# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 20_54 - 162 UPF0054 PF02130.12 145 9.2e-44 146.3 0.0 1 1 2.8e-47 1.1e-43 146.0 0.0 22 145 30 152 17 152 0.89 # 53044 # 53529 # 1 # ID=20_54;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.702 11_110 - 631 Sulfotransfer_3 PF13469.1 215 1.5e-18 66.2 9.7 1 1 1.6e-21 1.5e-18 66.2 9.7 2 210 367 551 366 556 0.64 # 128426 # 130318 # -1 # ID=11_110;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.738 11_40 - 527 Sulfotransfer_3 PF13469.1 215 1.8e-17 62.7 7.0 1 1 1.9e-20 1.8e-17 62.7 7.0 1 212 282 470 282 473 0.66 # 45436 # 47016 # 1 # ID=11_40;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.683 6_49 - 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393 Pyr_redox_2 PF07992.9 201 0.031 12.1 0.2 1 1 0.00049 0.054 11.4 0.2 1 35 4 38 4 119 0.79 # 164821 # 165999 # 1 # ID=6_138;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=3-4bp;gc_cont=0.707 9_27 - 333 RNA_pol_L PF01193.19 66 9.8e-25 83.5 0.0 1 1 4.1e-28 1.5e-24 82.9 0.0 1 65 28 227 28 228 0.97 # 13483 # 14481 # 1 # ID=9_27;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.652 18_50 - 334 Gp_dh_N PF00044.19 151 1.1e-60 202.0 0.0 1 1 9.1e-64 1.7e-60 201.4 0.0 1 151 3 152 3 152 0.98 # 63886 # 64887 # -1 # ID=18_50;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.640 2_227 - 342 Gp_dh_N PF00044.19 151 0.0063 14.5 0.0 1 1 5.8e-06 0.011 13.7 0.0 62 151 48 134 5 134 0.84 # 272420 # 273445 # -1 # ID=2_227;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.663 9_18 - 176 Ribosomal_L6 PF00347.18 77 4.6e-37 124.4 0.1 1 2 4.1e-17 1.5e-13 49.0 0.1 2 77 12 80 11 80 0.92 # 7997 # 8524 # 1 # ID=9_18;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.657 9_18 - 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620 MobB PF03205.9 140 0.0013 16.4 0.3 1 2 0.028 3.1 5.5 0.1 2 20 29 47 28 71 0.88 # 165999 # 167858 # -1 # ID=8_128;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.703 8_128 - 620 MobB PF03205.9 140 0.0013 16.4 0.3 2 2 0.0038 0.43 8.3 0.0 2 23 341 362 340 365 0.87 # 165999 # 167858 # -1 # ID=8_128;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.703 13_44 - 1000 MobB PF03205.9 140 0.0036 15.0 0.2 1 1 0.0024 0.27 9.0 0.1 4 32 639 667 637 671 0.86 # 55815 # 58814 # 1 # ID=13_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.681 2_143 - 167 MobB PF03205.9 140 0.0048 14.6 0.0 1 1 7e-05 0.008 13.9 0.0 1 20 1 20 1 37 0.86 # 164727 # 165227 # -1 # ID=2_143;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.717 18_63 - 206 MobB PF03205.9 140 0.0062 14.2 0.0 1 1 8.6e-05 0.0097 13.6 0.0 2 30 25 53 24 58 0.83 # 76318 # 76935 # 1 # ID=18_63;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.717 17_3 - 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665 MMR_HSR1 PF01926.18 116 2.2e-08 32.1 0.0 2 2 0.097 11 4.1 0.0 4 18 499 513 496 583 0.91 # 16164 # 18158 # -1 # ID=18_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.695 2_190 - 652 MMR_HSR1 PF01926.18 116 4.8e-08 31.0 0.0 1 1 9.4e-10 1e-07 29.9 0.0 2 116 155 260 154 260 0.77 # 233531 # 235486 # -1 # ID=2_190;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.685 4_138 - 376 MMR_HSR1 PF01926.18 116 1.4e-07 29.5 0.0 1 1 2.1e-09 2.3e-07 28.8 0.0 2 67 206 275 205 327 0.67 # 166000 # 167127 # -1 # ID=4_138;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.723 25_10 - 535 MMR_HSR1 PF01926.18 116 3.4e-07 28.3 0.0 1 1 5.1e-08 5.6e-06 24.3 0.0 2 116 14 141 13 141 0.64 # 12036 # 13640 # 1 # ID=25_10;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.671 13_4 - 688 MMR_HSR1 PF01926.18 116 8e-06 23.8 0.0 1 1 2.1e-07 2.4e-05 22.3 0.0 3 116 13 140 11 140 0.71 # 4244 # 6307 # -1 # ID=13_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.725 8_128 - 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253 Methyltransf_26 PF13659.1 117 0.019 13.0 0.9 1 1 0.00036 0.033 12.2 0.9 8 78 10 83 3 126 0.70 # 41770 # 42528 # 1 # ID=1_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.702 8_90 - 592 Methyltransf_26 PF13659.1 117 0.088 10.9 2.7 1 1 0.0071 0.64 8.1 2.4 9 90 42 124 36 215 0.86 # 125634 # 127409 # 1 # ID=8_90;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.721 6_70 - 342 NAD_Gly3P_dh_N PF01210.18 157 6.2e-53 176.7 0.0 1 1 3.8e-55 1e-52 176.0 0.0 1 150 8 158 8 165 0.99 # 85620 # 86645 # 1 # ID=6_70;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.718 1_200 - 449 NAD_Gly3P_dh_N PF01210.18 157 2.6e-05 22.0 0.5 1 1 1.1e-06 0.00029 18.6 0.2 2 79 3 86 2 161 0.73 # 229910 # 231256 # -1 # ID=1_200;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.666 5_227 - 389 NAD_Gly3P_dh_N PF01210.18 157 6.5e-05 20.7 0.1 1 1 4.7e-07 0.00013 19.8 0.1 1 81 2 85 2 108 0.86 # 240968 # 242134 # 1 # ID=5_227;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.581 1_82 - 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991 Plug PF07715.10 108 1.2e-24 84.7 4.1 1 1 4.1e-26 2.7e-24 83.6 1.6 4 108 59 175 56 175 0.96 # 143996 # 146968 # -1 # ID=3_114;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.678 3_221 - 931 Plug PF07715.10 108 2e-24 84.0 1.7 1 1 7.9e-26 5.2e-24 82.7 1.7 4 108 59 175 56 175 0.95 # 275503 # 278295 # -1 # ID=3_221;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.695 4_176 - 963 Plug PF07715.10 108 2e-24 84.0 1.4 1 1 7.5e-26 4.9e-24 82.8 1.4 6 108 60 183 55 183 0.94 # 204042 # 206930 # -1 # ID=4_176;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.683 8_130 - 797 Plug PF07715.10 108 6.4e-24 82.4 1.0 1 1 2.3e-25 1.5e-23 81.2 1.0 3 108 51 171 49 171 0.95 # 170952 # 173342 # 1 # ID=8_130;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.688 8_129 - 797 Plug PF07715.10 108 1.5e-23 81.2 0.8 1 1 8.3e-25 5.4e-23 79.4 0.2 3 108 48 168 46 168 0.96 # 168110 # 170500 # 1 # ID=8_129;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.688 2_249 - 952 Plug PF07715.10 108 2e-23 80.8 1.5 1 1 5.9e-25 3.9e-23 79.9 1.5 4 108 71 187 68 187 0.94 # 294903 # 297758 # 1 # ID=2_249;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.674 8_158 - 813 Plug PF07715.10 108 2.1e-23 80.7 0.7 1 1 7.4e-25 4.9e-23 79.6 0.7 3 108 50 172 48 172 0.91 # 207701 # 210139 # 1 # ID=8_158;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.697 2_154 - 943 Plug PF07715.10 108 2.2e-23 80.7 2.5 1 1 6.8e-25 4.5e-23 79.7 1.3 4 108 71 186 69 186 0.90 # 185041 # 187869 # -1 # ID=2_154;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.678 11_41 - 919 Plug PF07715.10 108 4.4e-23 79.7 0.6 1 1 6.7e-25 4.4e-23 79.7 0.6 3 108 47 164 45 164 0.94 # 47063 # 49819 # -1 # ID=11_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.608 2_347 - 971 Plug PF07715.10 108 1.8e-22 77.8 3.1 1 1 2.7e-23 1.8e-21 74.5 0.1 4 108 40 156 38 156 0.96 # 403258 # 406170 # -1 # ID=2_347;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.667 8_137 - 710 Plug PF07715.10 108 3.1e-22 77.0 0.8 1 1 1.4e-23 9.5e-22 75.4 0.8 3 108 61 171 59 171 0.93 # 182295 # 184424 # 1 # ID=8_137;partial=00;start_type=TTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.696 15_97 - 951 Plug PF07715.10 108 1.1e-21 75.2 1.3 1 1 3.3e-23 2.1e-21 74.3 0.7 5 108 45 159 41 159 0.93 # 95989 # 98841 # 1 # ID=15_97;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.682 8_29 - 995 Plug PF07715.10 108 1.2e-18 65.4 4.6 1 1 4e-20 2.6e-18 64.3 1.9 2 108 130 247 129 247 0.92 # 39636 # 42620 # 1 # ID=8_29;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.672 7_92 - 944 Plug PF07715.10 108 2.2e-18 64.6 2.4 1 1 8.7e-20 5.7e-18 63.2 2.4 4 108 66 181 63 181 0.90 # 115153 # 117984 # 1 # ID=7_92;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.669 9_51 - 833 Plug PF07715.10 108 6.1e-18 63.1 0.3 1 1 4.5e-19 3e-17 60.9 0.0 2 108 55 167 54 167 0.89 # 42787 # 45285 # -1 # ID=9_51;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.693 18_23 - 685 Plug PF07715.10 108 9.5e-18 62.5 0.1 1 1 3.5e-19 2.3e-17 61.3 0.1 3 107 57 165 55 166 0.97 # 25450 # 27504 # -1 # ID=18_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.700 24_16 - 684 Plug PF07715.10 108 2.4e-17 61.3 0.5 1 1 8.9e-19 5.9e-17 60.0 0.5 3 107 47 155 45 156 0.97 # 13457 # 15508 # -1 # ID=24_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.673 13_20 - 966 Plug PF07715.10 108 2.6e-17 61.1 2.9 1 1 6.5e-18 4.3e-16 57.2 0.9 6 108 156 263 151 263 0.93 # 26749 # 29646 # 1 # ID=13_20;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.692 10_22 - 709 Plug PF07715.10 108 2.9e-17 61.0 0.8 1 1 1.1e-18 7.2e-17 59.7 0.8 24 108 70 158 50 158 0.92 # 21020 # 23146 # 1 # ID=10_22;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.729 5_74 - 703 Plug PF07715.10 108 3.6e-17 60.7 0.7 1 1 1.2e-18 8e-17 59.6 0.1 3 107 69 166 67 167 0.89 # 80968 # 83076 # -1 # ID=5_74;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.703 4_132 - 820 Plug PF07715.10 108 3.7e-17 60.6 1.0 1 1 1.8e-18 1.2e-16 59.0 1.0 2 108 60 173 59 173 0.89 # 157755 # 160214 # 1 # ID=4_132;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.690 3_237 - 1044 Plug PF07715.10 108 1.2e-16 59.0 3.7 1 1 2.5e-18 1.6e-16 58.6 2.1 2 107 68 186 67 187 0.95 # 302929 # 306060 # -1 # ID=3_237;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.656 3_45 - 1034 Plug PF07715.10 108 1.8e-16 58.4 0.7 1 1 2.7e-18 1.8e-16 58.4 0.7 2 108 71 179 70 179 0.93 # 54315 # 57416 # -1 # ID=3_45;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.660 4_185 - 878 Plug PF07715.10 108 2.3e-16 58.1 0.1 1 1 1.2e-17 7.9e-16 56.4 0.1 8 108 58 162 50 162 0.91 # 218003 # 220636 # 1 # ID=4_185;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.667 8_23 - 896 Plug PF07715.10 108 3.1e-15 54.4 0.2 1 1 4.8e-17 3.1e-15 54.4 0.2 3 108 61 172 59 172 0.92 # 25419 # 28106 # 1 # ID=8_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.630 1_374 - 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913 Plug PF07715.10 108 8.3e-14 49.9 3.8 1 1 1.8e-15 1.2e-13 49.4 0.7 9 108 68 173 59 173 0.93 # 5633 # 8371 # -1 # ID=32_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.669 10_94 - 736 Plug PF07715.10 108 1.5e-13 49.0 2.5 1 1 5.6e-15 3.7e-13 47.8 0.4 2 103 67 160 66 165 0.93 # 100493 # 102700 # 1 # ID=10_94;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.692 21_25 - 901 Plug PF07715.10 108 3.8e-13 47.7 0.6 1 1 2e-14 1.3e-12 46.0 0.2 9 99 95 184 88 192 0.92 # 27852 # 30554 # 1 # ID=21_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.682 10_70 - 832 Plug PF07715.10 108 1.1e-12 46.3 0.2 1 1 1.6e-14 1.1e-12 46.3 0.2 2 108 120 231 119 231 0.94 # 75227 # 77722 # 1 # ID=10_70;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.672 1_274 - 685 Plug PF07715.10 108 1.4e-12 45.9 0.0 1 1 6e-14 4e-12 44.5 0.0 21 108 64 151 51 151 0.90 # 312602 # 314656 # -1 # ID=1_274;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.716 8_75 - 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714 Plug PF07715.10 108 1.3e-06 26.7 0.2 1 1 4.5e-08 2.9e-06 25.6 0.2 6 106 61 155 58 157 0.89 # 17061 # 19202 # -1 # ID=9_31;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.681 6_16 - 797 Plug PF07715.10 108 1.7e-05 23.1 2.7 1 1 7.6e-07 5e-05 21.6 2.7 8 107 84 192 78 193 0.80 # 23253 # 25643 # -1 # ID=6_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.703 20_25 - 1081 Plug PF07715.10 108 4.4e-05 21.8 2.8 1 1 6.7e-07 4.4e-05 21.8 2.8 6 104 142 243 138 247 0.88 # 25477 # 28719 # -1 # ID=20_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.644 9_120 - 626 PIF1 PF05970.9 364 9.7e-05 19.5 0.0 1 1 7.9e-08 0.00015 18.9 0.0 6 127 21 144 19 150 0.81 # 120770 # 122647 # 1 # ID=9_120;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.724 3_103 - 229 PIF1 PF05970.9 364 0.0015 15.6 0.0 1 1 1.2e-06 0.0022 15.0 0.0 17 53 25 61 13 63 0.82 # 130121 # 130807 # -1 # ID=3_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.703 6_156 - 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283 Methyltransf_23 PF13489.1 161 8.1e-14 49.7 0.0 1 1 1e-15 1.3e-13 49.0 0.0 14 121 54 182 41 223 0.74 # 73738 # 74586 # 1 # ID=14_77;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.715 4_249 - 254 Methyltransf_23 PF13489.1 161 2.2e-13 48.3 0.0 1 1 2.6e-15 3.3e-13 47.7 0.0 12 157 56 233 47 236 0.78 # 297541 # 298302 # -1 # ID=4_249;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.663 1_192 - 334 Methyltransf_23 PF13489.1 161 6.7e-13 46.7 0.0 1 1 8.3e-15 1e-12 46.1 0.0 11 160 136 286 122 287 0.79 # 219550 # 220551 # 1 # ID=1_192;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.703 2_265 - 298 Methyltransf_23 PF13489.1 161 1e-12 46.1 0.0 1 1 1.6e-14 2e-12 45.1 0.0 5 153 93 243 88 245 0.74 # 316392 # 317285 # -1 # ID=2_265;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.699 2_113 - 202 Methyltransf_23 PF13489.1 161 3e-12 44.6 0.0 1 1 2.9e-14 3.7e-12 44.3 0.0 6 121 26 153 14 185 0.72 # 129825 # 130430 # 1 # ID=2_113;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.715 2_262 - 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