# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 6_96 - 163 UPF0054 PF02130.12 145 1.4e-37 125.9 0.0 1 1 5.3e-41 1.6e-37 125.7 0.0 33 145 35 145 12 145 0.91 # 113278 # 113766 # -1 # ID=6_96;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.389 5_168 - 504 Mg_chelatase PF01078.16 207 2.7e-96 318.4 0.0 1 1 2.2e-98 3.9e-96 317.8 0.0 1 206 190 395 190 396 0.99 # 178502 # 180013 # -1 # ID=5_168;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.440 3_149 - 425 Mg_chelatase PF01078.16 207 7e-08 29.6 0.2 1 2 4.2e-08 7.5e-06 23.0 0.3 21 54 109 143 74 162 0.82 # 166635 # 167909 # -1 # ID=3_149;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.396 3_149 - 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754 MobB PF03205.9 140 0.00048 17.6 0.1 2 2 0.0069 0.6 7.5 0.0 4 24 493 513 491 519 0.91 # 163619 # 165880 # 1 # ID=1_143;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.408 3_56 - 559 MobB PF03205.9 140 0.00049 17.5 0.5 1 2 0.015 1.3 6.4 0.1 3 21 36 54 35 59 0.89 # 60474 # 62150 # -1 # ID=3_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.429 3_56 - 559 MobB PF03205.9 140 0.00049 17.5 0.5 2 2 0.0034 0.3 8.5 0.0 2 22 354 374 353 380 0.88 # 60474 # 62150 # -1 # ID=3_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.429 4_137 - 380 MobB PF03205.9 140 0.0012 16.3 0.1 1 1 3.3e-05 0.0029 15.0 0.1 2 22 165 185 164 239 0.83 # 163375 # 164514 # -1 # ID=4_137;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 4_91 - 859 MobB PF03205.9 140 0.0014 16.0 0.1 1 2 0.091 8 3.9 0.0 5 27 204 226 203 239 0.86 # 113358 # 115934 # 1 # ID=4_91;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.418 4_91 - 859 MobB PF03205.9 140 0.0014 16.0 0.1 2 2 0.0039 0.34 8.3 0.0 4 25 602 623 600 635 0.85 # 113358 # 115934 # 1 # ID=4_91;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.418 2_239 - 192 MobB PF03205.9 140 0.0019 15.7 0.0 1 1 3.3e-05 0.0029 15.1 0.0 2 33 5 30 4 72 0.80 # 272443 # 273018 # 1 # ID=2_239;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.385 10_58 - 246 MobB PF03205.9 140 0.0021 15.5 0.2 1 1 4.8e-05 0.0042 14.5 0.2 2 25 33 56 32 65 0.91 # 52178 # 52915 # 1 # ID=10_58;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 7_157 - 226 MobB PF03205.9 140 0.0022 15.4 0.0 1 1 5.1e-05 0.0045 14.4 0.0 2 20 37 55 36 68 0.85 # 172160 # 172837 # 1 # ID=7_157;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 9_20 - 604 MobB PF03205.9 140 0.0023 15.4 0.0 1 1 5.6e-05 0.0049 14.3 0.0 2 23 381 402 380 412 0.89 # 21958 # 23769 # -1 # ID=9_20;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.380 3_236 - 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318 PhoH PF02562.11 205 2.5e-91 302.2 0.0 1 1 1.2e-93 3.8e-91 301.6 0.0 2 205 106 309 105 309 0.99 # 113763 # 114716 # -1 # ID=6_97;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.376 2_163 - 468 PhoH PF02562.11 205 1.9e-55 185.0 0.0 1 1 1.1e-57 3.4e-55 184.2 0.0 2 191 255 456 254 464 0.93 # 183875 # 185278 # -1 # ID=2_163;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.404 3_8 - 525 PhoH PF02562.11 205 8.7e-05 19.6 0.2 1 2 0.0003 0.093 9.7 0.0 22 47 25 50 21 57 0.89 # 8179 # 9753 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.411 3_8 - 525 PhoH PF02562.11 205 8.7e-05 19.6 0.2 2 2 0.002 0.6 7.0 0.1 21 46 260 285 246 289 0.87 # 8179 # 9753 # 1 # ID=3_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.411 9_44 - 703 PhoH PF02562.11 205 0.00034 17.6 0.0 1 1 3.6e-06 0.0011 15.9 0.0 5 48 304 349 300 354 0.88 # 51459 # 53567 # -1 # ID=9_44;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.404 1_314 - 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214 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0048 13.7 0.0 1 1 0.0011 0.11 9.2 0.0 17 40 6 29 2 36 0.86 # 196772 # 197413 # 1 # ID=6_174;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.391 1_170 - 574 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0064 13.3 0.0 1 1 0.00012 0.012 12.4 0.0 18 51 358 392 346 406 0.89 # 199565 # 201286 # -1 # ID=1_170;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.402 6_47 - 495 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0066 13.3 0.0 1 1 0.00017 0.017 11.9 0.0 18 49 249 282 235 285 0.89 # 47599 # 49083 # -1 # ID=6_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.411 1_320 - 288 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.0066 13.3 0.5 1 1 0.00025 0.025 11.4 0.3 16 51 14 51 9 57 0.92 # 375644 # 376507 # -1 # ID=1_320;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.416 5_119 - 750 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.014 12.3 0.3 1 1 0.00093 0.092 9.6 0.3 16 50 137 182 132 303 0.63 # 131543 # 133792 # 1 # ID=5_119;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.394 10_83 - 218 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.016 12.1 0.0 1 1 0.00023 0.023 11.5 0.0 12 38 25 51 17 73 0.74 # 73112 # 73765 # -1 # ID=10_83;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 4_110 - 429 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.019 11.8 0.0 1 1 0.00043 0.043 10.6 0.0 16 41 41 66 33 102 0.81 # 136058 # 137344 # -1 # ID=4_110;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.420 10_116 - 156 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.021 11.6 0.1 1 1 0.00039 0.039 10.8 0.1 14 41 26 53 14 60 0.81 # 107502 # 107969 # -1 # ID=10_116;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.415 3_218 - 451 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.023 11.5 0.1 1 1 0.00069 0.069 10.0 0.1 18 45 91 119 89 127 0.83 # 247789 # 249141 # -1 # ID=3_218;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.449 10_76 - 57 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.024 11.4 0.0 1 1 0.00026 0.025 11.4 0.0 20 39 6 25 3 43 0.73 # 67966 # 68136 # 1 # ID=10_76;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.345 12_40 - 222 Zeta_toxin PF06414.7 201 0.033 11.0 0.0 1 1 0.0005 0.049 10.4 0.0 14 38 25 49 16 60 0.78 # 33860 # 34525 # 1 # ID=12_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.368 1_32 - 493 NAD_binding_8 PF13450.1 68 4.3e-12 43.6 0.1 1 1 3.1e-13 3.2e-11 40.9 0.1 1 66 7 72 7 74 0.92 # 39055 # 40533 # -1 # ID=1_32;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.427 3_356 - 509 NAD_binding_8 PF13450.1 68 2.4e-11 41.3 0.0 1 1 5.7e-13 5.9e-11 40.0 0.0 1 61 17 81 17 88 0.84 # 413923 # 415449 # 1 # ID=3_356;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 5_206 - 675 NAD_binding_8 PF13450.1 68 2.9e-11 41.0 0.0 1 1 9.9e-13 1e-10 39.2 0.0 1 53 386 440 386 449 0.86 # 223151 # 225175 # 1 # ID=5_206;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.418 6_60 - 476 NAD_binding_8 PF13450.1 68 5.5e-09 33.7 7.5 1 2 4.4e-08 4.5e-06 24.4 0.4 1 36 10 45 10 48 0.95 # 66993 # 68420 # 1 # ID=6_60;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.416 6_60 - 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247 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 0.00071 16.3 0.1 1 1 5.2e-06 0.00094 15.9 0.1 2 86 7 91 6 142 0.62 # 385787 # 386527 # 1 # ID=2_332;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.398 9_25 - 2600 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 0.0011 15.6 0.0 1 1 1.2e-05 0.0022 14.7 0.0 2 85 1793 1876 1792 1881 0.71 # 27152 # 34951 # -1 # ID=9_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.381 2_333 - 249 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 0.0026 14.4 0.5 1 1 3.2e-05 0.0057 13.3 0.5 1 127 7 141 7 192 0.53 # 386561 # 387307 # 1 # ID=2_333;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.387 4_225 - 253 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 0.0044 13.7 0.0 1 1 2.9e-05 0.0052 13.4 0.0 2 87 3 81 2 149 0.70 # 267989 # 268747 # -1 # ID=4_225;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.436 8_22 - 376 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 0.018 11.7 0.0 1 1 0.00014 0.025 11.2 0.0 1 83 5 80 5 84 0.84 # 22953 # 24080 # -1 # ID=8_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.408 12_103 - 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192 ABC_tran PF00005.22 137 4.5e-05 21.5 0.1 1 1 1.2e-06 6.6e-05 21.0 0.1 13 39 5 31 2 147 0.86 # 272443 # 273018 # 1 # ID=2_239;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.385 4_137 - 380 ABC_tran PF00005.22 137 0.00017 19.7 0.1 1 1 8.6e-06 0.00047 18.2 0.1 7 37 159 189 158 345 0.81 # 163375 # 164514 # -1 # ID=4_137;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 10_84 - 352 ABC_tran PF00005.22 137 0.00029 18.9 0.1 1 1 9.2e-06 0.00049 18.1 0.1 16 93 151 261 144 304 0.74 # 73749 # 74804 # -1 # ID=10_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.430 2_6 - 447 ABC_tran PF00005.22 137 0.0016 16.5 0.0 1 1 6.6e-05 0.0036 15.3 0.0 8 39 212 243 210 323 0.81 # 5390 # 6730 # 1 # ID=2_6;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.424 1_390 - 337 ABC_tran PF00005.22 137 0.0018 16.3 0.0 1 1 7.3e-05 0.0039 15.2 0.0 5 35 158 188 154 274 0.83 # 463293 # 464303 # -1 # ID=1_390;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.379 3_149 - 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703 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 6.1e-09 33.3 0.0 3 3 4.2e-08 1.2e-05 22.6 0.0 42 148 541 645 534 668 0.85 # 111380 # 113488 # -1 # ID=11_111;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.394 1_281 - 390 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 9e-09 32.7 0.0 1 1 6.5e-11 1.8e-08 31.7 0.0 41 123 218 295 209 327 0.83 # 333677 # 334846 # 1 # ID=1_281;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.417 2_105 - 221 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 9.2e-07 26.1 0.0 1 1 4.9e-09 1.4e-06 25.6 0.0 40 124 45 130 26 138 0.78 # 110933 # 111595 # -1 # ID=2_105;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.351 3_49 - 282 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 2.6e-06 24.7 0.0 1 1 1.5e-08 4.3e-06 24.0 0.0 22 127 93 192 79 202 0.79 # 53947 # 54792 # 1 # ID=3_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.424 1_525 - 445 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 2.7e-06 24.6 0.0 1 1 1.5e-08 4.3e-06 24.0 0.0 43 152 298 399 289 420 0.76 # 607583 # 608917 # 1 # ID=1_525;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.401 3_284 - 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440 NAD_binding_9 PF13454.1 156 0.00019 18.9 0.2 2 2 0.013 2.8 5.4 0.0 1 20 175 194 175 221 0.79 # 450329 # 451648 # -1 # ID=1_380;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.392 1_239 - 234 NAD_binding_9 PF13454.1 156 0.00021 18.8 0.7 1 1 0.0002 0.045 11.3 0.1 1 39 73 119 73 133 0.82 # 281595 # 282296 # -1 # ID=1_239;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.423 3_356 - 509 NAD_binding_9 PF13454.1 156 0.0003 18.3 0.0 1 1 2.2e-05 0.0048 14.4 0.0 2 39 17 52 16 77 0.81 # 413923 # 415449 # 1 # ID=3_356;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.388 9_37 - 508 NAD_binding_9 PF13454.1 156 0.00091 16.8 2.5 1 2 0.00017 0.038 11.5 0.7 1 37 29 60 29 73 0.81 # 43899 # 45422 # 1 # ID=9_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.392 9_37 - 508 NAD_binding_9 PF13454.1 156 0.00091 16.8 2.5 2 2 0.041 9 3.8 0.0 113 153 189 227 173 230 0.76 # 43899 # 45422 # 1 # ID=9_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.392 2_157 - 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