# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 4_62 - 159 UPF0054 PF02130.12 145 7.4e-44 145.7 0.7 1 1 4.3e-47 8.3e-44 145.5 0.7 16 144 19 147 5 148 0.93 # 63406 # 63882 # -1 # ID=4_62;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.298 3_284 - 503 Mg_chelatase PF01078.16 207 5e-97 320.1 0.0 1 1 4.7e-99 7.1e-97 319.6 0.0 1 205 190 394 190 396 0.99 # 287343 # 288851 # -1 # ID=3_284;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.368 2_141 - 414 Mg_chelatase PF01078.16 207 6.8e-08 29.0 0.1 1 2 5e-06 0.00076 15.8 0.1 4 61 17 75 14 92 0.69 # 151948 # 153189 # 1 # ID=2_141;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.326 2_141 - 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274 MobB PF03205.9 140 0.0074 13.1 0.4 1 1 0.00019 0.015 12.1 0.4 4 49 12 57 9 146 0.79 # 136455 # 137276 # 1 # ID=3_144;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.348 9_30 - 439 MobB PF03205.9 140 0.0077 13.0 0.0 1 1 0.00035 0.027 11.3 0.0 1 20 202 221 202 231 0.87 # 26058 # 27374 # -1 # ID=9_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.346 3_225 - 323 MobB PF03205.9 140 0.008 13.0 1.5 1 1 0.00041 0.032 11.0 0.3 3 34 50 81 47 88 0.83 # 220600 # 221568 # -1 # ID=3_225;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.330 4_171 - 244 MobB PF03205.9 140 0.0094 12.8 0.4 1 2 0.046 3.6 4.4 0.1 2 21 33 52 32 69 0.83 # 164270 # 165001 # 1 # ID=4_171;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.376 4_171 - 244 MobB PF03205.9 140 0.0094 12.8 0.4 2 2 0.012 0.93 6.3 0.0 17 67 178 225 177 236 0.80 # 164270 # 165001 # 1 # ID=4_171;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.376 5_43 - 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458 Zeta_toxin PF06414.7 201 6.9e-08 28.9 0.1 1 1 1.4e-09 1.4e-07 27.9 0.1 12 92 96 177 85 210 0.79 # 238826 # 240199 # 1 # ID=4_233;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.339 10_9 - 875 Zeta_toxin PF06414.7 201 3.2e-07 26.7 0.0 1 2 0.017 1.8 4.7 0.0 20 40 223 243 214 253 0.82 # 12790 # 15414 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.359 10_9 - 875 Zeta_toxin PF06414.7 201 3.2e-07 26.7 0.0 2 2 8.3e-07 8.6e-05 18.8 0.0 11 57 599 648 589 685 0.82 # 12790 # 15414 # -1 # ID=10_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.359 4_241 - 171 Zeta_toxin PF06414.7 201 4.7e-05 19.6 0.1 1 1 2.5e-06 0.00026 17.2 0.1 16 53 2 39 1 169 0.74 # 246772 # 247284 # 1 # ID=4_241;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.275 2_257 - 660 Zeta_toxin PF06414.7 201 5.3e-05 19.5 0.0 1 1 1.1e-06 0.00012 18.4 0.0 15 56 194 234 183 256 0.85 # 282721 # 284700 # 1 # ID=2_257;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.377 4_25 - 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936 tRNA-synt_1f PF01921.13 360 3.6e-08 29.5 0.0 2 2 1.2e-09 4.6e-07 25.9 0.0 265 340 580 656 558 676 0.85 # 38286 # 41093 # 1 # ID=3_35;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.357 7_105 - 463 tRNA-synt_1f PF01921.13 360 6.3e-08 28.7 0.2 1 2 0.00038 0.15 7.8 0.0 29 73 27 71 10 105 0.74 # 91683 # 93071 # 1 # ID=7_105;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.336 7_105 - 463 tRNA-synt_1f PF01921.13 360 6.3e-08 28.7 0.2 2 2 2.4e-07 9.6e-05 18.3 0.0 279 319 262 302 233 326 0.85 # 91683 # 93071 # 1 # ID=7_105;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.336 4_210 - 814 tRNA-synt_1f PF01921.13 360 5.7e-07 25.6 0.1 1 2 0.00028 0.11 8.2 0.0 31 69 41 79 15 82 0.72 # 217656 # 220097 # -1 # ID=4_210;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.344 4_210 - 814 tRNA-synt_1f PF01921.13 360 5.7e-07 25.6 0.1 2 2 4.3e-06 0.0017 14.2 0.0 276 320 569 614 558 663 0.78 # 217656 # 220097 # -1 # ID=4_210;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.344 3_4 - 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335 ABC_tran PF00005.22 137 0.0068 13.8 0.0 1 1 0.00037 0.016 12.6 0.0 2 34 150 182 149 189 0.89 # 343299 # 344303 # -1 # ID=3_332;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.376 4_25 - 456 ABC_tran PF00005.22 137 0.007 13.8 0.1 1 1 0.00074 0.033 11.6 0.1 13 94 53 220 47 261 0.59 # 21469 # 22836 # -1 # ID=4_25;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.347 4_181 - 347 ABC_tran PF00005.22 137 0.0076 13.7 0.0 1 1 0.00041 0.018 12.4 0.0 14 35 60 81 55 122 0.82 # 176189 # 177229 # 1 # ID=4_181;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.359 1_17 - 191 ABC_tran PF00005.22 137 0.0077 13.6 0.3 1 1 0.00026 0.012 13.1 0.3 19 42 11 34 4 177 0.74 # 15670 # 16242 # -1 # ID=1_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.326 9_37 - 419 ABC_tran PF00005.22 137 0.0079 13.6 0.1 1 1 0.00053 0.023 12.1 0.1 12 36 107 131 100 192 0.89 # 33682 # 34938 # -1 # ID=9_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.333 1_237 - 453 ABC_tran PF00005.22 137 0.0089 13.4 7.9 1 1 0.0018 0.079 10.4 7.9 10 66 215 283 211 416 0.56 # 228241 # 229599 # 1 # ID=1_237;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.331 3_218 - 208 ABC_tran PF00005.22 137 0.012 13.0 0.2 1 1 0.00031 0.014 12.8 0.2 11 42 3 35 1 203 0.84 # 211988 # 212611 # -1 # ID=3_218;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.345 5_118 - 353 ABC_tran PF00005.22 137 0.014 12.8 0.4 1 1 0.00063 0.028 11.8 0.1 9 45 55 91 52 186 0.89 # 116280 # 117338 # -1 # ID=5_118;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.384 9_30 - 439 ABC_tran PF00005.22 137 0.014 12.8 0.3 1 1 0.0025 0.11 9.9 0.0 13 42 203 232 191 332 0.71 # 26058 # 27374 # -1 # ID=9_30;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA/GGAG/GAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.346 3_200 - 395 ABC_tran PF00005.22 137 0.02 12.3 0.0 1 1 0.00073 0.032 11.6 0.0 9 58 10 59 7 168 0.85 # 188908 # 190092 # -1 # ID=3_200;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.414 2_121 - 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185 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1e-50 168.8 0.0 1 1 5.1e-53 1.1e-50 168.7 0.0 1 177 6 176 6 182 0.93 # 71069 # 71623 # 1 # ID=1_73;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.321 4_270 - 718 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 6.3e-10 35.8 0.1 1 3 0.06 13 2.2 0.0 41 61 194 214 186 241 0.83 # 274735 # 276888 # -1 # ID=4_270;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.318 4_270 - 718 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 6.3e-10 35.8 0.1 2 3 0.026 5.7 3.4 0.1 72 130 264 318 255 329 0.77 # 274735 # 276888 # -1 # ID=4_270;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.318 4_270 - 718 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 6.3e-10 35.8 0.1 3 3 3.7e-09 8e-07 25.7 0.0 39 143 554 655 546 682 0.84 # 274735 # 276888 # -1 # ID=4_270;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.318 7_106 - 315 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 2.6e-09 33.8 0.0 1 1 2.1e-11 4.7e-09 33.0 0.0 29 129 123 218 115 235 0.76 # 93075 # 94019 # 1 # ID=7_106;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.330 3_158 - 291 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 3e-07 27.1 0.0 1 1 3.6e-09 7.9e-07 25.7 0.0 25 126 103 198 85 228 0.76 # 146908 # 147780 # -1 # ID=3_158;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.292 4_97 - 281 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 6.1e-05 19.6 0.0 1 1 5.9e-07 0.00013 18.5 0.0 34 93 138 197 131 217 0.86 # 101003 # 101845 # 1 # ID=4_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.314 2_182 - 680 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00011 18.8 0.1 1 2 8.3e-05 0.018 11.5 0.0 93 128 95 131 72 167 0.73 # 189643 # 191682 # 1 # ID=2_182;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.297 2_182 - 680 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00011 18.8 0.1 2 2 0.018 3.9 3.9 0.0 42 57 430 445 419 449 0.80 # 189643 # 191682 # 1 # ID=2_182;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.297 2_40 - 242 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.00031 17.3 0.0 1 1 2.1e-06 0.00046 16.7 0.0 41 136 80 181 67 220 0.74 # 40534 # 41259 # -1 # ID=2_40;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.296 2_309 - 449 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0011 15.5 0.0 1 1 8.2e-06 0.0018 14.8 0.0 42 139 300 393 287 418 0.75 # 339397 # 340743 # 1 # ID=2_309;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.325 4_47 - 496 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0025 14.3 0.0 1 1 2.9e-05 0.0063 13.0 0.0 42 130 202 294 188 304 0.70 # 43078 # 44565 # 1 # ID=4_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.347 4_47 - 496 Eco57I PF07669.6 106 8.4e-07 26.4 0.0 1 1 9.1e-09 3e-06 24.7 0.0 2 105 277 389 275 390 0.85 # 43078 # 44565 # 1 # ID=4_47;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.347 9_41 - 482 Eco57I PF07669.6 106 1.3e-06 25.8 0.2 1 1 2.1e-08 7e-06 23.5 0.0 3 103 281 383 278 386 0.81 # 37518 # 38963 # -1 # ID=9_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.337 7_106 - 315 Eco57I PF07669.6 106 0.0012 16.3 0.0 1 1 1e-05 0.0034 14.8 0.0 2 21 203 222 202 258 0.84 # 93075 # 94019 # 1 # ID=7_106;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.330 5_131 - 310 Eco57I PF07669.6 106 0.002 15.5 0.0 1 1 1.7e-05 0.0054 14.2 0.0 30 105 3 78 1 79 0.93 # 126613 # 127542 # 1 # ID=5_131;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.345 3_158 - 291 Eco57I PF07669.6 106 0.0046 14.4 0.4 1 1 5.2e-05 0.017 12.6 0.4 2 25 186 208 185 266 0.74 # 146908 # 147780 # -1 # ID=3_158;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.292 1_163 - 760 Eco57I PF07669.6 106 0.0055 14.2 2.0 1 1 8.7e-05 0.029 11.9 0.0 3 101 489 609 485 613 0.88 # 151515 # 153794 # -1 # ID=1_163;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.322 9_33 - 311 IPPT PF01715.12 253 2.6e-84 279.2 1.0 1 1 1.6e-87 3.1e-84 279.0 1.0 2 248 38 287 37 293 0.97 # 28499 # 29431 # -1 # ID=9_33;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.344 7_105 - 463 tRNA-synt_1e PF01406.14 301 4.4e-135 446.7 0.4 1 1 8.9e-138 4.4e-135 446.7 0.4 2 300 14 312 13 313 0.99 # 91683 # 93071 # 1 # ID=7_105;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.336 3_4 - 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