# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 4_16 - 162 UPF0054 PF02130.12 145 1.5e-42 142.7 0.0 1 1 7.1e-46 1.7e-42 142.5 0.0 21 145 29 152 16 152 0.89 # 17622 # 18107 # -1 # ID=4_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.636 134_4 - 132 UPF0054 PF02130.12 145 0.0017 16.0 0.1 1 1 7.6e-07 0.0019 15.9 0.1 82 126 50 94 18 114 0.75 # 1514 # 1909 # -1 # ID=134_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.672 47_19 - 530 Sulfotransfer_3 PF13469.1 215 9.6e-17 60.7 3.0 1 1 5.9e-20 9.6e-17 60.7 3.0 1 212 282 470 282 473 0.67 # 26408 # 27997 # 1 # ID=47_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=3Base/5BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.657 25_39 - 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599 Helicase_C PF00271.26 78 7e-18 62.7 0.0 1 1 7.8e-19 2.1e-16 57.9 0.0 2 78 247 323 246 323 0.97 # 7036 # 8832 # -1 # ID=23_11;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.652 13_65 - 674 Helicase_C PF00271.26 78 3.7e-16 57.1 0.0 1 1 3e-18 8.1e-16 56.1 0.0 2 76 465 544 464 545 0.97 # 70311 # 72332 # 1 # ID=13_65;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.601 62_8 - 1155 Helicase_C PF00271.26 78 7.8e-16 56.1 0.2 1 1 8.5e-18 2.3e-15 54.6 0.2 8 77 844 914 840 915 0.95 # 9051 # 12515 # -1 # ID=62_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.656 100_5 - 834 Helicase_C PF00271.26 78 6.1e-14 50.0 0.0 1 1 5.1e-16 1.4e-13 48.9 0.0 7 77 241 329 237 330 0.94 # 2648 # 5149 # 1 # ID=100_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.702 44_23 - 832 Helicase_C PF00271.26 78 2.2e-13 48.2 0.0 1 1 5.7e-15 1.5e-12 45.5 0.0 12 77 347 412 340 413 0.93 # 29943 # 32438 # -1 # ID=44_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.655 1_127 - 834 Helicase_C PF00271.26 78 9.7e-11 39.8 0.0 1 1 8.8e-13 2.4e-10 38.5 0.0 11 76 307 371 304 373 0.95 # 132829 # 135330 # 1 # ID=1_127;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.671 23_13 - 1374 Helicase_C PF00271.26 78 1.7e-10 39.0 0.1 1 1 1.7e-12 4.6e-10 37.6 0.1 5 77 327 415 323 416 0.94 # 9963 # 14084 # 1 # ID=23_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.665 21_17 - 741 Helicase_C PF00271.26 78 1.2e-08 33.1 0.0 1 2 0.022 6 5.2 0.0 4 43 266 305 263 307 0.90 # 15144 # 17366 # -1 # ID=21_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.704 21_17 - 741 Helicase_C PF00271.26 78 1.2e-08 33.1 0.0 2 2 1.1e-08 2.9e-06 25.4 0.1 9 77 510 591 504 592 0.76 # 15144 # 17366 # -1 # ID=21_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.704 32_5 - 1184 Helicase_C PF00271.26 78 1.4e-06 26.5 0.7 1 1 3.6e-08 9.7e-06 23.8 0.2 8 76 781 848 777 850 0.91 # 4872 # 8423 # -1 # ID=32_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.661 2_76 - 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282 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.00076 17.8 0.0 1 1 9.5e-06 0.0012 17.2 0.0 2 58 49 117 48 236 0.73 # 36979 # 37824 # 1 # ID=16_34;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.665 37_29 - 442 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.0017 16.7 0.0 1 1 2.4e-05 0.003 15.9 0.0 3 91 15 147 13 219 0.76 # 29557 # 30882 # 1 # ID=37_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.667 50_17 - 989 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.0023 16.3 0.0 1 1 0.0021 0.27 9.6 0.0 3 20 639 656 637 693 0.73 # 20704 # 23670 # 1 # ID=50_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.633 12_40 - 455 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.0045 15.3 0.1 1 1 8.2e-05 0.01 14.2 0.1 2 88 73 189 72 222 0.52 # 42896 # 44260 # -1 # ID=12_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.569 121_7 - 265 MMR_HSR1 PF01926.18 116 0.0049 15.2 0.0 1 1 7.5e-05 0.0093 14.3 0.0 3 22 38 57 36 86 0.89 # 3774 # 4568 # -1 # ID=121_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.687 15_27 - 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234 TIP49 PF06068.8 398 0.038 11.1 0.1 1 2 0.0044 1.5 5.8 0.1 53 72 44 63 29 80 0.82 # 19481 # 20182 # -1 # ID=26_25;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.681 26_25 - 234 TIP49 PF06068.8 398 0.038 11.1 0.1 2 2 0.027 9.2 3.2 0.0 351 382 165 196 143 206 0.84 # 19481 # 20182 # -1 # ID=26_25;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.681 94_6 - 824 TIP49 PF06068.8 398 0.058 10.5 3.0 1 2 0.0011 0.37 7.8 0.0 45 77 345 377 336 387 0.85 # 4647 # 7118 # 1 # ID=94_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 94_6 - 824 TIP49 PF06068.8 398 0.058 10.5 3.0 2 2 0.056 19 2.2 0.0 330 359 476 505 466 541 0.77 # 4647 # 7118 # 1 # ID=94_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.627 11_52 - 277 Adeno_IVa2 PF02456.10 370 0.0025 14.9 0.0 1 2 1.6e-06 0.008 13.2 0.0 61 107 28 75 12 88 0.76 # 53365 # 54195 # 1 # ID=11_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 11_52 - 277 Adeno_IVa2 PF02456.10 370 0.0025 14.9 0.0 2 2 0.05 2.4e+02 -1.5 0.0 235 246 221 232 213 239 0.84 # 53365 # 54195 # 1 # ID=11_52;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.604 1_41 - 293 EF_TS PF00889.14 221 1.1e-70 235.8 6.8 1 1 2.7e-74 1.3e-70 235.5 6.8 1 221 56 272 56 272 0.97 # 45351 # 46229 # 1 # ID=1_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.629 57_21 - 120 Ribosomal_L18p PF00861.17 119 2.5e-31 106.7 5.2 1 1 6.1e-35 3e-31 106.5 5.2 6 119 8 119 4 119 0.93 # 17839 # 18198 # -1 # ID=57_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 19_12 - 465 NAD_binding_9 PF13454.1 156 1.4e-32 111.0 2.1 1 1 4.1e-34 9.4e-32 108.3 0.1 1 155 13 164 13 165 0.91 # 13530 # 14924 # -1 # ID=19_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.682 128_5 - 470 NAD_binding_9 PF13454.1 156 8.2e-24 82.5 4.2 1 2 3.6e-25 8.3e-23 79.3 0.1 2 155 7 149 6 150 0.91 # 2438 # 3847 # 1 # ID=128_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.687 128_5 - 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550 NAD_binding_9 PF13454.1 156 0.0087 14.2 0.1 1 1 9.9e-05 0.023 12.8 0.1 3 37 26 58 24 65 0.86 # 11610 # 13259 # 1 # ID=12_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.642 4_89 - 394 NAD_binding_9 PF13454.1 156 0.014 13.6 3.4 1 1 0.00021 0.049 11.8 1.1 2 155 9 162 8 163 0.70 # 85266 # 86447 # -1 # ID=4_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.645 93_12 - 164 NAD_binding_9 PF13454.1 156 0.014 13.5 0.0 1 1 9.1e-05 0.021 13.0 0.0 1 42 9 48 9 76 0.87 # 13084 # 13575 # 1 # ID=93_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.628 1_82 - 417 NAD_binding_9 PF13454.1 156 0.015 13.4 1.5 1 2 0.0052 1.2 7.3 0.1 1 41 7 41 7 48 0.82 # 91691 # 92941 # 1 # ID=1_82;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.648 1_82 - 417 NAD_binding_9 PF13454.1 156 0.015 13.4 1.5 2 2 0.041 9.5 4.4 0.1 100 153 216 261 152 262 0.80 # 91691 # 92941 # 1 # ID=1_82;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.648 3_5 - 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