 4.4e-22 76.4 0.0 2 94 219 310 218 337 0.86 # 59740 # 61080 # 1 # ID=15_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.658 3_78 - 440 MMR_HSR1 PF01926.18 116 3.9e-21 73.3 0.0 1 1 7.8e-23 8.7e-21 72.2 0.0 1 116 200 318 200 318 0.82 # 74300 # 75619 # 1 # ID=3_78;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.658 38_19 - 351 MMR_HSR1 PF01926.18 116 4.6e-21 73.1 0.0 1 1 6.1e-23 6.8e-21 72.5 0.0 1 116 161 288 161 288 0.83 # 27373 # 28425 # -1 # ID=38_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.655 10_2 - 364 MMR_HSR1 PF01926.18 116 1.8e-19 67.9 0.0 1 1 2.9e-21 3.2e-19 67.1 0.0 1 92 4 112 4 207 0.82 # 1073 # 2164 # -1 # ID=10_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 25_12 - 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847 Plug PF07715.10 108 1.4e-16 58.9 1.5 1 1 6.2e-18 3.7e-16 57.5 1.5 2 108 56 164 55 164 0.96 # 77031 # 79571 # 1 # ID=3_80;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.644 57_1 - 1034 Plug PF07715.10 108 1.5e-16 58.9 0.7 1 1 2.4e-18 1.5e-16 58.9 0.7 2 108 71 179 70 179 0.93 # 137 # 3238 # -1 # ID=57_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 63_19 - 713 Plug PF07715.10 108 1.5e-16 58.8 1.3 1 1 5.5e-18 3.4e-16 57.7 0.2 2 108 64 167 63 167 0.94 # 17870 # 20008 # 1 # ID=63_19;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.667 1_110 - 879 Plug PF07715.10 108 2.5e-16 58.1 0.1 1 1 1.2e-17 7.5e-16 56.6 0.1 2 108 52 162 51 162 0.95 # 137940 # 140576 # -1 # ID=1_110;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.632 18_2 - 1004 Plug PF07715.10 108 2.7e-16 58.0 1.3 1 1 1.8e-17 1.1e-15 56.0 1.3 2 100 69 172 68 180 0.90 # 1046 # 4057 # 1 # ID=18_2;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.647 130_1 - 898 Plug PF07715.10 108 3.5e-16 57.6 0.3 1 1 1.7e-17 1e-15 56.2 0.3 2 108 17 135 16 135 0.96 # 121 # 2814 # 1 # ID=130_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.631 95_6 - 1067 Plug PF07715.10 108 7e-16 56.7 1.1 1 1 5.6e-17 3.4e-15 54.4 1.1 6 107 75 182 70 183 0.93 # 6349 # 9549 # 1 # ID=95_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.633 81_5 - 1052 Plug PF07715.10 108 1e-15 56.2 1.0 1 1 5.4e-17 3.3e-15 54.5 1.0 2 107 67 185 66 186 0.93 # 5388 # 8543 # 1 # ID=81_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.638 61_22 - 683 Plug PF07715.10 108 1.1e-15 56.0 0.7 1 1 4.2e-17 2.5e-15 54.9 0.7 5 107 48 154 44 155 0.96 # 21498 # 23546 # 1 # ID=61_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.636 131_2 - 888 Plug PF07715.10 108 1.9e-15 55.3 1.4 1 1 7.9e-17 4.8e-15 54.0 1.4 2 108 76 181 75 181 0.94 # 205 # 2868 # 1 # ID=131_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.688 14_38 - 979 Plug PF07715.10 108 3.1e-15 54.6 1.5 1 1 1.9e-16 1.1e-14 52.8 1.5 2 106 61 171 60 174 0.90 # 52133 # 55069 # 1 # ID=14_38;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.619 109_2 - 921 Plug PF07715.10 108 5.7e-15 53.7 2.8 1 1 1.8e-16 1.1e-14 52.9 0.9 2 106 65 168 64 170 0.95 # 1120 # 3882 # -1 # ID=109_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.645 83_7 - 905 Plug PF07715.10 108 7.9e-15 53.3 4.0 1 1 2.2e-16 1.3e-14 52.6 1.7 4 108 54 165 51 165 0.90 # 6873 # 9587 # -1 # ID=83_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.632 53_18 - 981 Plug PF07715.10 108 1.1e-14 52.8 7.1 1 1 2.2e-16 1.3e-14 52.6 0.6 3 104 76 183 74 188 0.90 # 23857 # 26799 # 1 # ID=53_18;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.654 13_10 - 914 Plug PF07715.10 108 2.7e-14 51.6 0.3 1 1 4.4e-16 2.7e-14 51.6 0.3 3 108 66 177 64 177 0.92 # 18436 # 21177 # -1 # ID=13_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.606 25_24 - 899 Plug PF07715.10 108 2.8e-14 51.5 0.3 1 1 4.5e-16 2.8e-14 51.5 0.3 2 108 101 213 100 213 0.96 # 29726 # 32422 # -1 # ID=25_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.626 26_19 - 793 Plug PF07715.10 108 6.6e-14 50.3 0.0 1 1 4.6e-15 2.8e-13 48.3 0.0 2 106 55 165 54 166 0.86 # 19946 # 22324 # 1 # ID=26_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 1_68 - 803 Plug PF07715.10 108 8.8e-14 49.9 2.3 1 1 1.5e-15 8.8e-14 49.9 2.3 4 102 62 170 60 177 0.86 # 90403 # 92811 # -1 # ID=1_68;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.665 33_35 - 739 Plug PF07715.10 108 1.9e-13 48.8 0.9 1 1 3.7e-14 2.2e-12 45.4 0.3 2 103 65 158 64 163 0.93 # 40783 # 42999 # -1 # ID=33_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.659 4_37 - 892 Plug PF07715.10 108 2e-13 48.8 0.8 1 1 3.3e-15 2e-13 48.8 0.8 9 108 82 176 74 176 0.94 # 49912 # 52587 # -1 # ID=4_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.643 105_2 - 1039 Plug PF07715.10 108 7.1e-13 47.0 3.2 1 1 1.2e-14 7.1e-13 47.0 3.2 5 108 73 192 71 192 0.94 # 1822 # 4938 # -1 # ID=105_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 3_108 - 845 Plug PF07715.10 108 8.1e-13 46.8 2.0 1 1 1.3e-14 8.1e-13 46.8 2.0 2 107 78 179 77 180 0.90 # 110181 # 112715 # 1 # ID=3_108;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.612 15_54 - 772 Plug PF07715.10 108 8.4e-13 46.8 1.8 1 1 1.4e-14 8.4e-13 46.8 1.8 6 93 55 150 52 166 0.79 # 66034 # 68349 # 1 # ID=15_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.638 8_3 - 895 Plug PF07715.10 108 9.9e-13 46.5 0.3 1 1 5.2e-14 3.1e-12 44.9 0.3 6 101 85 178 80 185 0.89 # 5322 # 8006 # -1 # ID=8_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 42_30 - 790 Plug PF07715.10 108 1.2e-12 46.3 0.3 1 1 2e-14 1.2e-12 46.3 0.3 2 108 78 189 77 189 0.94 # 35412 # 37781 # -1 # ID=42_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.654 95_5 - 923 Plug PF07715.10 108 5.4e-12 44.2 0.5 1 1 3.4e-13 2.1e-11 42.3 0.5 6 106 66 174 62 176 0.82 # 3402 # 6170 # 1 # ID=95_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.653 5_13 - 775 Plug PF07715.10 108 5.8e-12 44.1 1.0 1 1 2.9e-13 1.7e-11 42.5 1.0 5 98 61 162 58 173 0.81 # 12567 # 14891 # -1 # ID=5_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.644 126_1 - 842 Plug PF07715.10 108 1.4e-11 42.8 0.3 1 1 7.2e-13 4.4e-11 41.2 0.3 3 106 69 176 67 178 0.89 # 7 # 2532 # -1 # ID=126_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.652 5_94 - 739 Plug PF07715.10 108 1.8e-11 42.5 0.1 1 1 1.1e-12 6.4e-11 40.7 0.1 3 108 53 162 51 162 0.92 # 99220 # 101436 # 1 # ID=5_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 25_43 - 885 Plug PF07715.10 108 1.9e-11 42.4 1.2 1 1 2.5e-12 1.5e-10 39.5 0.1 5 108 70 168 66 168 0.92 # 51384 # 54038 # -1 # ID=25_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.635 3_107 - 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