# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 2_81 - 170 UPF0054 PF02130.12 145 9.5e-45 148.5 1.1 1 1 5.9e-48 1.1e-44 148.3 1.1 10 145 26 159 15 159 0.93 # 83026 # 83535 # -1 # ID=2_81;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.329 9_25 - 651 Sulfotransfer_3 PF13469.1 215 2.8e-14 51.4 0.0 1 1 2.2e-17 4.3e-14 50.8 0.0 4 209 329 519 327 526 0.77 # 28900 # 30852 # 1 # ID=9_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.309 3_63 - 503 Mg_chelatase PF01078.16 207 3.4e-97 320.6 0.0 1 1 3.5e-99 5.2e-97 320.1 0.0 1 205 190 394 190 396 0.99 # 74063 # 75571 # 1 # ID=3_63;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.370 4_105 - 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325 PRK PF00485.13 194 0.0022 14.7 0.0 1 1 7.6e-06 0.0036 13.9 0.0 1 20 42 61 42 108 0.79 # 161698 # 162672 # 1 # ID=3_141;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.346 1_195 - 261 PRK PF00485.13 194 0.015 11.9 0.2 1 1 5.6e-05 0.027 11.1 0.2 1 24 42 65 42 77 0.88 # 201451 # 202233 # -1 # ID=1_195;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.337 1_116 - 118 Ribonuclease_P PF00825.13 111 1.6e-16 57.3 0.4 1 1 8.9e-20 1.7e-16 57.2 0.4 4 105 9 108 6 117 0.89 # 124104 # 124457 # -1 # ID=1_116;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.302 1_280 - 106 Ribosomal_S10 PF00338.17 97 5.5e-39 129.0 0.5 1 1 3.2e-42 6.1e-39 128.9 0.5 1 96 8 103 8 104 0.99 # 288260 # 288577 # 1 # ID=1_280;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.346 2_377 - 303 tRNA_anti-like PF12869.2 144 0.0046 13.5 0.3 1 1 5.5e-06 0.011 12.3 0.3 4 59 8 60 1 72 0.74 # 368070 # 368978 # -1 # ID=2_377;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.377 7_86 - 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630 Miro PF08477.8 119 9.2e-05 20.0 4.0 2 2 0.0016 0.096 10.3 0.0 1 22 341 362 341 389 0.87 # 364584 # 366473 # -1 # ID=2_374;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.320 3_141 - 325 Miro PF08477.8 119 0.00029 18.4 0.0 1 1 1.1e-05 0.00066 17.3 0.0 2 25 43 66 43 102 0.79 # 161698 # 162672 # 1 # ID=3_141;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.346 3_213 - 746 Miro PF08477.8 119 0.00038 18.0 0.0 1 1 1.9e-05 0.0012 16.5 0.0 3 119 4 119 2 119 0.77 # 234542 # 236779 # -1 # ID=3_213;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.334 2_88 - 173 Miro PF08477.8 119 0.0007 17.2 0.0 1 1 3.7e-05 0.0022 15.5 0.0 3 58 114 163 112 167 0.77 # 89428 # 89946 # -1 # ID=2_88;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.331 3_10 - 335 Miro PF08477.8 119 0.00071 17.1 0.0 1 1 2.2e-05 0.0013 16.3 0.0 2 119 162 285 161 285 0.84 # 12128 # 13132 # 1 # ID=3_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.380 1_18 - 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466 MobB PF03205.9 140 9e-05 19.3 0.0 2 2 0.043 2.8 4.7 0.0 5 21 188 204 185 215 0.88 # 487267 # 488664 # 1 # ID=1_502;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.356 1_32 - 237 MobB PF03205.9 140 0.0001 19.1 1.3 1 1 1.9e-06 0.00012 18.9 0.0 3 67 54 111 52 135 0.81 # 31889 # 32599 # 1 # ID=1_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.373 3_134 - 334 MobB PF03205.9 140 0.00012 18.8 3.1 1 1 2e-06 0.00013 18.7 1.2 2 32 129 159 128 165 0.92 # 153826 # 154827 # 1 # ID=3_134;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.350 5_120 - 222 MobB PF03205.9 140 0.00018 18.3 0.4 1 1 9.5e-06 0.00061 16.6 0.1 2 35 9 42 8 46 0.88 # 137286 # 137951 # 1 # ID=5_120;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.303 3_122 - 610 MobB PF03205.9 140 0.00028 17.7 0.0 1 1 1.1e-05 0.00071 16.4 0.0 2 31 399 428 398 441 0.87 # 139365 # 141194 # 1 # ID=3_122;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.346 2_209 - 168 MobB PF03205.9 140 0.00035 17.4 0.1 1 1 2.2e-05 0.0014 15.4 0.1 4 32 6 34 3 71 0.75 # 207522 # 208025 # -1 # ID=2_209;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.325 2_280 - 244 MobB PF03205.9 140 0.00039 17.2 0.5 1 2 0.053 3.4 4.5 0.1 2 21 33 52 32 71 0.82 # 280099 # 280830 # -1 # ID=2_280;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.359 2_280 - 244 MobB PF03205.9 140 0.00039 17.2 0.5 2 2 0.00068 0.044 10.6 0.0 17 75 178 232 177 237 0.88 # 280099 # 280830 # -1 # ID=2_280;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.359 1_18 - 860 MobB PF03205.9 140 0.00043 17.1 0.0 1 2 0.029 1.8 5.3 0.0 5 29 204 228 203 243 0.86 # 16495 # 19074 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.359 1_18 - 860 MobB PF03205.9 140 0.00043 17.1 0.0 2 2 0.0031 0.2 8.4 0.0 3 27 603 627 602 638 0.87 # 16495 # 19074 # 1 # ID=1_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.359 5_44 - 614 MobB PF03205.9 140 0.00053 16.8 0.1 1 2 0.033 2.1 5.1 0.0 2 20 31 49 30 66 0.79 # 55804 # 57645 # 1 # ID=5_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.329 5_44 - 614 MobB PF03205.9 140 0.00053 16.8 0.1 2 2 0.0024 0.15 8.8 0.0 3 21 342 360 341 412 0.94 # 55804 # 57645 # 1 # ID=5_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.329 7_26 - 486 MobB PF03205.9 140 0.00058 16.7 0.2 1 1 2.7e-05 0.0018 15.1 0.2 3 28 275 300 273 305 0.90 # 34429 # 35886 # -1 # ID=7_26;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.329 3_106 - 343 MobB PF03205.9 140 0.0011 15.8 0.0 1 1 4.2e-05 0.0027 14.5 0.0 3 29 127 153 125 171 0.85 # 120874 # 121902 # 1 # ID=3_106;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.370 2_446 - 436 MobB PF03205.9 140 0.0021 14.9 0.0 1 1 8.1e-05 0.0052 13.6 0.0 1 22 202 223 202 231 0.90 # 435505 # 436812 # -1 # ID=2_446;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.340 1_187 - 440 MobB PF03205.9 140 0.0021 14.8 0.1 1 1 0.00014 0.0087 12.9 0.1 2 25 39 62 38 74 0.85 # 192757 # 194076 # 1 # ID=1_187;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.362 3_123 - 323 MobB PF03205.9 140 0.0041 13.9 0.3 1 1 0.0003 0.019 11.7 0.1 3 34 50 81 47 89 0.83 # 141200 # 142168 # 1 # ID=3_123;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.347 7_53 - 941 MobB PF03205.9 140 0.0042 13.9 0.1 1 1 0.002 0.13 9.1 0.0 4 27 638 661 635 678 0.81 # 62549 # 65371 # 1 # ID=7_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.349 2_93 - 298 MobB PF03205.9 140 0.0043 13.8 0.3 1 1 0.00064 0.041 10.7 0.1 3 24 7 28 6 91 0.84 # 93917 # 94810 # 1 # ID=2_93;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.306 2_185 - 227 MobB PF03205.9 140 0.0044 13.8 0.0 1 1 0.00021 0.014 12.2 0.0 8 45 10 47 3 120 0.80 # 183935 # 184615 # -1 # ID=2_185;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.292 1_195 - 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198 MobB PF03205.9 140 0.0091 12.8 0.0 1 1 0.00027 0.018 11.9 0.0 2 33 27 58 26 64 0.88 # 35445 # 36038 # 1 # ID=9_30;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.348 4_125 - 442 MobB PF03205.9 140 0.01 12.6 1.9 1 1 0.00019 0.012 12.3 0.6 2 22 56 76 55 86 0.87 # 130679 # 132004 # -1 # ID=4_125;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.338 6_40 - 254 MobB PF03205.9 140 0.012 12.4 0.4 1 1 0.00043 0.027 11.2 0.1 2 21 33 52 32 55 0.88 # 34438 # 35199 # -1 # ID=6_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.311 1_226 - 226 MobB PF03205.9 140 0.014 12.2 0.3 1 1 0.0004 0.026 11.3 0.3 3 23 29 49 27 55 0.89 # 235712 # 236389 # -1 # ID=1_226;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.323 6_101 - 560 MobB PF03205.9 140 0.015 12.1 0.0 1 1 0.00056 0.036 10.9 0.0 4 24 382 402 379 413 0.84 # 90203 # 91882 # 1 # ID=6_101;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.286 2_248 - 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974 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 1.6e-08 30.9 0.0 1 1 2.6e-10 4.5e-08 29.4 0.0 1 129 637 768 637 772 0.74 # 198469 # 201390 # -1 # ID=3_176;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.295 4_133 - 380 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 2.7e-05 20.2 0.0 1 1 2.5e-07 4.3e-05 19.6 0.0 2 119 6 121 5 130 0.79 # 138366 # 139505 # -1 # ID=4_133;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.362 3_175 - 240 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 3.2e-05 20.0 0.1 1 1 3.3e-07 5.8e-05 19.2 0.1 1 172 9 179 9 181 0.75 # 197769 # 198488 # -1 # ID=3_175;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.333 4_131 - 380 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 0.0002 17.4 0.1 1 1 2.6e-06 0.00046 16.2 0.1 23 126 17 119 8 126 0.76 # 136803 # 137942 # -1 # ID=4_131;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.346 7_15 - 257 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 0.00026 17.0 0.2 1 1 2.3e-06 0.00041 16.4 0.2 1 79 13 85 13 139 0.79 # 22469 # 23239 # -1 # ID=7_15;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.342 2_179 - 89 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 0.0015 14.5 0.1 1 1 1e-05 0.0018 14.3 0.1 2 75 9 76 8 83 0.81 # 178427 # 178693 # -1 # ID=2_179;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.352 7_13 - 2185 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 0.01 11.8 0.0 1 1 0.00014 0.024 10.6 0.0 1 128 1682 1816 1682 1821 0.66 # 14866 # 21420 # 1 # ID=7_13;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.297 1_303 - 119 Ribosomal_S13 PF00416.17 107 5.2e-38 126.9 1.2 1 1 6.1e-41 5.8e-38 126.7 1.2 1 107 3 108 3 108 0.99 # 299083 # 299439 # 1 # ID=1_303;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.378 2_420 - 219 Ribosomal_S13 PF00416.17 107 0.014 12.9 0.3 1 1 0.0001 0.099 10.2 0.2 5 39 64 96 60 155 0.81 # 408819 # 409475 # -1 # ID=2_420;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.330 1_512 - 251 Methyltransf_25 PF13649.1 101 1.6e-16 57.6 0.0 1 1 1.8e-18 3e-16 56.7 0.0 1 101 66 163 66 163 0.93 # 496204 # 496956 # -1 # ID=1_512;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.348 6_87 - 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216 Methyltransf_25 PF13649.1 101 4.1e-07 27.4 0.0 1 1 5.7e-09 9.2e-07 26.3 0.0 2 101 53 147 52 147 0.84 # 169442 # 170089 # -1 # ID=4_156;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.276 2_166 - 613 Methyltransf_25 PF13649.1 101 4.9e-07 27.1 0.2 1 2 0.0021 0.33 8.4 0.0 19 65 146 194 94 220 0.73 # 165385 # 167223 # 1 # ID=2_166;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.308 2_166 - 613 Methyltransf_25 PF13649.1 101 4.9e-07 27.1 0.2 2 2 2.2e-05 0.0036 14.7 0.0 21 73 471 525 456 561 0.81 # 165385 # 167223 # 1 # ID=2_166;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.308 2_117 - 282 Methyltransf_25 PF13649.1 101 7.5e-05 20.1 0.0 1 1 1.8e-06 0.00029 18.3 0.0 1 98 150 233 150 236 0.67 # 120397 # 121242 # 1 # ID=2_117;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.326 5_123 - 450 Methyltransf_25 PF13649.1 101 0.00044 17.7 0.0 1 1 8.9e-06 0.0014 16.0 0.0 1 58 305 358 305 373 0.90 # 139042 # 140391 # 1 # ID=5_123;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.333 3_19 - 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177 ABC_tran PF00005.22 137 0.00065 17.1 0.7 1 1 4.7e-05 0.0019 15.6 0.7 12 37 5 30 2 168 0.83 # 103465 # 103995 # 1 # ID=2_102;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.335 2_131 - 350 ABC_tran PF00005.22 137 0.00071 17.0 3.5 1 1 4.6e-05 0.0018 15.6 3.5 11 38 23 50 18 313 0.83 # 131890 # 132939 # -1 # ID=2_131;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.289 6_8 - 451 ABC_tran PF00005.22 137 0.0008 16.8 3.6 1 1 5e-05 0.002 15.5 3.6 10 66 213 281 209 414 0.66 # 4976 # 6328 # -1 # ID=6_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.327 5_81 - 295 ABC_tran PF00005.22 137 0.0016 15.8 0.3 1 1 0.00026 0.01 13.2 0.2 12 42 164 194 158 226 0.80 # 97579 # 98463 # -1 # ID=5_81;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.325 2_209 - 168 ABC_tran PF00005.22 137 0.0017 15.7 0.1 1 1 6.9e-05 0.0028 15.1 0.0 14 76 5 71 2 131 0.75 # 207522 # 208025 # -1 # ID=2_209;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.325 2_272 - 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