# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 3_66 - 209 UPF0054 PF02130.12 145 2.1e-38 128.2 0.0 1 1 1.1e-41 2.5e-38 127.9 0.0 17 143 21 149 3 151 0.86 # 79504 # 80130 # -1 # ID=3_66;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.656 2_49 - 555 Mg_chelatase PF01078.16 207 6.5e-83 274.3 0.1 1 1 9.4e-85 9.5e-83 273.7 0.1 1 204 233 436 233 439 0.94 # 62365 # 64029 # 1 # ID=2_49;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG(G)/GGAGG;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.658 9_42 - 567 Mg_chelatase PF01078.16 207 2.4e-08 30.7 0.0 1 2 0.0026 0.26 7.7 0.1 25 47 50 72 43 77 0.90 # 51533 # 53233 # -1 # ID=9_42;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.616 9_42 - 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558 Helicase_C PF00271.26 78 8.4e-13 45.4 0.0 1 1 1.9e-14 1.9e-12 44.2 0.0 9 77 440 509 434 510 0.92 # 301944 # 303617 # 1 # ID=3_258;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.633 4_74 - 792 Helicase_C PF00271.26 78 2e-12 44.1 0.0 1 1 1.1e-13 1.1e-11 41.7 0.0 5 78 328 401 325 401 0.96 # 74911 # 77286 # -1 # ID=4_74;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.679 3_11 - 1091 Helicase_C PF00271.26 78 2.7e-12 43.7 0.1 1 1 9.7e-14 9.7e-12 41.9 0.1 21 78 771 828 735 828 0.85 # 17155 # 20427 # -1 # ID=3_11;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.612 11_14 - 988 Helicase_C PF00271.26 78 4e-11 40.0 0.1 1 1 1.3e-12 1.3e-10 38.4 0.1 7 76 487 556 483 557 0.95 # 14121 # 17084 # -1 # ID=11_14;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.504 2_129 - 1339 Helicase_C PF00271.26 78 4e-10 36.8 0.1 1 1 9.2e-12 9.3e-10 35.6 0.1 8 77 281 366 277 367 0.92 # 157538 # 161554 # -1 # ID=2_129;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.604 1_389 - 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1041 MMR_HSR1 PF01926.18 116 8.1e-07 26.3 0.0 2 3 0.0015 0.085 10.2 0.0 3 20 580 597 578 645 0.91 # 106292 # 109414 # 1 # ID=1_132;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.677 1_132 - 1041 MMR_HSR1 PF01926.18 116 8.1e-07 26.3 0.0 3 3 0.027 1.6 6.1 0.0 2 58 800 855 799 893 0.71 # 106292 # 109414 # 1 # ID=1_132;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.677 5_5 - 639 MMR_HSR1 PF01926.18 116 1.1e-06 25.9 0.0 1 1 4.2e-08 2.4e-06 24.8 0.0 2 116 9 137 8 137 0.62 # 4234 # 6150 # 1 # ID=5_5;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.655 2_84 - 1033 MMR_HSR1 PF01926.18 116 1.7e-06 25.3 0.1 1 1 6.8e-08 4e-06 24.1 0.1 2 116 533 642 532 642 0.73 # 101844 # 104942 # 1 # ID=2_84;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.662 4_219 - 706 MMR_HSR1 PF01926.18 116 2.7e-06 24.7 0.0 1 1 1e-07 5.8e-06 23.6 0.0 3 116 16 138 14 138 0.68 # 246552 # 248669 # 1 # ID=4_219;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.615 1_350 - 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500 RNA_helicase PF00910.17 107 0.02 12.4 0.1 2 2 0.088 8.8 3.9 0.0 2 18 303 319 302 353 0.86 # 160869 # 162368 # 1 # ID=1_180;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.691 2_193 - 457 RNA_helicase PF00910.17 107 0.022 12.3 0.0 1 1 0.00037 0.038 11.5 0.0 1 21 65 85 65 159 0.83 # 234396 # 235766 # 1 # ID=2_193;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.646 9_67 - 204 RNA_helicase PF00910.17 107 0.023 12.2 0.0 1 1 0.00041 0.041 11.4 0.0 1 21 15 35 15 53 0.85 # 80858 # 81469 # 1 # ID=9_67;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.637 1_234 - 345 RNA_helicase PF00910.17 107 0.024 12.1 0.0 1 1 0.00044 0.044 11.3 0.0 2 19 39 56 38 90 0.86 # 215912 # 216946 # -1 # ID=1_234;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.640 5_15 - 378 RNA_helicase PF00910.17 107 0.025 12.1 0.0 1 1 0.00088 0.088 10.3 0.0 2 19 48 65 47 72 0.89 # 15839 # 16972 # 1 # ID=5_15;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG/GGAGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.635 7_69 - 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