# --- full sequence --- -------------- this domain ------------- hmm coord ali coord env coord # target name accession tlen query name accession qlen E-value score bias # of c-Evalue i-Evalue score bias from to from to from to acc description of target #------------------- ---------- ----- -------------------- ---------- ----- --------- ------ ----- --- --- --------- --------- ------ ----- ----- ----- ----- ----- ----- ----- ---- --------------------- 4_162 - 159 UPF0054 PF02130.12 145 8.7e-40 133.1 0.1 1 1 3.1e-43 9.8e-40 132.9 0.1 18 145 21 145 5 145 0.85 # 184982 # 185458 # -1 # ID=4_162;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.382 22_16 - 504 Mg_chelatase PF01078.16 207 7.5e-96 317.0 0.0 1 1 8.9e-98 1.5e-95 316.0 0.0 1 206 190 395 190 396 0.99 # 12232 # 13743 # -1 # ID=22_16;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.420 1_199 - 425 Mg_chelatase PF01078.16 207 5.5e-08 30.0 0.4 1 2 7e-08 1.2e-05 22.4 0.7 20 47 108 135 74 162 0.78 # 234038 # 235312 # -1 # ID=1_199;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.376 1_199 - 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228 MobB PF03205.9 140 0.0073 13.8 0.0 1 1 0.0002 0.017 12.6 0.0 2 18 37 53 36 56 0.89 # 43400 # 44083 # -1 # ID=10_41;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.421 2_97 - 645 MobB PF03205.9 140 0.0076 13.7 0.0 1 1 0.00039 0.033 11.7 0.0 5 36 188 218 185 302 0.88 # 95403 # 97337 # 1 # ID=2_97;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 11_12 - 364 MobB PF03205.9 140 0.0084 13.6 0.1 1 1 0.0053 0.45 8.0 0.0 4 28 6 30 4 58 0.78 # 11076 # 12167 # 1 # ID=11_12;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.435 14_59 - 433 MobB PF03205.9 140 0.0092 13.5 0.1 1 1 0.00031 0.026 12.0 0.1 2 23 38 59 37 69 0.85 # 65573 # 66871 # -1 # ID=14_59;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.425 1_173 - 342 MobB PF03205.9 140 0.012 13.1 0.0 1 1 0.0012 0.1 10.0 0.0 2 23 29 49 28 60 0.84 # 205050 # 206075 # 1 # ID=1_173;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.392 12_62 - 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248 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 7.9e-06 22.7 0.5 1 1 6.2e-08 1.1e-05 22.2 0.5 2 127 7 141 6 184 0.66 # 21814 # 22557 # 1 # ID=2_26;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.407 4_104 - 270 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 5e-05 20.1 0.0 1 1 3.4e-07 6.2e-05 19.8 0.0 1 75 5 80 5 132 0.87 # 126217 # 127026 # 1 # ID=4_104;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.381 9_8 - 249 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 5.4e-05 20.0 0.4 1 1 5.9e-07 0.00011 19.0 0.4 1 150 7 175 7 192 0.59 # 6764 # 7510 # -1 # ID=9_8;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.373 13_84 - 253 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 0.00029 17.6 0.0 1 1 2.2e-06 0.00041 17.1 0.0 2 166 12 184 11 206 0.68 # 79233 # 79991 # -1 # ID=13_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.415 2_252 - 283 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 0.00032 17.4 0.0 1 1 2.5e-06 0.00047 16.9 0.0 1 114 4 122 4 130 0.73 # 266523 # 267371 # 1 # ID=2_252;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.366 1_135 - 241 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 0.0008 16.1 0.0 1 1 5.8e-06 0.0011 15.7 0.0 92 169 95 176 7 180 0.65 # 155058 # 155780 # 1 # ID=1_135;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.362 25_17 - 258 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 0.0018 15.0 0.0 1 1 1.1e-05 0.002 14.8 0.0 1 107 9 119 9 198 0.74 # 18666 # 19439 # -1 # ID=25_17;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.421 37_7 - 341 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 0.0028 14.4 0.1 1 1 0.00011 0.02 11.5 0.0 1 80 24 104 24 112 0.81 # 6104 # 7126 # 1 # ID=37_7;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGxAGG/AGGxGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.342 9_9 - 247 Polysacc_synt_2 PF02719.10 294 0.012 12.3 0.0 1 1 9.1e-05 0.017 11.8 0.0 2 74 7 74 6 143 0.51 # 7689 # 8429 # -1 # ID=9_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.408 13_91 - 119 Ribosomal_S13 PF00416.17 107 3.8e-39 131.2 0.4 1 1 4.2e-42 4.4e-39 131.0 0.4 1 107 3 108 3 108 0.99 # 84622 # 84978 # -1 # ID=13_91;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.367 22_41 - 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266 Methyltransf_25 PF13649.1 101 8e-14 49.6 0.0 1 1 1.6e-15 1.6e-13 48.7 0.0 1 95 43 131 43 137 0.86 # 35519 # 36316 # -1 # ID=11_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.397 1_37 - 231 Methyltransf_25 PF13649.1 101 2.2e-13 48.2 0.0 1 1 4e-15 3.8e-13 47.4 0.0 1 101 55 145 55 145 0.95 # 45780 # 46472 # -1 # ID=1_37;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.378 33_3 - 240 Methyltransf_25 PF13649.1 101 4.2e-13 47.3 0.0 1 1 1.8e-14 1.7e-12 45.3 0.0 2 101 45 137 44 137 0.91 # 2489 # 3208 # 1 # ID=33_3;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.319 3_96 - 251 Methyltransf_25 PF13649.1 101 5.3e-13 47.0 0.1 1 1 1e-14 9.6e-13 46.2 0.1 1 101 66 163 66 163 0.91 # 112956 # 113708 # 1 # ID=3_96;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.408 10_82 - 335 Methyltransf_25 PF13649.1 101 9.7e-13 46.1 0.0 1 1 1.9e-14 1.9e-12 45.2 0.0 1 98 96 186 96 189 0.86 # 89666 # 90670 # -1 # ID=10_82;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.406 11_52 - 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952 ABC_tran PF00005.22 137 9.5e-22 75.5 0.1 3 4 3.7e-05 0.0018 16.3 0.1 1 29 622 650 622 660 0.95 # 50368 # 53223 # -1 # ID=13_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.433 13_56 - 952 ABC_tran PF00005.22 137 9.5e-22 75.5 0.1 4 4 2.6e-07 1.3e-05 23.3 0.0 90 136 810 859 757 860 0.80 # 50368 # 53223 # -1 # ID=13_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.433 27_39 - 475 ABC_tran PF00005.22 137 2e-19 68.0 0.0 1 1 9.7e-21 4.8e-19 66.8 0.0 1 135 80 211 80 213 0.82 # 46683 # 48107 # -1 # ID=27_39;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.371 21_4 - 354 ABC_tran PF00005.22 137 2.4e-06 25.6 1.7 1 2 5.6e-05 0.0028 15.7 0.1 16 34 28 46 22 52 0.90 # 3405 # 4466 # 1 # ID=21_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.355 21_4 - 354 ABC_tran PF00005.22 137 2.4e-06 25.6 1.7 2 2 0.013 0.63 8.1 0.2 96 125 240 284 139 301 0.57 # 3405 # 4466 # 1 # ID=21_4;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.355 10_74 - 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859 ABC_tran PF00005.22 137 3.6e-05 21.8 1.5 1 1 0.0021 0.11 10.6 0.0 16 49 603 637 599 657 0.77 # 102847 # 105423 # 1 # ID=1_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.407 1_124 - 380 ABC_tran PF00005.22 137 5.4e-05 21.3 0.5 1 1 6.5e-06 0.00032 18.8 0.5 6 38 155 187 152 334 0.69 # 144946 # 146085 # -1 # ID=1_124;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.403 21_11 - 415 ABC_tran PF00005.22 137 6.6e-05 21.0 0.0 1 1 7.2e-06 0.00035 18.6 0.0 13 70 199 255 194 329 0.65 # 13624 # 14868 # 1 # ID=21_11;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 2_151 - 176 ABC_tran PF00005.22 137 0.00011 20.3 0.1 1 1 3.7e-06 0.00018 19.6 0.1 10 45 5 42 1 170 0.69 # 170755 # 171282 # -1 # ID=2_151;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=4Base/6BMM;rbs_spacer=13-15bp;gc_cont=0.413 9_44 - 203 ABC_tran PF00005.22 137 0.00028 18.9 0.5 1 1 9.1e-06 0.00045 18.3 0.5 13 37 5 29 2 197 0.88 # 43624 # 44232 # 1 # ID=9_44;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.343 19_48 - 231 ABC_tran PF00005.22 137 0.00032 18.8 0.0 1 1 9e-06 0.00044 18.3 0.0 6 61 36 94 34 217 0.75 # 54013 # 54705 # 1 # ID=19_48;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.375 4_142 - 231 ABC_tran PF00005.22 137 0.0021 16.1 0.1 1 1 7.9e-05 0.0039 15.3 0.1 13 74 9 94 5 200 0.67 # 164947 # 165639 # 1 # ID=4_142;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGAG/GAGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.405 11_103 - 326 ABC_tran PF00005.22 137 0.0023 16.0 0.0 1 1 8.8e-05 0.0043 15.1 0.0 11 50 191 226 187 271 0.79 # 102701 # 103678 # 1 # ID=11_103;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.405 7_84 - 265 ABC_tran PF00005.22 137 0.0026 15.8 0.1 1 1 0.0046 0.22 9.6 0.0 8 31 98 121 94 132 0.87 # 84832 # 85626 # -1 # ID=7_84;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=AGGAG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.362 17_55 - 344 ABC_tran PF00005.22 137 0.003 15.6 0.0 1 1 0.00013 0.0062 14.6 0.0 13 36 64 87 60 130 0.78 # 51567 # 52598 # 1 # ID=17_55;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.421 4_41 - 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391 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 9.3e-10 35.9 0.0 1 1 6.1e-12 1.9e-09 34.9 0.0 41 128 219 301 209 340 0.77 # 114720 # 115892 # 1 # ID=5_98;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.396 12_77 - 220 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1.5e-07 28.7 0.0 1 1 7.6e-10 2.4e-07 28.1 0.0 36 125 40 131 17 138 0.74 # 80061 # 80720 # 1 # ID=12_77;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.338 9_104 - 290 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 8e-07 26.4 0.0 1 1 4.2e-09 1.3e-06 25.7 0.0 35 96 148 207 142 226 0.87 # 98885 # 99754 # 1 # ID=9_104;partial=00;start_type=GTG;rbs_motif=AGGA;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.433 10_53 - 311 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1.1e-06 25.9 0.0 1 1 7.6e-09 2.4e-06 24.8 0.0 35 153 134 250 122 262 0.78 # 60925 # 61857 # -1 # ID=10_53;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.394 21_23 - 708 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1.3e-06 25.7 0.0 1 2 0.011 3.4 4.8 0.0 48 61 200 213 188 262 0.84 # 27873 # 29996 # 1 # ID=21_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.386 21_23 - 708 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 1.3e-06 25.7 0.0 2 2 3.3e-06 0.001 16.2 0.0 43 136 542 633 534 675 0.78 # 27873 # 29996 # 1 # ID=21_23;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=11-12bp;gc_cont=0.386 4_179 - 445 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 2.3e-05 21.6 0.0 1 1 1.4e-07 4.3e-05 20.7 0.0 44 140 299 393 283 410 0.81 # 202413 # 203747 # 1 # ID=4_179;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.382 10_89 - 288 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.0055 13.9 0.0 1 1 4e-05 0.012 12.7 0.0 42 128 112 193 90 202 0.80 # 95362 # 96225 # 1 # ID=10_89;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.406 24_32 - 273 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.013 12.6 0.3 1 2 0.046 14 2.7 0.0 41 58 26 43 8 69 0.81 # 34138 # 34956 # 1 # ID=24_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.368 24_32 - 273 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.013 12.6 0.3 2 2 0.0015 0.48 7.5 0.2 112 127 172 187 154 241 0.74 # 34138 # 34956 # 1 # ID=24_32;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.368 16_21 - 427 Cons_hypoth95 PF03602.10 183 0.027 11.6 0.0 1 1 0.00014 0.044 10.9 0.0 67 130 263 322 233 351 0.73 # 22172 # 23452 # -1 # ID=16_21;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.432 5_72 - 239 DUF2791 PF10923.3 417 0.01 12.2 0.1 1 1 5.3e-06 0.017 11.5 0.1 49 82 12 45 9 51 0.90 # 81361 # 82077 # 1 # ID=5_72;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.338 34_9 - 771 Eco57I PF07669.6 106 0.033 12.3 0.5 1 2 0.00062 2 6.6 0.1 52 98 210 257 180 266 0.86 # 7208 # 9520 # 1 # ID=34_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.391 34_9 - 771 Eco57I PF07669.6 106 0.033 12.3 0.5 2 2 0.012 37 2.5 0.0 44 77 290 323 261 338 0.82 # 7208 # 9520 # 1 # ID=34_9;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.391 11_56 - 314 IPPT PF01715.12 253 1.5e-89 297.1 0.0 1 1 5.6e-93 1.8e-89 296.9 0.0 2 246 38 284 37 291 0.98 # 58319 # 59260 # -1 # ID=11_56;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=GGA/GAG/AGG;rbs_spacer=5-10bp;gc_cont=0.402 4_36 - 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