# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 16_13 - 135 UPF0054 PF02130.12 145 1.7e-33 112.0 0.1 1 1 1e-36 2e-33 111.8 0.1 33 145 20 123 5 123 0.90 # 10653 # 11057 # -1 # ID=16_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 5_90 - 505 Mg_chelatase PF01078.16 207 2e-74 246.3 0.0 1 1 3.3e-76 2.9e-74 245.7 0.0 1 205 201 404 201 406 0.97 # 82727 # 84241 # 1 # ID=5_90;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.353 3_141 - 407 Mg_chelatase PF01078.16 207 1.6e-07 27.8 0.4 1 2 4.7e-06 0.00041 16.6 0.1 22 46 107 131 101 145 0.89 # 148469 # 149689 # -1 # ID=3_141;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 3_141 - 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573 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.0065 12.1 2.8 2 2 0.00062 0.13 7.8 0.0 298 352 446 501 440 507 0.91 # 15865 # 17583 # -1 # ID=1_19;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.329 16_10 - 247 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.024 10.3 1.4 1 2 0.013 2.8 3.5 0.2 242 264 24 47 16 49 0.86 # 8474 # 9214 # 1 # ID=16_10;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.370 16_10 - 247 ABC_ATPase PF09818.4 448 0.024 10.3 1.4 2 2 0.0063 1.4 4.5 0.1 377 416 178 217 127 231 0.73 # 8474 # 9214 # 1 # ID=16_10;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.370 2_232 - 228 Pox_MCEL PF03291.11 332 1.7e-05 20.9 0.0 1 1 2.9e-08 2.8e-05 20.2 0.0 59 108 37 87 28 98 0.83 # 227649 # 228332 # 1 # ID=2_232;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.336 2_233 - 229 Pox_MCEL PF03291.11 332 0.00046 16.2 0.5 1 2 1.5e-05 0.014 11.3 0.0 62 108 38 84 28 102 0.88 # 228342 # 229028 # 1 # ID=2_233;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.320 2_233 - 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243 AAA_17 PF13207.1 121 0.0045 14.9 1.4 1 1 0.00041 0.013 13.4 1.4 2 16 30 44 29 118 0.95 # 371363 # 372091 # -1 # ID=1_386;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.333 20_3 - 584 AAA_17 PF13207.1 121 0.0053 14.7 0.1 1 1 0.00046 0.014 13.3 0.1 3 19 362 378 360 506 0.80 # 2941 # 4692 # -1 # ID=20_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.369 1_193 - 323 AAA_17 PF13207.1 121 0.0055 14.6 0.3 1 1 0.00056 0.017 13.0 0.3 1 17 29 45 29 124 0.90 # 188863 # 189831 # 1 # ID=1_193;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.337 22_1 - 463 AAA_17 PF13207.1 121 0.0077 14.1 0.9 1 1 0.0032 0.099 10.6 0.0 4 42 40 86 37 155 0.67 # 358 # 1746 # -1 # ID=22_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.322 14_12 - 395 AAA_17 PF13207.1 121 0.0078 14.1 0.6 1 1 0.0006 0.019 12.9 0.4 3 23 54 74 53 225 0.84 # 10933 # 12117 # 1 # ID=14_12;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.294 3_113 - 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192 Zeta_toxin PF06414.7 201 2.1e-05 20.8 0.0 1 1 3.2e-07 2.5e-05 20.5 0.0 16 146 2 134 1 180 0.88 # 398657 # 399232 # 1 # ID=1_418;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.366 5_1 - 249 Zeta_toxin PF06414.7 201 4.5e-05 19.7 0.0 1 1 8.8e-07 6.8e-05 19.1 0.0 12 49 137 176 130 206 0.85 # 78 # 824 # -1 # ID=5_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.335 1_89 - 557 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0001 18.6 0.1 1 1 1.6e-05 0.0012 15.0 0.0 14 41 187 214 173 229 0.80 # 80770 # 82440 # 1 # ID=1_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.318 1_263 - 449 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0001 18.5 0.0 1 1 2.7e-06 0.00021 17.5 0.0 13 102 95 188 86 218 0.70 # 257129 # 258475 # -1 # ID=1_263;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.359 19_9 - 196 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00027 17.2 0.1 1 1 9e-06 0.0007 15.8 0.0 18 43 5 29 2 38 0.81 # 5567 # 6154 # 1 # ID=19_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.315 2_32 - 644 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00035 16.8 0.0 1 1 1.3e-05 0.00098 15.3 0.0 15 45 205 234 192 269 0.84 # 33092 # 35023 # -1 # ID=2_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.366 2_122 - 204 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00061 16.0 0.1 1 1 9.6e-05 0.0075 12.5 0.1 18 41 5 28 2 102 0.84 # 123055 # 123666 # -1 # ID=2_122;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.332 3_11 - 218 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.00066 15.9 0.0 1 1 1.4e-05 0.0011 15.2 0.0 17 46 28 58 19 64 0.81 # 7618 # 8271 # -1 # ID=3_11;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.315 1_227 - 441 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.001 15.3 0.0 1 1 3e-05 0.0023 14.1 0.0 12 51 45 83 35 128 0.87 # 225718 # 227040 # 1 # ID=1_227;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.337 8_60 - 733 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0013 15.0 0.0 1 1 0.00022 0.017 11.3 0.0 10 63 471 533 461 578 0.75 # 63022 # 65220 # 1 # ID=8_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.314 9_52 - 259 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0013 14.9 0.0 1 1 2.7e-05 0.0021 14.2 0.0 21 57 33 70 15 84 0.89 # 49719 # 50495 # -1 # ID=9_52;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.317 14_7 - 290 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0016 14.6 0.1 1 1 4e-05 0.0031 13.7 0.1 6 101 74 172 70 192 0.64 # 5372 # 6241 # 1 # ID=14_7;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.356 3_54 - 232 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0019 14.4 0.0 1 1 3.1e-05 0.0024 14.0 0.0 16 46 27 57 15 123 0.86 # 58658 # 59353 # -1 # ID=3_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.338 1_438 - 224 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0028 13.9 0.0 1 1 6.4e-05 0.005 13.0 0.0 18 55 33 71 29 88 0.87 # 419003 # 419674 # -1 # ID=1_438;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.344 1_233 - 272 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0033 13.6 0.0 1 1 7e-05 0.0054 12.9 0.0 17 47 42 72 28 126 0.85 # 231998 # 232813 # 1 # ID=1_233;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.268 1_281 - 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251 KaiC PF06745.8 227 0.017 11.3 0.0 1 1 0.00039 0.047 9.9 0.0 53 141 159 246 128 250 0.81 # 77298 # 78050 # -1 # ID=7_72;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.347 22_1 - 463 AAA_14 PF13173.1 128 8.2e-34 113.4 0.6 1 1 9e-35 3.2e-33 111.4 0.6 3 128 36 169 34 169 0.86 # 358 # 1746 # -1 # ID=22_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.322 8_60 - 733 AAA_14 PF13173.1 128 9.8e-10 35.5 0.2 1 2 1.1e-06 4.1e-05 20.6 0.1 8 74 171 256 164 304 0.71 # 63022 # 65220 # 1 # ID=8_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.314 8_60 - 733 AAA_14 PF13173.1 128 9.8e-10 35.5 0.2 2 2 0.0012 0.044 10.8 0.0 4 75 480 561 478 601 0.62 # 63022 # 65220 # 1 # ID=8_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.314 9_40 - 398 AAA_14 PF13173.1 128 2.2e-09 34.4 0.1 1 1 1.3e-10 4.6e-09 33.4 0.1 8 127 40 151 35 152 0.75 # 37283 # 38476 # 1 # ID=9_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.328 1_233 - 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131 Ribosomal_S11 PF00411.14 110 1.4e-41 138.2 0.2 1 1 8.7e-45 1.7e-41 137.9 0.2 1 110 19 129 19 129 0.98 # 74882 # 75274 # -1 # ID=6_82;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.392 3_241 - 336 TIGR00329 TIGR00329 305 5.9e-101 334.5 0.1 1 1 6.9e-104 6.7e-101 334.3 0.1 1 305 3 302 3 302 0.98 # 239027 # 240034 # -1 # ID=3_241;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.363 1_163 - 742 TIGR00329 TIGR00329 305 0.02 10.9 0.8 1 1 5.6e-05 0.054 9.5 0.0 252 302 670 720 654 723 0.82 # 155870 # 158095 # -1 # ID=1_163;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.322 2_128 - 259 Ribosomal_S2 PF00318.15 211 2.6e-84 278.7 0.0 1 1 3.1e-87 3e-84 278.5 0.0 1 211 7 223 7 223 0.99 # 130173 # 130949 # -1 # ID=2_128;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.375 25_1 - 91 Ribosomal_S2 PF00318.15 211 0.0057 13.0 0.0 1 1 7.2e-06 0.007 12.7 0.0 99 159 12 78 6 82 0.83 # 286 # 558 # -1 # ID=25_1;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.322 13_5 - 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330 tRNA_Me_trans PF03054.11 356 0.00012 17.8 0.0 1 1 5.9e-07 0.00023 16.9 0.0 2 124 4 114 3 139 0.79 # 33066 # 34055 # -1 # ID=5_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.386 2_286 - 609 tRNA_Me_trans PF03054.11 356 0.00034 16.3 0.0 1 1 1.4e-06 0.00054 15.7 0.0 7 86 262 332 258 374 0.86 # 273797 # 275623 # 1 # ID=2_286;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.314 6_88 - 134 Ribosomal_L18e PF00828.14 129 2e-08 31.8 1.5 1 1 3e-11 2.9e-08 31.2 1.5 4 100 28 116 26 130 0.81 # 78418 # 78819 # -1 # ID=6_88;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.366 5_46 - 470 Ribosomal_L18e PF00828.14 129 0.058 10.9 3.8 1 2 0.0014 1.3 6.5 0.1 23 72 369 416 363 422 0.79 # 46972 # 48381 # 1 # ID=5_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 5_46 - 470 Ribosomal_L18e PF00828.14 129 0.058 10.9 3.8 2 2 0.0034 3.3 5.2 0.4 102 126 419 443 416 447 0.79 # 46972 # 48381 # 1 # ID=5_46;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 3_210 - 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