# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 2_123 - 162 UPF0054 PF02130.12 145 5.9e-43 143.9 0.0 1 1 3e-46 6.8e-43 143.7 0.0 21 145 29 152 16 152 0.89 # 118854 # 119339 # 1 # ID=2_123;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.632 30_28 - 132 UPF0054 PF02130.12 145 0.014 12.9 0.1 1 1 6.7e-06 0.015 12.9 0.1 82 126 50 94 18 114 0.74 # 33565 # 33960 # 1 # ID=30_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.667 53_18 - 534 Sulfotransfer_3 PF13469.1 215 6.1e-17 61.3 3.4 1 1 4e-20 6.1e-17 61.3 3.4 1 212 286 474 286 477 0.63 # 26289 # 27890 # 1 # ID=53_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.659 8_52 - 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911 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00031 18.2 0.0 1 1 0.0001 0.015 12.7 0.0 11 57 635 684 624 732 0.80 # 637 # 3369 # -1 # ID=83_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.678 1_134 - 328 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00037 17.9 0.0 1 1 4.8e-06 0.00069 17.1 0.0 11 49 2 39 1 43 0.93 # 133885 # 134868 # -1 # ID=1_134;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.668 13_45 - 761 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00052 17.5 0.0 1 1 6.1e-05 0.0087 13.5 0.0 19 58 494 541 480 582 0.81 # 44045 # 46327 # 1 # ID=13_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.622 39_9 - 558 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00055 17.4 0.3 1 1 1.3e-05 0.0018 15.7 0.2 14 42 346 375 336 392 0.79 # 6574 # 8247 # -1 # ID=39_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.699 29_40 - 448 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0015 15.9 0.1 1 1 6.5e-05 0.0093 13.4 0.0 15 53 46 83 35 133 0.85 # 46206 # 47549 # 1 # ID=29_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.615 43_28 - 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215 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.025 11.9 0.1 1 1 0.00026 0.037 11.4 0.1 18 51 39 73 35 84 0.89 # 79313 # 79957 # 1 # ID=1_79;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.682 47_19 - 346 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.027 11.8 0.0 1 1 0.00046 0.065 10.6 0.0 17 42 124 152 116 218 0.87 # 13576 # 14613 # 1 # ID=47_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.614 23_20 - 229 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.028 11.8 0.0 1 1 0.00031 0.044 11.2 0.0 17 43 31 58 18 68 0.80 # 24648 # 25334 # 1 # ID=23_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.656 63_22 - 181 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.03 11.7 0.0 1 1 0.00031 0.045 11.1 0.0 19 50 7 37 5 69 0.91 # 20185 # 20727 # 1 # ID=63_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.648 162_3 - 465 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.031 11.7 0.2 1 1 0.00052 0.074 10.4 0.1 18 42 101 125 98 135 0.88 # 631 # 2025 # 1 # ID=162_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.668 12_47 - 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357 Ubie_methyltran PF01209.13 233 0.05 11.0 0.0 1 1 0.00023 0.074 10.4 0.0 47 156 130 238 121 266 0.81 # 23134 # 24204 # 1 # ID=7_24;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.648 56_15 - 106 TIGR01079 TIGR01079 104 3.2e-32 109.0 5.8 1 1 7.9e-36 3.6e-32 108.9 5.8 2 103 3 102 2 103 0.97 # 7298 # 7615 # 1 # ID=56_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.610 56_18 - 133 Ribosomal_S8 PF00410.14 129 1.9e-46 155.4 0.0 1 1 4.7e-50 2.1e-46 155.2 0.0 1 128 5 131 5 132 0.99 # 8699 # 9097 # 1 # ID=56_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.589 25_38 - 724 UvrD_C PF13361.1 351 1.7e-95 318.7 0.0 1 1 2.5e-98 2.3e-95 318.3 0.0 2 350 274 616 273 617 0.97 # 46218 # 48389 # 1 # ID=25_38;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.654 30_6 - 659 UvrD_C PF13361.1 351 3.6e-83 278.2 0.0 1 1 1.2e-85 1.1e-82 276.6 0.0 1 350 269 603 269 604 0.93 # 5824 # 7800 # 1 # ID=30_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.631 44_15 - 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370 PGK PF00162.14 384 0.049 10.5 0.0 2 2 0.035 79 -0.1 0.0 237 306 232 297 222 348 0.69 # 101387 # 102496 # 1 # ID=3_105;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.680 2_60 - 247 KR PF08659.5 181 6e-28 96.0 0.4 1 1 5.5e-30 9.2e-28 95.4 0.4 3 168 6 171 5 185 0.89 # 56246 # 56986 # 1 # ID=2_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.638 87_2 - 254 KR PF08659.5 181 2.5e-26 90.7 7.7 1 1 2.3e-28 3.9e-26 90.1 7.7 4 174 19 190 17 199 0.87 # 496 # 1257 # -1 # ID=87_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.640 11_21 - 247 KR PF08659.5 181 3.9e-19 67.3 1.4 1 1 3.1e-21 5.2e-19 66.9 1.4 5 172 8 177 5 188 0.91 # 24796 # 25536 # -1 # ID=11_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.628 10_40 - 248 KR PF08659.5 181 7e-17 60.0 5.1 1 1 5.8e-19 9.8e-17 59.5 4.3 3 165 10 170 9 189 0.81 # 39331 # 40074 # 1 # ID=10_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 18_2 - 267 KR PF08659.5 181 1.2e-14 52.6 0.6 1 1 1.1e-16 1.9e-14 52.0 0.6 4 161 9 166 7 181 0.84 # 439 # 1239 # -1 # ID=18_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.669 91_7 - 282 KR PF08659.5 181 1.3e-12 46.0 9.5 1 1 1.3e-14 2.2e-12 45.3 9.5 3 166 9 176 8 191 0.86 # 6871 # 7716 # -1 # ID=91_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.686 13_6 - 258 KR PF08659.5 181 1.5e-12 45.9 3.3 1 1 1.3e-14 2.2e-12 45.3 3.3 3 177 18 190 17 193 0.83 # 3451 # 4224 # -1 # ID=13_6;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.616 4_113 - 252 KR PF08659.5 181 1.7e-12 45.6 4.4 1 1 1.3e-14 2.2e-12 45.3 4.4 2 166 4 166 3 184 0.85 # 115698 # 116453 # 1 # ID=4_113;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.669 1_19 - 253 KR PF08659.5 181 3.9e-12 44.5 6.8 1 1 3.4e-14 5.8e-12 43.9 6.8 3 162 4 160 3 173 0.90 # 15683 # 16441 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.672 4_27 - 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254 Epimerase PF01370.16 236 2.8e-08 31.8 1.1 1 1 4.3e-10 7e-08 30.5 1.1 1 194 18 217 18 236 0.74 # 496 # 1257 # -1 # ID=87_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.640 11_21 - 247 Epimerase PF01370.16 236 7.1e-07 27.2 0.1 1 1 7.3e-09 1.2e-06 26.4 0.1 2 121 7 146 6 213 0.79 # 24796 # 25536 # -1 # ID=11_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.628 50_10 - 256 Epimerase PF01370.16 236 7.7e-06 23.8 0.3 1 1 8.5e-08 1.4e-05 23.0 0.1 1 100 8 99 8 113 0.84 # 9026 # 9793 # 1 # ID=50_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.648 1_19 - 253 Epimerase PF01370.16 236 1.7e-05 22.6 0.6 1 1 1.6e-07 2.6e-05 22.1 0.3 1 80 4 90 4 141 0.78 # 15683 # 16441 # 1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.672 64_25 - 293 Epimerase PF01370.16 236 2e-05 22.4 1.8 1 1 3.1e-07 5e-05 21.1 0.3 1 72 8 78 8 129 0.74 # 23092 # 23970 # 1 # ID=64_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.687 4_113 - 252 Epimerase PF01370.16 236 5e-05 21.1 0.2 1 1 4.1e-07 6.6e-05 20.7 0.2 1 121 5 142 5 160 0.71 # 115698 # 116453 # 1 # ID=4_113;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.669 18_2 - 267 Epimerase PF01370.16 236 6.6e-05 20.7 0.0 1 1 9.3e-07 0.00015 19.5 0.0 1 154 8 168 8 209 0.72 # 439 # 1239 # -1 # ID=18_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.669 60_8 - 270 Epimerase PF01370.16 236 0.00015 19.5 1.3 1 1 1.3e-06 0.00021 19.1 0.1 1 75 86 163 86 173 0.79 # 10188 # 10997 # 1 # ID=60_8;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.665 91_7 - 282 Epimerase PF01370.16 236 0.00021 19.1 0.8 1 1 2.3e-06 0.00038 18.3 0.8 2 160 10 179 9 239 0.77 # 6871 # 7716 # -1 # ID=91_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.686 4_27 - 259 Epimerase PF01370.16 236 0.00039 18.2 0.1 1 1 5.7e-06 0.00093 17.0 0.1 1 155 13 176 13 191 0.70 # 28562 # 29338 # -1 # ID=4_27;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.632 26_3 - 211 Epimerase PF01370.16 236 0.00078 17.2 0.0 1 1 6.9e-06 0.0011 16.7 0.0 1 116 3 110 3 119 0.79 # 1377 # 2009 # -1 # ID=26_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.654 13_5 - 251 Epimerase PF01370.16 236 0.00093 17.0 0.0 1 1 9.2e-06 0.0015 16.3 0.0 1 118 16 146 16 160 0.71 # 2702 # 3454 # -1 # ID=13_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.631 10_40 - 248 Epimerase PF01370.16 236 0.001 16.8 2.1 1 1 3.5e-05 0.0056 14.4 2.1 1 68 10 82 10 225 0.65 # 39331 # 40074 # 1 # ID=10_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 19_32 - 246 Epimerase PF01370.16 236 0.0014 16.3 0.4 1 1 2.2e-05 0.0036 15.1 0.4 1 91 8 103 8 184 0.63 # 39901 # 40638 # 1 # ID=19_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.678 8_78 - 438 Epimerase PF01370.16 236 0.0031 15.3 0.0 1 1 2.9e-05 0.0047 14.7 0.0 6 77 56 124 52 152 0.79 # 86325 # 87638 # 1 # ID=8_78;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.663 130_3 - 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739 Plug PF07715.10 108 2.2e-11 42.3 0.2 1 1 8.3e-13 8.2e-11 40.5 0.1 3 108 53 162 51 162 0.92 # 56701 # 58917 # 1 # ID=10_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.634 54_25 - 778 Plug PF07715.10 108 2.2e-11 42.3 0.8 1 1 5.9e-13 5.8e-11 41.0 0.8 5 98 64 165 61 176 0.81 # 23486 # 25819 # -1 # ID=54_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.629 46_20 - 1038 Plug PF07715.10 108 6.5e-11 40.8 2.8 1 1 3e-12 3e-10 38.7 2.8 4 108 151 251 149 251 0.89 # 16814 # 19927 # -1 # ID=46_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.602 14_57 - 777 Plug PF07715.10 108 2e-10 39.2 3.9 1 1 2.3e-12 2.3e-10 39.0 1.1 3 94 80 174 78 188 0.82 # 63036 # 65366 # -1 # ID=14_57;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.628 7_94 - 152 Plug PF07715.10 108 9e-09 33.9 0.9 1 1 1.9e-10 1.9e-08 32.9 0.9 2 69 84 149 83 151 0.93 # 94103 # 94558 # 1 # ID=7_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 12_5 - 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