# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 33_7 - 162 UPF0054 PF02130.12 145 1.4e-43 145.7 0.0 1 1 4.1e-47 1.6e-43 145.5 0.0 19 145 27 152 15 152 0.89 # 5783 # 6268 # -1 # ID=33_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.708 1_3 - 530 Sulfotransfer_3 PF13469.1 215 1.9e-17 62.6 4.6 1 1 2.5e-20 1.9e-17 62.6 4.6 2 214 278 470 277 471 0.77 # 3814 # 5403 # -1 # ID=1_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.669 24_21 - 268 Sulfotransfer_3 PF13469.1 215 4.5e-13 48.5 8.3 1 1 5.9e-16 4.5e-13 48.5 8.3 4 213 5 201 2 205 0.79 # 30096 # 30899 # 1 # ID=24_21;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 4_25 - 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491 KaiC PF06745.8 227 2.1e-65 218.1 0.0 2 2 4.1e-38 1e-35 121.0 0.0 2 222 249 462 248 466 0.89 # 18632 # 20104 # -1 # ID=22_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.667 1_251 - 467 KaiC PF06745.8 227 7.8e-18 62.5 0.0 1 2 4.4e-14 1.1e-11 42.4 0.1 1 74 83 154 83 163 0.92 # 291161 # 292561 # -1 # ID=1_251;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.705 1_251 - 467 KaiC PF06745.8 227 7.8e-18 62.5 0.0 2 2 1.3e-06 0.0003 18.0 0.0 105 203 166 267 157 284 0.77 # 291161 # 292561 # -1 # ID=1_251;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.705 6_62 - 350 KaiC PF06745.8 227 2.2e-07 28.3 0.8 1 1 1.2e-08 2.8e-06 24.7 0.8 1 77 39 113 39 234 0.84 # 62235 # 63284 # 1 # ID=6_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.648 32_16 - 772 KaiC PF06745.8 227 1.5e-05 22.3 0.1 1 2 7.2e-05 0.017 12.3 0.0 9 38 291 327 288 335 0.80 # 23873 # 26188 # -1 # ID=32_16;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.730 32_16 - 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267 KR PF08659.5 181 1.1e-14 52.5 0.6 1 1 1.3e-16 1.5e-14 52.1 0.6 1 156 6 161 6 185 0.83 # 164568 # 165368 # 1 # ID=7_133;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.733 26_29 - 281 KR PF08659.5 181 1.4e-14 52.2 9.9 1 1 1.8e-16 2.1e-14 51.6 9.9 2 166 8 176 7 188 0.87 # 37452 # 38294 # 1 # ID=26_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.699 5_56 - 245 KR PF08659.5 181 1.7e-14 52.0 3.7 1 1 2.4e-16 2.9e-14 51.2 3.7 3 141 8 149 7 156 0.86 # 64069 # 64803 # -1 # ID=5_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.684 22_19 - 289 KR PF08659.5 181 7.4e-14 49.9 0.2 1 1 8.6e-16 1e-13 49.4 0.2 4 122 48 165 46 179 0.91 # 16021 # 16887 # -1 # ID=22_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.663 9_95 - 258 KR PF08659.5 181 2.8e-12 44.7 1.3 1 1 3.1e-14 3.7e-12 44.3 1.3 2 165 11 176 10 191 0.85 # 111277 # 112050 # 1 # ID=9_95;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.686 5_164 - 257 KR PF08659.5 181 3.2e-12 44.5 4.9 1 1 4.4e-14 5.3e-12 43.8 4.9 4 153 9 166 7 195 0.88 # 182286 # 183056 # 1 # ID=5_164;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.712 13_6 - 258 KR PF08659.5 181 3.4e-12 44.5 2.2 1 1 4.1e-14 4.9e-12 43.9 2.2 3 156 18 165 17 191 0.85 # 3549 # 4322 # -1 # ID=13_6;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.630 13_5 - 251 KR PF08659.5 181 4.8e-12 44.0 0.7 1 1 5.3e-14 6.5e-12 43.5 0.7 2 154 15 161 14 179 0.84 # 2800 # 3552 # -1 # ID=13_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.632 2_12 - 245 KR PF08659.5 181 2e-11 41.9 3.6 1 1 4.1e-13 4.9e-11 40.7 3.6 3 125 7 127 6 182 0.86 # 11586 # 12320 # -1 # ID=2_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.725 6_29 - 269 KR PF08659.5 181 3.9e-11 41.0 3.5 1 1 5e-13 6.1e-11 40.4 3.5 3 174 20 193 19 196 0.85 # 29382 # 30188 # -1 # ID=6_29;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.724 33_26 - 247 KR PF08659.5 181 5.3e-11 40.6 0.4 1 1 7.4e-13 9e-11 39.8 0.4 2 125 16 138 16 179 0.86 # 20930 # 21670 # 1 # ID=33_26;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.746 29_5 - 249 KR PF08659.5 181 3.4e-09 34.7 3.0 1 1 4.3e-11 5.2e-09 34.1 3.0 4 155 11 155 9 176 0.83 # 3638 # 4384 # 1 # ID=29_5;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.692 11_70 - 252 KR PF08659.5 181 1.2e-08 32.8 0.4 1 1 1.4e-10 1.7e-08 32.4 0.4 3 123 12 126 11 190 0.84 # 80000 # 80755 # -1 # ID=11_70;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.687 12_54 - 637 KR PF08659.5 181 3.2e-08 31.5 1.5 1 1 3.9e-10 4.7e-08 30.9 0.2 2 136 286 410 285 429 0.85 # 63109 # 65019 # -1 # ID=12_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.654 3_146 - 243 KR PF08659.5 181 6.7e-08 30.4 7.2 1 1 7.3e-10 8.8e-08 30.1 7.2 3 174 4 177 3 183 0.86 # 181227 # 181955 # 1 # ID=3_146;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.722 16_6 - 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288 GHMP_kinases_N PF00288.21 67 3.4e-10 37.9 0.4 1 1 5.1e-13 9.9e-10 36.4 0.4 1 66 93 150 93 151 0.89 # 49469 # 50332 # 1 # ID=23_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.704 51_8 - 180 Ribosomal_L10 PF00466.15 100 7e-26 88.1 0.1 1 1 2.5e-29 9.7e-26 87.7 0.1 4 100 6 101 3 101 0.97 # 12789 # 13328 # -1 # ID=51_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.646 12_43 - 466 MMR_HSR1 PF01926.18 116 4.3e-50 166.6 0.0 1 2 2.5e-26 2.6e-24 83.5 0.0 2 116 5 120 4 120 0.88 # 50690 # 52087 # -1 # ID=12_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.681 12_43 - 466 MMR_HSR1 PF01926.18 116 4.3e-50 166.6 0.0 2 2 1.5e-25 1.5e-23 81.0 0.0 1 116 180 298 180 298 0.87 # 50690 # 52087 # -1 # ID=12_43;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.681 1_175 - 301 MMR_HSR1 PF01926.18 116 6.8e-23 78.9 0.0 1 1 1e-24 1e-22 78.3 0.0 2 116 13 127 12 127 0.84 # 204587 # 205489 # -1 # ID=1_175;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.689 37_27 - 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326 TIP49 PF06068.8 398 0.037 10.8 0.0 1 1 0.00018 0.046 10.4 0.0 46 88 29 71 15 108 0.83 # 82434 # 83411 # 1 # ID=10_78;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.723 14_50 - 244 TIP49 PF06068.8 398 0.044 10.5 0.0 1 1 0.00086 0.22 8.2 0.0 53 72 44 63 29 81 0.80 # 53020 # 53751 # -1 # ID=14_50;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.740 8_55 - 280 Adeno_IVa2 PF02456.10 370 0.015 12.0 0.0 1 2 5.1e-05 0.098 9.3 0.0 76 106 46 77 30 90 0.76 # 68817 # 69656 # 1 # ID=8_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 8_55 - 280 Adeno_IVa2 PF02456.10 370 0.015 12.0 0.0 2 2 0.029 57 0.2 0.0 234 246 223 235 212 244 0.82 # 68817 # 69656 # 1 # ID=8_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.651 7_28 - 541 Adeno_IVa2 PF02456.10 370 0.043 10.5 0.0 1 1 4e-05 0.077 9.7 0.0 91 115 338 360 327 366 0.81 # 28351 # 29973 # 1 # ID=7_28;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.674 8_94 - 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181 Guanylate_kin PF00625.16 183 0.026 12.0 0.0 1 2 0.00018 0.24 8.9 0.0 5 30 7 32 4 73 0.81 # 43592 # 44134 # -1 # ID=21_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.705 21_32 - 181 Guanylate_kin PF00625.16 183 0.026 12.0 0.0 2 2 0.04 51 1.3 0.0 112 137 95 120 76 167 0.62 # 43592 # 44134 # -1 # ID=21_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.705 2_266 - 463 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 4.4e-27 92.9 0.0 1 1 1.2e-28 2.7e-26 90.3 0.0 1 138 142 312 142 312 0.94 # 303252 # 304640 # -1 # ID=2_266;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.696 4_32 - 475 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 1.7e-26 91.0 0.0 1 1 5.6e-28 1.3e-25 88.1 0.0 1 138 147 317 147 317 0.90 # 34513 # 35937 # 1 # ID=4_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.726 22_30 - 446 Sigma54_activ_2 PF14532.1 138 1.9e-26 90.8 0.0 1 1 3.4e-28 7.8e-26 88.8 0.0 1 138 142 312 142 312 0.91 # 29035 # 30372 # 1 # ID=22_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.718 13_10 - 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279 Methyltransf_23 PF13489.1 161 5.6e-13 47.0 0.0 1 1 6.2e-15 8.2e-13 46.4 0.0 5 125 74 200 69 249 0.71 # 36547 # 37383 # -1 # ID=1_29;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.726 3_155 - 310 Methyltransf_23 PF13489.1 161 2e-12 45.2 0.2 1 1 8.4e-14 1.1e-11 42.7 0.1 72 152 75 218 18 220 0.71 # 191703 # 192632 # 1 # ID=3_155;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.594 34_20 - 254 Methyltransf_23 PF13489.1 161 4.9e-12 43.9 0.0 1 1 5.6e-14 7.5e-12 43.3 0.0 9 156 53 232 46 236 0.74 # 22660 # 23421 # -1 # ID=34_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.664 8_112 - 202 Methyltransf_23 PF13489.1 161 1.2e-11 42.6 0.0 1 1 1.1e-13 1.5e-11 42.3 0.0 6 120 26 147 14 184 0.74 # 134272 # 134877 # 1 # ID=8_112;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.696 2_62 - 233 Methyltransf_23 PF13489.1 161 3.2e-10 38.0 0.0 1 1 4.2e-12 5.6e-10 37.2 0.0 19 157 54 210 36 214 0.76 # 69245 # 69943 # -1 # ID=2_62;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.714 28_23 - 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