# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 21_17 - 172 UPF0054 PF02130.12 145 8.1e-41 135.9 0.0 1 1 4.6e-44 9.6e-41 135.6 0.0 15 142 34 158 19 161 0.86 # 20478 # 20993 # 1 # ID=21_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.516 6_39 - 499 Mg_chelatase PF01078.16 207 2.7e-96 317.9 0.0 1 1 3.6e-98 5.4e-96 316.8 0.0 1 206 192 396 192 397 0.98 # 42859 # 44355 # -1 # ID=6_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.591 2_2 - 437 Mg_chelatase PF01078.16 207 1.1e-08 31.6 0.1 1 2 7.1e-09 1.1e-06 25.2 0.0 2 43 22 68 21 90 0.80 # 911 # 2221 # 1 # ID=2_2;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 2_2 - 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419 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 7.1e-09 33.0 0.3 1 2 1.1e-07 1.3e-05 22.3 0.3 1 35 2 36 2 53 0.88 # 60910 # 62166 # 1 # ID=7_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.548 7_49 - 419 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 7.1e-09 33.0 0.3 2 2 0.0019 0.22 8.5 0.0 62 124 195 259 141 275 0.74 # 60910 # 62166 # 1 # ID=7_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.548 12_39 - 395 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 1.6e-08 31.9 0.1 1 1 2.9e-10 3.3e-08 30.8 0.1 1 37 6 42 6 174 0.90 # 34881 # 36065 # 1 # ID=12_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.527 7_32 - 632 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 9.2e-07 26.1 0.6 1 1 2.1e-08 2.4e-06 24.7 0.6 1 63 11 92 11 174 0.64 # 41539 # 43434 # 1 # ID=7_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.579 2_83 - 438 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 1.6e-05 22.0 0.4 1 1 4.2e-07 4.9e-05 20.5 0.7 1 30 10 38 10 55 0.85 # 85695 # 87008 # 1 # ID=2_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.649 25_30 - 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304 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00034 17.2 0.0 1 1 6.9e-06 0.00096 15.8 0.0 39 129 132 216 125 232 0.78 # 1619 # 2530 # 1 # ID=4_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.461 2_28 - 368 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00064 16.3 0.0 1 1 8.5e-06 0.0012 15.5 0.0 34 124 179 262 171 276 0.79 # 27354 # 28457 # -1 # ID=2_28;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.556 26_15 - 327 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0011 15.6 0.0 1 1 1.2e-05 0.0017 15.0 0.0 45 124 6 82 2 140 0.83 # 17958 # 18938 # -1 # ID=26_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.403 1_146 - 599 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0013 15.3 0.1 1 1 0.00027 0.037 10.6 0.0 97 128 41 73 24 83 0.70 # 164840 # 166636 # 1 # ID=1_146;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.461 22_26 - 645 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0014 15.2 0.1 1 1 0.00024 0.033 10.7 0.0 100 128 108 137 81 145 0.65 # 25526 # 27460 # 1 # ID=22_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.498 4_40 - 251 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0022 14.6 0.0 1 1 2.1e-05 0.0029 14.2 0.0 69 130 109 177 75 214 0.71 # 47296 # 48048 # -1 # ID=4_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.604 3_12 - 217 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0057 13.2 0.0 1 2 0.009 1.3 5.6 0.0 106 125 12 31 2 38 0.72 # 11100 # 11750 # 1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.327 3_12 - 217 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0057 13.2 0.0 2 2 0.0094 1.3 5.5 0.0 19 59 132 171 124 205 0.76 # 11100 # 11750 # 1 # ID=3_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.327 7_35 - 208 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0087 12.7 0.0 1 1 8.4e-05 0.012 12.2 0.0 44 101 70 126 38 145 0.81 # 45946 # 46569 # -1 # ID=7_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.567 1_37 - 728 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.009 12.6 0.1 1 1 0.00023 0.032 10.8 0.0 75 128 202 254 198 282 0.80 # 35260 # 37443 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.364 3_112 - 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930 tRNA-synt_1e PF01406.14 301 8.3e-10 35.4 0.0 2 2 3e-09 1.1e-06 25.2 0.0 237 300 589 652 576 653 0.86 # 15763 # 18552 # 1 # ID=11_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.551 20_18 - 686 tRNA-synt_1e PF01406.14 301 1.4e-07 28.1 0.9 1 2 0.0027 0.94 5.7 0.0 21 93 16 88 3 114 0.86 # 20875 # 22932 # 1 # ID=20_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.540 20_18 - 686 tRNA-synt_1e PF01406.14 301 1.4e-07 28.1 0.9 2 2 1e-07 3.6e-05 20.2 0.0 244 283 330 370 295 386 0.82 # 20875 # 22932 # 1 # ID=20_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.540 10_42 - 879 tRNA-synt_1e PF01406.14 301 5.4e-05 19.6 0.0 1 2 0.00044 0.15 8.3 0.0 21 49 48 76 29 170 0.78 # 44383 # 47019 # -1 # ID=10_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.569 10_42 - 879 tRNA-synt_1e PF01406.14 301 5.4e-05 19.6 0.0 2 2 0.00025 0.087 9.1 0.0 250 297 633 681 625 685 0.80 # 44383 # 47019 # -1 # ID=10_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.569 7_51 - 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190 Methyltransf_9 PF08003.6 315 0.021 10.7 0.0 1 1 4e-05 0.028 10.3 0.0 112 188 50 127 40 129 0.95 # 917 # 1486 # -1 # ID=29_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.539 26_13 - 359 NAD_binding_4 PF07993.7 249 9.6e-17 57.9 0.0 1 2 3.7e-05 0.013 11.6 0.0 1 23 11 33 11 55 0.89 # 15825 # 16901 # -1 # ID=26_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.513 26_13 - 359 NAD_binding_4 PF07993.7 249 9.6e-17 57.9 0.0 2 2 3.7e-15 1.3e-12 44.4 0.0 86 197 78 194 62 225 0.87 # 15825 # 16901 # -1 # ID=26_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.513 41_5 - 356 NAD_binding_4 PF07993.7 249 7.1e-16 55.0 0.0 1 2 3.2e-05 0.011 11.8 0.0 1 24 6 28 6 37 0.89 # 3252 # 4319 # 1 # ID=41_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.539 41_5 - 356 NAD_binding_4 PF07993.7 249 7.1e-16 55.0 0.0 2 2 3.5e-14 1.2e-11 41.2 0.0 86 197 73 189 62 225 0.85 # 3252 # 4319 # 1 # ID=41_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.539 3_111 - 335 NAD_binding_4 PF07993.7 249 4.5e-10 36.0 0.0 1 2 0.00043 0.15 8.1 0.1 1 21 5 25 5 68 0.79 # 102704 # 103708 # 1 # ID=3_111;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 3_111 - 335 NAD_binding_4 PF07993.7 249 4.5e-10 36.0 0.0 2 2 1.3e-09 4.7e-07 26.2 0.0 86 247 69 226 59 228 0.79 # 102704 # 103708 # 1 # ID=3_111;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.514 41_4 - 340 NAD_binding_4 PF07993.7 249 7e-10 35.4 0.0 1 1 1.3e-11 4.5e-09 32.8 0.0 1 187 6 168 6 208 0.79 # 2117 # 3136 # 1 # ID=41_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.496 3_42 - 288 NAD_binding_4 PF07993.7 249 2.3e-09 33.7 0.0 1 1 1.8e-11 6.3e-09 32.3 0.0 86 200 49 152 2 196 0.72 # 36434 # 37297 # -1 # ID=3_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.553 11_27 - 637 NAD_binding_4 PF07993.7 249 2.9e-05 20.3 0.1 1 1 2e-07 6.9e-05 19.1 0.1 1 145 284 420 284 445 0.79 # 32541 # 34451 # -1 # ID=11_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.571 4_40 - 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